22
BIOLOGICK BIOLOGICK É É V V Ě Ě DY DY Ú Ú VOD VOD Z Z Á Á KLADY MOLEKUL KLADY MOLEKUL Á Á RN RN Í Í BIOLOGIE BIOLOGIE

BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

  • Upload
    others

  • View
    4

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

BIOLOGICKBIOLOGICKÉÉ VVĚĚDYDY

ÚÚVODVOD

ZZÁÁKLADY MOLEKULKLADY MOLEKULÁÁRNRNÍÍ BIOLOGIEBIOLOGIE

Page 2: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

DOPORUDOPORUČČENENÁÁ LITERATURALITERATURA

Jan Jan ŠŠmardamardaZÁKLADY BIOLOGIE A ANATOMIE PRO STUDUJÍCÍ PSYCHOLOGIE

ZdenZdeněěk k WilhelmWilhelm a kolektiva kolektivSTRUČNÝ PŘEHLED FYZIOLOGIE ČLOVĚKA PRO BAKALÁŘSKÉ STUDJNÍ PROGRAMY

OldOldřřiichiich NeNeččasasBIOLOGIE

Stanislav Stanislav RosypalRosypalPŘEHLED BIOLOGIE

Stefan Stefan SilbernaglSilbernagl, , AgamemnonAgamemnon DespopulosDespopulosATLAS FYZIOLOGIE ČLOVĚKA

Jan Jan ŠŠmardamardaBIOLOGIE PRO PSYCHOLOGY A PEDAGOGY

Page 3: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

ŽŽIVOT A JEHO CHRAKTERISTIKAIVOT A JEHO CHRAKTERISTIKA

- život je vázán na hmotu a mimo ní neexistuje - substancí života je živá hmota- živá hmota se charakteristicky odlišuje od neživé

Charakteristika živých soustav• specifické chemické složení• vysoce organizované, strukturálně složité

a hierarchicky uspořádané• při jednotném stavebním plánu má nesmírnou variabilitu• prostorově ohraničené systémy

(systém otevřený × systém uzavřený)• schopnost autoreprodukce, dědičnosti a vývoje• schopnost autoregulace• chemický a energetický metabolismus

Page 4: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

MOLEKULMOLEKULÁÁRNRNÍÍ BIOLOGIEBIOLOGIE

- studuje struktury a interakcí biomakromolekul a jejich vztah k funkcím a vlastnostem živých soustav

- studuje vztah mezi fyzikálně-chemickou a biologickou úrovni

MolekulMolekuláárnrníí genetikagenetika

součást molekulární biologie zabývající se funkcíinformačních makromolekul

Page 5: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

CHEMICKCHEMICKÉÉ SLOSLOŽŽENENÍÍ

BiogennBiogenníí prvkyprvky

Makrobiogenní prvky- organická forma (C, H, O, N, S, P)

- anorganická forma (K, Na, Cl, Ca, Mg, Fe, P)

Oligobiogenní prvky (Cu, Zn, Co, Se...)

VodaVoda• tvoří většinu hmoty živých soustav

• molekula se chová jako elektrický dipól

• tvoří hydratační obal

• schopnost tvořit vodíkové můstky OO OOHH

HHHH

HH

OO HH

HH

HH

HH

OO

++

++

22--

HHHH

OO HH

HHOO

HH

HHOO

HHHH

OO

KK

Page 6: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

CHEMICKCHEMICKÉÉ SLOSLOŽŽENENÍÍ

NNíízkomolekulzkomolekuláárnrníí organickorganickéé lláátkytky

Polární látky- sacharidy

- organické kyseliny

- aminokyseliny

- nukleotidy

Nepolární látky

- uhlovodíky (karoten, steroidy)

- vyšší mastné kyseliny

- fosfolipidy

Page 7: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

CHEMICKCHEMICKÉÉ SLOSLOŽŽENENÍÍ

VysokomolekulVysokomolekuláárnrníí organickorganickéé lláátkytky((biologickbiologickéé makromolekulymakromolekuly))

vznikají kondenzací z látek nízkomolekulárních

POLYSACHARIDYPOLYSACHARIDY

NUKLEOVNUKLEOVÉÉ KYSELINYKYSELINY

BBÍÍLKOVINYLKOVINY

informační makromolekuly

Page 8: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

NUKLEOVÉ KYSELINY

CukryCukry

NukleotidNukleotid

FosfFosfáátt

RNA: kyselina ribonukleovRNA: kyselina ribonukleováá- fosfát + ribóza + (G+C+A+U)

DNA: kyselina deoxyribonukleovDNA: kyselina deoxyribonukleováá- fosfát + deoxyribóza + (G+C+A+T)

DusDusííkatkatéé bbáázeze

PO-

O

NukleozidNukleozid

O-

guanin adenin tymin cytozin uracil

deoxyribóza ribóza

Page 9: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

NUKLEOVÉ KYSELINY

PrimPrimáárnrníí strukturastruktura::

SekundSekundáárnrníí strukturastruktura::

TerciTerciáálnlníí strukturastruktura::

zastoupení a pořadí

nukleotidů

pravotočivá,

antiparalelní

dvojšroubovice

nadšroubovice -superhelix

Page 10: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

- zastoupení jednotlivých druhů aminokyselin a jejich pořadí

- aminokyseliny jsou pospojovány peptidickou vazbou

- každý peptidový řetězec je na jedné straně zakončen -NH2

skupinou (N konec) a na druhém konci –COOH skupinou (C

konec)

- zastoupení a pořadí aminokyselin je pro každý druh

bílkoviny charakteristický

BÍLKOVINYPrimPrimáárnrníí strukturastruktura::

N N N N

H

H

HH

H H

HH

H HOH OH OH

O OO

O

CC C C C CC C

H

RR

RR RR

H2O

++

RR

peptidovpeptidováávazbavazba

Page 11: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

BÍLKOVINY

SekundSekundáárnrníí strukturastruktura::- prostorové uspořádání bílkovin vytvářející se vlivem vodíkových

vazem mezi skupinami -NH- a -CO-

α-helix

β-skládaný list

• řetězec je šroubovitě stočen

• vodíkové vazby propojují

jednotlivé závity šroubovice

• vodíkové vazby propojují

dva vedle sebe ležící

polypeptdické řetězcevodíkpvýmůstek

Page 12: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

BÍLKOVINY

TerciTerciáálnlníí strukturastruktura::- prostorové trojrozměrné uspořádání

polypeptidového řetězce schopné díky

různosti chemické povahy

aminokyselin postranních skupin tvořit

nekovalentní vazby

Globulární proteiny

Fibrilární proteiny

pravidelné střídání α-šroubovice aβ-skládaného listu

převažují segmenty buď α-šrouboviceanebo β-skládaného listu

Page 13: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

BÍLKOVINY

KvartKvartéérnrníí strukturastruktura::

- větší proteiny často

obsahují více než jeden

polypeptidový řetězec

- jejich vzájemné

uspořádání v prostoru

představuje kvartérní

strukturu

Page 14: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

FUNKCE BÍLKOVIN

metabolické strukturní informační• enzymenzym – katalýza rozpadu a tvorby kovalentních vazeb

• strukturnstrukturníí proteinprotein - poskytuje mechanickou oporu buňkám a tkáním

• transportntransportníí proteinprotein – přenáší malé molekuly a ionty

• pohybový proteinpohybový protein – je původcem pohybu buněk a tkání

• zzáásobnsobníí proteinyproteiny – skladuje malé molekuly nebo ionty

• signsignáálnlníí proteinprotein – přenáší informační signály z buňky do buňky

• receptorovýreceptorový proteinprotein - v buňkách detekuje chemické a fyzikálnísignály a předává je ke zpracování buňce

• regularegulaččnníí protein v genovprotein v genovéé expresiexpresi – váže se na DNA a spouštínebo vypíná transkripci

• proteiny se zvlproteiny se zvlášáštntníím poslm posláánníímm – proteiny se specializovanou funkcí (mrazuvzdorný, lepivý, svítivý …)

Page 15: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

BIOMEMBRBIOMEMBRÁÁNYNY

lipidy cukry bbíílkovinylkoviny(fosfatidylcholin,

cholesterol)

(glykoproteiny,

glykolipidy)

Cholin

Fosfát

Glycerol

mastn

ákyselin

a

CH2-N+(CH2)3lCH2l

Ol

O=P-O-lOl

CH2-CH-CH2l lO Ol l

C=O C=O l l

CH2 CH2l lCH2 CH2l lCH2 CH2l lCH2 CH2l lCH2 CH2l lCH2 CH2l lCH2 CH2l lCH2 CHl \\

CH2 CHl \

CH2 CH2l \CH2 CH2i \CH2 CH2l \CH2 CH2l \CH2 CH2l \CH2 CH2l \CH2 CH2l \CH3 CH3

polpoláárnrnííhydrofilnhydrofilnííhlavihlaviččkaka

nepolnepoláárnrnííhydrofhydrofóóbnbníířřetetěězcezce

extracelulární

prostor

cytoplazma

COOH

NH2

lipidová

dvojvrstva

micela

Page 16: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

Hlavní funkce buněčných membrán:1) Ohraničují buňky a buněčné organely

2) Udržují koncentrační a elektrochemickégradienty

3) Zajišťují transport živin a produktů metabolizmu

4) Jsou nositeli antigenů buněk

5) Izolují v ohraničených vezikulách biologicky silně účinné látky

6) Umožňují vznik vzruchu a jeho vedení (svalová a nervová buňka)

BIOMEMBRBIOMEMBRÁÁNYNY

Page 17: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

DIFÚZE • Proces, při kterém se částice v důsledku svého stálého neuspořádaného pohybu snaží vyplnit celý dostupný prostor.

• Pohybují se z oblasti o vysokékoncentraci do míst s nízkoukoncentraci částic.

• Rychlost difúze závisí na transportnívzdálenosti, na výměnné ploše, na povaze difúzní látky a prostředí

MEMBRMEMBRÁÁNOVÝ TRANSPORTNOVÝ TRANSPORTPlazmatická membrána

- odděluje dvě kapalné fáze, které obsahují různé složky- není pro všechny složky stejně propustná, je polopropustná

SEMIPERMEABILNÍ

Page 18: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

MEMBRMEMBRÁÁNOVÝ TRANSPORTNOVÝ TRANSPORT

OSMÓZA

.

.

.

..

.

.

.

..

.

.

....

....

..... ...

... .

...

.

. ....

...

.

...

.

.. .

. H2O NaCl

osmóza

� Difúze molekul rozpouštědla přes semipermeabilní membránu z oblasti o nízkékoncentraci rozpuštěné látky do oblasti s vyššíkoncentraci rozpuštěné látky.

OSMOTICKÝ TLAK – tlak vyvinutý na koncentrovanější roztok potřebný k tomu, aby se zamezilo pohybu rozpouštědla

ONKOTICKÝ TLAK – osmotický tlak vytvářený bílkovinami krevní plazmy

TONICITA – osmotický tlak v relaci ke krevníplazmě• Izotonický (0,9% roztok NaCl, 5% glukóza)• Hypertonický• Hypotonický

OSMOLALITA – koncentrace osmoticky aktivních látek; plasma = 290 mosm/kg H2O

Page 19: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

MEMBRMEMBRÁÁNOVÝ TRANSPORTNOVÝ TRANSPORT1. 1. ProstProstáá difdifúúzeze

� látky rozpustné v tucích- endogenní: prostaglandiny, steroidy, steroidní hormony- exogenní: aspirin, lokální anestetika, alkohol

�malé neutrální molekuly – O2, CO2, částečně H2O

2. 2. PPřřestup iontovými kanestup iontovými kanáályly (usnadn(usnadněěnnáá difdifúúze)ze)

V lipidové dvojvrstvě plazmatické membráněplavou transportní proteiny – iontové kanály• kanál je uvnitř naplněný vodou

• mohou jím difundovat jen molekuly o určitých rozměrech - především maléanorganické ionty: Na+, K+, Cl- a vodaK+

vně

uvnitř

♦ řízenénapětím

♦ řízenéchemicky

♦ řízenéfyzikálními impulsy

♦ stále otevřené

Page 20: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

MEMBRMEMBRÁÁNOVÝ TRANSPORTNOVÝ TRANSPORT3. 3. SpSpřřaažženýený transport (sekundtransport (sekundáárnrněě aktivnaktivníí transport)transport)

Přenášečový transport dvou dějů, z nichž jeden je pasivní, ale je spřažen s jiným, aktivním systémem, který energii spotřebovává

Symport– spřažený transport látek stejným směrem

•Např. Symport iontů Na+ a glukózy,energii pro transport poskytuje koncentrační a potenciálový gradient Na+ udržovaný Na+-K+-ATPázou

vně

uvnitř

Glukóza Na+

Antiport– spřažený transport látek opačným směrem

•Např. Antiport iontu Ca2+ a 3 iontů Na+

vně

uvnitř

Na+

Ca2+

Page 21: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

MEMBRMEMBRÁÁNOVÝ TRANSPORTNOVÝ TRANSPORT

4. 4. AktivnAktivníí transporttransport

Transport látek proti jejich elektrickému

nebo chemickému gradientu, což

vyžaduje přísun energie(ATP ADP + P)

vně

uvnitř

3 Na+

2 K+

�Na+-K+-ATPáza – v každé membráně- elektrogenní účinek- důležitá pro stabilní klidové napětí

�Ca2+-ATPáza – ve svalových a střevních buňkách�H+-ATPáza – v buňkách žaludku

Page 22: BIOLOGICK É VĚDY - Masaryk University · 2007-11-07 · MOLEKUL ÁRN Í BIOLOGIE-studuje struktury a interakcíbiomakromolekula jejich vztah k funkcíma vlastnostem živých soustav

5. 5. EndocytEndocytóózaza a a exocytexocytóózazaMnoho látek (proteiny, cholesterol) nemůže pronikat ani lipidovou dvojvrstvou, ani procházet transportními kanály. Mohou však prostupovat plazmatickou membránou uzavřeny do transportních váčků:

Endocytóza membrána se vchlípídovnitř (invaginuje) a přitom uzavře obsah mimobuněčnétekutiny (proteiny) do nitra buňky

Exocytóza – při kontaktu buněčnétransportní vezikuly s plazmatickou membránou oběmembrány vzájemně splynou a plazmatická membrána se otevře do extracelulárního prostoru

MEMBRMEMBRÁÁNOVÝ TRANSPORTNOVÝ TRANSPORT