43

Click here to load reader

العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

المميزة العالماتالجزيئية

Molecular Markers

Page 1

Page 2: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

النبات مربى تواجه صعوبات

Page 2

تنفيذ أثناء الصعوبات من عديد النبات مربى تواجهكالمقاومة المرغوبة الصفات لنقل التربية برنامجالغير البيئة ظروف و والحشرات لالمراض: ) اهمها ) – – وغيرها حرارة ملوحة جفاف مناسبة

Page 3: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 3

1- ) ( سنوات عدة اجيال عدة الى النبات مربى manyيحتاجgenerations needed من المرغوبة الصفة نقل يمكن حتى

مثل االخرى التهجين طرق أو الرجعى التهجين برنامج خالل. غيرها أو التجميعى التهجين أو النسب تتبع مع التهجين

ǺǷǾǬȇǂǘdz¦ÀȂǰƬƫ .§ Ƣǐ ƻȏ¦ÂƶȈǬǴƬdz¦ƨȈƫ¦̄ DzȈǏ ƢƸǸdz¦ǺȈLjƸƫȄǧƢǷ¦ƾƼƬLJ¦¼ǂǘdz¦ǂưǯ¢ǺǷƤLjǼdz¦ǾǬȇǂǗ

:ƨȈLJƢLJ¢©¦ȂǘƻªȐƯÎ .§ ¢ǺȇȂƥ¢ǺȈƥǺȈƴȀƬdz¦� -ÏƨƦƼƬǼǸdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦¾ƢLjǻ¢Ǿǟ¦°± -

.ƢȀƬǜƷȐǷƨdzȂȀLjdz̈ƾǟƢƦƬǷÐDzȈƳǺǷƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦DzǬƫƮȈƷǾǬȈǫ®©ȐƴLjƥ· ƢǨƬƷȏ¦ -

.ǾȈǴȇÃǀdz¦DzȈƴdz¦Ȅdz¤

džǷƢƼdz¦DzȈƴdz¦F5

² ®ƢLjdz¦DzȈƴdz¦F6

ǞƥƢLjdz¦DzȈƴdz¦F7

ȄƬƷÂǺǷƢưdz¦ǺǷ¾ƢȈƳȋ¦

ǂNjƢǠdz¦ȄǻƢưdz¦F8-F12

)§(§ ȋ ¦ × )¢(§ ȋ ¦

ȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦F2

Ǟƥ¦ǂdz¦DzȈƴdz¦F4

ƮdzƢưdz¦DzȈƴdz¦F3

ǂưǰȇǶƯǞǫȂǷǺǷǂưǯ¢Ȅǧ©¦°ƢƦƬƻ¤Ãǂƴƫ

ƾȇƾƳǦǼǐ ǯƢȀǠȇ±ȂƬdz©ȏȐLjdz¦Dzǔǧ¢

ƨƦLJƢǼǷÀȂǰƬdzƾƷȄǐ ǫȋ °̈ǀƦdz¦̈®Ƣȇ±

ƾ̈ȇƾƴdz¦ƨȈƯ¦°Ȃdz¦ƤȈǯ¦ǂƬǴdz

¢ƾƦȇÂ̈ƾǟƢƦƬǷȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦©ƢƫƢƦǻǾǟ¦°±

©ƢƫƢƦǼdz¦ǽǀǿǺȈƥ§ ƢƼƬǻȍ¦

ƨǟ¦°±ƨƦƼƬǼǸdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦°Âǀƥ̧°DŽƫ

§ ƢƼƬǻƜƥƶǸLjƬdz»ȂǨǏ Ȅǧ̈ƾǟƢƦƬǷ

ƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦

ƢȇǂȀǜǷǾǴƯƢǸƬǸdz¦©ȐƟƢǠdz¦°ȂȀǛ¢ƾƦȇ

ƢȀƥƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦Dzǔǧ¢ƤƼƬǼƫÂ

¾Ȃǐ ƸǸdz¦Ǿǻ°ƢǬǷ§°ƢƴƫǀȈǨǼƫ¢ƾƦȇ

ǞǷ©¦°ǂǰǸdz¦ǺǷ®ÂƾƸǷ®ƾǠƥ

ƢȀƥƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦Dzǔǧ¢§ ƢƼƬǻ¤

©¦̄ ¾Ȃǐ ƸǸdz¦Ǿǻ°ƢǬǷ§°Ƣƴƫ

©¦°ǂǰǸdz¦

¾Âȋ¦DzȈƴdz¦©ƢƫƢƦǻ

ƾȈǨƬLjƫÂǾǨǴǰǷǂȈǣǾǬȇǂǘǯǾȈƯ¦°Ȃdz¦̈®ƢǸdz¦ǶƴƷ̈®Ƣȇ±ƨdzƢƷȄǧ¿¦ƾƼƬLJȐdzǾǸƟȐǷǂưǯ¢ÀȂǰƫǞȈǸƴƬdz¦ǾǬȇǂǗ

.ȄǠȈƦǘdz¦§ ƢƼƬǻȏ¦ǺǷ̈®ƢǨƬLJȏ¦̈DŽȈǸƥ

džǷƢƼdz¦DzȈƴdz¦

² ®ƢLjdz¦DzȈƴdz¦

ǞƥƢLjdz¦DzȈƴdz¦

ǺǷƢưdz¦ǺǷ¾ƢȈƳȋ ¦

ǂNjƢǠdz¦ȄǻƢưdz¦ȄƬƷÂ

)§(§ ȋ ¦ × )¢(§ ȋ ¦

ȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦

Ǟƥ¦ǂdz¦DzȈƴdz¦

ƮdzƢưdz¦DzȈƴdz¦

©ƢǨǏ ¦ȂǸǴdzǾǬƥƢǘǷǂȈǤdz¦©ȏȐLjdz¦ƾǠƦƬLjƫ ǞǫȂǷǺǷǂưǯ¢Ȅǧ©ȏȐLjdz¦ǽǀǿǂƦƬƼƫ� . ƾ̈ȇƾƳ»ƢǼǏ ƘǯǺȈǟ°¦DŽǸdz¦ȄǴǟ̧±ȂƫÂǂưǰƫǺȈƬǼƯ¢Â¢ǾdzȐLJȄdz¤ǂǐ ƬƼƫÂƨƥȂǴǘǸdz¦

°̈ǀƦdz¦̈®ƢȇDŽdz̈ƾǟƢƦƬǷ©ƢƫƢƦǼdz¦̧°DŽƫ

Ȅǐ ǫȋ ¦ƾƸǴdz

ǺǷ̧°DŽȇÒÍ Í ÍȄdz¤ÕÍ Í ÍƢƫƢƦǻ

ðƢƴƬdz¦ÃÂƢǬƬdz¦¾ƾǠǸƥƢǠǸƴǷ

ǺǷȄǴǟ¾Ȃǐ Ƹdz¦ÒÍ Í ÍȄdz¤

ÕÍ Í ÍǾǼȈǟǀƻƘƥƢǠǸƴǷ©ƢƫƢƦǻ

ȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦¶ȂǘƻǺǷǾȈƟ¦Ȃnjǟ

ǺǷȄǴǟ¾Ȃǐ Ƹdz¦ÒÍ Í ÍȄdz¤ÕÍ Í Í

ǺǷǾȈƟ¦ȂnjǟǾǼȈǟǀƻƘƥƢǠǸƴǷ©ƢƫƢƦǻ

ƮdzƢưdz¦DzȈƴdz¦¶Ȃǘƻ

ǺǷ̧°DŽƫÒÍ Í ÍȄdz¦ÕÍ Í Í©ƢǧƢLjǷȄǴǟƢƫƢƦǻ

ƨǼȈǟǀƻ¢ǺǷƢȀȈǴǟ¾Ȃǐ Ƹdz¦ǺǰǷ¢ǽǀǿÂǾǠLJ¦Â

ǶƯǞƥ¦ǂdz¦DzȈƴdz¦¶ȂǘƻǺǷǖƻDzǯǺǷǾȈƟ¦Ȃnjǟ

Ȅdz¦ȂƷƤƼƬǼȇÏ Í ÍȄdz¦ÐÍ ÍƢȇ®ǂǧƢƫƢƦǻ

©ƢƫƢƦǼdz¦ǺǷǾǟ°DŽǼǸdz¦©ȐƟƢǠdz¦ǚƷȐƫ

ǺǷƢȀǼǷƤƼƬǼȇÂdžǷƢƼdz¦DzȈƴǴdzƨȇ®ǂǨdz¦

Ï Í-ÐÍƢƫƢƦǻ

¾Âȋ¦DzȈƴdz¦

ǶȈǬƫÂƨȈƟƾƦǸdz¦¾Ȃǐ ƸǸdz¦Ǿǻ°ƢǬǷ§°ƢƴƫǀǨǼƫ

¾ȂǏȂdz¦ǺǰǸȇȄƬƷƨƦƼƬǼǸdz¦®¦ǂǧȋ ¦½ȂǴLJ

Ȅdz¦ȂƸdzÒ-Õ±̈ƢƬǸǷƨdzȐLJ

Page 4: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

صفات- 2 تكون المرغوبة الصفات من كثيرمن quantitative traitsكمية العديد فيها يتحكم

الوراثية polygeneticالعوامل

Page 4

Page 5: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

األمراض -3 لمقاومة التربية عنداستخدام الى المربى فيلجأ والحشراتو المرضية بالمسببات الصناعية العدوى

.الحشرية

Page 5

للطفيل الوراثى البيئية ظال التركيب روف

الوراثى للعائلالتركيب

Page 6: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

بين- 3 بالتفاعل الصفات تتأثرالبيئية والظروف الوراثى التركيب

المنطقة . فى السائدة

Page 6

Page 7: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

المعلمات استخدام مميزاتالجزيئية

Page 7

ثابتة معلمات stableأنها

نهائي ال استخدامها يمكن التي المعلمات عدد

النظر بصرف األنسجة جميع في اكتشافها يمكن

النمو من النبات حالة عليها يكون التي الخلية عن

التطور . أو

ال مستوي علي DNAالدراسة

. الوراثي الثبات أي البيئية بالظروف تتأثر ال

Page 8: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

DNA ال تركيب

Page 8

Page 9: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 9

Page 10: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 10

Page 11: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Gel electrophoresis

Page 11

• is a technique used for the separation of DNA, RNA or protein molecules using an electric current applied to a gel matrix.

• It is usually performed for analytical purposes, such as RFLP, PCR,

Page 12: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

الوراثية المعلمات طرق أهم

Page 12

Restriction Fragment Length Polymorphisms )RFLP(Minisatellites or Variable Number of Tandem Repeats )VNTR(Internal Transcribed Spacer regions of nuclear ribosomal genes )ITS(Sequence-Tagged Sites )STS(Microsatellites, Simple Sequence Repeat )SSR(, Amplified Sequence Length Polymorphism )ASLP(Sequence Characterized Amplified Region )SCAR(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence )CAPS(Single-Strand Conformation Polymorphism )SSCP(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis )DGGE(Thermal Gradient Gel Electrophoresis )TGGE(Heteroduplex Analysis )HDA(Denaturing High Performance Liquid Chromatography )DHPLC(Multiple Arbitrary Amplicon Profiling )MAAP(Random Amplified Polymorphic DNA )RAPD(DNA Amplification Fingerprinting )DAF(Arbitrarily Primed Polymerase Chain Reaction )AP-PCR(Inter-Simple Sequence Repeat )ISSR(Single Primer Amplification Reaction )SPAR(Directed Amplification of Minisatellite DNA )DAMD(Amplified Fragment Length Polymorphism )AFLP(Selectively Amplified Microsatellite Polymorphic Loci )SAMPL(

Page 13: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Advances in molecular markers

Page 13

Page 14: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Examples of Techniques to detect DNA polymorphism (DNA markers)

Page 14

i( Non-PCR based marker- RFLP

ii( PCR-based markers- RAPD- AFLP- SSR

Page 15: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP)

Page 15

1. DNA Fingerprinting

2. Genetic mapping

3. QTL mapping

4. Maker-assisted selection for breeding program

Applications of RFLP

Page 16: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Restriction Enzymes

Page 16

Page 17: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 17

Page 18: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 18

Page 19: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

PCR-based methods

Page 20: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 20

Random Amplified polymorphic DNA )RAPDs)

Page 21: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 21

Aplifed Fragment length Polymorphism )AFLPs(

Page 22: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 22

Gel for AFLP markers

Page 23: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 23

Page 24: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 24

Page 25: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 25

Genetic diversity among wheat genotypes by means AFLP Markers

Page 26: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Microsatellites or Simple Sequence Repeats (SSRs)

Description:

AAAAAAAAAAA : (A)11

GTGTGTGTGTGT : (GT)6

CTGCTGCTGCTG :(CTG)4

ACTCACTCACTCACTC :(ACTC)4

Page 27: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Microsatellites

Page 28: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Applications of Molecular Markers

• Genetic diversity and fingerprinting

• Inheritance and mapping– Simply inherited traits– Quantitative traits (dissection into QTL)

Page 29: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 29

Page 30: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 30

Page 31: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 31

Page 32: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 32

Page 33: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Applications of Molecular Markers

• As selection tools: Marker-Assisted Selection

Page 34: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

F2

P2

F1

P1 x

large populations consisting of thousands of plants

ResistantSusceptible

MARKER-ASSISTED SELECTION (MAS)

MARKER-ASSISTED BREEDING

Method whereby phenotypic selection is based on DNA markers

Page 35: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 35

Page 36: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Marker-based gene identification and isolation

Page 37: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Particle Gun

Page 37

Page 38: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

الحيوية جياتكنولو

لل البحثيالتطوير

في التميزتحقيق خالل من زراعية

ال

مجمع

شتهربم زراعة

ال كليةب حثية

البمعامل

ال

عنوان

المشروع مــــ

المشروع دة

24

شهــــ

ــرا

Page 39: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

المشروع أهداف

4هدفحصول

هيئة اعضاءالتدريس

ومعاونيهم وطالب

الدراسات بالكلية العليا

الجوائز علىوبراءات االختراع العلمية المحلية .والدولية

3هدف

تميز المجلة العلمية

المتخصصة للكلية.

2هدف تطوير معامل

التكنولوجيالحيوية ا

الزراعية المتميزة.

1هدف

تحقيقالتميز

و الكمىالنوعى

في البحوث

الزراعية التطبيقي

ة.

Page 40: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

لتنفيذ ا الالزمة النقدية لتدفقاتمشروعال

الربع السنوي

الوحدة تمويلمباني

غير سكنية

تجهيزات

آالت ومعدات

دراسات وبحوث

إجمالي

اإلجمالي

500.000 810.000 900.000 600.000 2.810.000

الربع السنوي

الجامعة تمويلمباني

غير سكنية

تجهيزات

آالت ومعدات

دراسات وبحوث

إجمالي

اإلجمالي

500.000 900.000 900.000 600.000 2.900.000

Page 41: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 41

Application of Molecular Markers for Developing Promising Hybrid Corn Tolerant to Drought

الجفاف تتحمل شامية ذرة هجن إلستنباط الجزيئية المعلمات تطبيق

Molecular Mapping of QTLs for Drought and Salt Tolerance in Bread Wheat Using Microsatellite Markers 

قمح في والملوحة الجفاف لتحمل الكمية للصفات الجينات تحديدالميكروستاليت الخبز باستخدام

بحثية مشاريع

Page 42: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

[email protected]

Page 42

Thank you

Page 43: العلامات المميزة الجزيئية Molecular Markers Page 1

Page 43

General Discussion