aybu.edu.tr · Web viewThe structure and properties of nucleic acids, Properties of DNA and RNA, Homogenization Methods, Physical Methods, Chemical methods, Dialysis, Freeze drying

KANSER BİYOLOJİSİ TEZLİ YÜKSEK LİSANS PROGRAMIEk- 1. AKTS Bilgi Formu

YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

TIBBİ BİYOLOJİ ANABİLİM DALI2014-2015 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu: İSG518 Ders Adı: Biyomedikal İstatistikYarıyıl GüzProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProgramıDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları -

Ders Süresi Haftada 2 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Selcen YÜKSELDersin Amacı Bu derste, temel istatistiksel kavramlar ve yöntemler, sağlık alanına özel

örnek ve uygulamalarla öğrenciye kavratılmaya çalışılır.Ders İçeriği Dersin işlenişi öğrenci merkezli bir yaklaşımla yapılır. Tüm öğrenciler

bir hafta öncesinden verilen konuya çalışmış olarak hazırlıklı gelir. İlgili konu öğrencilerin kendi bilim alanlarından örnekler vermesi ve yorumlaması temelinde işlenir.

Dersin Öğrenme Çıktıları Öğrencilere, temel istatistiksel sorunları kendi başına çözebilme, yorumlayabilme ve kendi alanındaki literatürde yer alan istatistiksel çözümlemeleri kavrayıp eleştirel olarak yorumlayabilme becerisi kazandırılmaya çalışılır. Bu dersi alan öğrenciler, ileri düzeyde alacakları diğer istatistik derslerinde daha başarılı olabilecek ve diğer istatistiksel derslerde kendilerini daha kolay geliştirebileceklerdir.

Haftalık Ders ProgramıHafta Konular

1. Temel istatistiksel kavramlar, istatistik, biyoistatistik, biyoistatistiğin kullanım alanları, evren, örneklem, istatistik, parametre, veri, değişken, veri tipleri vb.

2. Tanımlayıcı istatistikler; verilerin sınıflandırılması, ortalama ve konum ölçüleri, histogram, çubuk grafik, dal-yaprak grafiği vb.

3. Tanımlayıcı İstatistikler: yaygınlık ölçüleri, kutu-çizgi grafikleri, ortalama ve standart sapma grafikleri vb.

4. İlişkilerin tablo ve grafiklerle incelenmesi: Çapraz tablolar, ortalamaya göre tablolar, temel grafik gösterimlerin çok değişkenli uygulamaları, saçılım grafikleri vb.

5. Kuramsal dağılışlar: Normal dağılım, binom dağılımı, poisson dağılımı. Normallik testleri ve grafikleri.6. Örneklem dağılışları ve güven aralıkları: Ortalamanın ve oranın örneklem dağılışı, güven aralıkları, yorumları.7. Araştırma ve Örnekleme Yöntemleri, Farklı araştırma türleri, Farklı örnekleme yöntemleri ve kullanım yerleri.

8. Hipotez testlerine giriş: Hipotez testinin amacı, aşamaları, hataları, p ve alfa değerleri, karar verme süreci, parametrik ve parametrik olmayan hipotez testleri.

9. Hipotez Testleri (Tek Örneklem testleri)10. Hipotez testleri (Bağımsız iki Örneklem testleri)11. Hipotez Testleri (Bağımlı iki örneklem testleri)12. Hipotez Testleri (Bağımsız ve bağımlı k örneklem testleri)13. Korelasyon ve farklı korelasyon katsayıları: Pearson, Spearman, phi, Cramer V, Eta, vb14. Basit ve Çoklu Doğrusal regresyon

Kaynaklar

1. Alpar R. Spor Bilimlerinde Uygulamalı İstatistik.

Nobel Yayın-Dağıtım, Ankara, 2001.

2. Field A. Discovering Statistics Using SPSS. Third Edition

SAGE Publications Ltd

3.Rosner B. Fundementals of Biostatistics. Sixth Edition

Thomson

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer,

ProjeToplam AKTS

2 0 - - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav - -Ödev, Seminer 14 40Uygulama - -Final 1 60

Ek- 2. ECTS Information

YILDIRIM BEYAZIT UNIVERSITYINSTITUTE OF HEALTH SCIENCES

DEPARTMENT OF MEDICAL BIOLOGY2014-2015 ECTS INFORMATION

Course code: ISG 518 Name of course: BiostatisticsYear/ Semester: FallProgram: Master of Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: CompulsoryPrerequisites: GraduateLength of course: 2 hours per weekResponsible for course: Assist. Prof. Dr. Selcen YÜKSEL

Course objectives: Basic statistical concepts and methods are taught to students by examples and applications in health sciences.

Course contents:The course is conducted in a student orientated manner. Students are told to be prepared for the following weeks topics. Students are asked to give and interpret examples related to their disciplines.

Learning outcomes:

Graduates will be able to:Solve the basic statistical problems and interpret on their own.Gain the ability of comprehending and critical thinking about the statistical solutions in the literature of their own field.Succeed in advance statistics courses and improve themselves in other courses of statistics.

Weekly Course FlowWeek Subjects:

1. The basic statistical concepts, Statistics, Biostatistics, application fields of biostatistics, population, sample, parameter, statistics, data, variable, types of variable, etc.

2. Descriptive Statistics: classification of data, mean and measures of location, histogram, bar chart, stem-and-leaf plot and etc.

3. Descriptive statistics: measures of variability, box-plot, graphs of mean and standard deviation, etc.

4. Evaluating the relations by tables and graphs: Cross-tabs, scatter plot, tables for mean, multivariate applications of basic table notations.

5. Theoretical distributions: Normal distribution, binomial distribution, Poisson distribution. Normality tests and graphs.

6. Sample distributions and confidence intervals: Sample distribution of mean and proportion, confidence intervals and interpretations.

7. Research and Sampling Methods, types of researches, types of samplings and applications.

8. Introduction to hypothesis testing: aim and steps of hypothesis testing, error, p and alpha value, decision process, parametric and nonparametric tests.

9. Hypothesis Testing (One-Sample Tests)10 Hypothesis Testing (Independent Two Samples Tests)11. Hypothesis Testing (Paired Two Samples Tests)12. Hypothesis Testing (Independent and Related k Samples Tests)13. Correlation and different correlation coefficients: Pearson, Spearman, phi, Cramer V, Eta, etc.14 Simple Linear Regression and Multiple Linear Regression

Education and Teaching Methods: CreditTheory Practice Lab. Project Assignment Other Total ECTS

2 0 – – – – 2 8Evaluation Criteria: Number Rate (%)

Midterm exam – –Assignment 14 40Project – –Laboratory – –Practice – –Final exam 1 60

Ek- 1. AKTS Bilgi Formu


TIBBİ BİYOLOJİ ANABİLİM DALIAKTS BİLGİ FORMU

Ders Adı Metabolik BiyokimyaDers Kodu KB501Yarıyıl 2013-2014Program Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek LisansDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları YokDers Süresi Haftada 3 saatÖğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Özen ÖZENSOY GÜLERDersin Amacı Bu dersin amacı öğrencilerin metabolizmada gerçekleşen

biyokimyasal olayların normal çalışma düzenini öğrenmesi; başta kanser olmak üzere diğer bazı hastalık ve durumlarda ortaya çıkan metabolik olayları anlayabilmesidir.

Ders İçeriği Enzim kinetiği ve inhibisyonu, glikoliz, oksidatif fosforilasyon, elektron taşıma sistemi, protein karakterizasyonu

Dersin Öğrenme Çıktıları -HaftalıkDersProgramı

Hafta Konular1. Enzimler2. Enzim Kinetiği ve İnhibisyonu3. Kan Biyokimyası4. Su ve Metabolizma5. Kimyasal Reaksiyonlar ve Enerji6. Karbohidratlar7. Aminoasitler ve Proteinler8. Ara sınav9. Glikoliz10. Oksidatif fosforilasyon11. Oksidatif fosforilasyon12. Elektron Transport Sistemi13. Elektron Transport Sistemi14. Seminer15. Final SınavıKaynaklar David L. Nelson, Michael M. Cox. Lehninger Principles of Biochemistry, Fifth edition

ÖğretimYöntemVeTeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer, Proje Toplam AKTS4 3 7 10DeğerlendirmeYöntemivegeçmekriterleri Sayısı Katkısı(%)

AraSınav 1 20Seminer/Makale 1 15Ödev, Seminer 1 15UygulamaFinal 1 50



DEPARTMENT OF MEDİCAL BİOLOGYECTS INFORMATION

Name of course Metabolic BiochemistryCourse code: KB501Year/ Semester: 2013- 2014Program: Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: CompulsoryPrerequisites: NoneLength of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assoc. Prof. Ozen OZENSOY GULER

Course objectives:Objectives of this course is to learn biochemical events which acts on metabolism and to understand metabolic events in the case of diseases such as cancer, autoimmune diseases….etc

Course contents:Enzyme kinetics and inhibition, glycolysis, oxidative phosphorilation, electron transport system, protein characterization

,Learning outcomes: -

Weekly Course FlowWeek Subjects:1. Enzymes2. Enzyme Kinetics and İnhibition3. Blood Biochemistry4. Water and Metabolism5. Chemical Reactions and Energy6. Carbohydrates7. Aminoacids and Proteins8. Midterm exam9. Glycolysis10 Oxidative Phosphorilation11. Oxidative Phosphorilation12. Electron Trasnport System13. Electron Transport System14. Seminary15. Final exam


4 3 7 10Evaluation Criteria: Number Rate (%)

Midterm exam 1 20Assignment 1 15Project 1 15Laboratory – –Practice – –Final exam 1 50




Ders Kodu: KB 503 Ders Adı: Biyokimya ve Moleküler Biyolojide Temel KonularYarıyıl GüzProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProgramıDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları -


Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Ender ŞİMŞEKDersin Amacı Bu derste, Biyokimya ve Moleküler Biyolojide temel konuların teorik

olarak öğretilmesi amaçlanmaktadır.Ders İçeriği

DNA, RNA ve protein izolasyonu ve karakterizasyonu açıklanıp gen ekspresyonu ve düzenlenmesi üzerinde durulacaktır.

Dersin Öğrenme Çıktıları Biyokimya ve Moleküler Biyolojide temel konularını öğrenciye kazandırmak.

Haftalık Ders ProgramıHafta Konular1. Karbohidratlar2. Aminoasitler ve Protein3. Enzimler4. Lipit Metabolizması5. DNA Yapısı ve Replikasyonu6. DNA Fonksiyonu ve İzolasyonu7. Vize8. RNA Yapısı ve İzolasyonu9. Gen İfadesinin Akışı10. Protein Sentezi Yapısı ve Fonksiyonu11. Post-translasyonel Modifikasyonlar12. Epigenetik13. Bakteriyal Transformasyon14. Moleküler Klonlama15. Final Sınavı

Kaynaklar Biochemistry/Stryer, Biochemistry/Lehninger, Lewin's GENES X


ProjeToplam AKTS

3 0 - - 3 10Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 %20Ödev, Seminer 1 %20Laboratuvar - -Uygulama - -Final 1 %60



DEPARTMENT OF MEDICAL BIOLOGYECTS INFORMATION

Course code: KB 503 Name of course: Basic Topics of Biochemistry and Molecular BiologyYear/ Semester: FallProgram: Master of Cancer Biology (Graduate Program with Thesis)Language of instruction: TurkishCategory: CompulsoryPrerequisites: -Length of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assist. Prof. Ender ŞİMŞEK

Course objectives: This course is intended to teaching the Basic Topics of Biochemistry and Molecular Biology.

Course contents: DNA, RNA and protein isolation and characterization will beexplained and also focused on the gene expression and regulation.

Learning outcomes: To gain students basic topics of Biochemistry and Molecular Biology.Weekly Course Flow

Week Subjects:

1.CarbohydratesDNA structure and replication

2. Amino Acids and Proteins

3. Enzymes

4. Lipid Metabolism

5. DNA Structure and Replication

6. DNA function and Isolation

7. Midterm exam

8. RNA Isolation and Structure

9. The flow of gene expression

10 Structure and Function of Protein Synthesis

11. Post- translational Modifications

12. Epigenetics

13. Bacterial Transformation

14. Molecular Cloning

15. Final ExamEducation and Teaching Methods:

Credit

Theory Practice Lab. Project Assignment Other Total ECTS3 0 – – – – 3 10

Evaluation Criteria: Number Rate (%)Midterm exam 1 % 20Assignment 1 % 20Project – –Laboratory – –Practice – –Final exam 1 % 60




Ders Kodu: KB 505 Ders Adı: Moleküler Araştırmalarda Güncel MetotlarYarıyıl BaharProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProgramıDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları -


Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Ender ŞİMŞEKDersin Amacı Bu ders, moleküler araştırmalarda kullanılan güncel metotların teorik

olarak öğretilmesini amaçlamaktadır.Ders İçeriği Ders, DNA ve RNA’nın izolasyonları ve kalitatif&kantitatif tayinleri,

elektroforez tipleri, blotlama teknikleri, genetik ekspresyon ve mutagenez konularını içermektedir.

Dersin Öğrenme Çıktıları Moleküler araştırmalarda kullanılan güncel metotları öğrenciye kazandırmak.

Haftalık Ders ProgramıHafta Konular1. DNA İzolasyon Yöntemleri2. RNA İzolasyon Yöntemleri3. DNA’nın kalitatif ve kantitatif tayini4. RNA’nın kalitatif ve kantitatif tayini5. Elektroforez prensipleri ve tipleri6. Blotlama Teknikleri7. İmmünopresipitasyon8. Vize9. Gen Transferleri10. Genetik Ekspresyon11. miRNA&siRNA12. İn vitro Mutagenez13. Genetik Polimorfizm belirleme yöntemlerinin öğretilmesi14. Literatür araştırmaları15. Final

Kaynaklar

Bilimsel Makaleler (SCI / SCI-expanded)

Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler (Prof.Dr. Güler Temizkan, Prof.Dr. Nazlı Arda)

Laboratory Investigations in Molecular Biology


ProjeToplam AKTS

3 0 - - 3 10Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 %20Ödev, Seminer 1 %20Laboratuvar - -Uygulama - -Final 1 %60



DEPARTMENT OF MEDICAL BİOLOGYECTS INFORMATION

Course code: KB 505 Name of course: Current Methods in Molecular Researchs

Year/ Semester: SpringProgram: Master of Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: CompulsoryPrerequisites: -Length of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assist. Prof. Ender ŞİMŞEK

Course objectives: This course aims to teach current methods used in molecular researchs.

Course contents:This course include DNA and RNA isolation and quantitative & qualitative determination, electrophoresis types, blotting techniques , genetic expression and mutagenesis issues.

Learning outcomes: To gain students current methods used in molecular researchs.


1. DNA Isolation Methods

2. RNA Isolation Methods

3. Qualitative and quantitative analysis of DNA

4. Qualitative and quantitative analysis of RNA

5. Electrophoresis principles and types

6. Blotting Techniques

7. Immunoprecipitation

8. Midterm Exam

9. Gene Transfers

10 Genetic Expression

11. miRNA&siRNA

12. In vitro Mutagenesis

13. Teaching the genetic polymorphism detection method

14. Literature research

15. Final ExamEducation and Teaching Methods: Credit

Theory Practice Lab. Project Assignment Other Total ECTS3 0 – – – – 3 10

Evaluation Criteria: Number Rate (%)Midterm exam 1 %20Assignment 1 %20Project – –Laboratory – –Practice – –Final exam 1 %60




Ders Adı: Tümör Biyolojisinde Temel KavramlarDers Kodu: KB507Yarıyıl BaharProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProgramıDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları -


Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Ender ŞİMŞEKDersin Amacı Bu derste, tümör oluşumu ve gelişimine dair temel kavramların

öğrenciye kazandırılması amaçlanmıştır.Ders İçeriği Dersin içeriğinde tümör oluşumu, tümör gelişimi basamakları, kanser

genetiği konuları üzerinde durulacaktır.Dersin Öğrenme Çıktıları Öğrencilere kanser biyolojisine dair temel kavramları kazandırabilmek.

Haftalık Ders ProgramıHafta Konular1. Hücre Biyolojisi2. Kanserin Doğası3. Kanser Hücresinin Özellikleri4. Hücre Döngüsünün Kontrolü5. Onkogenler6. Tumor Supresor Genler7. Vize8. p53 ve Apoptoz9. Hücre Ölümsüzlüğü ve Tümorogenez10. Çok Basamaklı Tümorogenez11. İnvasyon ve Metastaz12. Tümör İmmunolojisi13. Geleneksel Kanser Tedavileri14. Final

Kaynaklar

1. The Biology of Cancer, Robert A. Weinberg

2. Molecular Cell Biology 6th. Edition


ProjeToplam AKTS

3 0 - - 3 10Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)Ara Sınav 1 20Ödev, Seminer 1 20UygulamaFinal 1 60




Name of course Basic Topics of Tumor BiologyCourse code: KB507Year/ Semester: SpringProgram: Master of Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: CompulsoryPrerequisites: -Length of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assist. Prof. Dr. Ender ŞİMŞEKCourse objectives: Objectives of this course is to learn the basic concepts regarding cancer biology

Course contents: Cancer biology, cancer epidemiology, cancer genetics, cancer biochemistry, cancer stem cells, general information about cancer types

Learning outcomes: Graduates will be able:To give the students basic concepts regarding the biology of cancer

Weekly Course FlowWeek Subjects:1. The Biology Of Cell2. The Nature of Cancer3. Cancer Hallmarks4. Control Of The Cell Cycle5. Oncogenes6. Tumor Suppressor Genes7. Midterm exam8. p53 and Apoptosis9. Cell İmmortalization and Tumorigenesis10 Multi-Step Tumorigenesis11. İnvasion and Metastasis12. Tumor Immunology13. The Rational Treatment of Cancer14. Final Exam



Midterm exam 1 20Assignment 1 20Project – –Laboratory – –Practice – –Final exam 1 60




DersAdı Hücre BiyolojisiDers Kodu KB508Yarıyıl BaharProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProğramıDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Ön koşulları -Ders Süresi Haftada 2 saatÖğretimEleman(lar)ı Doç.Dr. Ahmet ÇarhanDersin Amacı Bu dersin amacı; öğrencilere, hücre, hücre kompartımanı ve

hücresel olayları tanımlayabilme, fizyolojik ve patolojik olguların mekanizmalarının kavranmasının sağlanması, yorumlanması ve bu alandaki literatürde yer alan bilgileri kavrayıp eleştirel olarak yorumlayabilme becerisi kazandırılmaya çalışılır.

Ders İçeriği Hücre ve hücre bileşenleri, hücre zarı ve zar olayları, hücre iskeleti, hücre döngüsü, hücre ölümü ve yaşamı olayları

Dersin Öğrenme Çıktıları Öğrencilere, hücre, hücre kompartımanı ve hücresel olayları tanımlayabilme, fizyolojik ve patolojik olguların mekanizmalarının kavranmasının sağlanması, yorumlanması ve bu alandaki literatürde yer alan bilgileri kavrayıp eleştirel olarak yorumlayabilme becerisi kazandırılmaya çalışılır.

Haftalık Ders ProgramıHafta Konular1. Hücre Biyolojisine Giriş2. Hücre Bölümleri ve Protein Yönlendirme3. Hücre Bölümleri ve Protein Yönlendirme4. Hücre Zarı ve Hücre Zarı Olayları5. Hücre Zarı ve Hücre Zarı Olayları6. Hücresel Birleşkeler, Hücre Yapışma Molekülleri, Hücre Dışı Matriks ve Hücre İskeleti7. Hücresel Birleşkeler, Hücre Yapışma Molekülleri, Hücre Dışı Matriks ve Hücre İskeleti8. Hücresel Birleşkeler, Hücre Yapışma Molekülleri, Hücre Dışı Matriks ve Hücre İskeleti9. Seminer-I10. Hücre Döngüsü11. Hücre Döngüsü12. Hücre Ölümü13. Hücre Ölümü ve Yaşamı14. Seminer-II15. Final SınavıKaynaklar 1. The Cell, Alberts, 5th ed.

2. Hücresel Moleküler Biyoloji, Alberts, TUBA Yayınları3. Molecular Biology (David Clark)4. The Cell-A Molecular Approach (Hausmann &Cooper)

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer, Proje Toplam AKTS2 0 - 2 4 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)

AraSınav Seminer Makale Yazımı

Seminer/Makale

Ödev, Seminer 2 40UygulamaFinal 1 60




Name of course Cell BiologyCourse code: KB508Year/ Semester: 2014-2015/SpringProgram: Master of Science in Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: GraduateLength of course: 2 hours per weekResponsible for course: Assoc.Prof. Ahmet CARHAN

Course objectives:

Understanding the basics of cell, cellular compartments, cellular events, To able to describe cellular events, To understand, comment and critical review of the mechanisms for physiological and

pathological events To use up-to date literature for critical reviewing of the mechanisms for physiological

and pathological events

Course contents:

Cell ve cellular compartments Cell membrane and events Cell cytoskeleton, cellular junctions and cell adhesion molecules Cell cycle Cell survival and death

Learning outcomes:

Understanding the basics of; cell ve cellular compartments,cell membrane and events, cell cytoskeleton, cellular junctions and cell adhesion molecules, cell cycle, cell survival and death mechanisms through presentation, seminars, literature search and presentation

Students will gain knowledge to understand, comment and critical review of the mechanisms for physiological and pathological events

To gain knowledge to undestand cancer biologyWeekly Course Flow

Week Subjects:1. Introduction to Cell2. Cellular Compartments and Protein Sorting3. Cellular Compartments and Protein Sorting4. Cellualr Membrane and membrane events5. Cellualr Membrane and membrane events6. Cellular Junctions, Cell Adhesion Molecules, Extracellular Matrix, Cell Cytoskeleton7. Cellular Junctions, Cell Adhesion Molecules, Extracellular Matrix, Cell Cytoskeleton8. Cellular Junctions, Cell Adhesion Molecules, Extracellular Matrix, Cell Cytoskeleton9. Seminar-I10 Cell Cycle11. Cell Cycle12. Cell Death13. Cell Death and Survival14. Seminar-II15. Final exam


2 0 – – 2 – 4 8Evaluation Criteria: Number Rate (%)

Midterm exam - -Assignment 2 40Project – –Laboratory – –Practice – –Final exam 1 60




Ders Adı Kanser Hücresinin HaberleşmesiDers Kodu KB509YarıyılProgram Tıbbi Biyoloji / Kanser BiyolojisiDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları YokDers Süresi 3 saatÖğretim Eleman(lar)ı Prof.Dr.Meltem ÖzgünerDersin Amacı Bu dersin amacı, normal hücrenin ve kanser hücresinin yolaklarında

meydana gelen değişiklikleri incelemektir.Ders İçeriği Kanser Hücresinin haberleşmesi ve sinyal yolakları

Dersin ÖğrenmeÇıktılarıHaftalıkDersProgramı

Hafta Konular1. Kanser haberleşmesi dersine giriş2. Hücre siklusu3. Hücre sinyal yolakları(Genel bilgi)4. Moleküler ve Hücresel biyosinyaller5. Kök hücreler ve Hücre kültür yöntemleri6. Kanser kök hücresi7. Ara sınav8. Ubikitin-proteozom yolağı9. PI3 yolağı10. Otofaji11. Apoptoz12. mTORsinyal yolağı13. MAPK sinyal yolağı14. Final Sınavı15.

ÖğretimYöntemVeTeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer, Proje Toplam AKTS3 saat 0 0 0 3 saat 10 AKTSDeğerlendirmeYöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)

AraSınav Ara sınav 1 %20Ödev, Seminer Ödev 2 %20Uygulama Sunum 1 %10Final Final 1 %50




Name of course HistologyCourse code: KB509Year/ Semester:Program: Medical Biology/Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: CompulsoryPrerequisites: -Length of course: 3 hourResponsible for course: Prof. Dr. Meltem ÖZGÜNER

Course objectives: The aim of the lesson, to teach normal cell signaling pathways and how they differ during cancer process

Course contents: Cancer cell communication and signaling pathways

Learning outcomes:Weekly Course Flow

Week Subjects:1. Introduction2. Cell cycle3. Cell signaling pathways(General information)

4.Molecular and Cellular aspects of biosignals

5. Stem cells and Cell culture methods6. Cancer stem cell7. Midterm exam8. Ubiquitin-proteosome pathways9. PI3 pathways10 Otophagy11. Apoptosis12. mTORpathways13. MAPK pathways14. Final exam

15.Education and Teaching Methods: Credit

Theory Practice Lab. Project Assignment Other Total ECTS3 hour 0 0 0 0 0 3 10 AKTS

Evaluation Criteria: Number Rate (%)Midterm exam 1 %20Assignment 2 %20Project 1 %10Laboratory – –Practice – –Final exam 1 %50




Ders Adı HistolojiDers Kodu KB510YarıyılProgram Tıbbi Biyoloji / Kanser BiyolojisiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları YokDers Süresi 2 saatÖğretim Eleman(lar)ı Prof.Dr.Meltem ÖzgünerDersin Amacı Bu dersin amacı, insan hücresi ve temel dokularının yapısal

temellerini öğrenciye aktarmaktır. Öğrencilere, tıbbın temel bilimlerinden hücre ve doku bilimini öğretmek amaçlanmıştır. İleride alacakları kanser hücre biyolojisine temel oluşturmak esastır.

Dersİçeriği Temel histoloji- İnsan Hücre ve dokularının temel yapısal özellikleri

Dersin ÖğrenmeÇıktılarıHaftalıkDersProgramı

Hafta Konular1. Histoloji tanımı ve temel kavramlar2. Hücrenin bölümleri ve hücre zarı3. Hücre sitoplazması--membranlı organeller4. Hücre sitoplazması- membransız organeller5. Hücre çekirdeği-(nukleus, nukleolus. nukleer membran)6. Hücre bölünmesi-Mitoz.7. Hücre bölünmesi-Mayoz8. Ara Sınav9. Dokular-Epitel doku10. Dokular-Bağ dokusu11. Dokular-Kemik, kıkırdak doku12. Dokular-Kan ve Yağ dokusu13. Dokular-Kas dokusu14. Dokular-Sinir dokusu15. Final SınavıKaynaklar 1. Gartner L. Color text book of Histology. Saunders

2. Junqueira .Basic Histology.12th edition.Lange.3.Ross HM, Pawlina W. Histology. Sixth edition. Lippincott Williams-Wilkins

ÖğretimYöntemVeTeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer, Proje Toplam AKTS2 saat 0 0 0 2 saat 7 AKTSDeğerlendirmeYöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)

AraSınav Ara sınav 1 %20Ödev, Seminer Ödev 2 %20Uygulama Sunum 1 %10Final Final 1 %50




Name of course HistologyCourse code: KB510Year/ Semester:Program: Medical Biology/Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: -Length of course: 2 hourResponsible for course: Prof. Dr. Meltem ÖZGÜNER

Course objectives:The aim of the this lesson,to teach the structure of the human cell and tissues to the students and this lesson will help to understand the basis of cancer biology.

Course contents: Basic Histology-Basic structures of the human cell and tissues

Learning outcomes:Weekly Course Flow

Week Subjects:1. Introduction to Histology

2. Compartments of the cell and cell membrane

3. Cell membrane- membranous organels4. Cell membrane-non-membranous organels

5. Cell nucleus(nucleus, nucleolus, nuclear membrane)

6. Cell division-mitosis7. Cell-division-meiosis8. Midterm exam

9. Tissues-Epithelium tissue

10 Tissues-Connective tissue11. Tissues-Bone and Cartilage tissues12. Tissues-Blood and adipose tissue

13. Tissues-Muscle tissues

14. Tissues-Nervous tissues15. Final exam


2 0 0 0 0 0 2 7Evaluation Criteria: Number Rate (%)

Midterm exam 1 20Assignment 2 20Project 1 10LaboratoryPracticeFinal exam 1 50




Ders Adı İmmünolojiDers Kodu KB512Yarıyıl 2012-2013 BaharProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek LisansDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları YokDers Süresi Haftada 2 saatÖğretim Eleman(lar)ı Prof.Dr. Başak YalçınDersin Amacı Bu dersin amacı öğrencilerin immün sistemin normal çalışma

düzenini öğrenmesi; başta kanser olmak üzere diğer bazı hastalık ve durumlarda ortaya çıkan patolojik mekanizmaları anlayıp değerlendirebilmesidir.

Ders İçeriği İmmün sistemin yapısı, organları, hücre ve elemanları ile işleyişi, İmmün sistemin hastalıklardaki rolü ve fonksiyonu

Dersin Öğrenme Çıktıları -HaftalıkDersProgramı

Hafta Konular1. İmmün sistemin doku ve elemanları ve immün sisteme genel bakış2. Adezyon molekülleri, lökosit migrasyonu, İnflamasyon3. Doğal bağışıklık sistemi ve işleyişi-Seminer4. Antijenler ve antikorlar5. MHC molekülleri, Antijenin işlenmesi ve sunulması6. Lenfosit gelişimi, antijen reseptör gen rearanjmanı7. Hücresel immünitenin efektör mekanizmaları8. B hücre aktivasyonu ve antikor üretimi- Ara Sınav9. Humoral immünitenin efektör mekanizmaları-Seminer10. Sitokinler ve kemokinler11. İmmüntolerans ve otoimmünite-Ara Sınav12. Transplantasyon immünolojisi13. Enfeksiyon immünolojisi14. Kanser immünolojisi15. Final SınavıKaynaklar Abbas A. Cellular and Molecular Immunology 7. baskı, 2012

Male D. Immunology, 8. baskı, 2013ÖğretimYöntemVeTeknikleri

Teori Uygulama Lab Ödev, Seminer, Proje Toplam AKTS2 4 6 7DeğerlendirmeYöntemivegeçmekriterleri Sayısı Katkısı(%)

AraSınav 2 20Seminer/Makale 2 15Ödev, Seminer 2 15UygulamaFinal 1 50




Name of course ImmunologyCourse code: KB512Year/ Semester: 2012- 2013/SpringProgram: Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: Master of Science in Cancer BiologyPrerequisites: NoneLength of course: 2 hours per weekResponsible for course: Prof. Basak Yalcin

Course objectives:Objectives of this course is to learn the functions and mechanisms of immune system under normal circumstances and in the case of diseases such as cancer, infections, autoimmune diseases….etc

Course contents:General properties of immune response, cells and tissues of immune systemRole and functions of immune system in diseases

Learning outcomes: -Weekly Course Flow

Week Subjects:1. Introduction to immunology2. Adhesion molecules, leucocyte migration, inflammation3. Innate immune system-Seminar4. Antigens and antibodies5. MHC molecules, antigen processing and antigen presentation6. Development of lymphoytes, antigen receptor gene rearrangement7. Effector mechanisms of cellular immunity8. Blymhocyte activation and antibody production-Midterm exam9. Effector mechanisms of humoral immunity-Seminar10 Cytokines and chemokines11. Immuntolerans and autoimmunity-Midterm Exam12. Transplantation immunology13. Immunity to infections14. Cancer immunology15. Final exam



Midterm exam 2 20Assignment 2 15Project 2 15LaboratoryPracticeFinal exam 1 50




DersAdı İnsan Genetiği Moleküler YaklaşımlarDers Kodu KB514Yarıyıl 2014-2015/ BaharProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProgramıDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Ön koşulları -Ders Süresi Haftada 2 saatÖğretimEleman(lar)ı Doç.Dr. Ahmet ÇarhanDersin Amacı Bu dersin amacı, temel hücresel olgu ve insan genetiği olaylarını,

mekanizmaları sunum, seminer ve literatür araştırmaları ile öğrenciye kavratmaya çalışmaktır.

Öğrencilere, hücre, genom, genom regülasyonu, kanser genetiği ve etkileyen olgularının mekanizmalarını kavranmasının sağlanması, yorumlanması ve bu alandaki literatürde yer alan bilgileri kavrayıp eleştirel olarak yorumlayabilme becerisi kazandırılmaya çalışılır.

Ders İçeriği Gen ve Genom, kromozom ve yapısı, genom regülasyonu, epigenetik, onkogenler ve tumor supressorler, tanıda yeni laboratuvar yöntemleri)

Dersin Öğrenme Çıktıları Öğrencilere araştırmalarında gen ve genom olaylarını anlayabilmesini sağlama, kanser biyolojisini anlamada bu temel bilgiyi kullanma yeteneğinin kazanılması,Kanser oluşumu, gelişimi ve sonucu ile ilgili konuları moleküler bakış çözebilmeHaftalık Ders Programı

Hafta Konular1. Genom ve Karşılaştırması2. Genom ve Karşılaştırması3. Genom Regülasyonu-Replikasyon4. Genom Regülasyonu-Transkripsiyon5. Genom Regülasyonu-Transkripsiyon6. Genom Regülasyonu-Translasyon7. Genom Regülasyonu-Translasyon8. Seminer-1.hafta9. Kromozom ve yapısı10. Epigenetik-111. Epigenetik-212. Mutasyon ve DNA onarımı13. Onkogen ve Proto-onkogenler14. Seminer -215. Final SınavıKaynaklar 1. The Cell, Alberts, 5th ed.

2. Hücresel Moleküler Biyoloji, Alberts, TUBA Yayınları3. Molecular Biology (David Clark)4. The Cell-A Molecular Approach (Hausmann &Cooper)5. Human Molecular Genetics, 4th ed. (Tom Strachan Andrew Read)

Öğretim Yöntem Ve TeknikleriTeori Uygulama Lab Ödev, Seminer, Proje Toplam AKTS2 2 4 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)

Ara Sınav Seminer Makale Yazımı Seminer/MakaleÖdev, Seminer 2 40UygulamaFinal 1 60




Name of course Molecular Approaches in Human GeneticsCourse code: KB514Year/ Semester: 2014-2015/ Spring TermProgram:Language of instruction:Category: ElectivePrerequisites: GraduateLength of course: 2 hours per weekResponsible for course:

Course objectives:

Understanding the basics of cellular and human genetics events, mechanism through presentation, seminars, literature search and presentation

Students will gain knowledge for cell, genome, genome regulation, cancer genetics To be able to understand, comment and critical reviewing for the mechanisms of

genome regulation, epigenetics and cancer genetics

Course contents: Gene, genome, chromosome and its structure, genome regulation, Epigenetics, oncogenes and tumor supressors, New diagnosis methods in cancer biology

Learning outcomes:

Understanding the basics of cellular and human genetics events, mechanism through presentation, seminars, literature search and presentation

Students will gain knowledge for cell, genome, genome regulation, cancer genetics To be able to solve or create solutions for how cancer occurs or develops To be able to understand, comment and critical reviewing for the mechanisms of

genome regulation, epigenetics and cancer genetics

Weekly Course FlowWeek Subjects:1. Genome and the Comparison2. Genome and the Comparison3. Genome Regulation-Replication4. Genome Regulation- Transcription5. Genome Regulation- Transcription6. Genome Regulation- Translation7. Genome Regulation- Translation8. Seminar-I9. Chromsome and its structure10 Epigenetics-111. Epigenetics-II12. Mutation and DNA repair13. Oncogenes and Proto-oncogenes14. Seminar-II

15. Final exam



Midterm examAssignment 2 40ProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 60


YILDIRIM BEYAZIT ÜNİVERSİTESİSAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜTIBBİ BİYOLİJİ ANABİLİM DALI2013-2014 AKTS BİLGİ FORMU

Ders Kodu KB516 Ders Adı Rekombinant DNA teknikleri IYarıyıl GüzProgram Kanser BiyolojisiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi LisansüstüDersin Ön koşulları -


Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Özen ÖZENSOY GÜLERDersin Amacı Rekombinant DNA tekniklerini kavramakDers İçeriği Nükleik asitlerin yapı ve özellikleri, DNA ve RNA’nın Özellikleri,

Homojenizasyon Yöntemleri, Fiziksel Yöntemler, Kimyasal yöntemler, Diyaliz, Dondurarak kurutma (Liyofilizasyon), Spektral Yöntemler, Radyoizotopların Kullanımı, DNA izolasyonu, Bakterilerden genom DNA’sı İzolasyonu, Bitkilerden Kromozon DNA’sı izolasyonu, Plazmid DNA izolasyonu, Agaroz jel elektroforezi

Dersin Öğrenme Çıktıları Rekombinant DNA tekniklerinin önemini öğrenmekHaftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Nükleik asitlerin yapı ve özellikleri2. DNA ve RNA’nın Özellikleri3. Homojenizasyon Yöntemleri4. Fiziksel Yöntemler5. Kimyasal yöntemler6. Diyaliz7. Dondurarak kurutma (Liyofilizasyon)8. Spektral Yöntemler9. Radyoizotopların Kullanımı10. DNA izolasyonu11. Bakterilerden genom DNA’sı İzolasyonu12. Bitkilerden Kromozon DNA’sı izolasyonu13. Plazmid DNA izolasyonu14. Agaroz jel elektroforeziKaynaklar Genetics: A Conceptual Approach: Benjamin A. Pierce, Lehninger Principles of Biochemistry David L.

Nelson, Michael M. CoxÖğretim Yöntem Ve Teknikleri

Teori Uygulama Lab Ödev, Seminer, Proje

Toplam AKTS

1 - - 1 2 7Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)

Ara Sınav 1 15Ödev, Seminer 1 15UygulamaFinal 1 70




Course code: KB516 Name of course: Recombinant DNA techniques ISemester: Fall semesterProgram: Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: -Length of course: 2 hours perweekResponsible for course: Assoc. Prof. Özen ÖZENSOY GÜLERCourse objectives: To understand the importance of recombinant DNA

techniquesCourse contents: The structure and properties of nucleic acids, Properties

of DNA and RNA, Homogenization Methods, Physical Methods, Chemical methods, Dialysis, Freeze drying (lyophilization), Spectral Methods, Use of Radioisotopes, DNA isolation, Isolation of genomic DNA from bacteria, Isolation of chromosomal DNA from plants, Plasmid DNA isolation, Agarose gel electrophoresis

Learning outcomes: Learn the importance of recombinant DNA techniquesWeekly Course Flow

Week Subjects:

1. The structure and properties of nucleic acids2. Properties of DNA and RNA3. Homogenization Methods4. Physical Methods5. Chemical methods6. Dialysis7. Lyophilization8. Spectral Methods9. Use of Radioisotopes10. DNA isolation11. Isolation of genomic DNA from bacteria12. Isolation of chromosomal DNA from plants13. Plasmid DNA isolation14. Agarose gel electrophoresis

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project, Assignment Total ECTS1 - - 1 2 7Evaluation Criteria: Number Rate (%)

Midterm exam 1 15Assignment, Project

1 15

LaboratoryPracticeFinal exam 1 70



Ders Kodu KB520 Ders Adı Enzim İmmobilizasyonuYarıyıl BaharProgram Kanser BiyolojisiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi LisansüstüDersin Ön koşulları -


Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Özen ÖZENSOY GÜLERDersin Amacı Enzim teknolojisi uygulamalarının önemini kavramakDers İçeriği İmmobilizasyon, Enzim immobilizasyonu nedir?, Enzim

immobilizasyonun serbest enzime göre üstünlükleri, Enzim İmmobilizasyon yöntemleri, Kovalent bağlama, iyonik bağlama yöntemleri, Matrikste Tutuklama, Enzim immobilizasyonun önemi, Enzim immobilizasyonu ve endüstrideki uygulamaları

Dersin Öğrenme Çıktıları Enzim teknolojisi uygulamalarının önemini öğretmekHaftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Enzimler2. Protein izolasyonu ve saflaştırılması3. Enzim Teknolojisi4. Enzim İmmobilizasyonu5. Enzim İmmobilizasyonu6. Enzim İmmobilizasyonu7. Mikrokapsülleme8. Tutuklama metotları9. Çapraz Bağlanma Metotları10. Biyoteknoloji11. Biyomateryaller12. Biyosensörler13. Yapay kromozom, yapay virüs, yapay enzim14. Yapay organKaynaklar Biochemistry/Stryer, Biochemistry/Voet, Immobilization of Enzymes and Cells- Jose M. Guisan


ProjeToplam AKTS

2 - - - 2 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)

Ara Sınav 1 40Ödev, SeminerUygulamaFinal 1 60




Course code: KB520 Name of course: Enzyme ImmobilizationYear/ Semester: SpringProgram: Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: -Length of course: 2 hours perweekResponsible for course: Assoc. Prof. Özen ÖZENSOY GÜLERCourse objectives: To understand the importance of enzyme technology

applicationsCourse contents: Immobilization, What is the immobilization of

enzymes?, The superiority of the free enzyme immobilization of enzymes, Enzyme Immobilization methods, Covalent bonding, ionic binding methods, Immobilization in matrix, The importance of enzyme immobilization, Application in industry of enzyme immobilization.

Learning outcomes: Learn the importance of enzyme technology applications


1. Enzymes2. Protein isolation and purification3. Enzyme Technology4. Enzyme Immobilization5. Enzyme Immobilization6. Enzyme Immobilization7. Microencapsulation8. Immobilization methods9. Cross-Linking Methods10. Biotechnology11. Biomaterials12. Biosensors13. Synthetic chromosomes, Synthetic viruses, Synthetic enzymes14. Synthetic organs

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project, Assignment Total ECTS2 - - - 2 8Evaluation Criteria: Number Rate (%)

Midterm exam 1 40AssignmentProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 60




Ders Adı: Kanser BiyolojisiDers Kodu: KB521Yarıyıl BaharProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProgramıDersin Dili TürkçeDersin Türü ZorunluDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları -


Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Ender ŞİMŞEKDersin Amacı Bu derste, kanser biyolojisine dair temel kavramların öğrenciye

kazandırılması amaçlanmıştır.Ders İçeriği Bu derste kanser epidemiyolojisi, kanser oluşumu, kanser gelişimi

basamakları, kanser genetiği, kanser kök hücresi, kanser türlerine göre karsinogenez, kanser biyokimyası ve kanser tedavileri konuları üzerinde durulacaktır.

Dersin Öğrenme Çıktıları Öğrencilere kanser biyolojisine dair temel kavramları kazandırabilmek.Haftalık Ders Programı

Hafta Konular1. Hücre Biyolojisi2. Kanser Biyolojisine Giriş3. Kanser Epidemiyolojisi ve Etiyolojisi4. Kanser Genetiği5. Kanser Biyokimyası6. Kanser Kök Hücresi7. Vize8. Anjiyogenez9. İmmün Sistem ve Kanser10. Baş Boyun Kanserleri Klinik Yaklaşım11. Meme Kanseri Hakkında Genel Bilgiler12. Metastatik Meme Kanserinde Biyolojik Tedaviler13. Tiroid Lezyonlarına Moleküler Yaklaşım14. Sistemik Kanser Kemoterapi Prensipleri15. FinalKaynaklar


ProjeToplam AKTS





Name of course: The Biology of CancerCourse code: KB521Year/ Semester: SpringProgram: Master of Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: CompulsoryPrerequisites: -Length of course: 3 hours per weekResponsible for course: Assist. Prof. Dr. Ender ŞİMŞEKCourse objectives: Objectives of this course is to learn the basic concepts regarding cancer biology

Course contents: Cancer biology, cancer epidemiology, cancer genetics, cancer biochemistry, cancer stem cells, general information about cancer types

Learning outcomes: Graduates will be able:To give the students basic concepts regarding the biology of tumor development

Weekly Course FlowWeek Subjects:1. The Biology of Cell2. Introduction to Cancer Biology3. Epidemiology and Etiology of Cancer4. Cancer Genetics5. Cancer Biochemistry6. Cancer Stem Cells7. Midterm exam8. Angiogenesis9. Immune System and Cancer10 Clinical Approach for Head and Neck Cancer11. General Information About Breast Cancer12. Biological Treatments in Metastatic Breast Cancer13. Molecular Approach to Thyroid Lesions14. Principles of Systemic Cancer Chemotherapy15. Final Exam







Ders Adı: Dolaşan Tümör HücreleriDers Kodu: KB526Yarıyıl BaharProgram Kanser Biyolojisi Tezli Yüksek Lisans ProgramıDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi Yüksek LisansDersin Önkoşulları -


Öğretim Eleman(lar)ı Yrd. Doç. Dr. Ender ŞİMŞEKDersin Amacı Bu derste, dolaşan tümör hücrelerine dair temel kavramların öğrenciye

kazandırılması amaçlanmıştır.Ders İçeriği Dersin içeriğinde tümör oluşumu, tümör gelişimi basamakları,

anjiyogenez, metastaz, dolaşan tümör hücreleri üzerinde durulacaktır.Dersin Öğrenme Çıktıları Öğrencilere kanser biyolojisine dair temel kavramları kazandırabilmek.

Haftalık Ders ProgramıHafta Konular1. Hücre Biyolojisi2. Kanserin Doğası3. Kanser Hücresinin Özellikleri4. Karsinogenez süreci5. Anjiyogenez6. Metastaz7. Vize8. Dolaşan Tümör Hücreleri9. Dolaşan Tümör Hücrelerinin Tanımlanması ve Karakterizasyonu10. Dolaşan Tümör Hücrelerini Zenginleştirme Saptama Metotları11. Dolaşan Tümör Hücrelerinin Biyobelirteç Olması12. Dolaşan Tümör Hücrelerinin Klinik Etkileri13. Meme Kanseri Hastalarında Dolaşan Tümör hücreleri14. Final

Kaynaklar

3. The Biology of Cancer, Robert A. Weinberg

4. Molecular Cell Biology 6th. Edition


ProjeToplam AKTS





Name of course Circulating Tumor CellsCourse code: KB526Year/ Semester: SpringProgram: Master of Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: -Length of course: 2 hours per weekResponsible for course: Assist. Prof. Dr. Ender ŞİMŞEKCourse objectives: Objectives of this course is to learn the basic concepts regarding circulating tumor cellsCourse contents: Cancer biology, cancer development, angiogenesis, metastasis, circulating tumor cells.

Learning outcomes: Graduates will be able:To give the students basic concepts regarding the circulating tumor cells

Weekly Course FlowWeek Subjects:1. The Biology of Cell2. The Nature of Cancer3. Cancer Hallmarks4. Carsinogenesis Prosses5. Angiogenesis6. Metastasis7. Midterm exam8. Circulating Tumor Cells

9. Identification and Characterization of Circulating Tumor Cells

10 Enrichment and Detection Methods of Circulating Tumor Cells11. Circulating Tumor Cells as A Biomarker12. Clinical Implications of Circulating Tumor Cells13. Circulating Tumor Cells in Breast Cancer Patients14. Final Exam






Ders Kodu KB528 Ders Adı Protein Turnoveri ve Aminoasit KatabolizmasıYarıyıl BaharProgram Kanser BiyolojisiDersin Dili TürkçeDersin Türü SeçmeliDersin Düzeyi LisansüstüDersin Ön koşulları Enzim İmmobilizasyonu ve Rekombinant DNA Teknikleri derslerini

almış olmakDers Süresi Haftada 2 saat

Öğretim Eleman(lar)ı Doç. Dr. Özen ÖZENSOY GÜLERDersin Amacı Protein molekülleri yaşayan canlılarda sürekli olarak sentezlenir ve

ayrışır. Hücresel tek proteinlerin konsantrasyonu bir seri biyokimyasal mekanizmalarla düzenlenen sentez ve ayrışma hızları ile elde edilir. Bu dersin amacı öğrencilerin biyokimyadaki temel metabolik olaylardan olan protein turnoveri ve aminoasit katabolizmasını öğretmektir.

Ders İçeriği Proteinlerin aminoasitlere Degradasyonu (Ayrışması), Dietsel aminoasitlerin sindirimi ve emilimi, Protein Turnoveri, Amino asit degradasyonun ilk basamağı ürenin uzaklaşması, Üre devri ve metabolizmadaki azotun önemi, Degrade olmuş (Ayrışan) aminoasitlerin karbon atomlarının acil metabolik araürün olarak kullanımı

Dersin Öğrenme Çıktıları Protein turnoveri ve aminoasit katabolizmasını öğrenmek.Haftalık Ders Programı

Hafta Konular

1. Proteinlerin aminoasitlere Degradasyonu (Ayrışması)2. Proteinlerin aminoasitlere Degradasyonu (Ayrışması)3. Dietsel aminoasitlerin sindirimi ve emilimi4. Dietsel aminoasitlerin sindirimi ve emilimi5. Dietsel aminoasitlerin sindirimi ve emilimi6. Protein Turnoveri7. Protein Turnoveri8. Amino asit degradasyonun ilk basamağı ürenin uzaklaşması9. Amino asit degradasyonun ilk basamağı ürenin uzaklaşması10. Amonyum iyonunun karada yaşayan canlılarda üreye dönüşümü11. Üre devri ve metabolizmadaki azotun önemi12. Üre devri ve metabolizmadaki azotun önemi13. Degrade olmuş (Ayrışan) aminoasitlerin karbon atomlarının acil metabolik araürün olarak kullanımı14. Degrade olmuş (Ayrışan) aminoasitlerin karbon atomlarının acil metabolik araürün olarak kullanımıKaynaklar Biochemistry/Stryer, Biochemistry/Voet


ProjeToplam AKTS

42 28 - 130 200 8Değerlendirme Yöntemi ve geçme kriterleri Sayısı Katkısı(%)

Ara SınavÖdev, SeminerUygulamaFinal 1 100




Course code: KB528 Name of course: Protein Turnover and Aminoacid Catabolism

Year/ Semester: SpringProgram: Cancer BiologyLanguage of instruction: TurkishCategory: ElectivePrerequisites: Person who has been taken enzyme Immobilization and

Recombinant DNA Techniques coursesLength of course: 2 hours perweekResponsible for course: Assoc. Prof. Özen ÖZENSOY GÜLERCourse objectives: Protein molecules are continuously synthesized and

degraded in living organisms. Concentration of individual cellular proteins are obtained with synthesis and degradation rates by serial biochemical mechanisms are arranged.The aim of the course is to teach the basic biochemistry as metabolic processes in protein turnover and amino acid catabolism.

Course contents: Degradation of proteins into aminoacids, Digestion and absorption of dietary amino acids, Protein Turnover, The first step of amino acid degradation: urea excretion, Alternation of urea to ammonium ions in living terrestrial, Urea cycle and the importance of nitrogen in metabolism, Using as an emergency metabolic intermediates of carbon atoms of degradable amino acids

Learning outcomes: Learn the protein turnover and amino acid catabolism.Weekly Course Flow

Week Subjects:

1. Degradation of proteins into aminoacids2. Degradation of proteins into aminoacids3. Digestion and absorption of dietary amino acids4. Digestion and absorption of dietary amino acids5. Digestion and absorption of dietary amino acids6. Protein Turnover7. Protein Turnover8. The first step of amino acid degradation: urea excretion9. The first step of amino acid degradation: urea excretion10. Alternation of urea to ammonium ions in living terrestrial11. Urea cycle and the importance of nitrogen in metabolism12. Urea cycle and the importance of nitrogen in metabolism13. Using as an emergency metabolic intermediates of carbon atoms of degradable amino acids14. Using as an emergency metabolic intermediates of carbon atoms of degradable amino acids

Education and Teaching Methods:Theory Practice Lab. Project, Assignment Total ECTS42 28 - 130 200 8Evaluation Criteria: Number Rate (%)

Midterm examAssignmentProjectLaboratoryPracticeFinal exam 1 100

Documents

aybu.edu.tr · Web viewThe structure and properties of nucleic acids, Properties of DNA and RNA, Homogenization Methods, Physical Methods, Chemical methods, Dialysis, Freeze drying