Bases Teóricas para el Mejoramiento Genético de Tilapias

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  • Bases Tericas para el Mejoramiento Gentico de

    Tilapias

    THOMAS GITTERLE Ph.D

    CENIACUA

  • Bases Tericas para el Mejoramiento Gentico de Tilapias

    Conceptos bsicos de la gentica poblacional

    Estrategias de mejoramiento

    Tipos de seleccin

    Interaccin genotipo-ambiente

    Programa nacional de mejoramiento de la tilapia en Colombia

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Definiciones Consanguinidad Heterosis Seleccin Mutacin Migracin Deriva Gentica Distancia gentica entre poblaciones Equilibrio Hardy-Weinberg

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Definiciones: Fenotipo: cualquier rasgo medible o distintivo de un

    individuo. Genotipo : Es la informacin gentica del individuo y

    codifica sobre su fenotipo Locus. La posicin de un gen o el gen como tal Alelo. Es una de las formas variantes de un gen en un

    locus Homocigoto. La unin de gametos portadores de dos

    alelos idnticos (AA) o BB Heterocigoto: La unin de gametos portadores de alelos

    diferentes (AB).

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Definiciones:Ej: gen del color en tilapias

    (dominancia incompleta). Tres fenotipos: negro, rojo y

    albino Dos alelos A y B Tres genotipos AA, AB y BB

    Ej: Gen del color en truchas (dominancia completa)

    Dos fenotipos: plateados y albino Dos Alelos A y a Tres genotipos AA, Aa y aa

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Definiciones:Frecuencias Frecuencia allicas. Proporcin de cada alelo individual en la poblacin Dos alelos A y B Freq A (p) + Freq B (q) = 1; p+q =1

    Frecuencias genotpicas: Proporcin de cada una de las las combinaciones allicas en una poblacin: Dos alelos A y B Freq AA (p2) + Freq AB (2pq) + Freq BB (q2)

    p2 + 2pq + q2 = 1

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Consanguinidad

    Se genera al producir progenies de padres emparentados Auto-fertilizacin Cruces entre hermanos enteros o entre hermanos medios

    En poblaciones pequeas y cerradas se produce consanguinidad en el tiempo aunque los cruzamientos sean al azar

  • ConsanguinidadCoeficiente de consanguinidad (F)

    Probabilidad que dos alelos sean idnticos por ascendencia (origen comn)

    La tasa de consanguinidad acumulada (F) por generacin de una poblacin cruzada al azar es:

    eNF

    21

    =

    Donde Ne es el numero de individuos que se reprodujeron efectivamente: es el tamao de una poblacin ideal

  • NF

    21

    =Poblacin ideal hace referencia a: Los cruzamientos se hacen con individuos de la misma lnea (no hay migracin)

    Las generaciones son discretas no se sobreponen

    Los animales reproductores son los mismos en cada generacin y deben transmitir sus genes a la siguiente generacin.

    Los cruzamientos son al azar entre individuos

    No hay seleccin y la mutacin se descarta

    Consanguinidad

  • fm

    fme NN

    NNN

    +=

    4

    Generalmente, el tamao de la poblacin efectiva en tilapias es pequea debido a su alta fecundidad.

    se pueden utilizar muy pocos reproductores para conformar la siguiente generacin de cra

    una acumulacin rpida de la consanguinidad.

    Consanguinidad

    Por ejemplo: con Nm machos y Nf hembras usados en cada generacin el tamao de la poblacin efectiva es:

  • Consanguinidad

    272010

    )20))(10(4(

    =

    +=eN e

    NF

    21

    =

    Ejemplo:

    Si se tiene una proporcin sexual de 1 Macho por 2 hembras

    el numero efectivo de machos reproducindose por da es de

    10 (20 hembras) entonces:

    Segn la frmula:

    F = 1.88% por generacin

  • Consanguinidad

    Ejercicio. En una proporcin sexual de 3 hembras por 1 macho:

    Que numero de hembras y macho son necesarios cruzar por generacin para que el coeficiente de consaguinidad sea menor a 1%

    Formulas

    fm

    fme NN

    NNN

    +=

    4eN

    F21

    =

  • Consanguinidad

    Consecuencias de la consanguinidad:

    aumenta la frecuencia de homocigotos

    expresin de alelos recesivos

    la mayora de deformaciones y algunas enfermedades son

    recesivas

    se expresan mas frecuentemente en poblacin consanguneas

    se afecta el fitness de la poblacin (reproduccin, sobrevivencia

    etc)

    depresin por consanguinidad

  • Consanguinidad

    Poblaciones de O. niloticus Fis

    Naturalizadas 0.8813(0.067)Domesticadas 0.8223(0.023)

    Costa Atlntica Colombiana

    Ejemplos de niveles de consanguinidad: (Fis)

    O.niloticus

    Tomado de Narvaez 2006AIT = Chitralada (Tailandia)

    GIFT = Genetic imporved farmed tilapia (Tailandia)

    IDRC = Tailandia

    GTT = Alemania

    Rutten et al., 2004

  • Consanguinidad

    Ejemplos de niveles de consanguinidad: (Fis)

    Tilapia roja (Llanos, Huila, Valle, Atlntico, Caldas)

    Poblaciones de Tilapia spp Fis

    pob 1 0.4132pob 2 0.3346pob 3 0.3688pob 4 0.3534pob 5 0.4190pob 6 0.2060

    Regiones colombianas

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Exocra o entrecruzamientosEs el efecto contrario a la consanguinidad: Incrementa la freecuencia de heterocigotos

    Reduccin de la probabilidad de expresin de genes recesivos

    Incrementa el Fitness

    Pude expresar Vigor Hbrido

    Funciona en: Cruces entre especies y Cruces entre individuos de la misma especie:

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional Seleccin

    Existe seleccin cuando unos genotipos en particular tienen un mayor xito en reproducirse que otros genotipos.

    Por ejemplo: Alelo A > reproductiva Frq Atiende a incrementarse en la poblacin en el tiempo

  • SeleccinEjemplo de seleccin natural:

    Frq A = 1-q ; Frq a = q

    A completamente dominate; una ventaja selectiva es asumida para los genotipos AA y Aa.

    s = coeficiente de seleccin desventaja sobre otros genotipos

    si el genotipo aa es letal (albinismo en bagre) s = 1

    Si se conocen s y q de una poblacin inicial se puede estimar la frqdel alelo a en las siguientes generaciones como:

    2

    2

    1)1(

    sqqsqqs

    =

  • Seleccin

    1667.0)5.0)(1(1

    )5.01()5.0)(1(2

    2

    =

    = sq

    Ejemplo de seleccin natural:

    si s = 1, y q = 0.5 entonces

    Generacin q = freq a0 0.5001 -0.1667 0.3332 -0.0832 0.2503 -0.0501 0.2004 -0.0334 0.1675 -0.0238 0.1436 -0.0179 0.1257 -0.0139 0.1118 -0.0111 0.1009 -0.0091 0.09110 -0.0076 0.08350 -0.0004 0.019

    100 -0.0001 0.010

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional MutacinLa mutaciones son cambios en las secuencias de los pares de bases del ADN o RNA

    PO Ej: Cambio del alelo A a alelo a

    Mutaciones pueden ser causadas por :Errores en la copia del material gentico durante la divisin celularExposicin a radiacinMutaciones qumicasVirus

    Las mutaciones aunque ocurren en una frecuencia muy baja son unafuente importante de variacin gentica en las especies.

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional Deriva GenticaEs una fluctuacin azarosa de las frecuencias allicas, resultante de un efecto aleatorio de la combinacin de los alelos en poblaciones pequeas.

    Entre mas pequea sea la poblacin mayor es el efecto de de la deriva gentica.

    Ejemplo: 2 padres heterocigotos:

    Aa x AaAA Aa aa(25%) (50%) (25%)

    Si solo se tiene dos progenies y por chance los dos son AA,(p = 0.25 x 0.25 = 0.125) se pierde el alelo a

  • Deriva Gentica

    0

    20

    40

    60

    80

    100

    120

    1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49Generaciones

    N

    u

    m

    e

    r

    o

    d

    e

    c

    e

    r

    d

    a

    s

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Migracin

    En muchas especies existen poblaciones aisladas en sus mayoria por barreras fsicas. Los intercambios genticos entre poblaciones aisladas s ele llama migracin

    Esta cambia le frecuencia genticas de las poblaciones aisladas y su magnitud depende de la cantidad de individuos inmigrantes.

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Distancia Genticas

    Los efectos de la seleccin, mutacin y deriva gentica hacen que las poblaciones aisladas experimente una divergencia en las frecuencias allicas.

    La distancia gentica sirve para evaluar que tanto las poblaciones se han mantenido aisladas y como ha sido el flujo gentico entre ellas.

    Para evaluar las distancia se utiliza comnmente el valor de distancias genticas de Nei (D)

  • Tomado de Narvaez 2006

  • Conceptos Bsicos de la Gentica Poblacional

    Equilibrio Hardy-Weinberg

    Las frecuencias genotpicas de un locus de una poblacin cruzada al azar en ausencia de migracin, seleccin y mutacin permanecen constantes de una generacin la siguiente.

  • Equilibrio Hardy-Weinberg

    Estimar si una poblacin esta o no en equilibrio de Hardy-Weinberg sirve para: Aceptar la presuncin de cruzamientos al azar Evaluar la presencia de factores que estn alterando la frecuencia allicas como: Patrones de cruzamientos no azarosos Evidencia de consanguinidad Evidencias de Seleccin, Mutacin, Migracin o Deriva Gentica

    Evidencia de una poblacin cerrada muy pequea

  • En una poblacin dada: 1 gen con 2 loci A y B,Freq alelicas A = p

    de a = q; p+q= 1

    Posibles genotpos: AA, Aa, aaFrecuencia genotpica con dos alelos p2 + 2pq + q2 = 1

    Freq A = 0.7 Freq. a = 0.3Freq AA = 0.49; Freq aa = 0.09 y Freq Aa = 0.420.49 + 0.09 + 0.42 = 1

    Equilibrio Hardy-Weinberg

  • Derivacin y prueba de hiptesis

    Ejemplo Prctico:

    Tres genotipos:

    AA tilapia negra

    Aa Tilapia roja

    aa Tilapia albina

    Total animales = 1612:

    1469 son negros (AA) 138 rojos (Aa) 5 albinos (aa)

    Estimar la frecuencia de A y a

    Equilibrio Hardy-Weinberg

  • Derivacin y prueba de hiptesis

    ))()()((2)()(2

    aaobsAaobsAAobsAaobsAAobsp

    ++

    +=

    Total animales = 1612:

    1469 son negros (AA) 138 rojos (Aa) 5 albinos (aa)

    Estimar la frecuencia de A = p y a = q

    )51381469(2138)1469(2

    ++

    +=p

    32243076

    =p

    p = 0.954

    q = 1 p

    q = 0.046

    Equilibrio Hardy-Weinberg

  • Derivacin y prueba de hiptesis

    Total animales = 1612: 1469 son negros (AA) 138 rojos (Aa) 5albinos (aa)

    Estimar la frecuencia de A = p y a = q

    p = 0.954 q = 0.046Los valores esperados por la ley de H-W son:

    Equilibrio Hardy-Weinberg

  • Equilibrio Hardy-Weinberg

    Prueba de chi cuadrado para aceptar o rechazar la hiptesis nula: no hay diferencias entre las frecuencias allicas de los valores esperados y los observados se cumple el supuesto que la poblacin esta en equilibrio H-W

    83.0756.0073.0001.0

    4.3)4.35(

    2.141)2.141138(

    4.1467)4.14671469(

    )(

    222

    22

    =

    ++=

    +

    +

    =

    = EEO

    Valores observados 1469 (AA) 138 (Aa) 5 (aa)

    Valores esperados por H-W: 1467.4 (AA) 141.2 (Aa) 3.4(aa)

  • Equilibrio Hardy-Weinberg

    83.0756.0073.0001.0

    4.3)4.35(

    2.141)2.141138(

    4.1467)4.14671469(

    )(

    222

    22

    =

    ++=

    +

    +

    =

    = EEO

    Grados de libertad = (# fenotipos) (# alelos): 3 -2 = 1

    El valor para un valores de se significancia de 0.05 en un grado de libertad = 3.84

    Como 0.83 < 3.88 entonces se acepta la hiptesis nula: La poblacin se encuentra en equilibrio de H-W

  • Tomado de Narvaez 2006

    Heterocigosidad esperada (He) y observada (Ho) de poblaciones de tilapia niltica en la Costa

    Atlntica colombiana

  • Heterocigosidad esperada (He) y observada (Ho) de cuatro poblaciones de tilapia niltica

    AIT = Chitralada (Tailandia)

    GIFT = Genetic imporved farmed tilapia (Tailandia)

    IDRC = Tailandia

    GTT = Alemania Rutten et al., 2004

  • Heterocigosidad esperada (He) y observada (Ho) de cuatro poblaciones de tilapia roja (Regiones

    colombianas)

    Poblaciones de Tilapia spp Obs_Het Exp_Het*

    pob 1 0.4200 0.7230pob 2 0.4542 0.6898pob 3 0.4542 0.7271pob 4 0.5347 0.8355pob 5 0.4375 0.7609pob 6 0.4583 0.5833

    Regiones colombianas

  • Estrategias de mejoramiento

    A.Mejoramiento convencionalEndo y Exo cra

    Variabilidad gentica no aditiva

    Efectos de combinacin de genes

    Seleccin Variabilidad gentica aditiva

    B.Estrategias genmicasManipulacin cromosmica

    PolyploidiaReversin sexual

    Transgenesis OGMHormonas de crecimientoTolerancias al frio

  • Estrategias de Mejoramiento

    Conceptos bsicos Gentica aditiva Gentica no aditiva

    Epistasis Dominancia

    Endocra Exocra Seleccin

  • Estrategias de Mejoramiento

    Conceptos bsicos Gentica aditiva

    Cada locus tiene un valor aditivo sobre el carcter este valor puede ser negativo o positivo

    A A B B

    -a + ad = 0

    A B

    A A B B

    -a + a 0

    A B

    d

  • Estrategias de Mejoramiento Conceptos bsicos

    Gentica no aditiva Dominancia completa y sobredominancia

    A A BB

    -a +a = d0

    A B

    A A BB

    -a +a 0

    A B

    d

  • Estrategias de Mejoramiento

    Conceptos bsicos Gentica no aditiva

    Eptasis Interaccin de genes

    A B

    CC

    A A

    Cc

    +a 0

  • Estrategias de MejoramientoEndocra

    Produccin de lneas consanguneas para aplicar entrecruzamientos y asi explotar la gentica no aditiva epstasisy dominancia)

    La consanguinidad en general es daina muchas lineasSe aplica en pollos y gallinas en conjunto con la entrecruzamiento

    para diseminacin al sector productivo Para proteccin de material gentico Alto chance de depresin por consanguinidad. Endocria sin seleccin no causa ningn beneficio adicional al de reestablecer la varianza gentica.

    Es buena cuando existe sobredominancia

  • Estrategias de MejoramientoExocra o entrecruzamiento

    Es un sistema muy utilizado en acuicultura. El entrecruzamiento se puede hacer entre. Especies Lneas seleccionadas Poblaciones Lneas consanguneas

  • Exocra o entrecruzamiento

    Efectos de la exocra: Heterosis

    Vigor hibrido: Las progenies tienen un desempeo superior a las lneas parentalesEn acuacultura la heterosis ha sido poco utilizada a excepcin de las tilapias:

    Por Ejemplo:Cruces entre O.aureus x O.spilurus y entre O. Mossambicus x O. niloticus presentaron 22% y 25% de heterosis para peso respectivamente

    Cruces entre O. Mossambicus x O. niloticus presentaron una tolerancia mayor a la salinidad que las especies parentales.

  • Heterosis cruzando diferentes lneas de la misma especie

    Bentsen et al. 1998

  • Heterosis cruzando diferentes lneas de la misma especie

    Maluwa et al. 2006

  • Exocra o entrecruzamiento

    Mtodos de entrecruzamientos: Habilidad Combinatoria

    Habilidad combinatoria general (HCG) Efecto promedio de la combinacin de una lnea con otras

    lneas o poblaciones Ejemplo cuatro lneas A, B , C y D

    A B C DA AB AC AD S1.B BA BC BD S2.C CA CB CD S3.D DA DB DC S4.

    S.1 S.2 S.3 S.4 S

    macho

    H

    e

    m

    b

    r

    a

  • Exocra o entrecruzamientoEjemplo cuatro lneas A, B , C y D

    HCG (A) = 1/6 (S1. + S.1) S/12

    = 1/6 (426+ 421) - 1600/12

    = 141 - 133 = 8

    A B C DA AB AC AD S1.B BA BC BD S2.C CA CB CD S3.D DA DB DC S4.

    S.1 S.2 S.3 S.4 S

    macho

    H

    e

    m

    b

    r

    a

    S1. 426 S.1 421S2. 387 S.2 399S3. 394 S.3 389S4. 392 S.4 391

    S 1600

    Ejercicio:

    Estimar la HCA de:

    B, C y D

  • Exocra o entrecruzamiento

    Mtodos de entrecruzamientos: Habilidad Combinatoria

    Habilidad combinatoria especfica (HCE) Cada combinacin de lneas debe tener un valor esperado:

    suma de las HCG de cada lnea. Si este valore se desva de los esperado entonces estas dos

    lneas presentan habilidad combinatoria especfica. Esta habilidad esta dada por la epstasis y la dominancia

    A B C DA AB AC AD S1.B BA BC BD S2.C CA CB CD S3.D DA DB DC S4.

    S.1 S.2 S.3 S.4 S

    machoH

    e

    m

    b

    r

    a

    Ejemplo cuatro lneas A, B , C y D

  • Exocra o entrecruzamientoEjemplo cuatro lneas A, B , C y D

    HCE (A x B) = AB HCG (A) HCG(B) S/12

    = 145 8 (-2) 133

    = 6

    HCE (B x A) = BA HCG (A) HCG(B) S/12 = 137 8 (-2) 133

    = -2

    S 1600

    Ejercicio:

    Estimar la HCE de:

    (B x C) y (C x B)

    A B C DA AB 145 AC 143 AD 138B BA 137 BC 121 BD 130C CA 145 CB 126 CD 123D DA 139 DB 128 DC 126

    Macho

    H

    e

    m

    b

    r

    a

  • Exocra o entrecruzamiento

    Mtodos de entrecruzamientos: Seleccin reciproca recurrente (SRR).

    Esta diseada para optimizar y mejorar ambos tipos de habilidad combinatoria.

    Ejemplo. 2 poblaciones (A y B) en las que se sabe que al cruzarlas existe heterosis

    A1 x B1 B10 x A10 A2 x B2 B11 x A11

    . .

    . . An x Bn Bnn x Ann

  • Exocra o entrecruzamiento

    Mtodos de entrecruzamientos: Seleccin reciproca recurrente (SRR).

    A1 x B1 B10 x A10 A2 x B2 B11 x A11

    . .

    . . An x Bn Bnn x Ann

    Se evalan las progenies

    Se seleccionas aquellos parentales con las mejores cruces

    Se descartan todos los dems

    Se descartan las progenies

    Se cruzan los individuos de las misma lneas entre si (AxA) y (BxB)

    Con los cruces se vuelve a repetir el procedimiento

    Estrategia interesante para tilapia

    GIFT x Chitralda X Fast

  • Estrategias de Mejoramiento

    Seleccin Es la estrategia mas utilizada: Se basa en la gentica aditiva. Se seleccionan los individuos con los mejores desempeos Incremento en la frecuencia de los alelos beneficiosos para el

    caracter a mejorar Los individuos que poseen frecuencias mayores de alelos positivos se

    dice que tiene un alto valor de cria.

    El valor de cra de cada individuo no se conoce

    Se puede estimar con diferentes niveles de precisin dependiendo de el mtodo a utilizar

  • Caractersticas de importancia econmica

    En algunos casos genes mayores pueden presentarse inicialmente, pero se fijan pronto en la poblacin bajo seleccin

    (Bentsen, 1994)

    Multifactorial: Afectados por un gran nmero de genes con efectos individuales pequeos

  • Principios de seleccin

    Proporcinseleccionada

    Media

    F

    r

    e

    c

    u

    e

    n

    c

    i

    a

    Peso de cosecha

    M0 M1

    G

    }

    Peso de cosecha

  • La respuesta de seleccin es acumulativa.

    Generaciones

    D

    e

    s

    e

    m

    p

    e

    o

    10 2 3 4

    Ganancia gentica

  • Incremento de la eficiencia de produccin

    100

    200

    300

    P

    r

    o

    d

    u

    c

    t

    i

    v

    i

    d

    a

    d

    ,

    %

    (

    R

    e

    f

    .

    (

    1

    9

    4

    0

    )

    1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000

    Pollos

    Ganado

    Cerdo

    Ao (Modificado de Eknath et al., 1991

    Salmn

    Tilapia

  • Heredabilidad

    fenotipo (P) = genotipo (G) + ambiente (E)

    G = genes aditivos (A) + genes no aditivos (C)

    Varianzas: VP = VA + VC + VE

    Heredabilidad (h2) = VA / VP= VA/ (VA+VC+VE)

  • Heredabilidad

    Heredabilidad (h2) = VA / VP

    Heredabilidades entre 0 y 0.10 bajas

    entre 0.10 y 0.30 medias

    arriba de 0.30 altas

  • Parmetros genticos en la tilapia niltica

    Caracter Heredabilidad Referenciapeso (35 g) 0.56 Bolivar et al., 2002peso (180 g) 0.34 Ponzoni et al., 2005peso (800 g) 0.26 Rutten et al., 2005Filete(%) (800 g) 0.12 Rutten et al., 2006

  • Bases Tericas para el Mejoramiento Gentico de

    Tilapias

    THOMAS GITTERLE Ph.D

    CENIACUA

  • Bases Tericas para el Mejoramiento Gentico de

    Tilapias

    THOMAS GITTERLE Ph.D

    CENIACUA

    Da 2

  • Repaso Conceptos bsicos de la gentica poblacional Definiciones Consanguinidad Heterosis Seleccin Mutacin Migracin Deriva Gentica Distancia gentica entre poblaciones Equilibrio Hardy-Weinberg

  • Repaso Estrategias de mejoramiento Conceptos bsicos

    Gentica aditivaGentica no aditiva

    Epistasis Dominancia Endocra Exocra Seleccin

  • Mtodos de Seleccin Seleccin individual o masal:

    Basada en el desempeo propio del individuo

    Desviacin del individuo de la media de toda la poblacin

  • Mtodos de SeleccinSeleccin individual o masal:

    Para caracteres registrados en animales vivos No se necesita informacin de ancestros ni familiares No se requiere marcacin Bajo costos Todos los candidatos debe evaluarse en el mismo

    ambiente No se necesita expertos calificados Eficiente solo en caracteres con altas heredabilidades

  • Mtodos de Seleccin

    Seleccin individual o masal:

    Eficiente solo en caracteres con altas heredabilidades Precisin de seleccin: Correlacin (rSA ) entre:el valor de seleccin y el valor de cra real Entre el fenotipo y el valor de cra real (rPA)h2 = rSAh2 = 0.25 rPA= 0.50

  • Mtodos de Seleccin

    Seleccin individual o masal:

    Adems Alto riesgo de consanguinidad

    depresin por consanguinidad No es eficiente para:

    Caracteres binarios Caracteres de baja heredabilidad Caracteres en el cual hay que sacrificar a los individuos

    Cuando las desviaciones ambientales entre individuos a seleccionar son muy grandes (edad, salinidad, sistema de engorde etc.)

  • Mtodos de Seleccin

    Seleccin FamiliarLos reproductores se seleccionan de acuerdo con el desempeo de sus parientes (hermanos medios y enteros) .

  • Mtodos de Seleccin

    Seleccin Familiar

    Se aplica a cualquier tipo de caracter Se utiliza la informacin de parientes Mas eficiente para caracteres de baja heredabilidad

    La media familiar se aproxima a la media gentica la precisin de seleccin es mayor

    Eficiente en caracteres binarios Evaluar en diferentes ambientes Hay un mayor control de la consanguinidad

    Se debe contar con mnimo 50 familias

  • Mtodos de Seleccin Seleccin Familiar

    La precisin de seleccin se ve fuertemente afectada cuando existen desviaciones ambientales comunes a miembros de la misma familia. Se deben mantener las condiciones homogneas Evaluar las familias en ambientes comunes

    Marcacin es necesaria Para que sea eficiente se debe contar con un buen numero de

    individuos por familia Se necesitan expertos calificados Mas costosa Solo se utiliza 50% de la variacin gentica aditiva

  • Mtodos de SeleccinSeleccin Familiar

    La precisin de seleccin (rfA) depende de : La heredabilidad Tamao de la familia Tipo de cruces (hermanos enteros y/o hermanos medios) La variacin del ambiente comn entre hermanos enteros (c2)

    Ejemplo:h2 = 0.25 y c2 = 0.10 rFA = 0.56h2 = 0.25 y c2 = 0.00 rFA = 0.67

  • Mtodos de SeleccinSeleccin combinada

    Se utiliza la informacin de las familias y de los individuos en cada familia

  • Mtodos de SeleccinSeleccin combinada

    Combina las ventajas de la seleccin individual y familiar Se utiliza el 100% de la varianza gentica aditiva Se utiliza toda los tipos de informacin disponibles

    Familias de hermanos medios, enteros y de cada individuo adems de todo el pedigr disponible hasta la fecha

    Reduce la probabilidad de consanguinidad porque no selecciona solo familias sino individuos de varias familias

    Se pueden seleccionar varios caracteres a la vez y combinarlos en un ndice de seleccin

    La precisin de seleccin es similar a la de la seleccin familiar.

  • Mtodos de Seleccin

    Seleccin Intra- Familiar

    Se utiliza la informacin de los individuos dentro de cada familia (desviacin del individuo de su media familiar)

  • Mtodos de SeleccinSeleccin Intra- Familiar

    Es la seleccin opuesta a la familiar Es ventajosa cuando las desviaciones ambientales comunes a

    familias de hermanos enteros son muy grandes Hay un control bueno de la consanguinidad si se hace rotativo

    los cruces entre familias y si el numero de familias es grande

    Solo tiene en cuenta 50% de varianza gentica aditiva La precisin de seleccin es baja:

    h2 = 0.25 rTA =1/2h2 rTA = 0.35

  • Mtodos de SeleccinSeleccin por progeniesSe seleccionan parentales dependiendo del desempeo de sus progenies

  • Mtodos de SeleccinSeleccin por progenies

    Es el mtodo mas directo de medir los valores de cra y el nico que puede dar una rTA = 1 independiente de la heredabilidad

    Es poco aplicada en acuacultura porque Aumenta los intervalos generacionales En pocas especies los reproductores aun estn disponibles cuando se tiene la informacin comercial de sus progenies

    Deben ser mltiples desovadotes

    Puede ser interesante en tilapia

  • Prediccin de la ganancia gentica

    DG = ganancia gentica anuali = intensidad de seleccinr = precisin de seleccinsp = desviacin estndar fenotpicaL = intervalo generacional

    DG = i*r*sP/L en donde:

    dF = depresin por consanguinidad

    - dF

  • Prediccin de la ganancia gentica

    G = ganancia gentica anuali = intensidad de seleccinr = precisin de seleccinsG = desviacin estndar genotpicaL = intervalo generacional

    G = i*r*sP/L Ejercicio:Estimar G para la seleccin individual,

    familiar e intrafamiliar cuando h2 = 0.25

    1. Intensidad de seleccin = 1.5 desviaciones estndares

    2. Desviacin estndar genotpica = 16

    3. Intervalo generaciones = 0.8

  • 02000

    4000

    6000

    8000

    10000

    12000

    0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24Meses

    P

    e

    s

    o

    ,

    g

    r

    a

    m

    o

    s

    Salmn del Atlntico desempeo de crecimiento

    Gen 0

    Gen 5

  • Penaeus vannamei.Respuestas de seleccin en peso de cosecha

    Generaciones

    P

    e

    s

    o

    d

    e

    c

    o

    s

    e

    c

    h

    a

  • Ganancia gentica: Diferencia entre grupos seleccionados y grupos control ajustados por edad, sexo y ambiente

    de engordeGene-

    ration

    LSM of body weight at

    harvest (g)

    Genetic gain in

    % of the previous

    generationControl Selected

    G1 41.80.8 50.20.2 20.1

    G2 85.52.4 97.90.2 14.5

    G3 136.03.9 149.00.6 9.6

    G4 103.41.5 123.60.6 9.0

    G5 133.72.0 153.61.2 14.9

    Tomada de Bentsen 2003

  • Respuesta de Seleccin del Programa de Mejoramiento de Tilapia en las Filipinas

    Bolivar et al., 2002

  • Interaccin Genotipo Ambiente (GxE)

    Se dice que existe GxEcuando el desempeo de los genotipos varan dependiendo del medio en que estos son evaluados.

    Ninguna especies esta adaptada a todos los ambientes

    genotipo A

    genotipo B

    Ambiente 1 Ambiente 2

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)

    Wohlfarth 1983

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)

    Dos tipos de interaccin: Cuando las diferencias entre

    genotipos se reducen dependiendo de la ambiente

    Cuando el mejor genotipo en un ambiente no lo es en otro ambiente

    genotipo A

    genotipo B

    Ambiente 1 Ambiente 2

    genotipo A

    genotipo B

    Ambiente 1 Ambiente 2

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)Cuando se produce semilla se quiere que esta se comporte bien

    en varios tipos de ambientes diferentes

    Que sea robusta a fluctuaciones del ambiente Las fluctuaciones son generalmente factores de estrs

    (salinidad, temperatura, oxigeno etc) Para esto los animales y las estimaciones de los valores de

    cra deben ser realizadas en los ambientes de engorde mas representativos de la industria Piscinas de tierraJaulas flotantes Condiciones de salobridad

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)

    Se necesita estimar la magnitud de (GxE)

    P = G + E + COVGE

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)

    Generalmente los programas de mejoramiento a gran escala no estn diseados para seleccionar animales solo para un ambiente de engorde.

    La eficiencia del mejoramiento depende, entre otras cosas, de lamagnitud de GxE

    Para minimizar GxE se debe reducir las fluctuaciones ambientales

    evitar evaluar las familias o genotipos en ambientes muy variados.

    Se debe restringir a los ambientes mas representativos de la industria

    Si la GxE es gran parte de la varianza fenotpica se deben crear lneas especficas para cada ambiente

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)Ejemplos de (GxE) Tilapia

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)Ejemplos de (GxE) Tilapia

  • Interaccin genotipo ambiente (GxE)

    Harvest weight, grams

    9

    10

    11

    12

    13

    14

    15

    16

    17

    Oceanos13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24

    r=0,87r=0,87

    Cart

    age

    ner

    a

    Harvest weight, grams

    Ejemplos de (GxE) Camarn (P.vannamei)

    -2.5

    -2

    -1.5

    -1

    -0.5

    0

    0.5

    1

    1.5

    2

    2.5

    -4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 5

    VC familias Oceanos

    V

    C

    f

    a

    m

    i

    l

    i

    a

    s

    C

    a

    r

    t

    a

    c

    u

    a

    r = 0.50

    Lote 1 Lote 18

  • Pasos para el establecimiento de un programa de mejoramiento gentico

    Establecimiento de la poblacin base Incluir animales de poblaciones con alta variabilidad gentica

    Evaluacin de la (co)varianzas genticas de las caractersticas a mejorar.

    Definicin del objetivo de cra (caractersticas a incluir y estrategias de seleccin)

    Seleccin de mejores individuos Diseminacin al sector productivo de la semilla mejorada

  • PROGRAMA NACIONAL PARA EL MEJORAMIENTO

    GENETICO DE TILAPIA POR MEDIO DE LA SELECCCION

    COMBINADA

  • PLANO ESTACION REPELN

  • Estanques en tierra para cra de reproductores

  • Tanques de produccin de familias

  • Equipos y materiales de marcacin

  • Actividades realizadas

    Adquisicin de poblaciones de O. niloticus

    Poblaciones nacionales

    Poblaciones extranjeras

  • Poblaciones nacionales 6 poblaciones domesticadas

    Caldas (1) Atlntico (1) Llanos orientales (3) Huila (1)

    1 poblacin naturalizada Cinaga de Lorica.

  • Fecha de llegada de las poblaciones

    09-Nov-06P6 Llano04-Oct-06P5 Huila22-Sep-06P4 _2 Caldas02-Ago-06P4_1 Caldas21-Jul-06P3 LLano19-Jul-06P2 LLano06-Jul-06P1 Atlantico

  • Incremento diario en peso en ambientes y densidades diferentes de 6 poblaciones de O. niloticus

    0.0

    0.5

    1.0

    1.5

    2.0

    2.5

    127.1 147.9 116.6 157 122 62 167

    P1 P2 P3 P4_1 P4_2 P5 P6Peso promedio por poblacin

    I

    n

    c

    r

    e

    m

    e

    n

    t

    o

    d

    i

    a

    r

    i

    o

    (

    g

    )

    0.05.010.015.020.025.030.035.040.0

    D

    e

    n

    s

    i

    d

    a

    d

    (

    a

    n

    i

    m

    a

    l

    e

    s

    /

    m

    2

    )

  • Crecimiento en ambiente comn machos

    Crecimiento en ambiente comn hembras

    Evaluacin comparativa del crecimiento en ambientes comunes

    0.0

    50.0

    100.0

    150.0

    200.0

    250.0

    300.0

    350.0

    400.0

    1 13 42 63

    Intervalos de muestreos (das)

    P

    e

    s

    o

    P

    r

    o

    m

    e

    d

    i

    o

    (

    g

    )

    P1 P2 P3 P4

    0.0

    50.0

    100.0

    150.0

    200.0

    250.0

    300.0

    350.0

    400.0

    1 13 42 63

    Intervalos de muestreo (das)

    P

    e

    s

    o

    p

    r

    o

    m

    e

    d

    i

    o

    (

    g

    )

    P1 P2 P3 P4

    2.2P 42.3P 31.2P 21.1P 1

    Gr/diaPoblacionMachos

    1.7P 41.5P 30.7P 21.1P 1

    Gr/diaPoblacinHembras

  • Actividades realizadas

    Esquema de cruces Pruebas de entrecruzamiento en de parejas

    de Tilapias nilticas en tanques de fibra Pruebas de cruces un macho una hembra Pruebas con hormonas EPC y Oxitocina

  • Pruebas con HormonasTratamientos

    TF= TRATAMIENTO CON OXITOCIMA 0,1 ml ( 10 U.I.) Y EPC 0,5 mg/kg PARA HEMBRAS. MACHOS SIN DROGASTE= TRATAMIENTO CON EPC CON 0,5 mg/kg PARA HEMBRAS y EPC CON 0,25 mg/kg PARA MACHOSTD= TRATAMIENTO CON EPC PARA MACHOS CON 0,5 mg/kg y OXITOCINA PARA HEMBRAS CON 0,1ml (10 U.I)TC= TRATAMIENTO CON EPC PARA MACHOS Y HEMBRAS CON 0,5mg/kgTB= TRATAMIENTO CON OXITOCINA PARA HEMBRAS Y MACHOS CON 0,1ml TA= TRATAMIENTO DE CONTROL SIN DROGAS

    67%46TF13%18TE13%18TD0%08TC0%08TB

    13%18TA

    Porecentajede xitoNde xitosNde replicas Tratamiento

    Resultados

  • Actividades ao 2007 Produccin de familias Evaluacin del crecimiento de las familia Recoleccin de informacin Estimacin de los parmetros genticos para

    peso y sobrevivencia