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Jornada Técnica de la Red Española de SupercomputaciónZaragoza, Julio 2010
ÍndiceÍndice
1.¿Qué es el BIFI?2.Investigación 3.Área de Computación
¿Qué es el BIFI?¿Qué es el BIFI?
¿Qué es el BIFI?
•El BIFI es un Instituto de Investigación Universitario de la Universidad de Zaragoza
•Objetivo: Aunar esfuerzos de Físicos, Químicos, Bioquímicos, Informáticos, en torno al estudio de proteínas, propiedades de la materia y desarrollo de ordenadores
•Dotar a los grupos de investigación de las herramientas necesarias para una investigación puntera y de calidad: laboratorios, ordenadores, reuniones, colaboraciones, etc.
•Vocación de actuar como centro en Red: Investigadores de Aragón, España y del resto del mundo.
•Gestado en la Facultad de Ciencias, Incialmente en el Edificio Cervantes. Nuevo Edificio en el Campus Río Ebro
•El BIFI es un centro de Excelencia en Aragón, con reconocimiento en los grupos de investigación internacionales de nuestro campo
•Importante peso específico en proyectos Autonómicos, Nacionales, Internacionales y de Transferencia
¿Qué es el BIFI?
•Bioquímica: Estudio de Protéinas, estabiliadad e interacción protéina-ligando, desarrollo de fármacos.
•Física: Materiales magnéticos, Sistemas Complejos, Redes Sociales, Transporte Cuántico.
•Computación: Supercomputación, Tecnologías GRID, Computación Voluntaria, Ordenadores dedicados basados en FPGAs, ASIC, GPU, etc.
¿Qué es el BIFI? ¿Qué es el BIFI? ¿Qué es el BIFI?
¿Qué es el BIFI? ¿Qué es el BIFI? ¿Qué es el BIFI?
Subvenciones Directas
500.000 Euros
¿Qué es el BIFI?
Instituto Universitario de Biocomputación y Física de Sistema Complejos
Equipo de Gobierno
MiembrosDel BIFI
100 personasadscritas de
Unizar, Españay otros países
Secretario,Director y
Subdirectora
Investigación en Bioquímica
•Interacción Proteína Ligando
•Estabilidad y Plegamiento de Proteínas
•Interacción Proteína-ADN y
Regulación Genética
•Biología Molecular y Cristalografía
Investigación en Bioquímica
•Materiales Complejos y Física Fundamental
•Redes Complejas y Sociedad
•Transporte y Computación Cuántica
•Computación y Supercomputación
Investigación en Física
COMPUTACIÓN
Supercomputación
Grid Computing
Computaciónvoluntaria
Ordenadoresdedicados
Visualizacióncientífica
Área de Computación
Nodo de la RES
Centro de Computación
Terminus
~ 600 procs x86_64
12TB en RAID5 sobre Lustre
Gigabit Ethernet + Infiniband
~75% hosted clusters!
Centro de Computación
GRID
NGIARAGRIDPIREGRID
Ordenadores Dedicados
Janus: Basado en FPGAs (MC Spin Glasses)BIFI,I3A,Ferrara, RomaEurotech
Janus II (FEDER) (Nuevas Aplicaciones)BIFI,I3A,Ferrara,Roma+nuevos sociosEurotech+nuevos socios
Computacion Voluntaria
ZIVIS Local (Ayto. Zaragoza,CIEMAT)
Ibercivis España y PortugalCSIC,Ceta,RedIRIS,(DGA,Ibercaja, Ayto Zaragoza…)
• Es el nodo del CECAM en España• Ubicado en el Edificio de Institutos• Colaboración estrecha con el BIFI en la fase inicial• Director: Michel Mareschal
ZCAM
Altix UV BIFI-ZCAM512-1024 procs Intel Xeon 7500 series
1-2 TB shared RAMNUMAlink (BW=120 Gb/s, Lat= <1µs)
P R Ó X I M A M E N T E . . .
(o equivalente)
(o equivalente)
All AtomsQ.M.
Matrices
DFTFluidos
Matrices Dispersas
LGT
Monte Carlo
Par. Tem
Spin ModelsFusion
Docking
ZCAM x x x x xCaesarAugusta x x x xTerminus x x xGRID x xIbercivis x
Rango de Aplicaciones
3D y Realidad Virtual
•Herramienta de Visualización Científica•Difusión y Divulgación
Red Española de Supercomputación
Red e-ciencia
CSIC: Rocasolano, Severo Ochoa, IFCA
Ciemat: Laboratorio Nacional de Fusión y Ceta-Ciemat
Universidades:Madrid, Extermadura, Ferrara, Roma, California, Toulouse, Pau...
National (NGI) and European (EGI) Grid Initiatives
Eurotech, HP
Área de Computación: Colaboraciones Científico-Tecnológias
Guillermo Losilla, Arturo Giner, Javier Alcazar (HPC)
Rubén Vallés, Jaime Ibar, Patricia Santos (GRID)
Alejandro Rivero, Gonzalo Ruiz, Juanjo Molinero, Dario Ferrer,
Francisco Sanz, Alfredo Ferrer (Ibercivis)
Jose Miguel Reynolds, Cristina Viñas (3D)
Jorge Monforte, Raquel Álvarez, Jose Miguel Gil (Janus)
Fermin Serrano, Elisa Cauhé (Proyectos I+D+i)
Isabel Vidal, Beatriz Antolí (Administración)
Personas Área de Computación