ANALISIS FAKTOR RESIKO INFEKSI Escherichia coli O157:H7

PADA SAPI DI KECAMATAN PETANG KABUPATEN BADUNG

SKRIPSI

Diajukan untuk Melengkapi Tugas-Tugas dan Memenuhi Persyaratan untuk

Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan

Oleh

Andi Isma Lestari Amin

NIM 1009005071

BAB I

FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN

UNIVERSITAS UDAYANA

DENPASAR

2014

i

ANALISIS FAKTOR RESIKO PENYEBARAN Escherichia coli O157:H7

PADA SAPI DI KECAMATAN PETANG KABUPATEN BADUNG

SKRIPSI

Diajukan untuk Melengkapi Tugas-Tugas dan Memenuhi Persyaratan untuk

Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan

Diajukan oleh

Andi Isma Lestari Amin

NIM 1009005071

Menyetujui/Mengesahkan

Pembimbing I, Pembimbing II,

Dr. drh. I Wayan Suardana, M.Si drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P

NIP. 19700122 199512 1 001 NIP. 19840804 200812 1 001

DEKAN FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN

UNIVERSITAS UDAYANA

Dr. drh. Nyoman Adi Suratma, M.P

NIP. 19600305 198703 1 001

Tanggal Lulus :

ii

Setelah mempelajari dan menguji dengan sungguh – sungguh kami

berpendapat bahwa tulisan ini baik ruang lingkup maupun kualitasnya dapat

diajukan sebagai skripsi untuk memperoleh gelar Sarjana Kedokteran Hewan.

Ditetapkan di Denpasar, tanggal

Panitia penguji

Dr. drh. I Wayan Suardana. M.Si

Ketua

drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P dr. Made Agus Hendrayana, M.Ked

Sekretaris Anggota

drh. Tjokorda Sari Nindhia, SKH, M.P Dr. drh. Hapsari Mahatmi, M.P

Anggota Anggota

i

RIWAYAT HIDUP

Penulis, Andi Isma Lestari Amin, dilahirkan di Tanahberu, Kabupaten

Bulukumba Sulawesi Selatan pada tanggal 22 September 1990. Penulis

merupakan anak kedua dari tiga bersaudara dari pasangan Andi Muhammad

Amin, S.Pd, M.Pd dan Andi Batari Toja, S.Pd.

Penulis menempuh Sekolah Dasar (SD) di Sekolah Dasar Negeri 155 Center

Tanahberu dan lulus pada tahun 2003, kemudian lulus dari bangku Sekolah

Menengah Pertama (SMP) di Sekolah Menengah Pertama Negeri 2 Kota

Bulukumba pada tahun 2006, dan menamatkan Sekolah Menengah Atas (SMA) di

Sekolah Menengah Atas Negeri 2 Kota Bulukumba pada tahun 2009. Penulis

resmi terdaftar sebagai mahasiswa Kedokteran Hewan Universitas Udayana pada

tahun 2010 melalui jalur Seleksi Nasional Masuk Perguruan Tinggi Negeri

(SNMPTN).

Selama berada di Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana, penulis

aktif menjadi Pengurus Minat dan Profesi (Minpro) “SULUH” pada periode

kepengurusan 2011-2013 dan aktif menjadi Pengurus BEM Fakultas Kedokteran

Hewan Universitas Udayana tahun 2012-2014.

Dalam rangka menyelesaikan tugas akhir dan untuk memenuhi salah satu

persyaratan untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran Hewan penulis melakukan

penelitian dengan judul “Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli

O157:H7 Pada Sapi di Kecamatan Petang Kabupaten Badung”.

ii

ABSTRAK

Tujuan penelitian ini untuk mengetahui faktor resiko yang berperan dalam

infeksi agen E. coli O157:H7 dan mengetahui asosiasi diantara faktor-faktor

resiko terhadap infeksi E. coli O157:H7 pada ternak sapi. Sampel yang

dipergunakan adalah sebanyak 58 sampel feses sapi yang dilengkapi dengan data

epidemiologi. Sampel berasal dari tujuh desa di Kecamatan Petang Kabupaten

Badung. Tahapan isolasi E. coli dilakukan dengan menumbuhkan bakteri pada

media eosin methylene blue agar (EMBA). Selanjutnya dilakukan pewarnaan

Gram untuk mengetahui bentuk dan warna dari E. coli. Untuk membedakan

bakteri fecal coli dan non fecal coli maka dilakukan identifikasi isolat dengan uji

indol, methyl red, voges-proskauer dan simon citrate (IMVIC). Selanjutnya untuk

mengkonfirmasi E. coli O157 maka isolat ditumbuhkan pada media sorbitol

macConkey agar (SMAC) yang dilanjutkan dengan uji aglutinasi latek O157.

Tahapan akhir yang dilakukan untuk memastikan E. coli O157 tersebut adalah E.

coli O157:H7 maka diuji dengan uji antiserum H7. Hasil analisis data

epidemiologi dengan Odds ratio menunjukkan bahwa sapi jenis kelamin jantan

memiliki nilai Odds ratio 4,1 yang berarti memiliki resiko menyebarkan E. coli

O157:H7 4,1 kali lebih besar dibandingkan dengan sapi yang berjenis kelamin

betina. Selain itu, sumber air minum ternak yang berasal dari non PAM memiliki

nilai Odds ratio 2,4 yang berarti 2,4 kali beresiko menyebarkan E. coli O157:H7

dibandingkan dengan air minum yang bersumber dari PAM. Namun, setelah

dilakukan uji Chi square belum ditemukan adanya signifikansi yang berpengaruh

nyata (P>0,05) dari asosiasi diantara faktor- faktor resiko tersebut.

Kata kunci : E. coli O157:H7, VTEC, Faktor resiko, Sapi, Petang

iii

ABSTRACT

The purpose of the research are to find out the risk factors that take part in

the infection of E. coli O157:H7 agent and also the association between the risk

factors toward the infection of E. coli O157:H7. The samples that are used in this

research are the samples of cattle feces and completed by the epidemiologic data.

The samples comes from seven villages in Petang subdistrict, Badung regency.

The isolation stages of E. coli are proceeded by growing the bacteria on eosin

methylene blue agar (EMBA) media. Then continued with the Gram coloring in

order to identifythe sahpe and the color of E. coli. In oreder to differentiate fecal

coli bacteria with non fecal coli, isolates identification with indole test, methyl

red, voges-proskauer and simon citrrate (IMVIC) are needed. Next stage is to

confirm the E. coli O157 by growing the isolates on sorbitol macConkey agar

(SMAC) media nad continued by latex agglutination test of E. coli O157.the last

stage is in order to ensure the E. coli O157 in needed E. coli O157:H7, then the

antiserum H7 test is needed. The result from the epidemiologic data analysis with

Odds ratio shows that the male cattle possess the Odds ratio of 4,1 which means

there are 4,1 times more E. coli O157:H7 transmit risk than female cattle. More

over, drinking water source for cattle that comes from non PAM source has odds

ratio of 2,4, which means that there are 2,4 times more E. coli O157:H7 transmit

risk than the drinking water from PAM. However, after Chi square test had been

carried out, there is still no risk factors yet that has significant real impact

(P>0,05) from the association among those risk factors.

Keywords : E. coli O157:H7, VTEC, Risk factor, Cattle, Petang

iv

UCAPAN TERIMA KASIH

Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT, Tuhan Yang Maha Esa,

berkat rahmat dan karunia-Nya penelitian dan penulisan skripsi yang berjudul

“Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7 Pada Sapi di

Kecamatan Petang Kabupaten Badung” dapat terselesaikan. Skripsi ini ditulis

sebagai salah satu persyaratan untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran Hewan

pada Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana.

Pada kesempatan ini penulis menyampaikan ucapan terima kasih dan

penghargaan yang setinggi-tingginya kepada :

1. Bapak Dr. drh. Nyoman Adi Suratma, M.P, selaku Dekan Fakultas

Kedokteran Hewan Universitas Udayana.

2. Bapak Dr. drh. I Wayan Suardana, M.Si selaku pembimbing I yang telah

banyak membimbing saya dan atas keikutsertaan saya dalam penelitian

kerjasama Kemitraan Penelitian dan Pengembangan Pertanian Nasional

(KP3N) yang didanai oleh Badan Pengembangan Pertanian Kementerian

Pertanian 2014.

3. Bapak drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P selaku pembimbing II yang

dengan penuh kebesaran hati telah meluangkan waktu dan pikiran untuk

membimbing penulis dalam penulisan skripsi sehingga skripsi ini dapat

terselesaikan dengan baik.

4. Para dosen penguji Bapak dr. Made Agus Hendrayana, M.Ked, Ibu drh.

Tjokorda Sari Nindhia, SKH, M.P, dan Ibu Dr. Drh. Hapsari Mahatmi, M.P,

atas kesediaannya menjadi penguji skripsi dan telah memberikan saran dan

kritik yang sangat baik dan membangun dalam rangka perbaikan skripsi ini.

5. Bapak drh. I Gusti Ketut Suarjana, M.P selaku pembimbing akademik yang

telah membimbing penulis selama mengikuti perkuliahan di Fakultas

Kedokteran Hewan Universitas Udayana.

6. Bapak dan Ibu dosen Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana yang

telah mendidik dan membimbing penulis selama mengikuti masa perkuliahan.

v

7. Ibu Ni Wayan Nursini, S.Tp, M.P staf Laboratorium Biosains dan

Bioteknologi Bukit Jimbaran yang telah membantu dalam penelitian saya.

8. Kedua orang tua tercinta, Ibunda Andi Batari Toja S.Pd dan Ayahanda Andi

Muhammad Amin, S.Pd, M.Pd, yang tak henti-hentinya memanjatkan doa

dan senantiasa memberikan nasehat dan dukungan moril maupun materi, serta

kakak dan adik ku tercinta, Andi Primi Lestari dan Andi Nur Ilmi Tenri Dio

serta Andi Dhadan Mirdan yang selalu menjadi penyemangat dan inspirasiku

untuk maju.

9. Ruwaidah, Natazha Priski Deanasthi, Tri Suci Galingging, Ratna

Bayuningsih, Sari Sartini, Yunita Sri Hastuti, Wahyu Hananto serta teman-

teman seperjuangan angkatan 2010, yang tidak dapat penulis sebutkan satu

persatu. Terima kasih atas berbagai bantuan dan kerjasamanya.

10. Venny Johan, drh. Rasdiyanah, dan drh. Adriyani Ris serta semua anggota

keluarga besar IKAMI (Ikatan Mahasiswa/Pelajar Indonesia) Sulsel Cab. Bali

yang telah menjadi keluarga baru selama penulis tinggal di Bali.

Penulis menyadari skripsi ini masih jauh dari sempurna dan untuk itu segala

kritik dan saran penulis harapkan demi sempurnanya skripsi ini. Sebagai akhir

kata penulis berharap skripsi ini dapat bermanfaat bagi kita semua.

Denpasar, Mei 2014

P e n u l i s

vi

DAFTAR ISI

Halaman

RIWAYAT HIDUP .................................................................................. i

ABSTRAK ................................................................................................ ii

ABSTRACT .............................................................................................. iii

UCAPAN TERIMA KASIH ................................................................... iv

DAFTAR ISI ............................................................................................. vi

DAFTAR TABEL .................................................................................... viii

DAFTAR GAMBAR ................................................................................ ix

DAFTAR LAMPIRAN ............................................................................ x

BAB I PENDAHULUAN ......................................................................... 1

1.1 Latar Belakang ........................................................................... 1

1.2 Rumusan Masalah ...................................................................... 4

1.3 Tujuan Penelitian ........................................................................ 4

1.4 Manfaat Penelitian ...................................................................... 5

1.5 Kerangka Konsep ....................................................................... 5

1.6 Hipotesis Penelitian .................................................................... 8

BAB II TINJAUAN PUSTAKA .............................................................. 9

2.1 Escherichia coli ......................................................................... 9

2.2 Verotipe Escherichia coli ........................................................... 11

2.3 Escherichia coli O157:H7 .......................................................... 14

2.3.1 Penularan Escherichia coli O157:H7 ............................... 17

2.3.2 Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7............. 19

2.4 Kondisi Geografis Kecamatan Petang ....................................... 22

BAB III MATERI DAN METODE ......................................................... 24

3.1 Bahan Penelitian ......................................................................... 24

3.2 Alat Penelitian ............................................................................ 24

3.3 Cara Pengumpulan Data Epidemiologi ...................................... 25

3.4 Prosedur Pengambilan Sampel Feses ......................................... 26

3.5 Isolasi dan Identifikasi Escherichia coli O157:H7 .................... 27

3.6 Variabel Penelitian .................................................................... 31

3.7 Analisis Data ............................................................................. 31

3.8 Lokasi Dan Waktu Penelitian .................................................... 32

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN .................................................. 33

4.1 Isolasi dan Identifikasi Escherichia coli O157:H7 ..................... 33

4.2 Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7 ........ 35

4.3 Pengujian Hipotesis ................................................................... 42

vii

BAB V PENUTUP ..................................................................................... 43

5.1 Kesimpulan ................................................................................ 43

5.2 Saran ........................................................................................... 43

DAFTAR PUSTAKA ............................................................................... 44

LAMPIRAN .............................................................................................. 49

viii

DAFTAR TABEL

Tabel Halaman

1. Hasil Isolasi E. coli dan Identifikasi E. coli O157:H7 di Kecamatan

Petang Kabupaten Badung ................................................................. 34

2. Deskripsi Data Hasil Analisis Faktor-faktor yang Berpengaruh

Terhadap Infeksi E. coli O157:H7 pada Sapi di Kecamatan Petang .. 35

3. Hasil Penghitungan Chi-square, P value dan Odds ratio Faktor

yang Berpengaruh Terhadap Infeksi E. coli O157:H7 ....................... 37

ix

DAFTAR GAMBAR

Gambar Halaman

1. Wilayah Kecamatan Petang .............................................................. 3

2. Bagan Kerangka Konsep E. coli O157:H7 ........................................ 6

3. Bentuk Bakteri Escherichia coli pada Mikroskop Elektron ............... 10

4. Transmisi Infeksi E. coli O157:H7 dari Ternak ke Manusia ............. 18

5. Bakteri Escherichia coli yang Tumbuh Pada Media EMBA ............. 28

6. Kondisi Sapi pada Beberapa Tempat Pemeliharaan .......................... 36

x

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran Halaman

1. Kuisioner Penelitian .......................................................................... 49

2. Data Hasil Isolasi dan Identifikasi E. coli O157:H7 di Kecamatan

Petang Kabupaten Badung ................................................................. 50

3. Data Hasil Uji Chi square dan Uji Odds ratio ................................... 52

4. Foto Hasil Uji Isolasi dan Identifikasi E. coli O157H7 ..................... 61