Click here to load reader
Upload
andrea-blair
View
276
Download
8
Embed Size (px)
Citation preview
المميزة العالماتالجزيئية
Molecular Markers
Page 1
النبات مربى تواجه صعوبات
Page 2
تنفيذ أثناء الصعوبات من عديد النبات مربى تواجهكالمقاومة المرغوبة الصفات لنقل التربية برنامجالغير البيئة ظروف و والحشرات لالمراض: ) اهمها ) – – وغيرها حرارة ملوحة جفاف مناسبة
Page 3
1- ) ( سنوات عدة اجيال عدة الى النبات مربى manyيحتاجgenerations needed من المرغوبة الصفة نقل يمكن حتى
مثل االخرى التهجين طرق أو الرجعى التهجين برنامج خالل. غيرها أو التجميعى التهجين أو النسب تتبع مع التهجين
ǺǷǾǬȇǂǘdz¦ÀȂǰƬƫ .§ Ƣǐ ƻȏ¦ÂƶȈǬǴƬdz¦ƨȈƫ¦̄ DzȈǏ ƢƸǸdz¦ǺȈLjƸƫȄǧƢǷ¦ƾƼƬLJ¦¼ǂǘdz¦ǂưǯ¢ǺǷƤLjǼdz¦ǾǬȇǂǗ
:ƨȈLJƢLJ¢©¦ȂǘƻªȐƯÎ .§ ¢ǺȇȂƥ¢ǺȈƥǺȈƴȀƬdz¦� -ÏƨƦƼƬǼǸdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦¾ƢLjǻ¢Ǿǟ¦°± -
.ƢȀƬǜƷȐǷƨdzȂȀLjdz̈ƾǟƢƦƬǷÐDzȈƳǺǷƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦DzǬƫƮȈƷǾǬȈǫ®©ȐƴLjƥ· ƢǨƬƷȏ¦ -
.ǾȈǴȇÃǀdz¦DzȈƴdz¦Ȅdz¤
džǷƢƼdz¦DzȈƴdz¦F5
² ®ƢLjdz¦DzȈƴdz¦F6
ǞƥƢLjdz¦DzȈƴdz¦F7
ȄƬƷÂǺǷƢưdz¦ǺǷ¾ƢȈƳȋ¦
ǂNjƢǠdz¦ȄǻƢưdz¦F8-F12
)§(§ ȋ ¦ × )¢(§ ȋ ¦
ȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦F2
Ǟƥ¦ǂdz¦DzȈƴdz¦F4
ƮdzƢưdz¦DzȈƴdz¦F3
ǂưǰȇǶƯǞǫȂǷǺǷǂưǯ¢Ȅǧ©¦°ƢƦƬƻ¤Ãǂƴƫ
ƾȇƾƳǦǼǐ ǯƢȀǠȇ±ȂƬdz©ȏȐLjdz¦Dzǔǧ¢
ƨƦLJƢǼǷÀȂǰƬdzƾƷȄǐ ǫȋ °̈ǀƦdz¦̈®Ƣȇ±
ƾ̈ȇƾƴdz¦ƨȈƯ¦°Ȃdz¦ƤȈǯ¦ǂƬǴdz
¢ƾƦȇÂ̈ƾǟƢƦƬǷȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦©ƢƫƢƦǻǾǟ¦°±
©ƢƫƢƦǼdz¦ǽǀǿǺȈƥ§ ƢƼƬǻȍ¦
ƨǟ¦°±ƨƦƼƬǼǸdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦°Âǀƥ̧°DŽƫ
§ ƢƼƬǻƜƥƶǸLjƬdz»ȂǨǏ Ȅǧ̈ƾǟƢƦƬǷ
ƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦
ƢȇǂȀǜǷǾǴƯƢǸƬǸdz¦©ȐƟƢǠdz¦°ȂȀǛ¢ƾƦȇ
ƢȀƥƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦Dzǔǧ¢ƤƼƬǼƫÂ
¾Ȃǐ ƸǸdz¦Ǿǻ°ƢǬǷ§°ƢƴƫǀȈǨǼƫ¢ƾƦȇ
ǞǷ©¦°ǂǰǸdz¦ǺǷ®ÂƾƸǷ®ƾǠƥ
ƢȀƥƨȇ®ǂǨdz¦©ƢƫƢƦǼdz¦Dzǔǧ¢§ ƢƼƬǻ¤
©¦̄ ¾Ȃǐ ƸǸdz¦Ǿǻ°ƢǬǷ§°Ƣƴƫ
©¦°ǂǰǸdz¦
¾Âȋ¦DzȈƴdz¦©ƢƫƢƦǻ
ƾȈǨƬLjƫÂǾǨǴǰǷǂȈǣǾǬȇǂǘǯǾȈƯ¦°Ȃdz¦̈®ƢǸdz¦ǶƴƷ̈®Ƣȇ±ƨdzƢƷȄǧ¿¦ƾƼƬLJȐdzǾǸƟȐǷǂưǯ¢ÀȂǰƫǞȈǸƴƬdz¦ǾǬȇǂǗ
.ȄǠȈƦǘdz¦§ ƢƼƬǻȏ¦ǺǷ̈®ƢǨƬLJȏ¦̈DŽȈǸƥ
džǷƢƼdz¦DzȈƴdz¦
² ®ƢLjdz¦DzȈƴdz¦
ǞƥƢLjdz¦DzȈƴdz¦
ǺǷƢưdz¦ǺǷ¾ƢȈƳȋ ¦
ǂNjƢǠdz¦ȄǻƢưdz¦ȄƬƷÂ
)§(§ ȋ ¦ × )¢(§ ȋ ¦
ȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦
Ǟƥ¦ǂdz¦DzȈƴdz¦
ƮdzƢưdz¦DzȈƴdz¦
©ƢǨǏ ¦ȂǸǴdzǾǬƥƢǘǷǂȈǤdz¦©ȏȐLjdz¦ƾǠƦƬLjƫ ǞǫȂǷǺǷǂưǯ¢Ȅǧ©ȏȐLjdz¦ǽǀǿǂƦƬƼƫ� . ƾ̈ȇƾƳ»ƢǼǏ ƘǯǺȈǟ°¦DŽǸdz¦ȄǴǟ̧±ȂƫÂǂưǰƫǺȈƬǼƯ¢Â¢ǾdzȐLJȄdz¤ǂǐ ƬƼƫÂƨƥȂǴǘǸdz¦
°̈ǀƦdz¦̈®ƢȇDŽdz̈ƾǟƢƦƬǷ©ƢƫƢƦǼdz¦̧°DŽƫ
Ȅǐ ǫȋ ¦ƾƸǴdz
ǺǷ̧°DŽȇÒÍ Í ÍȄdz¤ÕÍ Í ÍƢƫƢƦǻ
ðƢƴƬdz¦ÃÂƢǬƬdz¦¾ƾǠǸƥƢǠǸƴǷ
ǺǷȄǴǟ¾Ȃǐ Ƹdz¦ÒÍ Í ÍȄdz¤
ÕÍ Í ÍǾǼȈǟǀƻƘƥƢǠǸƴǷ©ƢƫƢƦǻ
ȄǻƢưdz¦DzȈƴdz¦¶ȂǘƻǺǷǾȈƟ¦Ȃnjǟ
ǺǷȄǴǟ¾Ȃǐ Ƹdz¦ÒÍ Í ÍȄdz¤ÕÍ Í Í
ǺǷǾȈƟ¦ȂnjǟǾǼȈǟǀƻƘƥƢǠǸƴǷ©ƢƫƢƦǻ
ƮdzƢưdz¦DzȈƴdz¦¶Ȃǘƻ
ǺǷ̧°DŽƫÒÍ Í ÍȄdz¦ÕÍ Í Í©ƢǧƢLjǷȄǴǟƢƫƢƦǻ
ƨǼȈǟǀƻ¢ǺǷƢȀȈǴǟ¾Ȃǐ Ƹdz¦ǺǰǷ¢ǽǀǿÂǾǠLJ¦Â
ǶƯǞƥ¦ǂdz¦DzȈƴdz¦¶ȂǘƻǺǷǖƻDzǯǺǷǾȈƟ¦Ȃnjǟ
Ȅdz¦ȂƷƤƼƬǼȇÏ Í ÍȄdz¦ÐÍ ÍƢȇ®ǂǧƢƫƢƦǻ
©ƢƫƢƦǼdz¦ǺǷǾǟ°DŽǼǸdz¦©ȐƟƢǠdz¦ǚƷȐƫ
ǺǷƢȀǼǷƤƼƬǼȇÂdžǷƢƼdz¦DzȈƴǴdzƨȇ®ǂǨdz¦
Ï Í-ÐÍƢƫƢƦǻ
¾Âȋ¦DzȈƴdz¦
ǶȈǬƫÂƨȈƟƾƦǸdz¦¾Ȃǐ ƸǸdz¦Ǿǻ°ƢǬǷ§°ƢƴƫǀǨǼƫ
¾ȂǏȂdz¦ǺǰǸȇȄƬƷƨƦƼƬǼǸdz¦®¦ǂǧȋ ¦½ȂǴLJ
Ȅdz¦ȂƸdzÒ-Õ±̈ƢƬǸǷƨdzȐLJ
صفات- 2 تكون المرغوبة الصفات من كثيرمن quantitative traitsكمية العديد فيها يتحكم
الوراثية polygeneticالعوامل
Page 4
األمراض -3 لمقاومة التربية عنداستخدام الى المربى فيلجأ والحشراتو المرضية بالمسببات الصناعية العدوى
.الحشرية
Page 5
للطفيل الوراثى البيئية ظال التركيب روف
الوراثى للعائلالتركيب
بين- 3 بالتفاعل الصفات تتأثرالبيئية والظروف الوراثى التركيب
المنطقة . فى السائدة
Page 6
المعلمات استخدام مميزاتالجزيئية
Page 7
ثابتة معلمات stableأنها
نهائي ال استخدامها يمكن التي المعلمات عدد
النظر بصرف األنسجة جميع في اكتشافها يمكن
النمو من النبات حالة عليها يكون التي الخلية عن
التطور . أو
ال مستوي علي DNAالدراسة
. الوراثي الثبات أي البيئية بالظروف تتأثر ال
DNA ال تركيب
Page 8
Page 9
Page 10
Gel electrophoresis
Page 11
• is a technique used for the separation of DNA, RNA or protein molecules using an electric current applied to a gel matrix.
• It is usually performed for analytical purposes, such as RFLP, PCR,
الوراثية المعلمات طرق أهم
Page 12
Restriction Fragment Length Polymorphisms )RFLP(Minisatellites or Variable Number of Tandem Repeats )VNTR(Internal Transcribed Spacer regions of nuclear ribosomal genes )ITS(Sequence-Tagged Sites )STS(Microsatellites, Simple Sequence Repeat )SSR(, Amplified Sequence Length Polymorphism )ASLP(Sequence Characterized Amplified Region )SCAR(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence )CAPS(Single-Strand Conformation Polymorphism )SSCP(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis )DGGE(Thermal Gradient Gel Electrophoresis )TGGE(Heteroduplex Analysis )HDA(Denaturing High Performance Liquid Chromatography )DHPLC(Multiple Arbitrary Amplicon Profiling )MAAP(Random Amplified Polymorphic DNA )RAPD(DNA Amplification Fingerprinting )DAF(Arbitrarily Primed Polymerase Chain Reaction )AP-PCR(Inter-Simple Sequence Repeat )ISSR(Single Primer Amplification Reaction )SPAR(Directed Amplification of Minisatellite DNA )DAMD(Amplified Fragment Length Polymorphism )AFLP(Selectively Amplified Microsatellite Polymorphic Loci )SAMPL(
Advances in molecular markers
Page 13
Examples of Techniques to detect DNA polymorphism (DNA markers)
Page 14
i( Non-PCR based marker- RFLP
ii( PCR-based markers- RAPD- AFLP- SSR
Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP)
Page 15
1. DNA Fingerprinting
2. Genetic mapping
3. QTL mapping
4. Maker-assisted selection for breeding program
Applications of RFLP
Restriction Enzymes
Page 16
Page 17
Page 18
PCR-based methods
Page 20
Random Amplified polymorphic DNA )RAPDs)
Page 21
Aplifed Fragment length Polymorphism )AFLPs(
Page 22
Gel for AFLP markers
Page 23
Page 24
Page 25
Genetic diversity among wheat genotypes by means AFLP Markers
Microsatellites or Simple Sequence Repeats (SSRs)
Description:
AAAAAAAAAAA : (A)11
GTGTGTGTGTGT : (GT)6
CTGCTGCTGCTG :(CTG)4
ACTCACTCACTCACTC :(ACTC)4
Microsatellites
Applications of Molecular Markers
• Genetic diversity and fingerprinting
• Inheritance and mapping– Simply inherited traits– Quantitative traits (dissection into QTL)
Page 29
Page 30
Page 31
Page 32
Applications of Molecular Markers
• As selection tools: Marker-Assisted Selection
F2
P2
F1
P1 x
large populations consisting of thousands of plants
ResistantSusceptible
MARKER-ASSISTED SELECTION (MAS)
MARKER-ASSISTED BREEDING
Method whereby phenotypic selection is based on DNA markers
Page 35
Marker-based gene identification and isolation
Particle Gun
Page 37
الحيوية جياتكنولو
لل البحثيالتطوير
في التميزتحقيق خالل من زراعية
ال
مجمع
شتهربم زراعة
ال كليةب حثية
البمعامل
ال
عنوان
المشروع مــــ
المشروع دة
24
شهــــ
ــرا
المشروع أهداف
4هدفحصول
هيئة اعضاءالتدريس
ومعاونيهم وطالب
الدراسات بالكلية العليا
الجوائز علىوبراءات االختراع العلمية المحلية .والدولية
3هدف
تميز المجلة العلمية
المتخصصة للكلية.
2هدف تطوير معامل
التكنولوجيالحيوية ا
الزراعية المتميزة.
1هدف
تحقيقالتميز
و الكمىالنوعى
في البحوث
الزراعية التطبيقي
ة.
لتنفيذ ا الالزمة النقدية لتدفقاتمشروعال
الربع السنوي
الوحدة تمويلمباني
غير سكنية
تجهيزات
آالت ومعدات
دراسات وبحوث
إجمالي
اإلجمالي
500.000 810.000 900.000 600.000 2.810.000
الربع السنوي
الجامعة تمويلمباني
غير سكنية
تجهيزات
آالت ومعدات
دراسات وبحوث
إجمالي
اإلجمالي
500.000 900.000 900.000 600.000 2.900.000
Page 41
Application of Molecular Markers for Developing Promising Hybrid Corn Tolerant to Drought
الجفاف تتحمل شامية ذرة هجن إلستنباط الجزيئية المعلمات تطبيق
Molecular Mapping of QTLs for Drought and Salt Tolerance in Bread Wheat Using Microsatellite Markers
قمح في والملوحة الجفاف لتحمل الكمية للصفات الجينات تحديدالميكروستاليت الخبز باستخدام
بحثية مشاريع
Page 43
General Discussion