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HISTORIAL DEL GRUPO DE GENÉTICA EVOLUTIVA DEL INSTITUTO CAVANILLES DE BIODIVERSIDAD Y BIOLOGÍA EVOLUTIVA DE LA UNIVERSITAT DE

VALÈNCIA

Periodo: 2010-2016 ACTIVIDADES DEL GRUPO

El grupo de investigación se dedica al estudio de la evolución biológica bajo diferentes aproximaciones como la evolución molecular, la biología de sistemas, la genómica y metagenómica, la evolución experimental o la epidemiología evolutiva y usando varios sistemas modelo que incluyen a las bacterias, los virus y los insectos. Una descripción detallada del grupo y sus integrantes se encuentra en http://www.uv.es/cavanilles/genevol/

LINEAS DE INVESTIGACION ACTUALES

1. Evolución y genómica de las bacterias simbióticas en insectos. 2. Biología de sistemas y evolución del metabolismo de asociaciones simbióticas. 3. Biología sintética y células mínimas. 4. Microbiota en insectos: ecología y filogenia. 5. Regulación genética del ciclo biológico y sistemática molecular de pulgones.

MIEMBROS ACTUALES DEL GRUPO

PROFESORES

Andrés Moya Simarro. Catedrático de Genética. Amparo Latorre Castillo. Catedrática de Genética. Francisco J. Silva Moreno. Catedrático de Genética. Rosario Gil García. Profesora Titular de Genética. David Martínez Torres. Profesor Titular de Genética. Juli Peretó Magraner. Profesor Titular de Bioquímica y Biología Molecular. Carlos García Ferris. Profesor Titular de Bioquímica y Biología Molecular.

INVESTIGADORES Y POSTDOCTORALES

Ana Guitérrez Preciado. Investigadora postdoctoral. Pablo Llop Pérez. Investigadora postdoctoral. Tania Rosas Pérez. Investigadora postdoctoral.

INVESTIGADORES PREDOCTORALES

Miquel Barberá. Becario de Formación de Personal Investigador del MICINN. Jorge Mariano Collantes Alegre. Becario predoctoral. Pablo García Barranquero. Becario predoctoral. Victor J. Luque Martín. Becario predoctoral. Alejandro Manzano Marín. Becario predoctoral Marie Curie. Vanesa Martínez Díaz. Becaria predoctoral FPI de Ministerio de Educación. Bertha Mariana Reyes Prieto. Becaria predoctoral Marie Curie Adrián Salazar Salazar. Becario predoctoral. Carlos Alberto Vargas Chávez. Becario predoctoral. Cristina Vilanova Serrador. Becaria predoctoral FPU.

TÉCNICOS DE INVESTIGACIÓN

Pascual Asensi. Técnico de Informática. Rebeca Domínguez Santos. Técnico de investigación, contratada por proyecto.

Laura Domínguez. Técnico de investigación, contratada por proyecto.

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ANTIGUOS MIEMBROS DEL GRUPO DE INVESTIGACIÓN PROFESORES

Eladio Barrio, Prof. Titular de Genética. Univ. Valencia. Santiago F. Elena, IBMCP, CSIC, Valencia. Mario Ali Farés, Triniti College (Dublín), IBMCP, Valencia Ana González. Catedrática de Genética. Univ. Valencia. Fernando González Candelas. Catedrático de Genética. Univ. Valencia. Ignacio Marín, Inst. Biomedicina, CSIC, Valencia.

Rafael Sanjuán Verdeguer. Profesor Titular de Genética. POSTDOCTORALES E INVESTIGADORES

Juan José Abellán. Investigador sénior CSISP/UVEG Carmela Belloch Trinidad, Investigadora IATA-CISC María Alma Bracho Lapiedra. Contrato FIS en CSISP/UVEG Purificación Carrasco Valero. Investigador postdoctoral contratado.

Jose Manuel Cuevas. Investigador postdoctoral contratado. Giuseppe D’Auria. Contrato FIS en CSISP/UVEG François Delmotte, INRA, Bordeaux Inmaculada García-Robles, Genetics Dpt., Univ. Valencia Carmen M. González Domenech. María José Gosalbes Soler. Contrato Postdoctoral CIBEResp en CSIP/UVEG Xavier López Labrador, Investigador sénior CSISP/UVEG Elisa Maiques Fernández. Instituto de Biomedicina de Valencia. Alexander Neef.

Alejandro Oceguera Figueroa. CONACYT Postdoctoral Researcher. Miguel Pignatelli. Instituto de Bioinformática Europeo. Carolina Rausell, Genetics Dpt., Univ. Valencia Jörg Schaber, Max Planck Institute for Molecular Genetics Javier Tamames de la Huerta, Centro de Biología Molecular, Madrid. Paul E. Turner, Yale University Roeland van Ham, Plant Research International, Univ. Wageningen Borys Wróbel, Institute of Oceanography, Polish Academy of Sciences. Yarza, Pablo. PROFESORES VISITANTES

Eduardo Mizubuti, Universidade Federal de Viçosa. 2005-06. Nancy A. Moran, Universidad de Arizona. 2002-03.

Howard Ochman, Universidad de Arizona. 2002-03. Yvan Rahbé, INRA, 2006-07. Arturo Becerra, Universidad Nacional Autónoma de México. 2012-13. ANTIGUOS DOCTORANDOS

María Alma Bracho, CSISP, Valencia Alicia Amadoz Navarro, CIPF, Valencia Eladio Barrio Esparducer, ICBiBE, Univ. Valencia. Eugeni Belda Cuesta, Laboratorie d’Analyses Bioinformatiques pour la Genomique et le Metabolisme. Celia Buades Rodrigo, Sistemas Genómicos Francy Yolima Carrillo Cruz. Iñaki Comas Espadas, CSISP, Valencia Marine Combe. Teresa Cortés Méndez, MRC National Institute for Medical Research, London Mireia Coscollá Devis, Swiss Tropical and Public Health Institute, Basel José Manuel Cuevas, IBMCP, Valencia. Joaquín Dopazo Blázquez, CIPF, Valencia Santiago Elena Fito, IBMCP, Valencia Mercedes Fernández, ICBiBE, Univ. Valencia

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Victoria Fernández, Sistemas Genómicos Victoria Furió Gomar-González Agustí Galiana Soriano José García, Dpto. Genética, Univ. Valencia Raquel Garijo, Dpto. Evolución y Salud, Univ. Valencia Laura Gómez-Valero, Pasteur Institute Sara Susana González González, Instituto Canario de Investigaciones Agrarias Adoración Hernández, Zoology Dpt., Univ. Valencia Marta Ibáñez Agulleiro. Nuria Jiménez Hernández, CSISP, Valencia Araceli Lamelas Cabello, Swiss Tropical and Public Health Institute, Basel Mª José López Sánchez, Pasteur Institute, Paris. Sergio López Madrigal, Institut National des Sciences Appliquées de Lyon Carlos Llorens, BiotechVana David Martínez Torres, ICBiBE, Univ. Valencia Rosario Miralles. Benjamín Ortiz Rivas. Carmen Palacios. Marisa Palop Esteban Rafael Patiño Navarrete. Becario de Formación de Personal Investigador del MICINN. Vicente Pérez Brocal, CSISP, Valencia. Marianoel Pereira, ICBiBE. Joan B. Peris. Silvia Ramos Ortiz. Joan Riera. Francesc Peris Bondria, Université Libre de Bruxelles, Bruselas. Beatriz Sabater, Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, IVIA, Valencia. Ana Sanchis Segovia Rafael Sanjuan, ICBiBE Diego Santos García. Vicente Sentandreu Corberá. Contratado UV. Manoli Torres, CSISP, Valencia

COOPERACIONES ACTUALES CON OTROS GRUPOS DE INVESTIGACIÓN En la Universidad de Valencia:

1) José M. García-Verdugo del Instituto Cavanilles de la Universitat de València, sobre Estudio con Microscopía Electrónica de los Bacteriocitos de varias especies de pulgones y cucarachas.

2) Enrique Font, sobre la secuenciación de genes implicados en visión en lagartijas sobre genética molecular de la visión en el ultravioleta en lagartos.

3) Manuel Serra, sobre el desarrollo de marcadores moleculares en la identificación de especies crípticas de rotíferos.

4) Joaquín Baixeras, sobre evolución y barcoding en la familia Tortricidae (Lepidoptera). 5) Manel Porcar, sobre microbiota de insectos. Nacionales:

6) Jose Aurelio Castro Ocón, de la Universidad de las Islas Baleares, para trabajar en evolución de virus de RNA.

7) Roderic Guigó, de Genoma España, en su nodo de Barcelona (IMIM, CRG, Universitat Pompeu Fabra) sobre la anotación del genoma del pulgón.

8) Francisco Montero de la Universidad Complutense y Toni Gabaldón del Centro de Investigación Príncipe Felipe, sobre el análisis teórico de rutas y redes metabólicas.

9) Álvaro Moreno, Universidad del País Vasco, y Jesús Catalá, Universidad Cardenal Herrera-CEU, sobre aspectos históricos y filosóficos del origen de la vida.

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10) Mª José Motilva, Universidad de Lleida sobre estudios de metabolómica en el microbioma humano.

11) Fernando Baquero Hospital Ramón y Cajal sobre modelo experimental de la resistencia a antibióticos en cucarachas.

Internacionales:

12) Jean Christophe Simon, Caude Rispe y Denis Tagu, del INRA, Rennes (Francia), en el estudio de la biología de las poblaciones de pulgones y biología molecular de caracteres asociados a ciclos de vida.

13) Consorcio internacional del Genoma del pulgón, dirigido por David Stern (Princeton, USA).

14) Purificación López y David Moreira del CNRS-Université Paris XI (Francia), en el estudio filogenético de rutas metabólicas y el análisis metagenómico.

15) Edward Holmes, de la Penn State Univeristy (USA) para trabajar en evolución de virus de RNA.

16) Abelaziz Hedi, del INSA-Lyon (Francia), en la secuenciación del genoma del endosimbionte primario de Sitophilus oryzae.

17) Siv Andersson Universidad de Uppsala sobre el estudio de redes metabólicas en bacterias endosimbióticas.

PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN FINANCIADOS 1. 2016-2018. Recognition of the primary infection by Pneumocystis in infants: a silent threat

to public health. ELAC2014/HID0254. Entidad financiadora: ERAnet LAC, proyecto europeo financiado por el Instituto de Salud Carlos III. Entidades participantes: FISABIO. Investigador responsable: Dr. Sergio Vargas. Cuantía de la subvención: 548.126 €.

2. 2015-2017. Identification of novel modulators of chronic inflammation in prevalent diseases: unveiling divergent mechanisms of disease. PIE14/00045. Entidad financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad. Instituto de Salud Carlos III. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Antonio Zorzano y otros 11 IPs, includio Dr. Andrés Moya (por la UV). Cuantía de la subvención: 679.800 €.

3. 2015. Equipamiento de Secuenciación Masiva Illumina Miseq para Investigación Biomédica y en Salud Pública en la Comunidad Valenciana. FPEF13-3E-2547. Entidad financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad. Entidades participantes: FISABIO. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 67.064,80 €.

4. 2015-2016. Innovación en modelos computacionales predictivos en epidemiología experimental de la resistencia a antibióticos. SAF2013-49788-EXP. Entidad financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad (Explora-Ciencia). Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 70.000,00 €

5. 2014-2017. Regulación de las interacciones simbióticas en insectos. Generalitat Valenciana. PROMETEOII/2014/065. Entidad financiadora: Generalitat Valenciana. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 300.000,00 €

6. 2014- 2015. Ayudas complementarias para proyectos I+D para grupos de calidad. ACOMP/2014/235. Entidad financiadora: Conselleria d’Educació, Cultura i Esport. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre Castillo. Cuantía de la subvención: 9.000,00 €.

7. 2013- 2015. Biología de sistemas de las interacciones entre los insectos y sus simbiontes. BFU2012-39816-CO2-01. Entidad financiadora: Ministerio de Economía y Competitiidad. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre Castillo. Cuantía de la subvención: 304.200,00 €.

8. 2013-2015. Interacción del microbioma y el viroma del intestino humano en condiciones de salud, enfermedad y estrés antibiótico. SAF2012-31187. Empresa/Administración financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad. Entidades participantes: Universitat

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de València. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 380.250,00 €.

9. 2012-2014. Red Iberoamericana sobre Pneumocystosis. Empresa/Administración financiadora: CYTED (Programa Iberoamericano de ciencia y tecnología para el desarrollo. Entidades participantes: 11. Investigador Coordinador: Dr. Enrique Calderon Sandubete. Cuantía de la subvención: 33.000,00 € (para 2012).

10. 2012-2013. Infección del virus del papiloma humano y su transmisión al recién nacido. Empresa/Administración financiadora: Comunidad de Madrid. Programas de I+D en Biomedicina 2010. Entidades participantes: 4. Investigador Coordinador: Dr. César Nombela Cano. Cuantía de la subvención: 112.000,00 $ USA

11. 2012-2015. Programación de circuitos microbianos en medicina protectiva y terapéutica. Empresa/Administración financiadora: Colciencias, Colombia. Entidades participantes: Grupos de Nutrición y Virología de la Universidad del Valle (Colombia) y Area de Genómica y Salud del CSISP. Investigador Coordinador: Dr. Andrés Orlando Castillo. Cuantía de la subvención: 995.850,00 €.

12. 2012-2015. Predicting whitefly population outbreaks in changing environments. Empresa/Administración financiadora: ARIMNet. Entidades participantes: 15. Investigador Coordinador: Dr. Einat Zori Fein (Israel). Investigador responsable: Dr. Francisco J. Silva Moreno (por Univ. València). Cuantía de la subvención: 55.000,00 €.

13. 2012-2015. Standardization and orthogonalization of the gene expression flow for robust engineering of NTN (new-to-nature) biological properties. (ST-Flow). Empresa/Administración financiadora: Sevent Framework Programme. –Proyecto: 289326. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador Coordinador: Dr. Víctor de Lorenzo (CSIC, Madrid, Spain). Investigador responsable: Prof. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 5.998.742 € (341.315 € para Univ. València).

14. 2011-2012. Ayudas complementarias para proyectos I+D para grupos de calidad. Empresa/Administración financiadora: Generalitat Valenciana. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre. Cuantía de la subvención:17.000.00 €.

15. 2010-2013. Symbiomics: molecular ecology and evolution of bacterial symbionts. Empresa/Administración financiadora: Unión Europea (VI PM), Marie Curie Research Training Networks. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Nicole Dubulier y Amparo Latorre. Cuantía de la subvención: 3.782.465,00 €, 458.559€ para la Universitat de València.

16. 2010-2011. Asesoramiento científico-técnico en el área de Genómica y Salud del CSISP. Empresa/Administración financiadora: Conselleria de Sanidad. Entidades participantes: Universitat de València y Generalitat Valenciana. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre. Cuantía de la subvención:12.000,00 €.

17. 2010-2011. Eliminación de bacteroides con RNAi e implicaciones en el estudio de la simbiosis. Empresa/Administración financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación Proyecto EXPLORA. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Xavier Bellés y Amparo Latorre. Cuantía de la subvención: 40.000,00 €.

18. 2010-2011. Metagenomics of symbiotic bacterial communities in the whitefly Bemisia tabaci: comparative genomics and functional analyses. Empresa/Administración financiadora: IBISA (Infrastructures Biologie Santé et Agronomie). Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre y Laurence Mounton. Cuantía de la subvención: Secuenciación y anotación de genomas bacterianos del insecto Bemisia tabaco.

19. 2009-2013. Genómica Evolutiva. Tipo de contrato: Programa Prometeo (GV). Empresa/Administración financiadora: Consellería de Educación de la Generalitat Valenciana. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 65.500,00 €.

20. 2009-2012. Metagenómica poblacional de comunidades microbianas humanas. Empresa/Administración financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 320.000 €.

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21. 2009-2012. Mejora del equipamiento de secuenciación automática de ADN del Servicio Central de Soporte a la Investigación Experimental. Empresa/Administración financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre. Cuantía de la subvención: 378.611,00 €.

22. 2009-2012. Mejora del equipamiento de secuenciación automática de ADN del Servicio Central de Soporte a la Investigación Experimental. Empresa/Administración financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre. Cuantía de la subvención: 378.611,00 €.

23. 2012-2014. Bases moleculares de la ritmicidad circadiana y estacional en pulgones: CGL2011-27404. Entidad financiadora: MICINN. Investigador responsable: Dr. David Martínez Torres. Número de investigadores participantes: 3. Cuantía de la subvención: 67.000€

24. 2011. Eliminación de bacteroides con RNAi e implicaciones en el estudio de la simbiosis. Empresa/Administración financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Entidades participantes: Instituto de Biología Evolutiva de la UPF-CSIC y Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Xavier Bellès. Cuantía de la subvención: 40.000,00 €.

25. 2011. Fotoperiodismo y reloj circadiano en pulgones: bases moleculares de la estacionalidad. Entidad Financiadora: MICINN. Proyecto CGL2010-22043. Entidades participantes: Universitat de Valencia. Investigador responsable: Dr. David Martínez Torres. Cuantía de la subvención: 12.000 €

26. 2010. Ayudas para grupos de investigación de calidad contrastada. Programa Gerónimo Forteza. Entidad financiadora: Generalitat Valenciana. Investigador responsable: David Martínez Torres. Cuantía de la subvención: contratación de personal de apoyo 6 meses.

27. 2010. Metagenomics of symbiotic bacterial communities inthe whitefly Bemisia tabaci: comparative genomics and functional analyses. Entidad financiadora: IBISA (Infrastructures Biologie Santé et Agronomie (Francia). Entidades participantes: CNRS (Lyon, Francia) Universitat de Valencia y Instituto de Investigacion Agraria de Israel. Investigador responsable: Dr. Laurence Mouton. Cuantía de la subvención: Secuenciación y anotación de genomas bacterianos del insecto Bemisia tabaci.

28. 2009-2012. Genómica evolutiva. Entidad financiadora: Generalitat Valenciana (PROMETEO/2009/092). Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Número de investigadores participantes: 13. Cuantía de la subvención: 65.500 € anuales

29. 2009-2012. Biología de sistemas de las interacciones bacterianas en insectos: Analisis genomico, estudios funcionales y evolutivos y modelizacion de sistemas con restricciones. Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Número de referencia: BFU2009-12895-C02-01, subprograma BMC. Entidades participantes: Universitat de València, Universidad Complutense de Madrid. Investigador responsable: Dr. Amparo Latorre. Número de investigadores participantes: 9. Cuantía de la subvención: 290.000 €.

30. 2009-2013. Genómica Evolutiva. Entidad financiadora: Conselleria de Educación, Generalitat Valenciana. Prometeo 2009/092. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Número de investigadores participantes: 5. Cuantía de la subvención: 65.500 €.

31. 2009-2012. Factores de riesgo de hospitalización por gripe A (H1N1)2009 y efectividad de intervenciones farmacológicas, higiene de manos, higiene respiratoria y otras medidas no farmacológicas. Estudio de casos y controles. Entidad Financiadora: MICINN-Instituto de Salud Carlos III. Proyecto GR09/0032. Entidades participantes: CIBERESP. Investigador responsable: Dr. Ángela Domínguez. Cuantía de la subvención: 750,000 €.

32. 2009-2012. Metagenómica poblacional de comunidades microbianas humanas. Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Entidades participantes: Universitat de València. Investigador responsable:Dr. Andrés Moya. Número de investigadores participantes: 11. Cuantía de la subvención: 320.000 €.

33. 2009-2011. Pathogenomics: Desarrollo, prevención y detección diagnóstica temprana de la colitis asociada a Clostridium difficile: una red interdisciplinar. Entidad financiadora: Socios Europeos de la Era-Net Pathogenomics, Ministerio de Ciencia e Innovación. Investigador responsable: Dr. Stephan Ott. Cuantía de la subvención: 1.852.748 €.

34. 2009-2010. Metagenómica en 2D: una alternativa a la clonación. Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Entidades participantes: Universitat de València.

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Investigador responsable:Dr. Andrés Moya. Número de investigadores participantes: 9. Cuantia de la subvención: 70.000 €.

35. 2008-2012. COST Action on “Arthropod Symbioses: from fundamental studies to pest and disease management”. Entidad financiadora: European Science Foundation (COST-FA0701). Investigador responsable: Dr. Kostas Bourtzis. Número de investigadores participantes: 100, procedentes de 23 países europeos. Cuantía de la subvención: 87.000.000 €

36. 2008-2011. Arthropod Symbioses: from fundamental studies to pest and disease management. Entidad financiadora: EU – COST Office. Entidades participantes: Consorcio Internacional Europeo, Universitat de València incluida. Investigador responsable: Dr. Kostas Bourtzis. Cuantía de la subvención: 2.000.000 €.

37. 2008-2010. Desarrollo de nuevas tecnologías ómicas y su aplicación a la síntesis de etanol. Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación. Entidades participantes: Biopolis, Universitat de València y Universidad Politécnica. Investigador responsable: Laia Pedrola. Número de investigadores participantes: 9. Cuantía de la subvención: 150.000 €.

38. 2008-2010. Sequence of the genome of the pea aphid Acyrthosiphon pisum. Entidad Financiadora: Baylor College of Medicine (USA). Entidades participantes: Consorcio internacional incluyendo la Universitat de Valencia. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 1.000.000 $.

39. 2008-2010. Targeting environmental pollution with engineered microbial systems à la carte (TARPOL). Entidad financiadora: Unión Europea. Entidades participantes: Universitat de Valencia y 17 centros más de la UE. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 1.000.000 €.

40. 2007-2011. CIBER Epidemiología y Salud Pública, grupo CB06/02/0050 integrado en la Agrupación Enfermedades Infecciosas y Salud Internacional. Entidades participantes: 40. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Número de investigadores participantes: 16. Cuantía de la subvención: 100.000 € por año.

41. 2007-2010. Estudio de las bases moleculares que controlan el polifenismo reproductivo en pulgones (sexualidad vs. partenogénesis) (CGL2007-67392/BOS). Entidad financiadora: MICINN. Investigador responsable: Dr. David Martínez Torres. Cuantía de la subvención: 139.150 €.

42. 2006-2010. CIBER de Epidemiología y Salud Pública. Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III. Entidades participantes: Consorcio. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya, grupo del Instituto Cavanilles. Número de investigadores participantes: 17. Cuantía de la subvención: 106.020 € por año.

PARTICIPACIÓN EN CONTRATOS DE INVESTIGACIÓN CON EMPRESAS O ADMINISTRACIONES 1. 2015-2016. Use of the microbiota to fight agaisnt multiresistant bacteria.

Empresa/Administración financiadora: IDF-INNOV, Francia. Entidades participantes: Hospital Bichat-Claude Bernard (Paris)-Area de Genomica y Salud (FISABIO). Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención: 20.000 €.

2. 2011-2012. Detección de papilomavirus en población joven. Empresa/Administración financiadora: Generalitat Valenciana. Entidades participantes: Area de Vacunas del CSISP. Area de Genomica y Salud. FISBAIO-CSISP. Investigador responsable: Dr. Andrés Moya. Cuantía de la subvención:30.000.00 €.

3. 2011-2012. Asesoramiento científico-técnico en el área de Genómica y Saludo del FISABIO-CSISP. Tipo de Contrato: Convenio. Empresa/Administración financiadora: FISABIO - Centro Superior de Investigación en Salud Pública. Dra. Amparo Latorre. Importe Total del Proyecto: 12.305 €.

4. 2009-2011. Asesoramiento científico-técnico en el área de Genómica y Salud del CSISP. Tipo de Contrato: Convenio. Empresa/Administración financiadora: Conselleria de Sanidad

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de la Generalitat Valenciana. Dr. Andrés Moya, Dra. Amparo Latorre. Importe Total del Proyecto: 449.000,00 €.

PATENTES:

1. Inventores (p.o. de firma): Moya; A.; Latorre, A.; Gosalbes, M.J.; Vázquez, J.; Andremont, A.; Ruppe, E.; Woether, P.L.; Angebault, C.; Djossou, F. Título: “Methods and means for managing extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing enterobacteriaceae colonization”. País de prioridad: España. Fecha de prioridad: 20/05/2015. Entidad titular: Universitat de Valencia, CIBER, FISABIO, Universidad Paris-Diderot, Hospital Bichat-Claude Bernard, Paris. N. de Solicitud: EP15305758.3

2. Inventores (p.o. de firma):Vilanova, C.; Baixeras, J.; Latorre, A.; Porcar, M. Título: Cepas de Pseudomonas sp. y usos de las mismas. País de prioridad: España. Fecha de prioridad: 04/07/2013. Entidad titular: Universitat de València. Países a los que se ha extendido: España. N. de solicitud: P201300612.

3. Inventores (p.o. de firma): Porcar, M.; Rodríguez-Barreiro, R.; Vilanova, C.; Abendroth, C.; Moya, A. Título: Dispositivo termoeléctrico microbiano y método asociado a dicho dispositivo. País de prioridad: España. Fecha de prioridad: 28/09/2012. Entidad titular: Universitat de València. Países a los que se ha extendido: España. N. de solicitud: P201200977

4. Inventores/as (p.o. de firma): Futami, R.; Muñoz-Pomer, A.; Viu, J.M.; Domínguez-Escribá, L.; Covelli, L.; Bernet, G.; Sempere, J.M.; Moya, A.; Llorens, C. Título: GPRO 1.0. Núm. de Solicitud: v-13-11 País de prioridad: ESPAÑA Fecha de prioridad: 2011. Entidad Titular: Biotech Vana S.L. Código Patente: 000298.

5. Inventores/as (p.o. de firma): Muñoz-Pomer, A.; Futami, R.; Moya, A.; Llorens, C. Título: CHECKALIGN 2.0. Núm. de Solicitud: V-2137-10 País de prioridad: ESPAÑA Fecha de prioridad: 2010. Entidad Titular: Biotech Vana S.L. Código Patente: 000297.

6. Inventores/as (p.o. de firma): Muñoz-Pomer, A.; Futami, R.; Covelli, L.; Domínguez-Escribá, L.; Bernet, G.; Fuster,G.; Moya, A.; Llorens, C. Título: BIOTECHVANA TIME (Tool for in-place molecular editing). Núm. de Solicitud: v-1683-10 País de prioridad: ESPAÑA Fecha de prioridad: 2010. Entidad Titular: Biotech Vana S.L. Código Patente: 000299

7. Inventores/as (p.o. de firma): Llorens, C.; Futami, R.; Covelli, L.; Domínguez-Escribá, L.; Muñoz-Pomer, A.; Viu, J.M.; Fuster, G.; Moya, A. Título: The Gypsy Database (GyDB) of mobile genetic elements release 2.0. Núm. de Solicitud: v-1307-10 País de prioridad: ESPAÑA Fecha de prioridad: 2010. Entidad Titular: Biotech Vana S.L. Código Patente: 000300.

PUBLICACIONES AÑO 2016 Gosalbes, M.J.; Vázquez-Castellanos, J.F.; Angebault, C.; Woerther, P.L.; Ruppé, E.; Ferrús, M.L.; Latorre, A.; Andremontc, A.; Moya, A. 2016. Carriage of enterobacteria producing extended spectrum beta-lactamases and composition of the gut microbiota in an Amerindian community. Antimicrobial Agents and Chemotherapy 60(1):507-14. AÑO 2015 Abendroth, C.; Vilanova, C.; Günther, T.; Luschnig, O.; Porcar M. 2015. Eubacteria and archaea communities in seven mesophile anaerobic digester plants in Germany. Biotechnol Biofuels 8:87.

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TESIS DOCTORALES Título: Estudi de les bases moleculars que controlen el polifenisme reproductiu en pugons (Sexualitat vs. Partenogènesi). Doctorando: Miguel Barberá Sola Directores: Dr. David Martínez Fecha: En proceso. Título: Cuestiones filosóficas del mejoramiento humano asociado a la medicina regenerativa Doctorando: Pablo García Barranquero Directores: Dr. Andrés Moya (UV), Dr. Antonio Javier Diéguez Lucena (Univ. Malaga) Fecha: En proceso. Título: Análisis estequiométrico, exhaustivo y comparado, de la bioenergética de bacterias endosimbiontes Doctorando: Jorge Calle Espinosa (UCM) Directores: Dr. Juli Peretó (UV), Dr. Francisco Montero (UCM). Fecha: En proceso. Título: Estructura y causalidad en la teoría evolutiva Doctorando: Victor Luque Martín Directores: Dr. Andrés Moya (UV), Dr. Valeriano Iranzo (UV). Fecha: En proceso. Título: “Investigating the evolutionary pathways towards replacement or complementation in the evolution of insect endosymbionts.” Doctorando: Alejandro Manzano Directores: Dr. Amparo Latorre Fecha: En proceso. Título: Estudio molecular del consorcio bacteriano Buchnera aphidicola/Serratia symbiotica en pulgones de la subfamilia Lachnidae. Doctorando: Vanesa Martínez Díaz Directores: Dr. Amparo Latorre y Dr. Rosario Gil Fecha: En proceso. Título: Integración de datos multi-omicos en la microbiota intestinal humana Doctorando: Daniel Martínez Martínez Director: Dr. Andrés Moya Fecha: En proceso. Título: “Computational analysis of genome-scale metabolic networks: new approaches to metabolic reduction and complementation in bacterial endosymbionts” Doctorando: Miguel Ponce de León (UCM) Directores: Dr. Juli Peretó (UV), Dr. Francisco Montero (UCM). Fecha: En proceso. Título: Análisis evolutivo de la reducción genómica en endosimbiontes de insectos. Doctorando: Bertha Mariana Reyes Directores: Dr. Andrés Moyá Fecha: En proceso. Título: Variabilidad viral en las coinfecciones HCV-HIV Doctorando: Vicente Sentandreu Corberá Directores: Dr. Andrés Moya y Dr. Fernando González Fecha: En proceso.

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Título: El genoma del gorgojo del arroz, Sitophilus oryzea: el sistema inmune y la síntesis de aminoácidos Doctorando: Carlos Vargas Directores: Dr. Amparo Latorre (UV), Dr. Aziz Heddi (INSA, France) Fecha: En proceso. Título: Aplicaciones biotecnológicas de insectos que viven en ambientes recalcitrantes Doctorando: Cristina Vilanova Directores: Dr. Manel Porcar y Dr. Amparo Latorre Fecha: En proceso. Leídas Título: “Characterization of the mutualistic endosymbiosis between intracellular bacteria and mealybugs (Hemiptera: Pseudococcidae)” Doctorando: Sergio López Madrigal Directores: Dr. Rosario Gil y Dr. Andrés Moya Lugar y año: Facultad de Biología. Universidad de Valencia, Mayo 2015. Calificación: Excelente “Cum laude” Título: “Effects of antibiotics and Clostridium difficile infection on the human gut microbiota” Doctorando: Ana Elena Pérez Cobas Directores: Dr. Amparo Latorre, Dr. Andrés Moya y Dr. María José Gosalbes Lugar y año: Facultad de Biología. Universidad de Valencia, Mayo 2015. Calificación: Excelente “Cum laude” Título: La relación entre el reduccionismo y la biología: análisis filosófico en el contexto de la genética, la evolución y el desarrollo Doctorando: Joan Riera Pabón Directores: Dr. Andrés Moya Lugar y año: Facultad de Filosofía. Universidad Nacional de Educación a Distancia, Febrero 2015. Calificación: Sobresaliente Título: "Endosymbiont communities in Bemisia tabaci: a metagenomic approach". Doctorando: Diego Santos Directores: Dr. Francisco Silva, Dr. Amparo Latorre y Dr. Andrés Moya Lugar y año: Facultat de Ciències Biològiques. Universitat de València, Diciembre 2014. Calificación: Apto “Cum laude” Título: "Evolutionary genomics and functional studieson the metabolic role of Blattabacterium sp., primary endosymbiont of cockroaches". Doctorando: Rafael Patiño Navarrete Directores: Dr. Amparo Latorre Lugar y año: Facultat de Ciències Biològiques. Universitat de València, Juliol 2013. Calificación: Apto “Cum laude” Título: “Variability of the human gut microbiota in space, time, and associated with the irritable bowel syndrome”. Doctorando: Ana Durbán Vicente Directores: Dr. Juan José Abellán, Dr. Amparo Latorre y Dr. Andrés Moya Lugar y año: Facultat de Ciències Biològiques. Universitat de València, Abril 2013. Calificación: Apto “Cum laude” Título: “El terrorisme suïcida: Una hipòtesi evolucionista sobre el suïcidi”. Doctorando: Josep Ripollés Garcia Directores: Dr. Andrés Moya Lugar y año: Facultat de Filosofia i Ciències de l'Educació. Universitat de València, Octubre 2012. Calificación: Apto “Cum laude”

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Título: Fraccionando la microbiota gastrointestinal humana. Doctorando: Francesc Peris Bondia Directores: Dr. Amparo Latorre Castillo y Dr. Giuseppe D’Auria. Lugar y año: Facultad de CC. Biológicas, Universitat de València, 28 junio 2012. Calificación: Apto “Cum Laude”. Título: Genómica comparada y evolutiva de endosimbiontes de pulgones Doctorando: Araceli Lamelas. Directores: Dra. Amparo Latorre Castillo y Dra. María José Gosalbes Soler Lugar y año: Facultad de CC. Biológicas, Universitat de València, 26 noviembre 2010. Calificación: Sobresaliente “cum laude”. Título: “Genome evolution and systems biology in bacterial endosymbionts of insects” Doctorando: Eugeni Belda Cuesta. Directores: Dr. Francisco Silva Moreno y Dr. Andrés Moya. Lugar y año: Facultad de CC. Biológicas, Universitat de València, 29 octubre 2010. Calificación: Sobresaliente “cum laude” (Doctorado Europeo). Título: Bases moleculares del control del modo de reproducción en pulgones. Identificación de genes regulados por el fotoperiodo y caracterización de los elementos del reloj circadiano en Acyrthosiphon pisum. Doctorando: Teresa Cortés Méndez Directores: Dr. David Martínez Torres. Lugar y año: Facultad de CC. Biológicas, Universitat de València, 11 junio 2010. Calificación: Sobresaliente “cum laude”. Título: Evolución de la virulencia en el virus de la estomatitis vesicular (VSV) durante la adaptación al hospedador. Doctorando: Victoria Furió Gomar-González. Directores: Dr. Rafael Sanjuán Verdeguer y Dr. Andrés Moya. Lugar y año: Facultad de CC. Biológicas, Universitat de València, 14 enero 2010. Calificación: Sobresaliente.