Laboratoire d’Écologie Microbienne de la Rhizosphère Laboratoire d’Écologie Microbienne de la Rhizosphère

« et d’Environnements extrêmes »« et d’Environnements extrêmes »(LEMiR « E »)(LEMiR « E »)

Personnel permanent

Chercheurs

ACHOUAK Wafa

BALESDENT Jérôme

BERGE Odile

CHAPON Virginie

HEULIN Thierry

SANTAELLA Catherine

ITA

BARAKAT Mohamed (IR)

BRUTESCO Catherine (TS)

BRANDELET Géraldine (T)

CONROD Sandrine (T)

DE LUCA Gille (IR)

MAROL Christine (I)

ROBERT Sylvie (IE)

Thésards

DERRIEN Delphine

GOMMAUX Maxime

HAICHAR Feth-El-Zahar

PROFIZI Camille

Post-Docs

CHANAL Angélique

DE GROOT Arjan

NERCESSIAN Olivier

SANCHEZ Lisa

DEAMARCON Estelle

Programme toxicologie nucléaire-EProgramme toxicologie nucléaire-E

TRANSPLAMTRANSPLAM(Cd, Zn)(Cd, Zn)

TOXICOGENOMICSTOXICOGENOMICS(Cd, U)(Cd, U)

RÉSISTANCE DES RÉSISTANCE DES BACTÉRIESBACTÉRIES

(Se, U)(Se, U)

Pseudommonas brassicacearumPseudommonas brassicacearum

Stenotrophomonas maltophiliaStenotrophomonas maltophilia

Ligation of DNA fragments in pGEMT

Electrotransformation

White/bleue screen

pGemT

E. coli DH5,

Plates LA-amp

Microplates growth and conservation

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 A

BC

DE

FG

H

A Digestion by S1 nuclease PCR cycle using Taq polymerase

AA

AA

A

DNA extraction (strain NFM421)

Ultrasound DNA fragmentation

0.5- 2 kb

2 Kb

Sub-WP2.1: Construction of small fragment genomic librarie and genomic microarrays of Pseudomonas brassicacearum NFM

421

12 000 clones

7 107 clones

Analysis and identification of modulated genes

R > 2 or < 0.5 Statistic Analysis of data

Fragment sequencing

Sequence homology

Banque de séquences

ATGCTCCATTCGGAATCGATTTACTCGCTATA

Gene identificationMetabolic pathway

+-

II

Ammoniamonoxygenase

amoA

NH3

METABOLISME DE L’AZOTE

hydroxylamine

H2O

NO2-

(nitrite)

4H,H +

H+

ATP

Nitrate reductase

nosF copper processing,

ATP/GTP binding protein

Denitrification

H+

Drug

AcrA like protein

Resistance-Nodulation-Division efflux system (RND)

OprB like protein

Glucosecarbohydrates

Carbohydrate-selective porin H+

Drug

OprM like protein

Membrane efflux Protein (OEP)

Na+/H+ antiporter

Na+

Major FacilitatorSuperfamily (MFS)

ara

H+

Putative arabinose-proton

symporter

Small solutes

H+, Pi

Putative MFS

H+, Pi

ATP

Ferrichrome or CopperABC transporter

Putative Transmenbrane oxidoreductase

PbD sequestration protein

ATP

T

AB

C

Pb(II)D

Pb(II)

Pb(II)

ATP

ABC transporteur

NAD

NADP

ADP

ATP NAD kinase

NADPphosphatase

P

H2O

NADPH

NADH

Pyridine nt transhydrogenase

PntA

H+

H+

Metabolisme des nicotinate et nicotinamide

HJKMN

BCDI

3FeS

EFG

5FeS

NADHNAD+

Q

QH2

FMN

H+2H+

METABOLISME ENERGETIQUE

NuoG et NuoLNADH dehydrogenase

ATP synthase F1, γ su atpG

ATP

H+

OmpA like protein

Porine

OprE like protein

OprL Peptidoglycan- associated lipoprotein

Macromolecules

OM integrity Growth in low osmolarity

FliCflagellinlikeprotein

FlgC flagellar- basal body rod

protein

Surface adhesion protein

Mobilitt

é et adh

ésion - L lys tRNA -D lysine

Diaminopimelate epimerasedapF

Diaminopimelate decarboxylaselysA

-L lysine

BIOSYNTHESE DE LA

LYSINE

-L aspartate 2.3-dihydrodipicolinate -N acetyl- -2-L amino-6-oxopimelate

-N succinyl-2-amino6-oxopimelate

-N succinyl- -2 .6-L diaminopimelate

2.6-diaminopimelate

Meso-2 .6-diaminopimelate

Biosynthè sepepidoglycan

Cholest-4- -3-en one

CholesterolO2

H2O2

Cholesteroloxidase

Mé tabolisme des lipides

-3-UDP acylN-acetylglucosamine

DeacetylaselpxC

-3- -(3 )-UDP O hydroxite teradecanoyl) -Dglucosamine

- - -UDP N D acetylglucosamine

-3- -(3 -UDP O OH teradecanoyl) -Nacetylglucosamine

-3- -(3 -UDP O OH teradecanoyl) -DglucosamineLpxD

Lipide Adissacharide

BIOSYNTHESE DES LIPOPOLYSACCHARIDES

sedoheptulose

- -ADP L glycero- -Dmanno-heptose-ADP heptose--LPS

heptosyltransferaseIIwaaF

…(KDO2)(Hep1)- Lipide A

-3-CMP deoxy--D mannotulonate

…(KDO2)… lipide AKdtA

…(KDO2)(hep1) … lipide A

…(KDO2)(hep1) )(gal1-6) … lipide A

WaaG

WaaY

WaaP

WaaQ

WaaB

WaaA

LpxL

WaaC

Mé tabolisme des sucres aminés

Lipopolysaccharidemature

WbpD: -UDP2 3 3 3 -Man NAc NAC NAc N

acetyltransferase

WbpG:aminotransferase

Biosynthè se du LPS(hétéropolymè re de di à

pentasaccharides= - B Band )LPS

Organic solvanttolerance protein OstA/ Imp

Biosynthè se de l’enveloppe et division cellulaire

mraZ familly proteinOstA

Quinoprotein ethanol DH

Acetaldéhyde

AcetaldehydeDHAcetate

+NADH H +

ethanol

2H ++2e

Acetyl CoAtransferase

3- oxoacyl-( ) ACP

synthaseIII

HexadecanoateBiosynthè se

des acides gras

Acetyl-( )ACP

Aceto-acetyl-( )ACP

Malonyl-CoA

Malonyl-( )ACP

Acetyl CoA

-P dol -Man GDP

Manβ- -P dol

-N glycan

Mé tabolismes du fructose et du mannose

Dolichol- -P mannosyl transferase

1dpm

-L tyrosine

Hydroxyphenylpyruvatedioxygenase

4-hydroxyphenyLpyruvate

homogentisate

maleylacetoacetate

fumarylacetoacetate

acetoacetatefumarate

Tyr aminotransferase

DEGRADATION DE LA TYROSINE

Phenol

Dé gradation des acides grasà chainecourteDé gradation de la lysine

Fermentation

Cycle duglyoxylate

2- aminomuconic6-semialdehyde

4- hydroxy2- oxovaleric acid

2- aminomuconicacid semialdehyde DH AmnC

2-amino-phenol

2- aminomuconic acid

4- oxalo crotonic acid

2- oxopent4- enoic acid

Pyruvic acidAcetaldehyde

AcetylCoA

AmnBA

AmnD

AmnE

AmnF

AmnG

AmnH

DEGRADATION DES COMPOSES PHENOL

Mé tabolisme dupropanoate

Dé gradation de la lysine

Mé tabolisme des acides gras

Mé tabolisme du tryptophane

TCA

Succinyl CoA

sucD

Isocitrate

oxalosuccinate

cétoglutarate

succinate

Acide fumarique

Acide malique

aconitase

Isocitrate

dehydrogenase

Isocitrate dehydrogenase

Cetoglutarate

dehydrogenase Succinyl CoA

synthetase

Succinatedehydrogenase

fumarase

Malate quinoneoxidoreductase

mqo

2H

CO2

CoASH

CO2, 2H

+ GDP PiGTPCoASH

2H

H2O

2H

Mé tabolisme dubutanoate

Mé tabolisme de l’ alanine et del’aspartate

Mé 5tabolisme des acides dibasiques en C

Biosynthè se et dé gradation des composé s cétones

CoASH

citrate

Oxaloacetate Citratesynthase

Mé tabolisme des nucléotides

Interconversionsdes pentoses etglucuronates

Mé tabolisme eté pargne des sucres

-6-Glucose P

-1-Glucose P

Glyceraladhehyde-3-P

Glycerate-2-P

Pyruvate

PEP

Acetyl CoA-L lactate

Cycle des pentoses phosphate -6Fructose P

MltK, ATP bindingsu

MltZFructokinase

ATP

E F GK

MannitolGlucitol

Fructose

,Transport du mannitol arabitol and glucitolmtl

DÉ GRADATION DU BENZOATE

3-hydroxypimeloyl-coA

Benzoyl-CoA

2-cétocyclohexane1-carboxyl-coA

6- -2-oxo hydroxycyclohexane

1-carboxyl-coAAcyl- CoA

thioesté rase II

Pimeloyl-coA

Mé tabolisme de la phénylalanine

Dé gradation del’é thyl benzène

Ré sistance au nickel (opé ronnreAB)

NreA protein

Ré gulateur transcriptionnel GntR

Opé ron glutamate

Utilisation de l’histidine

Ré pression de la dé gradation des acides gras

Short chain DH Hypothetical /serin thré onine kinase

-N acetyl transferase Probable sensor histidine kinase Molybdopterine oxidoreductase

(COLD SHOCK PROTEINSDnaK, CspA)

TRANSCRIPTION ET TRADUCTION

( -3)Facteurs initiation de la traduction IFProteines ribosomales ( 1 , 11)L S

-Histone like protein(HupN) DNA methyltransferase

DNA primaseTransposase

QQQQQQQQQ™ QQ QQ QQQQQQQQQQQQQQQQ QQQQ QQQQQQ QQQQ QQQQQQQQQQ

QQQQQ QQQQQ.

30% de proté ines inconnues

Biosynthè se de l’histidine

1 -Dmyo-inositol-1P

1 -Dmyo-inositol-1 .3 .4 .5P

1-phosphatidyl-1 -D myo-inositol-4 .5biP

Phosphatidyl-1 -D myo-inositol

1-Phosphatidyl-1 -Dmyo-inositol-4 .5biP

Phosphatidyl inositol4- -5-P kinase

( 5 )PiP K

Inositol 1.2 .4 .5 .6 P

METABOLISME DU PHOSPHATE INOSITOL

Substrat ox Substrat red

NADP++NADPH H+TrxR

Proteine-S 2Proteine-( )SH 2

TrxR -( )SH 2TrxR -S 2

ThioredoxinetrxA

Biosynthè se des nt purines et pyrimidines

Voie d’ assimilation du sulfate

Voie desthioredoxines

Mé tabolisme duglyoxylate

OSMOREGULATION

Phosphatidylcholine

Phosphorylcholine

choline

Betain aldehyde

GlycineBetain

Dimethylglycine

MethylglycineSARCOSINE

glycine

-L serine

tRNA gly

Sarcosine oxidasesoxA

Mé tabolisme dessphingoglycolipides

Mé tabolisme du méthane

Mé tabolisme du soufre

. P C

Phosphorylcho . .P

Cho. , DH betA

Betain aldehydeDHbetB

B HMT

DMGO

SHMT

Mé tabolisme des purines

Biosynthè se LPS

-L proline -D proline

Prolineracemase

Ornithinecyclodeaminase

5-aminopentanoate

Dihydrolipoamide

dihydrolipoate-Dproline reductase

-L ornithine

DEGRADATION DE L’ORNITHINE

BIOSYNTHESE DES POLYAMINES

agmatine

aguB

-L arginine

ornithine

glutamate

speA

-N acetylPutrescine

CO2

Putrescine

-N carbamoyl putrescine

NH 4

Decarboxylated-S adenosylmethionine

dSAM

-S adenosylmethionineSAM

spermidine

aguA

AgmatinasespeB

speE

speD

CO2 + NH4 +

Spermidine-N acetyl transferase

speG

Urée

speC

acetate

PRPP

BIOSYNTHESE DES PURINES

ARN

ADN

ARN

ADN

GDP GTPATP

dGTPdATP

IMP XMP GMPAMPADP

adenosine inosine xanthosineguanosine

adenine hypoxanthine xanthine guanine

-5Ribose P

Ribosylamine-5P

-L glutamine

1-(5’ )phosphoribosyl-N formylglycinamide

FGAM

1-(5’ )phosphoribosyl5- aminoimidazole( )AIR

5 ’phosphoribosyl4-carboxy-5- aminoimidazole( )CAIR

AICAR

Phosphoribosyl Aminoimidazole mutasepurE

Phosphoribosyl aminoimidazole

carboxylasepurK

N5 -CAIR

purE

ATPHCO3

-

ADP

Experiments in triplicates

Dye swap

+-

II

Biosynthèse LPS

L-proline D-proline

Proline racemase

Ornithine cyclodeaminase

5-aminopentanoate

Dihydrolipoamide

dihydrolipoateD-proline reductase

L-ornithine

DEGRADATION DE L’ORNITHINE

BIOSYNTHESE DES POLYAMINES

agmatine

aguB

L-arginine

ornithine

glutamate

speA

N-acetyl Putrescine

CO2

Putrescine

N-carbamoylputrescine

NH4

Decarboxylated S-adenosylmethionine

dSAM

S-adenosylmethionineSAM

spermidine

aguA

Agmatinase speB

speE

speD

CO2 + NH4+

Spermidine N-acetyl transferase

speG

Urée

speC

acetate

H+

ATP

Nitrate reductase

nosF copper processing,

ATP/GTP binding protein

Denitrification

H+

Drug

AcrA like protein

Resistance-Nodulation-Division efflux system (RND)

OprB like protein

Glucosecarbohydrates

Carbohydrate-selective porin H+

Drug

OprM like protein

Membrane efflux Protein (OEP)

Na+/H+ antiporter

Na+

Major Facilitator Superfamily (MFS)

ara

H+

Putative arabinose-proton

symporter

Small solutes

H+, Pi

Putative MFS

H+, Pi

ATP

Ferrichrome or CopperABC transporter

Putative Transmenbrane oxidoreductase

PbD sequestration protein

ATP

T

AB

C

Pb(II)D

Pb(II)

Pb(II)

ATPABC transporteur

NAD

NADP

ADP

ATP NAD kinase

NADPphosphatase

P

H2O

NADPH

NADH

Pyridine nt transhydrogenase

PntA

H+

H+

Metabolisme des nicotinate et nicotinamide

HJKMN

BCDI

3FeS

EFG

5FeS

NADHNAD+

Q

QH2

FMN

H+2H+

METABOLISME ENERGETIQUE

NuoG et NuoLNADH dehydrogenase

ATP synthase F1, γ su atpG

ATP

H+

OmpA like protein

Porine

OprElike protein

OprL Peptidoglycan-associated lipoprotein

Macromolecules

OM integrity Growth in low osmolarity

FliC flagellin like protein

FlgC flagellar basal-body rod protein

Surfaceadhesion protein

Mob

ilitt

é et

adh

ésio

n

Métabolisme du glyoxylate

OSMOREGULATION

Phosphatidyl choline

Phosphoryl choline

choline

Betain aldehyde

Glycine Betain

Dimethylglycine

MethylglycineSARCOSINE

glycine

L-serine

tRNA gly

Sarcosine oxidase soxA

Métabolisme des sphingoglycolipides

Métabolisme du méthane

Métabolisme du soufre

P. C

Phosphorylcho. P.

Cho. DH, betA

Betain aldehyde DH betB

B HMT

DMGO

SHMT

Métabolisme des purines

2-aminomuconic 6-semialdehyde

4-hydroxy 2-oxovaleric acid

2-aminomuconicacid semialdehyde DH AmnC

2-amino-phenol

2-aminomuconic acid

4-oxalo crotonic acid

2-oxopent 4-enoic acid

Pyruvic acidAcetaldehyde

AcetylCoA

AmnBA

AmnD

AmnE

AmnF

AmnG

AmnH

DEGRADATION DESCOMPOSES PHENOL

P-dol Man-GDP

Manβ-P-dol

N-glycan

Métabolismes du fructose et du mannose

Dolichol-P-mannosyl transferase

dpm1

Quinoprotein ethanol DH

Acetaldéhyde

Acetaldehyde DHAcetate

NADH+H+

ethanol

2H++2e

Acetyl CoA transferase

3-oxoacyl-(ACP)

synthase III

HexadecanoateBiosynthèse

des acides gras

Acetyl-(ACP)

Aceto-acetyl-(ACP)

Malonyl-CoA

Malonyl-(ACP)

Acetyl CoA

1D-myo-inositol-1P

1D-myo-inositol-1.3.4.5P

1-phosphatidyl-1D-myo-inositol-4.5biP

Phosphatidyl-1D-myo-inositol

1-Phosphatidyl-1D-myo-inositol-4.5biP

Phosphatidyl inositol4-P-5-kinase

(PiP5K)

Inositol 1.2.4.5.6P

METABOLISME DU PHOSPHATE INOSITOL

Métabolisme du propanoate

Dégradation de la lysine

Métabolisme des acides gras

Métabolisme du tryptophane

TCA

Succinyl CoA

sucD

Isocitrate

oxalosuccinate

cétoglutarate

succinate

Acide fumarique

Acide malique

aconitase

Isocitrate dehydrogenase

Isocitrate dehydrogenase

Cetoglutarate dehydrogenaseSuccinyl CoA

synthetase

Succinate dehydrogenase

fumarase

Malate quinone oxidoreductase

mqo

2H

CO2

CoASH

CO2, 2H

GDP + PiGTPCoASH

2H

H2O

2H

Métabolisme du butanoate

Métabolisme de l’alanine et de l’aspartate

Métabolisme des acides dibasiques en C5

Biosynthèse et dégradation des composés cétones

CoASH

citrate

Oxaloacetate Citrate synthase

Métabolisme des nucléotides

Interconversions des pentoses et glucuronates

Métabolisme et épargne des sucres

Glucose-6-P

Glucose-1-P

Glyceraladhehyde-3-P

Glycerate-2-P

Pyruvate

PEP

Acetyl CoAL-lactate

Cycle des pentoses phosphate Fructose-6P

MltK, ATP binding su

MltZFructokinase

ATP

E

F G

K

MannitolGlucitol

Fructose

Transport du mannitol, arabitol and glucitol mtl

DÉGRADATION DU BENZOATE

3-hydroxypimeloyl-coA

Benzoyl-CoA

2-cétocyclohexane1-carboxyl-coA

6-oxo-2-hydroxycyclohexane

1-carboxyl-coAAcyl-CoA

thioestérase II

Pimeloyl-coA

Métabolisme de la phénylalanine

Dégradation de l’éthyl benzène

Substrat ox Substrat red

NADP+NADPH+H+TrxR

Proteine-S2Proteine-(SH)2

TrxR-(SH)2TrxR-S2

Thioredoxine

trxA

Biosynthèse des nt purines et pyrimidines

Voie d’assimilation du sulfate

Voie des thioredoxines

PRPP

BIOSYNTHESE DES PURINES

ARN

ADN

ARN

ADN

GDP GTPATP

dGTPdATP

IMP XMP GMPAMPADP

adenosine inosine xanthosine guanosine

adenine hypoxanthine xanthine guanine

Ribose-5P

Ribosylamine-5P

L-glutamine

1-(5’phosphoribosyl)N-formylglycinamide

FGAM

1-(5’phosphoribosyl)5-aminoimidazole (AIR)

5’phosphoribosyl4-carboxy-5-aminoimidazole (CAIR)

AICAR

Phosphoribosyl Aminoimidazole mutase purE

Phosphoribosyl aminoimidazole

carboxylasepurK

N5-CAIR

purE

ATPHCO3

-

ADP

L-lys tRNA

L-tyrosine

Hydroxyphenylpyruvate dioxygenase

4-hydroxyphenyLpyruvate

homogentisate

maleylacetoacetate

fumarylacetoacetate

acetoacetate fumarate

Tyr amino transferase

DEGRADATION DE LA TYROSINE

Phenol

Dégradation des acides gras à chaine courteDégradation de la lysine

Fermentation

Cycle du glyoxylate

D-lysine

Diaminopimelate epimerase dapF

Diaminopimelate decarboxylase lysA

L-lysine

BIOSYNTHESE DE LA LYSINE

L-aspartate 2.3-dihydrodipicolinate N-acetyl-L-2-amino-6-oxopimelate

N-succinyl-2-amino6-oxopimelate N-succinyl-L-2.6-diamino

pimelate

2.6-diaminopimelate

Meso-2.6-diaminopimelate

Biosynthèse pepidoglycan

Cholest-4-en-3-one

CholesterolO2

H2O2

Cholesterol oxidase

Métabolisme des lipides

UDP-3-acylN-acetylglucosamine Deacetylase lpxC

UDP-3-O-(3hydroxite)-teradecanoyl) D-glucosamine

UDP-N-D-acetylglucosamine

UDP-3-O-(3OH-teradecanoyl)N-acetylglucosamine

UDP-3-O-(3OH-teradecanoyl) D-glucosamine

LpxD

Lipide A dissacharide

BIOSYNTHESE DES LIPOPOLYSACCHARIDES

sedoheptulose

ADP-L-glycero-D-manno-heptose

ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II

waaF

…(KDO2)(Hep1)-Lipide A

CMP-3-deoxy-D-mannotulonate

…(KDO2)…lipide AKdtA

…(KDO2)(hep1) …lipide A

…(KDO2)(hep1) )(gal1-6) …lipide A

WaaGWaaYWaaPWaaQWaaB

WaaALpxLWaaC

Métabolisme des sucres aminés

Lipopolysaccharide mature

WbpD: UDP-Man2NAc3NAC3NAc3N-acetyltransferase

WbpG: aminotransferase

Biosynthèse du LPS (hétéropolymère de di à

pentasaccharides = B- Band LPS)

Organic solvant tolerance protein

OstA/Imp

Biosynthèse de l’enveloppe et division cellulaire

mraZ familly protein

OstA

Ammonia monoxygenase

amoA

NH3

METABOLISME DE L’AZOTE

hydroxylamine

H2O

NO2-

(nitrite)

4H,H+

Résistance au nickel (opéron nreAB)

NreA protein

Régulateur transcriptionnel GntR

Opéron glutamate

Utilisation de l’histidine

Répression de la dégradation des acides gras

Short chain DH Hypothetical serin/thréonine kinase

N-acetyl transferase Probable sensor histidine kinaseMolybdopterine oxidoreductase

COLD SHOCK PROTEINS (DnaK, CspA)

TRANSCRIPTION ET TRADUCTION

Facteurs initiation de la traduction (IF-3)Proteines ribosomales (L1, S11)

Histone-like protein (HupN)DNA methyltransferase

DNA primaseTransposase

Polyamines Polyamines metabolismmetabolism

OsmoregulationOsmoregulation

Purines Purines biosynthesisbiosynthesis

TransportersTransporters

Unknown putative Unknown putative regulatorsregulators

LPS biosynthesis & LPS biosynthesis & motilitymotility

Peptidoglycan Peptidoglycan biosynthesisbiosynthesis

Lipids metabolismLipids metabolism

Oxidative Oxidative phosphorylationphosphorylation

Citric acid cycleCitric acid cycle

Stenotrophomonas maltophilia

Sélénites 10 mM

Tellurites 200 µg/ml

CdCl2 500 µM EDXESEM/MET

363 mmol/g cellules363 mmol/g cellules

≈ ≈ 4% de la biomasse cellulaire4% de la biomasse cellulaire

1 mM

ZnSO4

Apparition d ’un composé thiolé soluble de façon proportionnelle, et spécifique au Zn et au Cd (en cours de caractérisation)

cystéine, spécifique au cadmium

50 M

500 M

0

CdCl2

cys

Dosages en HPLC

Cd Co, Zn, Ni, Ag, Pb, Hg,

sélénites

Composés thiolés solubles cellulaires

SC777 TSA/10 Cd 500 µM

SC777 TSA/10

Métabolome des composés soufrés

0 1 2 3 4 5 6

Fonction de distribution radiale

R(Å)

CdS

CdCO

3

Cd-acétate

Cd-(OH)

2

TSA

LUM-

LUM+

paire atomique

Cd-O

paire atomique

Cd--Cd

paire atomique

Cd-S

Culture sur milieu solide + 500 Culture sur milieu solide + 500 M de CdClM de CdCl22

CdSCdS

Spéciation du cadmium

Sur milieu solide, la 1ère sphère de coordination du Cd est composée de 4 atomes de S à une distance de 2.53 Å qui correspond au CdSCdS

Sur milieu liquide 20% du Cd est sous forme de CdS et le reste sous forme

de Cd-O octaédrique

Formation de colonies jaunes en présence de Cd

TSA + 500 M de CdCl2TSA

Culture sur milieu liquide + 500 Culture sur milieu liquide + 500 M de CdClM de CdCl22

Culture sur milieu liquide + 500 Culture sur milieu liquide + 500 M de CdClM de CdCl22

Lumière continueLumière continue

Personnes impliquéesPersonnes impliquées

Jérome Rose (CNRS, CEREGE) : Spéciation du cadmium, analyses EXAFS, XANES

Christophe Junot (CEA, Sacay) : Caractérisation du composé thiolé par MS

Patrick Carrier (LEP, CEA) : Dosage du cadmium et autres par ICP optique

Stéphane Cuiné (LEP, CEA) : Analyse des composés thiolés solubles

Xavier Gidrol; Pascal Soularue (SGF, CEA Evry) : Production des puces à ADN

Laboratoire d’Écologie Microbienne de la Rhizosphère, DEVM

Delphine Pagès

Sandrine Conrod

Lisa Sanchez

Wafa Achouak