Trumpas 7 dienų karantinas

Saugaus ugdymo įstaigų atidarymo ir veikimo taktikaTumas Beinortas. 1/2/2021Recenzavo: Aistis Šimaitis, Laimonas Griškevičius, Valdas Pečeliūnas

Testas prieš grįžtant

Mažesnės klasės, kaukės, vėdinimas ir greita simptominių izoliacija

Profilaktinis kaupinių testavimas. Stebėsena

24 val. nuo tepinėlio iki izoliavimo

Protrūkių sekoskaita

Tikslas:

Kuo greičiau gražinti vaikus į kontaktinį ugdymą nesukeliant reikšmingo atvejų augimo visuomenėje

LIETUVOS RESPUBLIKOS

VYRIAUSYBĖS KANCELIARIJA 2021-02-08 Nr. LV-63

DOKUMENTAS PASIRAŠYTAS

ELEKTRONINIU PARAŠU

2021-02-08 Nr. LV-63

▪ Laikantis gerosios nefarmakologinių intervencijų praktikos, pernaša mokyklose gali būti maža: Šiaurės Karolinoje su aukštu paplitimu visuomenė per 9 savaites 772 COVID-19 atvejai mokyklose, 32 atvejai pernešti mokykoje18

▪ Antro piko metu, mažas skerspjūvio tyrimas Berlyne, rado, kad 9 iš 338 tirtų mokinių ir 1 ir 140 tirtų mokytojų turėjo COVID-19. Per 7 dienas, jie sukėlė 4 atvejus namie.

▪ Nemažai epidemiologinių tyrimų rodo, kad ugdymo institucijų veiklos sustabdymas koreliuoja su R mažėjimu. Tačiau esant daug paralelinių kitų ribojimų, sunku šio efekto mastą tiksliai apskaičiuoti.

▪ Dėl lengvesnės plėtros, naujos atmainos (duomenys tik iš B.1.1.7) gali turėti didesnę protrūkių riziką ugdymo įstaigose: protrūkiai pradinėje mokykloje Nyderlanduose, Jungtinėje Karalystėje19,20

▪ B.1.1.7 vienodai padidina pernašą visos amžiaus grupėse, įskaitant vaikus – potencialiai didesnė ugdymo įstaigų rolė.

▪ Todėl tikslinga vykdyti ugdymo įstaigų protrūkių sekoskaitą.

Daug nežinomųjų dėl ugdymo įstaigų rolės dydžio COVID-19 plėtrai

Židiniai dabar veikiančiose įstaigose

*B.1.1.7, B1.351 ir P.1 SARS-CoV-2 atmainų paplitimas gali reikšti efektyvesnį COVID-19 plitimą mokyklose ir reikalauti visų epidemiologinės kontrolės priemonių komplekto ugdymo įstaigose, siekiant palaikyti R<119.

Kontaktinio ugdymo saugus atnaujinimas

Žingsnis Nr. 1

Iki 14 dienųDabar veikiančių darželių židinių užgesinimas

Žingsnis Nr. 2

Pilotinės mokyklos: pradinių klasių moksleivių grąžinimas su epidemiologine kontrole

Žingsnis Nr. 3

Su epidemiologine kontrole į kontaktinį ugdymą grąžinamos kitos pradinės mokyklos ir abiturientai.Stebėsena su duomenų sistemizavimu.

Žingsnis Nr. 4

Su epidemiologine kontrole į kontaktinį ugdymą grąžinami likusių klasių mokiniai

Žingsnis Nr. 5

>4 sav. nuo kontaktinio ugdymo atnaujinimo, priklausomai nuo stebėsenos rezultatų ir paplitimo visuomenėje, pereinama nuo besimptomių prie stebėsenos testavimo

1. Prieš atnaujinant kontaktinio ugdymo procesą – užgesinti dabartinius židinius ugdymo įstaigose. (?Asmenų skaičius darželiuose šiuo metu)

2. Į ugdymo įstaigą neturi įžengti asmenys, kurie turi būti izoliacijoje (turi COVID-19 simptomų, COVID-19 simptomus arba diagnozę turintys namiškiai, nesenas COVID-19 kontaktas, atvykę iš užsienio prieš <7d.).

3. Ugdymo įstaigoje simptomus pajutę asmenys izoliuojami nedelsiant ir nelaukiant testavimo proceso.

4. Prieš pirmą kartą grįždami į ugdymo įstaigą, visi asmenys turi turėti neigiamą PGR klasės tyrimą (kaupinių PGR masiniam besimptomių testavimui įgalinti)

5. Siekti ugdymo procesą vykdyti mažesnėse grupėse: mažesnė protrūkio tikimybė, užsikrėtimo metu mažiau asmenų turi izoliuotis.

6. Ugdymo įstaigose taikomos nefarmakologinės prevencinės priemonės: kaukės (mokyklinio amžiaus vaikams), patalpų vėdinimas, rankų higiena, pertraukos skirtingu metu.

7. Pirmas kelias savaites po kontaktinio mokymosi atnaujinimo vykdomas prevencinis besimptomių asmenų testavimas: kas 7 d. kaupinių PGR arba 2 kartus per savaitę antigeno tyrimu. Epidemiologinė stebėsena.

8. Tyrimo rezultatai iš laboratorijos perduodami paskirtam atsakingam asmeniui už tos įstaigos infekcijų kontrolę

9. Nuo tepinėlio iki izoliacijos <24 val.

10. Praėjus 3-4 sav., įvertinus epidemiologinę įtaką ir profilaktinio testavimo rezultatus, sprendžiama dėl tolimesnio besimptomių asmenų testavimo tęsimo ar nutraukimo. Perėjimas prie atsitiktinio stebėsenos testavimo.

Principai

▪ Naudojama studentų profilaktiniam testavimui JAV, JK.

▪ Masačiusetso valstija sausį pradėjo masinę prevencinio COVID-19 testavimo programą nuo darželinukų iki 12os klasės moksleivių visoje valstijoje.

Reguliarus prevencinis kaupinių testavimas

Testavimo programa antigenų testais 11+ metų moksleiviams kas 3-5 dienas.

JK

https://www.perse.co.uk/news/2021/01/covid-19-mass-testing-programme-launched-perse/

1. Nosies tepinėlis

▪ Mažiau invazyvus nei nosiaryklės – minimalus diskomfortas▪ 2 cm ir pasukiojamas 15s. Ėminys iš abiejų šnervių su tuo pačiu tepinėliu▪ Su priežiūra gali būti atliekamas pačio asmens▪ Asmens atliekamas nosies tepinėlis su sveikatos priežiūros darbuotojo instrukcijomis,

jautrumas 94.0% (97.5% CI, 83.8 to 100.0) lyginant su sveikatos apsaugos darbuotojo nosiaryklės tyrimu. (Tu et al. NEJM 2020)

Tu et al. NEJM 2020 DOI: 10.1056/NEJMc2016321

2. Klasė (ar kontaktinis tinklas), suskirstomas į stabilias 5 asmenų grupes

Grupė A

Grupė B

Grupė C

Grupė D

Grupė E

3. Vienos grupės asmenų tepinėliai sugrupuojami toje pačioje virusologinėjeterpėje (kaupinys).

▪ Prie kaupinio kodo, priskiriami grupės asmenų ID ir kaupinys transportuojamas į dedikuotą laboratoriją.▪ Kadangi kaupinys sudaromas testavimo vietoje – laboratorija neapkraunama papildomu perpilstymo darbu, sumažėja

laboratorinių klaidų tikimybė.▪ Išlieka klaidų ir užkrėtimo tikimybė tepinėlio paėmimo vietoje

5 ėminių kaupinių testavimas

Profilaktinio studentų testavimo programa Kembridžo universitete

4. Grupės kaupinys laboratorijoje tiriamas viena PGR reakcija

▪ Analizuojant kaupinį, galimas šioks toks jautrumo nukritimas lyginant su individualiu PGR.

▪ Izraelyje 5-8 grupių PGR (laboratorinis grupavimas) – 3 PGR ciklų skirtumas (Barak et al.)

▪ Kai individualaus mėginio CT <35, kaupinio jautrumas 88% lyginant su individualiu. JeiguCT <33 – 95.5% jautrumas (5 ėminių kaupinys). (Praharaj et al.)

▪ Grupavimas surinkimo vietoje gali turėti ir didesnį jautrumą.

Optimalus kaupinio dydis priklauso nuo paplitimo:

▪ Izraelyje kaupiniais profilaktiškai testuoti 133816 asmenys: Kai paplitimas 1.7 proc. 8 ėminių kaupinys pasiekė 4,6 karto sutapymą, prie 5,7 proc. paplitimo 5 ėminių kaupinyspasiekė 2.4 karto sutapymą

Barak et al. medRxiv 2020https://doi.org/10.1101/2020.10.16.20213405

5. Teigiamas kaupinys - klasės izoliacija. Infekcijos sklaidos nutraukimas

▪ Minimalus laikas nuo tepinėlio iki izoliacijos = maksimalus taktikos efektyvumas. Tikslas <24 valandos.

▪ Lokali ugdymo įstaigų epidemiologinė kontrolė

▪ Teigiamo kaupinio asmenų individualus pakartotinis testavimas (mobilūs punktai), teigiamo asmens(-ų) kontaktų atsekimas ir izoliavimas už ugdymo įstaigos ribų.

▪ Kaupinių PGR izoliuotai klasei 7 izoliacijos dieną ir PGR- asmenų grįžimas į kontaktinį ugdymą.

5 ėminių kaupinių testavimas

▪ Sumažintos mokymosi grupės, privalomos kaukės, reguliuojami susibūrimai + profilaktinis testavimas▪ 5 asmenų kaupiniai PGR testavimui. Nosies tepinėliai▪ 2x savaitę bakalauro, 1x savaitę vyresniems studentams ir darbuotojams

Bent 3 kartus sumažino suminį užsikrėtimų skaičių

Stony Brook University (NY)▪ 26000 studentų▪ 645 atvejai

Efektyvumas realiame pasaulyje. Cornell University, NY.

Protrūkis, kai reguliarus testavimas nevykdytas. Greitai supresuotas su testavimo – izoliavimo programa.

▪ Kaupinys = tepinėliai virusologinėje terpėje iš >1 asmens

▪ Klasė = vaikai, kurie dalyvauja ugdymo procese kartu vienoje patalpoje t.y. priklauso tam pačiam kontaktiniam tinklui

▪ Grupė = asmenys, kurių tepinėliai patenka į vieną kaupinį

Terminologija

Visi kontaktiniame ugdyme dalyvaujantys asmenys (priešmokykliniame ir mokykliniame) pradedami testuoti profilaktiškai. Per 7d. užgesinami židiniai.

Kas 7d. klasei daromas kaupinių PGR tyrimas**

Visų grupių kaupiniai neigiami.Tęsiamas kontaktinis ugdymas

Nors vienos grupės kaupinys teigiamas

Visi klasės asmenys izoliuojami.

Profilaktiniame testavime gali nedalyvauti:▪ Prieš >7d. antrąja doze paskiepyti asmenys▪ Prieš <90d. sirgę COVID-19 – patvirtinta PGR arba antigeno testu▪ Per pastarąsias 60d. turėję teigiamą anti-S arba anti-RBD SARS-

CoV-2 antikūnų tyrimą

7 izoliacijos dieną kaupinių PGR visiems PGR- asmenims

AgT/PGR+ asmuo:▪ 10d. Izoliacija▪ Namiškių izoliacija▪ Kitų kontaktų atsekimas ir izoliavimas

PGR- grupė PGR+ grupėIndividualus AgT ar PGR

mobiliame punkte

Grįžtama į kontaktinį ugdymą

PGR- grupėPGR+ grupė*

Individualus AgT arba PGRmobiliajame punkte

AgT/PGR- asmuo

PGR- asmuo

*Jeigu PGR+ grupei darant individualius AgT ar PGR, visi atsakymai neigiami, tuomet izoliacija visai klasei nutraukiama ir tęsiamas kontaktinis ugdymas su profilaktiniu testavimu. Izraelyje iš PGR+ kaupinių, 3,9-5,3% buvo klaidingai teigiami (Barak et al.). Kembridžo universiteto kaupoiniųtestavimo programoje 0,25% klaidingai teigiamų** Arba antigenų tyrimas 2 kartus per savaitę

Pagrindinis algoritmas

Dabar veikiančių ugdymo įstaigų židinių užgesinimas.

1. Tėvų, moksleivių ir ugdymo įstaigų darbuotojų informacinė medžiaga bei sutikimo formos

2. Nuolatinių 5 asmenų, priklausančiam tam pačiam kontaktiniam tinklui, grupių suformavimai.

3. Už epidemiologinę kontrolę atsakingas asmuo ugdymo įstaigoje.

4. Tepinėlių paėmimo infrastruktūra. Galimi variantai:▪ mobilios brigados

▪ apmokyti ugdymo įstaigų darbuotojai

▪ savarankiškas paėmimas su apmokyto asmens priežiūra

▪ tėvai +/- su apmokyto asmens priežiūra

5. Operatyvus mėginio pristatymas į laboratoriją.

6. Sprendimas kaupinio duomenų sujungimui su atskirais grupės asmenimis, kaupinio registracija, sujungimas su asmens ir epidemiologinę kontrolę vykdančio asmens telefonu.

7. Duomenų tėkmė apie kaupinio rezultatą iš laboratorijos į ugdymo įstaigą. Pradžiai skambutis, SMS.

8. Savalaikė epidemiologinė kontrolė, gavus atsakymą: užtikrinti laiką nuo tepinėlio iki izoliacijos (jei kaupinysteigiamas) <24val.

Spręstinos užduotys

1. Sudaromos reguliaraus testavimo grupės – grupėje asmenys iš tos pačios klasės2. 48 val. prieš grįžtant į įstaigą visiems atliekamas kaupinių PGR tyrimas3. Toliau pereinama prie reguliaraus profilaktinio testavimo4. Profilaktinis testavimas vykdomas arba kaupinių PGR kas 7d. arba AgT 2x per savaitę

48 val. prieš grįžtant atliekamas kaupinių PGR

AgT/PGR+ asmuo:▪ 10d. Izoliacija▪ Namiškių izoliacija▪ Kitų kontaktų atsekimas ir izoliavimas

PGR+ grupė*Individualus AgT arba PGR

mobiliame punkte

AgT/PGR- asmuo

PGR- grupė

Grįžtama į kontaktinį ugdymą

Pagrindinis algoritmas

Piloto tikslai:1. Ištobulinti testavimo – izoliavimo proceso žingsnius.2. Stebėti, ar atsidarymas su tokia kontrole yra saugus3. Perkelti veikiantį epidemiologinės kontrolės modelį kitoms ugdymo įstaigoms

Pilotinės mokyklos: pradinių klasių moksleivių grąžinimas su epidemiologine kontrole.

Reikalingas už ugdymo įstaigų pilotą atsakingas asmuo ir modelio įdiegimo koordinatorius

Ugdymo įstaiga geltonoje/raudonoje savivaldybėje

Ugdymo įstaiga žalioje savivaldybėje (>2sav. žalia)

Tęsiamas reguliarus prevencinis testavimas

Pereiti prie atsitiktinio stebėsenos testavimo. Dideli kaupiniai

Sekti teigiamų kaupinių procentą. Potencialiai didinti kaupinio dydį.

Žingsnis Nr. 5. Po >4 sav. žaliose zonose pereinama prie stebėsenos testavimo

>4 sav. po klasės grįžimo

▪ Su 3% paplitimo prielaida, sutaupymo faktorius 3(pesimistinis scenarijus)

▪ Su 1% paplitimu prielaida – sutapymo faktorius 4(realistinis scenarijus)

Tikslesniam resursų poreikiui apskaičiuoti reikia:▪ Šiuo metu kontaktiniame ugdyme esančių vaikų ir

pedagogų skaičiaus.▪ Persirgusių vaikų arba pedagogų skaičiaus. ▪ Moksleivių ir pedagogų žaliose savivaldybėse

skaičius

Resursų racionalizacija:

▪ Mažas paplitimas –> didinti kaupinių dydį. Reikia didesnių mėgintuvėlių. Dabartiniai iki 7 pagaliukų. Prie mažo paplitimo, viena klasė – 1 PGR reakcija

▪ Žaliose zonose pereiti prie atsitiktinio stebėsenos testavimo – dalis atsitiktinių moksleivių iš skirtingų klasių duoda mėginius kaupiniui.

▪ Automatizuotos PGR sistemos – išplėstų pajėgumus, atpigintų testavimą.

▪ Netestuoti prieš 90d. persirgusių, turinčius Ak arba vakcinuotus asmenis. Šias išimtis potencialiai gali tekti keisti, jeigu paplistų B1.351, P,1 SARS-CoV-2 atmainos

Barak et al. medRxiv 2020

Resursų poreikis pradinukams

Pesimistinis scenarijus: Testuojami visi. Niekas neturi imuniteto. Paplitimas 3%

Realistinis scenarijus: Testuojami visi pradinukai, abiturientai. 15% turi imunitetą. Paplitimas 1%.

32600 PGR reakcijų per savaitę

Ir pesimistinio scenarijausprofilaktinio testavimo programai laboratorijų

PGR pajėgumų praktiškai pakanka.

Ikimokyklinių sk.

Pradinių sk. Abiturientų sk. Pedagogų sk. PGR reakcijų per sav.

Žingsnis Nr. 1 X/3 - - Y/3 (X+Y)/3

Žingsnis Nr. 2 - A/3 - B/3 (A+B)/3

Žingsnis Nr. 3 - 117309 22176 ~14000 51161

Dabartinis vid 7d. testavimas 8800/d.

Laboratorijos darydavo 15000+/d.

Savivaldybė Raudona Geltona Žalia

Atvejų sk./100000 per 14d.

>200* 200-150 150-100 100-25 <25

Prieš grįžtant Moksleivių ir namų ūkių testavimas

Židiniai Esant protrūkiui testuojama ugdymo įstaiga ir namų ūkiai. Protrūkių sekoskaita.

Personalo testavimas Profilaktinis ugdymo institucijų personalo testavimas

Darželiai Veikia Veikia Veikia Veikia Veikia

Profilaktinio testavimo

rekomendacija

Profilaktinio testavimo rekomendacija

Profilaktinio testavimo rekomendacija

Profilaktinio testavimo rekomendacija

-

Pradinės klasės Nuotolinis mokymas*

Kontaktinis arba mišrus

Kontaktinis arba mišrus Kontaktinis arba mišrus Kontaktinis mokymas

- Profilaktinis testavimas

Profilaktinis testavimas Profilaktinio testavimo rekomendacija

-

Abiturientai Nuotolinis mokymas

Nuotolinis mokymas Mišrus arba nuotolinis mokymas

Mišrus arba nuotolinis mokymas

Kontaktinis mokymas

- - Profilaktinis testavimas Profilaktinio testavimo rekomendacija

-

Kiti moksleiviai Nuotolinis mokymas

Nuotolinis mokymas Nuotolinis mokymas Mišrus mokymas Kontaktinis mokymas

- - - Profilaktinio testavimo rekomendacija

-

Kontaktinio ugdymo saugus atnaujinimas. Diskusijai.

*Vasario pradžioje pilotinis grįžimas su profilaktiniu testavimu kelioms Vilniaus miesto pradinių klasių mokykloms neatsižvelgiant į paplitimą. Siekiama parengti sistemą kitų pradinių mokyklų saugiam grąžinimui į kontaktinį ugdymą.

1. Koordinatorius

2. Testo paėmimo logistika

3. Laboratorijų įtraukimas. Pageidautina testo verifikacija kiekvienoje laboratorijoje.

4. Sutikimo formos, informacinė medžiaga.

5. Kaupinio ir asmens susiejimas duombazėje

6. Skambutis ar SMS iš laboratorijos į mokyklą

7. Epidemiologinės kontrolės funkciją atliekantis asmuo mokykloje

8. Namiškių izoliavimo ir kontakto atsekimo už mokyklos ribų funkcija

Veiksmų planas

▪ Skerspjūvio (cross-sectional) tyrimas Berlyno pradinėse ir vidurinėse mokyklose Lapkričio 2-16d.

▪ 7d. COVID-19 infekcijų vidurkis Berlyne tuo metu 185-210/100000

▪ 338 moksleiviai, 140 mokytojų, 611 namiškių.

▪ Mokyklose taikomos nefarmakologinės priemonės: patalpų vėdinimas x3/d., 75% mokyklų fiksuotos grupės, 15/24 mokyklų nereikalavo kaukių pamokos metu, bet 22/24 mokyklos reikalavo kaukių devėjimo pertraukų metu.

▪ PGR+ infekcijos paplitimas: 2.7% moksleivių (9/338), 0.7% mokytojų (1/140). 7 iš 10 buvo besimptomiai. 3 iš 7 išsivystė simptomai per ateinančias 3-7 dienas. Po 7 dienų, iš 10 mokykloje teigiamų atvejų, 4 namiškiai susirgo COVID-19 (patvirtinta PGR) -> 40 proc. pernaša per 7d.

Priedas Nr. 1. Infekcijos sklaida mokyklose.

SARS-CoV-2 infection and transmission in school settings during the second wave in Berlin, Germany: a cross-sectional studyTheuring et al. medRxiv sausio 29d. 2021

Incidence and Secondary Transmission of SARS-CoV-2 Infections in SchoolsZimmerman KO, Akinboyo IC, Brookhart A, et al. Incidence and secondary transmission of SARS-CoV-2 infections in schools. Pediatrics. 2021; doi: 10.1542/peds.2020- 048090

▪ Tęstinis tyrimas Šiaurės Karolinos mokyklose (90000 moksleivių) nuo rugpjūčio 15d. iki spalio 23d. 2020 metais

▪ 773 COVID-19 atvejai, 32 atvejai dokumentuoti kaip vaiko-vaikui pernaša mokykloje.

▪ Mokyklose laikomais nefarmakologinių priemonių, reguliarus testavimas nevykdomas

9.0% B.1.1.7 užsikrėtusių 0-9 metų vaikų kontaktai užskirėtėCOVID-19 aplyginus su 6.0% kai sukelėjas buvo kita COVID-19 padermė.

Ir su B.1.1.7 jauni vaikai ir mažiau infektyvūs negu vyresni asmenys.

Priedas Nr. 2. B.1.1.7 pernašos tikimybė kontaktams pagal mažiaus grupę

Investigation of novel SARS-CoV-2 variant Variant of Concern 202012/01 Technical briefing 3. Public Health England. 2021 sausio 5d.

Ekspozicijos sumažinimas, kai iki atsakymo praeina 24 val.

Savaitinis besimptomių kaupinių testavimas (70 proc. jautrumo prielaida)

~1,3 karto mažinamas R, jei nuo tepinėlio iki izoliacijos 24 val.

Tes

tavi

mo

daž

nis

Dienos nuo tepinėlio iki izoliacijos

Bergstrom et al. 2020https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.09.05.20188839v1.full.pdf

Profilaktinio testavimo efektyvumą epidemiologinei kontrolei galima padidinti:

▪ Dažninant testavimą▪ Testuojant grupes skirtingą savaitės dieną▪ Trumpinant laiką nuo ėminio iki izoliacijos (jei rezultatas teigiamas)

Priedas Nr.3. Epidemiologinės kontrolės efektyvumas

Kaupinių rotacinis PGR testavimas.

Pirmadienis Ketvirtadienis

Brook et al. 2020 https://doi.org/10.1101/2020.11.12.20230870

B.1.1.7, B1.351 ir P.1 SARS-CoV-2 atmainų paplitimas reikštų efektyvesnį COVID-19 plitimą ir reikalaus visų epidemiologinės kontrolės intervencijų komplekto, siekiant palaikyti R<1

Momentinis simptominių asmenų izoliavimas + 90% kontaktų atsekimas + savaitinis testavimas teoriškai R sumažina apie 0.9

Priedas Nr. 4. Epidemiologinės kontrolės efektyvumas

Svarbiausias faktorius – momentinis simptominių izoliavimas.

Savaitinis testavimas su 24val. uždelsimu iki atsakymo – R mažėja 0.3

Brook et al. medRXiv 2020

Priedas Nr. 5. Grupės dydžio, simptominių izoliavimo ir reguliaraus testavimo įtaka R

Grupės dydis stipriai koreliuoja su infekcijos plėtros greičiu.

Kuo mažesnė grupė ( idealiai <10 asmenų), tuo lėtesnis populiacinis infekcijų augimas

PGR testavimas 7 karantino dieną turi mažesnį SARS-CoV-2 sklaidos šansą negu 14 dienų karantinas.

Fig. 3: The impact of testing on the post-quarantine transmission for traced contacts.

Well et al. Nature Communications 2021

Priedas Nr. 6. Optimali karantino trukmė su testavimu.

Kucirka et al. 2020

7 dieną nuo kontakto PGR turi mažiausią klaidingai neigiamo atsakymo tikimybę.

1. Identifying Optimal COVID-19 Testing Strategies for Schools and Businesses: Balancing Testing Frequency, Individual Test Technology, and Cost. Gregory D. Lyng, Natalie E. Sheils, Caleb J. Kennedy, Daniel Griffin, Ethan M. Berke. medRxiv 2020.10.11.20211011; doi: https://doi.org/10.1101/2020.10.11.20211011

2. Smith, D.R.M., Duval, A., Pouwels, K.B. et al. Optimizing COVID-19 surveillance in long-term care facilities: a modelling study. BMC Med 18, 386 (2020). https://doi.org/10.1186/s12916-020-01866-6

3. Optimizing COVID-19 control with asymptomatic surveillance testing in a university environment. Cara E. Brook, Graham R. Northrup, Alexander J. Ehrenberg, the IGI Testing Consortium, Jennifer A. Doudna, Mike Boots. medRxiv 2020.11.12.20230870; doi: https://doi.org/10.1101/2020.11.12.20230870

4. Pooled testing for coronavirus (COVID-19): instructions only. Department of Health and Social Care. https://www.gov.uk/government/publications/cohort-pool-testing-for-coronavirus-covid-19/pooled-testing-for-coronavirus-covid-19-instructions-text-only#how-pooled-testing-works-for-university-students (prieiga sausio 30 d. 2021)

5. Pooling for SARS-CoV2 Surveillance: Validation and Strategy for Implementation in K-12 Schools Alexandra M. Simas, Jimmy W. Crott, Chris Sedore, Augusta Rohrbach, Anthony P. Monaco, Stacey B. Gabriel, Niall Lennon, Brendan Blumenstiel, Caroline A. Genco medRxiv 2020.12.16.20248353; doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.16.20248353

6. Pooled Surveillance Testing for PK-12 Public Schools. http://www.mapc.org/wp-content/uploads/2020/12/Pooled-Testing-Webinar-12-14-2020.pptx37.pdf (prieiga sausio 30d., 2021)

7. Masinio testavimo programa Masačiusetso valstijoje, JAV. https://www.doe.mass.edu/covid19/pooled-testing/ (prieiga sausio 30d. 2021)

8. Denny et al. CDC Morbidity and Mortality weekly report Implementation of a Pooled Surveillance Testing Program for Asymptomatic SARS-CoV-2 Infections on a College Campus — Duke University, Durham, North Carolina, August 2–October 11, 2020. https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/69/wr/pdfs/mm6946e1-H.pdf (prieiga sausio 30d.)

9. Efficient high-throughput SARS-CoV-2 testing to detect asymptomatic carriers NOAM SHENTAL, SHLOMIA LEVY, VERED WUVSHET, SHOSH SKORNIAKOV, BAR SHALEM, ANER OTTOLENGHI, YARIV GREENSHPAN, RACHEL STEINBERG, AVISHAY EDRI, RONI GILLIS, MICHAL GOLDHIRSH, KHEN MOSCOVICI, SINAI SACHREN, LILACH M. FRIEDMAN, LIOR NESHER, YONAT SHEMER-AVNI, ANGEL PORGADOR, TOMER HERTZ SCIENCE ADVANCES11 SEP 2020 : EABC5961

10. Baha Abdalhamid, MD, PhD, Christopher R Bilder, PhD, Emily L McCutchen, MS, Steven H Hinrichs, MD, Scott A Koepsell, MD, Peter C Iwen, PhD, Assessment of Specimen Pooling to Conserve SARS CoV-2 Testing Resources, American Journal of Clinical Pathology, Volume 153, Issue 6, June 2020, Pages 715–718, https://doi.org/10.1093/ajcp/aqaa064

11. Pooled testing for COVID-19 diagnosis by real-time RT-PCR: A multi-site comparative evaluation of 5- & 10-sample poolingPraharaj Ira, Jain Amita, Singh Mini, Balakrishnan Anukumar, Dhodapkar Rahul, Borkakoty Biswajyoti, Ashok Munivenkatappa, Das Pradeep, Biswas Debasis, Kalawat Usha, Turuk Jyotirmayee, Sugunan A P, Prakash Shantanu, Singh Anirudh K, Barathidasan Rajamani, Subhadra Subhra, Sabat Jyotsnamayee, Manjunath M J, Kanta Poonam, Mudhigeti Nagaraja, Hazarika Rahul, Mishra Hricha, Abhishek Kumar, Santhalembi C, Dikhit Manas Ranjan, Vijay Neetu, Narayan Jitendra, Kaur Harmanmeet, Giri Sidhartha, Gupta Nivedita. Year : 2020 Volume: 152 Issue Number: 1 Page: 88-94

12. Hirotsu, Y., Maejima, M., Shibusawa, M. et al. Pooling RT-qPCR testing for SARS-CoV-2 in 1000 individuals of healthy and infection-suspected patients. Sci Rep 10, 18899 (2020). https://doi.org/10.1038/s41598-020-76043-z

13. Lessons from applied large-scale pooling of 133,816 SARS-CoV-2 RT-PCR tests. Netta Barak, Roni Ben-Ami, Tal Sido, Amir Perri, Aviad Shtoyer, Mila Rivkin, Tamar Licht, Ayelet Peretz, Judith Magenheim, Irit Fogel, Ayala Livneh, Yutti Daitch, Esther Oiknine-Djian, Gil Benedek, Yuval Dor, Dana G. Wolf, Moran Yassour, The Hebrew University-Hadassah COVID-19 diagnosis team medRxiv 2020.10.16.20213405; doi: https://doi.org/10.1101/2020.10.16.20213405

14. Swabs Collected by Patients or Health Care Workers for SARS-CoV-2 Testing. Tu iet al. NEJM. 2020; 383:494-496 DOI: 10.1056/NEJMc2016321

Šaltiniai

15. Frequency and accuracy of proactive testing for COVID-19 Ted Bergstrom, Carl T. Bergstrom, Haoran LimedRxiv 2020.09.05.20188839; doi: https://doi.org/10.1101/2020.09.05.20188839

16. Kucirka LM, Lauer SA, Laeyendecker O, Boon D, Lessler J. Variation in False-Negative Rate of Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction-Based SARS-CoV-2 Tests by Time Since Exposure. Ann Intern Med. 2020;173(4):262-267. doi:10.7326/M20-1495

17. SARS-CoV-2 infection and transmission in school settings during the second wave in Berlin, Germany: a cross-sectional study. Stefanie Theuring, Marlene Thielecke, Welmoed van Loon, Franziska Hommes, Claudia Huelso, Annkathrin von der Haar, Jennifer Koerner, Michael Schmidt, Falko Boehringer, Marcus A. Mall, Alexander Rosen, Christof von Kalle, Valerie Kirchberger, Tobias Kurth, Joachim Seybold, Frank P Mockenhaupt, BECOSS Study Group. medRxiv 2021.01.27.21250517; doi: https://doi.org/10.1101/2021.01.27.21250517

18. Zimmerman KO, Akinboyo IC, Brookhart A, et al. Incidence and secondary transmission of SARS-CoV-2 infections in schools. Pediatrics. 2021; doi: 10.1542/peds.2020- 048090

19. School risk calculations scrambled by fast-spreading virus strains. Science. January 15th 2020. https://www.sciencemag.org/news/2021/01/new-coronavirus-variant-scrambles-school-risk-calculations (prieiga vasario 1d. 2021)

20. Investigation of novel SARS-CoV-2 variant. Variant of concern 202012/01. Technical briefing 3. Public health England. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/950823/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_3_-_England.pdf(prieiga vasario 1d.)

21. Asymptomatic COVID-19 screening programme. University of Cambridge. https://www.cam.ac.uk/coronavirus/stay-safe-cambridge-uni/asymptomatic-covid-19-screening-programme(prieiga vasario 1d., 2021)

Šaltiniai