31

In The Name of God Biological Journal of Microorganismbjm.ui.ac.ir/article_19552_afd20d7af3cc0545446b73153243ce00.pdf · Biological Journal of Microorganism has been recognized and

  • Upload
    others

  • View
    1

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

IIn The Name of God

Biological Journal of Microorganism

(Scientific - Research)

3rd Year, Vol. 3, No. 12

Winter 2015

Biological Journal of Microorganism has been recognized and ranked as a scientific-research

journal based on the document number 3/270996 issued by the Evaluation Committee of

Scientific journals of Research and Technology Ministry, in March, 2012.

BJM is listing or indexing in these Databases

http://uijs.ui.ac.ir/bjm BJM Electronic Database

http://www.isc.gov.ir ISC: Islamic World Science Citation center

http://www.sid.ir SID: Scientific Information Database

http://www.magiran.com Magiran: Journals database

http://www.doaj.org DOAJ: Directory of Open Access Journals

http://ulrichsweb.serialssolutions.com Ulrichsweb: global serials directory

http://journals.indexcopernicus.com Index Copernicus (IC Journal Master List)

http://www.ebscohost.com BSCOhost databases

http://scholar.google.com/ Google Scholar

Publication and Lithography: The University of Isfahan Publications

Publisher: the University of Isfahan

Number of copies: 500 copies

Price: 7 $ or 5 �

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -- - - - - - - - - - - - Authors and subscribers can submit their requests directly to

http://uijs.ui.ac.ir/bjm

Biological Journal of Microorganism

License Holder: The University of Isfahan Vice-President of Research and Technology

ISSN: 2322-5173 e-ISSN: 2322-5181

3rd Year, Vol. 3, No. 12, Winter 2015

Scientific Research Journal

Director in Charge: Dr. Seyed Hamid Zarkesh Associate Professor of Immunology University of Isfahan [email protected]

Editor-in-Chief: Dr. Giti Emtiazi Professor of Microbiology University of Isfahan [email protected]

Executive Manager: Arezoo Rahimsalmani [email protected] Tel: + 98 311 793 4230 Fax: + 98 311 793 2177

Literary- English Editor: Yaser Tazhibi

Literary- Farsi Editor: Batool Mehmandoust

General Layout Designer: Masume Dehghan

Publisher: University of Isfahan Address: Biological Journal of Microorganism Office, Dept. of Technology and Research, Bureau of Printing, Publishing and magazines, Hezarjarib Ave., University of Isfahan, Isfahan, Iran P. O. Box: 81746 - 73441, Isfahan – Iran [email protected]

Editorial Board

Dr. Mehrdad Azin Associate Professor of Biotechnology Iranian Research Organization for Science &

Technology (IROST)

[email protected]

Dr. Malahat Ahmadi Associate Professor of Microbiology Urmia University

[email protected]

Dr. Giti Emtiazi Professor of Microbiology University of Isfahan

[email protected]

Dr. Mohammad Reza Pour Shafie Professor of Microbiology Pasteur Institute of Iran

[email protected]

Dr. Mojtaba Taran Associate Professor of Microbiology Razi University

[email protected]

Dr. Nima Hosseini Jazani Professor of Microbiology Urmia University of Medical Science

[email protected]

Dr. Mohammad Rabbani Associate Professor of Microbiology University of Isfahan

[email protected]

Dr. Mohammad Roayaei Associate Professor of Microbiology Shahid Chamran University of Ahvaz

[email protected]

Dr. Seyed Hami Zarkesh Esfahani Associate Professor of immunology University of Isfahan

[email protected]

Dr. Nurekhoda Sadeghifard Associate Professor of Microbiology Ilam University

[email protected]

Dr. Rayhaneh Amooaghaie Associate Professor of plant physiology University of Shahrekord

[email protected]

Dr. Hajieh Ghasemiyan Safaee Professor of Microbiology Isfahan University of Medical Science

[email protected]

Dr. Ruha Kasra Kermanshahi Professor of Microbiology Alzahra University

[email protected]

Dr. Iraj Nahvi Professor of Biotechnology University of Isfahan

[email protected]

Author Submission Guidelines

The scientific Biological journal of Microorganism publishes articles dealing with research in fields related to biology of microorganisms and subjects related to it, including bacteria, yeasts, etc.

1- Topics of interest

� Structure, metabolism and genetics of microorganisms

� Ecology and Systematic of microorganisms

� Industrial, Environmental and Food Microbiology

� Pathogenic microorganisms

� Microbial nanobiotechnology

2- Submitting articles

� Registration in BJM electronic database and completing Submission form is required for submitting articles. BJM electronic database: http://uijs.ui.ac.ir/bjm

� the author (s) should confirm that their manuscripts report original research and has not been published and is not under review elsewhere; Except for the abstracts presented at the Scientific Assembly (the papers presented at scientific meetings must be noted on the prerequisite form).

� Authors are responsible for the content of the article.

� Editors are free to make the final decision on whether to accept or reject a particular manuscript.

� Manuscripts will be subject to a pre-review and when the approval of the editorial is obtained, it will be published with respect to time.

� The Innovation and Commitment form (prerequisite form) should be completed and submitted.

3- Manuscript preparation

� Use Microsoft Office Word 2007 in letter-sized paper (8½ × 11 inches) in one column.

� Manuscripts should be well written and well organized with no grammatical deviation.

� Authors' names should be listed in the order they wish to appear.

� Manuscripts should be compiled in the following order:

Introduction, Material and Method, Results, Discussion and conclusion, References.

� Acknowledge (if required) should be at the end of the article before the references section.

4- Title, Abstracts and Keywords

� A brief and informative title of less than 20 words.

� Abstracts of less than 300 words are required for all papers submitted and should precede the text of a paper containing the following sections:

Title, Introduction, Material and method, Results, Discussion and conclusion, Key words

� Key words: Up to 7 key words listed, in alphabetical order, after the abstract are required for indexing purposes.

� Preparing Persian abstract is necessary. This abstract should be set equal to English one and containing the following sections:

نتايج، بحث و نتيجه گيريها، مقدمه، مواد و روش

5- Tables, Figures, Diagrams and Photographs and Equations

� All tables, figures, diagrams and photographs should be numbered and have a title. The title of tables must be on top and below for the figures.

� If a figure or table is taken from another source, reference to the original table or figure should be provided and cited in the reference listed.

� Diagram should be set in one-dimensional format with black and white in color.

� For convenience of citation of equations, authors are encouraged to use Microsoft Word Equation 3.3. Plain sequential numbering through the manuscript is preferred and uses the International System of Units (SI).

6- References

� All references should be translated in English and they are numbered consecutively in the order they are first used in the text.

� All references cited in the text must appear in the reference list, and all references listed in the reference list must be cited in the text.

� Vancouver citation style must be applied for all manuscripts. The numbers should be in parentheses where you refer to (cite) your source of information. A consecutive number is allocated to each source as it is referred to for the first time. For more information regarding Vancouver citation style refer to Journal's web site.

Example of Citation to Books:

Lodish H, Baltimore D, Berk A, Zipursky Sl, Matsudaria P, Datnell j. Moleccular cell biology. 3rd ed. New York: Scientific American; 1995.

Example of Citation to Journal Articles:

Zamani P, Amoozegar M, Khajeh K. Cloning and Expression of Laccase Enzyme from B. pumilus strain GAZ23. Biological Journal of Microorganism. 2014; 3 (9):1-10. Example of Citation to a Chapter:

Poter RJ, Meldrum BS. Antiepileptic drugs. In: Katzung BG, editor. Clinical pharmacology. 6th ed. Norwalk, CN: Appleton and Lange; 1995: 361-80

Example of Citation to Theses and dissertations:

Bakhsheshi R. Isolation and Identification of chemolithotroph acidophilic bacteria of Qotoursou spring in Ardebil province [Dissertation]. Tehran: Shahid Beheshty Univ.; 2006.

Biological Journal of Microorganism

3rd Year, Vol. 3, No. 12, Winter 2015

Table of contents

1-14 A study on biosorption of copper ions by fungal chitosan: an alternative to shrimp chitosan Sanaz Behnam, Keikhosro Karimi, Akram Zamani and Arjomand Mehrabani-Zeinabad

15- 24 Polyphasic identification of Lechevaliera fradia subsp. Iranica, A rare actinomycete isolated from Loshan region of Iran Mahdi Moshtaghi Nikou, Mohaddaseh Ramezani and Shima Sadat Seyedmahdi

25- 32 The Study of Synergistic Effects of n.butanolic Cyclamen coum Extract and Ciprofloxacin on inhibition of Pseudomonas aeruginosa biofilm formation Ahya Abdi-Ali, Morvarid Shafiei, Fereshteh Shahcheraghi, Azra Saboora and Tooba Ghazanfari

33- 42 The effect of phosphate deficiency on quorum sensing signaling pathway of Sinorhizobium meliloti Najmeh Pakdaman and Akbar Mostajeran

43- 52 Comparison between Iranian and foreign mouthwashes effect against Candida albicans as a common fungal mouth flora Somayeh Talebi, Azar Sabokbar, Majid Riazipour and Mohsen Saffari

53- 58 Identifying verotoxigenic Escherishia.coli isolated from cold water fishes by Multiplex PCR in Chaharmahal Va Bakhtiary province Mojtaba Bonyadian

59- 68 Response of growth, protein and fatty acid content of Desmodesmus cuneatus to the repletion and depletion of nitrogen Mehdi Naderi Farsani, Saeed Meshkiniy, Ramin Manaffar and Zahra Asal Pishe

69- 78 Prevalence of CTX-M-Type β-Lactamases in Multi–Drug Resistant Escherichia coli Isolates from North of Iran, Rasht Tolou Babaei Hemmati, Mohammad Javad Mehdipour Moghaddam, Zivar Salehi and Seyyed Mahmood Habibzadeh

79- 92 A comparative study between inhibitory effect of L. lactis and nisin on important pathogenic bacteria in Iranian UF Feta cheese Saeed Mirdamadi and Shadi Agha Ghazvini

93- 104 Isolation and screening of native polyhydroxyalkanoate producing bacteria from oil contaminated soils of Abadan refinery Hossein Motamedi, Mohammad Roayaee Ardakani and Nasim Mayeli

10-1Farsi Abstract ■

18-11Annual table of contents (3rd Year, Vol. 3, No. 9-12, Spring 2014- Winter 2015) ■

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 18

Annual table of contents (3rd Year, Vol. 3, No. 9-12, Spring 2014- Winter 2015)

3rd Year– Vol. 3- No. 12, Winter 2015

1-14 A study on biosorption of copper ions by fungal chitosan: an alternative to shrimp chitosan Sanaz Behnam, Keikhosro Karimi, Akram Zamani and Arjomand Mehrabani-Zeinabad

15- 24 Polyphasic identification of Lechevaliera fradia subsp. Iranica, A rare actinomycete isolated from Loshan region of Iran Mahdi Moshtaghi Nikou, Mohaddaseh Ramezani and Shima Sadat Seyedmahdi

25- 32 The Study of Synergistic Effects of n.butanolic Cyclamen coum Extract and Ciprofloxacin on inhibition of Pseudomonas aeruginosa biofilm formation Ahya Abdi-Ali, Morvarid Shafiei, Fereshteh Shahcheraghi, Azra Saboora and Tooba Ghazanfari

33- 42 The effect of phosphate deficiency on quorum sensing signaling pathway of Sinorhizobium meliloti Najmeh Pakdaman and Akbar Mostajeran

43- 52 Comparison between Iranian and foreign mouthwashes effect against Candida albicans as a common fungal mouth flora Somayeh Talebi, Azar Sabokbar, Majid Riazipour and Mohsen Saffari

53- 58 Identifying verotoxigenic Escherishia.coli isolated from cold water fishes by Multiplex PCR in Chaharmahal Va Bakhtiary province Mojtaba Bonyadian

59- 68 Response of growth, protein and fatty acid content of Desmodesmus cuneatus to the repletion and depletion of nitrogen Mehdi Naderi Farsani, Saeed Meshkiniy, Ramin Manaffar and Zahra Asal Pishe

69- 78 Prevalence of CTX-M-Type β-Lactamases in Multi–Drug Resistant Escherichia coli Isolates from North of Iran, Rasht Tolou Babaei Hemmati, Mohammad Javad Mehdipour Moghaddam, Zivar Salehi and Seyyed Mahmood Habibzadeh

79- 92 A comparative study between inhibitory effect of L. lactis and nisin on important pathogenic bacteria in Iranian UF Feta cheese Saeed Mirdamadi and Shadi Agha Ghazvini

93- 104 Isolation and screening of native polyhydroxyalkanoate producing bacteria from oil contaminated soils of Abadan refinery Hossein Motamedi, Mohammad Roayaee Ardakani and Nasim Mayeli

10-1Farsi Abstract ■ 18-11Annual table of contents (3rd Year, Vol. 3, No. 9-12, Spring 2014- Winter 2015) ■

17 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

Annual table of contents (3rd Year, Vol. 3, No. 9-12, Spring 2014- Winter 2015)

3rd Year– Vol. 3- No. 11, Autumn 2014

1 Investigation and Partial Purification of Tellurite Reducing Enzyme from a Moderately Halophilic Bacterium Salinicoccus iranensis Sana Alavi, Mohammad Ali Amoozegar and Khosro Khajeh

2 Over production of xylanase from Bacillus mojavensis by classical mutagenesis Shokoofeh Ghazi, Mehrdad Azin and Abbas Akhavan Sepahi

3 Study of ACC deaminase activity of Rhizobacteria isolated from soils of northern Iran Zeinab Sadat Motesharrei, Hajar Mahmoodi, Parviz Owlia and Hassan Salimi

4 Isolation, Screening and Identification of Diatoms from Kermanshah Oil Refinery Wastewater Treatment Systems Elham Mohamadian, Naser Karimi, Behnam Rasekh, Hamidreza Ghasempour and Soma Dehlavi

5 Study of contamination of different dairy products distributed in Isfahan to saprophytic fungi Fatemeh Fallahi, and Mahboobeh Madani

6 Study of frequency and antimicrobial resistance of Lactococcus garvieae in rainbow trout fish in Chaharmahal va Bakhtiari Province Masoud Shahrani, Mehdi Raissy and Elahe Tajbakhsh

7 Optimization of α-amylase production by Bacillus amyloliquefaciens using response surfaces methodology Hami Kaboosi, Naimeh Tabari and Hamid Reza Samadlouie

8 Biocontrol of Causative Agent of Citrus Canker Disease Using Antimicrobial Substances Produced by Aspergillus awamori K-03 Sara Kazemzadeh, Naser Farrokhi, Saeed Aminzadeh, Seyed Mehdi Alavi, Abolfazl Masoudi, Mojtaba Mamarabadi and Tannaz Gudarzi

9 Isolation of Zinc Oxide (ZnO) nanoparticles resistant Pseudomonas strains from soil and investigation of Zinc resistance genes Shahla Soltani Nezhad, Mohammad Rabbani Khorasgani, Mohammad Mehdi Yaghoobi and Shahryar Shakeri

10 Examination of Clostridium difficile Contamination in beef meat distributed in Isfahan using culture and Multiplex-PCR method Zahra Esfandiari, Mohammad Jalali, Hamid Ezzatpanah, Scott.Weese and Mohammad Chamani

1- 116 Farsi full text ■

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 16

Annual table of contents (3rd Year, Vol. 3, No. 9-12, Spring 2014- Winter 2015)

3rd Year– Vol. 3- No. 10, Summer 2014

1 Mutagenesis by UV and Nitrous Acid for increase of rennet production in Rhizomucor miehei Naser Tajik, Mehrdad Azin, Masoud Fallahpour and Rezvan Pourahmad

2 Isolation and identification of oil sludge degrading bacteria from production tank Number 9 Masjed Soleiman Yalda Sheyni, Hossein Motamedi and Ahmad-ali Pourbabaee

3 Isolation and identification of a riboflavin producer yeast from Nectarine Roya Daneshazari, Mohammad Roayaei and Hossein Najafzadeh

4 Increase of Clavulanic acid production by using recombinant Streptomyces clavuligerus strain including claR gene Maryam Kay, Zohreh Hojati and Majid Motovali-Bashi

5 Molecular detection of Trypanosoma from one-humped camels slaughtered in Najafabad slaughterhouse Samaneh Mehrabiyan, Mohammadreza Mahzounieh, Mohammad Rabbani-Khorasgani, Hossein Tahmasby, Jasem Amiri Dehcheshmeh, Azam Ghorbani, Hamid Esmaili Najafabadi and Mehdi Salimi

6 Isolation and characterization of Fenitrothion-degrading bacteria from pestachio gardens in Kerman Provinance Mehrnoush Ghafari, Mehdi Hasanshahian and Mohamad Mahani

7 Wound Healing Activity of Methanolic Extract of Protoparmeliopsis muralis on Wounds Infected with Staphylococcus aureus in Wistar Rat Tahereh Valadbeigi and Somaye Rashki

8 Biodegradation of cyanide using Serratia sp. isolated from contaminated soil of gold mine in Takab Mojtaba Mohseni and Sajad Firuzyar

9 Flora of soil fungi in Khuzestan province's oil regions Vida Dawoodi, Mahbobeh Madani and Arezoo Tahmourespour

10 Isolation and identification of antibiotic resistance genes in Staphylococcus aureus isolates from respiratory system infections in shahrekord, Iran Maryam Reisi, Elahe Tajbakhsh and Hassan Momtaz

1- 106 Farsi full text ■

15 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

Annual table of contents (3rd Year, Vol. 3, No. 9-12, Spring 2014- Winter 2015)

3rd Year– Vol. 3- No. 9, Spring 2014

1 Cloning and Expression of Laccase Enzyme from B. pumilus strain GAZ23 Parvin Zamani, Mohammad Ali Amoozegar and Khosro Khajeh

2 Optimization of media for bioethanol production by Pichia stipitis from sugarcane bagasse pretreated by dilute acid Mohsen Ahi, Mehrdad Azin, Seyed Abbas Shojaosadati, Ebrahim Vasheghani Farahani and Mohsen Nosrati

3 Allele Specific-PCR method for fast detection of gyrA gene mutaions in clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis Vahideh Vahidi, Mohammad Reza Zolfaghari, Azam Ahmadi, Mana Shojapour, Seyed Reza Moadab and Mohammad Arjomandzadegan

4 An Investigation of beta-lactam antibiotics resistance in Escherichia coli isolates and molecular detection of Escherichia coli O157:H7 in cage birds from Shahrekord, Iran Hossein Tahmasby, Sara Barati, Hassan Momtaz, Mohammad Rafiee Dolatabadi, Mohammad Ghasemi, Seied Vahid Ahmadi Salianeh and Samaneh Mehrabiyan

5 Molecular detection of Chlamydophila felis in ocular discharge of domestic cats in Tehran & Isfahan Hassan Momtaz, Mohammad Alirezaie and Peyman Keyhani

6 Extracellular Synthesis of Silver Nanoparticles by Ralstonia sp. SM8 Isolated from the Sarcheshmeh Copper Mine Morahem Ashengroph

7 Detection of virulence genes (yrp1 and yrpE) in the Yersinia ruckeri by polymerase chain reaction test in Chaharmahal-Va-Bakhtiary province, Iran Firooz fadaeifard and Saeed Simin

8 Isolation of phosphatase-producing phosphate solubilizing bacteria from Loriya hot spring: Investigation of phosphate solubilizing in the presence of different parameters Maryam Parhamfar, Arastoo Badoei-Dalfard, Mouj Khaleghi and Mehdi Hassanshahian

9 The Study of the Multilayer Filtration Process Efficiency on Giardia lamblia Elimination in Isfahan Water Treatment Plant Zahra Mosaviyan, Ali-Asghar Rastegari and Saeed Abedi

10 Improvement of endophytic Azospirillum colonization by co-inoculation with Cellulomonas Uda ATCC 491 Mohammad Javad Mehdipour Moghaddam, Giti Emtiazi and Majid Bouzari

1- 112 Farsi Full text ■

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 14

)1393بهار تا زمستان - 12تا 9شماره –ومسسال (فهرست مطالب ساليانه

1393زمستان -12شماره –سال سوم

ميگويي كيتوزان براي جايگزيني: قارچي كيتوزان توسط مس هاي يون زيستي جذب بررسي■ آباد ينز يمهربان ارجمند ي وزمان كريمي، اكرم ساناز بهنام، كيخسرو

1 ــازي ■ ــي ف ــايي پل ــه Lechevaliera fradia subsp. Iranicaشناس ــده از منطق ــدا ش ــادر ج ــت ن ــك اكتينومايس ، ي

لوشان ايران مهدي مشتاقي نيكو، محدثه رمضاني و شيما سادات سيد مهدي

2

بيوتيك سيپروفلوكساسين بر مهار تشـكيل و آنتي Cyclamen coumبررسي اثرات سينرژيسمي عصاره بوتانلي گياه ■ Pseudomonas aeruginosaبيوفيلم

احياء عبدي عالي، مرواريد شفيعي، فرشته شاهچراغي، عذرا صبورا و طوبي غضنفري

3

Sinorhizobium meliloti در quorum sensing سگينالينگ مسير روي فسفر كمبود تاثير■ نجمه پاكدامن و اكبر مستأجران

4 عنــوان فلــور هــاي ايرانــي و خــارجي بــر عليــه كانديــدا آلبيكــنس بــه مقايســه آزمايشــگاهي اثــر دهانشــويه ■

قارچي شايع در دهان پور و محسن صفاري ، آذر سبكبار، مجيد رياضيسميه طالبي

5

ــاكتري■ ــه اشريشــيا كلــي هــاي شناســايي ب ــي ب ــان ســرد آب وســيله واكــنش وروتوكســيژن جداشــده از ماهي اي پليمراز چندگانه در استان چهارمحال و بختياري زنجيره

مجتبي بنياديان

6

ــرايط ■ ــاتئوس درش ــموس كون ــك دسمودس ــيدچرب جلب ــروتئين و اس ــواي پ ــد، محت ــزان رش ــنش مي واك كمبود و انباشتگي نيتروژن

مشكيني، رامين مناف فر و زهرا عسل پيشهمهدي نادري فارساني، سعيد

7

ــوع ■ ــاي ن ــيوع بتاالكتامازه ــه CTX-Mش ــاي در جداي ــمال E. coliه ــي از ش ــه داروي ــت چندگان ــا مقاوم ب ايران، رشت

، محمــد جـواد مهـدي پـور مقدم، زيور صالحي و سيـد محمـود حبيــب زادهطلـوع بـابـايي همتي

8

زا در پنير فتا ايراني هاي بيماري باكتري و نيسين براي مهار رشدكوكوس الكتيس مقايسه اثر الكتو ■ سعيد ميردامادي و شادي آقا قزويني

9 ــال ■ ــاكتري غرب ــازي ب ــري و جداس ــده گ ــد كنن ــومي تولي ــاي ب ــي ه ــر پل ــي پليم ــانوآت از هيدروكس آلك

آلوده به نفت پااليشگاه آبادان هاي خاك رعايايي اردكاني و نسيم مايليحسين معتمدي، محمد

10

)1393بهار تا زمستان - 12تا 9شماره –سال سوم(فهرست مطالب ساليانه ■

18-11

104-1 انگليسي متن كامل■

13 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

)1393بهار تا زمستان - 12تا 9شماره –ومسسال (فهرست مطالب ساليانه

1393 پاييز -11شماره –سال سوم

ــي■ ــالص بررس ــبي و خ ــازي نس ــزيم س ــاي(آن ــاي ) ه ــؤثر در احي ــت م ــك دوس ــاكتري نم ــت از ب تلوريSalinicoccus iranensis

آموزگار و خسرو خواجهثنا علوي، محمد علي

20-1

تصادفي ييزا با استفاده از روش جهش باسيلوس موجاونسيسافزايش ميزان توليد آنزيم گزيالناز از ■ شكوفه غازي، مهرداد آذين و عباس اخوان سپهي

36-21

كشور شمال مناطق هاي خاك از شده جدا هاي ريزوباكتري در دآميناز ACC فعاليت بررسي■ سادات متشرعي، هاجر محمودي، پرويز اولياء و حسن سليميزينب

46-37

شـركت پـااليش نفـت خروجـي هـاي سيسـتم تصـفيه پسـاب دياتومـه شناسـايي و سـازي گري، خالص غربال ■ كرمانشاه

پور و سوما دهلوي الهام محمديان، ناصر كريمي، بهنام راسخ، حميدرضا قاسم

58-47

هاي ساپروفيت مختلف لبني عرضه شده در شهر اصفهان به قارچبررسي آلودگي محصوالت ■ فاطمه فالحي و محبوبه مدني

70-59

در ماهيـان قـزل آالي رنگـين كمـان الكتوكوكـوس گارويـه مطالعه فراوانـي و مقاومـت دارويـي بـاكتري ■ در استان چهارمحال و بختياري

مسعود شهراني، مهدي رئيسي و الهي تاجبخش

78-71

با روش سطح پاسخ فسينز آميلوليكويي باسيلوسسازي توليد آلفا آميالز توسط بهينه■ حامي كابوسي، نعيمه طبري و حميد رضا صمدلويي

90-79

بيوكنترل عامل مولـد بيمـاري شـانكر مركبـات بـا اسـتفاده از تركيبـات ضـد ميكروبـي توليـد شـده توسـط ■ K-03 Aspergillus awamori قارچزاده، ســـيد مهـــدي علـــوي، ابوالفضـــل مســـعودي، مجتبـــي ممرآبـــادي و طنـــاز كـــاظم زاده، ناصـــر فرخـــي، ســـعيد امـــينســـارا

گودرزي

98-91

هاي دخيل در مقاومت مقاوم به نانو اكسيد روي از خاك و بررسي ژن هاي سودوموناسجداسازي ■ شهريار شاكريشهال سلطاني نژاد، محمد رباني خوراسگاني، محمد مهدي يعقوبي و

108-99

بـا روش كلسـتريديوم ديفيسـيل بررسي آلودگي گوشـت گوسـاله عرضـه شـده در سـطح شـهر اصـفهان بـه ■ كشت و واكنش زنجيره اي پليمراز با تكنيك چندتايي

زهرا اسفندياري، محمد جاللي، حميد عزت پناه، اسكات ويز و محمد چمني

116-109

10 -1 چكيده انگليسي■

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 12

)1393بهار تا زمستان - 12تا 9شماره –ومسسال (فهرست مطالب ساليانه

1393 تابستان -10شماره –سال سوم

Rhizomucor mieheiو اسيد نيترو براي افزايش توليد رنت در UVيي توسط زا جهش■ پور و رضوان پوراحمد ناصر تاجيك، مهرداد آذين، مسعود فالح

12-1

مسـجد 9بـرداري شـماره هـاي تجزيـه كننـده پسـماند نفـت از مخـزن بهـره جداسازي و شناسـايي بـاكتري ■ سليمان

شيني، حسين معتمدي و احمدعلي پوربابايييلدا

26-13

جداسازي و شناسايي يك سويه توليدكننده ريبوفالوين از نكتارين ■ زاده آذري، محمد رعايايي اردكاني و حسين نجف رويا دانش

36-27

ــي ■ ــد آنت ــزايش تولي ــك اف ــك كالوالني ــه بيوتي ــاد گون ــا ايج ــيد ب ــاي اس ــسه ــي استرپتومايس ــروس كالول ج claRتراريخت واجد ژن

مريم كي، زهره حجتي و مجيد متولي باشي

44-37

آباد كشتار شده در كشتارگاه نجف كوهانه تريپانوزوم در شترهاي يك جستجوي مولكولي■ــاني خوراســگانييــه، محمدرضــا محزونســمانه مهرابيــان، ــان، ده چشــمه يــريجاســم امطهماســبي، ، حســينمحمــد رب ي، اعظــم قرب

يميسل يمهد آبادي و اسماعيلي نجفحميد

50-45

كننـده سـم آلـي كشـاورزي فنيتروتيـون از باغـات پسـته اسـتان هـاي تجزيـه جداسازي و شناسايي بـاكتري ■ كرمان

شاهيان و محمد ماهاني مهرنوش غفاري، مهدي حسن

64-51

اورئـوس اسـتافيلوكوكوس بـر زخـم آلـوده بـا پروتوپارمليوپسـيس مـوراليس اثر ترميمـي عصـاره متـانولي ■ ويستار موش در

سميه راشكيطاهره ولد بيگي و

74-65

جداشده از خاك آلوده معدن طال در تكاب سراشياتجزيه زيستي سيانيد توسط باكتري ■ مجتبي محسني و سجاد فيروزيار

86-75

خوزستاناستان هاي خاكزي مناطق نفتي قارچفلور ■ پور آرزو طهمورثو مدنيمحبوبه ، دا داودييو

96-87

جــدا اورئــوس اســتافيلوكوكوسي هــا ايزولــهبيــوتيكي در مقاومــت آنتــي ي هــا جداســازي و شناســايي ژن■ ي دستگاه تنفسي در شهرستان شهركرد ها شده از عفونت

مريم رئيسي، الهه تاج بخش و حسن ممتاز

106-97

10 -1 چكيده انگليسي■

11 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

)1393بهار تا زمستان - 12تا 9شماره –ومسسال (فهرست مطالب ساليانه

1393بهار -9شماره – سوم سال

GAZ23سويه Bacillus pumilusكننده آنزيم الكاز از باكتري كلونينگ و بيان ژن كد■ محمدعلي آموزگار و خسرو خواجهپروين زماني،

10-1

يكيا استيپيتيسبه كارگيري با از باگاس نيشكر پيش تيمار اسيدي شده توليد بيواتانولي ساز نهيبه■ محسن نصرتيو ابراهيم واشقاني فراهاني، سيد عباس شجاع الساداتيمحسن آهي، مهرداد آذين،

20-11

در مايكوبــاكتريوم Allele Specific PCR روش مولكــولي ســريعتشــخيص مقاومــت بــه افلوكساســين بــا ■ توبركلوزيس

زادگان محمد ارجمندرضا ذوالفقاري، اعضم احمدي، مانا شجاع پور، سيد رضا مودب و وحيده وحيدي، محمد

34-21

ي اشريشــيا كلــي و جســتجوي مولكــولي هــا ي بتاالكتــام در جدايــه هــا بررســي مقاومــت بــه آنتــي بيوتيــك ■ در پرندگان زينتي شهركرد O157:H7اشريشيا كلي

ــين ــبي، حس ــاز، طهماس ــن ممت ــي، حس ــارا برات ــدس ــي محم ــت رفيع ــادي، دول ــمي، آب ــد قاس ــيدمحم ــد س ــدي وحي ــاليانه و احم س سمانه مهرابيان

44-35

ي خانگي در تهران و اصفهان ها در ترشحات چشمي گربه كالميدوفيال فليس رديابي مولكولي■ رضايي و پيمان كيهاني حسن ممتاز، محمد علي

52-45

ــاكتري ■ ــانوذرات نقــره توســط ب جــدا شــده از معــدن مــس Ralstonia sp. SM8ســنتز خــارج ســلولي ن سرچشمه

مراحم آشنگرف

64-53

ــايي■ ــاي ژن شناسـ ــدت هـ ــري yrpEو yrp1 حـ ــينيا راكـ ــاكتري يرسـ ــه روش در بـ ــتان PCRبـ در اسـ چهارمحال و بختياري

نسعيد سيميو فيروز فدايي فرد

74-65

بررســي پتانســيل : كننــده فســفات مولــد آنــزيم فســفاتاز از چشــمه آب گــرم لريــا بــاكتري حــلجداســازي ■ هاي مختلف كنندگي فسفات در حضور شاخص حل

مريم پرهام فر، ارسطو بدويي دلفارد، موج خالقي و مهدي حسن شاهيان

88-75

ــت ■ ــذف كيس ــتره درح ــد بس ــيون چن ــارآيي فيلتراس ــي ك ــا بررس ــا ه ــا المبلي ــه آب ي ژياردي ــفيه خان درتص اصفهان

سعيد عابديو زهرا موسويان، علي اصغر رستگاري

98-89

Cellulomonas uda ATCCبــدنبال تلقــيح تــوأم بــا انــدوفيت Azospirillumتحريــك كلونيزاســيون ■491

محمد جواد مهدي پور مقدم، گيتي امتيازي و مجيد بوذري

112-99

10 -1 چكيده انگليسي■

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 10

پليمر ي بومي توليد كنندهها گري و جداسازي باكتري غربال آلوده به نفت پااليشگاه آبادان هاي آلكانوآت از خاك هيدروكسي پلي

ــدي ــين معتمــ :*حســ

:اردكـاني محمد رعايايي ــايلي ــيم مـــــ :نســـــ

ــران، ــواز، ايـــ ــران اهـــ ــهيد چمـــ ــگاه شـــ ــوژي، دانشـــ ــيار ميكروبيولـــ [email protected]دانشـــــواز، ــتاد ميكروبيولــــــوژي، دانشــــــگاه شــــــهيد چمــــــران اهــــ [email protected]، ايــــــراناســــ

[email protected]دانشجوي كارشناسي ارشد ميكروبيولوژي، دانشگاه شـهيد چمـران اهـواز، ايـران،

كيدهچ هـاي موجـب گـرايش بـه سـمت روش سنتزي هاي پالستيك مصرف واسطهه ب زيست محيط آلودگي افزايش :مقدمه

هاي بـومي تحقيق حاضر با هدف يافتن باكتريبنابراين، . است شده پذير پليمرهاي تجزيه توليد براي بيوتكنولوژي نوين . انجام شد ها در توليد پليمرهاي زيست تخريب پذير به منظور استفاده از آن PHAتوليد كننده

گـري غربـال آوري و پـس از غنـي سـازي اوليـه، نمونـه خـاك آلـوده بـه پسـماندهاي نفتـي جمـع :ها مواد و روشآميـزي انجـام و بـا رنـگ PHA Detection Agar آلكـانوآت در محـيط هيدروكسي هاي توليد كننده پليمر پلي باكتري

تعيين هويـت 16S rRNAهاي فنوتيپي و تعيين توالي ها با استفاده از روش جدايه. تاييد شد Nile Blue Aسودان سياه و . انجام شد SDSهاي مختلف هيپوكلريت سديم و استخراج و تعيين بازده توليد پليمر با استفاده از غلظت. شدند

هاي متفـاوت بودنـد كـه بـا توجـه بـه ميـزان جدايه داراي توانايي توليد پليمر به ميزان 17 جدايه مختلف، 26از :نتايجهـاي ترين درصد بازده جدايـه بيش. جدايه به منظور مطالعات بيشتر انتخاب شدند 4تجمع پليمر درون سلول باكتريايي،

د شـ در تعيين هويت مشخص .شددرصد محاسبه 86/79±84/11و 06/81 ±92/6، 82±05/19، 53/75 ±08/5 منتخبهاي آلوده به هاي مختلف اين گونه در خاك در واقع بيوتيپ. تعلق دارند باسيلوس سرئوسها به گونه كه تمامي جدايه

. نفت توان متفاوتي در توليد پليمر نشان دادند

آلوده به تركيبات نفتي به علت هاي كه خاك كردتوان بيان هاي اين تحقيق مي با توجه به يافته :گيري بحث و نتيجهكه مقدار كربن بسيار باالتري نسبت به نيتروژن و فسفر دارند و تركيبات هيدروكربني متفاوت طي زمان طوالني در اين

آلكـانوآت هيدروكسـي هاي موثر در توليد پليمر پلـي هاي مناسبي براي جداسازي سويه اند، محل اين مناطق انباشته شدهسـازي شـرايط توليـد در جهـت هاي سازش يافته با محيط با منبع كربن باال را با بهينه توان سويه ترتيب ميبه اين . هستند

. كار برد هتوليد صنعتي اين پليمر ب

آلكانوآت، پليمر، زيست تخريب پذير، پسماند نفتي هيدروكسي پلي :هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات *

07/08/1393: تاريخ پذيرش -29/04/1393: تاريخ دريافت

9 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

و نيسين براي مهار رشد كوكوس الكتيس مقايسه اثر الكتو زا در پنير فتا ايراني هاي بيماري باكتري

:* سعيد ميردامـادي

:شادي آقـا قزوينـي

[email protected] ،دانشــــيار بيوتكنولــــوژي، ســــازمان پژوهشــــهاي علمــــي و صــــنعتي ايــــران، تهــــران، ايــــران [email protected]، كارشناس ارشد صنايع غذايي، سازمان پژوهشهاي علمي و صنعتي ايران، تهران، ايـران

كيدهچتوليـد كننـده نيسـين در كشـت تـوام و نيسـين الكتوكوكـوس الكتـيس در مطالعـه حاضـر اثركشـت بـاكتري :مقدمه

در مقايســه .دشــغــذايي در محــيط كشــت و پنيــر فتــا ايرانــي بررســي زاي هــاي بيمــاري اســتاندارد خــالص بــر بــاكتري، بلكـه نقـش بهتـري در بهبـود كيفيـت ميكروبـي پنيـر طعم و مزه پنيـر شـد نه تنها باعث بهبود الكتيس الكتوكوكوس

. اولترافيلتر فتا به عنوان يك مدل غذاي لبني تخميري داشت

هـاي و سويهعنوان توليد كننده نيسين به الكتو كوكوس الكتيس زير گونه الكتيسبراي اين منظور :ها مواد و روشزا به پنير اولترافيلتر تلقيح هاي استاندارد بيماري عنوان سويه به رئوسوك اوو استافيلوك منوسيتوژنز، اشرشيا كليليستريا

. دشو همراه با نيسين رسم الكتوكوكوس الكتيسكشت توام با تنها، ه شكلها ب منحني رشد هر يك از باكتري. ندشد . دشيد يتا RF-HPLC ه حساس استاندارد اندازه گيري و با توليد نيسين از روش انتشار در آگار بر عليه سوي

بعد از يك الكتوكوكوس الكتيسهر دو محيط حاوي نيسين و درليستريامنوسيتوژنز نتايج نشان داد كه تعداد :نتايجآن پـس تعداد مقاومت بيشتري داشت و رئوسواستافيلوكوكوس ا. و طي دو هفته به صفر رسيد 3به 7هفته از لگاريتم

از لگـاريتم 28تا روز ،در طي هفته اول روند افزايشي و سپساشرشيا كلي كه تعداد در حالي .روز به صفر رسيد 28از افزايـي اثر هم علت بهدر محيط كشت حاوي نيسين، تعداد آن در پنير اشرشياكليافزايش تعداد با وجود. كمتر نشد 4

ي مايه پنيـر نـه تنهـا افـزايش نيافـت ها و ديگر سوي الكتوكوكوس الكتيسسط هاي توليدي تو نيسين و ديگر متابوليت . بلكه رو به كاهش نهاد

در ابتداي فاز لگـاريتمي ليستريا منوسيتوژنزنتايج نشان داد كه در محيط كشت و پنير فتا تعداد :گيري بحث و نتيجه. دشـ با وجود حساسـيت كمتـر بـه نيسـين نيـز مهـار رئوسوا استافيلوكوكوسكاهش و الكتوكوكوس الكتيس توسطايـن . با وجود مقاومت به نيسـين در كشـت تـوام افـزايش نيافـت وحتـي رونـدي كاهشـي نشـان داد كلي اشرشياتعداد

هاي آغازگر اثر مهار كنندگي بهتـري از نيسـين به همراه سويه الكتوكوكوس الكتيسپژوهش نشان داد كه استفاده از بـه عنـوان كشـت همـراه بـا الكتوكوكـوس الكتـيس اسـتفاده از . زا دارد هاي بيماري كنترل آلودگي باكتريبر رشد و

. شود زاي مهم مي ي بيماريها هاي مايه در افزايش كيفيت محصول موثر و مانع رشد باكتري سويه

زا بيماري هاي باكتري كننده، محافظت نيسين، ،الكتيس الكتوكوكوس :هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات *

31/02/1393: تاريخ پذيرش -02/09/1392: تاريخ دريافت

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 8

با مقاومت چندگانه E. coliي ها در جدايه CTX-Mشيوع بتاالكتامازهاي نوع دارويي از شمال ايران، رشت

:طلــــوع بـابــــايي همتـــي ور مقدم :* محمــد جـواد مهـدي ـپ

ــو ــار زيـــــــ :يلحصـــــــ:سيـد محمــود حبيـــب زاده

[email protected] مولكــولي، دانشـگاه گـيالن، ايــران، كارشـناس ارشــد زيســت شناسـي سـلولي و ـــران، ـــالن، ايـــ ـــگاه گيـــــ ـــوژي، دانشـــــــ ـــار ميكروبيولــــــ [email protected] استاديـــــ

ــتاد ـــران، اسـ ـــالن، ايـــــ ـــاه گيـــــ ـــي، دانشگـــــــ ـــك مولكولــــــــ [email protected] ژنتيـــــــ [email protected] پاتـوبيــــولوژي رازي، رشـــت، ايـــــران، ، آزمايشــگاهاستـاديار آسيبب شناسـي

كيدهچ

هـا در بـين تـرين شـاخص مقاومـت بـه آنتـي بيوتيـك عنوان مهـم به) ESBLs( با طيف گستردهبتاالكتامازهاي :مقدمهدر بيشـتر شيوع بااليي داشته و ESBLاز CTX-Mدر طول دهه گذشته، انواع . ها در سراسر جهان هستند انتروباكترياسه

هدف از اين مطالعه بررسي الگوي مقاومت به آنتي بيوتيـك . هستند) UTI(ارتباط با مسببين مهم عفونت ناحيه ادراري در UTIمقاومت چندگانه دارويي از بيمـاران مبـتال بـه با E. coliي ها در بين جدايه CTX-Mو فراواني بتاالكتامازهاي

. شمال ايران است

با اسـتفاده از آزمـون ها جدايه ESBLهاي فنوتيپ. استفاده شدهاي ادرار از نمونه E. coliجدايه 33 :ها مواد و روشبـا اسـتفاده از ) 9و 8، 2، 1(ي هـا ، شامل گـروه ESBLهاي مرتبط با ژن. تعيين شدند) DDST(سينرژي ديسك دوتايي

. ندشدتكثير ) PCR(اي پليمراز واكنش زنجيره

ي نسـل سـوم و هـا مقاوم بـه سفالوسـپورين ها آن درصد 55حساس به پپيراسيلين بوده و E. coliي ها تمام جدايه :نتايج. نشـان داده شـد ESBLهـاي توليـد كننـده جدايـه درصـد 88در CTX-Mمولكـولي حضـور ژن تحليل. چهارم بودند

CTX-Mي فاقـد ها بسيار مقاوم به چند آنتي بيوتيك نسبت به جدايه) 9و CTX-M )1 ،2 ،8حاوي E. coliهاي جدايه . بود ESBLكننده توليد E. coliهاي در جدايه CTX-Mترين نوع عنوان شايع به CTX-M-1. بودند

توليـد E. coliي هـا بيوتيـك ترجيحـي بـراي كنتـرل سـويه اساس نتايج مطالعه حاضر، آنتي بر :گيري بحث و نتيجهدر بـين CTX-Mنـوع ESBLاگرچه، شـيوع . در شمال ايران، رشت، بايد پپيراسيلين باشد CTX-Mنوع ESBLكننده .اهميت است دارايبا مقاومت چندگانه دارويي كم بود، اما كنترل همين فراواني كم نيز E. coliي ها جدايه

، اشيرشيا كلي، بتاالكتامـاز وسـيع الطيـف، مقاومـت چندگانـه دارويـي، عفونـت ناحيـه CTX-M :كليديهاي واژه ادراري

نويسنده مسؤول مكاتبات * 09/09/1393: تاريخ پذيرش -14/04/1393: تاريخ دريافت

7 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

واكنش ميزان رشد، محتواي پروتئين و اسيدچرب جلبك دسمودسموس كوناتئوس درشرايط كمبود و انباشتگي نيتروژن

:* مهدي نادري فارساني

:ســـــعيد مشـــــكيني :رامـــين منـــاف فـــر ــه ــل پيشـ ــرا عسـ :زهـ

[email protected] ،دانش آموخته كارشناسي ارشـد تكثيـر و پـرورش آبزيـان، دانشـگاه اروميـه، ايـران ــتاديار ــاناســــــ ــرانبهداشــــــــت آبزيــــــ ــه، ايــــــ ــگاه اروميــــــ [email protected]، ، دانشــــــــتاديار ــان اســــ ــوژي آبزيــــ ــران بيوتكنولــــ ــه، ايــــ ــگاه اروميــــ [email protected] ،، دانشــــ

ــران ــه، اي ــگاه ارومي ــاهي، دانش ــي گي ــت شناس ــد زيس ــي ارش ــه كارشناس ــش آموخت [email protected] ،دان

كيدهچهـاي تـك سـلولي جلبـك ) ها ويژه اسيدهاي چرب، پروتئين و رنگدانه به(ي بيوشيميايي اميزان بيومس و محتو :مقدمه

نشان داده هست كه غلظـت نيتـروژن ها نتايج پژوهش. كنند ميكروارگانيسم ايفا مينقش مهمي را در توليد تجاري اين . استهاي تك سلولي از عوامل مؤثر بر ميزان رشد و تركيب بيوشيميايي جلبك

در محـيط ) خـانواده سندسماسـه، كلروفيتـا (ريز جلبك دسمودسموس كونـاتئوس در اين پژوهش، :ها مواد و روش هروز 12 هـاي مختلـف نيتـروژن در يـك دوره حت تأثير غلظتت 7اسيديته درجه سانتي گراد و 25دماي ، BMكشت

شـكل هـا بـه به منظور تعيين تراكم سلولي و زمان دو برابر شدن جمعيت ريزجلبكي، شمارش جلبك. پرورش داده شدهـا نيـز بـا ي چـرب و پـروتئين ريزجلبـك تعيـين ميـزان اسـيدها . روزانه و با استفاده از الم هموسيتومتري انجام گرفـت

. انجام شدبرداشت توده جلبك در مرحله سكون

در غلظـت ) ليتر سلول در ميلي 36±01/1×105(و تراكم سلولي ) در روز 35/0±09/0(باالترين ميزان رشد ويژه :نتايج ، بـا چنـد پيونـد غيراشـباع تـرين ميـزان اسـيدهاي چـرب متوسـط بـيش ،همچنين. دست آمده موالر نيتروژن ب ميلي 5/2

در تيمار فاقد نيتروژن مشاهده ،درصد 01/17 ،ترين مقدار و كم) موالر ميلي 5(در غلظت باالي نيتروژن ، درصد 31/25ه تيمار فاقد نيتروژن بـ ،درصد 14/11 ،موالر و كمينه آن ميلي 5نيز در غلظت ،درصد 81/35، بيشينه ميزان پروتئين. شد

. دست آمد

ها نتايج اين مطالعه نشان داد كه غلظت مواد مغذي مختلف نقش مهمي در پرورش ريز جلبك :گيري نتيجهبحث و داشته و بسته به نوع مواد مغذي هر گونه كاهش يا افـزايش در غلظـت آن تغييراتـي را در فيزيولـوژي و ارزش غـذايي

ثر مورد مطالعه ؤها در عوامل م بت به ساير غلظتموالر نس ميلي 5/2غلظت ،در اين مطالعه. شود ها موجب مي ريزجلبك . همانند ميزان رشد نتايج بهتري نشان داد

پروتئين، رشد، نيتروژن دسمودسموس كوناتئوس،اسيدهاي چرب، :هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات * 04/06/1393: تاريخ پذيرش -12/11/1392: تاريخ دريافت

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 6

وروتوكسيژن جداشده از ماهيان سرد آبي اشريشيا كلي هاي شناسايي باكتري اي پليمراز چندگانه در استان چهارمحال و بختياري وسيله واكنش زنجيره هب

:* مجتبي بنياديان

[email protected]، مشـترك، دانشـگاه شـهركرد، ايـران هـاي دانشيار ميكروبيولوژي مواد غذايي، پژوهشكده بيمـاري

كيدهچ

در مـاهي سـرد آبـي اشريشـيا كلـي هاي وروتوكسيژن باكتري اين مطالعه به منظور شناسايي ميزان شيوع سويه: مقدمه . غزل آالي رنگين كمان توسط روش واكنش پليمراز زنجيره اي چندگانه انجام شد

پوست و گوشت ماهي در مراحل آخر توليد از استخرهاي پرورش اخـذ و ،نمونه مدفوع 100تعداد :ها مواد و روش هـاي بـاكتري سـويه ،سـپس . انجـام شـد اشريشيا كليشناسي و بيوشيميايي براي تشخيص باكتري هاي ميكروب آزمون

Stx1 ،Stx2 ،eaeهاي حدت اي چندگانه براي شناسايي ژن جدا شده توسط روش واكنش پليمراز زنجيرهاشريشيا كلي . آزمون شدند hly و

.نـد ند، آلوده بودهستكه وروتوكسيژن O157هاي غير از نتايج اين مطالعه نشان داد كه ماهيان سرد آبي به سويه :نتايجهـاي جـدا شـده از مـدفوع حـاوي مـوارد بـاكتري درصـد 4در و هاي جدا شده از پوسـت موارد باكتري درصد 14در . بودند eaeو Stx1 ،Stx2هاي ژن

هـاي تواننـد حامـل سـويه بـي پرورشـي مـي آاين مطالعـه نشـانگر ايـن اسـت كـه ماهيـان سـرد :گيري بحث و نتيجهله ممكن است أهاي اين مس از علت. ها به انسان شوند انتقال اين سويه ببوده و موج اشريشيا كليوروتوكسيژن باكتري

آلودگي آب استخرهاي پرورش ماهي توسط مدفوع حيوانات، پرندگان، غذاي ماهيان يا كـارگران بـه بـاكتري را نـام . شود سازي عوامل آلوده كننده توصيه مي محدود برايتوجه بيشتر . برد

چندگانهاي ، وروتوكسين و پليمراز زنجيرهاشريشيا كليماهيان سرد آبي، :هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات *

31/02/1393: تاريخ پذيرش -11/09/1392: تاريخ دريافت

5 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

ي ايراني و خارجي بر عليهها مقايسه آزمايشگاهي اثر دهانشويه عنوان فلور قارچي شايع در دهان كانديدا آلبيكنس به

ــالبي ــميه طـ :*سـ

:آذر ســــــــبكبار :پـور مجيد رياضي

:محســن صــفاري

[email protected] ،كارشــــناس ارشــــد ميكروبيولــــوژي، دانشــــگاه آزاد اســــالمي واحــــد كــــرج، ايــــران [email protected] ،دانشــــــــيار ميكروبيولــــــــوژي، دانشــــــــگاه آزاد اســــــــالمي واحــــــــد كــــــــرج، ايــــــــران

[email protected] ،، تهران، ايران)عج(دانشيار انگل و قارچ شناسي، مركز ميكروب شناسي كاربردي، دانشگاه علوم پزشكي بقيه اهللا [email protected] ،، تهــــران، ايــــران) عــــج(اســــتاديار آمــــوزش بهداشــــت، دانشــــگاه علــــوم پزشــــكي بقيــــه اهللا

كيدهچ

ها بـراي بسـياري از دهانشويه. م باليني جدا شده استيبدون عال از افراد سالم درصد 65در كانديدا آلبيكنس :مقدمههـاي ايرانـي و خـارجي بـر ثير دهانشـويه أمطالعه حاضر با هدف بررسي تـ . شوند اهداف پيشگيرانه و درماني استفاده مي

. انجام شد به عنوان فلور قارچي رايج در دهان كانديدا آلبيكنس

سـپس از كشـت . اسـتفاده شـد 10231ATCC كانديدا آلبيكنسدر اين مطالعه، ازسوش استاندارد :ها مواد و روشــازه ــنس ت ــدا آلبيك ــاعته 24( كاندي ــه و )س ــيون تهي ــد 530در آنOD ، سوسپانس ــده ش ــانومتر خوان ــيون .ن سوسپانس

در ، ايجـاد دو چاهـك در محـيط كشـت ،سـپس .در محيط سابوروددكستروزآگاركشـت داده شـد كانديدا آلبيكنس ،سـپس . ساعت انكوبـه شـد 24به مدتگراد سانتيدرجه 37 و در دماي) ميكروليتر 100(ها دهانشويه ريخته داخل آن

)MFC( و حـداقل غلظـت كشـندگي )MIC(حـداقل غلظـت مهاركننـدگي رشـد . هاله عدم رشـد انـدازه گيـري شـد تحليـل مسـتقل و Tهـاي آمـاري ، آزمـون SPSSهـا بـا اسـتفاده از نـرم افـزار آمـاري داده .نيز مشخص شد ها دهانشويه

. شدواريانس يك طرفه بررسي

هـاي ، اختالف معناداري بين اثرات ضـد قـارچي دهانشـويه MFCو MICنتايج مربوط به روش آگار ديفيوژن، :نتايج . )<05/0Pvalue(ايراني و خارجي نشان ندادند

اين مطالعه نشان داد كه هر دو دهانشويه ايراني و خارجي اثر خوبي دربرابر كانديدا آلبيكـنس :گيري بحث و نتيجه . به عنوان فلور قارچي شايع در دهان داشتند

، فلور قارچي، دهانشويهكانديدا آلبيكنس: هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات *

31/03/1393: تاريخ پذيرش -30/07/1392: تاريخ دريافت

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 4

Sinorhizobium در quorum sensing سگينالينگ مسير روي فسفر كمبود تاثيرmeliloti

ــدامن ــه پاكــ :نجمــ

ــتأجران ــر مسـ :* اكبـ

ــراي دنشــجوي ــوژيدكت ــاهي فيزيول ــران گي [email protected] ،، دانشــگاه اصــفهان، ايــتاد ــوژياســــ ــاهي فيزيولــــ ــران ،گيــــ ــفهان، ايــــ ــگاه اصــــ [email protected] ،دانشــــ

كيدهچ

ها در محيط باكتري به طور معمول. ستها ضروري پرمصرف براي رشد باكتريترين عناصر فسفر يك از مهم :مقدمههـاي ناقـل ژن. است ها براي رويارويي با چنين شرايطي تكامل يافته هايي در آن و مكانيسم هستندبا كمبود فسفر مواجه

، در پاسـخ PhoBكننده ، به واسطه تنطيم(Quorum sensing) گر حد نصاب و مسير انتقال سيگنال حس (pstS) فسفاتحداقل از Sinorhizobium melilotiري گر حد نصاب در باكت مسير حس. باكتري به اين شرايط استرسي دخالت دارند

زي و همزيستي دخالـت -هاي باكتري در شرايط آزاد و در كنترل فعاليتاست تشكيل يافته expRو sinI ،sinRسه ژن . دارد

تركيـب ( pLK004حامـل پالسـميدهاي S. melilotiهاي تراريخت باكتري تراكم جمعيت در گونه :ها مواد و روش، )egfpو ژن sinRانـداز تركيـب راه egfp( ،pLK65 )و ژن sinIانـداز تركيـب راه egfp( ،pLK64 )و ژن pstSانداز راه

pLK66 )انداز تركيب راهexpR و ژنegfp ( و كنترل) ژنegfp كمبـود ( 1/0هـاي مختلـف در غلظـت ) انـداز بدون راه .گيري شد ساعت اندازه 40و 24، 16مختلف هاي موالر فسفات در زمان ميلي) غلظت كافي فسفات( 2و 5/0، )فسفات

با تقسيم واحـد فلورسـنس سـاطع شـده بـر تـراكم expRو pstS ،sinI ،sinRهاي مختلف فعاليت پروموتر ژن ،همچنين . دشها مختلف فسفات محاسبه جمعيت باكتري در غلظت

ساعت پـس از كشـت 40ويژه هاي تراريخت با كاهش غلظت فسفات در محيط كشت، به سرعت رشد باكتري :نتايجو sinI(سنسـينگ هـاي مسـير كـروم برخي ژن ،و همچنين (pstS)ناقل فسفات فعاليت پروموتر ژن. ها، كاهش يافت آن

sinR و نهexpR (دنبال كاهش غلظت فسفات در محيط كشت، افزايش يافت به .

تـوان بـه افـزايش بيـان ژن ناقـل كمبـود فسـفات مـي به S. melilotiهاي باكتري جمله پاسخ از :گيري بحث و نتيجهنيـز در شـرايط sinR بيـان ژن . تواند اين كمبود در محـيط را جبـران نمايـد د كه تاحدودي ميكراشاره (pstS)فسفات

كنـد و عمـل مـي sinIعنوان فعال كننـده ژن به SinRپروتئين . شود مي القا PhoBكمبود فسفات به كمك تنظيم كننده هـاي شـود كـه احتمـاالً موجـب تسـهيل فعاليـت گر حد نصاب در شرايط كمبود فسفات فعـال مـي مسير حس ،بنابراين

. دشو زي و همزيستي مي -باكتري در شرايط آزاد

نصاب، سينوريزوبيوم مليلوتيكمبود فسفر، انتقال فسفر، مسير حسگر حد :هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات * 31/02/1393: تاريخ پذيرش -18/10/1392: تاريخ دريافت

3 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

و Cyclamen coumبررسي اثرات سينرژيسمي عصاره بوتانلي گياه Pseudomonas aeruginosaبيوتيك سيپروفلوكساسين بر مهار تشكيل بيوفيلم آنتي

:* احياء عبـدي عـالي

:مرواريــــد شــــفيعي :فرشـــته شـــاهچراغيــبورا ــذرا صـــ :عـــ :طــــوبي غضــــنفري

[email protected] ،، تهــــــــران، ايــــــــران)س(دانشــــــــيار ميكروبيولــــــــوژي، دانشــــــــگاه الزهــــــــرا ــجوي ــرايدانشــ ــگاه دكتــ ــرا ميكروبيولوژي،دانشــ ــران،)س(الزهــ ــران ، تهــ [email protected] ،ايــ

ــتاد ــران، ايـــــران اســـ ــران، تهـــ ــاكتريولوژي، انستيتوپاســـــتور ايـــ [email protected]، بـــــيا ــرا دانشــــــ ــگاه الزهــــــ ــوژي، دانشــــــ ــران)س(ر ميكروبيولــــــ ــران، ايــــــ [email protected]، ، تهــــــ

[email protected] ،نولوژي، مركز تحقيقات تنظيم پاسخ هاي ايمني، دانشـگاه شـاهد، تهـران، ايـران ايماستاد

كيدهچ

بيمـاران مبـتال بـه مولـد بيـوفيلم يكـي از عوامـل مهـم مـرگ و ميـر در P. aeruginosaهـاي ناشـي از عفونت :مقدمههـا بـه دليـل بيوتيـك ها نسبت بـه بسـياري از آنتـي ، بيوفيلمها پژوهشبسياري از نتايج بر اساس . فيبروز سيستيك هستند

.هـا، بايـد تشـكيل بيـوفيلم مهـار شـود ها به آنتي بيوتيك براي كاهش مقاومت باكتري. مقاوم هستندساختار نفوذناپذير در تركيـب بـا Myrsinaceaeگياه متعلق بـه خـانواده C. coumدر اين مطالعه، اثرات ضدبيوفيلمي عصاره بوتانلي گياه

. بررسي شد P. aeruginosaسيپروفلوكساسين عليه بيوفيلم

P. aeruginosaسـويه بـاليني و P. aeruginosa PAO1ابتـدا توانـايي تشـكيل بيـوفيلم، در سـويه :هـا مواد و روش

(PA214) گيـاه ) سـاقه زيرزمينـي (گيـري بخـش تـوبر عصاره. توسط روش ميكروتيترپليت اثبات شدC. coum توسـط عصـاره بوتـانلي گيـاه فعاليـت ضـدميكروبي و ضـدبيوفيلمي . ي دي اتيل اتر، الكل اتانول و بوتانول انجام شدها محلول

C. coum )هـاي بيوتيك سيپروفلوكساسين توسط روش به تنهايي و در تركيب باآنتي) كه داراي تركيبات ساپونيني بودmicrodilution عصــاره بوتــانلي گيــاه يســيته تــاثيرات سايتوتوكس. و كريســتال ويولــه بررســي شــدC. coum روي بــر

. بررسي شد MTT توسط روش HT-29هاي سلول

ميـزان سـاپونين عصـاره . دشـ كمـي اثبـات ه شـكل بـ P. aeruginosaي هـا توانايي تشكيل بيوفيلم توسط سويه :نتايجتـاثيرات ضـدميكروبي عليـه C. coumعصـاره بوتـانلي گيـاه . بـود ليتـر ميكروگرم بر ميلي C. coum ،156بوتانلي گياه

و آنتــي بيوتيــك C. coumتركيــب عصــاره بوتــانلي گيــاه . نشــان داد P. aeruginosaزي -آزاد يهــا ســويهفاقد C. coumعصاره بوتانلي گياه . (ΣFBIC ≤ 0.5) داري سبب مهار تشكيل بيوفيلم شد طور معني هسيپروفلوكساسين ب

. بود HT-29يها برروي سلول اثرات سايتوتوكسيك

و آنتي بيوتيك سيپروفلوكساسين فعاليـت ضـدبيوفيلمي C. coumتركيب عصاره بوتانلي گياه :گيري بحث و نتيجه .نشان داد، اما هنوز مستلزم تحقيقات باليني بيشتري است P. aeruginosaداري عليه معني

سيپروفلوكساسين، Cyclamen coum، بيوفيلم، P. aeruginosa :هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات *

31/01/1393: تاريخ پذيرش -25/10/1392: تاريخ دريافت

1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه 2

، يك اكتينومايست Lechevaliera fradia subsp. Iranicaشناسايي پلي فازي نادر جدا شده از منطقه لوشان ايران

:* مهــدي مشــتاقي نيكــو

:محدثــــــه رمضــــــاني :شيما سادات سـيد مهـدي

ــتي ــي و زيســ ــاير ژنتيكــ ــي ذخــ ــز ملــ ــوژي، مركــ ــد ميكروبيولــ ــناس ارشــ ــرانكارشــ [email protected]، ايــ [email protected]، مركــز ملــي ذخــاير ژنتيكــي و زيســتي ايــران ميكروبيولــوژي، دانشــجوي دكتــري

ــران ــتي اي ــي و زيس ــاير ژنتيك ــي ذخ ــز مل ــوژي، مرك ــد ميكروبيول ــناس ارش [email protected]، كارش

كيدهچ

اند و توانايي تجزيه مـواد هاي طبيعي و ساخته دست بشر پراكنده شده در محيطبه طور وسيعي ها اكتينومايست :مقدمههـاي فعـال زيسـتي هـا و مولكـول بيوتيـك توليـد آنتـي بـراي ها به عنوان يك منبع غني آن ،همچنين. آلي را دارا هستند

. شوند و از اهميت چشمگيري در صنعت برخوردار هستند شناخته مي

تحت شناسـايي پلـي فـازي قـرار جداسازي شد و LO5يك اكتينومايست نادر با نام ،در اين مطالعه :ها مواد و روشوسـيله كميتـه بـين المللـي سيسـتماتيك ديدگاه تاكسونومي پلـي فـازي كـه بـه بر اساساين اكتينومايست نادر .گرفت

. شدشناسايي ،مصوب شده است (ICSP)ها پروكاريوت

گـاالكتوز، مـانوز و رامنـوز ،و همچنـين (D)پايمليك اسيد نوع مـزو يـا دي آمينو داراي دي LO5ديواره سويه :نتايجدي فسـفاتيديل گليسـرول، فسـفاتيديل گليسـرول و :محتواي فسفوليپيدي غشـا شـامل . عنوان قندهاي تشخيصي است به

ن سـويه از نشـان داد كـه ايـ 16S rRNAفيلوژني بر اساس مقايسه توالي كامـل ژن تحليل. فسفاتيديل اتانول آمين است Lechevalieria fradiae CGMCCدرصــدي بـه 6/98و داراي شـباهت Pseudonocardiaceaeخـانواده ياعضـا

4.3506T ارتباط . استDNA-DNA بـين سـويهLO5 وLechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T مقـدار گويـايهـاي جديـد بـه آن اسـتناد درصـد كـه بـراي معرفـي گونـه 70كه با توجه به باالتر بـودن آن از حـد درصدي است 75 Lechevalieria fradiaeنـام بـا Lechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T به عنوان زيرگونـه LO5سويه شود، مي

subsp. Iranica IBRC-M 10378 شود معرفي مي .

بنـدي پلي فازي مبتني بر مطالعات فنوتيپي، شيميوتاكسونومي و فيلوژني بـراي طبقـه يك روش :گيري بحث و نتيجهتعيـين بـراي بـراي بـه دسـت آوردن اطالعـات مـورد نيـاز .يك اكتينومايست نادر در حد زيرگونه پيشنهاد شده اسـت

بندي الزم براي طبقههايي استفاده شده است كه با حداقل استانداردهاي ، از تكنيك LO5وضعيت تاكسونوميك سويه ها تصـويب ي تاكسونومي كميته بين المللي سيستماتيك پروكاريوتها يك ميكروارگانيسم خاص كه توسط زيركميته

. شده اند، مطابقت دارند

ي نادر ، شيميوتاكسونومي، مطالعات فيلوژنتيكها شناسايي پلي فازي، اكتينومايست :هاي كليدي واژه مكاتباتنويسنده مسؤول *

24/12/1392: تاريخ پذيرش -06/09/1392: تاريخ دريافت

1 1393 زمستان، 12 شمارهسوم، سال ، ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريه

: قارچي كيتوزان توسط مس هاي يون زيستي جذب بررسي ميگويي كيتوزان براي جايگزيني

:* ســــــــاناز بهنــــــــام

:كريمــــــي كيخســــــروــان اكــــــــرم :يزمــــــ

:آبـاد ينز يمهربان ارجمند

ــجوي ــري دانشــ ــي دكتــ ــيمي، مهندســ ــگاه شــ ــنعتي دانشــ ــفهان، صــ ــران اصــ [email protected] ،ايــــيار ــي دانشـــــ ــيمي، مهندســـــ ــگاه شـــــ ــنعتي دانشـــــ ــفهان، صـــــ ــران اصـــــ [email protected]، ايـــــــتاديار ــي اســـ ــيمي، مهندســـ ــگاه شـــ ــنعتي دانشـــ ــفهان، صـــ ــران اصـــ [email protected]، ايـــ

[email protected]ايـــــــران، اصـــــــفهان، صـــــــنعتي دانشـــــــگاه شـــــــيمي، مهندســـــــي اســـــــتاد

كيدهچ

در صنعت، كيتوزان از دي اسـتيله . هاست يكي از كاربردهاي اصلي كيتوزان در حذف فلزات سنگين از پساب :مقدمههاي زيگومايسـت منبع ديگر كيتوزان ديواره سلولي قارچ. شود شدن كيتين موجود در ضايعات سخت پوستان توليد مي

.هاي بيشتري نسبت به ضايعات سخت پوستان دارد كه مزيت است

و كيتوزان ميگويي بـراي اينديكوس موكوركيتوزان قارچي استخراج و خالص شده از زيست توده :ها مواد و روش 52تـا 5 (، غلظـت يـون مـس )5/5تـا 3(اسـيديته تـأثير . اسـتفاده و مقايسـه شـدند هاي مس از محلول آبي حذف يون

هـاي فلـزي بـر ، زمان جذب، دما و حضور سـاير يـون )گرم بر ليتر ميلي 3000تا 200(، مقدار كيتوزان )گرم بر ليتر ميلي .جذب زيستي بررسي شد

به دستگرم بر گرم ميلي 7/60و 5/58به ترتيب هاي قارچي و ميگويي هاي جذب براي كيتوزان بيشينه ظرفيت :نتايجاز ميـان . بـاالتر بـود وزان قـارچي از كيتـوزان ميگـويي بـه ميـزان درخـور تـوجهي سرعت جذب مس توسط كيتـ . آمداي و الوويچ، مدل شبه مرتبه دوم هو بهترين مدل براي تطبيق بر هاي شبه مرتبه اول، شبه مرتبه دوم، نفوذ درون ذره مدلدما و حضور . حلول افزايش يافتم اسيديتهبراي هر دو نوع كيتوزان، ظرفيت جذب با افزايش . استهاي سينتيكي داده

هاي النگمـاير، نيز به خوبي با مدل دما همهاي داده. بر ظرفيت جذب مس نداشت در خور توجهيتأثير فها ساير يون . دشپترسون توصيف -فرندليچ و ردليچ

مـس از هـاي تواننـد بـه طـور مـوثري بـراي حـذف يـون هر دو كيتوزان قارچي و ميگويي مـي :گيري بحث و نتيجهكـه ايـن فرآينـد بـراي فرآيند جذب براي كيتوزان قارچي سـريع بـوده، در حـالي . هاي آبي به كار گرفته شوند محلول

. استبنابراين، از نقطه نظر سينتيكي كيتوزان قارچي نسبت به ميگويي ارجح . كيتوزان ميگويي كندتر است

ميگويي، تصفيه آب جذب زيستي، مس، كيتوزان قارچي، كيتوزان :هاي كليدي واژه

نويسنده مسؤول مكاتبات *

31/02/1393: تاريخ پذيرش -24/09/1392: تاريخ دريافت

ها شناسي ميكروارگانيسم ستزي

1393 زمستان -12شماره – ومسسال

فهرست مطالب

كيتــوزان بــراي جــايگزيني: قــارچي كيتــوزان توســط مــس هــاي يــون زيســتي جــذب بررســي■ ميگويي

آباد ينز يمهربان ي و ارجمندزمان كريمي، اكرم ساناز بهنام، كيخسرو

1

، يـك اكتينومايسـت نـادر جـدا شـده از Lechevaliera fradia subsp. Iranica شناسـايي پلـي فـازي ■ منطقه لوشان ايران

مهدي مشتاقي نيكو، محدثه رمضاني و شيما سادات سيد مهدي

2

بيوتيك سيپروفلوكساسـين بـر و آنتي Cyclamen coumبررسي اثرات سينرژيسمي عصاره بوتانلي گياه ■ Pseudomonas aeruginosaمهار تشكيل بيوفيلم

احياء عبدي عالي، مرواريد شفيعي، فرشته شاهچراغي، عذرا صبورا و طوبي غضنفري

3

Sinorhizobium meliloti در quorum sensing سگينالينگ مسير روي فسفر كمبود تاثير■ نجمه پاكدامن و اكبر مستأجران

4

عنـوان كانديـدا آلبيكـنس بـه هـاي ايرانـي و خـارجي بـر عليـه مقايسه آزمايشگاهي اثر دهانشـويه ■ فلور قارچي شايع در دهان

پور و محسن صفاري سميه طالبي، آذر سبكبار، مجيد رياضي

5

وســيله وروتوكســيژن جداشــده از ماهيــان ســرد آبــي بــه اشريشــيا كلــي هــاي شناســايي بــاكتري■ اي پليمراز چندگانه در استان چهارمحال و بختياري واكنش زنجيره

انمجتبي بنيادي

6

ــاتئوس ■ ــموس كون ــك دسمودس ــيدچرب جلب ــروتئين و اس ــواي پ ــد، محت ــزان رش ــنش مي واك درشرايط كمبود و انباشتگي نيتروژن

مهدي نادري فارساني، سعيد مشكيني، رامين مناف فر و زهرا عسل پيشه

7

ــوع ■ ــي ا E. coliهــاي در جدايــه CTX-Mشــيوع بتاالكتامازهــاي ن ــه داروي ــا مقاومــت چندگان ز ب شمال ايران، رشت

طلـوع بـابـايي همتي، محمــد جـواد مهـدي پـور مقدم، زيور صالحي و سيـد محمـود حبيــب زاده

8

زا در پنيـر هـاي بيمـاري بـاكتري و نيسـين بـراي مهـار رشـد كوكـوس الكتـيس مقايسه اثر الكتـو ■ فتا ايراني

سعيد ميردامادي و شادي آقا قزويني

9

آلكـانوآت هيدروكسـي پليمـر پلـي هـاي بـومي توليـد كننـده اسـازي بـاكتري گـري و جد غربال ■ آلوده به نفت پااليشگاه آبادان هاي از خاك

حسين معتمدي، محمد رعايايي اردكاني و نسيم مايلي

10

)1393بهار تا زمستان - 12تا 9شماره –ومسسال (فهرست مطالب ساليانه ■

18-11

104-1 انگليسي متن كامل■

ها شناسي ميكروارگانيسم زيست نشريهمقاالت راهنماي نگارش

هـا و شناسي ميكروارگانيسم هاي مرتبط با زيست يسم آمادگي دارد تا دستاوردهاي پژوهشي در زمينهشناسي ميكروارگان پژوهشي زيست -نشريه علمي .كند را در قالب مقاالت علمي منتشر ... ها، مخمرها و هاي وابسته به آن شامل باكتري رشته

:محورهاي موضوعي نشريه .1

ها؛ ژنتيك ميكروارگانيسم متابوليسم و ساختار، � ها؛ يستماتيك ميكروارگانيسماكولوژي و س � شناسي صنعتي، محيطي و غذايي؛ ميكروب � ها؛ بيماري زايي ميكروارگانيسم � .نانوبيوتكنولوژي ميكروبي �

نكات مهم ارسال مقاله .2

. جهت ارسال مقاله الزم است در پايگاه الكترونيكي نشريه ثبت نام و سپس فرم ارسال مقاله تكميل شود �

http://uijs.ui.ac.ir/bjm: پايگاه الكترونيكي نشريه

هـاي بوده و قبالً در نشريات داخلي و يا خارجي منتشر نشده باشد، مگر به شكل خالصه در مجمـع ) ها(مقاله بايد نتيجه پژوهش شخصي نويسنده � ). در مورد مقاالت ارائه شده در مجامع علمي، مشخصات كامل مجمع بايد در فرم پيش نياز ذكر شود (علمي

.زمان براي بررسي به مجالت ديگر ارسال شده باشند ارسالي نبايد به صورت هممقاالت �

.است) ها(مسؤوليت مطالب مندرج در مقاله بر عهده نويسنده �

.ها آزاد است دفتر نشريه در ويراستاري، رد يا قبول مقاله �

.شوند با رعايت نوبت منتشر مي شود و در صورت تصويب در هيأت تحريريه مقاالت دريافتي توسط متخصصان امر داوري مي �

)براي دريافت فرم به وب سايت نشريه مراجعه كنيد. (الزامي است )فرم پيش نياز(فرم تعهد و نوآوري تكميل و ارسال �

روش تدوين مقاله .3 . و به صورت يك ستوني انجام شده باشد A4، روي كاغذMicrosoft Office Word 2007تايپ مقاله با نرم افزار �

. ژه ها دقت الزم مبذول شود قاله بايد فارس سليس، روان و از نظر دستور زبان صحيح باشد، در انتخاب وامتن م �

مسلم است تغيير و يا جابجايي اسامي نويسندگان بعد از مشخص . نام نويسندگان به همان ترتيبي آورده شود كه مايل هستند در نشريه چاپ شود � .مكان پذير نخواهد بودا) داوري اوليه( شدن نتيجه داوري

.بخش زير باشد 5شايسته است متن مقاله به ترتيب شامل �

منابع-5بحث و نتيجه گيري و -4نتايج، -3ها، مواد و روش-2مقدمه، -1 .در صورت لزوم بخش قدرداني در انتهاي مقاله و قبل از بخش مراجع نوشته شود �ها در اولين بـار ذكـر شـدن در مـتن بـه شوند، به فارسي نوشته شود اما شكل التين تمامي آن ذكر ميالزم است نام نويسندگاني كه در متن مقاله �

. در مورد اسامي فارسي، شكل التين اين اسامي نيز در اولين بار ذكر شدن، زير نويس شود. صورت زيرنويس درج شود

. فارسي آنها در متن و معادل انگليسي به صورت زيرنويس درج شودكار بردن كلمات انگليسي در متن مقاله خود داري شود؛ معادل از به �

هاي كليدي عنوان مقاله، چكيده و واژه .4 .واژه تجاوز نكند 20عنوان مقاله كوتاه و در راستاي محتواي مقاله باشد و از �

:باشدزير بخش 5الزم است اين چكيده به ترتيب شامل . كلمه باشد 300چكيده فارسي نبايد بيشتر از �

هاي كليدي واژه-5گيري، بحث و نتيجه-4نتايج، -3ها، مواد و روش-2مقدمه، -1

.واژه مجزا باشد 7هاي كليدي فارسي و انگليسي بايد يكسان و حداكثر شامل واژه �

.باشد بخش زير 5اين چكيده بايد معادل چكيده فارسي تنظيم شود و شامل . الزم است براي مقاله چكيده انگليسي تهيه كنيد �1- Introduction, 2-Material and method, 3-Results, 4-Discussion and conclusion, 5-Keywords

جدول، نمودار، تصاوير و فرمول نويسي .5

ير عنوان جدول در باالي آن و عنـوان سـا . گذاري شوند و به همراه عنوان در متن آورده شوند شماره شكلها تحت عنوان تمامي شكل و نمودار � .گذاري شوند جداول نيز جداگانه شماره. ها در زير آن نوشته شود شكل

اگر شكل يا جدولي از مرجع ديگري اخذ شده است در ادامه عنوان جدول يا شكل همانند متن ارجاع داده و مشخصات كامل ماخـذ در بخـش � . مراجع درج شود

از ارسال نمودارها به فرمت عكس خودداري كنيد تا هنگام صفحه آرايـي . شوندها به صورت تك بعدي و به صورت سياه و سفيد تنظيم نمودار � .امكان تغيير فونت و فرمت نمودار فراهم باشد

.به باال تهيه شوند 300dpiتصاوير با كيفيت �

.ها به فارسي نوشته شود هاي روي شكل كلمات و عبارت �

گـذاري شـوند تهيه و به ترتيـب شـماره Microsoft Word Equation 3.3ستفاده از معادالت بايد به صورت خوانا با حروف و عالئم مناسب با ا � . معرفي شوند) SI(المللي واحدها واحدها بر حسب سيستم بين

.انتخاب شود In Line With Textبه صورت Text Wrappingها در بخش فرمت شكل �

نحوه نگارش منابع .6

.درج شوند الزم است همه مراجع فارسي به زبان انگليسي �

بنابراين، از ترجمـه . ها قابل دستيابي است اين شكل التين در قسمت چكيده التين آن. در خصوص منابع فارسي، از شكل التين آنها استفاده شود � .خودسرانه منابع خودداري شود

. گذاري و مرتب شوند اند شماره تمام مراجع به ترتيبي كه در متن آمده �

.ها اشاره شده است در بخش مراجع آورده شوند قاله به آنفقط مراجعي كه در متن م �

قاعده كلي اين شيوه اين است كه منابع به ترتيب استناد، با اسـتفاده از اعـداد در . باشد شيوه استناد ونكوورنحوه نگارش مراجع بايد بر اساس � .ور روي وب سايت نشريه مراجعه كنيدتر به شيوه نامه ونكو براي كسب اطالعات دقيق .گذاري شوند داخل پرانتز شماره

:نمونه استناد به كتاب

Lodish H, Baltimore D, Berk A, Zipursky Sl, Matsudaria P, Datnell j. Moleccular cell biology. 3rd ed. New York: Scientific American; 1995.

: نمونه استناد به مقاله مجلهZamani P, Amoozegar M, Khajeh K. Cloning and Expression of Laccase Enzyme from B. pumilus strain GAZ23. Biological Journal of Microorganism. 2014; 3 (9): 1-10.

: نمونه استناد به فصلي از كتابPoter RJ, Meldrum BS. Antiepileptic drugs. In: Katzung BG, editor. Clinical pharmacology. 6th ed. Norwalk, CN: Appleton and Lange; 1995: 361- 80

:نمونه استناد به پايان نامه Bakhsheshi R. Isolation and Identification of chemolithotroph acidophilic bacteria of Qotoursou spring in Ardebil province [Dissertation]. Tehran: Shahid Beheshty Univ; 2006.

ها سمشناسي ميكروارگاني زيست نشريه و فناوري دانشگاه اصفهان پژوهشمعاونت : صاحب امتياز

2322-5173): شاپا چاپي(شماره استاندارد بين المللي

2322-5181): شاپا الكترونيكي(شماره استاندارد بين المللي

1393 زمستان -12شماره -ومسسال پژوهشي - علمي

گيتي امتيازيدكتر : سردبير دانشگاه اصفهان -اسيشن ميكروب استاد

[email protected]

دكتر سيد حميد زركش اصفهاني: مدير مسؤول اصفهان دانشگاه -دانشيار ايمنولوژي باليني

[email protected]

ياسر تذهيبي: ويراستار انگليسي

بتول مهماندوست: ويراستار فارسي

سلماني آرزو رحيم : مدير اجرايي

0311-7934230: شماره تماس 0311-7932177: دورنگار

[email protected] معصومه دهقان: صفحه آرا

انـگاه اصفهـارات دانشـانتش: رـناش اداره چاپ، انتشارات و مجالت،

و فناوري دانشگاه اصفهان پژوهشمعاونت [email protected]

معاونـت ،مركزي نهساختمان كتابخا ،دانشگاه اصفهان ،اصفهان :نشانيــژوهش ــاوري پ ــر ،اداره چــاپ، انتشــارات و مجــالت ،و فن نشــريهدفتــت ــم زيسـ ــي ميكروارگانيسـ ــا شناسـ ــتي ، هـ ــد پسـ 8174673441: كـ

[email protected]

اعضاي هيأت تحريريه

ــر ــن دكتـــــ ــرداد آذيـــــ مهـــــ

هاي علمي و صنعتي ايران پژوهش سازمانژي، دانشيار بيوتكنولو

[email protected]

كتــــــر مالحــــــت احمــــــدي د

ــيار ــروب دانشـــ ــي ميكـــ ـــاهشناســـ ــه ، دانـشـــگـــــ اروميـــ

[email protected]

ــر ــازي دكتـــــ ــي امتيـــــ گيتـــــ

ـــاد ــروب استـــــــ ــي ميكـــ ـــاه اشناســـ ــفهان، دانشــگــــ صـــ

[email protected]

رضــا پــور شــفيع محمــد دكتــر

ـــاد ــ اسـتـــ ــي روب ميك ــهشناس ــران ، مؤسس ــتور اي ــتيتو پاس انس

[email protected]

مجتبـــــــي تـــــــاران دكتـــــــر

دانشــــگاه رازي كرمانشــــاه ، شناســــي ميكــــروب دانشــــيار

[email protected]

ــي ــيني جزنــ ــا حســ ــر نيمــ دكتــ

پزشـــكي اروميـــه شناســـي، دانشـــگاه علـــوم ميكـــروب اســـتاد

[email protected]

دكتــــــــر محمــــــــد ربــــــــاني

، دانشگـــــــــاه اصــــــفهانشناســــــي ميكــــــروب دانشــــــيار

[email protected]

دكتــــــر محمــــــد رعايــــــايي

ـــار ــروب دانشـيـ ــي ميك ــگاه ، شناس ــواز دانش ــران اه ــهيد چم ش

[email protected]

دكترسيد حميد زركـش اصـفهاني

ــاليني، ــيار ايمنولـــــوژي بـــ ـــاندانشـــ ـــاه اصفهــــــ دانشگـــــ

[email protected]

دكتـــر نورخـــدا صـــادقي فـــرد

ـــار ــروب دانـشـيــــــ ــي ميكــ ــالم شناســ ـــاه ايــ ، دانـشـگـــــــ

[email protected]

ــر ريح ــايي دكتـــ ــه عموآقـــ انـــ

ــيار ــو دانشــ ــو لــ ــهركرد ژي فيزيــ ـــاه شــ ــاهي، دانشگــــ گيــ

[email protected]

صــفايي دكتــر حاجيــه قاســميان

علــوم پزشــكي اصــفهان ، دانشــگاهشناســي ميكــروب اســتاد

[email protected]

ي كرمانشــاهي دكتــر روحــا كســر

ـــاد ــروب استـــــــ ــي ميكـــ ــراء شناســـ ـــاه الزهـــ ، دانشــگــــ

[email protected]

دكتــــــــر ايــــــــرج نحــــــــوي

اســــــــتاد بيوتكنولــــــــوژي، دانشگـــــــــــاه اصفهــــــــــــان

[email protected]

ــت نشــريه ــم زيس ــي ميكروارگانيس ــا شناس ــر اســ ه ــه شـــب ــ 270996/3ماره ـاس ابالغي ورخ ـم

ــيكم 24/12/1390 ـــسـ ـــيون بررسـ ـــي نشـ ـــريات علمـ ــ ،ومـي وزارت علـ ـــتحقيقـ اوري ـات و فنـ .است پژوهشي –علمي ه ـداراي درج

:شودميو فهرست نمايه هاي زير ها در پايگاه ميكروارگانيسم شناسي زيست نشريه

http://uijs.ui.ac.ir/bjm نشريه الكترونيكيپايگاه

http://www.isc.gov.ir پايگاه علوم استنادي جهان اسالم

http://www.sid.ir جهاد دانشگاهي پايگاه اطالعات علمي

http://www.magiran.com بانك اطالعات نشريات كشور

http://www.doaj.org فهرست مجالت پژوهشي با دسترسي آزاد: دوآج

http://ulrichsweb.serialssolutions.com راهنماي بين المللي نشريات ادواري: اولريخ

http://journals.indexcopernicus.com )فهرست مجالت برتر( ايندكس كوپرنيكوس

http://www.ebscohost.com هاي اطالعاتي ميزبان پايگاه :ابسكو

/http://scholar.google.com گوگل اسكوالر

انتشارات دانشگاه اصفهان: چاپ و ليتوگرافي انــگاه اصفهــدانش: رـناش الـري 40000: تـمـقي نسخه 500: راژـتي

۱۳۹۳ ز��تان -۱۲ �ماره – وم� سال

�و��ی -ع��ی