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Dr. Gustavo Mora Aguilera COLPOS
Dr. Patricia Rivas Valencia INIFAP-CEVAMEX
Dr. Emiliano Loeza Kuk INIFAP-MOCOCHA
Dr. Noe Ruiz García U del M-Pto. Escondido
Dr. Daniel Ochoa Martínez COLPOS
Dra. Alejandra Gutiérrez Espinosa COLPOS
MC. Pedro Robles DGSV
Nuevos Enfoques Epidemiológicos en el Manejo Preventivo y Erradicativo de Problemas Fitosanitarios en Cítricos
Contactos:[email protected]@inifap.gob.mx
Temática
El problema
La necesidad de un nuevo
enfoque epidemiológico
La viabilidad de un nuevo
enfoque
1. El Problema
Gráfico de defunciones acumulado
Defunciones
acumulado, 79
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 53 55 57 59 61 63 65 67 69 71 73
Gráfico de confirmados acumulados
Confirmado
acumulado, 4131
0
500
1000
1500
2000
2500
3000
3500
4000
4500
1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 53 55 57 59 61 63 65 67 69 71 73
La enseñanza de la influenzaEpidemia Año País Población Mundial Tipo Subtipo Total muerte aprox
Gripe Española 1918 Mundial 1,650,000,000 A H1N1 50,000,000
Gripe Asiática 1957 Asia 2,629,000,000 A H2N2 2,000,000
Gripe Hong Kong 1968 Asia 3,334,874,000 A H3N2 1,000,000
Gripe Rusa 1977 Rusa 3,692,492,000 A H2N2 1,000,000
SARS 2002 Asia 6,070,581,000 Coronavirus - 812
Influenza 2009 Mexico 6,671,679,034 A H1N1 592
Gripe aviar 2003-2005 Asia 6,070,581,000 A H5N1 60
Mora y Acevedo 2009 con datos publicados
Hospedante Enfermedad Patógeno Vector Regulación en México
Todos los cítricos Huanglongbing Candidatus Liberibacter spp. Diaphorina citri, Trioza
erytreae NOM-EM-047-FITO-2009
Todos los cítricos Cancro Xanthomonas axonopodis pv. citri No tiene vector NOM-011-FITO-1995
Naranja dulceClorosis variegada Xyllela fastidiosa Oncometopia nigricans
NOM-011-FITO-1996
Limon mexicano,
variedades injertadas
en naranjo agrio
Tristeza Citrus tristeza virus Toxoptera citricida , T
aurantii, Aphis gossypii,
A. spiraecola
NOM-031-FITO-2000 Y
NOM-079-FITO-2009
Najanja dulce,
mandarina
Leprosis Citrus leprosis virus Brevipalpus phoenicis ,
B. obovatus,B.
CalifornicusNOM-011-FITO-1995
Naranjo y pomelo Psorosis Citrus psorosis Ophiovirus No reportado NOM-079-FITO-2002
Mandarina, macrofila,
lima, volkameriana,
tangelos, kumquat,
limas dulces
Xiloporosis Citrus xiloporosis virus No tiene vector
NOM-079-FITO-2002
Limonero, Naranjo Mancha foliar Altermaria limicola - NOM-011-FITO-1995
? Hoja rugosa Citrus leaf rugose Ilarvirus No reportado NOM-011-FITO-1996
? Mosaico Citrus mosaic Badnavirus No reportado NOM-011-FITO-1997
? Incompatibilidad de
injerto
Citrus tatter leaf Capillovirus No reportadoNOM-011-FITO-1998
? Variegado Citrus variegation Ilarvirus No reportado NOM-011-FITO-1999
Naranjo / Citrus
limonia
Muerte súbita Citrus sudden death-associated
Marafivirus?
Toxoptera citricida , T
aurantii, Aphis gossypii,
A. spiraecolaNOM-011-FITO-2000
Exocortis Citrus exocortis Pospiviroid No reportado NOM-079-FITO-2002
Citrus Cocadviroid IV Citrus Cocadviroid IV No reportado NOM-079-FITO-2003
Citrus Apscaviroid III Citrus Apscaviroid III No reportado NOM-079-FITO-2004
Hop stunt Hostuviroid-
citrus
Hop stunt Hostuviroid-citrus No reportadoNOM-079-FITO-2005
Citrus bent leaf
Apscaviroid
Citrus bent leaf Apscaviroid No reportadoNOM-079-FITO-2006
Enanismo Citrus dwarfing Apscaviroid No reportado NOM-011-FITO-1995
Rompimiento de corteza Citrus bark cracking Cocadviroid No reportadoNOM-011-FITO-1996
Naranjo trifoliado, lima
rangpur, lima dulce,
citranges, limon persa
cidra naranja, toronja
• Florida-México 830 Km
• Cuba-México 496 Km
• Louisiana y Georgia-México 1,000 Km
Distancia aproximada entre los sitios con presencia de HLB en AL y México
• Rep. Dominicana-México 1,795 Km
• Belice-México 0 Km
Mexico
USA
Situación actual de Diaphorina citri
Situación actual de HLB en el Mundo
Trioza erytreae
6 de julio 09
Estados con detecciones asintomáticas VTC.
Estados sin detecciones de VTC.
Estados sin cítricos.
Estados con presencia del Pulgón Café.
VTC y Pulgón café
Estados citrícolas con presencia.
Estados sin presencia de leprosis
Estados que no cultivan cítricos.
Situación actual de la Leprosis
Fuente: http://www.doacs.state.fl.us/pi/canker/exmaps.html
Cancro
Cancro y Clorosis Variegada
Cancro y Clorosis Variegada
1. Tres especies de Liberobacter:Candidatus Liberobacter asiaticusCandidatus Liberobacter africanus¿Candidatus Liberobater americanus?
(una mutación en la 16s)
2. Muerte Súbita de los Cítricos¿Selección de variantes severas de CTV?¿Un marafivirus?
3. Erradicación del CTV MéxicoEliminación actual de variantes moderadas ¿establecimiento de variantes agresivas?
Se aplica el paradigma etiológico consistente
en enfocarse en el organismo como agente
causal y en la enfermedad como el efecto
1. Deficiente sistema preventivo con énfasis en
control legal
2. Se enfatiza el Diagnóstico-Detección. Es
decir: el Dónde?
2. Un Nuevo Enfoque
Cultivo
Vector
Virus
ClimaManejo
Absorbancia 0.81
B. Filo
B. Filo
Leprosis
HLBB. phoenicis
D. citri
Un Nuevo Sistema Epidemiológico
Sistema epidemiólogicoa). Integracion en el hospedanteb). Multiples patógenosc). Multiples vectores
Suelo
Clima
ni
Cítricos
Manejo
Agronó-
micoT.citricida
CTV
Inte
ns
idad
de
En
ferm
ed
ad
Asunción 1
Estudios epidemiológicos a nivelsubpoblacional (polimorfismo ypatogénesis) permite anticiparcambios de intensidad epidémicaatribuible a procesos de variaciónpoblacional y al fenómeno decontagio Acciones preventivas
Asunción 2
Estudios epidemiológicos a nivelpoblacional en los niveles deintegración planta, parcela, región ycontinente permite reducir cambiosde intensidad epidémica atribuible aprocesos de dispersión o de contagio
Acciones erradicativas
3. La Factibilidad del Nuevo Enfoque
El modelo de CTV
Hipótesis
El análisis de la estructura poblacional de haplotipos del Citrus tristeza virus en la planta, yen el vector permitirá explicar en:
• Brasil, la asociación de aislamientos de tipo severo con la MSC, => especiación
• México, evidenciar cambios de prevalencia de aislamientos por la presencia de T. citricida, para establecer el riesgo de cambios en la intensidad de epidemias de tristeza. => selección
Rivas et al., 2008. Agrociencia
Loeza et al., 2008. Agrociencia
Aparente
Severos Tam.
Aparente
Moderados / Ver.
Aparente
Moderados / Tam.
RT-PCR
PM35
RT-PCR
PM34
SSCP
Tamaulipas Veracruz
Aparente
Moderados Ver.
1.00 0.86 0.72 0.57 0.43
Coeficiente de Similaridade (Nei & Li)
Regiões com MSC
1.00 0.86 0.72 0.57 0.43
Coeficiente de Similaridade (Nei & Li)
Regiões com MSC
A B C D E
A) Capela do Alto
B) Capão Bonito
C) Comendador Gomes
D) Uberlândia
E) Botucatu
Haplotipos con MSC = 5
Haplotipos sin MSC = 7
CTV
MSC
Estructura del CTV en la planta
Definir umbrales de establecimientoEn región Fuente (foránea)
Éxito de establecimiento CTV
Inci
den
cia á
rea d
isp
ersi
ón
efec
tiva (
%) 3.3-12% incidencia
agregación retorna
3-10 meses
1.5
0
12
10 3
Umbral de
establecimiento
Indices de
agregación
40 48 54 61 68 75 82 89 950
0.2
0.4
0.6
0.8
1
Tiempo (p.e. Días Después de la Siembra)
Incidencia / Severidad
El chip tiene el tamaño de la uña de
un dedo pulgar
Contiene oligonucleótidos, (secuencias cortas de DNA
que portan información genética) fijados en las
columnas de vidrio
Hasta 256,000 oligonucleótidos pueden estar en un chip
La unión entre los oligonucleótidos sigue las reglas de apareamiento de bases del DNA: el nucleótido A se aparea con T y G con C. Se requiere el marcaje de la sonda
desconocida con una molécula fluorescente para detectar al material
unido.
Las secuencias desconocidas de nucleótidos que entran en contacto con el chip, se unen a su contraparte
(el oligonucleótido fijado a la columna de vidrio) sólo si existe un
apareamiento completo.
Chips de genes
La prevención de problemas de interés regulatorio en
cítricos requiere de un nuevo paradigma que se
fundamente en la planta como elemento integrador de
un sistema de vigilancia.
Este Sistema de Vigilancia debe operar a nivel inter- e
intra-regional con un alcance continental.
El sistema debe considerar un complejo de organismos
priorizados mediante procedimientos cuantitativos.
Este modelo requiere de la cooperación entre
productores, investigadores, técnicos de comités
estatales, oficiales gubernamentales, etc.
Hay 4 proyecto de investigación en México: 52
millones. ¿Seguimos por la ruta del organismo?
Fundación Produce Tamaulipas
Agradecimientos
Unión Agrícola Regional de Citricultores
de Tamaulipas (UARCT)
Comité para el Fomento a la Investigación
Citrícola del Estado de Tamaulipas (CEFICET)
Comité Estatal de Sanidad Vegetal-Tamaulipas
CONACYT G35488B
Dirección General de Sanidad Vegetal
CESV-Yucatán
Fundecitrus
Colegio de Postgraduados
CONACYT-Becas
