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Microbiología General Aislamiento e identificación de Microorganismos

clase identificación

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  • Microbiologa General

    Aislamiento e identificacin de

    Microorganismos

  • Para qu aislar microorganismos?

    Para qu identificar un microorganismo ?

    Caracterizacin vs. Identificacin

    1. Pruebas bioqumicas Identificacin presuntiva

    2. Pruebas Moleculares Identificacin final

  • Aislamiento e identificacin de microorganismos

    Procedencia Caractersticas Expectativas

    Mtodos convencionales Mtodos moleculares

    Tratamiento inicial

    Siembra Aislamiento Identificacin

  • Tratamiento inicial

    Siembra

    Enriquecimiento (selectivo o no)

    Calentamiento Filtracin Homogeneizacin, etc

    Seleccin de medios de cultivo Inculo Observacin microscpica

  • Agotamiento por estras, diluciones seriadas, etc

    Subcultivo

    Aislamiento

    Criterios de pureza

    Cultivo puro

    Identificacin

    Macroscpicos

    Microscpicos

  • Muestras

    Microorganismos indicadores

    Coliformes P. aeruginosa

    Deteccin de B. cereus en leche en polvo,miel, arroz

    Deteccin de S. aureus en alimentos procesados y leche cruda

    Aislamiento de Lactobacillus spp de productos fermentados

    Agua

    Alimentos

  • Aislamiento de Bacillus cereus de muestras de alimento o suelo

    Seleccin de esporas

    Calentamiento

    Enriquecimiento

    Agotamiento por estras Mossel

    Colonias aisladas (Man (-), Lecitinasa (+))

    Repique

    Tinciones

    Cultivo puro

  • Morfologa de las colonias

    Forma y tamao de las colonias: Irregular, puntiforme

    Bordes: liso, rugoso.

    Elevacin: Convexo, elevado, umbonado, liso.

    Color: pigmento, opaca, translucida, brillante.

    Textura: Mojada, mucosa, seca.

  • Bacillus subtilis

    Forma de la colonia y tamao: irregular

    Bordes: ondulado

    Elevacin: umbonada

    Color: Blanca crema

    Textura : seca

    Proteus vulgaris

    Tpico aspecto sobre la caja de petri

    Klebsiella pneumoniae

  • Pruebas bioqumicas

    para la identificacin de

    Bacterias

    Exoenzimas y Endoezimas

  • I M Vi C*

    Indol

    Rojo de Metilo

    Vohes Proskauer

    Citrato

    Identificacin de bacilos entricos

    Bacilos cortos, Gram negativos, no formadores de esporas y fermentadores de

    glucosa.

    Miembros

    Patgenos: Salmonella y Shigella

    Patgenos ocasionales: Proteus y Klebsiella

    Flora normal: Escherichia y Enterobacter

  • Test de produccin de Indol

    Determina la capacidad de un microorganismo de degradar triptfano

    Triptofanasa

    Triptofano Indol + Acido Piruvico + amoniaco

    Butanol

    Indol + p-dimetilaminobenzaldehido Halo rojizo en la superficie del tubo

    HCl

    Reactivo Kovac

  • positivo negativo

    E.coli

    Accin de la triptofanasa

    El triptofano se adiciona al medio en una

    Concentracin 1%. Es una peptona derivada de

    la casena. Se adicionan 10 a 12 gotas del reacc. de KOVACS.

  • Rojo de Metilo

    Para identificar bacterias que metabolizan glucosa con produccin de altas concentraciones de cidos.

    Sirve para diferenciar E.coli de Enterobacter

    El medio tiene glucosa al 10% y Rojo Fenol

    E. coli : estabiliza el pH bajo producto de la acidificacin del medio

    Enterobacter: Convierte los cidos en productos finales neutros como 2,3 butanediol y acetoina lo que

    resulta en una elevacin del pH en in valor de 6.

    Positive positive negative control.

    pH 4 vira al rojo (test positivo)

    pH 6 sigue indicando presencia de

    acido pero a una concentracin

    insuficiente para producir el viraje

  • Left: uninoculated control

    Right: negative (copper color)

    Left: uninoculated control

    Right: positive (red color) Left is Barritt's A (alpha-napthol) and right is

    Barritt's B (KOH--potassium hydroxide).

    Voges-Proskauer (VP)

    Para identificar microorganismos capaces de producir acetoina y 2,3butanediol como

    resultado de la degradacin de glucosa. Positivo para Enterobacter aerogenes

    Barritt's A (alpha-napthol) y Barritt's B (potassium hydroxide) se adicionan al cultivo

    y se agita ligeramente. Rojo positivo

    Glucosa + O2 piruvato a-acetolactato acetoina 2,3 butanodiol

    40% KOH

    Acetoina + a-naftol Complejo rosado (creatina + diactetilo)

    Etanol Absoluto

  • Para determinar la capacidad de un m.o. de utilizar la enzima citrato permeasa para usar

    como fuente de carbono el citrato nicamente.

    Simmon's citrate agar: Es un medio definido que contiene citrato de sodio como fuente carbonada.

    Si el citrato se utiliza se producen compuestos que alcalinizan el medio. El indicador de pH , azul

    de bromotimol, cambia de verde a pH neutro (6.9) a azul a pH mayores que 7.6.

    Citrato

    Enterobacter cloacae: positive

    Escherichia coli: negative

    Klebsiella pneumoniae: positive

    Citrato permeasa

    Glucosa + O2 Ac. piruvico + Ac. Oxalacetico + CO2

    Exceso de Sodio + CO2 + H2O Na2CO3

    (producto alcalino que eleva pH

    vira de verde a azul)

  • Catalasa* Para determinar microorganismos que producen la enzima catalasa. Micrococcaceae

    como Staphylococcus catalasa positivos, Streptococcaceae, Streptococcus

    Enterococcus catalasa negativo.

    H2O2 es producido por bacterias aerobias o facultativas mediante reacciones no

    enzimticas de reduccin de flavoprotenas o por accin enzimtica de radicales

    superxido. H2O2 puede daar las bacterias, la enzima catalasa presente en algunas bacterias lo transforma en agua y oxgeno.

    Se adiciona perxido de hidrogeno sobre una gota o ansada de cultivo sobre un porta

    objeto. Un burbujeo indica la presencia de la enzima.

    2H2O2 2H2O+ O2 Catalasa

  • Oxidasa*

    Para identificar bacterias que contengan la enzima citocromo oxidasa (respiracin).

    Oxidase negativa Enterobacteriacae y Pseudomonadaceae, Neisseria oxidasa positiva.

    La enzima citocromo oxidasa cataliza el transporte de electrones de un donor hacia el

    aceptor final de la respiracin (oxgeno). En este test un donor de electrones artificial

    (phenylenediamine) se usa para Reducir la citocromo Oxidasa.

    Si la enzima esta presente se observar una coloracin purpura.

    El test se debe leer a los 15 segundos pues el reactivo puede cambiar de color con el paso

    del tiempo.

    oxidasa (+)

    Pseudomonas

    oxidasa (-)

    E. coli

    Neisseria

  • Reduccin de nitrato*

    Muestra la capacidad de un m.o. de reducir nitrato (NO3) a nitrito (NO2), nitrgeno

    molecular (N2) o amoniaco, usando la enzima nitrato reductasa.

    Nitrato (NO3) puede ser reducido por diferentes compuestos incluso por respiracin

    anaerobia o por denitrificacin. El medio de cultivo contiene nitrato de potasio como

    sustrato.

    Determinacin de Nitrito NO2-: Reactivo GRIESS-ILOSVAY

    1. Solucin A: acido sulfanico

    2. Solucin B: a-naftilamina

    Determinacin de Amonio (NH4+): Reactivo de NESSLER

    REACCION POSITIVA: aparicin instantnea de una coloracin rojo cereza

    Que no se produzca color puede indicar dos cosas: (1) el nitrito no se redujo (2) se redujo

    a otros compuestos. Para distinguir esta situacin se adiciona Zinc. Si hay nitrato en el

    medio se va a reducir a nitrito y el medio se tornar rojo mostrando una reaccin negativa.

    Si al adicionar Zn no sucede nada, se redujo a otros compuestos.

  • Pseudomonas aeruginosa: no hay cambio de

    color, negativo

    Escherichia coli: cambio de color a rojo, positivo

    Corynebacterium xerosis: no hay cambio de color,

    negativo

    Test del nitrato

    Reagent A: Sulfanilic Acid

    Reagent B: alpha-naphthylamine

  • Triple Sugar Iron Agar (TSI)*

    Enterobacterias y otros bacilos intestinales Gram negativos

    Para diferenciar bacterias basado en su habilidad para fermentar glucosa, lactosa y/o

    sucrosa.

    TSI contiene tiosulfato de hierro, sustrato para la produccin de sulfuro de hidrogeno y

    sulfato ferroso.

    Rojo fenol. Fermentacin de carbohidratos vira de rojo a naranja a amarillo en presencia

    de cidos.

    Se siembra en profundidad con una aguja y luego se estra el pico de flauta.

  • Azcar Productos cidos pH (Amarillo)

    Peptonas Amoniaco (NH3) pH (Rojo)

    Fermentacin (medio cido) + Tiosulfato de Sodio SH2 (gas)

    SH2 + iones frricos Sulfuro ferroso (precipitado negro insoluble)

  • Agar inclinado alcalino (rojo) y superficie

    recta acida (amarilla) con o sin produccin

    de gas (ruptura o no del agar)

    Agar inclinado alcalino (rojo) y superficie

    recta alcalina (rojo) o sin cambios

    Agar inclinado acido (amarillo) y

    superficie recta acida (amarilla) con y sin

    produccin de gas (ruptura o no del agar)

    nicamente

    fermenta glucosa

    No ocurre

    fermentacin de

    carbohidratos

    Puede ocurrir

    fermentacin de

    lactosa o sacarosa

    o ambos

  • Test de la Descarboxilasa

    Muestra la capacidad de un m.o. para descarboxilar un aminocido.

    En esta reaccin se remueve el grupo carboxilo (COOH) de un aminocido produciendo

    amina y dixido de carbono.

    El indicador de pH (purpura de bromocresol) es adicionado con unas gotas de aceite

    mineral que crean un ambiente de anaerobiosis para promover la fermentacin.

    Se necesita un ambiente cido porque la enzima solo funciona en estas condiciones. pH

    alcalino el indicador cambia a purpura (positivo).

  • Prueba de fenilalanina-desaminasa

    Para identificar accin de la enzima phenilalanina-deaminasa. Usado para distinguir

    Morganella, Providencia, y Proteus (phenilalanina-deaminasa positiva) gneros de otros

    miembros de Enterobacteriaceae (phenylalanine deaminase negativa).

    El medio contiene el aminocido fenilalanina. La enzima remueve el grupo (NH2) y

    libera amonio (NH3). Se obtiene acidofenilpiruvico, que puede ser detectado por la

    adicin de un agente oxidante (Cloruro Ferrico al 10%).

    Un cambio de color al verde indica una reaccin positiva.

    Negativo Positivo

  • Prueba de ureasa Determinar la capacidad de un microorganismo de desdoblar la urea, formando dos

    molculas de amoniaco por accin de la enzima ureasa

    Indicador de pH: rojo fenol. Presencia de amoniaco aumenta el pH y vira a rosa oscuro

    Urea + 2 H2O CO2 + H2O + 2 NH3 (NH4) CO3

    1. No inoculado

    2. Proteus vulgaris: Positivo

    3. Escherichia coli: Negativo

  • Prueba de hidrlisis de caseina

    Determinar la capacidad de producir enzimas proteilicas capaces de hidrolizarla casena

    Agar leche. Contiene caseina la cual le da el color blanco. Algunas bacterias secretan

    caseasa, la cual rompe la molcula de casena en pequeos polipentidos los cuales

    atraviesan la membrana celular. Esta reaccion de hidrlisis, aclara el area alrededor de la

    colonia.

    Bacillus subtilis es positivo para la enzima

    caseasa.

  • Prueba de licuefaccin de Gelatina*

    Determinar la capacidad de un organismo de producir enzimas de tipo preoteltico

    (gelatinasas) que licuan gelatina

    Protena + H2O Polipptidos

    Polipptidos + H2O Aminocidos individuales

    Escherichia coli: negativa (gelatina como solido)

    Pseudomonas aeruginosa: positiva (gelatina degradada)

  • Prueba de hidrlisis de Almidn

    Determinar la capacidad de un microorganismo de hidrolizar el almidn mediante

    enzimas del tipo amilasas

    -amilasa

    Almidn dextrinas + maltosa + glucosa

    H2O polisacridos disacrido monosacrido

    El almidn en presencia de Iodo imparte coloracin azul indicando ausencia de amilasa

    (Resultado Negativo)

    Si el almidon fue hidrolizado, se vera una zona clara alrededor de las colonias (Resultado

    Positivo)

    lugol

  • Fermentacin de carbohidratos (rojo fenol) Se adiciona un azcar al medio: Lactosa, sacarosa o glucosa

    Propsito: Se usa para determinar fermentacin de ciertos azcares y produccin de gases.

    Se usa para identificar bacterias entricas Gram negativas.

    Durante el proceso de fermentacin el aceptor final de electrones es una molcula orgnica.

    Un tubo (Durham) es colocado dentro del medio invertido con el propsito de capturar gases

    liberados durante la fermentacin.

    El indicador cambia al amarillo por debajo de pH 6.8 y cambia al rojo por encima de pH

    7.4.

    Si el microorganismo no fermenta el carbohidrato pero usa la peptona se va a acumular

    amonio, esto elevara el pH.

  • 1- Control sin inocular

    2- Amarillo: Utilizacin del azcar, produccin de cido sin gas.

    3- Amarillo y produccin de gas.

    4- Fermentacin negativa. Oscurecimiento del medio

    de cultivo producto de utilizacin de peptonas y liberacin

    de amonio.

    5- Negativo

    orgamismos

    1. Control Negative

    2. S. aureus Acid

    3. P. vulgaris Acid, Gas

    4. P. aeruginosa Negative

    5. E. coli Acid, Gas

    resultados

    Fermentacin de glucosa

  • Identificacin y Caracterizacin

    Catalasa Fermentacin de azcares Hemlisis Deteccin de genes de virulencia (toxinas-PCR hblA, B, C, D.)

    Aislamiento de Bacillus cereus de muestras de alimento o suelo

    Seleccin de esporas

    Calentamiento

    Enriquecimiento

    Agotamiento por estras Mossel

    Colonias aisladas (Man (-), Lecitinasa (+))

    Repique

    Tinciones

    Cultivo puro