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SNDS et EGB Bases de données médico-administratives: Accessibilité et structure de ses données Thi Hoang Diem Vuillemenot Ingénieur de Recherche en Informatique, IFERISS IFERISS Institut Fédératif d’Etudes et de Recherches Interdisciplinaires Santé Société

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SNDS et EGB

Bases de données médico-administratives: Accessibilité et structure de ses données

Thi Hoang Diem Vuillemenot

Ingénieur de Recherche en Informatique, IFERISS

IFERISSInstitut Fédératif d’Etudes et de Recherches Interdisciplinaires Santé Société

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Contenu

• SNDS• Contexte de création

• Condition d’accès

• Architect de données

• EGB

• Utilisation de SNDS

• Perspectives

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Contexte de création de SNDS

• Loi de modernisation du système de santé du 19 janvier 2016 : création du SystèmeNational des Données de Santé (SNDS)

• SNDS doit permettre:• Ouverture des données de santé dans le respect de la vie privée du citoyen

• Amélioration de la santé des populations et l’analyse de la dépense publique

• Finalités interdites:• La promotion des produits de santé auprès des professionnels de santé et des établissements

de santé

• Exclusion de garanties des contrats d’assurance ou modification de cotisations d’asurance

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SNDS (Système National des Données de Santé)

• SNDS: Hérité du SNIIRAM (Système national d'information inter-régimes de l'Assurance maladie), centralise, enrichi et met à disposition de manière sécurisée les données en santé.

SNIIRAM(Système national

d'information inter-régimes de l'Assurance maladie)

PMSI(ATIH)

CépiDC(Inserm)

Handicap(MDPH)

Remboursement complémentaire

(AMC)

SNDS

évolution2019201820172003 2009 2016

Soins secteur libéral Données des

hôpitaux

Cause décès Maisons

départementales

des personnes

handicapées

Assurance

maladie

complémentaire

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Données collectées

• Consommation de soins de ville

• Consommation de soins en établissement(hopitaux, cliniques,...)

• Acts et consultation externes des hôpitaux publiques

• Offre de soins

• Bénéficiaires de l’assurance maladie (tous régimes)

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SNDS - Offre de données

Dépenses(DAMIR,...)

Offre de soinsActivités des professionnels de

santé & établissements (AMOS,...)

Bénéficiaires et leurs dépensesEGB, DCIR, PMSI

Des produits restitués par thème

Sans individualisation des bénéficiaires & offreurs de soins

Individualisation des offreurs de soins Individualisation des bénéficiaires et leurs dépenses: échantillonnées (EGB) ou exhaustives (DCIR,PMSI)

SNDSEntrepot de

données

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Condition d’accès et sécurité

Accès encadré par CNIL(Commission nationale de l'informatique et des libertés) & INDS (Institut des données de santé)

Sans risque de ré identification des personnes

Avec risque de ré identification des personnes

• Data.Gouv• CépiDC• Améli• Drees

Accès permanent

Accès sur projet

• Autorisation pérenne: liste des établissements et périmètre fixés par décret

• Habilitation nominative des utilisateurs et après formation

• Accès sécurisé et tracé

• Recherche, études, évaluations pour un intérêt publique quelque soit demandeur• Données «customisées»• Procédure demande d’accès

Open Data

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Accès sur projet- Procédure standard/simplifié de demande d’accès

Porteurs de projet

INDS

CEREES

CNIL

Autorisation

d’utilisation

• Point d’entrée unique des demandes d’accès: http://www.indsante.fr/

• Accompagnement, suivie des dossiers des demandeurs

• Délais de 7 jours

• Avis de CEREES(Comité d’expertise pour les recherche les

études et les évaluations dans le domaine de la santé)

• Délais de 1 mois

• Décision de CNIL

• Délais de 2 mois

INDS

CEREES

Projet conforme

à méthodologie de

référence MR-003

(www.cnil.fr )

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Accès permanent: Condition d’accès et sécurité• 3 catégories des profils d’accès fixés par décret :

• interrogation des produits agrégés et semi-agrégés (DAMIR, AMOS, SNIREP...) :>>> historique de données sur 5 ans +1 ; 9 ans +1 ; 19 ans +1 selon les profils.

• interrogation des produits individuels échantillonnées (EGB) : >>> périmetre de données sur 20 ans, avec ou sans possibilité de croisement des identifiantspotentiels.

• interrogation des produits individuels exhaustifs (DCIR, PMSI) :>>> historique de 5, 9 ou 19 + 1 selon les profils.

• Protection de données individuelles :

• Bénéficiaires anonymes

• Croisement de données sensibles interdit pour certain profils :

• La commune de résidence

• Mois+année de naissance du bénéficiaire

• Date de soins

• Date de décès

• Commune de décès

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Exemple de condition d’accès permanent: cas de l’INSERM

Procédure de demande d’accès : Le guichet unique pour toutes les demandes pour les agents de l’Inserm est l’Institut de Santé Publique : [email protected].

• interrogation des produits agrégés et semi-agrégés (DAMIR, AMOS, SNIREP...) : >>> historique de données sur 5 ans +1.

• interrogation des produits individuels échantillonnées (EGB) : >>> périmètre de données sur 20 ans, sans possibilité de croisement des identifiants potential.

• interrogation des produits individuels exhaustifs (DCIR, PMSI) :>>> pas d’accès permanent.

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Architect du système d’information

Portail SNDS:

• Accès sécurisés

• Espaces de travail maîtrisés

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EGB (Echantillon Généraliste des Bénéficiaires)

• Echantillon anonyme des bénéficiaires (consommants ou non consommant) de l’assurancemaladie

• Échantillonnage 1/97ème de la population totale protégé par différentes régimes (env. 660000 individus).

• Echantillon représentatif de la population en terme de tranche d’age/sex sur toute la France

• Historisations des données des remboursements sur 20 ans au-delà de l’année en cours (à partir2003)

• Contient information sociodémographiques et médicales des bénéficiaires et les prestations qu’ilsont perçues

• Environ 600 millions lignes de données, ou environ 200GB.

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Finalités de l’EGB

• Comparaison des pratiques aux référentiels

• Etudes sur parcours de soin avec grand profondeur.

• Analyse qualité de soins

• Etudes épidémiologiques ou économiques

• Pas adapté pour les études régionales et sur les maladies rares.

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EGB- La constitution de données

Bénéficiaires Prestations (soins de ville + hospitalisations)

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PMSI MCO, PMSI HAD, BGNA

• PMSI (Programme de Médicalisation des Systèmes d‘Information) • MCO (Médecine, Chirurgie, Obstétrique et odontologie)

• Séjours hospitaliers établissements publics & privés

• Soins externes des établissements publics et assimilés

• HAD (Hospitalisation à domicile)

Information d’ordre médical:• Le groupe homogène de malades (GHM)

• Unité médicale où le patient est hospitalisé (RUM)

• Diagnostic principal et les diagnostic associés (code CIM-10)

• Actes techniques pratiqués

• Donnée de tarification, telles que le groupe homogène de séjours (GHS)

• BGNA (Budget Global NAtionale)• Le reste à charge de tous les séjours MCO, Soins de suite et de réadaptation (SSR) et Psychiatrie

• Valoriser les séjours SSR et de Psychiatrie qui sont absents des tables de prestations du SNIIRAM et associées

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Données des Bénéficiaires

• ID (NIR crypté)

• Age

• Sex

• Date de naissance/décès (dépend du profil d’utilisateur)

• Commune/Dept de résidence (dépend du profil d’utilisateur)

• Historique d’affiliation aux régimes d’assurance depuis 2003

• ALD (affection long durée, code CIM10)

• ...

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Données des dépenses

• ID bénéficiaire

• Code d’acte (code CCAM: classification commune des actes médicaux)

• Année et mois d'hospitalisation

• Code FINESS géographique de l’établissement prescripteur

• Code FINESS géographique de l’établissement exécutant

• Date de début/fin d'exécution des soins

• Année et mois de début/fin des soins

• N° PS exécutant / prescripteur

• Des actes affinées et ses détailles:

• Pharmacie

• Biologie

• Dispositif médical

• Transport

• ...

• ...

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Données des prestations (cont.)

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Etudes de cas• Qui sont les bénéficiaires ayant acheté des antidépresseurs en 1/2015?

• Table de prestation: ID de bénéficiaire, ID dépense, date d’achat

• Table de codes affinés de pharmacie: ID dépense, ID/codeCIP du médicament

• Table du référentiel pharmacie: ID/code CIP médicament, classe ATC(N06A pour antidépresseurs)

• Quel est le nombre de patients en ALD pour diabète type 1 qui ontacheté des pompes à insulines en 1/2015?

• Table de prestation: ID bénéficiaire, ID dépense

• Table des dispositifs médicaux: ID dépense, date d’achat, code LPP du dispositif

• Table du référentiel médicalisé: code bénéficiaire, motif d’exonération(pour ALD), code CIM de la pathologie (diabète type 1)

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Limites du SNDS

• Pas de résultat d’examen clinique ou paraclinique

• Informations partielles sur la consommation des personnes âgées en EHPAD(établissement d'hébergement pour personnes âgées dépendantes) et pas d’information sur l’hospitalisation en long séjour

• Peu de données sociales

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Utilisation de SNDS

• Repérage et cartographie des pathologies et ses dépenses• Etude transversale et longitudinale: parcours de soin complètes en combinaison données DCIR/EGB avec PMSI.• Effets indésirables des dispositifs médicaux, médicaments• Etudes sur les populations consommant et non consommant• Données volumineuses pour les méthodes d’apprentissage automatique/fouille de données pour la prédiction des

risques/ coûts de soins, aide à la décision,...

Défis:

• Système de codage complexe et évolutif (CCAM, CIM, LPP, ALD,...)• Repérage des cas de pathologies complexe et pas encore standardisé ? (Group REDSIAM)

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Perspective

• Etudes sur les effets indésirables des dispositifs médicaux

• Les prothèses implantable (hanche, genoux,..)

• Implants mammaires

• Sondes pour defibrillation implantable

• Etude sur impact environnement (pollution)-santé

• Data mining pour détection automatique des patterns/association rules dispositif/médicament- effet indésirable ?

• Outil/Méthode Machine Learning pour prédiction de risque, d’aide à décisiondans diagnostic/prise en charge ?

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Merci!Questions?

Sujets pour discussion?

Références:

Formations « Architecture et données du SNIIRAM/SNDS» et « EGBs» par CNAMTS

https://www.ameli.fr

https://www.has-sante.fr

https://www.snds.gouv.fr

http://www.indsante.fr