Keanekaragaman Jenis Teripang di

Fafanlap dan Gamta, Kepulauan Misool

dan Uji Aktivitas Kandungan Senyawa

Kimia pada Teripang Pasir, Kabupaten

Raja Ampat

Tesis

Diajukan kepada

Program Studi Magister Biologi

untuk Memperoleh Gelar Master Sains Biologi (M.Si)

Oleh:

Rahman Rumlus NPM: 422012112

Program Studi Magister Biologi Universitas Kristen Satya wacana

Salatiga 2014

LEMBAR PENGESAHAN

Judul Tesis : Keanekaragaman Jenis Teripang di Fafanlap dan Gamta, Kepulauan Misool dan

Uji Aktivitas Kandungan Senyawa Kimia pada Teripang

Pasir, Kabupaten Raja Ampat Nama Mahasiswa : Rahman Rumlus

NPM : 422012112

Program Studi : Magister Biologi

Menyetujui,

Prof. Dr. Ir. Haryono Semangun

Pembimbing I

Prof. Ocky Karnaradjasa, M.Sc., Ph.D

Pembimbing II

Jubhar C. Mangimbulude, Ph.D.

Pembimbing III

Mengesahkan,

Ketua Program Studi Magister Biologi

Jubhar C. Mangimbulude, Ph.D.

Dinyatakan Lulus Ujian Tanggal: ______________________

PERNYATAAN KEASLIAN KARYA TULIS TESIS

Yang bertanda tangan di bawah ini,

Nama : Rahman Rumlus

NPM : 422012112 Program Studi : Magister Biologi Fakultas : Biologi

Menyatakan dengan sesungguhnya bahwa tesis dengan

judul:

Keanekaragaman Jenis Teripang di Fafanlap dan

Gamta, Kepulauan Misool dan Uji Aktivitas

Kandungan Senyawa Kimia pada Teripang Pasir,

Kabupaten Raja Ampat

yang dibimbing oleh: 1. Prof. Dr. Ir. Haryono Semangun2. Prof. Ocky Karnaradjasa, M.Sc., Ph.D.

3. Jubhar C. Mangimbulude, Ph.D.

adalah benar-benar hasil karya saya.

Di dalam laporan tesis ini tidak terdapat keseluruhan

atau sebagian tulisan atau gagasan orang lain yang saya ambil dengan cara menyalin atau meniru dalam bentuk rangkaian kalimat atau gambar serta simbol

yang saya akui seolah-olah sebagai karya saya sendiri tanpa memberikan pengakuan pada penulis atau

sumber aslinya.

Salatiga, 28 Agustus 2014

Yang memberi pernyataan,

Rahman Rumlus

PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI TESIS UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS

Sebagai sivitas akademika Universitas Kristen Satya Wacana (UKSW), saya yang bertanda tangan di bawah ini:

Nama : Rahman Rumlus

N P M : 422012112

Program Studi : Magister Biologi

Fakultas : Biologi

Jenis Karya : Tesis

demi untuk pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui

untuk memberikan kepada UKSW Hak bebas royalty

nonekslusif (non-exclusive royalty free right) atas karya

ilmiah saya berjudul :

“Keanekaragaman Jenis Teripang di Fafanlap dan

Gamta, Kepulauan Misool dan Uji Aktivitas

Kandungan Senyawa Kimia pada Teripang Pasir,

Kabupaten Raja Ampat”

Beserta perangkat yang ada (jika diperlukan).

Dengan hak bebas royalty noneksklusif ini, UKSW berhak

menyimpan, mengalihformatkan, mengelola dalam bentuk

data, merawat, dan memublikasikan tugas akhir saya,

selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis.

Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenar-benarnya.

Dibuat di : Salatiga

Pada tanggal : 28 Agustus 2014

Yang menyatakan,

Rahman Rumlus

Mengetahui,

Prof. Dr. Ir. Haryono Semangun

Pembimbing I

Prof. Ocky Karnaradjasa, M.Sc., Ph.D

Pembimbing II

Jubhar C. Mangimbulude, Ph.D.

Pembimbing III

i

Abstrak

Penelitian dilakukan di perairan Kampung Fafanlap Distrik Misool Selatan dan Kampung Gamta Distrik Misool Barat, Kabupaten Raja Ampat. Dan Penelitian di Laboratorium Terpada Universitas Diponigoro Semarang (UNDIP) Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kelimpahan, dan komposisi jenis, dan indeks keragaman jenis teripang di perairan kampung Fafanlap dan Gamta dan mengetahui potensi teripang pasir yang berasal dari Fafanlap sebagai sumber senyawa anti bakteri Escherichia coli dan Staphylococcus aureus serta mengetahui kandungan senyawa yang ada pada teripang pasir (Holothuria scabra). Teripang merupakan kelompok jenis holothuroidea yang dieksploitasi sebagai salah satu produk perikanan untuk diperdagangkan. Pengamatan ini dilakukan pada bulan Mei, Juni, September, dan Oktober 2013. Contoh pengambilan teripang dilakukan dengan menggunakan snorkling.Metode transek yang berukuran 25 m yang diletakkan sejajar garis pantai yang berukuran 2x100 meter.dan sampel diambil secara acak atau manta taw,setiap transek hanya diambil 3 sampel,sampel diambil di daerah litoral pada 2 lokasi: Fafanlap dan Gamta, Analisis terhadap struktur komunitas berdasarkan empat indeks ekologis yaitu komposisi, kepadatan, keanekaragaman jenis, dan kelimpahan. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa di lokasi perairan kampung Fafanlap ditemukan dua jenis yaitu teripang pasir (H. scabra) dan teripang getah (H. vacabunda), dan di lokasi Gamtahanya di temukan satu jenis yaitu teripang getah (H. scabra) kedua jenis teripang tersebut yang berasal dari suku Holothuriidea. Oleh karena itu kekayaan jenis, kelimpahan, dan komposisi teripang di perairan Fafanlap dan Gamta relatif sedikit atau sangat rendah.Variasi indeks ekologi pada kedua lokasi relative kecil. Hasil uji aktifitas yaitu teripang pasir (H. scabra) yang berasal dari perairan kampung Fafanlap mengandung senyawa yang berpotensi sebagai anti-bakteri Escherichia coli dan Staphylococcus aureus serta mengandung senyawa golongan Flavanoid, saponin, steroid, dan triterpenoid.

Kata kunci: Teripang Pasir, keanekaragaman anti bakteri, senyawa kimia jenis teripang

ii

Abstract

The study was conducted in the waters of South Misool Kampung Fafanlap District and Village Gamta District West Misool, Raja Ampat. Laboratory and Research at the University Terpada Diponigoro Semarang (UNDIP) This study aims to determine the abundance and species composition, and species diversity index of sea cucumbers in the waters and Gamta Fafanlap village and know the potential of the sand sea cucumbers originating from Fafanlap as a source of antibacterial compounds Escherichia coli and Staphylococcus aureus as well as knowing the content of compounds that exist in the sand sea cucumber (H. scabra). Sea cucumbers Holothuroidea is a type of group that is exploited as one fishery products to be traded. This observation was conducted in May, June, September, and October 2013 Sample collection is done by using snorkeling sea cucumbers. Method of measuring 25 m transects were laid parallel to the coastline measuring samples taken randomly 2x100.dan or manta taw, each transect only taken 3 samples, samples taken in the littoral area in 2 locations: Fafanlap and Gamta, Analysis of community structure based on four ecological indices, namely the composition, density, species diversity, and abundance. The results obtained showed that the location of the village waters Fafanlap found two types of sand sea cucumbers (H. scabra) and cucumber sap (H. vacabunda), and at the location Gamta only found one type of the sea cucumber sap (H. vacabunda) both types of sea cucumbers is derived from the tribe Holothuriidea. Therefore, species richness, abundance, and composition of sea cucumbers in the waters Fafanlap and Gamta relatively little or very lace. Ecological index variation at both locations relatively small. The results of the activity test sand sea cucumbers (H. scabra) derived from the village Fafanlap waters contain compounds that have potential as anti-bacteria Escherichia coli and Staphylococcus aureus as well as the class of compounds containing flavonoids, saponins, steroids and triterpenoids. Key words: Sand Sea cucumber, anti bacterial diversity, the chemical types of sea cucumbers.

iii

Prakata

Pertama-tama Penulis panjatkan puji

serta rasa syukur kehadirat Allah, Tuhan

Semesta Alam yang telah mencurahkan

limpahan Rahmat dan nikmatNya, sehingga

dalam penulisan tesisi ini dapat terselesaikan.

Kedua, Penulis ucapkan terimakasih kepada

Ibuku Hafsa Rumatela dan Ayahku Majid

Rumlus, Ibu mertuaku Sujila dan Ayah

mertuaku Almarhum Wiji Taruno. Istriku

Suryaningsih, putraku Taufiqurahman Rumlus,

dan putriku Aisyah Raniyah Rahman Rumlus

yang telah memberikan semangat dalam

penyelesaian tesis ini.

Penulis mengucapkan terimakasih

dan apresiasi terbaik atas selesainya penelitian

dan penulisan tesis ini, kepada yang saya

banggakan:

1. Prof. Dr. Ir. Haryono Semangun,

2. Prof. Ocky Karna Radjasa,

3. Christian Jubhar Mangimbulude, Ph.D,

4. Dr. Ir. Martanto Martosupono,

iv

Yang telah dengan sabar, tekun dan teliti dalam

memberikan bimbingan, arahan, serta

pencerahan.

Ucapan terimakasih juga penulis

sampaikan kepada:

1. Kementrian Pendidikan dan Kebudayaan

(Kemendikbud) yang telah memberikan

bantuan Bea Siswa Unggulan.

2. Pemerintah Kabupaten Raja Ampat, yang

telah memberikan bantuan bea Siswa

melalui Dinas Pendidikan Kabupaten Raja

Ampat;

3. Dinas Pendidikan, Kabupaten Raja Ampat

yang telah memberi izin studi;

4. Handung Nuryadi yang telah membantu

memberikan pelatihan Microbiologi dan Bio-

teknologi Laut dan menyediakan

laboratorium untuk penelitian;

5. Seluruh Staf Akademik Program

Pascasarjana Magister Biologi UKSW

Salatiga;

6. Seluruh Petugas loboratorium Magister

Biologi UKSW Salatiga;

v

7. Seluruh staf petugas, pengelolah

laboratorium Terpadu UNDIP Semarang;

8. Teman-teman S2 Program Pascasarjana

Magister Biologi UKSW Salatiga;

9. TNC Cabang Misool Selatan Kabupaten Raja

Ampat yang telah membatu memvasilitasi

dalam penelitian ini;

10. Wahid Macap yang telah membantu

memvasilitasi alat transportasi dalam

penelitian;

11. Serta semua pihak yang tidak bisa penulis

menyebut satu-persatu yang telah

memberikan andil dalam penyelesaiyan tesis

ini.

Penulis sangat menyadari bahwa

dalam tesis ini masih jauh dari sempurna, maka

kritik, saran, dan koreksi penulis sangat

mengharapkan demi kesempurnaan tesis ini.

Akhirnya penulis berharap semoga tesis ini

dapat bermanfaat bagi pengembangan ilmu

pengetahuan. Amin Yarabbal Alamin.

Salatiga, 15 Agustus 2014

P e n u l i s

vi

Daftar Isi

Abstrak .................................................................. i

Prakata ................................................................... ii

Daftar Isi ............................................................... v

I. Pengantar ..................................................... 1

A. Latar Belakang ........................................ 1

B. Perumusan Masalah ................................ 6

C. Tujuan ..................................................... 7 D. Manfaat ................................................... 8

II. Tinjuan Pustaka ........................................... 9

A. Pengertian Teripang ................................... 9 B. Morofologi dan Klasifikasi Teripang ............ 10

C. Habitat dan Penyebaran Teripang .............. 15

D.Parameter Fisika dan Kimia Perairan ........ 17 III. Metode Penelitian ......................................... 34

A. Waktu dan Lokasi Penelitian ..................... 34

B. Alat dan Bahan .......................................... 36 C. Prosedur Pengukuran Kualitas Air Laut ..... 37

D.Penelitian Farmakologi .............................. 37

E. Prosedur Uji Aktivitas ............................... 38

F. Prosedur Uji Fitokimia/Zookimia .............. 39 G.Analisi Data .............................................. 49

IV. Hasil dan Pembahasan ................................. 41

A. Hasil Penelitian Ekologi ............................. 41 B. Pembahasan Penelitian Ekologi ................. 48

C. Hasil Uji Aktivitas ..................................... 52

D.Hasil Uji Fitokimia/Zookimia .................... 54 E. Pembahasan Penelitian Laboratorium ....... 58

V. Kesimpulan .................................................. 64

A. Kesimpulan ............................................... 64 B. Saran ........................................................ 65

Daftar Pustaka ............................................. 67

Lampiran ...................................................... 77