JAN17
BIOLOGI MOLEKULERLAPORAN RESMIPRAKTIKUM BIOLOGI
MOLEKULERP2ANALISIS GEN DAN HEMOLOGI PROTEINTujuan1.Mampu melakukan
analisis terhadap ekspresi gen dan dapat mendeteksi hasil ekspresi
gen.2.Dapat mencari homologi gen penghasil protein tertentu dari
manusia dengan gen beberapa organisme lain.Dasar teori Ekspresi gen
pada dasarnya merupakan suatu proses sintesis protein. Proses
ekspresi gen ditentukan oleh sel itu sendiri, jika sel tersebut
membutuhkan suatu protein, maka gen tertentu akan diekspresikan,
namun jika gen tersebut tidak membutuhkan protein maka gen tersebut
tidak diekspresikan. Jadi tidak semua gen akan diekspresikan pada
saat yang bersamaan namun tergantung dari kebutuhan sel tersebut.
Reaksi dasar dari sintesis protein adalah pembentukan ikatan
polipeptida antara gugus karboksil dari asam amino yang akan tumbuh
dengan gugus amina dari asam amino bebas. Reaksi sintesis ini
membutuhkan cetakan atau template yaitu mRNA yang diperoleh dari
ahsil transkripsi DNA. Sintesis protein diawali dari proses
inisiasi, yaitu berikatanya dua sub unit ribosom dengan mRNA pada
daerah spesifik, yaitu 10-30 nukleotida pada daerah upstream dan
star kodon. Proses inisiasi memerlukan suatu kodon spesifik yaitu
AUG ( menyandi asam amino metionin ) Setelah proses inisiasi
selesai maka dilanjutkan dengan terjadinya proses perpanjangan (
elongasi ). Pada proses perpanjangan rantai polipeptida ini dapat
dikatakan melewati siklus yang terdiri dari tiga tahap. Pertama
molekul amina asil tRNA akan terikat pada A-site yang kosong dengan
jalan berikatan dengan kodon dari mRNA yang terdapat pada A-site.
Kedua, gugus karboksil akhir dari rantai polipeptida akan taerlepas
dari molekul tRNA yang ada pada P-site dan membentuk ikatan
polipeptida dengan gugus amino dari asam amino yang terikat pada
tRNA dalam A-site. Reaksi ini dikatalisis oleh enzim peptidil
transferase. Ketiga, peptidil transferase yang baru terbentuk dalam
A-site tersebut kemudian dipindahkan ke P-site saat ribosom
bergerak kedepan sepanjang tiga nukleotida dari mRNA. Pada saat
proses translokasi tahap tiga tersebut, tRNA bebas yang semula
menduduki P-site akan terlepas dari ribosom dan siap menerima
molekul tRNA yang baru dan mulailah siklus seperti tadi lagi,
proses perpanjangan ini akan terus berlangsung sampai ahirnya
ribosom mengenal salah satu dari tiga stop kodon yakni UAA, UAG,
UGA sehingga sintesis protein akan mengalami terminasi dan rantai
polipeptida yang sudah terbentuk tadi akan lepas dari ribosom.
Seperti telah dijelaskan sebelumnya, protein merupakan polipeptida
yang tersusun atas asam amino. Sekuens asam amino dari
masing-masing protein tertentu oleh gen yang mengkodenya. Gen
ditranskripsi menjadi mRNA dan kemudian mRNA ditranslasikan menjadi
protein oleh ribosom. mRNA merupakan nukleotida yang terdiri atas
fosfat, gula deoksi dan basa. Urutan basa yang berbeda akan
menghasilkan asam amino dan protein yang sama, misalnya insulin
terdapat pada manusia, babi, kera, kuda, dan beberapa hewan mamalia
lainya. Meskipun fungsi insulin pada masing-masing organism
tersebut sama, namun ternyata memiliki struktur primer yang
berbeda, sehingga manusia tidak dapat dengan mudah memakai produk
insulin dari berbagai organisme untuk terapi karena dapat
menimbulkan reaksi antigen antibody. Oleh sebab itu diperlukan
penelitian mengenai homologi protein antar organisme sehingga dapat
dibandingkan kemiripan asam amino yang menyusun protein. Melalui
program blastp yang terdapat pada situs NCBI, kita dapat mencari
protein sehomolog dari berbagai macam organisme. Homologi bukan
berarti sama persis, namun terdapat kemiripan antara satu dengan
yang lainnya dengan persen kemiripan tertentu. Untuk tujuan terapi,
misalnya diinginkan suatu protein pengganti dari hewan tertentu,
tentu akan dipilih protein yang memiliki persen kemiripan yang
paling tinggi dengan protein yang kita miliki, sehingga diharapkan
reaksi alergi tidak terjadi dan protein tersebut dapat bekerja
dengan baik sesuai yang diharapkan. Analisis computer sangat
penting bagi penentuan lokasi gen dalam rangkaian DNA, tujuanya
adalah untuk pencarian homologi, dengan membandingkan rangkaian DNA
dengan rangkaian DNA lainya. Dasar dari pencarian homologi ini
adalah dengan membandingkan gen-gen yang memiliki kemiripan atau
sama sehingga gen baru dapat ditemukan dengan kemiripan dengan
gen-gen yang lain. Homologi gen merupakan salah satu dari
revolusioner ancestor yang dibuka oleh rangkaian yang mirip antara
gen-gen. persamaan ini dapat dilihat dari molekuler filogeni
sebagai dasarnya. Homologi dapat dicari dengan rangkaian DNA tetapi
biasanya rangkaian gen tentative ini dimasukan oleh rangkaian asam
amino sebelum pencarian dilakukan. Alasanya adalah karena asam
amino memiliki 20 asam amino yang berbedadalam protein, tetapi
hanya 2 nukleotida dalam DNA, jadi gen-gen itu biasanya tidak
berhubungan dengan lebih dari satu asam amino yang lainya. Software
computer yang biasa digunakan untuk analisis homologi gen adalah
blast (basic local alighment search tool ) ( Altshul et al., 1990
). Analisis ini lebih mudah atau dengan masuk ke salah satu
jaringan DNA database dang kemudian rangkaiannya dapat dilihat
secara langsung. Hasil yang cocok atau positif pada gen yang sudah
ada pada database dapat memberikan indikasi yang jelas tentang
fungsi dari gen yang baru atau implikasi dari gen-gen yang cocok
untuk gen lebih halus atau licin. Kenyataanya, gen-gen secara tidak
langsung memiliki segmen-segmen yang pendek yang sama antara yang
satu dengan yang lain. Walaupun gen-gen tidak berhubungan, tetapi
protein-proteinya memiliki fungsi yang sama. Contoh dari analisis
computer adalah tudor domain, memiliki 120 asam amino yang
diidentifikasi pertama kali pada gen Drosophila melonogaster. Di
bawah ini adalah struktur dari tudor protein D. melanogaster, yang
di dalamnya terdapat 10 kopian dari tudor domain, domain ini
ditemukan pada protein kedua Drosophila, homoles pada protein
ancestor A-kinase pada manusia (AKAPI149) yang berperan dalam
metabolism RNA. Protein ini memiliki kesamaan struktur dengan
lainya dan lebih tampak dari tudor domain, dan aktifitas pada
masing-masing protein melibatkan RNA. Informasi yang berasal dari
analisis computer tidak lengkap, tetapi titik utamanya adalah tipe
dari percobaan itu harus diselesaikan untuk menghasilkan data lebih
jelas lagi tentang fungsi dari tudor domain tersebut.Kandungan
genom inti manusia (Segmen 50-kb pada kromosom 7)Untuk memulai
mengungkapkan tentang komposisi dari genom inti manusia akan
dipelajari mengenai segmen 50-kb pada kromosom 7, segmen ini
membentuk bagia dari reseptor lokus sel-T, wilayah yang lebih besar
(685 kb) pada genom yang mempunya protein spesifik dalam respon
imun. Segmen 50kb mengandung informasi genetic sebagai berikut
:Satu gen, gen ini dinamakan TRY4 dan mengandung iformasi untuk
sintesis protein bernama tripsinogen, yang merupakan prekusor
inaktif dalam enzim digesti tripsin. TRY4 merupakan salah satu
anggota dari kelompok gen tripsinogen yang mengandung dua kluster
pada kesemua bagian ahir dari lokus reseptor sel-T. Gen ini tidak
berhubungan dengan respon imun, dan merupakan contoh gen
diskontinyu. Informasinya digunakan untuk sintesis protein
tripsinogen yang terpisah menjadi 5 ekson, dan dipisahkan oleh 4
intron non koding.Dua segmen gen, mereka adalah V28 dan V29-1, dan
merupakan bagian spesifik dari setiap reseptor protein sel T. V28
dan V29-1 merupakan gen tidak lengkap, hanya satu segmen dari
sebuah gen, dan sebelumnya diekspresikan, mereka harus terhubung
dengan segmen gen lainya dari lokus manapun. Hal ini terjadi pada
limfosit T dan merupakan contoh perubahan permanen dalam aktifitas
genom yang muncul sepanjang diferensial sel. V28 dan V29-1
merupakan gen diskontinyu.Satu pseudoen, sebuah pseudogen merupakan
salinan nonfungsional dari sebuah gen, biasanya satu sekuens
nukleotida dapat berubah sehingga infotmasi biologi di dalamnya
menjadi tidak dapat dibaca. Pseudogen ini dinamakan TRY5 dan
pseudogen ini berhubungan dengan anggota fungsional dari kelompok
gen tripsinogen.52 gen sekuens panjang berulang, sekuens terdapat
di berbagai tempat pada genom. Terdapat 4 tipe utama genom panjang
berulang, dinamakan LINEs ( elemen nuclear panjang yang
berselang-seling ), elemen LTR ( ujung panjang yang berulang ) dan
tranpor DNA. Dua mikrosatelit, sebutan di atas merupakan sekuens
dimana sebuah motif pendek berulang dalam tandem. Satu dari mikro
satelit dapat dilihat di bawah ini yang mempunyai motif GA berulang
sebanyak 16 kali, sepanjang sekuens :5-
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA3-
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTMikrosatelit kedua meliputi 6 motif
TATT berulang.Terakhir, kira-kira 50% dari segmen 50kb pada genom
manusia terbuat dari peregangan non gen, tidak berulang, satu
salinan DNA yang belum diketahui fungsinya atau signifikan.Sesuai
dengan informasi biologis yang disimpanya, basis data sekuens
biologis dapat berupa basis data primer untuk menyimpan sekuens
primer asam nukleat maupun protein, basis data sekunder untuk
menyimpan motif sekuens protein, dan basis data struktur untuk
menyimpan data struktur protein maupun asam nukleat.Basis data
utama untuk sekuens asam nukleat saat ini adalang GenBank (Amerika
Serikat),EMBL(Eropa),dan DDBJ(Dna Data Bank of japan). Ketiga basis
data tersebut bekerja sama dan bertutur data secara harian untuk
menjaga keluasan kecakupan masing-masing basis data. Sumber utama
data sekuens asam nukleat adalah submisi langsung dari pariset
individual, proyek sekuens genom, dan pendaftaran paten. Selain
berisi sekuens asam nukleat, entri dalam basis data sekuens asam
nukleat umumnya mengandung informasi tentang jenis asam nukleat
(DNA atau RNA), nama organism sumber asam nukleat tersebut, dan
pustaka yang berkaitan dengan sekuens asam amino nukleat.Sementara
itu, contoh beberapa basis data penting yang menyimpan sekuens
primer protein adalah PIR (protein informasi resource,USA),
Swiss-Prot(EUR), dan TrEMBEL(EUR). Ketiga basis data tersebut telah
digabungkan dalam UniProt yang didanai sebagian besar oleh AS.
Entri dalam UniProt mengandung informasi tentang sekuens protein,
nama organism sumber protein, pustaka yang berkaitan, dan komentar
yang umumnya berisi penjelasan mengenai fungsi protein
tersebut.BLAST merupakan perkakas bioinformatika yang berkaitan
erat dengan penggunaan basis data sekuens biologis. Penelusuran
BLAST pada basis data sekuens memungkinkan gen sejenis pada
beberapa organisme atau untuk memeriksa keabsahan hasil sekuensing
maupun untuk memeriksa fungsi gen hasil sekuensing. Algoritma yang
mendasari kerja BLAST adalah penyejajaran sekuens.PDB adalah basis
data tunggal yang menyimpan model structural tiga dimensi protein
dan asam nukleat hasil penentuan eksperimental (dengan
kristalografi-X,spektokrofi NMR dan mikroskopi electron). PDB
menyimpan data struktur sebagai koordinat tiga dimensi yang
menggambarkan posisi atom-atom dalam protein ataupun asam
nukleat.Analisis ekspresi genAnalisis klastering ekspresi gen pada
kangker payudaraEkspresi gen dapat ditentukan dengan mengukur kadar
mRNA dengan berbagai macam teknik. Teknik-teknik tersebut umumnya
diterapkan pada analisis ekspresi gen skala besar yang mengukur
ekspresi banyak gen, bahkan genom dan menghasilkan data skala
besar. Metode-metode pengalian data diterapkan pada data tersebut
untuk memperoleh pola-pola informative. Sebagai contoh,
metode-metode komprasi digunakan untuk membandingkan ekspresi
diantara gen-gen, sementara metode-metode klastering digunakan
untuk mempartisi data tersebut berdasarkan kesamaan ekspresi
gen.Basis data sekuens biologisSesuai dengan jenis informasi
biologis yang disimpannya,basis datasekuens biologis dapat berupa
basis data primer untuk menyimpan sekuens primerasam
nukleatmaupunprotein, basis data sekunder untuk menyimpan motif
sekuens protein, dan basis data struktur untuk menyimpan data
struktur protein maupun asam nukleat.Basis data utama untuk sekuens
asam nukleat saat ini adalahGenBank(Amerika Serikat),EMBL(Eropa),
danDDBJ(en)(DNA Data Bank of Japan,Jepang). Ketiga basis data
tersebut bekerja sama dan bertukar data secara harian untuk menjaga
keluasan cakupan masing-masing basis data. Sumber utama data
sekuens asam nukleat adalah submisi langsung dari periset
individual, proyek sekuensinggenom, dan pendaftaranpaten. Selain
berisi sekuens asam nukleat, entri dalam basis data sekuens asam
nukleat umumnya mengandung informasi tentang jenis asam nukleat
(DNAatauRNA), namaorganismesumber asam nukleat tersebut, dan
pustaka yang berkaitan dengan sekuens asam nukleat
tersebut.Sementara itu, contoh beberapa basis data penting yang
menyimpan sekuens primer protein adalahPIR(Protein Information
Resource, Amerika Serikat),Swiss-Prot(Eropa), danTrEMBL(Eropa).
Ketiga basis data tersebut telah digabungkan dalamUniProt(yang
didanai terutama oleh Amerika Serikat). Entri dalam UniProt
mengandung informasi tentang sekuens protein, nama organisme sumber
protein, pustaka yang berkaitan, dan komentar yang umumnya berisi
penjelasan mengenai fungsi protein tersebut.BLAST(Basic Local
Alignment Search Tool) merupakan perkakas bioinformatika yang
berkaitan erat dengan penggunaan basis data sekuens biologis.
Penelusuran BLAST (BLAST search) pada basis data sekuens
memungkinkan ilmuwan untuk mencari sekuens asam nukleat maupun
protein yang mirip dengan sekuens tertentu yang dimilikinya. Hal
ini berguna misalnya untuk menemukangensejenis pada
beberapaorganismeatau untuk memeriksa keabsahan
hasilsekuensingmaupun untuk memeriksa fungsi gen hasil
sekuensing.Algoritmayang mendasari kerja BLAST adalah penyejajaran
sekuens.PDB(Protein Data Bank, Bank Data Protein) adalah basis data
tunggal yang menyimpan model struktural tiga dimensiproteindanasam
nukleathasil penentuan eksperimental (dengankristalografi
sinar-X,spektroskopi NMRdanmikroskopi elektron). PDB menyimpan data
struktur sebagaikoordinat tiga dimensiyang menggambarkan
posisiatom-atom dalam protein ataupun asam nukleat.Penyejajaran
sekuensPenyejajaran sekuens(sequence alignment) adalah proses
penyusunan/pengaturan dua atau lebihsekuenssehingga persamaan
sekuens-sekuens tersebut tampak nyata. Hasil dari proses tersebut
juga disebut sebagaisequence alignmentataualignmentsaja. Baris
sekuens dalam suatualignmentdiberi sisipan (umumnya dengan tanda
"") sedemikian rupa sehingga kolom-kolomnya memuat karakter yang
identik atau sama di antara sekuens-sekuens tersebut. Berikut
adalah contohalignmentDNA dari dua sekuens pendek DNA yang berbeda,
"ccatcaac" dan "caatgggcaac" (tanda "|" menunjukkan kecocokan
ataumatchdi antara kedua sekuens).ccat---caac| ||
||||caatgggcaacSequence alignmentmerupakan metode dasar dalam
analisis sekuens. Metode ini digunakan untuk
mempelajarievolusisekuens-sekuens dari leluhur yang sama (common
ancestor). Ketidakcocokan (mismatch) dalamalignmentdiasosiasikan
dengan prosesmutasi, sedangkan kesenjangan (gap, tanda "")
diasosiasikan dengan proses insersi atau delesi.Sequence
alignmentmemberikanhipotesisatas prosesevolusiyang terjadi dalam
sekuens-sekuens tersebut. Misalnya, kedua sekuens dalam
contohalignmentdi atas bisa jadi berevolusi dari sekuens yang sama
"ccatgggcaac". Dalam kaitannya dengan hal ini,alignmentjuga dapat
menunjukkan posisi-posisi yang dipertahankan (conserved) selama
evolusi dalam sekuens-sekuensprotein, yang menunjukkan bahwa
posisi-posisi tersebut bisa jadi penting bagi struktur atau fungsi
protein tersebut.Selain itu,sequence alignmentjuga digunakan untuk
mencari sekuens yang mirip atau sama dalambasis datasekuens. BLAST
adalah salah satu metodealignmentyang sering digunakan dalam
penelusuran basis data sekuens. BLAST menggunakan
algoritmaheuristikdalam penyusunanalignment.Beberapa
metodealignmentlain yang merupakan pendahulu BLAST adalah metode
"Needleman-Wunsch" dan "Smith-Waterman". Metode Needleman-Wunsch
digunakan untuk menyusunalignmentglobaldi antara dua atau lebih
sekuens, yaitualignmentatas keseluruhan panjang sekuens tersebut.
Metode Smith-Waterman menghasilkanalignmentlokal, yaitu alignment
atas bagian-bagian dalam sekuens. Kedua metode tersebut
menerapkanpemrograman dinamik(dynamic programming) dan hanya
efektif untukalignmentdua sekuens (pairwise alignment)Clustal
adalah program bioinformatika untukalignmentmultipel (multiple
alignment), yaitualignmentbeberapa sekuens sekaligus. Dua varian
utama Clustal adalahClustalWdanClustalX.Metode lain yang dapat
diterapkan untukalignmentsekuens adalah metode yang berhubungan
denganHidden Markov Model("Model Markov Tersembunyi",HMM). HMM
merupakan model statistika yang mulanya digunakan dalamilmu
komputeruntuk mengenali pembicaraan manusia (speech recognition).
Selain digunakan untuk alignment, HMM juga digunakan dalam
metode-metode analisis sekuens lainnya, seperti prediksi daerah
pengkode protein dalamgenomdan prediksi struktur sekunder
protein.Prediksi struktur proteinSecara kimia/fisika, bentuk
strukturproteindiungkap dengankristalografi
sinar-Xataupunspektroskopi NMR, namun kedua metode tersebut sangat
memakan waktu dan relatif mahal. Sementara itu,
metodesekuensingprotein relatif lebih mudah
mengungkapkansekuensasam aminoprotein. Prediksi struktur protein
berusaha meramalkan struktur tiga dimensi protein berdasarkan
sekuens asam aminonya (dengan kata lain, meramalkan struktur
tersier dan struktur sekunder berdasarkan struktur primer protein).
Secara umum, metode prediksi struktur protein yang ada saat ini
dapat dikategorikan ke dalam dua kelompok, yaitu metode pemodelan
protein komparatif dan metode pemodelande novo.Pemodelan protein
komparatif(comparative protein modelling) meramalkan struktur suatu
protein berdasarkan struktur protein lain yang sudah diketahui.
Salah satu penerapan metode ini adalahpemodelan homologi(homology
modelling), yaitu prediksi struktur tersier protein berdasarkan
kesamaan struktur primer protein. Pemodelan homologi didasarkan
padateoribahwa dua protein yanghomologmemiliki struktur yang sangat
mirip satu sama lain. Pada metode ini, struktur suatu protein
(disebut protein target) ditentukan berdasarkan struktur protein
lain (protein templat) yang sudah diketahui dan memiliki kemiripan
sekuens dengan protein target tersebut. Selain itu, penerapan lain
pemodelan komparatif adalahprotein threadingyang didasarkan pada
kemiripan struktur tanpa kemiripan sekuens primer. Latar
belakangprotein threadingadalah bahwa struktur protein lebih
dikonservasi daripada sekuens protein selama evolusi; daerah-daerah
yang penting bagi fungsi protein dipertahankan strukturnya. Pada
pendekatan ini, struktur yang paling kompatibel untuk suatu sekuens
asam amino dipilih dari semua jenis struktur tiga dimensi protein
yang ada. Metode-metode yang tergolong dalamprotein
threadingberusaha menentukan tingkat kompatibilitas tersebut.Dalam
pendekatande novoatauab initio, struktur protein ditentukan dari
sekuens primernya tanpa membandingkan dengan struktur protein lain.
Terdapat banyak kemungkinan dalam pendekatan ini, misalnya dengan
menirukan proses pelipatan (folding) protein dari sekuens primernya
menjadi struktur tersiernya (misalnya dengan simulasidinamika
molekular), atau dengan optimisasi global fungsi energi protein.
Prosedur-prosedur ini cenderung membutuhkan proses komputasi yang
intens, sehingga saat ini hanya digunakan dalam menentukan struktur
protein-protein kecil. Beberapa usaha telah dilakukan untuk
mengatasi kekurangan sumber daya komputasi tersebut, misalnya
dengansuperkomputer(misalnya superkomputerBlue Gene[1]dariIBM)
ataukomputasi terdistribusi(distributed computing, misalnya
proyekFolding@home) maupunkomputasi grid.Analisis ekspresi
genEkspresi gendapat ditentukan dengan mengukur kadarmRNAdengan
berbagai macam teknik (misalnya denganmicroarrayataupunSerial
Analysis of Gene Expression["Analisis Serial Ekspresi Gen", SAGE]).
Teknik-teknik tersebut umumnya diterapkan pada analisis ekspresi
gen skala besar yang mengukur ekspresi banyakgen(bahkangenom) dan
menghasilkan data skala besar. Metode-metode penggalian data (data
mining) diterapkan pada data tersebut untuk memperoleh pola-pola
informatif. Sebagai contoh, metode-metode komparasi digunakan untuk
membandingkan ekspresi di antara gen-gen, sementara metode-metode
klastering (clustering) digunakan untuk mempartisi data tersebut
berdasarkan kesamaan ekspresi gen.Cara KerjaA.Analisis Ekspresi
GenBuka situs NCBIIsi kotak search nucleotide for dengan nama gen
yang akan dianalisis (kode keterangan homosapiens)Pilih gen yang
akan dianalisisCopy sekuens dalam region CDSBuka situs NCBI lagi
kemudian klik OFR FinderMasukan sekuens CDS yang telah di-copy
(langkah 4) ke kolom FASTA Format-VKlik Orf Find, akan muncul 6
frameKlik frame tersebut satu-persatu maka akanmuncul sekuens asam
amino hasil transkripsi CDS yang telah dimasukan tadi. Carilah
frame mana yang merupakan sekuens gen pengkode protein target
dengan mencocokan sekuens asam amino yang didapat dengan sekuens
asam amino pada tampilan awal identitas gen (features)
Ekspresi GenHasil PengamatanKode gen : NM_002692Nama Gen :
Homosapiens G-rich RNAsequens binding factor 1 (GRSF1)CDS :
283-4002frameKode genNama genCDSLength AAlenghtORFStarStop
+1NM_002692Homosapiens G-Rich RNA283-4002123937201341
+2NM_002692-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich
RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich RNA283-4002
283-4002
283-4002
283-400235
60
63
33108
183
192
1024
4
4
42
2
5
21
1
1
1
+3NM_002692-Homosapiens G-Rich RNA283-4002241-1-1
-1NM_002692-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich
RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens
G-Rich RNA283-4002
283-4002
283-4002
283-4002
283-400259
35
88
95
64
180
108
267
279
1955
5
5
5
5-
1
2
1
--
1
1
1
1
-2NM_002692-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich
RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens
G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich
RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens
G-Rich RNA283-4002
283-4002
283-4002
283-4002
283-4002
283-4002
283-4002
283-4002
283-4002
283-400235
65
73
64
73
63
38
40
57
124107
198
222
195
222
192
117
123
174
37510
10
10
10
10
10
10
10
10
10-
1
6
3
2
2
2
3
2
3-
1
1
1
1
1
1
1
1
-
-3NM_002692-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich
RNA-Homosapiens G-Rich RNA-Homosapiens G-Rich RNA283-4002
283-4002
283-4002
283-4002210
65
4
75631
198
126
2284
4
4
42
1
1
1-
1
1
1
Homologi proteinOrganisme : Homosapiens tumor proteinKode
mRNASPESIESSCORE BIT
XP_523149.2Pan troglodytes
XP.511957.2Macaca mulatta764
AAB.91535.1Callithrix jacchus737
NP.601040616.1Bos Taurus739
XP.002747994.1Sus scrofa711
AAB.413344.1Ailuropoda melanoleuca615
AAC.53040.1Mus musculus610
BAA78379.1Rattus norvegicus607
XP.001912188.1Danio rerio515
Xenopus laevis
Keterangan :-Pan troglodytes : Simpanse afrika-Macaca mulatta :
Monyet reshus-Callithrix jacchus : Monyet kecil-Bos Taurus : Sapi
tanduk panjang-Sus scrofa : Babi Hutan-Ailuropoda melanoleuca :
Panda-Mus musculus : Tikus-Rattus norvegicus : Tikus gede-Danio
rerio : Ikan gubby garis zebra-Xenopus laevis : Katak
HutanDiposkan17th January 2011olehHR PUTRILabel:Bosen nge-Game
Belajar jah . . .1Lihat komentar1. PSCS LAKNUS23 Mei 2014
21.15pembahasanya mana?Balas
HR PUTRIblog bertukar cerita dan sarana berbagi software game PC
windows linux ubuntu handphone, java, symbians , android , ios ,
blacberry , windows mobile dll hehe walopun jarang updatenya sih
gpp yah ^_^
Magazine Beranda HR PUTRI FACEBOOK Fanspage
JUL7
ROOT MUDAH DENGAN EROOT (1x click)mau share cara root yang
paling simple gan.
liat-liat kayake lom ada d doc deh :/.
maaf sebelumnya y para master kalo kurang berkenan boleh d
hapus.
cara root ini telah sukses saya coba di fw 4.1.B.0.631.
syarat-syaratnya.
download aplikasinya:
-
Eroot : 4shared (cuman 10mb)
-
mirror mediafire
-
mirror zippyshare
-
kalo sudah download jalankan programnya (run as
administrator).
conteng usb debugging dan unknown sourch pada HH
pastikan sudah menginstal pc companion / flashtools.
-
step-stepnya
- jalankan programnya (eroot yang sudah didownload tadi)run as
administrator.
- tunggu proses.
- colokan HH ke kompi (pastikan driver debugging uda
terinstal).
- tunggu HH ke deteck di aplikasi eroot.
- Klick tulisan root.3
JUN2
humor sardotcuman mau share cerita lucu nih
guyonan ala sardot pake bahasa jawa
judulnya
pasangan mesra
sardot lan paijem iku pasangan sing mesra sing kawit SMA,,,,
Nanging saiki terpisah amergo sardot lan paijem wis nduwe bojo
dewe-dewe,,,
paijem: Hay mas dot.... Sampean ngko bengi iso dolan neng omah
ku g,,,?
aku kangen banget karo sampean mas....! (telpon)
sardot : iso dek jem,,,,, tapi bojomu ono gak,,,?
paijem: tenang wae, bojoku lungo keluar kota semingu..
sardot: Waw...
AUG16
Dead Space qWVGADead space merupakan game keren Fps yang
terbilang sukses di android dengan ukuran yang tidak terlalu besar
seperti game-game hd sekarang pada umumnya dead space mampu
memberikan kualitas grafis yang apik
untuk menjalankan gamenya setelah menginstal gamenya terlebih
dahulu diharuskan mendownload datanya.2
APR3
BRAIN CHALLENGE 4 240x400 jarsudah lama g pos game 240x400 pada
kesempatan kali ini saya mau share game brain challenge 4 untuk
resolusi 240x400 jar.
APR2
WhatsApp Messenger v2.7.4982 Androidwhatsapp messenger V2.7.4982
merupakan versi whatsapp terbaru untuk android seperti yangtelah
kita ketahui whatsapp messenger merupakan aplikasi chat yang
memungkinkan pengguna terhubung walaupun dengan perangkat
berbeda
sebelumnya saya telah memposting untuk blacberry kali ini saya
posting untuk android tanpa membuang waktu silahkan UNDUH
pasword jika ada : hr-putri2
APR2
VIRTUAL TENNIS CHALLENGE HD ANDROID APKini dia gan game ajib
dengan grafik ajib pula :)
game tennis yang harus ada di h-h agan :D
tested on my ginggerbread 2.3 1 ghz
game dari snapdragon dan sega ini memang sangat memiliki
kualitas grafik yang halus dan mantep!
game play nya pun g rumit pasti agan suka dengan game ini :)
atas ne ane gan dari indonesia hehe baru peringkat 21 dunia gan
dari 50
bisa multiplayer juga gan :)
gmana ajib kan grafiknya
monggoh gan silahkan :)
unduh
apk :apk oh apk
sd :memori
pasword jika ada :19
APR2
WHATSAPP BLACBERRYhehe banyk yang mengatakan aplikasi ini
sebagai BBM KIller duh duh ada-ada saja
kelebihanya dari aplikasi ini bisa menghubungkan seseorang
walaupun berbeda perangkat atau sistem operasi yang berbeda..
dengan syarat anda mempunyai nomor handphone teman anda :)
walopun beda perangkat seperti java symbian windows mobile
android, ios bahkan blacberry
tapi aplikasi ini berbayar dan untuk perjobaan anda akan
mendapatkan gratis 1 tahun masa percobaan .
MAR24
Merubah Penampilan hp Android Layaknya Win7lama sekali saya g
pos
kali ini saya mau pos aplikasi apk gan
sejenis launcher
begini penampakanya
tampilan awal gan home utama
jika ada misscalls atau sms keluar notifikasinya popup gan
seperti d gambar
star menu pun layaknya windows 7 sungguhan juga ada log of dan
boot
untuk HH yang udah d root fungsi log of dan Boot bisa d gunakan
tapi jika belum root fungsi itu hanya sebuah pajangan gan
start apps list untuk melihat semua daftar aplikasi yang udah d
instal
link downloadnya
KLIKJ3
FEB4
ASPHALT 6 ADRENALIN HD ANDROID HVGAdah lama g pos hehe kali ini
ane mau share game balapan andalan saiia di henpon saya
keren pokokknya top markotop
neh screenshootnya langsung dari ginggerbred saiiya :D
downloadnya :APK NYA
jika ada pasword : hr_putri
sd datanya
part 1
part 2
part 3
PENTING ! setelah data di gabung dan di extract
simpan data di sddata/gameloft/game
join dengan HJ SPLIT bisa dicari di google atau ini :download hj
split
*part 2 udah fix
untuk versi javanya 240x400 juga adaasphalat 6 adrenalin
java49
JAN17
athan pro for PCduh lama banget saya g update hehe maklum gi
sibuk-sibuknya kuliah >.
