Asam nukleat 6

  • View
    780

  • Download
    3

Embed Size (px)

Text of Asam nukleat 6

  • 1. ASAM NUKLEATImocahriau.blogspot.com

2. SEJARAH PENEMUAN ASAM NUKLEAT1879, Albrecht Kossel menemukan asam nukleat yangtersusun oleh suatu gugus gula, gugus fosfat, dangugus basaAda dua jenis asam nuklet:1. DNA (deoxyribonucleid acid)2. RNA (ribonucleid acid asam nukleat memiiki peran penting dalam biosintesa protein 3. Nukleosida : pentosa +basa Nukleotida : pentosa + basa + asam fosfat 4. GULA RIBOSA Gula pada asamnukleat adalah ribosa. Ribosa (-D-furanosa)5adalah gula pentosa(jumlah karbon 5).4 13 2 Dalam penulisan diberitanda prime() untukmembedakanpenomoran pada basanitrogen 5. PERHATIKAN Ikatan gula ribosa dengan basa nitrogen (pada atomkarbon nomor 1). Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat (pada atomkarbon nomor 5). Gugus hidroksil pada atom karbon nomor 2 6. BASA NITROGEN Basa nitrogen berikatan dengan ikatan-b padaatom karbon nomor1 dari gula ribosa ataudeoksiribosa. Pirimidin berikatan ke gula ribosa pada atom N-1dari struktur cincinnya. Purin berikatan ke gula ribosa pada atom N-9 daristruktur cincinnya. 7. BASA PIRIMIDIN DAN PURINPerhatikan struktur cincinnya 8. BASA-BASA DALAM ASAM NUKLEAT 9. GUGUS FOSFATNukleosida (Gula Ribosa yang berikatan dengan basa nitrogen) + satu atau lebih gugus fosforildisebut nukleotida. 10. RIBONUKLEOTIDA Gula ribosa yang berikatandengan basa nitrogen (dalamcontoh di samping adalah suatupirimidin, urasil dan sitosin)pada atom karbon nomor 1nyadisebut ribonukleosida (dalamcontoh di samping adalah uridindan sitidin). Ribonukleosida yangterfosforilasi pada atom karbonnomor 5nya disebutribonukleotida (dalam contoh di Penyampaian ribonukleotidasamping adalah uridilat ataubiasana dalam bentuk singkatansitidilat)(misalnya) U, atau UMP (uridinmonofosfat) 11. RIBONUKLEOTIDA UTAMAPerhatikan atom N9 (pada purin) dan N1 (padapirimidin) yang berikatan dengan atom C nomor 1 dari ribosa 12. KERAGAMAN IKATAN FOSFAT Hidrolisis RNA oleh enzim menghasilkan ribonukleosida 5- mono-fosfat atau ribonukleosida 3-monofosfat. 13. KERAGAMAN JUMLAH FOSFAT 123Nucleosida mono-, di-, dan trifosfat 14. ASAM NUKLEAT Monomer nukleotida dapat berikatan satusama lain melalui ikatan fosfodiesterantara -OH di atom C nomor 3nyadengan gugus fosfat dari nukleotidaberikutnya. Kedua ujung poli- atau oligonukleotidayang dihasilkan menyisakan gugusfosfat di atom karbon nomor 5nukleotida pertama dan gugushidroksil di atom karbon nomor 3nukleotida terakhir. 15. KERANGKA GULA-FOSFAT Oleh karenanya kerangka dasar polinukleotida atau asam nukleattersusun atas residu fosfat dan ribosa yang berselang-seling. Urutan basa dalam polinukleotida ditulis dari ujung yang memilikigugus fosfat di atom karbon nomor 5 ke ujung yang memilikigugus hidroksil di atom karbon nomor 3, atau biasa disebut ujung5 ke 3: 5-ATGCTAGC-3 Perhatikan bahwa kerangka dasar polinukleotida memiliki muatannegatif. 16. BASA NITROGEN DAPAT BERPOSISISYN- ATAU ANTI- 17. KONFORMASI KERANGKA DASARGULA-FOSFAT Polinukleotida memilikikebebasan berotasi tak terbatas,kecuali pada kerangka cincinribosanya. 18. NUKLEOTIDA DAN ASAM NUKLEATRibonukleotida adalahpenyusun RNARibonukleotidaRNA 19. KOMPOSISI BASA PENYUSUN ASAMNUKLEAT OrganismeAGCTEscherichia coli 24,7 26,0 25,7 23,6Khamir 31,3 18,7 17,1 32,9Gandum 27,3 22,7 22,8 27,1Salmon 29,7 20,8 20,4 29,1Ayam 28,8 20,5 21,5 29,3 20. HASIL PENELITIAN CHARGAFF1. Asam nukleat yang diisolasi dari berbagai jaringan organisme yang sama memiliki komposisi basa yang sama2. Komposisi basa Asam nukleat beragam pada organisme yang berbeda3. Komposisi basa Asam nukleat suatu spesies tidak berubah oleh umur, nutrisi, dan lingkungan4. Jumlah residu adenin selalu setara dengan jumlah residu timin, sedangkan jumlah residu guaninn selalu setara dengan jumlah residu sitosin 21. KESIMPULAN PENELITIAN CHARGAFF Asam nukleat merupakan bahan penentu sifatmahluk hidup Asam nukleat diturunkan/ditransfer dari induk keketurunannya 22. MASALAH RNA: KETIDAKSTABILAN DNA, yang memiliki H sebagai pengganti OH di atomC nomor 2, lebih stabil 23. RIBOSA vs DEOKSIRIBOSA Turunan penting dariribosa adalah 2-deoksiribosa, seringhanya disebutdeoksiribosa, yang padakarbon nomor 2nya OHdigantikan oleh H. Deoksiribosa ditemukan diDNA (deoxyribonucleicacid) DNA RNA Ribosa ditemukan di RNA(ribonucleic acid). Penggantian OH oleh Hdi atom C nomor 2mempengaruhi struktur! 24. DEOKSIRIBONUKLEOTIDA PENYUSUN DNA Gula 2-deoksiribosa yangberikatan dengan basa nitrogen(dalam contoh di sampingadalah purin - adenin dan guanin) pada atom karbon nomor 1nya disebut deoksiribonukleosida (dalam contoh di samping adalah deoksiadenosin dan deoksiguanosine). Deoksiribonukleosida yangterfosforilasi pada atom karbonnomor 5nya disebut Penyampaian DeoksiribonukleotidaDeoksiribonukleotida (dalam biasanya dalam bentuk singkatancontoh di samping adalah(misalnya) A, atau dA (deoksiA),deoksiadenilat danatau dAMP (deoksiadenosindeoksiguanilat).monofosfat) 25. DEOKSIRIBONUKLEOTIDA UTAMA 26. PENAMAAN NUKLEOTIDA (1) 27. PENAMAAN NUKLEOTIDA (2) 28. ASAM NUKLEAT Monomer nukleotida dapat berikatansatu sama lain melalui ikatanfosfodiester antara -OH di atomC nomor 3nya dengan gugusfosfat dari nukleotidaberikutnya. Kedua ujung poli- atauoligonukleotida yang dihasilkanmenyisakan gugus fosfat diatom karbon nomor 5nukleotida pertama dan gugushidroksil di atom karbon nomor3 nukleotida terakhir. 29. IKATAN HIDROGEN ANTARRANGKAIAN BASA DNAWatson-Crick base pairing 30. NUKLEOTIDA DAN ASAM NUKLEATDeoksiribonukleotida adalah penyusun DNA HDeoksiribonukleotidaDNA 31. STRUKTUR DNA DNA terdiri atas duarangkaian heliks anti-paralel(paralel berlawanan arah)yang melilit ke kanan suatuporos. Ukuran lilitan adalah 36 ,yang mengandung 10.5pasangan basa per putaran. Kerangka yang berselang-seling antara gugusdeoksiribosa dan fosfatterletak di bagian luar. Ikatan hidrogen antara basapurin dan pirimidin terletak dbagian dalam. 32. RANGKAIAN BENANG DNA Basa penyusun suatu benang DNAyang antiparallel tidak samamelainkan bersifat komplementerhadap benang pasangannya. Basa C berpasangan dengan G,sedangkan A dengan T. Hal inisangat bemanfaat dalam kaitanuntuk penyimpanan danpemindahan. 33. DIMANA ASAM NUKLEAT BERPERAN? DNA mengandung gen, informasi yang mengatursintesis protein dan RNA. DNA mengandung bagian-bagian yang menentukanpengaturan ekspresi gen (promoter, operator, dll.) Ribosomal RNA (rRNA) merupakan komponen dariribosom, mesin biologis pembuat protein Messenger RNAs (mRNA) merupakan bahanpembawa informasi genetik dari gen ke ribosom Transfer RNAs (tRNAs) merupakan bahan yangmenterjemahkan informasi dalam mRNA menjadiurutan asam amino RNAs memiliki fungsi-fungsi yang lain, di antaranyafungsi-fungsi katalis 34. Terima Kasih