Upload
others
View
5
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Biometria, alapozó biostatisztika
Könnyű BalázsELTE TTK Növényrendszertani, Ökológiai és Elméleti Biológiai Tsz.
BEVEZETŐ
Előadás (biometb17va) Déli Tömb, 0-822 Mogyoródi József terem Kedd: 10.00-11.00
Gyakorlatok (biometb17va) Déli tömb, 7-424 (BI számítógépes labor)
Szerda 10.00-11.00 - Paczkó Mátyás Szerda 11.00-12.00 - Hubai AndrásSzerda 12.00-13.00 - Hubai AndrásSzerda 14.00-15.00 - Vörös DánielCsütörtök 8.00- 9.00 - Könnyű BalázsCsütörtök 9.00-10.00 - Radványi ÁdámPéntek 10.00-11.00 - Konrád KrisztinaPéntek 11.00-12.00 - Kovács Bálint
TananyagKombinatorika
Valószínűségszámítás
Valószínűségi változók(2-3. hét)
R
Leíró statisztika(4-5. hét)
Hipotézisvizsgálat(6-7. hét)
Egymintás próbák (8-9. hét)
Kétmintás próbák(10.hét)
ANOVA(11. hét)
Függetlenség, korreláció(12.hét)
Lineáris regresszió(13. hét)
Előfeltételek, irodalom
Solt György: Valószínűségszámítás (Bólyai sorozat)
● Reiczigel-Harnos-Solymosi: Biostatisztika, nem statisztikusoknak● Könyv (+ ebook + gyf)
4000 Ft (ELTE-s ár)● ebook+gyakorló
feladatok https://e-akademia.hu/ féléves előfizetés!!!2000 Ft
● A honlapról letölthető előadás, feladatsor
Előfeltételek● Matematika (kombinatorika,
valószínűségszámítás )● Informatika (R)Irodalom:
http://plantsys.elte.hu/drupal/hu/oktatas/biometria
Gyakorlat● Kötelező a részvétel (max. 3 hiányzás)● Két sikeres (>50%) évközi ZH
KövetelményekElőadás
● Elméleti kérdések a gyakorlati ZH-ban (>80% → GY jegy előfeltétel)
I. ZH: 6-7. hét II. ZH: 15. hét (Vizsgaidőszak 1. hét)
március 18. 18.00-20.00 – Hubai András május 18. 16.00-18.00 – Könnyű Balázs
március 19. 18.00-20.00 – Hubai András május 18. 18.00-20.00 – Radványi Ádám
március 20. 18.00-20.00 – Konrád Krisztina május 19. 16.00-18.00 – Konrád Krisztina
Március 23. 19.00-21.00 – Radványi Ádám május 19. 18.00-20.00 – Kovács Bálint
március 24. 19.00-21.00 május 20. 16.00-18.00 – Hubai András
március 25. 18.00-20.00 – Könnyű Balázs május 20. 18.00-20.00 – Hubai András
március 26. 18.00-20.00 – Vörös Dániel május 21. 18.00-20.00
március 27. 18.00-20.00 – Kovács Bálint május 22. 18.00-20.00 – Vörös Dániel
Déli tömb, 7-424 (BI számítógépes labor)
Gyakorlat● Kötelező a részvétel (max. 3 hiányzás)● Két sikeres (>50%) évközi ZH
I. ZH: 6-7. hét II. ZH: 15. hét (vizsgaidőszak 1. hete)
● Házi feladatok:● A rész: adott heti anyagrészből● B rész: következő heti anyagrészből
● Pótolási lehetőségA vizsga időszak 2. hetében elméletből is, és gyakorlatból is
JegyZH1 + ZH2 + HF
pl. 40% + 40% + 20% → Pont → ponthatárok → Jegy
KövetelményekElőadás
● Elméleti kérdések a gyakorlati ZH-ban (>80% → GY jegy előfeltétel)
Gyakorlatra
OlvasniTK: 6-12. oldal
Miért érdemes statisztikát tanulni?egy szubjektív válasz
A cikk főszereplője: anticianidok
Bevezető:Anticiánok szerepe a növényi stresszben
Stressz indukált antocianidokKépzése (hipotézis:
reaktív oxigén gyökök semlegesítése)
Felhalmozódása különböző szövetekben
Cél:
„do different anthocyanins accumulate in response to different stress conditions?”
Antocián ujjlenyomat
Eredmények
Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?
AnthocyaninInductiveCondition
Eredmények
Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?
0.11
0.04 0.060.1 0.12 0.15
0.28
0.49 0.560.11 =?= 0.100.11 =?= 0.120.11 =?= 0.15
Eredmények
Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?
0.11
0.04 0.060.1 0.12 0.15
0.28
0.49 0.560.11 =?= 0.040.11 =?= 0.06
Eredmények
Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?
0.11
0.04 0.060.1 0.12 0.15
0.28
0.49 0.560.11 =?= 0.280.11 =?= 0.490.11 =?= 0.56
Eredmények
Az antocianidok minden stressz hatására azonos mennyiségben termelődnek?
Antocianid tartalom(statisztika)
Kontroll vs. Kezelés
0.11 < 0.04*
0.11 < 0.06*
0.11 = 0.100.11 = 0.120.11 = 0.150.11 > 0.28*
0.11 > 0.49*
0.11 > 0.56*
* szignifikáns különbség ~ sztochasztikus (véletlen) ingadozásnál nagyobb eltérés
„2x2 néha 5”avagy miért
van sztochasztikus
ingadozás?
mérési korlátok
Kutatástervezés
Kutatástervezés
● Kérdés → alapkutatás (ismeretszerzés), alkalmazott kutatás (az ismeretek alkalmazhatóságának felderítése)
● A rendszer megismerése, elővizsgálatok, alapos irodalmazás● Kérdés pontosítás, tudományos hipotézis(ek) („prekoncepció”)● Statisztika megválasztása és a statisztikai hipotézisek felállítása
● Válaszváltozók, háttérváltozók, becslés, kontroll● Megfelelő mérési technika kiválasztása● Következetesség● Adatminőség● Közlés formája: ábrák, táblázatok, statisztikai vizsgálatok
tudományos hipotézis ≠ statisztikai hipotézis
Mintavétel
Hányféleképpen vehető ki n elemű halmazból k elem?
kombináció
Figyelem! A minta jelentése a
statisztikában eltér a biológiai kíséreltekben
megszokottól: 1 mérés ↔ az
objektumok egy csoportja
Mintavétel
● Reprezentativitás
● Randomitás
● Elemszám
● Variancia
Gyakorlatra
OlvasniTK: 13-32. oldal
Gyakorlathttp://plantsys.elte.hu/drupal/hu/oktatas/biometriaFeladatsor:● Bevezető gyakorlatok