23
26Dec15 Copyright Dan Edwards 1

26Dec15 CopyrightDan)Edwards) 1ourpuzzlingpast.com/geneblog/wp-content/uploads/2015/12/Ancestry... · Found)on)the)AncestryDNA)DNA)landing)page)for)each)kit:) Thegoalof creangmirrored$

Embed Size (px)

Citation preview

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   1  

Collec:ons  of  family  histories  (Trees  and  documents)  

Sets  of  DNA  Matches                    

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   2  

Successfully  Finding  Ancestors  and  Birth  Families  through    Matches’  Trees  at  AncestryDNA  

Depends  upon  Exploita:on  of  at  least  three  par:es:  1.  You  

•  Your  DNA  test  at  AncestryDNA  and  the  resultant  match  list  2.  A  Close  match  

•  Close  cousin’s  DNA  test  at  AncestryDNA    •  Clouse  cousin  family  history  as  represented  by  their  public  pedigree  

3.  Another  party  •  Match  #2’s  DNA  test  at  AncestryDNA    •  Match  #2’s  family  history  as  represented  by  their  public  pedigree  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   3  

Fundamentals  •  Defini:on  of  “To  Mirror”:  

Ø  To  copy  a  pedigree  of  a  DNA  match  •  That  you  then  use  as  a  proxy  for  your  own  pedigree  

•  Primary  tools:  1.  AncestryDNA  DNA  match  list  2.  AncestryDNA’s  Shared  Ancestor  pedigree  matching  system  3.  Ancestry.com  tree  soQware  

•  Usefulness  Ø  Depends  upon  how  many  of  your  cousins  have  tested  

•  AncestryDNA    database  of  tests  currently  favors  US  colonials  but  that  is  changing  as  AncestryDNA  offers  their  product  in  other  countries.  

Ø  Perseverance  is  important  as  one  may  have  to  wait  a  while  un:l  a  revelatory  DNA  match  appears.  

Note  that  Ancestry  soQware  capabili:es  

may  change  at  any  :me  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   4  

Note:  this  intensive  use  of  con:nually  connec:ng  and  disconnec:ng  mirrored  pedigrees  in  an  aVempt  to  use  the  shared  ancestor  hints  to  discover  bio-­‐families  is  an  “off-­‐label”  use  of  the  system  as  we’ve  not  seen  AncestryDNA  discuss  or  encourage  this.  

Found  on  the  AncestryDNA  DNA  landing  page  for  each  kit:   The  goal  of  crea,ng  mirrored  pedigrees  for  an  AncestryDNA  kit  is  to  generate  these  Shared  Ancestor  Hints  

Knowing  What  You  Bought    at  AncestryDNA  

The  number  of  “4th  cousins”  (really  meaning  es,mated  4th  to  6th  cousins)  or  closer  is  based  ONLY  on  DNA  matching  and  has  nothing  to  do  with  aGached  trees.  

covered  for  privacy  

covered  for  privacy  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   5  

Also  found  on  the  landing  page  is  the  link  to  the  “ethnicity”  es9mate  page.    We  are  ignoring  those  inten9onally.  

Algorithm  For  Exploi:ng  Mirrored  Pedigrees  Ø  Create  a  Private,  Non-­‐searchable  tree  on  ancestry.com  for  research,  hereaQer  referred  as  

your  research  tree.  Ø  You  only  need  one  such  tree  as  any  ancestry.com  tree  can  contain  many  thousands  of  people  and  you  can  connect  

and  disconnect  individuals  to  each  other  as  oQen  as  you  wish;  you  will  want  to  maintain  a  large  database  of  possible  rela:ves  anyway  and  it  is  easier  to  manage  one  large  database  of  possible  rela:ves  than  many  different  databases.    So  if  you  are    going  to  mirror,    for  example  your  closest  25  matches  you  don’t  need  25  trees  –  just  one  tree  (i.e.  database)  will  do.  

Ø  Edi:ng  individuals  in  an  ancestry.com  tree  and  manipula:ng  trees:    see  the  many  Ancestry.com  videos  for  direc:ons.  Ø  Make  your  specula:ve  trees  non-­‐searchable  so  that  other  ancestry.com  users  won’t  stumble  across  your  tree  and  

incorporate  your  specula:ons  into  their  trees.  

Ø  Start  with  your  closest  match  of  unknown  rela:onship  to  you,  who  has  a  pedigree  aVached  to  their  test  of  at  least  a  few  genera:ons.        Ø  If  a  match  doesn’t    have  a  pedigree  aVached  obviously  there  is  nothing  there  to  mirror  (but  you  might  s:ll  find  it  

useful  to  use  the  Shared  Matches  capability  of  AncestryDNA  on  such  a  match.)  Ø  If  you  have  a  close  match  you  want  to  research  and  they  only  have  aVached  a  short  pedigree,  you  can  research  their  

ancestors  and  if  their  families  are  well  documented  you  can  build  back  their  pedigree  and  use  it    for  your  own  pedigree.    However,  be  aware  that  there  are  many  poorly  researched  trees  at  ancestry.com  and  as  you  build  pedigrees  look  for  suppor:ng  documenta:on.  

Ø  Copy  your  match’s  pedigree  (star:ng  with  your  match  as  the  root)  to  a  reasonable  depth  (to  3rd  or  4th  great  grandparents  as  a  minimum  is  oQen  needed),    Ø  by  entering  the  individuals  from  your  match’s  pedigree  into  your  research  tree  and  connec:ng  them  to  each  other  as  

shown  in  your  match’s  pedigree  chart.  Ø  Start  with  the  direct  lines  –  ie.  the  parents,  the  parents  of  the  parents,  and  so  on.    Later  you  will  probably  want  to  go  

back  and  add  in  other  individuals  (siblings  and  spouses)  depending  upon  whether  you  discover  a  direct  line  ancestor  is  common  to  other  kits  in  the  AncestryDNA  database.  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   6  

Algorithm  For  Exploi:ng  Mirrored  Pedigrees  (cont.)  

Ø  AVach  your  AncestryDNA  kit  to  the  root  person  (your  match’s  posi:on  in  the  mirrored  pedigree.)  

Ø  Wait  un:l  the  AncestryDNA  Shared  Ancestor  matching  system  does  its  work  in  comparing  the  pedigrees  of  DNA  matches  (this  can  take  a  couple  of  hours  to  a  couple  of  days.)  Ø  On  occasion  the  Shared  Ancestor  Hint  system  can  appear  to  get  stuck,  not  changing  shared  ancestors  hints  

even  though  you’ve  changed  the  person  to  which  you’ve  aVached  your  DNA  kit.      You  may  have  to  detach  your  kit  and  wait  a  couple  of  days  un:l  all  the  previous  shared  ancestor  hints  clear  out,  and  then  aVach  your  kit  to  your  new  root  person.  

Ø  If  Shared  Match  hints  are  created  (which  will  be  reported  to  you  on  your  DNA  landing  page),  view  each  match  flagged  as  such  for  the  common  ancestors.  Ø  If  for  any  given  mirrored  pedigree  you  get  more  than  one  shared  

ancestor  hint  to  the  same  couple,  you  ought  to  try  the  “second  step”  outlined  later.  

Ø  Repeat  the  mirror  pedigree  crea:on  then  for  the  next  closest  match  on  your  list  for  whom  you  don’t  know  the  connec:on.  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   7  

Shared  Ancestor  Hint  Appearance  on  a  DNA  Match  Page  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   8  

covered  for  privacy  

covered  for  privacy  

covered  for  privacy  

covered  for  privacy   covered  for  privacy  

covered  for  privacy  

covered  for  privacy  

“You”  as  the  person  whose  pedigree  you  mirrored.  

A  DNA  match  in  your  match  list  who  has  a  family  tree  aVached  to  their  kit.  

Ancestors  your    two  matches  (the  one  you  mirrored,  and  another  one)  share  that  may  be  your  ancestors    too.  

If  the  match  is  not    contactable  use  the  “Shared  Matches”  capability  (discussed  later)  of  AncestryDNA  to  iden:fy  common  rela:ves  who  might  be  contactable.  

Ø  “Possible  range:  Parent,  Child  -­‐  immediate  family  member”  

Your  parent  or  sibling  is  in  the  database!      Mirroring  not  necessary  if  your  goal  was  to  find  such  person.          

Ø  “Possible  range:  Close  family  -­‐  1st  cousins”  Your  half-­‐sibling,  aunt/uncle,  or  grandparent  is  in  the  database!    Mirroring  might  provide  more  informa:on  but  contact  is  the  most  direct  way  to  your  final  goal  if  you  are  seeking  birth  family.    

When  To  Use  Mirroring  with  Matches  

Ø  “Possible  range:  1st  -­‐  2nd  cousins”    You  have  a  first  or  second  cousin,  or  half-­‐first  cousin,  or  half-­‐aunt/uncle,  or  grand  aunt/uncle,  or  a  double  2nd  cousin,  in  the  database.  Ø  However,  unless  you  happen  across  a  family  group  who  have  tested  many  of  

their  family  members,  you  are  unlikely  to  get  shaky  leaf  hints  on  grandparents.    Great  grandparents  are  more  likely  to  be  found.        

Ø   If  you  are  lucky  to  have  many  such  close  matches  with  aVached  pedigrees,  you  can  some:mes  see  their  common  ancestors  just  by  visual  inspec9on  of  their  pedigrees.  

 

The  ul:mate  usefulness  of  mirroring  any  given  match  may  depend  upon  the  closeness  of  the  match  whose  pedigree  you  wish  to  mirror.        

Per  es9mated  (by  AncestryDNA)  kinship  categories:  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   9  

When  To  Use  Mirroring  with  Matches  (cont.)  

Ø  “Possible  range:  2nd  -­‐  3rd  cousins”  Your  DNA  match  is  a  cousin  not  too  close  and  thus  may  not  have  personal  knowledge  about  your  birth  family,  but  you  share  at  least  one  common  ancestor  not  too  long  ago.  •  Most  recent  common  ancestor  is  likely  post  Civil  War  (in  the  USA)  or  an  immigrant  late  

enough  to  be  found  in  immigra:on  documents.    Ø  “Possible  range:  3rd  -­‐  4th  cousins”  

Your  DNA  match  is  a  cousin  not  too  close;  these  are  challenging  but  workable  in  finding  family  groups  which  include  your  ancestors.      You  probably  have  many  biological  cousins  in  this  kinship  range  in  society  at  large  (even  if  not  yet  DNA  tested)  so  you  are  likely  to  have  some  in  your  match  list  but  it  can  take  considerable  work  doing  descendency  research  to  narrow  down  your  birth  family  with  these  kind  of  matches.  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   10  

Matches  of  this  distance  are  oQen  produc:ve  for  doing  genealogy  work  because  the  shared  ancestors  lived  during  a  period  when  it  is  likely  they  leQ  some  documenta:on  that  can  be  found.    Discovering  shared  ancestors  at  this  depth  can  reinforce  hypotheses  regarding  possible  closer  rela:ves.  

Pedigree  Chart,  of  moderate  depth  and  high  completeness,  Mirrored  from  a  close  match,  illustra:ng  shared  ancestor  hints    

Close  match  you  mirrored  

parents   grandparents   Great  grandparents   2nd  great  grandparents   3rd  great  grandparents  

Your  DNA  kit  aVached  here  

Typical    3rd  cousin  match  

Your  possible  ancestor  Your  possible  ancestor  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   11  

When  To  Use  Mirroring  with  Matches  (cont.)  Ø  “Possible  range:  4th  -­‐  6th  cousins”    Ø  “Possible  range:  5th  -­‐  8th  cousins”  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   12  

In  both  of  these  cases  there  are  significant  challenges  arising  from:  •  Randomness  of  DNA  inheritance  

•  We  can  have  matches  from  very  distant  cousins  who,  by  random,  might  share  an  expected  amount  of  DNA  similar  to  4th  cousins.  

•  We  can  have  3rd  cousins  with  whom  we  share  no  significant  chromosome  regions  and  thus  are  not  “matches”,  or,  are  matches  but  share  such  small  chromosome  regions  that  they  appear  as  distant  cousins.  

•  Accumula:on  of  NPEs/adop:ons  through  :me  •  NPE  rates  of  1%  to  2%  per  genera:on  means  that  the  paper  pedigrees  

connec:ng  many  5th  cousins  are  not  the  connec:on  via  DNA.  •  Significant  numbers  of  non-­‐documented  adop:ons  during  :mes  of  wars  

and  famines,  and  plagues.  •  Inaccuracy  of  deep  family  trees  

•  Records  are  oQen  missing  and  family  histories  are  inferred  •  Genealogy  scams  of  the  past  

Common  Errors  and  Pinalls  •  Presump:ons:  –  Assuming  the  shared  ancestor  hint  person  is  your  ancestor  

•  Could  be  your  cousin  –  Be  aware  of  “half”-­‐rela:ve  possibili:es  

•  In  an  ancestral  couple  on  which  you  have  a  shared  ancestor  hint  you  may  be  related  to  only  one  of  the  two.  

•  Tree  mismanagement  –  Duplica:ons  of  too  many  trees  

•  Solu:on:  Use  a  single  database  –  Not  making  the  research  tree  private  and  non-­‐searchable  

•  AVaching  your  DNA  test  to  long  dead  people  •  Using  too  distant  of  matches  –  Solu:on:  Use  “Extremely  High”  probability  matches  at  AncestryDNA  –  these  are  your  closest  rela:ves  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   13  

Ø  What  to  do  when  one  thinks  one  has  found  an            ancestor:  Create  a  Descendant  chart  for  two  genera:ons  

Ø  Spouses  of  children  of  ancestor  Ø  Grandparents  of  spouses  

Second  Steps  and  Special  Cases  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   14  

Use  mirroring  technique  on  various  grandchildren  of  ancestor  to  find  through  which  child  of  a  shared  hint  ancestor  you  may  be  descended.  

This  amount  of  depth  in  a  mirrored  tree  is  not  necessary  and  can  be  misleading  

=  

Add  sib

lings    

and  spou

ses  

Your  mirrored  match  

Second  Steps  and  Special  Cases  (cont.)  Ø  Large  numbers  of  “3rd  to  4th  cousin”  matches:  

–  If  you  have  very  many  matches  es:mated  to  be  3rd  to  4th  cousins  then  one  or  both  of  your  parents  may  come  from  endogamous  popula:ons  •  Ashkenazi  Jews  (AJ)  •  Island  popula:ons  

–  Hawaii  and  Polynesia  –  Puerto  Rico  

•  Very  many  genera:ons  of  cousin  marriages  combined  with  rela:vely  small  founding  popula:ons  leads  to  many  small  but  sta:s:cally  significant  shared  chromosome  regions  between  any  two  individuals  in  these  popula:ons,  making  one  seem  like  a  4th  cousin  to  everyone  in  the  popula:on.  

•  Mirroring  and  cousin  network  methods  may  be  of  limited  use  •  Possibly  Y  chromosome  and  mitochondrial  DNA  matching  methods  may  be  required  

Ø  Shared  ancestor  hints  may  appear  on  several  different  lines  in  a  mirrored  pedigree:  –  Mul:ple  cousins:  double  first  cousins,  double  2nd  cousins,  combined  2nd  and  3rd  

cousins,  etc.  •  You  have  ancestors  who  married  siblings  from  the  same  family,  or  married  cousins,  and  this  may  occur  

more  than  once  on  any  of  your  lines.    This  is  not  uncommon.  •  Our  ancestors  tended  to  find  mates  within  their  small  communi:es,  leading  to  family  trees  being  very  

interwoven.  •  This  is  one  reason  why  you  want  to  keep  a  single  database  (i.e.  a  single  research  tree)  as  you  may  have  

to  research  an  en:re  liVle  community  and  families  may  be  mul:ply  connected!  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   15  

Addi:onal  Techniques  For  Data-­‐Mining  Matches’  Pedigrees  

Ø  Networks:  Crea:ng  sets  of  individuals,  each  of  whom  may  match  only  a  subset  of  the  en:re  set.  Ø  DNA  Circles/  NADs  Ø  Custom  made  networks  

•  Using  an  In  Common  With  tool  Ø  Segment  mapping:  For  each  autosome  and  the  X  chromosome,  

using  cousin  matches  to  assign  por:ons  of  chromosomes  to  ancestors.  This  method  requires  going  from  the  known  to  the  unknown  

•  Suited  beVer  for  those  who  already  know  some  of  their  ancestors  and  have  iden:fied  tested  cousins.  

Ø  Jeff  Snavely’s  Chrome  extension  Ø  Harvests  ancestors  from  matches.  Ø  If  used  then  mirroring  may  be  redundant.  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   16  

Networks  of  Matches:  Of  DNA  Circles  and  New  Ancestor  Discoveries  (NADs)  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   17  

The  “New  Ancestor”  -­‐  If  not  a  direct  line  ancestor,  then  a  cousin  or  a  spouse  of  a  cousin.      In  some  cases  he/she  will  be  an  ancestor  of  a  spouse  of  a  cousin.  

If  you  mirror  the  pedigree  of  one  of    these  matches  then  the  person  at  the  center  of  the  NAD  (in  this  case  James  Turner)  will  show  up  as  a  shared  ancestor  hint  for  that  pedigree.  

View  the  Ancestry  Academy  Course  for  More  informa:on  on    DNA  Circles  and  NADs  

The  person  to  which    the  AncestryDNA  Kit  is  aVached  but  who  does  not  have  the  NAD  target  ancestor  in  their  current  pedigree.  

Sample  NAD:  

Why  use  Mirroring  if  AncestryDNA  has  NADs?    

Ø NADs  exist  because  DNA  Circles  exist.  –  Every  NAD  in  the  system  is  a  DNA  Circle  for  at  least  a  few  other  

people.  –  If  an  ancestor  is  not  the  center  of  a  DNA  Circle  somewhere  in  the  

system,  then  there  will  be  no  NAD  for  others  to  exploit.  

Ø  Even  though  mul:ple  instances  of  an  ancestor  may  exist  in  the  AncestryDNA  aVached  pedigree  database,  a  DNA  Circle  s:ll  may  not  be  created:  –  The  requirements  for  the  crea:on  of  DNA  Circles  may  be  too  strict  

•  Spelling  varia:on  in  names  can  keep  the  DNA  Circle  algorithm  from  iden:fying  common  ancestors.  

–  Database  dynamics:  people  are  constantly  changing  pedigrees  to  which  they  aVach  DNA  kits,  so  DNA  Circles  with  cri:cally  few  members  may  disappear  easily.  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   18  

Custom  Networks  of  Common  Matches  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   19  

“Shared  Matches”  Tool  provided  to  find  matches  In  Common  With  with  any  match  in  your  list.    Found  on  each  of  your  AncestryDNA  match  pages:  

Returns  a  list  of  DNA  matches  of  confidence  (to  you)  of  “Extremely  High”  and  “Very  High”  (and  thus  excluding  matches  only  “High”,  “Good”,  and  “Moderate”)  who  also  are  a  DNA  match  to  your  currently  viewed  match.  

That  these  cousins  cluster  together  is  sugges:ve  that  they  share  ancestors,  or  their  ancestors  inter-­‐married.  

Keep  a  spreadsheet  for  cousin-­‐clusters.    Diagramming  the  connec:ons  may  help  visualize  the  families.  

Chromosome  Mapping  Ø  As  AncestryDNA  does  not  currently  offer  shared  region  (“segment”)  data  between  

matches,  chromosome  mapping  of  matches  at  AncestryDNA  is  not  possible  unless  one  transfers  their  genotype  data  to  3rd  party  sites  (gedmatch.com,  or  FTNDA.)  

Ø  Chromosome  mapping  works  by  going  from  the  known  to  the  unknown,  thus  requires  knowledge  of  shared  ancestors  with  a  known  cousin.  

Ø  For  a  discussion  of  these  techniques  and  tools  see:    hVp://blog.kiVycooper.com/tag/chromosome-­‐mapping/  

Ø  If  one  does  not  know  at  least  a  few  of  their  biological  predecessors  then  one  cannot  do  chromosome  mapping.      However,  one  may  be  able  to  benefit  from  the  work  of  others.    If  you  have  a  match  who  has  successfully  mapped,  to  one  set  of  their  ancestors,  the  shared  chromosome  region  between  the  two  of  you  then  you  know  that  ancestral  couple  are  your  rela:ves,  possibly  your  direct  line  ancestors,  but  at  least  your  cousins.  

Ø  Overall,  it  is  a  powerful  technique  but  requires  a  great  amount  of  work.  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   20  

Crea:ng  A  Large  Database  of  Ancestors  of    Your  DNA  Matches  

Ø  As  each  of  your  AncestryDNA  match  pages  has  a  list  of  pedigree  entrants  for  the  DNA  match  of  that  page,  if  the  DNA  kit  is  aVached  to  a  tree,  it  is  possible  to  collect  these  ancestors  into  a  large  database.  

Ø  Extraordinarily  laborious  to  do  this  manually,  though  technically  possible.  Ø  A  Google  Chrome  browser  extension  has  been  developed  to  automate  the  

process:  “AncestryDNA  Helper”  (search  for  that  name  at  the  Google  store.)  –  Check  the  Yahoo  group:  hVps://groups.yahoo.com/neo/groups/AncestryDNA_Discussion/info  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   21  

covered  for  p

rivacy  

Same  ancestor  found  in  several  pedigrees  from  different  families  

Several  different  DNA  kits  

Once  a  database  of  the  ancestors  from  thousands  of  matches  is  compiled,  common  ancestors  of  matches  become  no:ceable  (in  this  case  a  3rd  great  grandfather):  

Crea:ng  A  Large  Database  of  Ancestors  of    your  DNA  Matches  (cont.)  

Ø  However,  one  must  s:ll  be  careful  not  to  assume  someone  occurring  mul:ple  :mes  in  the  pedigrees  of  your  matches  is  your  ancestor.      They  could  be  a  cousin!  

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   22  

Same  ancestor  found  in  several  pedigrees  from  different  families  

Several  different  DNA  kits  

•  Here  an  ancestor  of  several  matches  shows  up  in  a  match  list,  but  in  this  case  the  ancestor  is  a  2nd  great  grand  uncle!  :  

In  this  case,  it  took  researching  the  siblings  of  this  gentleman  and  no:cing  more  matches  to  his  father  (on  previous  page)  and  that  there  were  matches  to  his  siblings  too,  to  be  sure  this  Theodore  was  an  uncle,  not  a  direct  line  ancestor.    

Conclusion:  Strategies  Ø  To  maximize  poten:al  of  AncestryDNA  Shared  Ancestor  hints  we  need:  

Ø  Many  individuals  to  do  autosomal  DNA  tests  Ø  Many  of  those  tested  need  to  have  

Ø  Developed  family  histories  Ø  Be  willing  to  share  their  pedigree  publicly  

Ø  This  is  a  collabora:ve  effort    

26-­‐Dec-­‐15   Copyright  Dan  Edwards   23  

Ø  The  Pedigree  Mirroring  technique  allows  one  without  knowledge  of  their  biological  ancestors  to  make  use  of  the  AncestryDNA  Shared  Ancestor  Hint  system.  

Ø  Discovery  of  a  common  ancestor  with  more  than  one  match  combined  with  descendant  research  gives  one  a  list  of  candidates  for  close  family  members.  

Ø  Addi:onally  tes:ng  of  one  or  more  of  these  candidates  can  result  in  the  discovery  of  a  birth  parent/family.  

Encourage  openness  in  the  genealogy  community  

Encourage  people  to  test