Upload
tarynuryana
View
121
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Pendek peptidoglikan pengakuan protein (PGRP-S) adalah salah satu dari sistem kekebalan bawaan pada mamalia.
PGRP-S yang ditemukan dari Camelus dromedarius (CPGRP-S) sangat ampuh melawan infeksi bakteri.
Karena mampu mengikat berbagai patogen yang terkait pola molekul (PAMPs) termasuk lipopolisakarida (LPS), lipoteichoic acid (LTA) dan peptidoglikan (PGN).
Heparin-seperti polisakarida juga telah diamati pada beberapa bakteri seperti kapsul K5 Escherichia Coli hingga membuat mereka relevan untuk menentukan sifat interaksi mereka dengan CPGRP-S.
Studi pengikatan CPGRP-S dengan disakarida heparin dalam larutan menggunakan permukaan resonansi plasmon memberikan nilai 3,3 × 10-7 M untuk konstanta disosiasi (Kd).
Struktur heparin yang terikat CPGRP-S ditentukan pada resolusi 2.8A mengungkapkan adanya sebuah molekul heparin terikat dalam kantong ikatan CPGRP-S.
Yang ditemukan tertanam erat pada protein dengan bantuan beberapa ion dan interaksi ikatan hidrogen.
Tiga kelompok sulfat dari Heparin S1 , S2 dan S3 telah ditemukan berinteraksi dengan residu, Arg-31, Lys-90, Thr-97, Asn-99 Asn-140, Gln-150 dan Arg-170 dari CPGRP-S.
Tempat pengikatan terdiri dari dua sub tempat , yaitu SI dan S-II dengan struktur cleftlike.
Disakarida Heparin terikat dalam sub tempat S-I.
Sebelumnya , menentukan struktur kompleks dari CPGRP-S dengan LPS , LTA dan PGN juga memperlihatkan bahwa gugus glycan mereka juga diadakan pada sub tempat SI yang menunjukkan bahwa disakarida heparin juga merupakan elemen penting bagi pengakuan oleh CPGRP-S.