25
Proteinové inženýrství Josef „Faskal“ Novák

Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Genetická modifikace je zajímavá, ale to pravé umění je modifikovat proteiny. Jak vytvořit vlákno silnější než ocel, vymýšlet nové léky? Které metody se používají k určení 3D struktury proteinů, a jak se tyto znalosti používají k navrhování proteinů s novými vlastnostmi?

Citation preview

Page 1: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Proteinové inženýrství Josef „Faskal“ Novák

Page 2: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Dogma molekulární biologie

• Tok informací v buňce

– Kde se může stát chyba? Všude

– Kde ji opravit? Na DNA!

Page 3: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 4: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Určování struktury proteinů Krystalografie

• Proč krystaly? Obsahují opakující se jednotky

• Konstruktivní interference (Braggův zákon)

Page 5: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 6: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Odbočka - DNA

Nezapomenout:

Šroubek a laserové ukazovátko

Page 7: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Proteiny

Page 8: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 9: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

• Výpočetně velmi náročné

• Kvalita závisí na kvalitě krystalu a měření

• Může obsahovat chyby

Page 10: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Fold It!

Page 11: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Další metody určování struktury

• Jaderná magnetická resonance

– Hlavně na malé molekuly

• Mrazová elektronová mikroskopie

– Hlavně velké struktury

Page 12: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 13: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 14: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Celkem

Jenom NMR

Jenom CryoEM

Myoglobin, původní model z plastelíny

Page 15: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

GFP

• Aequorea victoria

• První mutace objeveny náhodou, další uměle připravené

• Martin Chalfie, Osamu Shimomura and Roger Y. Tsien 2008 – Nobelova cena

Page 16: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 17: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 18: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 19: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Hledání léků

• Hledání malé molekuly, která by přesně seděla do klíčového místa proteinu

Page 20: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 21: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 22: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 23: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)
Page 24: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)

Čas na diskuzi