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Dakar 28 Avril 28 Mai 2005
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Qu’est ce que Microtrop ?
MICROTROP est un projet d’Université d’été de 5 semaines (25 avril -30 mai 2005) en Ecologie microbienne
Thème : les déséquilibres écologiques des sols et des eaux
MICROTROP se propose d’initier des étudiants de 3ème cycle et des jeunes chercheurs africains et européens à la démarche écologique d’étude des communautés microbiennes dans leurs milieux naturels
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Pourquoi Microtrop ?
Double Cliquer ici
• L’Ecologie Microbienne : un domaine en pleine évolution
• Les scientifiques du sud en dehors du flux informationnel et technique
• Pas de formation équivalente en Afrique et Europe
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Objectifs de Microtrop
• Formation de jeunes chercheurs aux outils de l’écologie microbienne appliqués aux biotope tropicaux
• Constitution d’un réseau d'écologistes microbiens en Afrique
• Constituer une trousse pédagogique permettant une diffusion de la discipline (livre, CD-ROM, site web , plateforme collaborative, e.learning)
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Principe de fonctionnement
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Interactions avec intervenants
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Intensité de la formation
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Conséquences…
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MixitéOrigine géographique des candidats (%)
7AF Ouest
4AF Centrale2
Mada
2Maghreb
5Europe
2AM du Sud
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Mixité des intervenantsAlonzo Cecilia Miambi Edouard
Le Rudulier Daniel Nazaret Sylvie Arfi Robert Neyra Marc
Bettarel Yvan Ollivier Bernard Bouvy Marc Philippot Laurent
Brauman Alain Pintado Jose Charles Munch Jean Poncet Gilles
Chotte Jean Luc Ranjard Lionel Dgigal Djibril Roger Pierre
Dick Richard Roy-Macauley Harold Dionigi Olivier Sall Saidou
Diouf Diegane Sall Cirre Duponnois Robin Savingui Patrick
Fall Saliou Servais Pierre Hamelin Jerome Villenave Cecille
Jacques Godon Jean Wade Tania Lensi Robert Yahia Kaci
Martin Fabrice
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Une formation pointue en Afrique ?
Dakar = Centre Africain leader en microbiologie
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Des sites uniques
Oscillatoria limneticaOscillatoria limnetica
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Forte logistique 1- Laboratoires équipés 2-Masse critique de chercheurs et techniciens
3- Infrastructures : garage, amphi, internet etc..
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MICROTROP Projet Multi-Institutionnel
Institutions partenaires
Organisation
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Bailleurs
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Pour Frédéric Ampe
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BudgetInstitutions-bailleurs Montant alloué Reçu ** Bailleurs institutionnels IFS 8 038 € 7 475 € AUF 20 000 € 18 600 € CNRS 5 000 € 5 000 € MAE 10 000 € 9 300 € UNESCO 2 289 € 2 129 € IFR Ecosystèmes 2 000 € 2 000 € Total institutionnels 44 504 € IRD Dept Soutien Formation 19 600 € 19 600 € Unité de Recherche Seq Bio 4 000 € 4 000 € Délégation à l'information et communication* (Film) 3 500 € 3 500 € Délégation au Syst. D'Informations* (informatique) 6 400 € 6 400 € total IRD 33 500 € Droits d'inscriptions NCCR Plant Survival, Suisse 2 700 € 2 550 € Université Libre de Bruxelles, Belgique 1 500 € 1 500 € DMP (Desert margin Program) 1 500 € 1 500 € Max Planck Institute, Allemagne 600 € 600 € Université Oregon, USA 1 542 € 1 542 € sous total inscription 7 692 € Total acquis 85 697 €
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Analyse du budget
• Nombre important d’organismes financeurs (11 en 2005)
• Contribution plus forte des instituts hors IRD (54% contre 49%)
• 10% du budget provient du payement de droits d’inscriptions (7 étudiants)
• Coût par étudiant 2005 (3400 €) < formation 2001 (4423 €).
• Coût journalier = 110 €/jours/candidat,
Origine des crédits des formations 2001 et 2005
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
Bailleursinstitutionnels
IRD* Droits d'inscriptions
2001
2005
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Contenu de l’atelier-formation
–Cours théoriques : – 63 h de cours – dispensés par 35 intervenants – organisés sous forme de 8 modules
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Programme des cours
I. Ecologie microbienne : concepts généraux 9hII. Microorganismes et changements globaux 5hIII. Adaptation des microorganismes aux milieux
naturels 10hIV. Microorganismes des milieux extrêmes 5hV. Bioindicateurs des écosystèmes 7h30VI. Restauration de la fertilité par les microorganismes
6h30VII. Pollution et bio dépollution 9hVIII. Méthodologies pour l'écologie microbienne
8hIX. Les nouvelles technologies de la communication
3h
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Travaux pratiquesDévelopper des approches polyphasiques
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Etablir l’influence des pratiques polluantes sur
les 3 sites témoinsBactéries photosynthétiques
pourpres ?
Sulfato-réductionSulfato-réduction
Algues eucaryotes et cyanobactéries
Bactéries photosynthétiques
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Mini projet de recherche
But : se familiariser à la conduite d'un projet de recherche. Principe : thèmes liés aux biotopes tropicaux étudiés
Contrainte : hors du champs thématiqueDurée : 2 semaines
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Noms et Prénoms
Intitulé des sujets BLANC Cyril et RAMANANKIERANA Niaina
Origine et diversité des bactéries productices d'EPS dans les sols de termitières"
CABIROL Nathalie Impact de l’hétérogénéité spatiale du sol sur l’émission de N20 DIEDHIOU Siré Denitrifying community response to eutrophication case study : Baie de Hann
DJIDOHOKPIN Carole Impact des pratiques culturales sur la diversité génétique des bactéries dégradant le 2,4-D dans les Niayes au Sénégal.
DJIGAL Djibril BILGO Ablasse
Recherche d’indice de contamination fécales et de pathogènes (P. aeruginosa) dans des eaux de boisson de différentes origines
FAKEM Henri Recherche d'hôtes alternatifs de Pseudomonas aeruginosa
HARRIS Jennifer Myconhization de la Tomate et d’une espèce herbacée rudinale en fonction des eaux d’arrosage sur le site des Niayes (eau usée / eau des céanes)
ISUMBISHO Pascal ALONSO Cécilia
Impact du microzooplancton sur la dynamique des populations bactériennes marines »
JOCKTANE Dominique
Sujet 1- Détection des virus dans la colonne d’eau et dans les sédiments en fonction du gradient de sel au Lac Rose Sujet 2- Etudier l’Impact du type d’irrigation sur la communauté bactérienne dénitrifiante
JOSSI Marylin Pourquoi le termite ne veut-elle pas prêter sa meule ?
MACARIE Hervé FALL Diomacor
L’eau d’irrigation et le type de plante ont-ils un impact sur les populations microbiennes (bactéries) qui colonisent la rhizosphère de ces plantes
OUMAROU Rabi Communautés bactériennes totales et dénitrifiantes des différents segments du tube digestif des termites
PIKA Pacome Impact du mercure (Hg) sur la structure, l’activité et la diversité des bactéries dénitrifiantes.
RABARY Bodo BENHALIMA Mounira
Mise en évidence des communautés bactériennes réductrices de nitrate et dénitrifiantes dans les sédiments du Lac Retba en fonction des gradients de salinité du milieu
ROUSSEL Ludovic Termites: Wolbachia or not Wolbachia?
SAVADOGO Paul MAHDHI Mosbah
Impact de la salinité et des pesticides sur les nématodes
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Exemple de résultat
Figure 4 : Structure génétique (A) et morphologique (B) de la
communauté bactérienne après 24 heures d’ incubation in si tu
dans la baie de Hann.
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MICROTROP : Un laboratoire d’essai des NTIC
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Présentation des NTIC • Elaborations de site internet sous SPIP
キキ Site publique du réseau Microtrop : http://www.microtrop.ird.sn
キキ Site restreint du réseau Microtrop http://www.microtrop.ird.sn/reseau
• Plateforme collaborative• Outils de communications (téléphonie sous IP)• VisioconférenceEnseignement répondant le plus aux attentes
6
6
7
12
12
0 2 4 6 8 10 12 14
Cours NTIC
Plate-forme collaborative
Edition Web
Outils de communication
TP site web
Quels outils NTIC pensez-vous utiliser en particulier ?
13
14
15
2
13
0 2 4 6 8 10 12 14 16
Edition web
Messagerie instantanée
Téléphonie sur Internet
Visioconférence
Plate-formecollaborative
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Olivier Dionigi Mr NTIC
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Do It Your Soil (DIYS)
Formation ouverte et à distancedans le domaine de la pédologie
Séquences d’apprentissage déclinées en trois parties: Introduction / Exercice / Synthèse
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Principe didactique:
Explain me … I will forget
Show me … I will remember
Let me do … I will understand
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NTIC = Réseau
– Réseau Opérationnel de Recherche (labo sans mur)
– Base de cours et amélioration et enrichissement des cours existants (cours)
– Mise à disposition de documents divers (appel d’offres)
– Espace pour les échanges scientifiques (réseau humain)
– E-meeting
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Bilan
Points Forts• Satisfaction en termes de formation • Mise en relation Sud-Sud et Nord-Sud • Reconnaissance de la formation par certaines Ecoles doctorales (Lyon 1, Université de Neuchâtel)• La méthode Microtrop • Définition de premiers éléments de fonctionnement du réseau
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BilanLes points à développer • Comment pérenniser la formation :
– Académique : unités de crédits– Financière : europe ?– Institutionnelle: prise de relais ou co-
animation, désignation de « têtes de pont »
• Comment le réseau peut participer au renforcement et/ou l’émergence d’équipes de recherche au Sud:– Idée : GIS pour Financement de projets inter-
institutionnels, projets régionaux renforcement ou émergence des collectifs
REUNION MICROTROP 2006