19
Молекулярная эволюция рода Tribolodon (Teleostei: Cyprinidae) Семина А.В. лаборатория генетики ИБМ ДВО РАН

Молекулярная эволюция рода Tribolodon (Teleostei: Cyprinidae)

  • Upload
    aurek

  • View
    72

  • Download
    1

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Семина А.В. лаборатория генетики ИБМ ДВО РАН. Молекулярная эволюция рода Tribolodon (Teleostei: Cyprinidae). T. hakonensis. T. brandti. T. nakamurai. T. sakhalinensis. Tribolodon brandti. Tribolodon nakamurai. Tribolodon sakhalinensis. Tribolodon hakonensis. Pseudoaspius leptocephalus. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Молекулярная эволюция рода Tribolodon (Teleostei: Cyprinidae)

Семина А.В.лаборатория генетики

ИБМ ДВО РАН

Page 2: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

T. hakonensisT. brandti

T. nakamuraiT. sakhalinensis

Page 3: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Сахалин

Приморскийкрай

Хабаровский край

Тумнин

ЧибисонБахураФирсовка

СусуяКорсаковка

Лютога

Тат

арск

ий п

роли

в

Японс

кое

море

ХоккайдоСеверо-западТихого океана

Охотское море

Залив Петра Великого

о. Хонсю

Набильский залив

Tribolodon brandti

Tribolodon nakamurai

Tribolodon sakhalinensis

Tribolodon hakonensis

Pseudoaspius leptocephalus

Leuciscus waleskii

Page 4: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Положение четырех исследованных ПЦР-сегментов относительно линейной генной карты митохондриальной

ДНК позвоночных

•ND3/ND4/ND4L/ND5/ND6•A6/A8•COIII•12S/16S

Page 5: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Consensus maximum parsimony tree

Numbers above – bootstrap valuesnreps=1000

Leuciscus waleskii

Pseudoaspius leptocephalusTribolodon sakhalinensis

T. hakonensis южный типT. hakonensis северный типT. nakamurai

T. brandti

C1C2G1N1M1M13M2M9M18M8E1E2E4K1K3K2S1S2S3S16S9

100

100

100

78

78

100

100

100

100

100

Page 6: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

C1C3C4C5C6C7C2 G1 N1 M1M5M15M16M3M13M14M17M8M2M4M6M7M9M10M11M12M18M19M20E1E12E16E14E17E20E2E6E11E3E4E15E19E5E7E8E9E10E13E18 K1K10K16K2K6K7K9K11K12K13K20K3K4K5K8K14K15K17K18K19 S1S4S2S5S8S10S11S13S14S15S18S9S3S6S12S16S17S19S20S70.1

Leuciscus waleskii

99

98

98

98

99

98

Pseudoaspius leptocephalus

T. nakamurai

T. sakhalinensis

T. brandti

T. hakonensis южный тип

T. hakonensis северный тип

Bayesian analysis

Numbers above – posterior probability

Page 7: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Скорость молекулярной эволюции, полученная с помощью калибровки палеонтологических и молекулярных данных

Разброс значений дивергенции при попарном сравнении последовательностей ДНК с момента исходной дивергенции (млн. лет), рассчитанной на основе

появления в ископаемых находках диагностического апоморфного признака.0.66% за 1 млн. лет

2002

Page 8: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Campostoma oligolepis

Campostoma anomalum

Couesius plumbeus

P lagopterus argentissimus

Semotilus atromaculatus

Leuciscus w aleckii

Phoxinus lagow skii

P seudaspius leptocephalus

Tribolodon nakamurai

T ribolodon hakonensis

T ribolodon ezoe

Tribolodon brandti

Cyprinella spiloptera

Rhinichthys atratulus

Rhinichthys osculus

Nocomis biguttatus

Nocomis micropogon

Maximum parsimony treeна основе последовательностей

сyt b

Эволюционные взаимоотношения североамериканских карповых рыб и

и исследуемой группы видов

Maximum parsimony treeна основе последовательностей

сyt b

Dowling et al., 2002Эволюционные взаимоотношения

североамериканских карповых рыб

Page 9: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Четвертичныйпериод

Плейстоценовая

Голоценовая 0.01

1.6 1.6

Неогеновыйпериод

Палеогеновыйпериод

Плиоценовая

Миоценовая 23.7 18.4

3.7

Эоценовая

Палеоценовая

33.7 10.0

57.8 24.1

66.4

5.3

8.6

-

Период ЭпохаНачаломлн. лет

Продолж.млн. лет

Олигоценовая Дивергенция L. waleskii vs. Tribolodon

и P. leptocephalus~20 млн. лет

Ископаемые находки

Tribolodon sp.

Поздний Олигоцен

Дивергенция северной и южной форм T. hakonensis

~3.5 млн. лет

Дивергенция T. nakamurai~8 млн. летПоздний

Миоцен

Дивергенция T. hakonensis,

T. brandti, T. sakhalinensis и P. leptochephalus~14-15 млн. лет

СреднийМиоцен

Page 10: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

р. Амур

р. Раздольная(Суйфун)

Речная система палео-Амура

Речная системапалео-Суйфуна

Северо-западТихого океана

о. Сахалин

о. Хоккайдо

Японс

кое

море

Page 11: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

T. brandti

T. brandti

404

190

T. hakonensis южный тип

T. hakonensis южный тип

501

331

242

147111

67

489

T. hakonensis северный тип

T. hakonensis северный тип

Фрагмент гена гормона роста

~1300 пн

Зонагибридизации

Page 12: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Фрагмент, кодирующий А6/А8/ND3, после обработки рестриктазой RsaI

М1 – 100 bp Ladder+1500 bp; M2 – λ/PstI

Рестрикционные спектры являются строго видоспецифичными и не перекрываются

Page 13: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Фенограмма, иллюстрирующая филогенетические отношения между северными и южными популяциями Tribolodon

hakonensis

Северный тип T. hakonensisЮжный тип T. hakonensis

Популяции:

1. р. Фирсовка2. р. Ильинское3. р. Бахура4. р. Корсаковка5. р. Тумнин

6. р. Терней7. зал. Восток8. р. Раздольная

Page 14: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Кета – Oncorhynchus keta

Page 15: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Филогенетические отношения в популяциях кеты

Page 16: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Пиленгас

Лобан

Сингиль

Сем. Mugilidae

Page 17: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)
Page 18: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)

Филогенетические отношения кефалей Японского, Азовского и Средиземного морей

Page 19: Молекулярная эволюция рода Tribolodon  (Teleostei: Cyprinidae)