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Apports des SIG à l’épidémiologie et à la santé publique : un survol. Alain-jacques Valleron UPMC & Inserm. Apports des SIG à l’épidémiologie et à la santé publique : un survol. Alain-jacques Valleron UPMC & Inserm. Définition d’un SIG ?. - PowerPoint PPT Presentation
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Apports des SIG à l’épidémiologie et à la santé publique :
un survol
Alain-jacques ValleronUPMC & Inserm
Apports des SIG à l’épidémiologie et à la santé publique :
un survol
Alain-jacques ValleronUPMC & Inserm
Définition d’un SIG ?
In : Le serveur éducatif de l'IGN et de l'Education Nationale sur l'information géographiquehttp://seig.ensg.ign.fr/
Person, place, time
• Le fondement de l’épidemiologie
• SIG pour aider à– Décrire
– Expliquer
– agir
Décrire
Kriging : Carrat et col., Am J of Epidemiology, 1992
Am J of Epid, 1992
Décrirede plus en plus d’outils interactifs et de bases de données
disponibles
http://ratecalc.cancer.gov/
Historique
Snow, Cholera, 1849-1854
13
1854
Districts with water supplied by
Population
Deaths from
Cholera
Cholera death rate per 1000 population
Southwark and Vauxhall Company
Only
167,654 844 5.0
Lambeth Company Only
19,133 18 0.9
Both Companies 300,149 652 2.2
14
Number of Fatal attacks by date of onset: Broad Street outbreak, London, 1854.
Snow - Farr
Voir Eyler : Soz.- Präventivmed. 46 (2001) 225–232
• Farr : C = C’ (e’ + a)/(e + a) – C et C’ sont les taux de mortalité dans deux
districts d’altitude e et e’• Valeurs observées: 177, 102,65, 34, 27, 22, 17, 7• Valeurs théoriques: 174, 99, 53, 34, 27, 22, 20, 6
Villermé1782-1863
Julia, C. and A.J. Valleron, Louis-Rene Villerme (1782-1863), a pioneer in social epidemiology: re-analysis of his data on comparative mortality in Paris in the early 19th century. J Epidemiol Community Health, 2010.
Corrélation écologiqueCausalité?
Nygard, K., et al., Association between environmental risk factors and campylobacter infections in Sweden Epidemiol Infect, 2004. 132(2): p. 317-25.
Krieger, N., et al.Geocoding and monitoring of US socioeconomic inequalities in mortality and cancer incidence: does the choice of area-based measure and geographic level matter?: the Public Health Disparities Geocoding Project. Am J Epidemiol, 2002. 156(5): p. 471-82
Pour (beaucoup) plus:
Greenland, S. and H. Morgenstern, Ecological bias, confounding, and effect modification. Int J Epidemiol, 1989. 18(1): p. 269-74.
Les sources de données modernes
• Innombrables bases de données environnementales informatisées (Sophie Valtat)
• Nouveaux outils
• Nouvelles méthodes
Sources de données satellitaires
• Résolution spatiale– Haute : 0.5 – 1.8 m.– Moyenne: 2 à 36 m.– Basse : >36m.
• Résolution temporelle• Résolution spectrale
Voir http://www.asprs.orgNotamment:http://www.asprs.org/a/news/satellites/Satellite_Archives_v3.pdf
EXEMPLE : SPOT6
EXEMPLE : SPOT 6
• Image product resolution:– Panchromatic: 1.5 m– Colour merge: 1.5 m– Multispectral: 8 m
• Spectral bands, with simultaneous panchromatic and multispectral acquisitions:– Panchromatic (450 – 745 nm)– Blue (450 – 525 nm)– Green (530 – 590 nm)– Red (625 – 695 nm)– Near-infrared (760 – 890 nm)
• Footprint: 60 km x 60 km– Responsive satellite tasking, with 6 tasking plans per day, per satellite– Capacity to acquire up to 3 million km2. daily
CORINE LAND COVER
(crédit SoES)
• Pesticides -> santé?– Couvert <-> santé– couvert -> pesticides
• Image satellitaire• Inférence sur la nature du couvert• Inférence sur les produits (pesticides) utilisés
In Ward,Env. Health Perspectives2000
Brody, J.G., et al., Using GIS and historical records to reconstruct residential exposure to large-scale pesticide application. J Expo Anal Environ Epidemiol, 2002. 12(1): p. 64-80.
Ward, M.H., et al., Identifying populations potentially exposed to agricultural pesticides using remote sensing and a Geographic Information System. Environ Health Perspect, 2000. 108(1): p. 5-12.
In Ward,Env. Health Perspectives2000
• Modèles de diffusion
Brody, J.G., et al., Using GIS and historical records to reconstruct residential exposure to large-scale pesticide application. J Expo Anal Environ Epidemiol, 2002. 12(1): p. 64-80.
Pollution par automobiles
s
English, P., et al., Examining associations between childhood asthma and traffic flow using a geographic information system. Environ Health Perspect, 1999. 107(9): p. 761-7.
In McKoneInternal reportLBNL, 2008
Ostfeld, R.S., G.E. Glass, and F. Keesing, Spatial epidemiology: an emerging (or re-emerging) discipline. Trends Ecol Evol, 2005. 20(6): p. 328-36.
Ostfeld, R.S., G.E. Glass, and F. Keesing, Spatial epidemiology: an emerging (or re-emerging) discipline. Trends Ecol Evol, 2005. 20(6): p. 328-36.
Lèpre en mélanésie
In Jim, Pacific Health Dialog, 2010
In Xiang,Envir. Research,2000
In Wei et col., Am. J. Trop. Med. Hyg., 84(3), 2011, pp. 497–503
In Wei et col., Am. J. Trop. Med. Hyg., 84(3), 2011, pp. 497–503
In Wei et col., Am. J. Trop. Med. Hyg., 84(3), 2011, pp. 497–503
In Wei et col., Am. J. Trop. Med. Hyg., 84(3), 2011, pp. 497–503
SIG et maladies chroniques
Étude SEARCH (507 DT1, 218 Témoins):
Liese, A.D., et al., Neighborhood level risk factors for type 1 diabetes in youth: the SEARCH case-control study. Int J Health Geogr, 2012. 11: p. 1
Ihrig, M.M., et col, A hospital-based case-control study of stillbirths and environmental exposure to arsenic using an atmospheric dispersion model linked to a geographical information system. Epidemiology, 1998. 9(3): p. 290-4.
Plans d’analyse de facteurs environnementaux
• Niveau écologique• Niveau individuel
– Les variables environnementales dépendent de l’individu (pollution estimé à un point)
• Multiniveaux– Des variables mesurées individuellement, soit
environnementales, soit par questionnaire (tabac)– ET des variables communes à des groupes d’individu
• Schéma cas-contrôle : le plus général
Questions méthodologiques récurrentes
• Données : – Comment estimer la trajectoire de vie– Comment estimer les « vraies » expositions?– Qualité du géocodage?Distinguer les cas où pas de résultats (donc problème de puissance) de ceux où il y a des résultats (un biais peut il les expliquer?)
• Analyse :– Autocorrélation spatiale– Modèles multiniveaux
Autocorrélation spatiale^ Moran, P. A. P. (1950). "Notes on Continuous Stochastic Phenomena". Biometrika 37 (1): 17–23.
Qualité du géocodage• Peut être critique.
• `Nombreux travaux– Bonner, 2003
• Comparaison GPS et géocodage (ArcView 3.2, DynaMap)
• 79% < 100m.• 3% > 800m.
Bonner, M.R., et al., Positional accuracy of geocoded addresses in epidemiologic research. Epidemiology, 2003. 14(4): p. 408-12.
Journaux spécialisés
• Health and Place IF=?
• Intl Journal of Health geographics IF=?• Transactions in GIS
IF=?
• Environmental Health Pespectives IF=7