RESUMEN ACTIVIDADES ACADÉMICAS

Instituto de Biología Funcional y Genómica

CURSO 2015-2016

Instituto de Biología Funcional y Genómica

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El IBFG

El Instituto de Biología Funcional y Genómica (IBFG) es un Centro Mixto de investigación de titularidad compartida entre el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y la Universidad de Salamanca (USAL).

Con la denominación de Instituto de Microbiología-Bioquímica (IMB), fue fundado en los años 1970 por el Prof. Julio R. Villanueva, catedrático de Microbiología y ex-Rector de la USAL, siendo uno de los primeros institutos mixtos de investigación entre el CSIC y la Universidad española. Estrechamente unido a la creación del antiguo Departamento de Microbiología de la Facultad de Biología de la USAL, el IMB tuvo su sede inicial en el edificio de la Facultad de Ciencias del campus de La Merced y, posteriormente, en el edificio Departamental del campus Miguel de Unamuno.

Desde su fundación hasta 1985, el IMB estuvo dedicado a la investigación y a la formación de PDI principalmente en el área de la Microbiología y a partir de entonces comienza a consolidar sus grupos y líneas de investigación en las áreas de Biología Molecular y Celular. Utilizando mayoritariamente los microorganismos como modelo de estudio, el IMB se convirtió en un centro de referencia en el campo de la morfogénesis en hongos y levaduras, formando a un buen número de profesionales que aplicaron sus conocimientos para la creación de muchos grupos de trabajo en otras Universidades o Centros del Consejo Superior de Investigaciones Científicas. En 2004, CSIC y USAL deciden desvincular el Departamento de Microbiología y Genética del IMB, permaneciendo éste como centro mixto de investigación.

En marzo de 2012 el IMB se traslada a una nueva sede propia, situada en una parcela próxima al campus Miguel de Unamuno, en la proximidad del Instituto de Neurociencias de Castilla y León (INCyL). La gestión durante el periodo 2004-2012 del Director del Instituto, el Dr. Ángel Durán (Investigador Científico del CSIC), fue fundamental en las actuaciones que derivaron tanto en la consecución del nuevo Centro como en su puesta en funcionamiento.

Con el cambio de ubicación, el IMB cambia a su denominación actual de Instituto de Biología Funcional y Genómica (IBFG), con la intención de permitir una diversificación y actualización de las áreas de estudio e incorporar grupos de trabajo que utilicen otros sistemas biológicos distintos de los microbianos. Su línea general de investigación refleja el interés actual del Centro en estudiar los mecanismos reguladores de las funciones celulares y su integración en el contexto del genoma a través de aproximaciones metodológicas avanzadas de biología celular, molecular y genómica, estructurándose en tres unidades básicas: I. Morfogénesis y polaridad celular, II. Dinámica del genoma y epigenética, y III. Regulación génica y diferenciación celular.

El IBFG dispone de 26 laboratorios de investigación y con una red de servicios de apoyo a la investigación que incluye administración, gerencia, compras y almacén, preparación de medios y reactivos, cultivos celulares, informática, protección radiológica y la unidad de servicios técnicos e infraestructura. En la actualidad trabajan alrededor de 130 personas incluyendo investigadores y profesores de plantilla del CSIC y de la USAL, doctores contratados, becarios y contratados realizando su tesis doctoral, técnicos de apoyo a la investigación, y otros profesionales dedicados a la administración y mantenimiento del Centro. El personal se distribuye en 21 grupos de investigación, integrados en las tres Unidades de Investigación, y en una unidad de apoyo administrativo y técnico.

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El IBFG: Organigrama

Director Sergio Moreno

Vicedirectores Pilar Pérez Francisco del Rey

Gerencia Alegría García

Junta de Instituto Director Sergio Moreno

Vicedirectores Pilar Pérez

Francisco del Rey

Gerente Alegría García

Jefe Unidad I Carlos R. Vázquez de Aldana

Jefe Unidad II Rosa Esteban

Jefe Unidad III Mercedes Tamame

Representantes del personal Margarita Díaz (personal docente) Pedro San Segundo (personal científico) Yolanda Arnáiz (personal de apoyo) Irene Arcones (personal científico predoctoral) Santiago Cavero (personal científico postdoctoral)

Claustro Científico Personal docente y/o investigador permanente

con grado de doctor, adscrito al IBFG

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El IBFG: Unidades de investigación

 

El IBFG está organizado en tres unidades de investigación o departamentos: Unidad I. Morfogénesis y polaridad celular La característica más evidente de los organismos es su forma, la cual está directamente relacionada con su adaptación al medio en el que viven. Esta relación entre la estructura y la función se mantiene a todos los niveles de la organización biológica, desde las moléculas hasta los organismos. La especialización de los tejidos de animales y plantas es consecuencia de la diferente morfología de sus células que, a su vez, depende de las proteínas que las componen y, por tanto, de la expresión diferencial de sus genes. También los microorganismos, a pesar de su pequeño tamaño, presentan una enorme diversidad morfológica que varía durante su desarrollo y diferenciación.

Los investigadores de esta Unidad estudian los mecanismos genéticos que controlan la morfogénesis en sistemas modelo de hongos y levaduras. Estos organismos pueden manipularse genéticamente con facilidad y, dada su relativa simplicidad estructural, permiten visualizar directamente la implicación de cualquier gen/proteína en su morfología, sus patrones de desarrollo. Por este motivo, además de su interés básico, estos estudios también tienen un claro potencial aplicado, ya que permitirían definir los mecanismos moleculares potencialmente implicados en algunas enfermedades, así como identificar nuevas dianas moleculares para el diseño de compuestos antifúngicos. Unidad II. Dinámica del genoma y epigenética El genoma contiene las instrucciones para el desarrollo y el mantenimiento de los organismos a lo largo de su vida. Uno de los procesos fundamentales del genoma es su replicación, que preserva la identidad de las células durante el ciclo de división celular y mantiene la continuidad de las especies a lo largo de las generaciones. La segunda función esencial es la transcripción de los genes para dirigir el desarrollo de los organismos y para responder de forma adaptativa a las variaciones de las condiciones ambientales. El tercer proceso básico del genoma es la recombinación que genera la diversidad genética sobre la que actúa la selección natural y, además, repara las lesiones a las que continuamente está sometido el DNA por causas endógeneas o exógenas.

La Unidad de Dinámica del Genoma y Epigenética estudia la relación funcional entre esos tres procesos y su regulación tanto a nivel genético como epigenético. Los mecanismos epigenéticos están mediados por modificaciones en las histonas o en el mismo DNA que no afectan a la secuencia de nucleótidos pero que se mantienen durante la división celular y los procesos de diferenciación. En estos estudios se utilizan aproximaciones genéticas, bioquímicas y genómicas en sistemas modelo que incluyen desde las levaduras hasta células humanas y de ratón. Unidad III. Regulación génica y diferenciación celular La expresión de los genes de un organismo está regulada por mecanismos moleculares que garantizan su desarrollo, adaptación y supervivencia en un ambiente cambiante. Distintos tipos de RNAs y proteínas ejecutan o regulan, entre otros, los procesos de transcripción y traducción de los genes. Conocer la estructura y funciones precisas de esas biomoléculas, cómo se regula su actividad, ó el papel que desempeñan formando partes de distintos complejos macromoleculares es fundamental para entender los procesos biológicos por los que se establecen los patrones de crecimiento, división y diferenciación celular, y la base de ciertas anomalías en el desarrollo de los organismos.

Los investigadores de la Unidad de Regulación Génica y Diferenciación Celular del IBFG estudian funciones biológicas básicas en microorganismos modelo y en células animales, mecanismos de patogenicidad de hongos oportunistas y, en colaboración con empresas, desarrollan

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proyectos aplicados para modificar algunas propiedades beneficiosas de bacterias, hongos y levaduras de interés biotecnológico e identificar el mecanismo de acción de fármacos.

El IBFG: Líneas de investigación

Unidad I. Morfogénesis y polaridad celular. página

• Regulación del crecimiento polarizado por las GTPasas Rho. Dra. Pilar Pérez 5 • Biosíntesis de la pared celular y su papel en morfogénesis, polaridad

y división celular. Dr. Juan Carlos Ribas. 6 • Tráfico intracelular de proteínas y morfogénesis fúngica. Dr. César Roncero. 7 • Rutas de señalización que controlan el crecimiento polarizado en S. pombe. 8 Dra. Yolanda Sánchez. • Tráfico vesicular y síntesis de glucano en Schizosaccharomyces pombe. 9 Dra. Henar Valdivieso. • Morfogénesis y separación celular. Dr. Carlos R. Vázquez de Aldana. 10

Unidad II. Dinámica del genoma y epigenética.

• Organización funcional del genoma eucariótico. Dr. Francisco Antequera. 11 • Regulación transcripcional. Dra. Olga Calvo. 12 • Ciclo celular y estabilidad genómica. Dr. Andrés Clemente. 13 • Virus RNA de levaduras. Dra. Rosa Esteban. 14 • Control del inicio de la recombinación meiótica. Dra. Cristina Martín-Castellanos. 15 • Dinámica meiótica de los cromosomas: regulación epigenética. 16 Dr. Pedro San Segundo. • Regulacion de replicación y respuesta de daño en el DNA. Dra. Mónica Segurado. 17

Unidad III. Regulación génica y diferenciación celular.

• Neurobiología molecular. Dra. Angeles Almeida. 18 • Bioenergética y estrés oxidativo del sistema nervioso. Dr. Juan Pedro Bolaños. 19 • Regulación de la homeostasis del zinc y virulencia en hongos patógenos. 20

Dr. José Antonio Calera. • Crecimiento, división y diferenciación celular. Dr. Sergio Moreno. 21 • Reguladores de ciclo celular y morfogénesis como factores de virulencia fúngica. 22 Dr. José Pérez Martín. • Regulación génica en Streptomyces. Dr. Ramón Santamaría. 23 • Regulación traduccional y biotecnología de levaduras. Dra. Mercedes Tamame. 24

 

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El IBFG: Líneas de investigación

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Hitos

• Cortés JCG, Pujol N, Sato M, Pinar M, Ramos M, Moreno B, Osumi M, Ribas JC and

Pérez P. (2015). Cooperation between paxillin-like protein Pxl1 and glucan synthase Bgs1 is essential for actomyosin ring stability and septum formation in fission yeast. PLoS Genet. 11: e1005358.

La citocinesis es la última etapa de la división celular que requiere el ensamblaje de un anillo de actomiosina adyacente a la membrana plasmática, y cuya contracción tira de la membrana para formar el surco de división entre las dos células hijas. En hongos el cierre del anillo se produce de forma coordinada con la síntesis de un septo formado de pared celular. En este trabajo se describe que la paxilina de la levadura de fisión, que se localiza en el anillo, y Bgs1, el enzima transmembranal encargado de la formación del septo primario, cooperan durante la citocinesis. Ambas se requieren para anclar y mantener el anillo en la membrana plasmática durante la citocinesis, y ambas colaboran en la formación del septo de división. De acuerdo a esto, la paxilina es esencial cuando se reduce la cantidad de Bgs1 en la célula. De esta forma, cuando se eliminan ambas proteínas, el anillo contráctil se forma, pero la pared celular crece hacía dentro, sin un surco de división definido y en ausencia de un septo de división. También se demuestra que durante la división celular se produce un incremento de la cantidad de paxilina en el anillo, que depende del dominio SH3 de la proteína F-BAR Cdc15. Consecuentemente, la ausencia de este dominio mimetiza el fenotipo de la ausencia de la paxilina en células con una reducción de Bgs1. Sorprendentemente, la reducción conjunta de la función de Cdc15 y paxilina induce que la contracción del anillo se desacople de la síntesis del septo, lo que indica que existe una cooperación entre estas proteínas del anillo y Bgs1 en la membrana que es esencial para la correcta división celular.

• Quintales L, Soriano I, Vázquez E, Segurado M, and Antequera F. (2015). A species-specific nucleosomal signature defines a periodic distribution of amino acids in proteins”. Open Biology 5: 140218.

Los nucleosomas facilitan la compactación del genoma dentro del núcleo y regulan el acceso de muchos complejos reguladores al DNA. En este trabajo hemos analizado si existe una relación entre la posición que ocupan los nucleosomas y la secuencia del DNA. Para ello, hemos generado mapas genómicos de distribución nucleosomal en cuatro especies de levadura. El análisis de las secuencias asociadas con nucleosomas ha revelado que la distribución de los cuatro nucleótidos adopta un patrón muy bien definido y diferente en cada especie a pesar del elevado grado de homología entre las histonas. En el caso de las regiones codificantes, estos patrones (nucleosomal signatures) determinan la distribución de los codones y predicen correctamente la frecuencia promedio de cada aminoácido a lo largo del DNA mononucleosomal. Estos resultados indican que existe una conexión directa entre la posición de los nucleosomas a lo largo de los genes y la composición de aminoácidos de las proteínas.

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Producción científica

PUBLICACIONES:

1. Vicentefranqueira R, Amich J, Laskaris P, Ibrahim-Granet O, Latgé JP, Toledo H, Leal F and Calera JA (2015). Targeting zinc homeostasis to combat Aspergillus fumigatus infections Front. Microbiol 6: 160

2. Pérez P, Portales E and Santos, B (2015). Rho4 interaction with exocyst and septins regulates cell separation in fission yeast Microbiology 161: 948-59

3. Calvo L, Anta B, López-Benito S, Martín-Rodríguez C, Lee FS, Pérez P, Martín-Zanca, D and Arévalo JC (2105). Bex3 dimerization regulates NGF-dependent neuronal survival and differentiation by enhancing trkA gene expression J Neurosci. 35: 7190-7202

4. Del Rey M, Benito R, Fontanillo C, Campos-Laborie FJ, Janusz K, Velasco-Hernández T, Abáigar M, Hernández M, Cuello R, Borrego D, Martín-Zanca D, De Las Rivas J,Mills KI and Hernández-Rivas JM (2015). Deregulation of genes related to iron and mitochondrial metabolism in refractory anemia with ring sideroblasts PLoS One 10(5): e0126555

5. Ohmayer U, Gil-Hernández A, Sauert M, Martín-Marcos P, Tamame M, Tschochner H, Griesenbeck J and Milkereit P. (2015). Studies on the Coordination of Ribosomal Protein Assembly Events Involved in Processing and Stabilization of Yeast Early Large Ribosomal Subunit Precursors PLoS One 10(12): e0143768

6. Morafraile EC, Diffley JFX, Tercero JA, Segurado M. (2015) Checkpoint-dependent RNR induction promotes fork restart after replicative stress Scientific Reports 5: 7886

7. Jiménez-Blasco D, Santofimia-Castaño P, González A, Almeida, A, Bolaños JP (2015). Astrocyte NMDA receptors' activity sustains neuronal survival through a Cdk5-Nrf2 pathway Cell Death and Differentiation 22:1877-1889

8. Santofimia-Castaño CRD, García-Sánchez L, Jiménez-Blasco D, Fernández-Bermejo M, Bolaños JP, Salido GM, González A. (2015). Melatonin induces the expression of Nrf2-regulated antioxidant enzymes via PKC and Ca2+ influx activation in mouse pancreatic acinar cells Free Radical Biology and Medicine 87: 226-236

9. Requejo-Aguilar R, López-Fabuel I, Jiménez-Blasco D, Fernández E, Almeida A, Bolaños JP. (2015). DJ1 represses glycolysis and cell proliferation by transcriptionally up-regulating Pink1 Biochemical Journal 467: 303-310

10. De Tudela, MVP, Delgado-Esteban M, Maestre C, Bobo-Jiménez V, Jiménez-Blasco D, Vecino R, Bolaños JP, Almeida A. (2015). Regulation of Bcl-xL–ATP synthase interaction by mitochondrial Cyclin B1–cyclin-dependent kinase-1 determines neuronal survival Journal of Neuroscience 35: 9287-9301

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11. Bouzier-Sore A, Bolaños JP. (2015). Uncertainties in pentose-phosphate pathway flux assessment underestimate its contribution to neuronal glucose consumption: Relevance for neurodegeneration and aging Frontiers in Aging Neuroscience 7: 89

12. Mojardín L, Botet J, Moreno S, Salas M. (2015). Chromosome segregation and organization are targets of 5´-fluoruracyl in eukaryotic cells Cell Cycle 14: 206-218

13. Rodríguez H, Rico S, Yepes A, Franco-Echevarría E, Antoraz S, Santamaría RI and Díaz M.

(2015) The two kinases, AbrC1 and AbrC2, of the atypical two-componentsystem AbrC are needed to regulate antibiotic production and differentiation in Streptomyces coelicolor Frontiers in Microbiology 6: 450  

14. Antoraz S, Santamaría R, Díaz M, Sanz D and Rodríguez H. (2015) Toward a new focus in antibiotic and drug discovery from the Streptomyces Arsenal Frontiers in Microbiology 6: 46

15. Cortés JCG, Pujol N, Sato M, Pinar M, Ramos M, Moreno B, Osumi M, Ribas JC and Pérez P. (2015). Cooperation between paxillin-like protein Pxl1 and glucan synthase Bgs1 is essential for actomyosin ring stability and septum formation in fission yeast PLoS Genet. 11: e1005358

16. García R, Botet J, Rodríguez-Peña JM, Bermejo C, Ribas JC, Revuelta JL, Nombela C, Arroyo J. (2015). Genomic profiling of fungal cell wall-interfering compounds: identification of a common gene signature BMC Genomics 16: 683

17. Ramírez M, Velázquez R, Maqueda M, López-Piñeiro A, Ribas JC. (2015). A new wine Torulaspora delbrueckii killer strain with broad antifungal activity and its toxin-encoding double-stranded RNA virus Front. Microbiol. 6: 983

18. Calderón-Noreña D, González-Novo A, Orellana-Muñoz S, Gutiérrez-Escribano P, Arnáiz-Pita Y, Dueñas-Santero E, Suárez B, Bougnoux M, Rey F del, Sherlock G, d’Enfert C, Correa-Bordes J and Vázquez de Aldana CR. (2015). A single nucleotide polymorphism uncovers a novel function for the transcription factor Ace2 during Candida albicans hyphal development PLoS Genetics 11(4): e1005152

19. Suárez B, Alonso-Nuñez ML, Rey F del, McInerny C, Vázquez de Aldana CR. (2015). Regulation of Ace2-dependent genes requires components of the PBF complex in Schizosaccharomyces pombe Cell Cycle 14: 3124-3137

20. Castanheira S and Pérez-Martín J (2015) Appressorium formation in the corn smut fungus Ustilago maydis requires a G2 cell cycle arrest Plant Sign & Behav 10: e1001227

21. de Sena-Tomás C, Sutherland JH, Milisavljevic M, Nikolic DB, Pérez-Martín J, Kojic M,

Holloman WK (2015) LAMMER kinase contributes to genome stability in Ustilago maydis DNA Repair 33: 70–77

22. de Sena-Tomas C, Yu EY, Calzada A, Holloman WK, Lue NF and Perez-Martin J (2015) Fungal Ku prevents permanent cell cycle arrest by suppressing DNA damage signaling at telomeres Nucleic Acids Research 43: 2138–2151

23. Yu EY, Pérez-Martín J, Holloman WK, Lue NF (2015) Mre11 and Blm-Dependent Formation of ALT-Like Telomeres in Ku-Deficient Ustilago maydis

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PLoS Genet 11: e1005570

24. Tenorio-Gómez M, de Sena-Tomás C, Pérez-Martín J (2015) MRN- and 9-1-1-Independent Activation of the ATR-Chk1 Pathway during the Induction of the Virulence Program in the Phytopathogen Ustilago maydis PLoS ONE 10: e0137192

25. Quintales L, Vázquez E and Antequera F (2015) Comparative analysis of methods for genome-wide nucleosome cartography Briefings in Bioinformatics 16: 576-587

26. Quintales L, Soriano I, Vázquez E, Segurado M, and Antequera F. (2015)

A species-specific nucleosomal signature defines a periodic distribution of amino acids in proteins Open Biology 5: 140218

27. Materne P, Anandhakumar J, Migeot V, Soriano I, Yague-Sanz C, Hidalgo E, Mignion C,

Quintales L, Antequera F and Hermand D. (2015). Promoter nucleosome dynamics regulated by signaling through the CTD code eLIFE 4: e09008

28. Vázquez E and Antequera F. (2015)

Replication dynamics in fission and budding yeasts via DNA polymerase tracking BioEssays 37: 1067-1073

29. Niavarani A, Currie E, Reyal Y, Anjos-Afonso F, Horswell S, Griessinger E, Sardina JL, and Bonnet D. (2015). APOBEC3A is implicated in a novel class of G-to-A mRNA editing in WT1 transcripts Plos ONE 10: e0120089

30. Madrid M, Jiménez R, Sánchez-Mir L, Soto T, Franco A, Vicente-Soler J, Gacto M, Pérez P, Cansado J. (2015). Multiple layers of regulation influence cell integrity control by the PKC ortholog Pck2 in fission yeast Journal of Cell Science 128: 266-280

CAPÍTULOS DE LIBROS:

Ribas JC and Cortés JCG. (2015) Imaging septum formation by fluorescence microscopy. DOI: 10.1007/978-1-4939-3145-3. Editorial: Sánchez-Díaz, A., Pérez, P. (Eds.), Springer, USA. ISBN 978-1-4939-3144-6, 978-1-4939-3145-3. In Yeast Cytokinesis - Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology)

PROYECTOS INTERNACIONALES:

Training in neurodegeneration, therapeutics intervention & neurorepair FP7-PEOPLE-2013-ITN-608381. 2013-2017 Dr. Juan Pedro Bolaños Novel mechanisms inactivating checkpoint response PEOPLE-CIG/1386. 2011-2015 Dr. Rodrigo Bermejo Sensing and integration of signals governing cell polarity and tropism in fungi FP7-PEOPLE-2013-ITN. 2013-2017 Dr. José Pérez Martín

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The Influence of cannabinoids on astrocyte-neuronal metabolic interactions 1R21 DA037678-01. 2014-2016 Dr. Juan Pedro Bolaños PROYECTOS NACIONALES: Regulación de la Integridad del Genoma: Replicación y Recombinación BFU2013-45182-P. 2014-2016 Dra. Cristina Martín Castellanos Exploración de la inhibición de la adquisición y regulación de la homeostasis del zinc como una nueva estrategia terapeútica contra el patógeno humano Aspergillus fumigatus SAF2013-48382-R. 2014-2016 Dr. José Antonio Calera Nuevas funciones de las GTPasas Rho en el crecimiento polarizado y la citocinesis de la levadura de fisión BFU2013-43439-P. 2014-2016 Dra. Pilar Pérez Virus RNA de S. cerevisiae: los narnavirus 20S RNA y 23S RNA y el virus L-A como modelos para estudios de persistencia vírica y relación con el metabolismo de la levadura BFU2010-15768. 2011-2015 Dra. Rosa Esteban lmportancia de las proteínas fosfatasas en la reparación de un daño en eI ADN y en estabilidad genómica BFU2013-41216-P. 2014-2016 Dr. Andrés Clemente Folding and transport of polytopic proteins in yeast: chitin synthase 3 (chs3), a paradigm in the study of intracellular traffic in Saccharomyces cerevisiae BFU2013-48582-C2-1-P. 2014-2016 Dr.César Roncero Transporte y control de calidad de B(1,3) glucan sintasas en Schizosaccharomyces pombe, un modelo alternativo para el estudio del transporte polarizado BFU2013-48582-C2-2-P. 2014-2016 Dra. Henar Valdivieso Caracterización estructural y funcional de la transcripción y de la reparación del ADN acoplada a la transcripción BFU2013-48374-PU2013. 2014-2016 Dra. Olga Calvo Control de la morfogénesis y citocinesis de la célula fúngica. Herramientas biotecnológicas y dianas para el estudio de antifúngicos específicos BIO2012-35372. 2013-2015 Dr. Juan Carlos Ribas El "checkpoint" de recombinación meiótica: regulación epigenética BFU2012-35748. 2013-2015 Dr. Pedro Antonio San Segundo Generación de un modelo de ratón “KNOCK-IN” para analizar la actividad supresora tumoral de la proteína p53 localizada en la mitocondria PI12/02847. 2013-2015 Dr. Dionisio Martín-Zanca

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Dinámica de la cromatina durante la replicación y la recombinación del DNA BFU2011-24909. 2012-2015 Dr. Francisco Antequera Morfogénesis en levaduras: papel de los reguladores de las GTPasas RHO1P en la coordinación entre el crecimiento polarizado y el mantenimiento de la integridad BFU2011-24683. 2012-2015 Dra. Yolanda Sánchez Nuevos mecanismos reguladores de la respuesta de checkpoint de daño al DNA BFU2011-24909. 2012-2015 Dr. Rodrigo Bermejo Conexiones entre los reguladores de ciclo celular y el programa de virulencia en hongos fitopatógenos: Ustilago maydis como sistema modelo BIO2011-27773. 2012-2015 Dr. José Pérez Martín Coordinación entre crecimiento, división y diferenciación celular BFU2011-28274. 2012-2015 Dr. Sergio Moreno Obtención de productos de panificación innovadores mediante el desarrollo de nuevas levaduras panaderas y de líneas de alta calidad del nuevo cereal Tritordeum IPT-2021-1321-060000. 2013-2015 Dra. Mercedes Tamame Función de p53 en la isquemia cerebral: búsqueda de dianas moleculares con valor pronóstico en el ictus. 2013-2015 PI12/00685 Dra. María Angeles Almeida Red de Investigación Neurovascular (INVICTUS) RD12/0014/0007. 2013-2016 Dra. María Angeles Almeida Red temática de investigación cooperativa en envejecimiento y fragilidad (RETICEF) RD12/0043/0021. 2013-2016 Dr. Juan Pedro Bolaños Adaptaciones metabólicas de las neuronas y la glia a los ros endógenos mitocondriales: implicaciones terapeúticas para la neurodegeneración SAF2013-41177-R. 2014-2016 Dr. Juan Pedro Bolaños La regulación del crecimiento del filamento infectivo en hongos fitopatógenos como diana de actuación para evitar infecciones BIO2014-55398-R. 2015-2017 Dr. José Pérez Martín. 2015-2017 Replicación y estrategia de defensa de los virus RNA de levaduras. Interferencia pérdida por RNA (RNAi) y empaquetamiento del genoma BFU2014-52418-P. 2015-2017 Dra. Rosa Esteban Cañibano Coordinación del crecimiento, la división y la diferenciación celular; implicaciones en el tamaño celular y el envejecimiento BFU2014-55439-R. 2015-2017 Dr. Sergio Moreno Pérez

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Determinantes del posicionamiento nucleosomal e ingeniería de la cromatina BFU2014-52143-P. 2015-2017 Dr. Francisco Antequera Nuevos productos industriales a través del desarrollo de nuevos starters y harinas innovadoras de alta calidad RTC-2015-4391-2. 2015-2018 Dra. Mercedes Tamame. Productos naturales marinos para el tratamiento de patologías del sistema nervioso. RTC-2015-3237-1. 2015-2018 Dr. Juan Pedro Bolaños Red de Inestabilidad Genómica BFU2014-51672-REDOC. 2015-2017 Dr. Sergio Moreno Nuevas aproximaciones para el desarrollo de microorganismos miceliares como productores de enzimas PCIN-2014-067. 2015-2017 Dr. Ramón Santamaría

PROYECTOS AUTONÓMICOS:

Papel de APC/C-CDH1 en prevenir el estrés replicativo y sus consecuencias fisiopatológicas envejecimiento prematuro y cáncer CSI151U13. 2013-2015 Dr. Sergio Moreno Control del crecimiento y la división celular fúngica. Aplicación en terapias antifúngicas y usos biotecnológicos CSI037U14. 2014-2015 Dr. Juan Carlos Ribas Búsqueda de proteínas fúngicas y humanas implicadas en el proceso de vigilancia del transporte vesicular en el Golgi. Utilidad en el diseño de nuevos fármacos SA073U14. 2014-2016 Dra. María Henar Valdivieso Activación del factor de transcripción NRF2 en astrocitos como diana terapeútica en neuroprotección SA003U13. 2013-2015 Dr. Juan Pedro Bolaños Función de p53 en la tolerancia isquémica: identificación de dianas moleculares implicadas en la supervivencia neuronal frente a la isquemia cerebral. BIO/SA35/15 Dra. María Delgado. 2015

PROYECTOS CON EMPRESAS:

Modificación de levaduras para habilitación de la producción de alquenos ABENGOA S.A. Dra. Mercedes Tamame. 2013-2015

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Premios y reconocimientos

Accésit al Premio Fundación Grupo Siro a la Investigación Agroalimentaria, concedido a la Dra. Mercedes Tamame Premio Extraordinario de Doctorado, concedido a la Dra. Sonia Marisa Castanheira Dias en la Rama de Conocimiento: Ciencias. Ámbito de Conocimiento: Biología Molecular, Celular y Genética Acreditación del IBFG como Instituto Universitario de Biología Funcional y Genómica, concedido por la Agencia para la Calidad del Sistema Universitario de Castilla y León (ACSUCYL)

Tesis doctorales leídas en 2015

Nombre: Miguel Veas Pérez de Tudela Fecha de lectura: 14-07-2015 Título: Función del complejo Cdk1-ciclina B1 en la excitotoxicidad Nombre: Irene López Fabuel Fecha de lectura: 18-09-2015 Título: Regulación de la formación de especies reactivas de oxígeno por la cadena respiratoria mitocondrial en células neurales

Nombre: Javier Garzón Hidalgo Fecha de lectura: 17-09-2015 Título: Regulación de la dinámica de replicación del DNA por APC/C-Cdh1 y sus consecuencias sobre la estabilidad del genoma Nombre: Marta Tormos Pérez Fecha de lectura: 02-10-2015 Título: Caracterización de la función de Mhf1/2 (CENP-S/X) en la segregación y en la reparación del DNA de Schizosaccharomyces pombe Nombre: Laura Parrilla Monge Fecha de lectura: 21-12-15 Título: Generación de un modelo de ratón “knock-in” para analizar la actividad supresora tumoral de la proteína p53 localizada en la mitocondria

   

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Trabajos de Fin de Máster y Fin de Grado en 2015

 

TRABAJOS DE FIN DE MASTER

Nombre: Sira Blanco Navarro Título: Biodiversidad microbiana en semillas de cereales cosechados en 2015: identificación genético molecular de especies de levadura de potencial interés biotecnológico Nombre: Alberto Bugallo Bordetas Título: Regulación de Exo1 en respuesta a daño en el DNA

Nombre: Aroa Sesmero Fernández Título: Papel de la actividad CDK en el inicio de la recombinación meiótica en Schizosaccharomyces pombe: caracterización de mutantes en la proteína de los Elementos Lineales Rec27.  Nombre: Sabrina Yuri Imada Minatelli Título: Deleción de los sistemas de dos componentes AbrA y AbrB en Streptomyces coelicolor: su efecto sobre la producción de antibióticos y diferenciación. Nombre: Ana Nacarino Palma Título: Identificación de factores implicados en el mecanismo de resistencia a fleomicina relacionados funcionalmente con Rgf1p Nombre: Esther Herruzo de la Fuente Título: Análisis funcional de la ATPasa Pch2 en el checkpoint de recombinación meiótica Nombre: Raquel Álvarez Ccossco Título: Factores epigenéticos que contribuyen al posicionamiento de nucleosomas en la heterocromatina de Schizosaccharomyces pombe

TRABAJOS  DE  FIN  DE  GRADO  

Nombre: Alejandro González Delgado Título: Construcción de cepas mutantes de Aspergillus Nombre: Sergio Alonso Aguado Título: Mecanismos de la regulación en la activación transcripcional de la RNA Polimerasa I Nombre: María Tejada Sánchez Título: Estudio del regulador Aor1 de Streptomyces coelicolor Nombre: Natalia García Blanco Título: Regulación de la replicación en respuesta a daño en el DNA en Saccharomyces cerevisiae Nombre: Jorge Bravo Villanueva Título: El problema de la resistencia a antibióticos: desde su origen hasta la búsqueda de nuevas soluciones Nombre: Delia Casas Pastor Título: Caracterización de la función de Rgf2p (Rho-GEF 2) en la estabilidad genómica.

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Nombre: Isabel Diez Santos Título: Rgf1p en el mantenimiento de la estabilidad genómica en S. pombe

Nombre: Jorge Pozas Martín Título: Fusión de los gametos durante la fecundación en mamíferos Nombre: Ana Lechuga Mateo Título: El checkpoint de recombinación meiótica: papel de las fosfatasas PP1 y PP4 Nombre: Heathcliff Dorado García Título: Regulación epigenética del checkpoint de recombinación meiótica: función de la proteína Ubp10 Nombre: Noelia Sánchez Núñez Título: Tráfico intracelular de proteínas y enfermedades asociadas. S. cerevisiae y Chs3p como paradigmas en el estudio de los mecanismos de transporte intracelular de proteínas Nombre: Rubén Masa González Título: Estudio de las proteínas fosfatasas durante la reparación de una lesión en el material genético Nombre: Raquel Manzano García Título: Dinámica del genoma durante el ciclo celular de Schizosaccharomyces pombe

Actividades Académicas y de Divulgación

CONGRESOS Y SIMPOSIOS ORGANIZADOS EN EL IBFG

Título: 5th Spanish Worm Meeting Organizadores: Ana María González Paramás (USAL), Celestino Santos Buelga (USAL) y José Pérez Martín (IBFG-CSIC) Patrocinadores: Biopolis SL; C. VIRAL S.L.; Canvax Biotech S.L. Fecha: 5-6 de marzo de 2015 Participantes: 60 personas

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Título: The Biology of Meiosis: Implications for Fertility and Genetic Disorders Organizadores: Juan Luis Santos (Universidad Complutense de Madrid), Ignasi Roig (Universidad Autónoma de Barcelona) y Pedro San-Segundo (IBFG-CSIC/USAL) Patrocinador principal: Fundación Ramón Areces Otros patrocinadores: The Company of Biologists, Asensio BioTécnica, Bio-Rad, Werfen, Fisher Scientific Fecha: 4-5 de junio de 2015 Nº de participantes: 83

Título: Cell Cycle: The Challenge to Coordinate Genome Stability and Morphogenesis Organizadores: Carlos Antón (PhD student), Camilla Frattini (PhD student), Rebeca Lapresa (PhD student), Cristina Rodríguez (Post-doc), Sara Villa (PhD student) Patrocinadores: The Biochemical Society, IBSAL, IBFG, Fisher Scientific, Grupo Yllera, VWR International Eurolab, Life Technolgies, CSIC y USAL Fecha: 4 de diciembre de 2015 Nº Participantes: 69

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CURSOS DE FORMACIÓN ORGANIZADOS POR EL GABINETE DE FORMACIÓN DEL CSIC EN EL IBFG

Título: Curso básico de citómetría Organizadores: Carmen Castro, Yolanda Arnaiz. Gabinete de Formación del CSIC. Impartido por Becton DIckinson Fecha: 25-28 de mayo de 2015 Nº de horas: 24 Nº de alumnos: 16

PARTICIPACIÓN EN CONFERENCIAS CIENTÍFICAS, CONGRESOS

Conferencia invitada: Tamame, M. "Obtención y caracterización de levaduras con buenas propiedades para panificación". Parque Científico de Barcelona: Agrasys. Baldiri y Reixac. Barcelona, 28 de septiembre de 2015 Conferencia invitada: Tamame, M. “De nuevas levaduras, cereales y productos de panificación". Fundación Siro I+DeA. El Espinar, Segovia, 11 de diciembre de 2015

Ponencia invitada: Juan Pedro Bolaños .“Molecular bases of the metabolic programs of neurons and astrocytes”. Cycle of Seminars on Bioenergetic and Redox Interactions between Neurons and Astrocytes. Universidad de Burdeos (Francia), 19 de febrero de 2015

“Metabolic and redox interactions between astrocytes and neurons: Molecular players and potential therapeutic implications”.Juan Pedro Bolaños. Seminarios IdiPaz. 24 de febrero de 2015

Ponencia invitada: Juan Pedro Bolaños “Astrocytes boost neuronal protection during neurotransmission”. Cycle of Seminars on Bioenergetic and Redox Interactions between Neurons and Astrocytes. Universidad de Burdeos (Francia), 16 de Abril de 2015

Ponencia invitada: Juan Pedro Bolaños Astrocytes boost neuronal protection during neurotransmission”. Symposium on “Training in Neurodegeneration,Therapeutics,and Neurorepair”. Trinity College Dublin (Irelanda), 7 de mayo de 2015

Ponencia invitada: Juan Pedro Bolaños Mitochondrial respiratory chain assembly dictates differential ROS production in neurons and astrocytes ”. Cycle of Seminars on Bioenergetic and Redox Interactions between Neurons and Astrocytes. Universidad de Burdeos (Francia), 28 de mayo de 2015

Sesión Plenaria Juan Pedro Bolaños. “Neurotransmission-dependent metabolic and redox coupling between neurons and astrocytes”. Oxygen Club of California World Congress. Oxidants and Antioxidants in Biology. Valencia. 26 de junio de 015

Sesión en simposio: Juan Pedro Bolaños “Astrocytic NMDA receptors sustain antioxidant protection of neurons through a novel Cdk5-Nrf2 pathway”. XII European Meeting on Glial Cells in Health and Disease. Simposio: Astrocyte metabolic reprogramming by oxygen and energy

Sesión en simposio: Juan Pedro Bolaños “Metabolic-Redox Adaptations of Neurons and Astrocytes to Neurotransmission. XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular. 9 de septiembre de 2015. Valencia

Sesión Plenaria Juan Pedro Bolaños “Peculiaridades del metabolismo energético cerebral. 1ª Reunión del Grupo Español de Hipoxia: HypoxiaNet.es. 2-3 de diciembre de 2015. Bilbao

Ponencia invitada: Juan Pedro Bolaños. Molecular bases of the metabolic programs of neurons and astrocytes”. MirCen Paris (Francia). 15 de diciembre de 2015

Conferencia invitada. Dr. Sergio Moreno. “Nutritional control of cell size by the greatwall-endosulfine-PP2A·B55 pathway”. Getting in and out of mitosis. The Company of Biologists. Wiston House, West Sussex (Reino Unido), 10-13 de mayo de 2015

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Conferencia invitada. Dr. Sergio Moreno. “Estrés replicativo y envejecimiento”. XII Curso para postgraduados sobre Fundamentos Moleculares de la Medicina. Real Academia Nacional de Medicina. Madrid, 27-28 de mayo de 2015 Conferencia invitada. Dr. Sergio Moreno. “Nutritional control of cell size by the greatwall-endosulfine-PP2A·B55 pathway”. Pombe 2015: 8th International Fission Yeast Meeting. Kobe (Japón), 21-26 de junio de 2015 Conferencia invitada. Dr. Sergio Moreno. “Nutritional control of cell division: how TOR controls mitotic entry”. Red Consolider Meeting Genomic Instability. Torremolinos, 9-10 de noviembre de 2015 Conferencia invitada. Dr. Sergio Moreno. “Nutritional control of cell size: how TOR controls mitotic entry?”. Seminario en el Máster de Genética Molecular y Biotecnología de la Universidad de Sevilla. Sevilla, 4 de diciembre de 2015 Conferencia invitada. Orellana-Muñoz, S., Arnáiz. Y., Rey, F. Correa-Bordes, J., Vázquez de Aldana, CR. Plasticity of septin filament assembly during hyphal development in Candida albicans. 10 Reunión de la Red Española de Levaduras (REDIL). El Escorial, 16-18 de diciembre de 2015. Conferencia invitada: Hoya M, Moro S, Yanguas F, Curto MA, Doncel C and Valdivieso MH. “In Schizosaccharomyces pombe the exomer participates in trafficking through the Golgi, early endosomes and late endosomes under standard and stress conditions”. Red Española de In vestigación en lavaduras. El Escorial (Madrid) 16-18 de diciembre de 2015

Conferencia invitada. Pedro San Segundo. “Meiotic checkpoint control of chromosome dynamics” Ramón Areces Foundation International Symposium on The biology of meiosis: implications for fertility and genetic disorders. June 4-5, 2015. Salamanca, Spain

Ponencia invitada. Pedro San Segundo. “Meiotic checkpoint control of chromosome dynamics by the nucleolar Pch2 ATPase”. X Reunión de la Red Española de Levaduras. 16-18 de diciembre, 2015. El Escorial (Madrid)

Ponencia Invitada : Arcones I, Anton C, Perez P, Valle R y Roncero C. Las levaduras como modelo de estudio en el transporte intracelular de proteínas: De las síntesis de quitina al premio Nobel.Congreso: XXV Congreso Nacional de Microbiología. Logroño,7-10 de julio 2015 Ponencia Invitada : Arcones I, Anton C, Perez J, y Roncero C. Deciphering the mechanisms for Chitin Synthase delivery to the sites of polarized growth. Fungal Cell Wall 2015. Paris, 26-28 de octubre 2015 Ponencia Invitada :Pérez P, Casquero, V, Gómez, A y Roncero C. Múltiples quinasas colaboran en el ensamblaje del cuello. Jornada de Senyalització en els models de llevat. Societat Catalana de Biologia. Lérida, 7-10 julio 2015 Ponencia Invitada :Arcones I, Antón C, Pérez P, y Roncero C. Deciphering the mechanisms for Chitin Synthase delivery to the sites of polarized growth. X Reunión de la Red Española de Levaduras. El Escorial, 16-18 de diciembre 2015 Ponencia Invitada: Villoria, MT., Ramos F., Dueñas E. and Clemente-Blanco A. The spindle-stabilizing function of Cdc14 is required to promote recombinatorial DNA repair.XL Congreso de la Sociedad Española de Genética Ponencia invitada:Cdc14 is required for DNA repair by homologous recombination Ramos F., Villoria, MT, Dueñas E. and Clemente-Blanco A .XL Congreso de la Sociedad Española de Genética

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Ponencia invitada: Stability of the metaphase spindle by Cdc14 is required for recombinational DNA repair Clemente-Blanco A. Red Española de Levaduras Conferencia invitada. Bermejo R. Cold Spring Harbor Laboratory Meetings: Eukariotic DNA replication & Genome Maintenance. Cold Spring Harbor, Nueva Yor, 1-5 septiembre de 2015 Conferencia invitada. Bermejo R. EMBO Workshop: DNA topoisomerases, DNA topology and human health. Les Diablerets, 13-17 septiembre de 2015 Comisión Evaluadora de los contratos Juan de la Cierva-Incorporación (IJCI) del Área de Biomedicina. Mayo 2015. Investigador : Rodrigo Bermejo Comité Científico de Evaluación de la Convocatoria Genérica de Proyectos de la Agencia Nacional de Investigación Francesa (Scientific Evaluation Committee for the ANR generic call for proposals 2015). Junio 2015 Investigador : Rodrigo Bermejo Panel evaluador de ciencias de la vida de las becas individuales 2015 de la acción Marie Slovdoska-Curie del programa H2020 de la Unión Europea (H2020-MSCA-IF-2015-LIF Panel). Noviembre 2015 Investigador: Rodrigo Bermejo Ponencia invitada. Juan Carlos Ribas. Fungal Cell Wall 2015. París, Francia. 2015. Cooperation between Paxillin and Glucan Synthases Is Essential for Septum Formation in Fission Yeast Ponencia invitada. Juan Carlos Ribas. Fission yeast cytokinesis. X Reunión de la Red Española de Levaduras. El Escorial, Madrid. 2015 Conferencia invitada: Francisco Antequera.“Nucleosomal signatures define a periodic distribution of amino acids in proteins” 8th International Fission Yeast meeting. Kobe (Japón) 21-26 de junio de 2015 Ponencia invitada: González S, García A, Vázquez E, Sánchez M, Antequera F. “Contribution of the DNA sequence to nucleosome positioning in Schizosaccharomyces pombe” 8th International Fission Yeast meeting. Kobe (Japón) 21-26 de junio de 2015 Ponencia invitada: Martienssen R, Ren J, Roche B, Castel S, Chang A, Zaratiegui M, Antequera F, Arcangioli B. “RNAi promotes heterochromatic silencing through replication-coupled release of RNA polymerase II” 8th International Fission Yeast meeting. Kobe (Japón) 21-26 de junio de 2015 Ponencia invitada: Ren J, Castel S, Bhattacharjee S, An-Yun Chang, Sánchez M, Valbuena A, Zaratiegui M, Fei L, Arcangioli B, Cande Z, Antequera F, Martienssen R. “Dcr1 in action at the replication-transcription collisions to protect genome integrity” 8th International Fission Yeast meeting. Kobe (Japón), 21-26 de junio de 2015

ACTIVIDADES ACADÉMICAS

Máster en Biología Celular y Molecular Especialidad: Biología Funcional y Genómica Asignatura: Biosíntesis, procesamiento y expresión del RNA en eucariotas Investigadoras: Rosa Esteban, Olga Calvo y Mercedes Tamame

Tutoría de Alumno en Prácticas del Convenio de Cooperación Educativa entre el Instituto de Enseñanza Secundaria Fray Luis de León de Salamanca y el IBFG, del alumno Oscar Alonso Díaz (Ciclo Formativo de Grado Medio) y de la alumna Noelia González Polo (Ciclo Formativo e Grado Superior) durante los dos últimos trimestres del curso 2014-15

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Investigadora responsable: Olga Calvo

Tutoría de Alumno en Prácticas del Convenio de Cooperación Educativa entre la Universidad de Salamanca y el IBFG de la alumna María García Agudo Investigadora responsable: Olga Calvo Coordinación del Programa de Movilidad Internacional de la Facultad de Biología de la Universidad de Salamanca Investigadora: Beatriz Santos Plan de Acción Tutorial de la Facultad de Biología de la Universidad de Salamanca. Investigadora: Beatriz Santos. Grado en Biología Asignatura Fisiología y Metabolismo Microbianos Investigadora: Beatriz Santos Máster de Biología Celular y Molecular Especialidad: Biología Funcional y Genómica Asignatura: Morfogénesis: de los virus a la célula eucariota Investigadora: Beatriz Santos Romero

Máster en Biología y Clínica del Cáncer Asignatura: Modelos de cáncer en ratones Investigador: Dionisio Martín Zanca

Máster de Biología Molecular y Celular Asignatura de 3 ECTs: " Biosíntesis, procesamiento y expresión del mRNAS en eucariotas" nvestigadora: MercedesTamame

Máster en Biología Celular y Molecular Especialidad: Biología Funcional y Genómica Asignatura: Dinámica y Estabilidad del Genoma Investigadores: Mónica Segurado, Pedro San Segundo y Rodrigo Bermejo Participación en el Bachillerato de Excelencia con alumnos del I.E.S. “Vaguada de la Palma” Investigador: Mónica Segurado Máster en Biología Celular y Molecular Especialidad: Biología Funcional y Genómica Asignatura: Crecimiento y División Celular Investigadores: Cristina Martín, Juan Pedro Bolaños y Sergio Moreno

Máster en Biología y Clínica del Cáncer Asignatura: Crecimiento, División Celular y Cáncer Investigadores: Cristina Martín, Juan Pedro Bolaños y Sergio Moreno

Máster en Biología Celular y Molecular Especialidad: Biología Funcional y Genómica Asignatura: Pluripotencia y diferenciación celular Investigador: José Pérez, Ángeles Almeida, Ramón I. Santamaría Máster en Biología Celular y Molecular Especialidad: Obligatoria Asignatura: Estructura y función de genomas Investigador: Margarita Díaz Plan de Acción Tutorial de la Facultad de Biología de la Universidad de Salamanca Investigadora: Margarita Díaz

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Impartición del Grado en Biología Asignatura Fisiología y Metabolismo Microbianos Investigadora: Margarita Díaz Coordinadora del Practicum de la Facultad de Biología Investigadora: Margarita Díaz  Prácticas de Empresa. Israel Esgueva Fuentes Titulo: Funcionalidad de un sistema toxina-antitoxina de Streptomyces Investigador responsable: Ramón Santamaría Beca Erasmus: Rachael Hattam Titulo: Búsqueda de activadores de la secreción de proteínas en Streptomyces Investigador responsable: Ramón Santamaría Microbiología Industrial en el GRADO de Biotecnología (curso 2014-2015) Investigador responsable: Yolanda Sánchez Prácticas bioinformáticas a los alumnos de la asignatura "Microbiología" (Licenciatura de Biotecnología) durante el curso 2014-2015 Investigador responsable: Carlos Rodríguez Máster Universitario en Biología Celular y Molecular organizado por la Facultad de Biología de la USAL. Asignatura: “Genómica Funcional y Epigenómica”. Curso 2014-2015. Investigador responsable: Carlos Rodríguez Máster en Biología Celular y Molecular Asignatura: Polaridad y Secreción en el Crecimiento Celular Investigadores: Pedro Miguel Coll Fresno, Yolanda Sánchez y Henar Valdivieso Impartición del Grado en Biología Asignatura Fisiología y Metabolismo Microbianos Investigadores: Henar Valdivieso y José Antonio Calera Abad Plan de Acción Tutorial de la Facultad de Biología de la Universidad de Salamanca Investigadora: Henar Valdivieso Máster en Biología Celular y Molecular Especialidad: Biología Funcional y Genómica Asignatura: Dinámica y Estabilidad del Genoma Investigadores: Pedro San Segundo y Rodrigo Bermejo Docencia de Grado Aplicaciones de Microbiología. Grado en Biología (Curso 2014-2015) Investigador: César Roncero Docencia de Master Coordinador del Master en Biología Celular y Molecular de la USAL (2014-2015) Aproximación experimental al estudio molecular de la célula (12ECTS). Master en Biología Celular y Molecular. (Curso 2015-2016) Investigador: César Roncero Participación en el Máster en Biología Celular y Molecular del IBFG Asignatura: Crecimiento y División Celular Asignatura: Dinámica y Estabilidad del Genoma Investigador: Andrés Clemente. Participación como laboratorio receptor del programa Erasmus Investigador: Andrés Clemente

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Participación como laboratorio receptor de estancias cortas de estudiantes universitarios Investigador: Andrés Clemente Asignatura “Genómica Funcional y Epigenómica” del Máster Universitario en Biología Celular y Molecular” . Investigador: Francisco Antequera Máster en “Biología Celular y Molecular”. Asignatura: Biosíntesis, procesamiento y expresión del RNA en eucariotas. Investigador: Rosa Esteban

 

ACTIVIDADES  DE  DIVULGACIÓN  

Conferencia de divulgación. Dr. Francisco Antequera. “El genoma humano”. Universidad de la Experiencia (Universidad de Salamanca). Salamanca, 11 de febrero de 2015 Conferencia de divulgación. Dr. Sergio Moreno. “Cómo frenar el envejecimiento”. Universidad de la Experiencia. Salamanca, 18 de febrero de 2015 Conferencia de divulgación. Dr. Sergio Moreno. “Cómo frenar el envejecimiento”. Farmaforum 2015. Facultad de Farmacia, Universidad de Salamanca. Salamanca, 7 de mayo de 2015 Conferencia de divulgación. Dr. Sergio Moreno. “Cómo frenar el envejecimiento”. II Campus de Etnografía y Folklore de la Universidad de Las Palmas de Gran Canaria. Ingenio, Las Palmas, 20 de Julio de 2015 Olimpiada de Biología. Estancia en el IBFG de los alumnos de bachillerato ganadores de la Olimpiada de Biología: Eulalia Capella Porta y Marcos Albarrán Gómez. Salamanca, 6-10 de julio de 2015

Semana de Orientación para alumnos de 2º de Bachillerato. Colegio Maristas Champagnat de Salamanca. Actividad “24 horas contigo”. Estancia en un laboratorio de Investigación. Alumnos: Marta Mira y Pablo Sánchez. 5 de marzo 2015 Investigador responsable: Dr. Pedro San Segundo Visita guiada a las instalaciones del IBFG de los alumnos del I.E.S. “Colegio Santísima Trinidad” de alumnos de 1º de E.S.O. 25 de marzo de 2015 Investigador responsable: Dr. Francisco Antequera Publicación en el “Norte de Castilla” artículo titulado “El IBFG y la USAL encabezan un proyecto nacional para mejorar la calidad del pan”. 29 de marzo de 2015 Investigadora responsable: Dra. Mercedes Tamame

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Visita guiada al IBFG por parte de alumnos de Bachillerato del I.E.S. “Gredos” de Piedrahita. (Avila). 14 de abril de 2015 Investigadora responsable: Dra. Olga Calvo Visita guiada a las diversas instalaciones del IBFG por parte de alumnos de 2º de Bachillerato del I.E.S. “Ornia” de La Bañeza (León). 28 de abril de 2015 Investigador responsable: Dr. Francisco Antequera y Dra. Carmen Castro Visita y actividades académicas por parte de los alumnos de Bachillerato de Excelencia del I.E.S. “Vaguada de la Palma”. Proyecto de innovacion docente institucional (ID2014/0325). Curso 2014/2015 Investigadores participantes: Mónica Segurado y Dr. César Roncero Visita a las instalaciones y servicios del IBFG y participación en diversas charlas y conferencias, por parte de los alumnos de la “Universidad de la Experiencia” de la Universidad de Salamanca. 4 de mayo de 2015 Investigador responsable: Dr. Francisco Antequera Presentación del IBFG y visita a las instalaciones a los alumnos del I.E.S. Pedro de Tolosa (San Martín de Valdeiglesias, Madrid). 10 de noviembre de 2015. Investigadores responsables: Francisco del Rey, Carlos Rodríguez Vázquez de Aldana, Ramón Santamaría, Sara Orellana Muñoz, Javier Encinar del Dedo Visita y actividades académicas con los alumnos de 2º curso de la Facultad de Medicina (Universidad de Salamanca). 25 de noviembre de 2015 Investigadores responsables: Dra. Pilar Pérez, Dr. Ramón Santamaría, Dr. Sergio Moreno, Dr. Carlos R. Vázquez de Aldana, Dra. Beatriz Santos Ciclo de Conferencias invitadas en centros de investigación. “Organización nucleosomal y evolución del genoma eucariótico” Universidad de Sevilla. 22 mayo 2015 Investigador responsable: Dr. Francisco Antequera Conferencia de divulgación sobre "Estructura y función de las células". Alumnos de la Universidad de la Experiencia (Toro, Zamora). Salamanca 4 de mayo de 2015 Investigador responsable: Dr. Francisco Antequera

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Resumen de la actividad científica del IBFG en 2015

Publicaciones IBFG Q1 24 Q2 6 Q3 0 Q4 0 Proyectos de investigación vigentes Internacionales 2 Nacionales 30 Autonómicos 4 Congresos y conferencias Congresos organizados en el IBFG 3 Conferencias invitadas congresos internacionales 10 Conferencias invitadas congresos nacionales 11 Ponencias invitadas congresos internacionales 13 Ponencias invitadas congresos nacionales 8 Tesis, trabajos fin de máster y de fin de grado IBFG Tesis doctorales defendidas 5 Trabajos fin de máster 7 Trabajaos fin de grado 13 Internacionalización Coautorías en publicaciones/trabajos internacionales 13 Actividad académica Coordinación máster en Biología Celular y Molecular Participación en el máster en Biología y Clínica del Cáncer Impartición Grado en Biología Plan de acción Tutorial Facultad de Biología Coordinación Programa Movilidad Internacional

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Programa de seminarios internos y externos en 2015

Programa de seminarios internos en 2015

Nombre: Angela Rubio Título: Cell cycle regulation under low nutritional conditions Fecha: 09-01-2015 Nombre: Daniel Jiménez Título: Astrocyte NMDA receptors activity sustains neuronal survival through a Cdk5-nrf2 pathway. Fecha: 15-01-2015 Nombre: Laura Parrilla Título: Continuando con el ratón p53mitoERTAM. Fecha: 22-01-2015 Nombre: Sara Orellana Título: Importancia de la plasticidad del anillo de septinas en la biología de C.albicans Fecha: 29-01-2015 Nombre: Teresa Revilla Título:  Estudio de Rga6, GAP de Cdc42 que regula la morfología celular de Schizosaccharomyces pombe Fecha: 05-02-2015 Nombre: Irene Arcones Título: Maintaining chitin synthesis homeostasis: the role of the early and late endosomal recycling in the maintenance of intracellular pools of Chs3 Fecha: 19-02-2015 Nombre: Carlos Antón Título: The role of exomer complex in protein secretion in fungi and its co-evolution with the Chitin Synthase III Fecha: 26-02-2015 Nombre: María Ángeles Curto Título: Estudio del papel de las posibles claudinas fúngicas DNIIp-DNI2p en el compartimentalización y la fusión de membranas Fecha: 12-03-2015 Nombre: Marta Hoya Título: El complejo CfrL/BchI en Schizosaccharomyces pombe : Tráfico desde el Golgi y los endosomas, ¿exómero o no? Fecha: 19-03-2015 Nombre: Sandra Moro Título: Papel del complejo Cfrl/BchI en la respuesta a estrés de Schizosaccharomyces pombe. Fecha: 26-03-2015 Nombre: Elvira Manjón Título: RgfIp (activador de la GTPasa RhoIp) es necesario en el mantenimiento de la estabilidad genómica en S. pombe Fecha: 09-04-2015

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Nombre: Isabel Acosta Título: Roles of the polo-like kinase Cdc5 during meiosis in Saccharomyces cerevisiae Fecha: 16-04-2015 Nombre: Sara Rivera Título: From quiescence to proliferation in Caenorhabditis elegans Fecha: 07-05-2015 Nombre: María Tenorio Título: La doble personalidad de la DNA polimerasa X en Ustilago maydis Fecha: 14-05-2015 Nombre: Antonio de la Torre Título: Papel de la ruta TOR durante el proceso de infección en Ustilago maydis Fecha: 21-05-2015 Nombre: Esther Cabañas Título: Estabilización de las horquillas de replicación por el checkpoint de fase S en S.cerevisae Fecha: 28-05-2015 Nombre: Luisa Bustamante Título: Control of meiotic recombination by cell cycle kinases. Fecha: 11-06-2015 Nombre: Camilla Frattini Título: The Bul2/Rsp5 ubiquitin ligase complex is required for replication fork restart. Fecha: 25-06-2015 Nombre: Sara Villa Título: Identification of Bul2/Rsp5 targets in response to replication stress Fecha: 02-07-2015 Nombre: Sergio Antoraz Título: Regulación de la producción de antibióticos en Streptomyces coelicolor por el sistema de dos componentes AbrA Fecha: 09-07-2015 Nombre: Prakhar Bisht Título: A topological role of the THO complex in coordinating DNA replication and gene transcription Fecha: 23-07-2015 Nombre: Sara González Título: Contribución de la secuencia del DNA al posicionamiento de los nucleosomas in vivo Fecha: 08-10-2015 Nombre: Enrique Vázquez Título: RiboPol: tras las huellas de la replicación a lo largo del genoma Fecha: 15-10-2015 Nombre: Critina Rodríguez Título: Impact of Tp53 Arg72Pro polymorphism on neurovascular repair and prognosis after intracerebral hemorrhage Fecha: 22-10-2015 Nombre: Verónica Bobo Título: Establishing synapses. Role of the interaction between APC/C-CdhL and ROCK-II Fecha: 29-10-2015

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Nombre: Rebeca Lapresa Título: Human Tp53 Arg72Pro polymorphism dictates neuronal susceptibility to amyloid B-neurotoxicity Fecha: 05-11-2015 Nombre Paula Allepuz Título: New functions of the heterodimer Rpb4/7 Fecha: 19-11-2015 Nombre: Héctor Toledo Título: Regulación por pH del transportador de Zinc alcalino, zrfC, esencial para la virulencia de Aspergillus fumigatus Fecha: 26-11-2015 Nombre: Sara Orellana Título: Importancia de la plasticidad del anillo de septinas en la biología de C. albicans Fecha: 03-12-2015 Nombre: Juan Carlos García Título: Control de la formación del surco de división durante anafase en la levadura de fisión Fecha: 10-12-2015

Programa seminarios externos en 2015 Nombre: Pedro Fernández Salguero. Universidad de Extremadura (Badajoz).16-01-2015 Nombre: José Ignacio Ibeas. Universidad Pablo de Olavide (Sevilla). 06-02-2015 Nombre: Miguel Angel Rodríguez Gabriel. Universidad Autónoma de Madrid. 13-02-2015 Nombre: Encarnación Martínez Salas. Centro Biología Molecular (CSIC). Madrid 20-02-2015 Nombre: Fátima Gebauer. Centro de Regulación Genómica. Barcelona. 27-02-2015 Nombre: Aurora Ruiz Herrera. Universidad Autónoma de Barcelona. 06-03-2015 Nombre: Rosa Esteban. IBFG. 20-03-2015 Nombre: María Gómez. Centro de Biología Molecular. Madrid. 27-03-2015 Nombre: Raúl Durán. mTOR and glutamine metabolism in cancer cells. Institut Européen de Chimie et Biologie. INSERM. Pessac (Francia) 10-04-2015 Nombre: Manuel Fuentes. Proteómica funcional: nuevas perspectivas. Centro de Investigación del Cáncer. Salamanca. 20-04-2015. Nombre: Stephen West. Defective DNA strand break repair: links to genome instabillity and cancer. The Francis Crick Institute. Clare Hall Laboratories. Hers (UK). 22-04-2015 Nombre: Antonio di Pietro. Departamento de Genética. Universidad de Córdoba. 19-06-2015 Nombre: Mohan K. Balasubramanian. Division of Biomedical Cell Biology. Warwick Medical School. University of Warwick. UK. 06-10-2015 Nombre: Daniel Tornero. Lund Stem Cell Center. Universidad de Lund. Suecia. 18-12-2015.  

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Personal de plantilla adscrito al IBFG

• PERSONAL DE LA USAL Personal docente e investigador Profesores funcionarios Nombre 1er Apellido 2º Apellido Categoría Juan Pedro Bolaños Hernández Catedrático Francisco del Rey Iglesias Catedrático José Antonio Calera Abad Profesor Titular Margarita Díaz Martínez Profesora Titular Emilio Fernández Sánchez Profesor Titular Fernando Leal Sánchez Profesor Titular Luis A. Miguel Quintales Profesor Titular Cesar Roncero Maillo Profesor Titular Yolanda Sánchez Martín Profesora Titular Beatriz Santos Romero Profesora Titular Mª Henar Valdivieso Montero Profesora Titular Nieves Rodríguez Cousiño Profesora Titular

Profesor contratado doctor permanente Pedro M. Coll Fresno

Profesor ayudante doctor Belén Suárez Fernández

Personal investigador contratado permanente (HUS y USAL)

Ángeles Almeida Parra Investigadora estabilizada I3SNS y

Profesora Asociada USAL Personal investigador contratado Mónica Segurado Carrascal Investigadora Contr. USAL

Personal de administración y servicios Personal laboral permanente Nombre 1er Apellido 2º Apellido Categoría Rosario Valle Vicente Técnico especialista laboratorio

• PERSONAL DEL CSIC Personal investigador Personal investigador funcionario Nombre 1er Apellido 2º Apellido Categoría Francisco Antequera Márquez Prof. de Investigación Sergio Moreno Pérez Prof. de Investigación Mª Pilar Pérez González Prof. de Investigación José Pérez Martín Prof. de Investigación Mª Rosa Esteban Cañibano Prof. de Investigación Juan Carlos Ribas Elcorobarrutia Investigador Científico Carlos Rodríguez Vázquez de Aldana Investigador Científico

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Rodrigo Bermejo Moreno Científico Titular Cristina Martín Castellanos Científica Titular Dionisio Martín Zanca Científico Titular Pedro A. San Segundo Nieto Científico Titular Ramón Santamaría Sánchez Científico Titular Mercedes Tamame González Científica Titular

Personal investigador contratado Andrés Clemente Blanco Ramón y Cajal

Personal técnico en plantilla o en proceso de consolidación Personal funcionario Carmen J. Castro Pichel Titulada Superior Laura Marín Vinader Titulada Superior Mª del Mar Sánchez García Titulada Superior Francisco Soriano Lázaro Titulado Técnico Fco. Javier Tola Arribas Titulado Técnico Isabel Acosta Gómez Ayudante de Investigación Francisco Alonso Mesonero Ayudante de Investigación Encarnación Estévez Rodríguez Ayudante de Investigación Alegría García Rodríguez Ayudante de Investigación Eva Mª Merino García Ayudante de Investigación Elvira Portales Francisco Ayudante de Investigación Yolanda Arnaiz Pita Ayudante de Investigación

Tsutomu Fujimura Titulado Superior PersonalLaboral María Fernández García

Técnico Superior Actividades Técnicas y Profesionales (Grupo 3)

ESTRUCTURA FUNCIONAL DEL IBFG. Unidades de Investigación Unidad I: Morfogénesis y polaridad celular Personal investigador de plantilla Francisco del Rey Iglesias Catedrático Mª Pilar Pérez González Prof. de Investigación Juan Carlos Ribas Elcorobarrutia Investigador Científico Carlos Rodríguez Vázquez de Aldana Investigador Científico César Roncero Maillo Profesor Titular Yolanda Sánchez Martín Profesora Titular Beatriz Santos Romero Profesora Titular Henar Valdivieso Montero Profesora Titular Pedro M. Coll Fresno Profesor Contrat. Dr. permanente Belén Suárez Férnandez Profesor Ayudante Doctor

Personal técnico de plantilla Elvira Portales Francisco Ayudante de Investigación Yolanda Arnaiz Pita Ayudante de Investigación Rosario Valle Vicente Técnica especialista lab. USAL

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Unidad II. Dinámica del genoma y epigenética Personal investigador de plantilla Francisco Antequera Márquez Prof. de Investigación Mª Rosa Esteban Cañibano Prof. de Investigación Olga Calvo García Científica Titular Rodrigo Bermejo Moreno Científico Titular Luis A. Miguel Quintales Profesor Titular Nieves Rodríguez Cousiño Profesora Titular Pedro A. San-Segundo Nieto Científico Titular

Personal investigador contratado Andrés Clemente Blanco Ramón y Cajal CSIC Mónica Segurado Carrascal Invest. Contratada USAL

Personal técnico de plantilla Mª del Mar Sánchez García Titulada Superior Isabel Acosta Gómez Ayudante de Investigación Tsutomu Fujimura Titulado Superior

Unidad III. Regulación génica y diferenciación celular Personal investigador de plantilla Juan Pedro Bolaños Hernández Catedrático Sergio Moreno Pérez Prof. de Investigación José Pérez Martín Prof. de Investigación José A. Calera Abad Profesor Titular Margarita Díaz González Profesora Titular Fernando Leal Sánchez Profesor Titular Emilio Fernández Sánchez Profesor Titular Dionisio Martín Zanca Científico Titular Ramón Santamaría Sánchez Científico Titular Mercedes Tamame González Científica Titular

Personal investigador contratado permanente

Ángeles Almeida Parra Investigadora estabilizada I3SNS

Profesora Asociada USAL Personal investigador contratado

María Delgado Esteban Contrato Miguel Servet IBSAL

 

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Servicios Científico Técnicos del IBFG

Citometría de Flujo

La citometría de flujo es una técnica analítica que permite medir la emisión de fluorescencia y la dispersión de luz producidas por la iluminación con un haz laser de células o partículas microscópicas de una en una y arrastradas por un flujo portador, a medida que pasan frente a un sistema de detección. Además, en algunos sistemas las células o partículas pueden ser separadas físicamente de acuerdo a sus propiedades físicas. De esta forma, la citometría de flujo permite realizar el análisis de múltiples parámetros en células individuales dentro de poblaciones celulares heterogéneas. Los datos recogidos pueden ser analizados estadísticamente con programas especializados que proporcionan información acerca de diferentes características celulares, como por ejemplo:

• El tamaño celular (parámetro FCS) • La complejidad celular (parámetro SSC) • Emisión de fluorescencia (FL2, FL3, etc.)

Microscopía

La microscopía óptica es una de las herramientas de investigación fundamentales en el IBFG. Hoy en día, con el desarrollo y las aplicaciones de las proteínas fluorescentes, es posible el diseño de experimentos complejos que permiten estudiar la dinámica de los procesos celulares en células vivas. Estos experimentos pueden ser realizados adquiriendo imágenes de las muestras que proporcionan información multidimensional en x, y, z, longitud de onda y tiempo. El servicio de microscopía tiene una dotación de equipos que permiten trabajar con una amplia gama de técnicas de microscopía óptica, desde la adquisición de imágenes de campo claro y fluorescencia convencional, hasta las microscopías confocales espectral y “spinning disk”. El servicio también tiene el equipamiento informático con los programas necesarios para el procesamiento de las imágenes adquiridas en los experimentos. Prestaciones a los usuarios: Análisis por microscopía confocal - En un microscopio confocal la luz que está fuera de foco es excluida de la imagen final gracias a la utilización de un diafragma. Debido a esta eliminación de la luz no enfocada las imágenes de la muestra tienen mayor resolución y contraste que las obtenidas con la microscopía de fluorescencia convencional. La fuente de luz utilizada es un haz laser y la otra ventaja de la técnica es que se pueden adquirir imágenes de los distintos planos focales en Z y después hacer una reconstrucción tridimensional de la muestra. En microscopía confocal se puede trabajar con muestras fijadas y también con células vivas. Analisis por microscopía confocal in vivo En un microscopio confocal la luz que está fuera de foco es excluida de la imagen final gracias a la utilización de un diafragma. Debido a esta eliminación de la luz no enfocada las imágenes de la muestra tienen mayor resolución y contraste que las obtenidas con la microscopía de fluorescencia convencional. La fuente de luz utilizada es un haz laser y la otra

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ventaja de la técnica es que se pueden adquirir imágenes de los distintos planos focales en Z y después hacer una reconstrucción tridimensional de la muestra. En microscopía confocal se puede trabajar con muestras fijadas y también con células vivas. Análisis por microscopía convencional Hoy en día la microscopía óptica permite estudiar los procesos biológicos tanto en células fijadas como vivas, siendo una herramienta indispensable para los biólogos celulares y moleculares. El microscopio óptico crea una imagen aumentada y detallada de la muestra, basada en los principios de transmisión, absorción, difracción y refracción de las ondas de luz. Entre las principales técnicas de microscopía óptica que permiten incrementar el contraste para el estudio de células vivas están: el contraste de fases, la técnica DIC ("Differential Interference Contrast") y la fluorescencia. Análisis por microscopía de fluorescencia La microscopía de fluorescencia utiliza la capacidad que tienen las moléculas fluorescentes o fluorocromos de absorber luz de longitudes de onda específicas para cada molécula y a continuación emitir fluorescencia con longitudes de onda más largas. Esta propiedad de las moléculas fluorescentes hace que la microscopía de fluorescencia sea una herramienta fundamental para la biología celular y molecular. Además, el aislamiento y caracterización de la proteína verde fluorescente y sus aplicaciones en el desarrollo de toda una familia de proteínas fluorescentes, ha hecho posible utilizar la microscopía de fluorescencia con células vivas en las que se estudian la localización y función de diferentes proteínas celulares. Composición de imágenes de microscopio La existencia de una gran variedad de programas informáticos especializados permite el procesamiento y análisis de las imágenes capturadas con los diferentes sistemas de microscopía (MetaMorph, ImageJ, etc...)

Genómica y Bioinformática La secuenciación masiva (Next Generation Sequencing) permite estudiar los genomas a un nivel de resolución imposible de abordar con las tecnologías de genómica tradicionales. La secuenciación masiva permite:

• Secuenciación rápida de genomas completos (reordenamientos y duplicaciones). • Mayor profundidad en el análisis de regiones diana específicas para la detección de

variantes poco frecuentes. • Secuenciación de transcriptomas completos y detección de variantes de RNA y

sitios de procesamiento alternativo. • Análisis de metilomas completos o de interacciones del DNA con proteínas. • Estudio de la diversidad microbiana en humanos o en el medio ambiente.

Prestaciones a los usuarios.

• Ultrasecuenciación de DNA – NGS. • Secuenciación de segunda generación. • Secuenciación masiva en paralelo.