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seminario ribozimas
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JULIO RUIZ QUIROZ
DNA cleavage catalysed by the ribozyme from Tetrahymena
Herschlag D. & Cech T.
Nature 1990, 344: 405-409
JULIO RUIZ QUIROZ
1982 CechProtozoo ciliado Tetrahymena thermophylaObservó que el corte y empalme de un intrón del Pre-RNA era autocatalíticoPor su característica de clivar otras cadenas de RNASe les denominó RIBOZIMAS
Hipotesis: “mundo de RNA”
Su estructura a semejanza de las enzimas, presenta plieguesLo que da origen a estructuras tridimensionales
JULIO RUIZ QUIROZ
RNA como enzima
Algunos RNA son capacesde catalizar reacciones químicasdel mismo modo que las enzimas:son las ribozimas
Ribozimahammerhead
Participan en el procesadodel RNA transcrito primarioy en la formación de enlacepeptídico en la síntesis deproteínas.
JULIO RUIZ QUIROZ
El 2-OH’ del RNA, actúa como nucleófilo catalítico
Reacción catalizada por la ribozima hammerhead
JULIO RUIZ QUIROZ
RIBOZIMAS NATURALES
GRUPO I INTRON Remueven intrones mediante dos
transesterificaciones produciendo uniones 3’-5’ y un 3’.OH
GRUPO II INTRONProducen el autoclivaje de intrones vía dos transesterificaciones, produciendo una unión inicial 2’-5’ y un 3’OH
JULIO RUIZ QUIROZ
Reacciones catalizadas por las ribozimas: grupo I intrón (NOH: 3'-OH de una guanosina), grupo II intrón (NOH: 2'-OH de una adenosina dentro del intrón) y RNasaP (NOH: H2O).
JULIO RUIZ QUIROZ
RIBOZIMAS
RIBONUCLEASA (RNAsa) PCataliza la hidrólisis sitio específica de
precursores de RNA
HAMMERHEAD (Cabeza de martillo)Cataliza el clivaje sitio-específico de sus
propias uniones fosfodiester por un ataque nucleofílico del 2’-OH al fosfato al ser escindido
JULIO RUIZ QUIROZ
Estructura terciaria
Scott et al and Klug, Science 1996
HAMMERHEAD RIBOZIMA
JULIO RUIZ QUIROZ
RIBOZIMAS
TIPO VIRUS DE LA HEPATITIS DELTA (HDV) Y HORQUILLA (HAIRPIN)
Catalizan la misma reacción que la ant., y son responsables de clivar intermed. generados durante la replicación de HDV y de virus satélites de RNA de las plantas.
JULIO RUIZ QUIROZ
RIBOZIMA HAIRPIN
JULIO RUIZ QUIROZ
RIBOZYMA DE LA HEPATITIS DELTA
JULIO RUIZ QUIROZ
Ribozima derivada del Tetrahymena thermophylaCataliza el clivaje de secuencias específicas de un oligodeoxinucleótido
JULIO RUIZ QUIROZ
Vía del auto-emplamamiento de T.termophila pre-ribosomal RNA
JULIO RUIZ QUIROZ
La ribozima de Tetrahymena ... 1010 vecesSe creia que el sustrato solo era RNACech reportaQue la ribozima Tetrahymena cataliza el clivaje de secuencia específica de DNA monocatenario.La caracterización de esta reacción servirá para entender mejorLas interacciones sustrato-ribozima.
JULIO RUIZ QUIROZ