37
eostatistique M. Ribatet Master Biostat — Universit´ e de Montpellier 1. Processus stochastiques 6 Quelques rappels ......................................................... 7 Processus gaussiens ....................................................... 9 Processus d’ordre 2 ...................................................... 12 Stationnarit´ e stricte ...................................................... 13 Stationnarit´ e faible ...................................................... 14 Isotropie ............................................................. 18 Continuit´ e de K(·) ...................................................... 21 Continuit´ e de Z (·)....................................................... 22 erivabilit´ e de Z (·) ...................................................... 24 Corr´ elation param´ etrique .................................................. 25 Stationnarit´ e intrins` eque................................................... 27 Variogramme .......................................................... 28 Propri´ et´ es de γ (·) ....................................................... 29 Variogrammes param´ etriques ............................................... 31 2. Mod´ elisation statistique 33 Donn´ ees de calcium ...................................................... 34 Variogramme empirique ................................................... 39 Ajustement d’un variogramme ............................................... 47 Krigeage ............................................................. 50 Mod´ elisation par processus gaussiens .......................................... 61 DM ................................................................. 63 3. Simulations de processus gaussiens 67 Motivations ........................................................... 68 Simulations non conditionnelles .............................................. 69 Simulations conditionnelles ................................................. 70 1

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Geostatistique

M. Ribatet

Master Biostat — Universite de Montpellier

1. Processus stochastiques 6Quelques rappels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7Processus gaussiens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9Processus d’ordre 2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12Stationnarite stricte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13Stationnarite faible . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14Isotropie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18Continuite de K(·) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21Continuite de Z(·). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22Derivabilite de Z(·) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24Correlation parametrique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25Stationnarite intrinseque. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27Variogramme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28Proprietes de γ(·) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29Variogrammes parametriques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31

2. Modelisation statistique 33Donnees de calcium. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34Variogramme empirique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39Ajustement d’un variogramme. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47Krigeage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50Modelisation par processus gaussiens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61DM. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63

3. Simulations de processus gaussiens 67Motivations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68Simulations non conditionnelles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69Simulations conditionnelles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70

1

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Qu’est ce que la geostatique ?

La geostatistique est une branche des statistiques visant a donner une description de quantitesdistribuees spatialement ou encore spatio–temporellement.

Voici quelques quantites d’interet :

– la temperature, precipitation, neige, . . .– concentration d’un polluant, ozone, . . .– teneur d’un minerai d’un gisement, . . .

Geostatistique Mathieu Ribatet – 2 / 70

Objectifs

L’objectif d’une analyse geostatistique sera bien souvent la prediction, e.g.,

– Temperature a Carnon sachant celles de Palavas, du Grau du roi et de la Grande Motte ?– Quel est l’endroit ayant la plus forte concentration d’un polluant ?

Toutefois elle permettra bien egalement de repondre a d’autres questions :

– les temperatures a Montepllier et Nımes sont elles fortement liees ?– Quelles variables semblent influencer la pollution ?

Geostatistique Mathieu Ribatet – 3 / 70

2

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Quelques references

Chiles, J.-P. and Delfiner, P. (1999). Geostatistics: Modelling Spatial Uncertainty. Wiley, New York.

Cressie, N. A. C. (1993). Statistics for Spatial Data. Wiley Series in Probability and Statistics. JohnWiley & Sons inc., New York.

Diggle, P., Ribeiro, P., and Justiniano, P. (2007). Model-based Geostatistics. Springer Series inStatistics. Springer.

Stein, M. L. (1999). Interpolation for spatial data: Some theory for kriging. Springer, New York.

Wackernagel, H. (2003). Multivariate geostatistics: An introduction with applications. Springer,New York, third edition edition.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 4 / 70

Ce que nous ne verrons pas :-(

Les donnees sur reseaux // grille, e.g.,

– analyse d’une image via un champ de Markov ;– nombre de malades de la grippe sur l’agglomeration Montpellieraine.

Theorie ergodique ; Cadre multivarie, e.g., modelisation jointe de la temperature et l’humidite. Theorie spectrale des processus (Bochner, Stein, Schoenberg, . . . )

Geostatistique Mathieu Ribatet – 5 / 70

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1. Processus stochastiques 6 / 70

Quelques rappels

Definition 1 (Rappel). Un processus stochastique defini sur X et a valeur dans E est une famille devariables aleatoires indexees par X et a valeur dans E toutes definies sur un meme espace deprobabilite (Ω,F , P ).

Exemple 1 (Marche aleatoire). Soient ε1, ε2, . . .iid∼ N(0, σ2) et posons

Z0 = ε0, Zt+1 = Zt + εt+1, t ≥ 0.

Ceci definit un processus stochastique sur X = N et a valeur dans E = R.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 7 / 70

Lois fini–dimensionnelles

Proposition 1. Un processus stochastique est totalement caracterise‡ par ses loisfini–dimensionnelles, i.e., pour tout n ≥ 1 et (s1, . . . , sn) ∈ X n,

PrZ(s1) ∈ B1, . . . , Z(xn) ∈ Bn, B1, . . . , Bn boreliens de E.

Ces dernieres doivent cependant satisfaire les hypotheses du theoreme d’extension de Kolmogorov,i.e., pour toute permutation σ de 1, . . . , n,

νs1,...,sn(B1,...,Bn)=νσ(s1),...,σ(sn)Bσ(1),...,Bσ(n)

etνs1,...,sn−1(B1, . . . , Bn−1) = νs1,...,sn(B1, . . . , Bn−1, E).

Remarque. Le theoreme d’extension de Kolmogorov permet d’assurer l’existence d’un processusstochastique ayant des lois fini–dimensionnelles donnees ν.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 8 / 70

4

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Processus gaussiens

Definition 2. Un processus Z(s) : s ∈ X est un processus gaussien si ses lois fini–dimensionnellessont Gaussiennes.

Exemple 2. L’exemple precedent de la marche aleatoire

Zt+1 = Zt + εt+1, εtiid∼ N(0, σ2),

definit un processus Gaussien sur N.

Remarque. Certaines personnes utilisent le terme “processus Gaussien” lorsque X = R ou N et“champs Gaussien” lorsque X = R

d, d ≥ 2. Personnelement je ne fais aucune distinction et parleraitoujours de processus stochastique (Gaussien ou non d’ailleurs).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 9 / 70

Illustration

0 2 4 6 8 10

−2

−1

01

s

Z(s

)

Z(2.5)

Den

sity

−4 −2 0 2 4

0.0

0.1

0.2

0.3

0.4

Z(7.5)

Den

sity

−4 −2 0 2 4

0.0

0.1

0.2

0.3

0.4

Figure 1: Illustration pedagogique d’un processus Gaussien sur X = [0, 10].

0 2 4 6 8 10

02

46

810

s

s

−3

−2

−1

0

1

2

3

0 2 4 6 8 10

02

46

810

s

s

−3

−2

−1

0

1

2

3

0 2 4 6 8 10

02

46

810

s

s

−3

−2

−1

0

1

2

3

Figure 2: Trois realisations d’un processus Gaussien sur X = [0, 10]2.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 10 / 70

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Cadre geostatistique

Puisque la geostatistique vise, par exemple, a donner une description d’une quantite distribueespatialement ou spatio–temporellement, nous nous restreindrons au cas ou X = R

2 voire X = R3.

Par exemple pour la modelisation de la pluie, nous definirons donc un processus stochastiquedefini sur R2 et a valeur dans R+.

Dans la suite, nous noterons indifferemment le processus stochastique par Z(s) : s ∈ X, Z(s),Z(·) ou tout simplement Z.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 11 / 70

Processus d’ordre 2

Definition 3. Un processus Z(s) : s ∈ X est dit d’ordre 2 si pour tout s ∈ X

VarZ(s) <∞ (et donc a fortiori EZ(s) <∞)

Ceci nous permet alors de considerer la tendance (trend // drift)

µ : X −→ E

s 7−→ µ(s) = EZ(s),

et la fonction de covariance

K : X × X −→ R

(s1, s2) 7−→ K(s1, s2) = CovZ(s1), Z(s2).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 12 / 70

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Stationnarite stricte

Definition 4. Un processus Z(s) : s ∈ X est dit strictement stationnaire si pour tout n ≥ 1 et(s1, . . . , sn) ∈ X n

PrZ(s1) ∈ B1, . . . , Z(sn) ∈ Bn = PrZ(s1 + h) ∈ B1, . . . , Z(sn + h) ∈ Bn,

h ∈ X et Boreliens B1, . . . , Bn.

C’est generalement une propriete bien trop forte (et impossible a verifier en pratique) qui font quel’on considere souvent une version assouplie.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 13 / 70

Stationnarite faible

Definition 5. Un processus d’ordre 2 Z(s) : s ∈ X est dit faiblement stationnaire si pour touts, s1, s2, h ∈ X

EZ(s) = EZ(s+ h)

CovZ(s1), Z(s2) = CovZ(s1 + h), Z(s2 + h),

i.e.,µ(s) = µ, K(s1, s2) = K(s1 + h, s2 + h).

Proposition 2. Si Z(s) : s ∈ X est faiblement stationnaire alors

µ(s) = µ, K(s1, s2) = K(o, s2 − s1)not.= K(s2 − s1),

ou o est une origine arbitraire de X .

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Question pour vous. . .

Avantage de la stationnarite ? Inconvenient de la stationnarite ?

Geostatistique Mathieu Ribatet – 15 / 70

Proprietes de la fonction de covariance (DM)

Soit Z(s) : s ∈ X un processus faiblement stationnaire. Sa fonction de covariance K(·) verifie alors

K(o) = VarZ(s) ≥ 0 pour tout s ∈ X ; K(h) = K(−h) ; K(h) ≤ K(o) ; Pour tout n ≥ 1 et λ1, . . . , λn ∈ R et s1, . . . , sn ∈ X ,

n∑

i,j=1

λiλjK(si − sj) ≥ 0.

Remarque. Cette derniere propriete revient a dire que K(·) est (semi) definie positive.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 16 / 70

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Proprietes sur les fonctions definies positives

Si K1(·) et K2(·) sont def. pos. alors a1K1(·) + a2K2(·) l’est aussi pour a1, a2 ≥ 0 ; Soient Kn(·)n≥1 une suite de fonctions def. pos. telle que Kn(s) → K(s) lorsque n→ ∞ pour

tout s ∈ X . Alors K(·) est def. pos. ; Si K1(·) et K2(·) sont def. pos. alors alors K(s) = K1(s)K2(s) est def. pos.

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Isotropie

Dans un esprit de modelisation, il sera souvent “agreable” de supposer l’isotropie

Definition 6. Un processus Z(s) : s ∈ X est dit isotrope si pour tout matrice de rotationa R

Z(s) : s ∈ Xd= Z(Rs) : s ∈ X.

Remarque. Si Z(s) : s ∈ X est faiblement stationnaire, alors cela revient a dire

K(h) = K(‖h‖), h ∈ X .

Remarque. Un processus non isotrope est anisotrope.

aUne matrice A est une matrice de rotation si A−1= A

⊤ et |A| = 1

Geostatistique Mathieu Ribatet – 18 / 70

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Question pour vous. . .

Avantage de l’isotropie ? Inconvenient de l’isotropie ?

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Allure generale de K(·)

0 2 4 6 8 10 12 14

01

23

45

h

K(h

)

0 2 4 6 8 10 12 14

0.0

0.5

1.0

1.5

2.0

2.5

3.0

h

K(h

)

0 2 4 6 8 10 12 14

0.0

0.1

0.2

0.3

0.4

0.5

h

K(h

)

Figure 3: Quelques fonctions de covariance isotropes.

En profiter pour definir :

portee (practical range) variance partielle (partial sill) effet pepite (nugget) derivabilite en l’origine

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Continuite de K(·)

Proposition 3. Soit un processus faiblement stationnaire Z(s) : s ∈ X de fonction de covarianceK(·). Si K(·) est continu a l’origine alors elle est continue partout.

Corollaire 1. La fonction de covariance K(·) d’un processus faiblement stationnaire ne peut etrediscontinue qu’en son origine (effet pepite) et si tel est le cas alors

K(h) = cδo(h) +Kc(h), h ∈ X ,

ou c > 0 (la pepite) et Kc(·) est une fonction de covariance continue.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 21 / 70

Continuite en moyenne quadratique

Definition 7. Un processus faiblement stationnaire Z(s) : s ∈ X est dit continu en moyennequadratique si

E[

Z(o)− Z(h)2]

−→ 0, ‖h‖ → 0.

Theoreme 1. Un processus faiblement stationnaire Z(s) : s ∈ X est continu en moyennequadratique si et seulement si K(·) est continue a l’origine.

Remarque (DM). Que devient ce theoreme lorsque le processus est seulement d’ordre 2 et de moyenneconstante ?

Geostatistique Mathieu Ribatet – 22 / 70

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Trajectoires continues p.s. et continuite en moyenne quadratique

0 5 10 15 20 25 30

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

s

Z(s

)

Figure 4: Realisation d’un processus L2–continu et mais a trajctoires non continues.

Z(s) = XI(s), I(s) = infi ≥ 1: ξi ≥ s,

avec ξi : i ≥ 1 ∼ PPP (1) et Xiiid∼ Ber(p).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 23 / 70

Derivabilite en moyenne quadratique

Definition 8. Un processus faiblement stationnaire Z(s) : s ∈ X est derivable s’il existe unprocessus d’ordre 2 D(s) : s ∈ X tel que

E

[

Z(s+ h)− Z(s)

‖h‖−D(s)

2]

−→ 0, ‖h‖ → 0.

Le processus D(s) : s ∈ X est appele processus derive (en moyenne quadratique) de Z(s) : s ∈ Xet sera note naturellement Z ′(s) : s ∈ X.

Proposition 4 (Bartlett, 1955). Un processus faiblement stationnaire est derivable en moyennequadratique si et seulement si K(·) admet une derivee seconde en son origine.

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Quelques familles de fonctions de correlation isotropesExponentielρ(h) = exp

(

−h

λ

)

, λ > 0

Gaussien

ρ(h) = exp

(

h

λ

)2

, λ > 0

Stable // Exponentiel puissance

ρ(h) = exp

(

h

λ

, 0 < κ ≤ 2, λ > 0

Whittle–Matern

ρ(h) =21−κ

Γ(κ)

(u

λ

(u

λ

)

, κ > 0, λ > 0.

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0.0 0.5 1.0 1.5 2.0

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

h

γ(h)

Stable

κ = 2κ = 1.5κ = 1κ = 0.5

0.0 0.5 1.0 1.5 2.0

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

h

γ(h)

Whittle−Matern

κ = 20κ = 1κ = 0.5κ = 0.25

Figure 5: Fonctions de correlation isotrope du type “Stable” et “Whittle-Matern”.

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Stationnarite intrinseque

Parfois il peut etre necessaire de relacher (un peu) l’hypothese de stationnarite faible

Definition 9. Un processus Z(s) : s ∈ X est dit intrinsequement stationnaire ou a accroissementsstationnaires si

EZ(s)− Z(s+ h) = 0,

VarZ(s)− Z(s+ h) = 2γ(h) (ne depend que de h)

Stationnarite intrinseque 6⇒ Stationnarite faible Stationnarite faible ⇒ Stationnarite intrinseque Stationnarite intrinseque suppose l’existence des 2 premiers moments de

Z(s+ h)− Z(s) : s ∈ X mais aucunement ceux de Z(s) : s ∈ X.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 27 / 70

Variogramme

Definition 10. Soit Z(s) : s ∈ X un processus (au moins!) a accroissements stationnaires. Onappelle (semi) variogramme la fonction

γ : X −→ R+

h 7−→ γ(h) =1

2E[

Z(s+ h)− Z(s)2]

.

Remarque. Si Z(s) : s ∈ X est faiblement stationnaire alors clairement

γ(h) = K(o)−K(h).

En revanche l’existance d’un variogramme n’assure pas celle de la fonction de covariance !!!

Geostatistique Mathieu Ribatet – 28 / 70

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Proprietes du variogramme (DM)

Proposition 5. Soient Z(s) : s ∈ X un processus a accroissements stationnaires et λ1, . . . , λn ∈ R

tels que∑n

j=1 λj = 0. Alors

E

n∑

j=1

λjZ(sj)

= 0, Var

n∑

j=1

λjZ(sj)

= −

n∑

i,j=1

λiλjγ(si − sj) ≥ 0

La proposition precedente indique que sous l’hypothese d’accroissement stationnaires, toutes lescombinaisons lineaires de Z(sj) ne sont pas valides !

Remarque. Attention pour votre DM, on travaille ici sous les hypotheses d’accroissementsstationnaires on ne peut donc pas ecrire EZ(s) ou VarZ(s) !!!

Geostatistique Mathieu Ribatet – 29 / 70

Proprietes du variogramme

γ(o) = 0 ; γ(h) ≥ 0 pour tout h ∈ X ; γ(−h) = γ(h) pour tout h ∈ X ; ‖h‖−2γ(h) −→ 0 lorsque ‖h‖ → ∞ (admis) ; La fonction h 7→ exp−cγ(h), c > 0, est une fonction de covariance (admis).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 30 / 70

15

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Variogrammes parametriques

Il existe deux types de variogrammes : bornes ou non. Dans le cas bornes, alors on reprend les familles parametriques donnees pour les covariances

puisqueγ(h) = K(o)−K(h)

Si le variogramme est borne alors γ(·) herite des proprietes deja vues pour K(·). Un modele parametrique non borne frequemment rencontre est le modele puissance

γ(h) =

(

h

λ

, 0 < κ < 2.a

aCombine avec un proc. gauss. on tombe sur un mouvement brownien fractionnaire (brownien classique pour κ = 1).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 31 / 70

0.0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

h

γ(h)

Stableκ = 2κ = 1.5κ = 1κ = 0.5

0.0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0

02

46

810

h

γ(h)

Puissanceκ = 0.5κ = 1κ = 1.5κ = 2

Figure 6: Variogrammes isotropes du type “Stable” et “puissance”.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 32 / 70

16

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2. Modelisation statistique 33 / 70

Donnees de calcium

Donnees de teneur en calcium (et magnesium) du sol (entre 0 et 20cm de profondeur) La region d’etude a ete divisee en 3 sous–regions

– HG : parcelle pouvant etre consideree comme naturelle ;– Bas: culture de riz (traitement au Ca le plus recent) ;– HD: A recu des engrais dans le passe.

Objectif : Modeliser spatialement la teneur de Ca encore presente qui a ete utilisee par le passepour neutraliser l’impact de l’aluminium present dans le sol.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 34 / 70

Format des donnees

east north altitude area ca20

1 5710 4829 6.10 3 52

2 5727 4875 6.05 3 57

3 5745 4922 6.30 3 72

4 5764 4969 6.60 3 74

5 5781 5015 6.60 3 68

6 5799 5062 5.75 3 45

7 5817 5109 5.35 3 47

8 5837 5161 5.10 3 49

9 5873 5254 5.00 2 38

10 5907 5347 5.20 2 53

11 5925 5394 5.05 2 60

12 5943 5441 4.65 2 47

13 5961 5487 4.40 2 34

...

Geostatistique Mathieu Ribatet – 35 / 70

17

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Question pour vous. . .

En tant que statisticien, que feriez vous si vous deviez travailler sur ces donnees ?

Geostatistique Mathieu Ribatet – 36 / 70

5000 5200 5400 5600 5800 6000

4800

5000

5200

5400

5600

5800

Longitude

Latit

ude

52

57

72

74

68

45

47

49

38

53

60

47

34

56

66

53

43

42

49

45

53

38

47

35

60

45

60

61

58

44

50

47

49

46

43

56

43

50

61

57

57

42

41

54

46

50

43

72

56

38

64

56

68

61

50

47

58

53

47

36

41

71

44

68

67

58

52

64

54

52

46

40

39

62

58

66

50

50

61

61

58

40

44

33

28

59

66

65

54

66

71

69

59

43

41

29

72

49

53

58

55

54

56

47

43

48

47

38

58

53

52

56

53

50

47

43

40

38

58

55

65

53

58

42

46

35

27

58

56

56

66

58

45

40

48

52

31

25

40

47

42

63

63

52

39

47

42

29

37

40

52

60

50

57

68

58

43

30

28

33

21

39

36

48

58

66

51

47

46

44

35

32

64

54

62

63

78

52

Figure 7: Donnees de teneur en Calcium dans le sol. (symbol plot)

Geostatistique Mathieu Ribatet – 37 / 70

18

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5000 5400 5800

2030

4050

6070

80

Longitude

Ca

4800 5000 5200 5400 560020

3040

5060

7080

Latitude

Ca

3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5

2030

4050

6070

80

Altitude

Ca

1 2 3

2030

4050

6070

80

Sous−region

Ca

Figure 8: Evolution de la teneur en Calcium en fonction des covariables disponibles.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 38 / 70

Variogramme empirique

Comme

γ(h) =1

2E[

Z(o)− Z(h)2]

,

un estimateur tres naturel est

γ(h) =1

2n

n∑

ℓ=1

Zℓ(si)− Zℓ(sj)2, h = ‖si − sj‖,

ou encore sa version agregee (binned)

γ(h) =1

2nN(h, ε)

n∑

ℓ=1

k∑

i,j=1

Zℓ(si)− Zℓ(sj)21|‖si−sj‖−h|≤ε,

avec

N(h, ε) =

k∑

i,j=1

1|‖si−sj‖−h|≤ε.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 39 / 70

19

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Variogramme empirique sur les donnees de Calcium

0 200 400 600 800 1000

050

100

150

200

h

γ(h)

Figure 9: Variogramme empirique sur les donnees de Calcium.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 40 / 70

20

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Variogramme empirique sur les donnees de Calcium

0 200 400 600 800 1000

050

100

150

200

h

γ(h)

Figure 10: Variogramme empirique sur les donnees de Calcium (tendance longitude).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 41 / 70

21

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Variogramme empirique sur les donnees de Calcium

0 200 400 600 800 1000

050

100

150

200

h

γ(h)

Figure 11: Variogramme empirique sur les donnees de Calcium (tendance latitude).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 42 / 70

22

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Variogramme empirique sur les donnees de Calcium

0 200 400 600 800 1000

050

100

150

200

h

γ(h)

Figure 12: Variogramme empirique sur les donnees de Calcium (tendance altitude).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 43 / 70

23

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Variogramme empirique sur les donnees de Calcium

0 200 400 600 800 1000

050

100

150

200

h

γ(h)

Figure 13: Variogramme empirique sur les donnees de Calcium (tendance sous-region).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 44 / 70

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Variogramme empirique sur les donnees de Calcium

0 200 400 600 800 1000

050

100

150

200

h

γ(h)

Figure 14: Variogramme empirique sur les donnees de Calcium (tendance sous-region + latitude).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 45 / 70

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Message a retenir

Attention a l’effet des covariables explicatives sur le variogramme. Ces dernieres “reduisent” lastructure de dependance et diminuent la variance.

Pensez aZ(s) = X(s)⊤β + ε(s), s ∈ X ,

ou ε(s) : s ∈ X est un processus faiblement stationnaire de fonction de covariance Kε(·). Alorsclairement

E[

Z(s1)− Z(s2)2]

= E[

Z(s1)− µ(s1)− Z(s2) + µ(s2) + µ(s1)− µ(s2)2]

= 2Kε(o) + µ(s1)− µ(s2)2 + 2Kε(s1 − s2)

≥ 2Kε(o)− 2Kε(s1 − s2)

= 2γε(s1 − s2).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 46 / 70

Ajustement d’un variogramme

Le principe n’est pas vraiment nouveaux : utilisons les moindres carres, i.e.,

1. Choix d’une famille parametrique de variogramme γ(·;ψ)2. Resolution du probleme de minimisation

ψ = argminψ∈Ψ

j

γ(hj)− γ(hj ;ψ)2

Remarque. Il sera souvent preferable d’utiliser les moindres carres ponderes, i.e.,

ψ = argminψ∈Ψ

j

N(hj , ε)

γ(hj , ψ)2γ(hj)− γ(hj ;ψ)

2.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 47 / 70

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Application

0 200 400 600 800 1000

050

100

150

h

γ(h)

OLSGLS

Figure 15: Ajustement par moindre carres d’un variogramme lie a la covariance exponentielle pour les donnees de teneur en Ca.(tendance sous–region)

Geostatistique Mathieu Ribatet – 48 / 70

Message a retenir

Le probleme d’optimisation n’est pas tres “aimable” et il sera donc souvent utile de tester lesestimations en partant de differentes valeurs initiales ;

Il est d’usage lorsqu’on suppose une famille de covariance de type Whittle–Matern de fixer leparametre de forme aux valeurs κ = 0.25, 0.5, . . . , 2. Ce parametre etant particulierement difficilea estimer.

Il est toujours important de se demander si un effet de pepite est reellement souhaitable.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 49 / 70

27

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Krigeage: Objectif

−1.0 −0.5 0.0 0.5 1.0

−1.

0−

0.5

0.0

0.5

1.0

Longitude

Latit

ude

χ

s0

Predire Z(s0) sachant Z(s1), . . . , Z(sk).

Geostatistique Mathieu Ribatet – 50 / 70

Predicteurs lineaires

Infinite de possibilites pour estimer Z(s0) ⇒ restriction au cadre des estimateurs lineaires sansbiais, i.e.,

Z(s0) =

k∑

j=1

λjZ(sj), EZ(s0) = µ(s0).

Parmi la classe de ces estimateurs, on essaiera de determiner le “meilleur” au sens de l’erreurquadratique

Z(s0) = argminT∈Est.Lin.

E[

T − Z(s0)2]

.

Remarque. On sait que le meilleur estimateur au sens erreur quadratique est toujoursT = EZ(s0) | Z(s1), . . . , Z(sk). Cela dit (sauf cas gaussien par ex.), ce n’est pas toujours unestimateur lineaire. . .

Geostatistique Mathieu Ribatet – 51 / 70

28

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Krigeage ordinaire

Supposons que Z(s) : s ∈ X est faiblement stationnaire de moyenne inconnue µ(s) ≡ µ et decovariance (connue) K(·).

Pour que l’estimateur soit sans biais il faut

EZ(s0) =

k∑

j=1

λjEZ(sj) = µ⇒

k∑

j=1

λj = 1.

Et l’on souhaite donc minimiser

VarZ(s0)− Z(s0) =k

i,j=1

λiλjK(si − sj) +K(o)− 2k

i=1

λiK(si − s0)

= λ⊤K(s)λ+K(o)− 2λ⊤K(s− s0),

sous la contrainte λ⊤1 = 1 avec λ = (λ1, . . . , λk) et s = (s1, . . . , sk),K(s) = K(si − sj)i,j=1,...,k.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 52 / 70

Krigeage ordinaire

Proposition 6 (DM). L’estimateur du krigeage ordinaire est donne par

Z(s0) = K(s− s0)⊤K(s)−1Z(s) +

1⊤K(s)−1Z(s)

1⊤K(s)−11

1− 1⊤K(s)−1K(s− s0)

,

ou Z(s) = Z(s1), . . . , Z(sk).De plus la variance de l’erreur est donnee par

VarZ(s0)− Z(s0) = K(o)−K(s− s0)⊤K(s)−1K(s− s0) +

1− 1⊤K(s)−1K(s− s0)2

1⊤K(s)−11

Geostatistique Mathieu Ribatet – 53 / 70

29

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Le krigeage ordinaire en pratique

1. Calcul du variogramme empirique ;2. Ajustement d’un variogramme parametrique ;3. Calculez K(s) ainsi que son inverse ;4. Pour chaque point s0 d’un grille de X

(a) Calcul de K(s− s0) ;(b) Calcul de Z(s0) et de la variance de l’erreur;

5. Faire de jolies cartes ;

Geostatistique Mathieu Ribatet – 54 / 70

Quantite de Calcium contenu dans le sol

5000 5200 5400 5600 5800 6000

4800

5000

5200

5400

5600

5800

X Coord

Y C

oord

20 30 40 50 60 7052

57

72

74

68

45

47

49

38

53

60

47

34

56

66

53

43

42

49

45

53

38

47

35

60

45

60

61

58

44

50

47

49

46

43

56

43

50

61

57

57

42

41

54

46

50

43

72

56

38

64

56

68

61

50

47

58

53

47

36

41

71

44

68

67

58

52

64

54

52

46

40

39

62

58

66

50

50

61

61

58

40

44

33

28

59

66

65

54

66

71

69

59

43

41

29

72

49

53

58

55

54

56

47

43

48

47

38

58

53

52

56

53

50

47

43

40

38

58

55

65

53

58

42

46

35

27

58

56

56

66

58

45

40

48

52

31

25

40

47

42

63

63

52

39

47

42

29

37

40

52

60

50

57

68

58

43

30

28

33

21

39

36

48

58

66

51

47

46

44

35

32

64

54

62

63

78

52

5000 5200 5400 5600 5800 6000

4800

5000

5200

5400

5600

5800

X Coord

Y C

oord

2 4 6 8 10 12

Figure 16: Krigeage ordinaire et erreur de prediction pour les donnees de teneur en Ca.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 55 / 70

30

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Question pour vous. . .

Que pensez vous de ce que nous venons de faire ?

Geostatistique Mathieu Ribatet – 56 / 70

Krigeage universel

Nous supposons desormais que

Z(s) = X(s)⊤β + ε(s), s ∈ X ,

ou ε(s) : s ∈ X est un processus faib. stat. de moyenne nulle et de covariance (connue) K(·), βvecteur de parametre a estimer et X(s) vecteur de covariables au point s ∈ X .

Z(s0) =∑k

j=1 λjZ(sj) est sans biais :

EZ(s0)− Z(s0) =k

j=1

λjX(sj)⊤β −X(s0)

⊤β

=

k∑

j=1

λjX(sj)−X(s0)

β

= 0, pour tout β.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 57 / 70

31

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Krigeage universel

L’equation precedente impose donc les p contraintes suivantes

k∑

j=1

λjXℓ(sj)−Xℓ(s0), ℓ = 1, . . . , p,

ou X(s) = X1(s), . . . ,Xp(s)—i.e., p covariables. On souhaite alors minimiser

VarZ(s0)− Z(s0)

avec les p contraintes precedentes.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 58 / 70

Krigeage universel

Apres quelques calculs penibles mais simples, on trouve alors pour λ = (λ1, . . . , λk)

λ = K(s)−1K(s− s0)−K(s)−1X(s)X(s)⊤K(s)−1X(s)−1X(s)⊤K(s)−1K(s− s0)−X(s0).

La variance de l’erreur de l’estimateur VarZ(s0)− Z(s0) est donnee par

K(o)−K(s− s0)⊤K(s)−1K(s− s0)+

X(s)⊤K(s)−1K(s− s0)−X(s0)⊤X(s)⊤K(s)−1

X(s)−1X(s)⊤K(s)−1K(s− s0) −X(s0).

Remarque. On retombe sur le krigeage ordinaire en posant X(s) ≡ 1.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 59 / 70

32

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Krigeage ordinaire // universel

5000 5200 5400 5600 5800 6000

4800

5000

5200

5400

5600

5800

X Coord

Y C

oord

20 30 40 50 60 7052

57

72

74

68

45

47

49

38

53

60

47

34

56

66

53

43

42

49

45

53

38

47

35

60

45

60

61

58

44

50

47

49

46

43

56

43

50

61

57

57

42

41

54

46

50

43

72

56

38

64

56

68

61

50

47

58

53

47

36

41

71

44

68

67

58

52

64

54

52

46

40

39

62

58

66

50

50

61

61

58

40

44

33

28

59

66

65

54

66

71

69

59

43

41

29

72

49

53

58

55

54

56

47

43

48

47

38

58

53

52

56

53

50

47

43

40

38

58

55

65

53

58

42

46

35

27

58

56

56

66

58

45

40

48

52

31

25

40

47

42

63

63

52

39

47

42

29

37

40

52

60

50

57

68

58

43

30

28

33

21

39

36

48

58

66

51

47

46

44

35

32

64

54

62

63

78

52

5000 5200 5400 5600 5800 6000

4800

5000

5200

5400

5600

5800

X Coord

Y C

oord

2 4 6 8 10 12

5000 5200 5400 5600 5800 6000

4800

5000

5200

5400

5600

5800

X Coord

Y C

oord

20 30 40 50 60 7052

57

72

74

68

45

47

49

38

53

60

47

34

56

66

53

43

42

49

45

53

38

47

35

60

45

60

61

58

44

50

47

49

46

43

56

43

50

61

57

57

42

41

54

46

50

43

72

56

38

64

56

68

61

50

47

58

53

47

36

41

71

44

68

67

58

52

64

54

52

46

40

39

62

58

66

50

50

61

61

58

40

44

33

28

59

66

65

54

66

71

69

59

43

41

29

72

49

53

58

55

54

56

47

43

48

47

38

58

53

52

56

53

50

47

43

40

38

58

55

65

53

58

42

46

35

27

58

56

56

66

58

45

40

48

52

31

25

40

47

42

63

63

52

39

47

42

29

37

40

52

60

50

57

68

58

43

30

28

33

21

39

36

48

58

66

51

47

46

44

35

32

64

54

62

63

78

52

5000 5200 5400 5600 5800 6000

4800

5000

5200

5400

5600

5800

X Coord

Y C

oord

2 4 6 8 10 12

Geostatistique Mathieu Ribatet – 60 / 70

Modelisation par processus gaussiens

Ce que nous avons vu precedemment est la vision Ecole des Mines de Paris. L’approche anglo–saxonne consiste a poser un modele et non pas seulement supposer une

stationnarite faible ou intrinseque. Le plus souvent on supposera que

ΦZ(s) = f(s;β) + ε(s), s ∈ X ,

ou Φ(·) est une fonction lien supposee connue (comme pour les GLM), ε(s) : s ∈ X unprocessus Gaussien centre de covariance K(·) et f(·;β) une fonction parametree par un vecteurde parametre β.

Nous nous restreindrons au cas ou Φ: z 7→ z et f(s;β) = X(s)β.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 61 / 70

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Vraisemblance

La log–vraisemblance est donnee par

ℓ(ψ) = −nk

2log 2π −

n

2log |K(s)| −

1

2

n∑

ℓ=1

zℓ(s)−X(s)β⊤K(s)−1zℓ(s)−X(s)β

Remarque. Numeriquement il sera plus efficace de calculer les formes quadratiques plus haut par laformule

y⊤K(s)−1y = y⊤C(s)C(s)⊤−1y

= y⊤C(s)−⊤C(s)−1y

= x(s)⊤x(s),

ou C(s) est la decomposition de Cholesky de K(s) et x(s) la solution du systeme triangulaireC(s)x(s) = y. De plus |K(s)| = |C(s)|2 =

∏kj=1C(s)2jj.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 62 / 70

DM

Ecrivez une fonction R calculant l’estimateur du maximum de vraisemblance d’un processus Gaussiendefini plus haut.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 63 / 70

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Rappel : Lois gaussiennes conditionnelles

Proposition 7. Soit Z(s, s0) un vecteur Gaussien de Rk×k0 d’esperance µ(s, s0) et matrice de

covariance K(s, s0). Alors

Z(s0) | Z(s) = z(s) ∼ N

µ(s0), K(s0)

,

avec

µ(s0) = µ(s0) +K(s0, s)K(s)−1z(s) − µ(s)

K(s0) = K(s0)−K(s0, s)K(s)−1K(s0, s)⊤,

ou nous avons utilise la decomposition suivante

K(s0, s) =

[

K(s0) K(s0, s)K(s0, s)

⊤ K(s)

]

.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 64 / 70

Lien avec le Krigeage

L’estimateur Z(s0) = EZ(s0) | Z(s) minimise l’erreur quadratique moyenne. Ainsi dans le casgaussien faib. stat.,

Z(s0) = µ(s0) = µ(s0) +K(s− s0)⊤K(s)−1Z(s) − µ(s).

Pour µ(s) = X(s)⊤β, et a covariance connue, on sait que

β = X(s)⊤K(s)−1X(s)−1

X(s)⊤K(s)−1Z(s),

Z(s0) = X(s0)⊤X(s)⊤K(s)−1

X(s)−1X(s)⊤K(s)−1Z(s)+

K(s− s0)⊤K(s)−1

[

Z(s)−X(s)⊤X(s)⊤K(s)−1X(s)−1

X(s)⊤K(s)−1Z(s)]

=(

X(s0)⊤X(s)⊤K(s)−1

X(s)−1X(s)⊤K(s)−1+

K(s− s0)⊤K(s)−1

[

1−X(s)⊤X(s)⊤K(s)−1X(s)−1

X(s)⊤K(s)−1])

Z(s)

=(

X(s0)⊤ −K(s− s0)K(s)−1

X(s)⊤

X(s)⊤K(s)−1X(s)−1

X(s)⊤K(s)−1+

K(s− s0)⊤K(s)−1

)

Z(s).

On retombe sur l’estimateur du krigeage universel !

Geostatistique Mathieu Ribatet – 65 / 70

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Limitation de la vraisemblance

La vraisemblance fait intervenir une decomposition de Cholesky—cout algorithmique O(k3). Ceci restreint son utilisation au cas ou k ≤ 3000. D’autres approches sont possibles lorsque k > 3000 :

– Processus Gaussien avec K(s) creuse ;– Utilisation de vraisemblances composites.

Geostatistique Mathieu Ribatet – 66 / 70

3. Simulations de processus gaussiens 67 / 70

Motivations

Les simulations sont souvent utiles afin d’estimer par ex.

Ψ = T [E Z(·) | Z(s) = z] ,

ou T est une fonctionnelle supposee connue. Puisque le krigeage Z(·) est un estimateur sans biais de EZ(·) | Z(s), si T est lineaire alors

l’estimateur Ψ = TZ(·) verifie

E

(

Ψ)

= T[

EZ(·)]

= T [EZ(·) | Z(s) = z] = Ψ.

Ce n’est plus vrai si T n’est pas lineaire ! Une solution consiste donc a estimer Ψ par desmethodes de type Monte–Carlo.

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Simulations non conditionnelles

Il s’agit ici de simuler selon la loi de Z(s) : s ∈ X. Trois grandes approches :

– Approche directe via une decomposition de Cholesky ;– Approche par matrices circulantes et FFT ;– Approche par bandes tournantes.

Nous allons

Geostatistique Mathieu Ribatet – 69 / 70

Simulations conditionnelles

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