17
Paper presenta*on by Janique Bertschi 20.05.2014 1 IRES = internal ribosome entry site, eIF4A = eukaryo*c ini*a*on factor4A

Paper&presentaon & by&Janique&Bertschi& 20.05ibmmsrvlakitu.unibe.ch/Altmann/BERTSCHI.pdf · 2014. 6. 19. · Paper&presentaon & by&Janique&Bertschi& 20.05.2014 IRES&= internal&ribosome&entry&site,&eIF4A&=&

  • Upload
    others

  • View
    2

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • Paper  presenta*on  by  Janique  Bertschi  

    20.05.2014  

    1  IRES  =  internal  ribosome  entry  site,  eIF4A  =    eukaryo*c  ini*a*on  factor-‐4A  

  • What  is  the  paper  about?  

    2  

  • What  is  the  paper  really  about?  

    INR  =  insulin-‐like  receptor   3  

    =  insulin  

    ?  

    cap-‐binding  complex  forma*on  

    mRNA  transla*on  

  • The  alterna*ve  way  of  transla*on  ini*a*on:  IRES  

    IRES  =  internal  ribosome  entry  site   4  

    •   well  known  from  viral  mRNAs  •   cap-‐independent  

  • Their  Hypothesis:  

    INR  =  insulin-‐like  receptor  ,  IRES  =  internal  ribosome  entry  site   5  

    ?  

    mRNA  of  e.g.  INR:  

    5‘  UTR   3‘  UTR  AAA  

    IRES  

  • Experiments  

    6  

  • Does  Foxo  ac*vate  PDCD-‐4  in  Drosophila  cells  ?  

    7  INR  =  insulin-‐like  receptor  ,  IRES  =  internal  ribosome  entry  site  

    ?  

    mRNA  of  e.g.  INR:  

    5‘  UTR   3‘  UTR  AAA  

    IRES  

  • •  Western  blot:  

    •  Same  on  mRNA  level    

    8  

    Does  Foxo  ac*vate  PDCD-‐4  in  Drosophila  cells  ?  

    Drosophila  cell  line    with  inducible  con-‐  stu*vely  ac*ve  FOXO.  

  • YES,  PDCD-‐4  is  ac*vated  by  FOXO  in  Drosophila  cells.  

    9  INR  =  insulin-‐like  receptor  ,  IRES  =  internal  ribosome  entry  site  

    ?  

    mRNA  of  e.g.  INR:  

    5‘  UTR   3‘  UTR  AAA  

    IRES  

  • How  can  dINR  mRNA  be  translated  if  FOXO  is  ac*ve?  

    10  INR  =  insulin-‐like  receptor  ,  IRES  =  internal  ribosome  entry  site  

    mRNA  of  INR:  5‘  UTR   3‘  UTR  

    AAA  

    cap-‐binding  complex  forma*on  

    mRNA  transla*on  

  • How  can  dINR  mRNA  be  translated  if  FOXO  is  ac*ve?  

    •  Constructs  that  were  cloned  into  Drosophila  S2  cells  expressing  a  constu,vely  ac,ve  form  of  FOXO.  

    Ø Dicistronic  mRNAs  :  A  high  Firefly/Renilla  ac*vity  ra*o  indicates  IRES  ac*vity  

    Ren  =  Renilla,  FF  =  Firefly,  IRES  =  internal  ribosome  entry  site   11  

    cap   5‘  UTR  of  dINR  

  • How  can  dINR  mRNA  be  translated  if  FOXO  is  ac*ve?  

    dINR  =  drosophila  insulin-‐like  receptor,  HCV  =  Hepa**s  C  Virus,  IRES  =  internal  ribosome  entry  site   12  

    Ø IRES  ac*vity  in  the  5‘  UTR  of  dINR  mRNAs  mediates    resistance  to  FOXO  induces  transla*on  inhibi*on,    comparable  to  the  well-‐characterized  IRES  from  Hepa,ts  C  Virus.  

  • Summary  

    INR  =  insulin-‐like  receptor  ,  IRES  =  internal  ribosome  entry  site   13  

    mRNA  of  e.g.  INR:  

    5‘  UTR   3‘  UTR  AAA  

    IRES  

    Actually,  resistance  to  low  levels  of  eIF4A    was  tested  in  more  detail  in  the  paper.  

  • What  else?  

    •  It  was  also  tested  in  a  mice  system  if  transla*on  of  their  mINR  and  mIGFR  mRNAs  is    cap-‐independent  or  requires  eIF4A.  

    Ø Evolu*onary  conserved  mechanism  J  Ø Take  home:  Transla*on  of  the  insulin  receptor  is  con*nued  under  condi*ons  of  generally  inhibited  protein  synthesis.  

    mINR  =  mouse  insulin  receptor,    mIGFR  =  mouse  insulin-‐like  growth  factor  receptor-‐I  

    14  

  • Outlook  

    Interes*ng  point:  As  there  are  other  geneproducts  induces  by  FOXO,  they  might  also  have  found  mechanisms  to  escape  4E-‐BP  and  Pdcd4  inhibi*on.  

    15  

  • 16  

    Thanks!

  • Supplementary  slides  

    17  

    inhibits  eIF4A  

    Is  dINR  s*ll  translated  (via  IRES)  if  eIF4A  is  directly  inhibited  with  a  small  molecule  called  Hippuristanol?  

    Ø   YES,  dINR  transla*on  is  specifically  resistant    to  eIF4A  inhibi*on