NF-B : simulations stochastiques

Alain Lilienbaum

UMR 7000Groupe « Voies de signalisation du stress du cytosquelette »Faculté de médecine La Pitié - Salpétrière 105, bd. de l’hôpital 75013 PARIS

GENE A

Start Stop

Eléments de contrôle

Signaux

AAA A

AA

A

A

ARNmessager

Protéines

LE FACTEUR DE TRANSCRIPTION NF-BLE FACTEUR DE TRANSCRIPTION NF-B

Transcription

Traduction

FACTEURS DE TRANSCRIPTION

Rôles Biologiques du Facteur NF-BRôles Biologiques du Facteur NF-B

- Réponse immunitaire

- Inflammations

- Survie face aux stress (oxydoreductions, ionisations,…)

- Traumatismes neurologiques, maladie d’Alzheimer,

maladie de Parkinson, cancers, arthrites rhumatoïdes.

- Plus d’une centaine de gènes « cibles » identifiés.

- Recherche d’agents inhibiteurs spécifiques.

Agents mitogènes Cytokines Produits viraux et bactériensFacteurs de stress

PMA,Facteurs de croissance…

TNF,IL1, IL2…

VIH, HTLV IEBV, CMV…

ROS, UV, RXTaxol…

NF-BNF-B

Immuno Récepteurs Cytokines, F.C. Redox.Adhérence cellulaire Virus

TNF,IL2, IL6, IL8…

CMH,TCRIL2R…

ELAM1VCAM1ICAM1

SODNOS-iGST

VIHCMVSV40

NF-B

IKKNIK

PAK

MEKK

PKC NAK

LPS Mitogènes TGF

TAK

T R Cytokines

Gènes cibles

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

Récepteurs

Gène A

Gène B

Gène C

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

SIGNAUX

Récepteurs

Voies designalisation Gène A

Gène B

Gène C

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

SIGNAUX

Récepteurs

Gène A

Gène B

Gène C

Voies designalisation

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

Récepteurs

Gène A

Gène B

Gène C

IB

p50 p65

IB

(p52, c-Rel, RelB)

(IBIBBcl3, p105, p100)

p50 p52

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

Immunoglobulines Ig : GGGACTTTCC

c-myc : GGGAAAACCC

TNF : GGGAATTCAC

IL8 : GGAATTTCCT

SITES DE FIXATION DE NF-B

NF-B actif (nucléaire)

temps (h)0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

Récepteurs

Gène A

Gène B

Gène IB

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

Récepteurs

Gène A

Gène B

Gène C

RESEAUX DE GENES Le facteur NF-BRESEAUX DE GENES Le facteur NF-B

Récepteurs

Gène A

Gène B

Gène C

t < tmax

n (Réaction n)

t = t +

Réaction n :(A + B -> AB)

A = A - 1B = B - 1AB = AB + 1

FonctionPseudo-aléatoire

30 + 31

32 + 33

34 + 35

36 + 37

38 + 39

40 + 41

42 + 43

44 + 45

46 + 47

48 + 49

50 + 51

52 + 53

54 + 55