Molekuláris interakciós ujjlenyomat

Málnási-Csizmadia András, Bikádi Zsolt, Hazai Eszter, Jelinek Balázs, Hári Péter, Simon Zoltán,

Zhenhui Yang, Zahoránszky Gergely

A projekt áttekintése

•Gyógyszerfejlesztés

– Nagyrészt szemiempirikus• Ismert/természetes hatóanyag továbbfejlesztése• High Throughput Screening

– Pontos hatásmechanizmus nem ismert, és nem is kell az engedélyezéshez

– Mellékhatások• Több fehérjepartner• A gyógyszerjelölt molekula elvetését okozhatja• Költséges (egy gyógyszer fejlesztése több 100 millió USD)

A projekt áttekintése

•Komplex szolgáltatás

A. Direct Similarity

B. ZMOL Similarity

C. Molecular Interaction Fingerprint

– Alkalmas gyógyszerjelölt molekulák többszintű szűrésére

• Szerkezetvizsgálat• Mellékhatás-vizsgálat

Straight et al, Science

Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék

• Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán

Virtua Drug Kft.• Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter

DELTA Elektronik Kft.• Hári Péter, Akli Péter

eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont

• Dr. Szathmáry Eörs

Résztvevők, partnerek

A projekt áttekintése

•Cél

Mellékhatás-predikció a bioinformatika eszközeivel

•Eszköz

Molekuláris dokkolás

Art Olson, TSRI

Dokkolási probléma: Két különálló molekula atomi koordinátáiból kiindulva hogyan adható meg kettejük komplexének szerkezete?

A projekt áttekintése

I. Adatgyűjtés, szelekció

II - III. Előkészítés és dokkolás

kcal/mol

8,5

2,5

0

-2,5

-4,5

Fehérjék

Ligandu

mo

k

Hasonló MIF

Hasonlókölcsönhatási partnerek

Hasonló hatások,Hasonló mellékhatások

IV. Az eredmények értékelése

MOLEKULÁRIS INTERAKCIÓS

UJJLENYOMAT (MIF)

Egyedileg jellemzi a kismolekulátKölcsönhatási partnerek előrejelzéseA fehérjekészlet diszkriminátor-felületként működik

V. A szolgáltatás beindítása

Összkép

• Adatgyűjtés– Gyógyszermolekulák és fehérjék 100%– Mellékhatások 50%

• Előkészítés 100%

• Dokkolás 100%

• Értékelés 2007. március

• Szolgáltatás indítása 2007. december

Állapot, ütemterv

Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék

• Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán

Virtua Drug Kft.• Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter

DELTA Elektronik Kft.• Hári Péter, Akli Péter

eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont

• Dr. Szathmáry Eörs

Résztvevők, partnerek