Upload
tophisopam
View
368
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Эпигенетика
Не все определяется последовательностью нуклеотидов в ДНКВсе клетки организма обладают одной и той же ДНК, но при этом сами по себе сильно отличаются друг от друга
Наличие у самок млекопитающих двух Х-хромосом не приводит к тому, что у них есть в 2 раза больше белков, закодированных этими хромосомами
Однояйцевые близнецы могут отличаться друг от друга
У одного и того же существа могут быть разноцветные глаза
Инактивация Х-хромосомыГен 6-глюкозо-фосфатдегидрогеназы мыши находится на X-хромосомеУ мышей с мутацией в одной из двух Х-хромосом часть эритроцитов имеет активный белок, а часть – мутантныйЭто означает, что вторая Х-хромосома случайным образом инактивируетсяУ особей с тремя Х-хромосомами активна все равно только однаУ мышей отцовская Х-хромосома «выключается» на стадии 2-4 клеток, а потом на стадии бластоцисты «включается» обратно, причем последующая инактивация носит случайный характер (у сумчатых всегда неактивна отцовская)
Инактивация Х-хромосомы
Гены с инактивированной Х-хромосомы не экспрессируются
Неактивная Х-хромосома очень плотно упакована в т.н. тельце Барра (Barr body)
Dosage compensation
Млекопитающие - инактивация Х-хромосомы
Многие насекомые (кузнечики, сверчки, тараканы) используют XO-систему определения пола. При этом когда Х-хромосома одна, она работает в два раза лучше (активация)
В C. elegans обе X-хромосомы у гермафродитов подавлены, но на ~50%
Клеточная памятьПочти все клетки, будучи отделены от организма, «помнят» свою историю
Импринтинг: специфичная в отношении родителя экспрессия генов в диплоидных клетках
Импринтинг: преимущественно затрагиваются гены, участвующие в развитии эмбриона
viroids/вироидыНебольшие (от 220 нуклеотидов) паразитные одноцепочечные РНК
Не кодируют никаких генов
Некоторые вироидные РНК являются рибозимами и вырезают себя из транскрипционных интермедиатов
Не имеют характерной для вирусов белковой оболочки
Potato spindle tuber viroid
Могут влиять на фенотип организма (непонятно, казалось бы, как – они же не кодируют белки?!)
RNA interference
Andrew Z. Fire Craig C. Mello1/2 of the prize 1/2 of the prizeUSA USAStanford University University of MassachusettsSchool of Medicine Medical SchoolStanford, CA, USA Worcester, MA, USA
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2006"for their discovery of RNA interference - gene silencing by double-stranded RNA"
сайленсингЗаражение картофеля PSTV приводит к метилированию последовательностей ДНК, гомологичных геному PTSV
Введение в геном множественных копий гена приводит к сайленсингу эндогенных копий
Мутации белков, вовлеченных в RNAi приводят к исчезновению центромерного гетерохроматина у S.pombe
Центромеры и гетерохроматин
RITS – RNA Induced Transcriptional gene Silencing
Направляет метилирование ДНК в областях, комплементарных siRNA
Направляет модификацию (метилирование) гистонов
Но из всего это следует, что должна существовать специальная центромерная РНК?
Действительно, в области центромеры Х-хромосомы есть два разнонаправленных промотора, направляющие синтез dsRNA, процессируемой далее в scRNA (Xist & Tsix). По другим данным, Tsix нужен для инактивации Xist
Если ввести ген Xist в другую (неполовую) хромосому, то она тоже будет инактивирована
13
Инактивация Х-хромосом
НуклеосомыСостоят из гистонов
Гистоны могут модифицироваться
Модификации гистонов
Ацетилирование гистонов
Ацетилирование остатков лизина уменьшает положительный заряд и ослабляет связывание с ДНК
Препятствует образованию ‘30 nm fiber’
Промотирует связывание факторов транскрипции
Помимо гистоновых ацетилаз, существуют также и деацетилазы
Метилирование гистоновМетилироваться могут остатки лизина
метилированиеСуществует множество разных метилаз, отвечающих на разные процессы
Связь модификаций
Возникновение одной модификации может как препятствовать появлению другой, так и помогать ее появлению
Нуклеотиды ДНК
CpG-island
Метилируются цитозины в палиндромной последовательности CG
5’ CpG 3’3’ GpC 5’
22
Связь метилирования ДНК и ацетилирования гистонов
23
ДНК-метилазыDnmt1: эмбрион погибает на ранних стадиях
Dmnt2: нет видимых эффектов
Dnmt3: эмбрион погибает на поздних стадиях
Dnmt4: эмбрион погибает на ранних стадиях
Dnmt5: не возникает импринтинг
24
Метилирование при дифференцировке клеток
Метилирование ДНК
Сравнение ДНК близнецов
Зеленый: больше
Желтый: столько же
Красный: меньше
26
наследование по ламарку
27
BNDF - нейротропный фактор моза
У крысы, употребляющих кокаин, как и у людей развивается зависимость
В мозгу начинает излишне экспрессироваться BDNF
Метилируются гистоны и ДНК
При этом модификация происходит также и в половых клетках
Самцы в следующем поколении более устойчивы к действию кокаина (дольше развивается привыкание)
Что запомнить:Метилирование ДНК как способ регуляции транскрипции
Модификация гистонов как способ упаковки ДНК в гетерохроматин
ncRNA как «маркеры» модифицируемых областей ДНК
Импринтинг: специфичная в отношении родителя экспрессия генов в диплоидных клетках