Epigenética del cáncer llega a la oncología convencional

Embed Size (px)

Citation preview

Epigentica del cncer llega a la oncologa convencional Manuel Rodrguez-Paredes1 & Manel Esteller13 La epigentica es uno de los campos ms prometedores y expansin en el panorama de la investigacin biomdica actual. Desde el inicio de la epigentica en la dcada de 1940, los descubrimientos en relacin con sus implicaciones en la biologa normal y la enfermedad no han cesado, recopilando una gran cantidad de conocimientos en la ltima dcada. El campo se ha movido desde slo un marcador reconocido, la metilacin del ADN, a una variedad de otros, incluyendo un amplio espectro de modificaciones de las histonas. Desde el punto de vista metodolgico, los exitosos primeros enfoques individuales de genes candidatos han sido complementados con los actuales enfoques integrales epigenmicos que permiten la interrogacin de los genomas para buscar aplicaciones de traduccin en una manera imparcial. Lo ms importante, el descubrimiento de las mutaciones en la maquinaria epigentica y la aprobacin de los primeros frmacos epigenticos para el tratamiento de los subtipos de leucemias y linfomas ha sido una revelacin para muchos cientficos biomdicos y clnicos. Aqu, vamos a resumir los progresos en el campo de la investigacin del cncer de la epigentica, que ha alcanzado la oncologa convencional en el desarrollo de nuevos biomarcadores de la enfermedad y nuevas estrategias farmacolgicas. Introduccin a la epigentica y sus funciones biolgicas Cuando Conrad Waddington acu la epigentica de la palabra (literalmente 'sobre' o 'sobre' la gentica) en la dcada de 1940, el trmino fue utilizado para explicar por qu las variaciones genticas a veces no se ha traducido en variaciones fenotpicas y de cmo los genes pueden interactuar con su entorno para producir un phenotype1. Pero la palabra en la actualidad se refiere especficamente al estudio de mitticamente y / o meiticamente cambios heredables en la expresin gnica que se producen sin cambios en el ADN sequence2. La interrupcin de estos cambios subyace una amplia variedad de patologas, incluyendo cncer3, 4. La regulacin epigentica incluye la metilacin del ADN (Fig. 1) y covalentes modificaciones de las histonas (Fig. 2), y vamos a discutir slo estas dos capas epigenticas aqu. La metilacin del ADN por lo general se lleva a cabo en el 5 posicin del anillo de citosina en los dinucletidos CpG, y su consecuencia es el silenciamiento de los genes y las regiones no codificantes del genoma. Hay tres principales (DNA methyltransferases DNMTs): DNMT1, que mantiene los patrones de metilacin existentes despus de la replicacin del ADN, y Dnmt3a y Dnmt3b, De las enzimas que el objetivo previamente novo unmethylated CpGs5. Sitios CpG se concentran tanto en las islas CpG, cortas ricas en CpG regiones de ADN ubicadas en aproximadamente el 60% de los promotores de genes humanos, o en regiones de grandes secuencias repetitivas (por ejemplo, los centrmeros y los elementos retrotransposon) 5,6. Aunque en este ltimo caso la mayora de los CpGs estn metilados para prevenir La inestabilidad cromosmica, la mayora de las islas CpG permanecen sin modificaciones durante el desarrollo y en tissues7 diferenciada. Sin embargo, ocurre naturalmente la isla CpG metilacin

tiene lugar durante los fenmenos de desarrollo tales como la inactivacin del cromosoma X o genmica imprinting5. La investigacin adicional ser necesaria para aclarar las funciones adicionales de la metilacin del ADN en non. CpG promotores de la isla y en el origen y mantenimiento de pluripotency8, 9. Los recientes hallazgos tambin sugieren que los cambios en el ADN de metilacin extensa causada por la diferenciacin llevarn a cabo en la isla CpG? Eshores? F, las regiones de densidad relativamente baja CpG cercanas a CpG islands10, 11. Adems, casi una cuarta parte de toda la metilacin del ADN encontrado en la madre embrionarias (ES) las clulas se producen en un contexto 12 no CpG. Finalmente, el 5-metilcitosina (5-mC) se puede convertir en 5-hidroximetilcitosina (5-HMC) por el 2-oxoglutarato. y Fe (II)dependientes oxigenasas TET1, TET2 y TET3 (ref. 13). Ser necesario profundizar en el papel de esta modificacin recientemente descrito, que se detect en clulas madre embrionarias y las neuronas de Purkinje y participar en la renovacin celular y auto ES celular interna de embriones la masa. Las histonas pueden sufrir mltiples despus de la traduccin modificaciones 15, que se encuentran principalmente a lo largo de su N-terminal de la cola. Las enzimas que agregar y eliminar las modificaciones que son, respectivamente, acetyltransferases histonas (HAT) y deacetilasas (HDAC y las sirtuinas), metiltransferasas (HMTs) y desmetilasas (HDM), quinasas y fosfatasas, ligasas de ubiquitina y deubiquitinases, ligasas de SUMO y proteasas, y para el 15, 16. En todo el genoma estudios han revelado que varias combinaciones de modificaciones en una regin genmica especfica puede llevar, como un "cdigo de histonas", a un estado ms "abierta" o "cerrado" de la estructura de la cromatina y, por tanto, a la activacin o la represin de gen expression17. Por ejemplo, tri-metilacin de lisinas (K) 4, 36 o 79 en H3 (H3K4me3, H3K36me3 y H3K79me3, respectivamente), monometilacion de H4K20 y H2BK5 (H4K20me y H2BK5me), y la acetilacin de H3K9 y H3K14 (H3K9ac y H3K14ac) dan como resultado la activacin de genes, mientras que el plomo di o trimethylation de H3K9 (H3K9me2 y H3K9me3) y trimethylation de H3K27 (H3K27me3) con el gen repression17- 19. En las clulas madre embrionarias, los principales genes de desarrollo siguen siendo preparado para el linaje especfico de la activacin o la represin como consecuencia de sus dominios bivalentes, una combinacin de dos modificaciones en sus regiones promotoras, H3K4me3 y H3K27me3. Cabe destacar que todos los procesos epigenticos trabajar juntos para establecer y mantener los estados de la cromatina a nivel mundial y local, condensados o decondensed que finalmente determinan la expresin de genes. La interaccin continua de todos estos procesos crea lo que Waddington llamado el "paisaje epigentico" y que hoy llamamos el "epigenome'-el estado epigentico que determina la forma en que un genoma eucaritico solo puede manifestarse en diferentes tipos celulares y etapas de desarrollo y que, si aberrante, da lugar al cncer y otras enfermedades.

Figura 1 los patrones de metilacin de ADN en las clulas normales y cancerosas. Metilacin del ADN se lleva a cabo a lo largo de todo el genoma, y su alteracin es una caracterstica tpica de cncer. (a) En las clulas normales (arriba), las islas CpG y las costas de la isla CpG no metiladas por lo general permanecen, lo que permite la transcripcin de genes. Adems, la metilacin del ADN en los organismos de genes evita falsos iniciaciones de transcripcin. En las clulas cancerosas (abajo), por el contrario, si bien ambas islas CpG y costas de la isla CpG pueden ser muy metilado, los organismos de genes carecen de esta modificacin. Como resultado, la transcripcin de muchos genes se bloquea, y la transcripcin aberrante puede producirse a partir incorrectos sitios de inicio de transcripcin (DST). (b) En las clulas normales (arriba), la metilacin de secuencias repetitivas evita la inestabilidad genmica y, de nuevo, la iniciacin de la transcripcin espurios. Adems, los elementos transponibles no se puede activar en un entorno metilado. En las clulas cancerosas (abajo), hipometilacin global provoca la inestabilidad genmica y la iniciacin de la transcripcin aberrante. La activacin simultnea de los transposones pueden llevar a una alteracin gentica.

Las modificaciones epigenticas en el cncer El cncer y otras muchas enfermedades humanas muestran regulation21 epigentica aberrante. En particular, el epigenoma del cncer se caracteriza por los cambios globales en la metilacin del ADN y la alteracin de los patrones de modificacin de las histonas. Debido a las caractersticas tpicas, tales como la hipometilacin del ADN a nivel mundial y promotor especfico de la hipermetilacin puede ser comnmente observada en neoplasias benignas y tumores en etapa temprana, se hace evidente que la desregulacin epigentica puede preceder a clsicos eventos preliminares de transformacin: las mutaciones en los supresores de tumores, los protooncogenes, o ambos, y instability22 genmica. La alteracin de los mecanismos epigenticos, ya sea por mutacin, la eliminacin o la alteracin de la expresin de cualquiera de sus componentes, se sabe que provocan patrones aberrantes de expresin de genes que dan lugar a todos los tpicos cnceres de caractersticas 3. De hecho, estos 'epimutaciones est a veces el segundo golpe para la iniciacin del cncer postulado por el modelo de dos hits, ya que puede silenciar el alelo restante activo del tumor previamente mutado suppressors. En trminos de la metilacin del ADN, las clulas cancerosas muestran todo el genoma y la hipometilacin del sitio especfico de la isla CpG promotor de hypermethylation3. Adems, un estudio reciente que compar el tejido del cncer colorrectal con su contraparte normal, tambin

sugiere cambios importantes en el shores24 isla CpG (Fig. 1). Hipometilacin del ADN se produce en muchas secuencias genmicas, como elementos repetitivos, retrotransposones, intrones y similares, dando lugar a instability3 genmica. En secuencias de repeticin, esto se logra mediante una mayor tasa de reordenamientos cromosmicos y, en retrotransposones, por una mayor probabilidad de translocacin a otro genmico regions25-27. Adems, hipometilacin ADN aberrante tambin puede dar cuenta de la activacin de algunos protooncogenes y conducir a la prdida de sellado, como en el caso del gen IGF2 (codificacin similar a la insulina factor de crecimiento-2) en Wilms de tumor28-30. Sin embargo, la alteracin epigentica ms reconocida en los tumores humanos es el promotor isla CpG hipermetilacin asociada con el silenciamiento de genes supresores de tumores como el gen CDKN2A (dependiente de ciclina 2A inhibidor de la cinasa), MLH1 (homlogo mutL-1), el BRCA1 (cncer de mama asociado- 1) y VHL (von HippelLindau supresor tumoral) 3,4, una observacin que se ha expandido a travs del estudio de la inactivacin de microRNAs con caractersticas inhibidoras del crecimiento por silencing31-34. La alteracin del paisaje metilacin del ADN en las clulas transformadas se ha apoyado recientemente por el hallazgo de mutaciones somticas en DNMT3A en la leucemia mieloide aguda (LMA) 35. Por ltimo, como MLL TET1 (MLL es la leucemia mieloide / linfoide o mixta de linaje (homlogo trithorax, Drosophila) de genes) fusiones se han observado en algunos casos de leucemia mielgena aguda y linfoctica leukemias36, de 37 aos, y las mutaciones homocigotas nulas y deleciones cromosmicas que implican el TET2 lugar se han descrito en diversas mieloide malignancies38, 39, el deterioro de la conversin de 5-mC en 5-HMC tambin podra estar relacionado con el cncer.

Figura 2 patrones de modificacin de las histonas en clulas normales y cancerosas. Principalmente a lo largo de sus protuberantes Nterminal de la cola, sino tambin dentro de su C-terminal regiones, las histonas pueden sufrir diversas modificaciones posttraduccionales. En el derecho de combinacin y traducido por los efectores apropiados, estas modificaciones contribuir al establecimiento de los estados de la cromatina a nivel mundial y local, condensados o decondensed que finalmente determinan la expresin de genes. Esta figura representa las modificaciones principales de las cuatro histonas en clulas normales (tipo y la posicin en la secuencia de aminocidos). Por otra parte, y debido a la interrupcin de sus patrones normales se relaciona con el cncer, las modificaciones de histonas tpicamente asociados con la enfermedad tambin se han sealado. Ac, acetilacin, Me, la metil acin; P, la fosforilacin, Ub, ubiquitinacin.

La alteracin de los patrones normales de covalentes modificaciones de las histonas es otro rasgo distintivo del cncer (Fig. 2) 40,41. Uno de los ejemplos ms caractersticos es la reduccin global de la trimethylation de H4K20 (H4K20me3) y la acetilacin de H4K16 (H4K16Ac), junto con la hipometilacin del ADN en secuencias repetidas en muchas escuelas primarias tumors40. Por otra parte, hay muchos ejemplos de alteraciones en las enzimas que agregar, quitar o reconocer las modificaciones especficas en tipos especficos de cncer (Fig. 3). En cuanto a la acetilacin de histonas, translocaciones cromosmicas que implican HAT como E1Aprotena de unin p300 (EP300), la respuesta de AMPc elemento de unin a la protena de unin (CREBBP), receptor nuclear coactivador-2 (NCOA2), MYST3 y MYST4 han sido identificados en hematolgica cancers42, 43 . En los cnceres hematolgicos y slidos, la unin de adenoviral E1A oncoprotenas y T de SV40 de EP300 y CREBBP conduce a la transformacin celular a travs de hypoacetylation global de H3K18 y la activacin simultnea de los genes que promueven el crecimiento celular y division44, de 45 aos. Por ltimo, mientras que colorrectal, de mama gstrico y los tumores pancreticos presentan mutaciones missense de EP300, la prdida de monoallica KAT5 (codificacin de lisina acetil-5) aumenta el potencial de malignidad transformation46, de 47 aos. La sobreexpresin de HDAC individuales, tales como HDAC1, HDAC2 y HDAC6, entre otros, tambin ha sido reportada en tumors48. Pero el papel de HDAC2 en la promocin tumoral es objeto de controversia, como la prdida de su expresin debido a mutaciones truncar tambin se ha documentado en un subgrupo de microsatlites inestables lneas celulares de colon y tumor primario samples49.

Figura 3 La seleccin de genes epigenticos alterados en los tumores humanos. La mutacin, supresin y / o alteraciones en la expresin de genes que codifican los componentes de los mecanismos epigenticos diferentes se observan tpicamente en los tumores humanos. La figura muestra una seleccin de genes que codifican enzimas que agregar, quitar y reconocer las modificaciones de histonas, as como los miembros de la maquinaria de metilacin del ADN, cuya desregulacin est conectado con el cncer. CRC, la cromatina complejos de remodelacin, AC, acetilacin, Me, metilacin.

Sirtuinas tambin se sobreexpresa en una amplia variedad de tumors50. Curiosamente, la inhibicin de la SIRT1 reactivadas parcialmente supresores de tumor, aun cuando sus promotores se mantuvo en gran medida methylated51. La expresin anmala o la actividad de HMTs y HDMS, debido a translocaciones cromosmicas, amplificacin, eliminacin, la sobreexpresin o silenciamiento, tambin ha sido reportado en el cncer. En el caso del gen MLL, que codifica el ms estudiado H3K4 HMT, su duplicacin en tndem parcial (MLL-PTD) y ms de 50 fusiones de genes en cuenta el 80% de las leucemias infantiles, y el 5-10% de la LMA en adultos y leukemias52 linfocitos . Muchas fusiones MLL parece activar los genes promotores de leucemia por el reclutamiento anormal de DOT1L, el HMT no-SETdominio para H3K79 (ref. 53). SMYD3, otro HMT H3K4, es con frecuencia upregulated en el cncer y las lneas celulares de carcinoma hepatocelular, en los que aumenta el crecimiento celular y promueve la transformation54. El H3K27 especficos HMT EZH2 est sobreexpresada en tumores slidos como el de prstata, mama, colon, piel y pulmn cancer55. En particular, el aumento de la expresin EZH2 endotelial promueve la angiognesis por silenciar el gen que codifica vasohibin-1, al menos en los ovarios cancer56. Aunque su funcin oncognica ha sido el foco de atencin principal, descubrimientos recientes muestran tambin la inactivacin de las mutaciones de EZH2 en el folicular y linfoma difuso de clulas B grandes lymphomas53, de 57 aos. Otras enzimas modificadoras tambin tienen un papel en el cncer. Nuclear de unin al receptor de dominio SET protena-1 (NSD1), una de HMT H3K36 y, en menor medida, por H4K20, est implicado en la translocacin leucomognico y es silenciado por la hipermetilacin del promotor en los gliomas y los neuroblastomas, y su mutacin heterocigota o prdida de heterocigosidad provoca un sndrome de sobrecrecimiento infantil con un mayor riesgo de tumorognesis llama syndrome58 Sotos, de 59 aos. Por el contrario, los datos recientes ponen de relieve el papel de HDM en el cncer. Curiosamente, ambas mutaciones sobreexpresin y la prdida de la funcin-de varios miembros de la familia Jumonji / ARID de dominio que contienen la protena-1 (JARID1) de H3K4me3 / 2 HDM se cree que contribuye a la tumorignesis en diversos tipos de cncer. Biomarcadores epigenticos en los individuos con cncer La metilacin del ADN y las histonas patrones de modificacin asociado con el desarrollo y progresin del cncer tiene un posible uso clnico. Las tres principales reas de oncologa clnica potencialmente se pueden beneficiar de la metilacin de ADN basados en biomarcadores: deteccin de cncer, el pronstico del tumor y la prediccin de la respuesta al tratamiento, un campo conocido como farmacogenetica (Fig. 4). La deteccin de clulas tumorales. Los ltimos diez aos han proporcionado un amplio mapa de los eventos de la metilacin aberrante del ADN que ocurren en las clulas del cncer, en especial para las islas CpG hipermetilados de supresor de tumores genes3, de 60 aos. Estos datos incluyen ejemplos de todas las clases de neoplasias humanas y se han puesto de relieve la existencia de un perfil nico de las islas CpG hipermetilados que define cada tumor type61, de 62 aos. El nfasis ahora est en centrarse en los eventos de metilacin aberrante que estn ausentes en las clulas normales y las tcnicas de desarrollo que ofrecen resultados fiables, sensibles y rpidos para

estudiar estos biomarcadores potenciales. Los recientes avances en las tecnologas que la modificacin par bisulfito de ADN con PCR63 han sido clave en el desarrollo de estos mtodos moleculares rpidos y cuantitativos. Recientemente, CpG hipermetilacin isla se ha utilizado como una herramienta para detectar clulas cancerosas en diversos tipos de fluidos biolgicos y tejidos biopsies63, 64. As, desde que fue mostrado por primera vez que el cncer de eventos especficos de hipermetilacin se pudo detectar en el suero de individuos con cancer65, una mirada de estudios han utilizado este material biolgico fcilmente accesible en la configuracin translacional y clnica. Buenos ejemplos son la deteccin de eventos especficos de hipermetilacin del cncer en las heces de los individuos con cncer colorrectal cancer66, en la orina para el cncer de vejiga screening67 o en el esputo para predecir el cncer de pulmn incidence68. Por otra parte, las nuevas tcnicas de gran alcance ahora puede detectar incluso cantidades mnimas de ADN aberrante methylation69, de 70 aos.

Figura 4 biomarcadores epigenticos en oncologa. De todos los tipos de muestras obtenidas de individuos con cncer, exmenes epigenticos nica y global, se han desarrollado para la identificacin de nuevos marcadores moleculares para controlar la enfermedad. Para predecir la malignidad en la tumorignesis de prstata y la respuesta a temozolomida en gliomas, el estudio de los eventos de hipermetilacin de GSTP1 y MGMT, respectivamente, est llegando a la etapa clnica.

Numerosos estudios han demostrado que la hipermetilacin del promotor CpG isla de genes supresores de tumores se produce a principios de la tumorignesis. Por lo tanto, la presencia de metilacin aberrante isla CpG por s solo no indica necesariamente un cncer invasivo, como lesiones premalignas o un precursor tambin puede llevar a estas firmas epigenticos. Este hallazgo tiene implicaciones para la deteccin temprana del cncer, especialmente en personas con riesgo gentico hereditario (por ejemplo, los portadores de mutaciones BRCA1 y BRCA2) o expuestas al medio ambiente cancergeno. Uno de los mejores ejemplos de esto es la deteccin de eventos aberrantes de metilacin del ADN en las primeras etapas de la tumorignesis de pulmn que afecta a los fumadores y miners71.

Sin lugar a dudas el mejor marcador de la metilacin del ADN para la deteccin de cncer, y los ms propensos a tener xito como un biomarcador epigentico, es la hipermetilacin de la glutatin S-transferasa gen (GSTP1) en la prstata cancer72. GSTP1 es hypermethylated en el 8090% de los hombres con cncer de prstata y, en menor porcentaje, en otros tipos de tumores, como el hgado, de mama y kidney73. Lo ms importante, aunque se hypermethylated en una fraccin de intraepitelial neoplasias74 prstata, no es en benigna de prstata hiperplsica tissue75. Por lo tanto, la deteccin de metilacin de GSTP1 puede ayudar a distinguir entre el cncer de prstata y lesiones benignas. Como se seal anteriormente, la hipermetilacin de islas CpG puede ser detectada en los fluidos biolgicos y muestras de biopsia, lo que sugiere que la deteccin de hipermetilacin de GSTP1 urine76, 77 y serum78, de 79 aos tiene excelentes perspectivas de aplicacin clnica. Establecimiento del pronstico del tumor. Una vieja aspiracin de los mdicos es la capacidad de tener en cuenta dos tumores morfolgicamente idnticas y distinguir cul crecer a un ritmo rpido y que se har con un comportamiento ms indolente. Los datos moleculares de estos estudios se utiliza rutinariamente para la deteccin de neoplasias hematolgicas a travs de la presencia de determinadas anomalas cariotpicas y ciertas protenas de fusin oncognico. Adems, los resultados prometedores utilizando estandarizados arrays de expresin gnica para el establecimiento del pronstico tambin estn empezando a surgir en el pecho de cancer80. Por lo tanto, es lgico que ciertas firmas aberrantes de metilacin de ADN tambin puede ser til para este propsito. La investigacin en la ltima dcada se ha producido un nmero creciente de eventos hipermetilacin en los loci de genes individuales que indican los resultados en personas con cncer. Por ejemplo, la hipermetilacin de los genes que codifican la HMT NSD1, la protena asociada a la muerte DAPK quinasa, la protena de membrana epitelial-3 y CDKN2A se ha relacionado con malos resultados en el neuroblastoma y el cncer de pulmn, cerebro y colon y recto, respectivamente3. Ms grande multicntrico y los estudios prospectivos son necesarios para validar estas y otras de un solo gen marcadores de metilacin de ADN. En los ltimos aos ha habido un nmero cada vez mayor de la metilacin del ADN a nivel mundial se aproxima dedicada a lograr el objetivo de identificar las caractersticas aberrantes de metilacin. Epigenomics revela dendrogramas pronsticos, similares a los obtenidos por anlisis de microarrays de genes de expresin, donde una combinacin de marcadores aberrantes de metilacin del ADN a partir de matrices CpG es used81, de 82 aos. Estos perfiles epigenmicos son complementarios a los patrones de expresin de genes y tienen la ventaja de que pueden ser desarrollados con el ADN extrado de archivado de material. Lo ms importante, marcadores individuales con gran potencial clnico, como predictores de recurrencia en el pulmn, metstasis en cancer83 colorrectal cancer84 o la progresin del virus asociado a neoplasms85, pueden ser identificados a partir de estas pruebas de deteccin de metilacin de ADN globales. Histona basados en marcadores tambin se han incorporado ms adelante en esta carrera molecular de biomarcadores epigenticos, y un deterioro particular de las modificaciones de histonas se ha asociado con la recurrencia del cncer de prstata cancer41.

Farmacogenetica. El desenmascaramiento reciente de lesiones genticas en los tumores ha permitido optimizar los regmenes de tratamiento del cncer, especficamente con la identificacin de la presencia de ErbB2 (v-erb-B2 eritroblstica la leucemia viral oncogn homlogo 2) amplificaciones, BCR-ABL1 (breakpoint cluster regin-c-abl 1-oncogn) translocaciones y mutaciones del EGFR (receptor del factor de crecimiento epidrmico). Se prev que, en los prximos aos, los patrones de hipermetilacin de los genes particulares tambin predecir la respuesta a tratamientos especficos. Los candidatos epigenticos ms prometedoras para predecir la respuesta pharmacoepigenetic son los genes de reparacin del ADN se someten a la inactivacin epigentica de los tumores, tales como la O6-metilguanina-ADN metiltransferasa gen que codifica, MGMT, el desajuste de reparacin del ADN en protenas gen que codifica, MLH1, el sndrome de Werner-gen asociado, ABN, o BRCA1. En los tejidos sanos, estas enzimas son responsables de la reparacin del dao en el DNA que se produce durante un tiempo de vida y prevenir la formacin de mutaciones y otros tipos de dao genmico. En las clulas cancerosas, sin embargo, estas enzimas pueden reparar el dao del ADN inducido por agentes de la quimioterapia muchos, por lo tanto la generacin de quimio-resistencia. Sin embargo, estos genes de reparacin del ADN tambin pueden someterse a la hipermetilacin asociada silenciamiento en una fraccin de los tumores humanos que el progreso con un fenotipo mutador, un taln de Aquiles, porque de esta manera no ser capaz de reparar el dao del ADN causado por el agente de quimioterapia. Hasta la fecha, el mejor ejemplo de la hipermetilacin del gen de reparacin del ADN que ha llegado a la clnica es la del gen MGMT en gliomas, como un predictor de respuesta a carmustine86 y temozolomide87, de 88 aos. MGMT invierte la adicin de grupos alquilo a las bases de guanina del ADN y, en las clulas normales, protege el ADN contra la generacin de mutaciones de transicin por agentes carcingenos tales como nitrosamides. La posicin O6 de la guanina es tambin un punto de ataque de los agentes alquilantes como la carmustina (BCNU), nemustine (ACNU), procarbazina, dacarbazina y temozolomida. Por lo tanto, los tumores humanos primarios sometidos a la hipermetilacin de MGMT89 podra ser ms sensibles a esta categora de medicamentos. La prueba de principio de estas observaciones es que la hipermetilacin isla CpG de MGMT es un predictor independiente de buena respuesta clnica a la carmustina en gliomas86. Estos descubrimientos se han ampliado posteriormente para mostrar que la hipermetilacin de este gen es tambin un predictor independiente de la respuesta a la temozolomida, un nuevo frmaco, en glioblastomas87. Muchos estudios han confirmado estos resultados sobre el tratamiento del glioblastoma basada en la temozolomida en muchos areas90 geogrfica diferente. Es tambin digno de mencin que la metilacin de MGMT podra denominar a los casos de glioma raras clasificadas como a largo plazo survivors91 y predecir las respuestas de cooperacin con otros agentes teraputicos, tales como cilengitide92 o incluso radiation93. Por el contrario, la hipermetilacin de MGMT en temozolomida-pacientes no tratados es un marcador de mal pronstico, y es probable que est relacionado con la acumulacin de mutaciones en estos tumores. De hecho, un fenotipo hypermutator consecuente a la deficiencia de los genes de reparacin se produce en temozolomida tratada glioblastomas94. Cuatro cuestiones finales relacionadas con MGMT inactivacin epigentica y digna de mayor exploracin son la ampliacin

del valor de la hipermetilacin de MGMT predictor para la temozolomida que otros tipos de cncer como pituitary95 agresiva, los tumores colorrectales y de pulmn de clulas no pequeas-, la revisin de los datos de ensayos clnicos utilizando temozolomida en tumores donde hay metilacin CpG isla muy poco de MGMT, tales como melanoma; la expansin de la metilacin de MGMT para predecir la respuesta a otros tipos de dao en el DNA, tales como aquellas mediadas por cyclophosphamide96; y la posibilidad de utilizar pequeas molculas como inactivadores de la protena MGMT en la isla CpG unmethylated tumors97.Figura 5 frmacos epigenticos para el tratamiento del cncer. Numerosos compuestos han sido reportados para ser eficaz contra las clulas cancerosas de los componentes de inhibicin de los mecanismos epigenticos. Esta figura muestra los frmacos epigenticos ms importantes clasificados en funcin de sus objetivos particulares epigenticos.

La posibilidad de utilizar el estado de metilacin de CpG isla para predecir la respuesta a la quimioterapia se ha descrito para otros genes de reparacin del ADN, como MLH1 en el tratamiento de cncer de ovario cancer98 cisplatino, WRN de irinotecn en cncer colorrectal tumors99, similar a la insulina factor de crecimiento de unin la protena-3 para el cisplatino en el pulmn y BRCA1 tumors100 de PARP (poli (ADP) ribosa polimerasa), los inhibidores de mama cancer101. Otras familias de genes que se someten a la hipermetilacin de islas CpG silenciamiento asociados y tienen un valor potencial como factores predictivos de respuesta a los agentes contra el cncer son los genes del ciclo celular, tales como puntos de control CHFR (puesto de control con forkhead asociada y el dedo anular), en relacin con docetaxel/paclitaxel102, 103, genes de metabolitos de transporte, tales como SLC19A1 ( soluto transportista familia 19 (transportador de folato), miembro 1), en relacin con el metotrexato en lymphomas104, y el GSTP1 (glutatin S-transferasa pi 1) de genes, relacionados con la doxorubicina en el pecho de cancer105. Por ltimo, es importante tener en cuenta que la falta de efectividad de los frmacos antisteroidal como el tamoxifeno, el raloxifeno y flutemide en algunos individuos con la hormona relacionada con tumores malignos pueden ser una consecuencia directa del silenciamiento epigentico de sus respectivos receptores celulares, tales como la estrgeno y la progesterona

receptors106. Una explicacin similar se puede aplicar a la falta de xito con el tratamiento preventivo retinoide, que podra estar relacionada con el silenciamiento epigentico del gen que codifica del receptor de cido retinoico, RARB2, y el gen que codifica la protena de unin celular retinol I, CRBP1. Con la epigenmico emergente technologies107, los investigadores tienen ahora las tcnicas que ayudarn a solucionar los perfiles de metilacin de ADN para la quimiosensibilidad de una manera imparcial, como se ha desarrollado en los ovarios cancer108, y completar el paisaje pharmacoepigenetics prometedor. Curiosamente, el uso de frmacos epigenticos, tales como agentes demethylating ADN, podra resensitize algunas de las clulas cancerosas resistentes a la quimioterapia clsica agents109, la conclusin de que es digno de una exploracin ms profunda. Medicamentos epigenticos para el tratamiento del cncer Como se describi anteriormente, y en contraste con las mutaciones genticas, epimutaciones son reversibles. Esta es la razn por tanta atencin se ha centrado en los ltimos aos en la bsqueda de frmacos epigenticos, lo que podra restaurar el paisaje normal epigenticos en las clulas cancerosas inhibiendo las enzimas de los mecanismos epigenticos (Fig. 5). Hasta la fecha, cuatro han sido aprobados por los EE.UU. Food and Drug Administration (FDA) para el tratamiento del cncer: dos inhibidores de la DNMT, Vidaza y decitabina (5-aza-y 5-aza-2'-desoxicitidina, respectivamente), para los pacientes con mielodisplsico el sndrome de que tienen pocas opciones teraputicas y desarrollar leucemia aguda, y dos inhibidores de la HDAC, vorinostat y romidepsin (cido hidroxmico suberoilanilida y, antes, FK-228, respectivamente), por el raro linfoma cutneo de clulas T (LCCT), entre otros-hematolgica malignancies110 113. Adems de los inhibidores de HDAC DNMT e inhibidores, inhibidores de la clase I, II y IV de las HDAC, los inhibidores de las sirtuinas (las HDAC clase III), sombreros, HMTs, HDM y varias quinasas tambin estn siendo intensamente investigado. Estos frmacos epigenticos se convertir en una parte crucial del arsenal teraputico contra el cncer en un futuro prximo. ensayos en combinacin con otros agentes para el tratamiento de diversas tumors114. Los efectos sobre la transcripcin de genes no slo de Vidaza y decitabina, sino tambin Zebularine, otro anlogo de la citidina, son sorprendentemente diferentes y afectan a genes de inters para leukemogenesis115. Algunos anlogos de nuclesidos tambin han sido descritos como la induccin de desmetilacin del ADN en clulas de cncer lines116-120. El arsenal de los inhibidores de HDAC incluye compuestos naturales y sintticos que se pueden dividir en cuatro clases qumicamente distintas: de cadena corta de cidos grasos, cidos hidroxmicos, pptidos cclicos y sus derivados de benzamida. Todos los inhibidores de HDAC se caracterizan por la presencia de un dominio de unin a metal que puede bloquear sustrato-Zn quelacin en los sitios activos HDAC. Esta es la razn por sirtuinas, que, en contraste, requieren NAD + en sus sitios activos, no se ven afectados por estos inhibitors121. Los principales efectos anticancergenos de los inhibidores de HDAC estn detencin del ciclo celular en G1 o G2-M, la induccin de la diferenciacin y la apoptosis, pero tambin pueden inhibir la angiognesis y la metstasis, as como mejorar la sensibilidad a chemotherapy122, 123. Un resumen de los inhibidores de HDAC ms importantes se muestran en la Tabla 1.

Inhibidores de la HDAC y los inhibidores de DNMT son el cncer ms ampliamente estudiado frmacos epigenticos. Inhibidores de SIRT estn menos estudiados, pero como la mayora de ellos son inhibidores de la SIRT1, es probable que se detenga la formacin de tumores e inducir la apoptosis mediante la actividad de p53 en aumento. Inmediatamente antes de la nicotinamida se inform de que un inhibidor fisiolgico de las sirtuinas, sirtinol y splitomicin fueron descritos como SIRT inhibitors124-126. Sirtinol inhibe SIRT1 y SIRT2, es capaz de la promocin de detencin del crecimiento en el cncer de cells127 y aumenta la sensibilidad a los conocidos medicamentos contra el cncer como la camptotecina y cisplatin128. Sin embargo, algunos anlogos sirtinol ya han demostrado mayores capacidades. Cambinol y salermide son otros inhibidores de SIRT. Cambinol inhibe la SIRT1 y SIRT2, induccin de apoptosis en BCL6 que expresan el linfoma de Burkitt cells129. Por el contrario, salermide, un inhibidor de la SIRT1 y SIRT2 a nivel micromolar, se ha descubierto recientemente para inducir la apoptosis independiente de p53 slo en las clulas cancerosas. Salermide ha demostrado que la reactivacin de los genes pro-apoptticos epigenticamente reprimidos por la SIRT1 mediada H4K16Ac deacetylation130. Finalmente, tenovins, tales como tenovin-1 y la ms soluble en agua tenovin 6-, son activos contra SIRT1 y SIRT2. Ellos trabajan en clulas de mamfero en un solo dgito concentraciones micromolar y retrasar el crecimiento del tumor in vivo como nica agents131. Tres de origen natural pequeas molculas han sido descritos como inhibidores de HAT: curcumina, cido garcinol y anacardic. La curcumina es un inhibidor de la EP300 y CREBBP especfica, capaz de reprimir EP300 mediada por acetilacin de p53 en vivo132. Sus actividades antitumorales en una amplia variedad de cnceres incluyen la regulacin a la baja y la regulacin positiva de CCND1 (ciclina D1) y CASP8 (caspasa-8), respectivamente, as como la inhibicin de la constitutiva del factor nuclear-EB activation133-135. cido garcinol y anacardic son EP300 y los inhibidores de KAT2B HAT. A pesar de garcinol tiene una permeabilidad mucho mejor celular que el cido anacardic, ambos puede mejorar la terapia del cncer. As, mientras que garcinol se ha demostrado que induce apoptosis en clulas HeLa, cido anacardic pueden sensibilizar a las clulas cancerosas a ionizante radiation136, 137. Algunos otras molculas pequeas se han descrito como inhibidores de sombrero, pero, hasta la fecha, slo una serie de isotiazolonas que afectan EP300 y la actividad KAT2B han sido capaces de inhibir el crecimiento en el colon y el cncer de ovario cells138. En cuanto a los inhibidores de HMT, slo tres compuestos han sido descritos como inhibidores de la lisina HMT: quetocina, DZNep y BIX 01.294. En primer lugar identificado como un inhibidor de HMT lisina-especfica de Drosophila melanogaster Su (var) 3-9, quetocina tambin inhibe su homlogo humano, y muestra las propiedades contra el cncer contra el mieloma mltiple (MM) 139140. DZNep induce la apoptosis en el cncer de mama y colorrectal MCF7 clulas HCT116, en la que promueve el agotamiento de los Polycombrepresivas compleja-2 de protenas (por ejemplo, EZH2) e inhibe la metilacin de la H3K27 modification141. Adems, el inhibidor de la arginina-especfica HMT IAM-1 (arginina Nmetiltransferasa inhibidor-1) se cree que inhibe PRMT1, PRMT3, PRMT4 y PRMT6 (ref. 142). El hecho de que PRMT4 est sobreexpresada en cnceres hormono-dependientes puede fomentar la

investigacin sobre estos casos particulares, inhibitors143. Debido a las similitudes estructurales, los anlogos de la AMI-1 derivado de AMI-5 puede inhibir no slo HMTs lisina y arginina especficos, sino tambin sombreros y algunos sirtuinas con la misma potencia, dando lugar a mltiples ligands'144 epigentica de la expresin ". Con respecto a los inhibidores de HDM, sabemos que los inhibidores de la monoamina oxidasas (IMAO), tales como pargilina, fenelzina y tranilcipromina, tambin puede inhibir la KDM1A HDM, pero en la actualidad no hay informacin sobre su supuesta properties145 contra el cncer. El aumento del arsenal de HDM en contra de los inhibidores de la HDM muchos implicados en el cncer ser una tarea importante en los prximos aos. Una cantidad creciente de pruebas que vinculan a la regulacin epigentica quinasas, y los avances importantes que se llevan a cabo en el campo de los inhibidores de la cinasa. As, la quinasa de tirosina JAK2 se ha informado que fosforilan H3Y41, impidiendo la H3K9me2 / 3 'lector' CBX5 de unin a chromatin146. Adems, Aurora quinasa B, que fosforila H3S10, manteniendo as la estabilidad cromosmica durante la mitosis, se ha encontrado que se sobreexpresa en diversos slido humana tumors147, 148. Tambin se han descubierto recientemente que, junto con Aurora quinasa A, es esencial para la progresin de Myc impulsada Clulas B lymphomas149. Un nmero considerable de aurora inhibidores de la cinasa se estn estudiando en ensayos clnicos. Danusertib (o PHA-739358) y MLN8237, actualmente en la fase 2, son los ms promising147, 150.151. Finalmente, el uso de inhibidores de HDAC en conjuncin con los inhibidores de tirosina quinasa, como AEE788 y mesilato de imatinib se encontr que era eficaz contra varios tipos de cncer cells152, 153. Terapias futuras del cncer seguramente explotar los efectos sinrgicos entre los frmacos epigenticos o entre frmacos epigenticos y otros agentes antitumorales. Un trabajo reciente se conecta la aparicin de resistencia de las clulas cancerosas a la erlotinib agente quimioteraputico con un incremento en la expresin de la KDM5 HDM (ref. 154). Por otra parte, tambin parece claro que los frmacos epigenticos, como los inhibidores de HDAC debe estar en sinergia con el ADN de los agentes nocivos, ya que pueden ofrecer un mejor acceso a la cromatina. Relevantes frmacos quimioteraputicos ya han sido probados en combinacin con inhibidores de la DNMT, los inhibidores de HDAC e inhibidores de SIRT. Por ejemplo, un reciente fase 2 estudio combin el romiplostim trombopoyetina mimtico con 5-azacitidina en pacientes con mielodisplsico syndrome155. En otros ejemplos de alianza exitosa, romidepsin era capaz de aumentar el efecto de la gemcitabina en refractario a las hormonas y el cncer de prstata cells156 sirtinol se observ para aumentar la sensibilidad a la camptotecina y cisplatino en el cncer de prstata PC3 cells128. Numerosos ensayos clnicos la combinacin de inhibidores de la HDAC y los inhibidores de DNMT ya han tenido lugar too157, 158. Finalmente, se ha demostrado que panobinostat o cido anacardic puede mejorar radiotherapy137, 159. En un futuro prximo, las combinaciones entre los frmacos epigenticos y dependientes de ciclina inhibidores de la cinasa, antagonistas o inhibidores del proteasoma HSP90AA1 Tambin se pondr a prueba. Otras

combinaciones interesantes de ingeniera puede implicar factores de transcripcin capaces de reactivar de forma selectiva epigenetically silenciado tumor suppressors160. Otro de los retos en la combinacin de diferentes agentes contra el cncer es determinar la mejor secuencia de su entrega. Se ha demostrado in vitro y en modelos de xenoinjerto que una combinacin de valproato con un inhibidor de la topoisomerasa II era slo el cncer eficaz inductora de muerte celular si se administr valproato first161. Notablemente, la eficacia teraputica de cualquier frmaco antitumoral es altamente dependiente de su captacin celular. Esto podra proporcionar una explicacin para la observacin clsica de que las tasas de respuesta clnica a los medicamentos epigenticos son generalmente bajos en los tumores slidos. En el caso particular de 5-azacitidina, que depende de los transportadores de nuclesidos variablemente expresadas para la absorcin, se ha observado recientemente que su entrega por esterificacin de cido eladico puede incrementar notablemente su activity162 anticanceroso. Por lo tanto, la investigacin sobre los mecanismos de captacin celular de diferentes frmacos epigenticos se requiere para mejorar las terapias epigenticas del cncer. Las perspectivas de futuro Ya hemos entrado en la era epigenmica. En los ltimos aos, el uso de las nuevas tecnologas de alto rendimiento ha hecho posible estudiar los procesos epigenticos a un nivel mucho ms amplio que un solo gen. Ahora, por ejemplo, el tratamiento de bisulfito de ADN metilado (methylC-ss) o su inmunoprecipitacin con anticuerpos contra citosina metilada (MeDIP-ss) combinado con secuenciacin de prxima generacin permite la investigacin del estado de metilacin del ADN de clulas humanas en el nucletido resolution12, 163 . Adems, inmunoprecipitacin de la cromatina seguido por los modernos de alta densidad de microarrays o, de nuevo, secuenciacin de prxima generacin (chip-chip chip y siguientes, respectivamente) puede determinar con precisin la ubicacin de las diferentes modificaciones covalentes de histonas a nivel mundial. Con estas ltimas tcnicas, la bsqueda de la ubicacin en todo el genoma de cualquier miembro de los mecanismos epigenticos tambin es posible. Este tipo de enfoque epigenmico ya est revolucionando la investigacin del cncer, y, por supuesto, algunos ejemplos ya se han incluido en este review10-12, 18,20. La integracin de estos datos con la informacin procedente de la genmica y transcriptmica de manera exponencial se ampliar la comprensin de la tumorignesis y dar mejores biomarcadores epigenticos para la deteccin, pronstico y La terapia de prediccin. Por ltimo, en el uso de frmacos epigenticos para el tratamiento del cncer, se requiere para promover el conocimiento de las cuestiones clave, tales como las dosis ptimas para las terapias individuales y combinadas, la secuencia de la entrega de terapias combinadas y la captacin tumoral de las terapias. Por otra parte, y teniendo en cuenta que los efectos de la mayora de los

medicamentos an son tan inespecficos que puede ser un arma de doble filo, causando efectos secundarios no deseados, ser necesario el diseo de nuevos agentes contra enzimas especficas de la maquinaria epigentica, en lugar de mundial procesos. En una era de una medicina cada vez ms precisa y personalizada, nuevos frmacos epigenticos podran desarrollarse incluso en contra de las distintas isoformas o variantes mutadas de determinadas enzimas que participan en tipos muy especficos de cncer.