マススペクトルのデータベースを使いこなす

有田正規、Ramon Mejia、津川裕司、福島敦史

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トレンド

metabolomicsgenomics

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metabolomics

proteomics

genomics

all (mil)

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持っていない人も

いますぐポスター会場 P1 に走ろう

植物特化型の理研ベンチャー

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海外動向• BBSRC (UK) … plant & microb. Initiative

• NIH (US) … $51 mil. / 5 years, repository

• EBI (EU) … MetaboLights repository

4

メタボロミクスの教科書

5

メタボロミクスの教科書買うとしたら （ちょっと高い）

6

リソース• 代謝物

– PubChem, ChemSpider, ChEBI, HMDB (human), DrugBank, LipidMaps (lipids), KNApSAcK (2nd)

• パスウェイ– KEGG, BioCyc, WikiPathways,

• 計測データ– MetaboLight (EBI), MassBase (Kazusa), DropMet

(RIKEN)– plantmetabolomics.org, metabolome-

express.org• スペクトル

– MassBank, NIST, METLIN

DATA DOWNLOAD

8

MassBank

146 300159 150188 600205 999

9

MassBank

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PRIMe

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KOMICS-MassBase

12

Golm Metabolome DB

13

METABOLITES

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植物のどこに何がある？実はまだわからない、でもデータはある

http://prime.psc.riken.jp/meko/

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作成中RefSpec インターフェース

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ANALYSIS TOOLS

17

MRMPROBSSoftware for widely-targeted analysis by

Hiroshi Tsugawa

18

Metlin, Xcms

19

TO CONTRIBUTE

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EBI MetaboLights

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結論予稿集の情報をぜひ試してみてください。

連絡先：Masanori.arita@riken.jp

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