PROBLEMES DE GENMICA HUMANA MODUL 8

1. Determina los distintos haplotipos en juego para poder determinar en cual se encuentra la mutacin que explica la enfermedad del padre y del hijo.

2. Mutaciones en gen PKD1 se asocian a quistes en los riones que obligan a dilisis o transplante de rion en los casos mas avanzados. Mutaciones en la secuencia codificante de se transmiten con un modelo de herencia autonmico dominante. Una familia llega a la clnica donde trabajas y muestra el siguiente pedigr. Tu sorpresa viene cuando la secuenciacin de los distintos exones no muestra ninguna mutacin. Recordando tu formacin en gentica, eliges una serie de 5 SNPs que cubren la secuencia genmica de PKD1 (figura de arriba) y obtienes estos resultados. A) Qu conclusin obtienes sobre la etiologa molecular de esta patologa? B) Se podra plantear un diagnstico preimplantacional para un futuro embarazo va fertilizacin in vitro?

SNP1: A/T SNP2: T/T SNP3: A/A SNP4: G/G SNP5: T/T

SNP1: A/A SNP2: G/T SNP3: G/G SNP4: A/A SNP5: T/A

SNP1: T/A SNP2: T/T SNP3: G/A SNP4: A/G SNP5: T/T

SNP1 SNP2 SNP3 SNP4 SNP5

SNP1: AA SNP2: CG SNP3: TT SNP4: GG SNP5: AA

SNP1: CC SNP2: GG SNP3: AT SNP4: CG SNP5: TT

SNP1: CA SNP2: GG SNP3: AA SNP4: CC SNP5: TA

3. Estas realizando un diagnostico preimplantacional. La siguiente imagen muestra un gel de agarosa correspondiente al anlisis de un polimorfismo biallico en 6 blastmeras, cada una de un embrin. El producto de PCR es de 550 bp. La enzima usada corta la secuencia GAATTC. La mutacion que se pretende diagnosticar genera un cambio G>T. A) Determina el genotipo de cada embrin. B) Qu blastmeras implantaras si el patrn de herencia es Dominante? Y si es recesivo? 4. Realizas un anlisis de fragmentos sobre un microsatelite que acaban de descubrir. Determinas el genotipo en 20 individuos y obtienes los resultados que se muestran en la tabla.

Codigo indiv Alelo1 Alelo2 1 314 317 2 317 320 3 320 320 4 323 323 5 320 326 6 317 323 7 323 320 8 326 317 9 314 314

10 317 317 11 320 320 12 326 317 13 323 326 14 320 323 15 317 320 16 314 317 17 320 320 18 323 323 19 326 329 20 323 320

A) Podrias decir que tamao tiene la regin comn y la variable, y que tipo de secuencia se encuentra repetida? B) Calcula el PIC del microsatelite y argumenta si sera adecuado o no para realizar estudios foreneses.

1 2 3 4 5 6 MM

5. Se realiza un estudio de segregacion de 6 marcadores microsatelites en una familia con una patologia autosmica recesiva ligada a 12q9.23 A) Podrias sealar donde se encuentra la mutacin? B) En que haplotipo original se encontraba?

6. Los siguientes arboles muestran la transmisin de una enfermedad ligada al cromosoma X en 4 familias DIFERENTES. Indica en cada caso la probabilidad que la propositus sea portadora. Razona los resultados obtenidos

7. En la siguiente figura se presenta dos arboles genealogicos correspodientes a dos familias afectadas por dos patologias recesivas. En la familia A, el caracter esta ligado al cromosoma X, en la familia B el caracter es autosomico. Ambas familias estan esperando un nuevo hijo y quieren saber si se ver o no afectado por la patologia en cuestion. Para averiguarlo, se realiza un diagnostico indirecto de los fetos, utilizando polimorfismos del tipo VNTR de loci ntimamente ligados a los genes que codifiquen para cada una de estas enfermedades. Los resultados obtenidos se presentan en la parte inferior de cada arbol.

A) Cual es el fenotipo esperado para el feto en cada caso? B) Como afectaria a este resultado el hecho de que los polimorfismos estuvieran a 15

cM del locus de la enfermedad? 8. La seora S. tiene 32 aos y esta embarazada de 32 semanas. Es su 4 embarazo y tiene 3 hijos y 1 hija, todos sanos. Viene a tu consulta porque el hijo de su hermana acaba de ser diagnosticada de hemofilia (recesiva ligada al X). El embarazo no ha tenido complicaciones. Le han hecho una ecografia y el feto es un nio de apariencia normal. Por la histria familiar, descubres que la seora S tuvo dos hermanos mayores que murieron de pequeos por problemas hemorragicos (hemoflia casi seguro). A) Cual es la probabilidad de que el feto de la seora S sea hemoflico? B) La familia se somete a un analisis de ligamiento usando un VNTR localizado a 2cM del gen responsable de la hemofilia y que presenta dos alelos (indicados en la figura como a y b). En vista de los resultados del diagnostico indirecto, cual es la probabilidad de que el feto sea hemoflico?

I

II

III

I1: ab I2: b II3:a II4:ab II5:bb III1,III2,III3:a III4:ab III6:b