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2015 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 1 投稿要求 进行验证。因此,实验材料的提交必须符合生物试样的运输、 转交、持有及使用的相关法律法规,且只能用于合理合法、善 意性的研究。相关法律法规的链接及信息请见 http://www.asm. org/ 网页中 Policy(政策)标签之下的内容。我们希望投稿者 尤其要注意美国国家管制物质注册登记处 (National Select Agent Registry, NSAR) 的管制物质/毒物 (Select Agent/Toxin) 清单,详 情请访问美国疾病防控中心 (Centers for Disease Control, CDC) 网站 http://www.selectagents.gov/index.html 和美国政府关于生命 科学双重用途科学研究监管方法的政策 (20123; http://www. phe.gov/s3/dualuse/Documents/us-policy-durc-032812.pdf)道德 ASM 对投稿的要求与 “Recommendations for the Conduct, Reporting, Editing, and Publication of Scholarly Work in Medical Journals(对医学期刊中学术著作的写作、报告、编辑和出版的 指导建议)一致,该要求由国际医学期刊编辑委员会 (Inter- national Committee of Medical Journal Editors) 编写并更新,最近 更新时间为 2013 8 (http://www.icmje.org/)我们希望每位作者都遵循最高道德标准。本“要求”将在 接下来的章节中详细说明 ASM 所秉承的道德标准。如有违反, 我处可能采取以下措施:发送训诫函、临时禁止在 ASM 期刊发 表文章和/或通知作者所在单位/机构。若作者受雇于某公司, 而该公司政策不允许该作者遵守 ASM 的政策,则 ASM 可对该 个人拒稿,且/ASM 可能对来自此类公司的作者一律拒稿。 ASM 期刊委员会尤其希望阐明以下几点。 剽窃。凡盗用他人知识产权的行为,均构成剽窃。其包括 整句或整段的逐字(或基本逐字)抄袭——即便在参考文献部 分标明出处者亦不例外。美国国家卫生研究所 (National Insti- tutes of Health, NIH) 科研道德办 (Office of Research Integrity, ORI) 所发布的“Avoiding Plagiarism, Self-Plagiarism, and Other Questionable Writing Practices: a Guide to Ethical Writing”(避免 剽窃、自我剽窃和其他错误的写作方法:写作道德指南;http:// ori.hhs.gov/avoiding-plagiarism-self-plagiarism-and-other-ques tionable-writing-practices-guide-ethical-writing)可帮助作者识别 有问题的写作方法。 2015 1 月,投稿要求,第 1-19 投稿范围 《分子与细胞生物学杂志》(Molecular and Cellular Biology, MCB) 致力于推进和传播真核细胞(同时包括微生物和高等生 物体)分子生物学方面的基础知识。在细胞形态和功能、基因 组组构、基因表达调控、形态发生和体细胞遗传学(不能是简 单的连锁分析)方面具有重要意义的论文,均欢迎投稿。本刊 通常不考虑仅介绍研究方法与核苷酸序列数据(而没有关于序 列的功能性意义的实验说明文档)的文章。 ASM 发行多份期刊,涵括微生物学中的不同领域。各期刊 都有规定的领域范围,投稿前请注意区分,选取最合适的期 刊。希望下列指南可为您提供一定的帮助。 关于细胞被病毒感染的论文,通常应投往《病毒学杂志》 (Journal of Virology)。但如果论文的侧重点明显是细胞,仅仅附 带提及病毒,则可投往本刊。 如对上述要求有不明之处,请咨询本刊主编。 若编辑建议将稿件转投到其他 ASM 期刊,将会联系通讯 作者。 请注意:若稿件由于存在科学性问题或不适于出版发表而 被某 ASM 期刊退稿,将被视为已被全体 ASM 期刊退稿。 编辑政策 微生物信息的使用 美国微生物学会 (American Society for Microbiology, ASM) 的理事会政策委员会 (Council Policy Committee, CPC) 代表学会 声明:本学会秉承一贯理念,坚信微生物学家的工作应当以合 理的方式运用科学造福人类,并提倡公众或有关部门关注一切 滥用微生物学或源于微生物学的信息的行为。ASM 成员有义务 劝阻任何滥用微生物学损害人类福祉(包括将微生物用作生物 武器)的行为。生物恐怖主义严重违背本学会“道德规范”中 的基本原则,ASM 及其成员对此深恶痛绝。 正如前文 CPC 决议所述,ASM 非常清楚,科技期刊中所 公开发表的信息有可能被滥用,因此对于此类问题的担忧是合 情合理的。所以,ASM 期刊委员会的成员若在审稿过程中发现 极个别可能导致此类问题的稿件,必定进行严格的评审把关。 但是,正如本“要求”后文将提到的,研究论文还必须包含充 足的细节、实验材料/信息等,以便于他人可以重复相关工作以 版权 © 2015,美国微生物学会。保留所有权利。“投稿要求”全年随时更 新。其现行版本请访问 http://journalitas.asm.org/t/49546

投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

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2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 1

投稿要求

进行验证。因此,实验材料的提交必须符合生物试样的运输、

转交、持有及使用的相关法律法规,且只能用于合理合法、善

意性的研究。相关法律法规的链接及信息请见 http://www.asm.

org/ 网页中 Policy(政策)标签之下的内容。我们希望投稿者

尤其要注意美国国家管制物质注册登记处 (National Select Agent

Registry, NSAR) 的管制物质/毒物 (Select Agent/Toxin) 清单,详

情请访问美国疾病防控中心 (Centers for Disease Control, CDC)

网站 http://www.selectagents.gov/index.html 和美国政府关于生命

科学双重用途科学研究监管方法的政策 (2012年3月; http://www.

phe.gov/s3/dualuse/Documents/us-policy-durc-032812.pdf)。

道德

ASM 对投稿的要求与 “Recommendations for the Conduct,

Reporting, Editing, and Publication of Scholarly Work in Medical

Journals(对医学期刊中学术著作的写作、报告、编辑和出版的

指导建议)” 一致,该要求由国际医学期刊编辑委员会 (Inter-

national Committee of Medical Journal Editors) 编写并更新,最近

更新时间为 2013 年 8 月 (http://www.icmje.org/)。

我们希望每位作者都遵循最高道德标准。本“要求”将在

接下来的章节中详细说明 ASM 所秉承的道德标准。如有违反,

我处可能采取以下措施:发送训诫函、临时禁止在 ASM 期刊发

表文章和/或通知作者所在单位/机构。若作者受雇于某公司,

而该公司政策不允许该作者遵守 ASM 的政策,则 ASM 可对该

个人拒稿,且/或 ASM 可能对来自此类公司的作者一律拒稿。

ASM 期刊委员会尤其希望阐明以下几点。

剽窃。凡盗用他人知识产权的行为,均构成剽窃。其包括

整句或整段的逐字(或基本逐字)抄袭——即便在参考文献部

分标明出处者亦不例外。美国国家卫生研究所 (National Insti-

tutes of Health, NIH) 科研道德办 (Office of Research Integrity,

ORI) 所发布的“Avoiding Plagiarism, Self-Plagiarism, and Other

Questionable Writing Practices: a Guide to Ethical Writing”(避免

剽窃、自我剽窃和其他错误的写作方法:写作道德指南;http://

ori.hhs.gov/avoiding-plagiarism-self-plagiarism-and-other-ques

tionable-writing-practices-guide-ethical-writing)可帮助作者识别

有问题的写作方法。

2015 年 1 月,投稿要求,第 1-19 页

投稿范围

《分子与细胞生物学杂志》(Molecular and Cellular Biology,

MCB) 致力于推进和传播真核细胞(同时包括微生物和高等生

物体)分子生物学方面的基础知识。在细胞形态和功能、基因

组组构、基因表达调控、形态发生和体细胞遗传学(不能是简

单的连锁分析)方面具有重要意义的论文,均欢迎投稿。本刊

通常不考虑仅介绍研究方法与核苷酸序列数据(而没有关于序

列的功能性意义的实验说明文档)的文章。

ASM 发行多份期刊,涵括微生物学中的不同领域。各期刊

都有规定的领域范围,投稿前请注意区分,选取最合适的期

刊。希望下列指南可为您提供一定的帮助。

关于细胞被病毒感染的论文,通常应投往《病毒学杂志》

(Journal of Virology)。但如果论文的侧重点明显是细胞,仅仅附

带提及病毒,则可投往本刊。

如对上述要求有不明之处,请咨询本刊主编。

若编辑建议将稿件转投到其他 ASM 期刊,将会联系通讯

作者。

请注意:若稿件由于存在科学性问题或不适于出版发表而

被某 ASM 期刊退稿,将被视为已被全体 ASM 期刊退稿。

编辑政策

微生物信息的使用

美国微生物学会 (American Society for Microbiology, ASM)

的理事会政策委员会 (Council Policy Committee, CPC) 代表学会

声明:本学会秉承一贯理念,坚信微生物学家的工作应当以合

理的方式运用科学造福人类,并提倡公众或有关部门关注一切

滥用微生物学或源于微生物学的信息的行为。ASM 成员有义务

劝阻任何滥用微生物学损害人类福祉(包括将微生物用作生物

武器)的行为。生物恐怖主义严重违背本学会“道德规范”中

的基本原则,ASM 及其成员对此深恶痛绝。

正如前文 CPC 决议所述,ASM 非常清楚,科技期刊中所

公开发表的信息有可能被滥用,因此对于此类问题的担忧是合

情合理的。所以,ASM 期刊委员会的成员若在审稿过程中发现

极个别可能导致此类问题的稿件,必定进行严格的评审把关。

但是,正如本“要求”后文将提到的,研究论文还必须包含充

足的细节、实验材料/信息等,以便于他人可以重复相关工作以

版权 © 2015,美国微生物学会。保留所有权利。“投稿要求”全年随时更

新。其现行版本请访问 http://journalitas.asm.org/t/49546。

Page 2: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

2 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

剽窃不仅限于文字,还可涉及稿件的任何部分,包括未经

许可、不标明出处、直接复制其他出版物的图片、表格等。同

时作者也不能在未标明出处的情况下重复使用自己本人曾经发

表过的成果,违者将被视为自我剽窃。

数据的捏造、歪曲及伪造。作为出版伦理委员会 (Commit-

tee on Publication Ethics, COPE) 会员,ASM 鼓励投稿者参阅

COPE 的“Code of Conduct and Best Practice Guidelines for Jour-

nal Editors”(期刊编辑行为准则和最佳实践指南,http://publi

cationethics.org/files/Code_of_conduct_for_journal_editors_0.

pdf)。数据的捏造、歪曲及伪造即构成不当行为。依照美国卫

生和公众服务部 (U.S. Department of Health and Human Services)

的定义,所谓“捏造”是指“编造数据或试验结果并对其进行

记录或报告”,所谓“伪造”是指“刻意歪曲研究材料、设备

或过程,或篡改、隐瞒某些数据或结果,造成研究记录不能正

确反映研究结果”(42 Code of Federal Regulations, §93.103)。用

于获取和分析数据的来源和方法(包括电子预处理手段)都必

须完全披露;如有例外,必须详细说明原因。

首次发表。提交给本期刊的稿件必须代表原创性研究,并

必须提供原始数据以供编辑做必要的审阅。

将稿件提交给本期刊之后,即代表:作者保证本人有权发

表该成果;该稿件或其他实质性内容相同的稿件之前从未刊

发,并未在其他任何地方等待刊发或已经刊发,且之前没有因

科学性问题被其他 ASM 期刊退稿。如果提交给 ASM 期刊的稿

件中含有来自之前曾经发表过的材料(包括作者本人的文章),

作者有责任主动说明。且应作为补充材料随稿件提交相关作品

的副本,该副本不用于发表。至于所用材料是否构成新稿件的

实质性内容(并因而导致稿件不能发表),应完全由编辑决定。

简而言之,若论文或实质内容曾经通过以下方式公开发

表,则 ASM 期刊将不予接收:

•期刊、杂志或书籍

•学术研讨会论文报告或专题研讨会论文汇编

•技术公报或公司白皮书

•公开网站

•其他可检索资源

但若为下列情况,只要所发表的数据不构成所投稿件的实

质性内容,则仍可向 ASM 期刊投稿或由其发表:

•在公开网站上发表研究方法/计划

•在个人/大学/公司网站或就某个问题而组成的小型科研

协作组网站上发表有限的原始数据

• 在公共数据库中保存未发表的测序数据

•在科研会议公告、会议发言网络直播上初步披露研究成

果或以论文摘要表的形式作为会议外围材料发布(如项

目组成部分)

•在个人/大学所主办的网站上发表的学位论文

研究材料的提供。在本期刊发表文章即代表:文章作者同

意在符合美国法律或政府规章的要求或限制的前提之下,通过

国家样本收藏中心或其他及时的途径,按照合理的价格,以有

限的数量向科学界的成员以非营利性目的提供其文章中所述之

所有 DNA、病毒、菌种、突变动物品系、细胞株、抗体及其他

类似材料。同时作者保证本人具备足够的权限以遵守本政策,

可以直接提供材料或与材料所有者达成试验材料传递协议。

同样,如果必须依赖某种或某些计算机程序方可验证文章

所得结果,且该程序出自作者所在实验室,无法通过商业途径

取得,则作者也必须同意提供此类程序。要提供此类程序及相

关使用文档,可使用以下任一途径:(i) 通过互联网传送该程

序;(ii) 作为基于网络服务器的工具;或 (iii) 编译或汇编后储存

于合适的介质中。材料提供应尽量采用及时的方式,按照合理

的价格,以非营利性目的向科学界的成员提供有限的数量。同

时作者保证本人具备足够的权限以遵守本政策,可以直接提供

材料或与材料所有者达成试验材料传递协议。

许可。如需从某份已发表的成果中复制或修改图片、表格

及复制文字(部分或全部),则应由通讯作者负责联系该发表

物的原始作者和原始出版者(如版权所有者)以获取许可。

获取许可的时间不得迟于开始修改阶段的时间。在投往

ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件中标明相关项目

(如“permissions for Fig. 1 in MCB00123-15”),并按照 ASM

制作编辑的要求提交授权书。此外,在稿件的图片说明或表格

脚注中还必须声明转载材料已获许可。转载文本必须加引号,

且必须在行文中或作为插入成分加入许可声明。

如果引用了未经公开的数据或个人通讯,则要求作者能够

提供书面保证书,保证已获得引用许可。对于预备交给 ASM 进

行发表的补充材料(参见“补充材料”),如果该 MCB 稿件

作者中并未包含该补充材料的所有者,则稿件通讯作者必须向

ASM 寄送由版权所有者签署、同意由 ASM 将该材料作为补充

材料发表的授权书。同时,通讯作者还应负责按照版权所有者

的要求在补充材料中添加版权声明。

署名权。全体作者必须一致认可稿件的投寄,并对全部内

容(包括初次提交版本与一切后续版本)负责,其中包括正确

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2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 3

投稿要求

的引文与致谢;全体作者还必须同意授权稿件的通讯作者代表

他们处理稿件刊印的一切相关事宜。

通讯作者应负责获得其他作者对于上述协议的一致认同,

并将稿件提交、审阅、刊印过程中的状态通知其他共同作者。

若稿件未经全体共同作者审阅认可就进行提交,将被视为违背

道德原则;遗漏合格共同作者也属于违规行为;然而,ASM 本

身并不会调查或试图解决作者署名权的争端问题。

凡为研究试验的整体设计和执行作出实质性贡献者,皆为

合格作者;因此,ASM 认为每位署名作者都必须为论文的所有

部分负责。仅提供一定协助的个人(如提供了菌株或试剂或为

论文提供批评意见)无需列为作者,但可在“致谢”部分加以

说明。ASM 不允许“代笔”(ghost authorship) 行为,即个人为

研究本身、数据分析和/或论文写作做出了贡献,却不符合论文

作者要求条件。代笔者的实例有:医学报告文案撰写员以及医

药或医疗器械公司所雇用的、并未为研究试验的整体设计和执

行作出实质性贡献的人员。

如果有来自某科研小组、调查小组、工作组、科研联合体

及其他类似团体(例如美国疾病防控中心的 Active Bacterial

Core Surveillance 小组)的成员作出了贡献,且符合本“要求”

对署名权的条件规定和对论文内容负责的要求,则可将该团体

放入标题之下的署名行。至于具体作出贡献者的姓名(必要时

可加上其所属机构名称),则只能在“致谢”部分中以单独的

一段列出。

但若合作团体中作出贡献的成员不满足前述“作出实质性

贡献”及“为论文负责”的要求,则不能将该团体列入标题之

下作者署名行中。此时,应改为将该团体中作出贡献的具体成

员列入“致谢”部分中。

标题之下署名行中的作者署名顺序,必须得到全体作者的

一致同意。允许在脚注中说明某两位或更多位作者所作贡献相

等(例如“C.J. and Y.S. contributed equally to. . .”)但必须得到

全体作者的一致同意。关于贡献的其他说明可在“致谢”部分

中涉及。

稿件提交之后,如若署名权有所变动(署名顺序、增/删作

者、通讯作者人选),则必须由全体作者签署声明并提交之后

方可生效。

若署名权存在问题,可能会造成稿件审阅和/或刊发推迟或

停止。若有关各方无法达成一致,则必须由各作者所在机构进

行调查解决、出具正式报告并签署协议声明,该协议声明提交

给 ASM 之后,稿件审阅和/或刊发才会继续。

ORCID(开放研究者与贡献者身份)。ASM 期刊是开放

研究者与贡献者身份(简称 ORCID)机构的成员之一,将在稿

件中发表每位作者的开放研究者与贡献者身份识别号。ORCID

是一个开放的、非营利的社会组织,通过开展志愿性活动致力

于对每位研究者创建并维护唯一的身份标识符号的注册系统;

ORCID 是一个公开透明的链接方法,将所有研究活动和产出与

这些标识符号一一对应。在 eJournalPress (eJP) 同行审稿系统中,

鼓励作者使用或创建自己的 ORCID 识别号,通过这些识别号

可快速链接到以该研究者为作者的稿件和出版物。本方法便于

区分有相同姓名的作者的情况。如需要有关 ORCID 的更多信

息,请登录 ORCID 网页查询。

利益冲突。在投稿信中,要求全体作者都要披露商业背

景、顾问身份、股票股权、专利授权协议等一切可能被视为令

所提交稿件存在利益冲突的情况。(仅仅在稿件的作者地址行

中包含公司名称不足以构成有效披露。)向编辑披露的内容将

保密。

但是,全体作者有责任在“致谢”部分中做一个大体的陈

述,披露与研究相关的资金或其他关系。构成潜在利益冲突而

需要披露的例子包括:可能影响作者所提出研究成果客观性的

关联关系,以及可能受益于所提出研究成果的利益关系。项

目、科研机构及公司资金来源等,应按下文所述在“致谢”

部分列出。此外,若稿件涉及商业产品,则必须将其制造商

的名称以明显的方式在“材料与方法”部分或其他合适的地方

标明。

版权

为了维护和保障本学会的所有权和合法权益、继续坚持为

科研工作者提供一个发表成果的高质量期刊,ASM 要求通讯作

者代表稿件全体作者签署一份版权转移协议。在此协议正式

生效执行(且无任何更改或附加条件)之前,ASM 不会刊发

来稿。

在通讯作者签署的版权转移协议中,在标明原始 ASM 刊物

的前提条件下,ASM 可准许通讯作者(及其他共同作者)在其

他刊物(包括纸质、光盘及其他电子格式)以作者或编辑的身

份重新发表其稿件中的零散部分。该重新发表权同样适用于在

能够通过互联网访问的主机上发表。但请注意:对于论文中的

重要部分,则除以下情况之外,未预先获得 ASM 书面许可之

前,不得重发,因为这可构成重复发表。

文章发表之后,作者在正确标明版权所有者(如第一页底

部的版权信息)的前提条件之下,可以无需预先征得 ASM 书面

许可、直接在自己的个人计算机主办或大学主办的网站(但不

包括企业、政府等类似机构)上重新发表。

完全由美国政府雇员执笔的成果不受版权法保护,因而不

存在版权转移问题。然而,版权转移协议中其他适用于普通作

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4 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

者的条款(如作者原创性和是否有权签署协议等)仍可适用于

美国政府雇员作者。

由惠康基金会 (Wellcome Trust) 或英国研究委员会 (Re-

search Councils UK) 承担开放访问费用的文章,将依据资助机构

的开放访问政策在 Creative Commons Attribution license (CC-BY)

许可证之下发表。提交时,要求作者将有关情况知会 ASM,并

填写“Author Warranty and Provisional License to Publish”(原

创保证及出版授权书)。

对于封面插图/照片,ASM 同样要求签署版权转移协议。

补充材料的版权(参见“补充材料”)仍由作者保有,但

应在文章版权转移协议中包含允许 ASM 刊发的许可。若稿件作

者并非该补充材料的版权所有者,则应获取经过其所有者签署

的、允许 ASM 将该材料作为文章补充材料刊发的授权书。

通讯作者还应负责按照该所有者的要求,将版权信息添加

到该补充材料中。

资助机构文献库

美国国立卫生研究院 (National Institutes of Health, NIH) 要

求其内部作者及受其资助的作者将获得录用的稿件副本提交给

公共医学资源中心 (PubMed Central, PMC) 以便发布于PMC公

共访问库(Public Access Repository) 中。然而,MCB 的投稿作者

将自动符合该政策规定,因而无需另行采取行动。这些年

来,ASM一直将ASM期刊中所发表的各类文章都保存在(PMC)

中。此外,ASM 还有政策规定,凡首次发表的研究论文,都将

在发表后的第 6 个月通过 PMC、HighWire 和国际上其他类似

于PMC的文献库向公众免费开放。作为这些政策的发起人,

ASM 完全符合 NIH 的政策规定。详情请见 http://publicaccess.

nih.gov/。同时,如有其他资助机构与 NIH 一样(例如惠康基

金会 “Wellcome Trust”),要求受资助的作者必须将通过后

的稿件发表在由该机构所维护的、允许开放访问的电子文献库

中以供公开访问,ASM 也可以接受此类 MCB 作者。若该资助

机构本身不具备这样的网站,则为了满足要求,ASM 可让作者

将稿件(但并非已经定版的文章)存放到由政府或非商业机构

所建立的、开放的适当机构或学科文献库中。

由于 ASM 会在 6 个月之后将首次发表的、经过订正和定版

的研究论文在 ASM 期刊和 PMC 网站上免费开放,因此要求作

者在稿件被录用之后提交给 PMC 或类似的开放访问站点时,

必须说明稿件开放日期不得早于 ASM 刊发定版文章之后的 6 个

月,且必须提供一个连接到期刊网站上所发稿件的链接。

人类受试者或动物研究

使用人类受试者或动物进行研究时,必须遵守联邦政府和

具体机构的监管制度。稿件作者如需描述涉及人类受试者或

动物实验的研究,则必须先根据情况获取其伦理审查委员会

(Institutional Review Board, IRB) 或动物关怀及使用委员会 (Insti-

tutional Animal Care and Use Committee, IACUC) 的许可,然后

方可提交稿件。若稿件作者属于多中心研究作者,则必须根据

情况获取其各自机构 IRB 或 IACUC 的许可。应在“材料与方

法”部分包含 IRB 或 IACUC 的许可声明。必须应要求提供 IRB

或 IACUC 审批状态的记录文件。

病人身份识别

从临床研究的病人中提取出菌株之后,不得使用病人姓名

首字母对其进行命名——即使是仅仅作为株系名称的一部分。

应将首字母改为数字或使用随机选定的字母。请勿给出医院的

单元号;如确实需要指定名称,只使用单元的最后两位数。

(注:对于约定俗成的某些病毒和细胞系名称,虽然里面也包

含有缩写字母,但可以接受 [例如 JC 病毒、BK 病毒、HeLa 细

胞系]。)

核苷酸和氨基酸序列

新确定的核苷酸和/或氨基酸序列必须存入GenBank/ENA/

DDBJ 等基因数据库,并在稿件中注明检索号,时间不得晚于

审校过程中的修改阶段。要求将序列数据最终公开,时间不得

晚于稿件的发表(在线发表)日期。检索号应以单独的段落列

于“材料与方法”部分的末尾。若稿件结论基于对序列的分析,

但审校阶段仍未提供 GenBank/ENA/DDBJ 检索号,则作者应在

注释中以补充材料形式提供序列数据,该数据不用于发表。

在稿件中引用之前已经发表过的序列检索号时,要求尽可

能在“参考文献”部分中注明原始来源(例如期刊文章)。

作者还应该在提交稿件之前及稿件校对阶段对标准基因数

据库(如 GenBank)中的核苷酸和氨基酸序列进行检索对比。

分析中应注明所用数据库以及各项分析的日期(如 January

2015)。有必要时,还应说明所用软件的版本。

请参阅“列出核苷酸序列”了解核苷酸序列的格式要求。

上文所述数据库的链接如下:DNA Data Bank of Japan

(DDBJ):http://www.ddbj.nig.ac.jp/,European Nucleotide Archive

(ENA):http://www.ebi.ac.uk/ena/ 和 GenBank、National Center

for Biotechnology Information:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

nucleotide。

正确使用 Locus Tag 为基因进行系统命名

依照国际核苷酸序列数据库 (International Nucleotide Se-

quence Database, INSD) 各合作数据库的建议并为了避免基因命

名出现冲突,要求科研人员遵循以下两条基本准则,在基因

的分析、注释、提交、报告和发表中正确地使用 Locus Tag。

Page 5: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 5

投稿要求

(i) Locus Tag 前缀是某基因组所有复制子的系统名称,只能关

联到一个已提交的基因组项目。(ii) 新的基因组项目必须在

INSD 注册,然后配合 INSD 分配新的 Locus Tag 前缀,以确保

其符合公认的标准。

微观结构测定

通过 X 射线晶体照相术或低温电子显微技术所获取的大分

子结构坐标必须储存在蛋白质数据库 (Protein Data Bank) 中,

并在稿件内注明所分配的识别码,时间不得迟于审校过程中的

修改阶段。要求将结构坐标最终公开,时间不得迟于稿件的发

表(在线发表)日期。但是鼓励作者在原始稿件中寄送坐标信

息,以便审校者将其与稿件相互参看。检索号应以单独的段落

列于“材料与方法”部分的末尾。

结构坐标数据库的链接有 http://rcsb-deposit.rutgers.edu/ 和

http://pdbdep.protein.osaka-u.ac.jp/en/。

基因芯片、下一代测序或其他高通量功能基因组学研究

数据

必须将用于支持研究的整套基因芯片、下一代测序或其他

高通量功能基因组学研究数据储存在适当的公开数据库(如 GEO、

ArrayExpress、CIBEX)中,并在稿件中注明所分配的检索号,

时间不得迟于审校过程中的修改阶段。要求将数据最终公开,

时间不得迟于稿件的发表(在线发表)的日期。然而鼓励作者

在原始稿件中寄送相关数据,以便于审校者将其与稿件相互参

看。检索号应以单独的段落列于“材料与方法”部分的末尾。

上文所述数据库的链接如下:Gene Expression Omnibus

(GEO):http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/;ArrayExpress:

http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/;和 Center for Information

Biology Gene Expression Database (CIBEX):http://cibex.nig.ac.jp/

data/index.html。

培养物保藏

MCB 要求论文作者将重要的菌株保存在开放性培养物保藏

中心,并在文中引用菌种库及菌株编号。由于无法保证个人从

菌株样本中所培养继代的可靠性,所以作者应注明实验室菌株

名称和供体来源以及原始菌株识别号。

补充材料

补充材料将与稿件一起进行同行审阅,因而初次提交稿件

时应一并上传到 eJournalPress (eJP) 同行审稿系统。补充材料只

能是较大的数据集和影像资料;其他的图片和表格等,应放入

稿件主体中。至于是否将补充材料与通过后的文章同时发表,

这将由编辑决定。有可能录用稿件但并不发表补充材料。

补充材料的文件仅限 10 个。补充材料应按照如下标准格式

提交。

• 数据集 (Excel [.xls]) 文件内应简短说明其在论文中的用

途。文件最大为 20 MB。请参阅此处的范例文件。

• 影像资料(Audio Video Interleave [.avi]、QuickTime

[.mov] 或 MPEG 格式文件)应以符合要求的大小和长度

提交,并随附说明。文件最大为 20 MB。

• 影像说明应放在一个单独的 PDF 文件中上传。文件最大

为 8 MB。

与稿件不同的是,补充材料不会由 ASM 期刊的人员进行编

辑,也不提供校对。对补充材料的引用说明不能放入“参考文

献”部分,应该放入补充材料中。补充材料将始终作为文章的

关联成分,发表之后不做任何修改。

先前发表过(纸质或在线)的资料不得作为补充材料发

表。此时应在稿件中对原始刊物进行正确的文献引用。

补充材料的版权仍由原作者保有,但通讯作者所填写的版

权转移协议中应包含允许 ASM 发表的许可授权书。若您并非版

权所有者,则应获取经过其所有者签署、允许 ASM 将该材料作

为您文章补充材料刊发的授权书。您还应负责遵照版权所有者

的要求在补充材料中添加版权声明。

另请参见“出版费用”。

免责声明

在本期刊所发表的文章仅代表其作者观点,并不代表 ASM

的立场。ASM 不为文章中所出现的任何方法、工具、产品或设

备的可靠性或适用性提供任何担保。凡稿件中出现商标名称的

情况,仅用于进行身份识别,不代表 ASM 对其有任何认可或

担保。

交稿、审稿与刊发流程

交稿流程

向本刊提交稿件者必须通过 eJournalPress (eJP) 在线提交及

同行审稿系统提交电子档,相关链接:http://mcb.msubmit.net/

cgi-bin/main.plex。(不接收电子邮件交稿。)首次使用者应创

建一个“Author(作者)”账户,可用于所有 ASM 期刊的交稿

事宜。关于如何创建“Author(作者)”账户的说明,请参见

上文链接中的“help for authors(作者帮助)”链接;此外,在

登录界面和账户所有者主页上的同名链接下,还提供如何按步

骤通过 eJP 提交稿件的说明。关于可接受的电子档格式,可参

见“help for authors(作者帮助)”界面中题为“Files(文件)”

的部分。

Page 6: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

6 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

审稿流程

稿件提交后将视为机密文件,由编辑、编辑委员会成员或

具有相关资质的特别审稿人进行审阅。

为便于审稿流程的快速进行,要求作者推荐至少三名在相

关领域中具有专业造诣、并符合以下条件的候选审稿人(其中

应包含至少一位编委会成员):并非作者所在机构的成员;最

近与作者所在实验室没有关联;与所交稿件不存在任何利益

冲突。

为便于审稿,如有待发表和已提交的稿件可为当前稿件的

评判提供重要参考价值,则应作为补充材料提供,该材料不用

于发表。

稿件提交到本期刊之后将分配一个管理编号(如 MCB00123-

15)并交由一名编辑处理。(在与编辑和期刊部进行往来通讯

时,请始终使用该管理编号。) 通讯作者应负责将稿件提交、

审阅、刊印过程中的状态传达给其他共同作者。审稿人员将在

严格遵守“Guidelines for Reviewers”(审稿指南,http://www.

journals.asm.org/site/misc/reviewguide.xhtml)规定的前提下,尽

快完成审稿。

本刊通常会在交稿后 4 到 6 周内联系通讯作者,以通知编

辑是决定采纳稿件、退回稿件,还是要求修改稿件。需要修改

时,则通讯作者必须在 2 个月内提交修订稿或撤回稿件。必须

对照审校意见逐条订正回应并以独立的文件上传(须相应标

明),同时应包含一份稿件的对比版(不含图片)作为修订版

稿件 (Marked Up Manuscript)。

对于稿件被退回或撤回以进行修改的情况,如能解决稿件

内的主要问题,则仍可提交到相同的 ASM 期刊。请注意:若稿

件由于存在科学性问题或不适于出版发表而被某份 ASM 期刊退

稿,将被视为已被全体 ASM 期刊退稿;但如果退稿的原因仅为

稿件范围问题,则可重新提交到适当领域的 ASM 期刊。

凡属重新提交的稿件(包括提交到同一份和不同期刊的情

况,不论修改幅度,也不论退稿和重交之间的时间间隔),都

必须在投稿信中说明稿件系重交,并给出之前的稿件管理编

号。必须对照审校意见逐条订正回应 (point-by-point response)

并以独立的文件上传(须相应标明),同时应包含一份稿件

的对比版(显示全部修订内容)作为修订版稿件 (Marked Up

Manuscript)。提交到同一份期刊的稿件,一般仍由最初的编辑

处理。

如无最初编辑或总编的许可,被退回的稿件只能重新提交

一次。

稿件录用通知

编辑认为稿件具有科学价值、决定录用刊发之后,将通知

作者和期刊部。同时会尽快将已录稿件的 PDF 版发布到网上

(可参见“MCB 收用”)。

对于文本文件,将依照具体的文章类型自动进行预编辑、

编辑格式清理和加标签处理,并检查插图。待所有文件完全达

到本“要求”以及 eJP 在线稿件提交系统的标准,则稿件录用

程序顺利完成。若存在某些问题可能导致文字编辑阶段需要大

幅修改、或者文件不适于出版发表,则 ASM 期刊的有关人员将

联系通讯作者。确定所有需要刊印的材料全部符合要求之后,

即可安排稿件在下一期刊发。将由 ASM 期刊部的编辑人员将完

成稿件编辑定版工作、使其符合规定的标准要求。

MCB 收用

作为研究型期刊,ASM 会将已完成同行审稿并且接受、但

并未进行文字编辑的 PDF 版稿件发布在网上。这称为“[期刊

缩写] 收用”(例如“MCB 收用”),可通过期刊网站访问。

稿件获得通过后将尽快发布在网上,每周一次,然后才进行定

版、文字编辑和正式刊发。被收用的稿件将原样发表(例如作

者在修改阶段所提交的稿件),不反映 ASM 的编辑更改。不接

受对 PDF 稿件的任何更正/更改。因此,MCB 收用的稿件和

最终刊印的文章可能会有所不同。稿件将一直列在“MCB Ac-

cepts”(MCB 收用)网页上,直至发表最终定版文章。届时,

将从“MCB Accepts”网页上撤下原稿件。此时将只有订阅者

方可访问该文章;待到定版文章发表 6 个月之后,才向所有人

免费开放(依照相关的 ASM 授权条件要求)。提交审议并通

过、可以刊发的补充材料不会立即发表,必须等待最终定版文

章一同发表。

ASM 有限制发表前宣传的政策,因此文章的媒体报道必须

等到获得录用的稿件发布在“MCB Accepts”网页上后方可开

始。若希望在稿件发布之后尽快得到通知,请注册 e-Alerts,网

址:http://mcb.asm.org/cgi/alerts。

关于如何引用此类稿件的说明,请见“参考文献”。

版面校样

版面校样将和一份问题表及校样处理说明一起,以电子档

的形式提交给通讯作者。请将对问题表的答复填写在提问页面

中,然后将问题的相关更改以及任何额外更改放入校样中。请

注意,文字编辑并不会每作一处修改都在问题表中提出询问。

提出询问的情况一般是要求提供必要的信息,解释不清楚的段

落或提醒注意一些可能已经影响到原意的编辑改动。作者应负

责通读全文、表格和图片说明,而非仅限于问题表中指出的问

题。发放校样并发出通知之后,应在 2 个工作日之内完成修订

并返还。

版面校对阶段应不涉及大规模订正或增删。校样中的图片

仅用于确定其内容和位置,不涉及印刷质量或颜色精确性。事

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2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 7

投稿要求

实上,PDF 页面上所打印的图片,其画面质量通常低于在显示

器上观看的效果。因此,版面校对时请勿针对颜色质量或印刷

效果而进行修改。

若在最初提交稿件和最终收到清样的期间获得重要的新信

息,则可在征得编辑许可之后,将新信息作为补遗 (Addendum)

插入校样中。如果参考文献中要添加未发表的数据或个人通讯

内容,则要求加上引用已获许可的书面保证书。请将改动范围

限制为所交稿件或待发表稿件的拼写错误、数据错误、语法错

误和更新参考信息。若文章中提供了链接,请再次检查该网站

以确定网址仍然正确、且希望读者寻找的资料依然存在。

若校样时间需要推迟或存在问题,请联系 ASM 期刊部(电

子邮箱:[email protected];电话:202-942-9214)。

PDF 文件

通讯作者(在“corresponding author” 脚注中给出电子邮

件地址)可有限访问(共下载 10 次)自己所发表文章的 PDF

文件。期刊发布之日,将自动发送电子邮件提醒。邮件中提供

一个链接,用于获取访问权限和说明。通讯作者本人可以查

阅、打印或储存文章。

若其他共同作者或同事希望查阅论文进行使用,则通讯作

者可向其提供前述链接;不能直接转发文章电子副本。但是,

应向其告知 ASM 的版权要求与规定。(详情请见:http://www.

journals.asm.org/site/misc/terms.xhtml。)请注意:每次下载都

会从通讯作者的 10 次限额中扣除。完成 10 次下载之后将被拒

绝访问,只有订阅期刊(可为个人名义或集团名义),或者等

待标准访问限制期结束(例如刊发后 6 个月)方可重新访问。

发表费用

版面费。若作者的研究经费来自拨款、专项基金(包括部

门级和机构级)或合同(包括政府合同)或研究属于作者正式

职责(如政府或企业等)的一部分,则要求支付版面费用(按

照版面页数而定,含文章插图等)。稿件录用之后,其通讯作

者将收到一封电子邮件,告知其如何支付版面费及其他有关费

用的方法(见下文)。

若通讯作者是 ASM 贡献级 (Contributing) 或优先级 (Pre mium)

的有效会员,则头八页的版面费为每页 $67,八页之后每页

$125(如有变动,恕不另行通知)。

若通讯作者是非会员或支持级 (Supporting) 会员,则版面

费头八页的版面费为每页 $135,八页之后之后每页 $250(如有

变动,恕不另行通知)。非会员或支持级会员的通讯作者可加

入 ASM 并续费或在线升级会员等级以获取发表费用优惠。

若研究并未获得上述形式的资助,则请在稿件获得录用后

发送费用优惠申请,联系地址:Journals Department, ASM;传

真:202-942-9355;电子邮箱:[email protected]。申请中必

须包含 ASM 所分配的稿件管理编号,同时说明成果资金来源。

费用减免仅适用于版面费;彩页费及其他出版费用等仍须作者

负责。

综述 (Minireviews)、短评 (Commentaries) 和读编通讯 (Let-

ters to the Editor) 等不计入版面费。

彩页费。彩色印刷出版的费用必须由作者自行承担。

若通讯作者是 ASM 贡献级 (Contributing) 或优先级 (Pre mium)

的有效会员,则彩页费是每张彩色图片 $170(如有变动,恕不

另行通知)。

若通讯作者是非会员或支持级 (Supporting) 会员,则彩页

费是每张彩色图片 $375(如有变动,恕不另行通知)。非会员

或支持级会员的通讯作者可加入 ASM 并续费或在线升级会员等

级以获取发表费用优惠。

综述、短评和读编通讯等不计彩页费。

纸质及电子论文单行本。每位共同作者均可购买论文纸质

单行本(“Reprint”,每批 100 份)及电子单行本(“Eprint”,

可下载的 PDF)。除前述的 10 份免费刊印版 PDF 文件之外,

综述的通讯作者还可免费获取自己作品的电子单行本 100 份,

短评的通讯作者可免费获取自己作品的电子单行本 50 份。关于

如何订购额度内免费单行本及额度外付费单行本的说明,请见

发给通讯作者的付款通知电子邮件。稿件刊发后,如需购买单

行本,请参见“Author Reprint Order Form”(单行本订购单)。

如有疑问,敬请联系:[email protected]

补充材料费。刊印论文时,如需附加补充材料一并发表,

则将向作者收取固定的费用。(例外:综述或短评文章的补充

材料不收取费用。)

若通讯作者是 ASM 贡献级 (Contributing) 或优先级 (Pre mium)

的有效会员,则补充材料费是 $190。若通讯作者是非会员或支

持级 (Supporting) 会员,则补充材料费是 $285。非会员或支持

级会员的通讯作者可加入 ASM 并续费或在线升级会员等级以获

取发表费用优惠。

选择开放访问的费用。所有文章类型都能接受由作者付款

的可选开放访问 (Optional Open Access, OOA)。若通讯作者是

ASM 贡献级 (Contributing) 或优先级 (Pre mium) 的有效会员,则

OOA 费是 $2,000。若通讯作者是非会员或支持级 (Supporting)

会员,则 OOA 费是 $3,000。非会员或支持级会员的通讯作者可

加入 ASM 并续费或在线升级会员等级以获取发表费用优惠。

Page 8: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

8 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

此费用需要在版面费、彩图费、补充材料费之外另算;

付费后即可让公众访问前期的“收用”版和经过编辑、排版并

最后在线发表的论文。选择本项目之后,可立即通过 NIH 的

PubMed Central 文献库开放访问;凡在 ASM 首次发表的研究论

文,都将在发表后的第 6 个月通过 PubMed Central 免费开放。

由惠康基金会 (Wellcome Trust) 或英国研究委员会 (Re-

search Councils UK) 承担开放访问费用的文章,将依据资助机构

的开放访问政策在 Creative Commons Attribution license (CC-BY)

许可证之下发表。提交时,要求作者将有关情况知会 ASM,

并填写“Author Warranty and Provisional License to Publish”

(原创保证及出版授权书)。

组织与格式

编辑风格

ASM 期刊的编辑风格符合“ASM Style Manual for Journals”

(ASM 期刊风格手册,美国微生物学会内部参考,2015 年)

及“How To Write and Publish a Scientific Paper”( 如何撰写和发

表科学论文,第 7 版,作者 Greenwood,加利福利亚州圣巴巴

拉市,2011 年)的要求(ASM 期刊部和编辑解释和修订版)。

编辑和 ASM 期刊部保留对稿件进行编辑,以使其符合前述

资料和本“要求”中所列出风格规定的特权。

研究论文的文字篇幅限 40,000 个字符(不计空格),包括

摘要、前言、结果、讨论和图片说明。同时,摘要限制在 200

字以内。作者应在致编辑的投稿信 (cover letter) 中说明各文字

部分的长度是否符合这些要求。“材料与方法”部分字数、“

参考文献”部分字数和与研究直接相关的图片数都没有限制。

ASM 录用稿件之后,将自动依照具体的文章类型进行预编

辑、编辑格式清理和加标签处理。为便于该流程的进行,要求

提交的稿件格式正确,有适当的分节和标题。

稿件全文格式应为双倍行距(行间距至少 6 mm),包括

图片说明、表格脚注和参考文献;每页都要有连续的页码,包

括摘要、图片说明和表格。最后两项请放在“参考文献”部

分。稿件每页都应添加连续行号;没有行号的稿件将可能被编

辑退稿并要求添加行号之后重新提交。字体大小不得小于 12 号。

建议做到能够轻松区分稿件中下列字符:数字“0”和字母

“O”、小写字母“l”和大写字母“I”;乘号“×”和字母

“x”。请勿自创图形符号或使用未包含在字处理程序中的特

殊字体;请使用“插入符号”功能。请将页面大小设置为 8.5

× 11 英寸(21.6 × 28 cm)。请将应当显示为斜体的内容设为斜

体,段落主题句应使用粗体。

若稿件英文水平过低或不符合本“要求”的标准,将可能

导致编辑不做审阅而直接退稿。

若对稿件英文水平没有把握,可请精通英文的人员帮助检

查,也可寻求专业的外文写作服务以获取帮助。

标题 (title)、眉题 (running title)、署名行 (byline)、各作者

所属机构和通讯作者。拟定标题时请注意,每份稿件都必须代

表着一个独立、完整的研究,因此不得使用加顺序编号的多个

标题。应避免主标题/副标题的形式,避免使用完整句子,避免

不必要的修饰和内容。文题页 (title page) 上应包括论文标题、

眉题(内容加空格不超过 54 个字符)、全体作者署名、进行研

究时各作者所属机构及通讯作者的姓名和地址;另外,如任何

作者所属机构已变动,还应在脚注中说明其目前地址。请在负

责论文相关事宜联络的通讯作者名字后面的署名行加上“#”

(参见下文“联系人脚注”)。请参阅此处的文题页范例。

文题页中还包含“材料与方法”部分的字数统计以及前

言、结果、讨论部分的总字数统计。

在署名行中添加科研小组。如果有来自某科研小组、调查

小组、工作组、科研联合体及其他类似团体(例如美国疾病防

控中心的 Active Bacterial Core Surveillance 小组)的成员作出了

贡献,且符合本“要求”对署名权的条件规定和对论文内容负

责的要求,则可将该团体放入标题之下的署名行。至于具体作

出贡献者的姓名(可加上其所属机构名称),可在“致谢”部

分中以单独的一段列出。

但若合作团体中作出贡献的成员不满足前述“作出实质性

贡献”及“为论文负责”的要求,则不能将该团体列入标题之

下作者署名行中。此时,应改为将该团体中作出贡献的具体成

员列入“致谢”部分中。

联系人脚注。稿件文题页上应包含通讯作者的电子邮件地

址。该信息将作为脚注随文章一同发表。这是为了便于联络交

流,并用于通知通讯作者领取校样,以及文章发表之后领取其

PDF 版文件。指定的通讯作者不能超过两人。

摘要 (Abstract)。请将摘要限制在 200 字的范围内,应做到

短小精悍、总结论文的基本内容,而不用包含过多的实验细

节。应避免使用缩写和参考文献,且不能加入图表。确有必要

使用参考文献的,请使用以下“参考文献”一节中所示格式(

请参见“摘要中的引用”部分)。

由于摘要部分会单独交由文摘服务发表,因此要求内容完

整,无需参考全文也能理解。

Page 9: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 9

投稿要求

前言 (Introduction)。前言部分应提供充足的背景信息,以

便于读者理解目前研究的内容和意义价值,而无需另行查阅先

前发表的相关资料。前言部分还应提供当前研究的前提假设和

理论依据。仅使用必需的参考文献,以提供最重要的背景知

识,而不是对该课题进行详尽的回顾。

材料与方法 (Materials and Methods)。材料与方法部分应提

供重复试验所需的充足技术信息。若离心条件十分关键,则应

给出充足的信息,以便让检查者可以重复试验过程:所用离心

机的厂商、电机型号、温度、最高速度时间和离心力(单位请

用 g 而非 rpm)。对于常见材料和方法(如介质和蛋白质浓度

测定),则只需简单说明。若有多个不同的常用方法,请具体

说明所用方法,并给出引用文献。例如表述“细胞采用超声波

破碎法,如前所述 (9)”优于“细胞按前述方法破碎 (9)”。这

便于读者了解所用方法而无需频繁参阅其他资料。新方法应作

完整说明,比较罕见的化学品、仪器设备或菌种应说明来源。

若研究中用到大量菌株或突变系,则应以表格说明其直接来源

(获取菌株的来源)以及各菌株、突变系、噬菌体和质粒等的

性质。

若某种方法或菌株仅用于论文内几个实验中的一个,则可

在“结果”部分中或表格脚注、图片说明中简单(一两个句

子)说明。要求说明获取菌株的来源。

结果 (Results)。“结果”部分应包含试验结果。至于对结

果的深入解读,应在“讨论”部分进行。试验结果应尽量精

简,可为后面三种形式之一:文字、表格(可分多个)、图片

(可分多张)。若使用文字或表格能更精简地呈现结果,则应

避免过多地使用图表。例如,除特殊情况外,请勿将用于确定

酶 Km

值的双倒数图以图形呈现,应直接在正文中给出数值。

类似地,除特殊情况外,其他获取运动或物理常数的常用作图

法(如粘度法作图和用于确定沉降速度的作图法)都不需要显

示。除非必须用照片才能显示的试验结果,否则请尽量减少照

片的使用(尤其是显微照片和电子显微照片)。请按在正文中

出现的顺序给图片和表格编号,并确保引用所有图片和表格。

讨论 (Discussion)。在讨论部分应探讨实验结果的意义,

说明其与过去研究成果和现有实验系统的关系,请勿过多重

复“结果”部分及“引言”部分的内容。在短篇论文中,可以

将“结果”和“讨论”部分合并。

致谢 (Acknowledgments)。必须在致谢部分中说明研究所

获得的资金支持。(若不说明,则默认代表作者没有获得任何

支持。)一般格式如下:“This work was supported by Public

Health Service grant CA-01234 from the National Cancer Institute.”

(本研究由美国国家癌症研究所的公共健康服务专项资金 CA-

01234 号赞助)。

个人协助者应列在单独的段落中;针对论文所反映观点或

所谈论产品的免责声明也应以同样方式处理。

附录 (Appendixes)。在附录部分包含附加材料以帮助读者

理解论文。标题、作者和参考文献必须与主要论文中的相关内

容一致。若无法将附录部分的所有作者都列在标题下署名行

或“致谢”部分中,则请将附录重写为可以作为独立文章发表

的形式。其中的公式方程、表格和图片的数字编号之前应当加

“A”,以示与正文部分有所区别。

参考文献 (References)。在清单中,参考文献应按在正文

中引用的顺序进行编号 (Citation-Sequence);ASM 已不再使用

过去的按字母顺序排列的体系 (Citation-Name)。正文中的参考

文献按照括号内数字顺序依次插入引用。未发表或未经同行审

阅的数据直接在正文中括号插入(见下文第 ii 节)。

(i) “参考文献”部分列出的文献。下列几种文献应列在“

参考文献”部分:

•期刊文章(纸质和在线版)

•书籍(纸质和在线版)

•书籍章节(要求列出书名)

•专利

•学位论文

•已发表的会议论文集

•会议文摘(来自已发表的文摘汇编或期刊的增刊)

•通讯(读编通讯)

•公司刊物

•待刊印的期刊文章、书籍和书籍章节(要求列出刊发名

称)

参考文献必须列出全部作者和/或编辑的姓名;不得用

“et al”进行省略。

由于从 PubMed 下载的标题和署名行等信息中往往不显示

音调符号、斜体、特殊字符等,因此要求作者参照文章的 PDF

文件或纸质版本在稿件中进行必要订正。

期刊名称的缩写应遵循 PubMed Journals Database 的规定进

行(见美国国立卫生研究院医学图书馆:http://www.ncbi.nlm.

nih.gov/nlmcatalog/journals),这是 ASM 风格要求的原始来源

(不要在缩略词中使用英文句点)。如需要使用 EndNote 软件

中ASM期刊最新的参考文献格式的输出格式,可以在“此处”

查阅;点击“打开”,然后再点击“下载和安装”将其保存至

Page 10: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

10 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

您的 EndNote 格式文件夹(本格式应替换任何之前 ASM 期刊的

输出格式[所有的 ASM 期刊应使用相同的参考文献格式])。

对于纸质参考文献,请遵循以下格式。

1. Caserta E, Haemig HAH, Manias DA, Tomsic J, Grundy FJ, Henkin TM, Dunny GM. 2012. In vivo and in vitro analyses of regulation of the pheromone-responsive prgQ promoter by the PrgX pheromone receptor protein. J Bacteriol 194:3386–3394.

2. Falagas ME, Kasiakou SK. 2006. Use of international units when dosing colistin will help decrease confusion related to various formulations of the drug around the world. Antimicrob Agents Chemother 50:2274–2275. (Letter.) {条目末尾处可使用 “Letter” 或 “Letter to the editor” 字样,但并非必需。}

3. Cox CS, Brown BR, Smith JC. J Gen Genet, in press.* {文章标题并非必需内容,但必须包含期刊标题。}

4. da Costa MS, Nobre MF, Rainey FA. 2001. Genus I. Thermus Brock and Freeze 1969, 295,AL emend. Nobre, Trüper and da Costa 1996b, 605, p 404–414. In Boone DR, Castenholz RW, Garrity GM (ed), Bergey’s manual of systematic bacteriology, 2nd ed, vol 1. Springer, New York, NY.

5. Stratagene. 2006. Yeast DNA isolation system: instruction man-ual. Stratagene, La Jolla, CA. {若公司刊物上没有给出作者姓名,则可使用公司名代替。}

6. Forman MS, Valsamakis A. 2011. Specimen collection, trans-port, and processing: virology, p 1276–1288. In Versalovic J, Carroll KC, Jorgensen JH, Funke G, Landry ML, Warnock DW (ed), Manual of clinical microbiology, 10th ed, vol 2. ASM Press, Washington, DC.

7. Fitzgerald G, Shaw D. In Waters AE (ed), Clinical microbiolo-gy, in press. EFH Publishing Co, Boston, MA.* {章节标题并非必需内容。}

8. García CO, Paira S, Burgos R, Molina J, Molina JF, Calvo C, Vega L, Jara LJ, García-Kutzbach A, Cuellar ML, Espinoza LR. 1996. Detection of Salmonella DNA in synovial membrane and synovial fluid from Latin American patients using the poly-merase chain reaction. Arthritis Rheum 39(Suppl 9):S185. {发表在增刊中的会议摘要。}

9. Carlson E. 2013. Selective penicillin-binding protein imaging probes reveal substructure in bacterial cell division, p 59. Final Program 113th Gen Meet Am Soc Microbiol. American Society for Microbiology, Washington, DC. {摘要标题并非必需内容。}

10. Rotimi VO, Salako NO, Mohaddas EM, Philip LP. 2005. Abstr 45th Intersci Conf Antimicrob Agents Chemother, abstr D-1658. {摘要标题并非必需内容。}

11. Green PN, Hood D, Dow CS. 1984. Taxonomic status of some methylotrophic bacteria, p 251–254. In Crawford RL, Hanson RS (ed), Microbial growth on C

1 compounds. Proceedings of the

4th International Symposium. American Society for Microbiol-ogy, Washington, DC.

12. O’Malley DR. 1998. Ph.D. thesis. University of California, Los Angeles, CA. {标题并非必需内容。}

13. Odell JC. April 1970. Process for batch culturing. US patent 484,363,770. {尽可能包含专利名;必须有专利号。}

14. Elder BL, Sharp SE. 2003. Cumitech 39, Competency assess-ment in the clinical laboratory. Coordinating ed, Sharp SE. ASM Press, Washington, DC.

*引用待刊印的 ASM 出版物时,期刊文章必须说明其管理编号

(如 MCB00123-15);书籍则必须给出书名。

对于仅供在线参考的资料,要求提供的信息原则上与纸质

文献相同。对于在线期刊文章,可用发表日期或修订日期代替

出版日期;对于没有传统页码或电子文章标识符的,则要求提

供文章 DOI 号(优先)或链接。

1. Bina XR, Taylor DL, Vikram A, Ante VM, Bina JE. 2013. Vibrio cholerae ToxR downregulates virulence factor production in re-sponse to cyclo(Phe-Pro). mBio 4(5):e00366-13. doi:10.1128/mBio.00366-13.

2. Winnick S, Lucas DO, Hartman AL, Toll D. 2005. How do you improve compliance? Pediatrics 115:e718–e724. doi:10.1542/peds.2004-1133.

3. Dionne MS, Schneider DS. 2002. Screening the fruitfly immune system. Genome Biol 3:reviews1010-reviews1010.2. doi:10.1186/gb-2002-3-4-reviews1010.

4. Giegé R, Springer M. 2012. Aminoacyl-tRNA synthetases in the bacterial world. EcoSal Plus doi:10.1128/ecosalplus.4.2.1.

注意:若为定期更新或更改的在线文献,则要求提供发表或访

问文献的日期。

引用 ASM“收用”稿件时要求格式如下。

Wang GG, Pasillas MP, Kamps MP. 15 May 2006. Per-sistent transactivation by Meis1 replaces Hox function in myeloid leukemogenesis models: evidence for co- occupancy of Meis1-Pbx and Hox-Pbx complexes on promoters of leukemia-associated genes. Mol Cell Biol doi: 10.1128/MCB.00586-06.

其他期刊对于待刊稿件的风格要求可能有所不同,但文献

引用条目中一般都必须包含下列信息:作者姓名、发表日期、

标题、期刊名称、卷号、页码及/或 DOI 号。如以下范例:

Zhou FX, Merianos HJ, Brunger AT, Engelman DM. 13 February 2001. Polar residues drive association of polyleucine transmembrane helices. Proc Natl Acad Sci U S A doi:10.1073/pnas.041593698.

(ii) 正文中引用的文献。应当在正文中引用的资料有

•未发表的数据

•提交刊发的稿件

•未发表的会议报告(例如未出现在公开的会议论文集中

的报告或展板)

•个人通讯

•专利申请书及申请中的专利

•计算机软件、数据库和网站

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2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 11

投稿要求

这些资料应直接用括号插入正文中,如下所示:

. . . 类似结果 (R. B. Layton and C. C. Weathers, unpub-

lished data)。

. . .采用了系统 (J. L. McInerney, A. F. Holden, and P. N.

Brighton, submitted for publication)。

. . . 如前所述 (M. G. Gordon and F. L. Rattner, presented

at the Fourth Symposium on Food Microbiology,

Overton, IL, 13 to 15 June 1989)。{用于未发表的文

摘和展板等。}

. . .这种新工艺 (V. R. Smoll, 20 June 1999, Australian

Patent Office)。{对于美国以外的专利申请,请注

明申请的出版日期。}

. . .在 GenBank 基因数据库中提供 (http://www.ncbi.

nlm.nih.gov/Genbank/index.html)。

. . . 运用 ABC 软件 (version 2.2; Department of Microbiol-

ogy, State University [http://www.state.micro.edu])。

文章中不得包含研究中所提到产品的厂家公司或其所售产

品的链接网址。但必须通过公司链接方可访问研究的相关科学

数据或得到研究所用共享软件的情况除外。

(iii) 摘要中的引用。摘要必须能够独立于文章本体而存

在,因此其中的引文必须清晰明了,无需参阅“参考文献”部

分就能理解。请使用简缩的形式,略去文章标题,如:

(P. S. Satheshkumar, A. S. Weisberg, and B. Moss, J Virol 87:10700–10709, 2013, doi:10.1128/JVI.01258-13)

(J. H. Coggin, Jr., p. 93–114, in D. O. Fleming and D. L. Hunt, ed., Biological Safety. Principles and Practices, 4th ed., 2006)

“. . . D. A. Hopwood 在最近一份报告 [mBio 4(5): e00612-13, 2013, doi:10.1128/mBio00612-13] 中指出……”

此风格同样适用于“补遗”(Addenda in Proof) 部分。

(iv) 补充材料的相关引用。若补充材料中必须引用文献,

则请将其放入补充材料中单独的“参考文献”部分中,并按相

应的编号进行索引;请勿直接使用其所属文章的索引编号。如

果主文和补充资料中均引用了同一参考文献,则需在主文和补

充资料的参考文献部分中都注明该参考文献。

综述 (Minireviews)

综述就是简短的(不包含参考文献应限制在六张版面之

内)人物介绍、历史回顾或对一些发展较快的领域进行总结。

综述必须以已经发表的文章作为根据;可以是本刊相关范围内

的任意专题。

综述既可以约稿,也可以作者主动供稿,视具体需要而

定。不论哪种,综述都要经过审阅,应通过 eJP 在线提交及同

行审稿系统提交。在投稿信中应说明稿件是否为约稿并注明约

稿人。

综述必须包含摘要。请将摘要控制在 200(含)字之内。

综述的正文中应有段落标题和/或段落主题句。

作者简介 (Author bios)。在编辑的邀请下,综述的通讯作

者可提交每位作者的简介和照片以随文章一同发表。这些信息

应在修改阶段提交。

•每位作者的简介限 150 字之内,应包含姓名、教育背

景、曾经任职的机构及职务、现就职机构、对所论述问

题兴趣的缘起,以及在这个领域进行研究的时间。

•照片应为护照照片尺寸黑白头像。请将照片缩小到约

1.125 英寸宽、1.375 英寸高。照片应当符合对于常规图

片的制作要求,另外还应使用 Rapid Inspector 检查像素

质量(网址:http://rapidinspector.cadmus.com/RapidIn-

spector/zmw/index.jsp)。

•提交时,请将文本和照片连同已修改的稿件一起上传到

在线提交及审稿系统。请将个人简介的文字和稿件放在

同一个文件中,接在“参考文献”部分之后。在提交系

统中上传头像照片时,请选择“Minireview Bio Photo”

(综述个人照片);请在每张照片的文件名中包含作者

全名或姓名的一部分以便于识别。

如有任何关于写作内容的问题,请联系科技编辑 (scientific

editor)。如有任何关于提交文件的问题,请联系制作编辑 (pro-

duction editor)。

短评 (Commentaries)

“短评”一般来自对编辑约稿的回信,属于通讯性质,涵

盖主题一般为本刊广大读者所关心的、不需要通过“综述”这

种形式讨论的主题。其目的在于提出学术界感兴趣的问题、引

发或引导探讨,提出科研与教育领域主流群体的看法或共识。

不能为文献评论、方法和技术说明论文,或针对某篇具体的已

发表的论文。短评也需要经过审阅。

长度不要超过四张版面,格式基本类似于上面的“综述”,

但是摘要限制在 75 字以内。

读编通讯 (Letters to the Editor)

“读编通讯”(Letters to the Editor) 仅用于对已经在期刊上

最终定版刊发的文章(不能是网上发布的已获得录用的稿件)

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12 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

提出看法,其中所引用的支持作者观点的资料必须为已经刊发

的文献。

此类通讯的长度不得超过 500 字,且应为双倍行距格式。

关于正确的格式,请参阅最新发表的通讯。请注意:作者及其

所属单位列在标题下方。

所有读编通讯一律提交电子档,同时在交稿表的相关下拉

列表中选择正确的稿件类型:Comment Letter(通讯)。应在

投稿信中说明其对应文章发表的期号和卷号,并注明文章标题

和第一作者的姓氏。请在交稿表的“Abstract(摘要)”部分填

写“Not Applicable”(不适用)。读编通讯中并不包含摘要。

通讯必须带有标题,并应同时在稿件和交稿表中注明。应尽量

控制图片和表格的数量。

通讯一般交由所涉文章的编辑处理。若该编辑认为可以发

表,他/她将联系原文通讯作者以邀请其作出回应,同时将其推

荐给主编。主编决定最终是否刊发。

请注意,有些文献收录/文摘服务的数据库并不收录“读编

通讯”。

勘误 (Errata)

勘误部分用于在文章发表之后纠正写作、编辑或刊印过程

中所出现的错误(错别字、漏字漏句、图片标记错误等)。提

交勘误表请通过 eJP 在线提交及同行审稿系统进行(参见

“交稿、审阅和刊发流程”)。请在交稿表的“Abstract(摘

要)”部分(必填字段)中填写“Not Applicable(不适用)”。

请以 Microsoft Word 文件格式上传勘误表。关于正确的格式,

请参看最新发行的版本。

作者订正 (Author Corrections)

“作者订正”部分用于更正已经发表的文章中一些遗漏性

错误(如遗漏某位作者或未注明引用)和不影响论文基本结果

或结论的技术性错误(如计量单位错误、整体数量级错误、多

个培养基中的一个受到污染、某种突变菌株鉴别错误等造成

研究的某个次要部分出现错误数据)。请注意:不可添加新

数据。

如需刊发“订正”以纠正技术性错误或署名权问题(包括

贡献度、数据和资料的使用权或所有权等),必须得到有关各

方的书面协定。若遗漏某位作者姓名,则必须提交文章全体作

者(包括姓名被遗漏者)签名的确认信。必要时可征询稿件责

任编辑的意见。

请通过 eJP 在线提交及同行审稿系统提交“作者订正”

(参见“交稿、审阅和刊发流程”)。

稿件类型请选择“Author Correction(作者订正)”。请

在交稿表的“Abstract(摘要)”部分(必填字段)中填写

“Not Applicable(不适用)”。请以 Microsoft Word 文件格式上

传“作者修订”。关于正确的格式,请参看最新发行的版本。

已签署的协议书应作为补充材料提供,该补充材料不用于发表

(PDF 扫描件)。

撤稿 (Retractions)

撤稿用于处理重大错误或违背道德做法的情况,比如数据

来源或文章的结果和结论有效性存在疑点。请通过 eJP 在线提

交及同行审稿系统提交“撤稿”(参见“交稿、审阅和刊发流

程”)。请在交稿表的“Abstract(摘要)”部分(必填字段)

中填写 “Not Applicable(不适用)”。请以 Microsoft Word 文

件上传“撤稿”。全体作者签署的协议书应作为补充材料提

供,该补充材料不用于发表(PDF 扫描件)。“撤稿”要求将

交由期刊主编负责,并征询稿件责任编辑和 ASM 期刊委员会主

席的意见。若各方均认可发表撤稿通知,且对其内容没有疑

问,则发往期刊部进行刊登。

插图与表格

插图

图像处理。提交刊发的数码图像将由 ASM 制作专家进行检

验。如根据下文标准发现有特殊处理或电子加工的迹象,则可

能被视为学术不端行为。一旦发现图像/数据存在加工处理的迹

象,将立即上报主编,然后可能要求作者提交其原始数据,用

于与所提交的图像文件进行比对。执行调查可能会推迟稿件的

发表,ASM 可能采取撤销稿件录用决定和/或其他措施。

对比度、亮度和/或色彩方面的线性调整一般可以接受,只

要该调整是为了便于观察数据中确实存在的要素,且应用于整

幅图像而非个别区域。不能接受的图像调整手段包含(但不限

于):删除、遮掩、复制(复制粘贴)、添加、选择性增强、

调整元素在图像中的位置。

若对画面进行非线性调整(如更改伽马设置),则交稿时

必须在图片说明中充分说明。此外,若图像是通过整合汇集多

个文件(包括同一图像中不相连的部位)而获得的,则必须能

够清楚地区分这些文件,不至于误认为是一个整体。可以采用

在各独立的图像之间插入分割线的方法。

文件类型与格式。插图可以是连续色调图像 (continuous-

tone images)、线形图 (line drawings)或图文混排 (composites)。

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2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 13

投稿要求

可以提交彩色图像,但彩图印刷费用应由作者自负。下面提供

一些降低制作成本同时保障准确再现颜色效果的建议。

首次提交时,既可以将每张图片作为单独的 PDF 文件上

传,也可以将全部图片合并在同一个 PDF 文件中。图片说明请

同时放置正文和图片所在页面内以便于审阅。在修改阶段必须

提交达付印级别的数码文件。图片说明必须进行文字和版面

调整以便于最终刊发,因此不能包含在图片中作为其一部分。

随订正稿件提交的图片必须为位图、灰阶图,也可为 RGB(优

先)或 CMYK 彩色模式图。具体参见“彩色插图”。半色调图

象(即由多种网点疏密度组成的图像)必须用灰阶图,不能用

位图。无论是黑白还是彩色图片,MCB 可以接受 TIFF 或 EPS

文件,但一般不鼓励使用 PowerPoint 文件。

关于如何创建符合我们要求的 EPS 和 TIFF 文件,请参考

Cadmus 数码艺术网站:http://art.cadmus.com/da/index.jsp。如

果是 PowerPoint 文件,则要求用户严格注意图片中的字体(可

参见后文关于字体的部分)。如果未严格遵循字体要求,图片

在刊印时就可能出现丢字、字符转换错误或图片中某些要素或

文字移位或模糊不清的问题。关于在 PowerPoint 图像中字体的

正确使用,请参考 Cadmus 数码艺术网站:http://art.cadmus.

com/da/instructions/ppt_disclaimer.jsp。请注意:由于页面合并

系统的要求,您还必须确定您的 PowerPoint 文件能正确无误地

转换成 PDF。

强烈建议作者在返回修订稿时检查确认数码图片符合刊印

要求,可通过在 Rapid Inspector 中运行文件检查,以下链接提

供该工具:http://rapidinspector.cadmus.com/RapidInspector/

zmw/index.jsp。Rapid Inspector 是简便易用的 Web 应用程序,

可在文件特性中找出可能导致图片无法刊发的问题。在使用

Rapid Inspector 时请注意检查 PowerPoint 文件,PowerPoint

应用过程中会出现一个已知的 bug,可偶尔导致 PowerPoint

Presentation (.pptx) 出现错误并关闭,虽然这些文件符合所有规

定的生成标准。如果您在操作中遇到这种bug,可以按照以下方

式纠正该问题:在操作“另存为”环节时选择将 PowerPoint 文

件保存为一个旧的版本如 PowerPoint 97-2004 Presentation (.ppt)

(使用下拉菜单并选择该格式)。一旦您将文件保存为 .ppt

格式并且同时符合所有规定的文件生成标准,那么这些 Power-

Point 文件均可成功在 Rapid Inspector 中运行。

如有任何关于 Rapid Inspector 印前检查工具用法的问题,

请发送电子邮件询问:[email protected]

最低分辨率。所用文件必须达到足够高的分辨率,这十分

重要。因此,将每张图像导入到图片文件中之前,必须先检查

确定其分辨率是否正确。(例如:将 72-dpi 的图像放在 300-dpi

的 EPS 文件中并不能让前者达到文件最低分辨率的要求。)但

是请注意:分辨率越高则文件越大,上传耗时越长。分辨率高

于最低值也不会提高刊印效果。最低分辨率如下:

•灰阶和彩图为 300 dpi

•图文混排为 600 dpi

•线型图片为 1,200 dpi

尺寸。提交的图片必须与刊发尺寸等大;也就是说:上传

图像的尺寸必须是将来刊发尺寸的 100% ,从而不需要进行缩

放。提交尺寸的图片分辨率仍应达到要求的标准。只需包含图

像中需要用到的部分。空白区域必须从图像上裁掉,图框标签

和图像之间间隔不能太大。

•单栏图片 (1-column figure) 的最大宽度: 20.6 picas(约

8.7 cm)

•双栏图片 (2-column figure) 的最大宽度: 42 picas(约

17.8 cm)

•双栏图片 (2-column figure) 的最小宽度: 26 picas(约

11.1 cm)

•标准图片的最大高度: 54.7 picas(约 23.2 cm)

•大号图(无眉题)的最大高度:57.4 picas(约 24.3 cm)

对比度。插图的对比度必须足够大,以便于轻松在显示器

或版面上查看。

图片的标记与组合。所有的最终文字和标记都必须整合到

图片中。首次提交时,插图应以 PDF 文件格式提供,请同时在

正文中及对应图片的下方添加图片说明以便于审阅。在修改阶

段必须提交符合刊印标准的数码图片文件(无图片说明)。将

图片编号放在图片边框之外,注意保留一定的距离。(文字编

辑阶段可能需要调整编号顺序。)每张图片都必须以独立的文

件上传,多张图片的组合 (multipanel figures) 必须合并为一个文

件:换言之,若某几张图片需要合并在一起,则无需单独上传

每张图片,应先将它们拼合在一起组成一张图片,然后以一个

文件形式上传。

字体。为避免出现字体方面的问题,请将文字设为以下字

体之一: Arial、Helvetica、Times Roman、European PI,Mathe-

matical PI 或 Symbol。Courier 字体仅限用于需要等宽字体的核

苷酸或氨基酸序列。其他字体则必须在创建文件的应用程序中

将其转换成路径(或曲线)。

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14 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

彩色插图。彩图的费用完全由作者自负。请参见“出版费

用”。所有提交的彩色图片都将按彩页处理。遵循以下几点将

有助于降低费用,同时确保彩图效果尽量准确。

最终的在线版本即为 MCB 和其他 ASM 期刊的入库版本。

为了尽量保证在线版本的再现效果,彩色插图最好用 RGB 彩色

模式,可以选择:(i) 每英寸像素数不低于 300 的 RGB TIFF 图

像(由像素组成的光栅图形文件);或 (ii) 兼容 Illustrator 的

EPS,用 RGB 彩色像素(矢量图文件,可包含线条、字体、填

充色与图形)。也可接受 CMYK 文件。除颜色空间之外,对

CMYK 文件的印制要求与 RGB 文件相同。RGB 颜色空间(红绿

蓝)是计算机显示器以及大多数捕捉科学数据的设备与软件的

原生色彩空间,可显示比 CMYK 颜色空间(青红黄黑)范围更

广的颜色(尤其是明亮的荧光色调),后者用于使用油墨色粉

在纸张上印刷的印刷设备。对于纸质版本(以及单行本),

ASM 的印刷供应商可根据提供的 RGB 版本彩图自动创建 CMYK

版。由于印刷机 用的 CMYK 油墨所能体现的颜色范围较窄,因

此纸质版期刊与在线版期刊上的色彩未必一致。

如需进一步了解 RGB 与 CMYK 颜色体系的对比信息,请

参考 Cadmus 数码艺术网站:http://art.cadmus.com/da/guide

lines_rgb.jsp。

作图

提交图形、图表、复杂化学式或数学公式、框图和其他图

示等,必须达到最终成品、无需额外加工或排版的标准。所有

元素(包括字母、数字、符号等)都必须清晰可读,图形的两

个轴都必须标明。由于本期刊需要同时以纸质和在线两种形式

出版,因此作者所提交的电子版文件将同时用于制作两种

版本。

创建线型图片时,请遵照以下要求:

(i) 提交的图片必须与制作尺寸等大。关于正确的尺寸,请

参见上文的“尺寸”。

(ii) 应避免在线形图中使用网格(即底纹)。若没有摩尔

纹图,印刷这些图片将会十分困难和耗时。建议用图案背景取

代网格,但不要用从其他应用程序中导入的填充图案。若必须

在图形中包含网格,

(a) 请使用每英寸不超过 85 根纹路的网线板来生成图

形。

(b) 若采用多重灰阶渐变,每个级别之间对比不得低

于 20%。

(c) 请勿使用 5% 以下或 95% 以上的灰阶,因为它们最

终的印刷效果很可能显示为无色或全黑。

(iii) 线条应为宽度不小于 1 磅的粗实线。

(iv) 最终制作时,所有文字都不能小于 6 磅。

(v) 避免将文字层直接覆盖在带底纹或纹理的区域。

(vi) 避免使用反白字(即白字黑底)。

(vii) 避免使用过粗的字体,以免造成相互粘连;还应避免

使用不常见的符号,因为印刷机可能无法复制图例。

(viii) 若使用彩色,请避免使用同种颜色的不同灰度;并避

免使用过浅的颜色。

在有纵横坐标的图片中(包括表格的列标题中),应避免

使用易混淆的带指数的数字。一般最好使用适当国际单位制

(Système International d’Unités, SI) 符号(μ 代表 10-6,m 代表

10-3,k 代表 103,M 代表 106 等)。因此,在图片纵坐标上表示

20,000 cpm,可用数字 20 加上坐标轴标尺 kcpm。完整的 SI 符

号清单请见国际纯粹与应用化学联合会 (International Union of

Pure and Applied Chemistry, IUPAC) 所出版的 Quantities, Units

and Symbols in Physical Chemistry 第 3 版 (RSC Publishing, Cam-

bridge, United Kingdom, 2011);另请参阅缩写列表:http://old.

iupac.org/reports/1993/homann/index.html。

若必须使用 10 的幂,则本期刊要求将指数式与数字放在一

起。如表示“20,000 个细胞/毫升”,则应在纵坐标上写“2”,

然后将标尺定为“104 cells per ml”(不能为“cells per ml

10-4”)。同样,酶活性 0.06 U/ml 可表示为 6 加上标尺“10-2 U/

ml”。建议表示为 60 mU/ml(毫单位/毫升)。

列出核苷酸序列

核苷酸序列较长时,应以图片形式按照下面的格式列出以

节约空间。以每行 100 到 120 个核苷酸符号的形式列出序列,

使用等宽字体以保证清晰可读;最终刊发时每行宽度是 6 英寸

(约 15.2 cm)。如有可能,请将每行核苷酸序列进一步细分成

10 到 20 个核苷酸一段,中间用空格或上标符号隔开。如果小

写字母能够在 6 英寸(约 15.2 cm)的行宽下清晰可辨,则可使

用大写和小写字母来列出外显子-内含子结构或转录区等。应为

序列逐行加上编号;请将代表每行第一个碱基的数字放在该行

左侧。尽量减小序列行之间的间隔,仅留下对序列进行标记所

需的空间即可。标记可加粗、加下划线、括号、方框等。必要

时也可使用单字母氨基酸符号体系对氨基酸序列进行编码,放

在紧贴每个密码子第一个核苷酸的上方或下方。需要对多个核

酸序列进行对比时,应尽量保持相同的格式。

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2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 15

投稿要求

图注

首次提交时,应将各图片说明同时放置在文本文件以及图

片文件中对应图片下方以便于审阅。

说明中提供足够的信息以便于理解图片,无需频繁参考正

文。但是,详细的试验方法说明请放在“材料与方法”部分,

请勿放在图片说明中。除非是某个实验所独有的方法,且在描

述简单(一两个句子)的情况下才能在图片说明中列出。在图

片中用到的符号和正文中没有出现的缩写,都应进行明确的

定义。

表格

若表格中包含图形、化学结构或底纹,则在修改阶段必须

按照符合要求的格式以插图形式提交。常规表格的首选格式是

Microsoft Word,但是也可接受 WordPerfect 和 Acrobat PDF。请

注意:目前不接受直接使用 Excel 文件制作的表格。必须先将

Excel 文件嵌入到 Word 或 WordPerfect 文档中,或先转换为

PDF,然后方可上传。

表格的格式要求如下。排列数据时,应将类似的材料排成

一列,从上往下而非从左向右读。栏目标题应当清楚明了,

从而无需参考正文即可理解数据的涵义。可参看“缩写”部分

(见下)规定的应在表格中使用的缩写。

可加入解释性的脚注,但不应使用过于详细的表格“说

明”。请勿在脚注中加入详细的实验说明。在信息量必须足够

大的情况下才能使用表格;若数据量少于六个,文字编辑会直

接将其合并到正文中。Table 1 就是一个很好的表格实例。

TABLE 1 Distribution of protein and ATPase in fractions of dialyzed membranesa

ATPase

U/mg ofMembrane Fraction protein Total U

Control Depleted membrane 0.036 2.3Concentrated supernatant 0.134 4.82

E1 treated Depleted membrane 0.034 1.98Concentrated supernatant 0.11 4.6

a Specific activities of ATPase of nondepleted membranes from control and treated bacteria were 0.21 and 0.20, respectively.

封页照片与图画

本刊会在封页上刊登照片与绘图。尽管在线版本才是本刊

的入库版本(见前文),但我们依然希望纸质版的封页能够呈

现理想的效果,因此要求彩色封页应使用 CMYK 颜色空间制

作。本刊会在将稿件退回作者处要求修改或接受稿件在 MCB

上刊发时对作者进行封页约稿;要求提交的材料与稿件中的内

容有关。作者主动提交的照片只会用在纸质版上(两份);若确

定选为封页,我们可能会通知作者提交数码文件。已提交的材

料不会退还给作者。只有在提交的材料被选中为封页后才通知

作者。材料入选后,其版权必须转移给 ASM。应在目录末尾

加一段对封页材料的简短说明。要获知封页稿件的技术要求,

或了解本刊对备选图画的意见,请联系本刊封面编辑 Roger J.

Davis ([email protected])。

系统命名

化学与生物化学命名

化合物名称的公认权威标准来自《美国化学文摘》(Chemi-

cal Abstracts, CAS:http://www.cas.org/) 及其索引。《默克索

引》第 15 版 (The Merck Index, RSC Books, Cambridge, United

Kingdom, 2013) 也是很好的资源。关于生物化学术语的用法

指南,可参阅《生物化学命名法及相关文档》(Biochemical No-

menclature and Related Documents, Portland Press, London, United

Kingdom, 1992),在以下网址提供:http://www.chem.qmul.ac.

uk/iupac/bibliog/white.html,也可参看《生物化学杂志》 (Jour-

nal of Biological Chemistry) 和《生物化学与生物物理学集刊》

(Archives of Biochemistry and Biophysics) 的投稿要求。

分子量属于无单位的比值,请勿使用道尔顿作为单位;只

有分子质量才能用道尔顿。

对于酶,请使用国际生物化学联合会 (International Union

of Biochemistry, IUB) 定名委员会 (Nomenclature Committee)

所规定的推荐(习惯)名称,详见:《酶命名法》(Enzyme

Nomenclature, Academic Press, Inc., New York, NY, 1992) 及其增补

文献:http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/。若采用非

推荐名,请在摘要和正文中首次出现时将其正式(习惯)名称

放在括号中。分配有国际系统分类编号 (EC number) 的则请使

用编号。若稿件属于酶学研究,请遵照 STRENDA Commission

所规定的标准,按要求充分说明实验条件并报告酶活性数据

(http://www.beilstein-institut.de/en/projects/strenda/guidelines)。

小鼠的命名

关于小鼠品系和基因的命名法,ASM 鼓励作者参照小鼠标

准化遗传命名国际委员会 (International Committee on Standard-

ized Genetic Nomenclature for Mice) 所提出的规范,可访问

Mouse Genome Informatics 主页:http://www.informatics.jax.org/,

另可参阅 Genetic Variants and Strains of the Laboratory Mouse

第 3 版 (M. F. Lyon et al., ed., Oxford University Press, Oxford,

England, 1996)。

Page 16: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

16 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

微生物系统命名

所有微生物一律用双名法,即名称由属名和种名构成(如

Escherichia coli)。可以单独使用属和属以上的名称,但不能单

用种名和亚种名。种名前面必须带属名,论文中首次出现时要

写全称。因此,在不与论文中其他属混淆的前提下,属名应使

用首字母缩写(如 E. coli)。所有细菌分类名称(界、门、纲、

目、科、属,种和亚种)都刊印为斜体,因此稿件中也应为斜

体;但菌株名称和编号则不需要。

关于细菌名称的拼写,请遵循 Approved Lists of Bacterial

Names (Amended) & Index of the Bacterial and Yeast Nomenclatural

Changes (V. B. D. Skerman et al., ed., American Society for Microbi-

ology, Washington, DC, 1989)和以下期刊所出版的验证表和通

告表:《国际系统与进化微生物学杂志》(International Journal

of Systematic and Evolutionary Microbiology, 原 formerly the Interna-

tional Journal of Systematic Bacteriology,1989 年 1 月起。此外,还

有两个万维网名录可提供目前已获公认的细菌名称:Prokaryotic

Nomenclature Up-to-Date (http://www.dsmz.de/bacterial-diversity/

prokaryotic-nomenclature-up-to-date.html) 和 List of Prokaryotic

Names with Standing in Nomenclature (http://www.bacterio.net/)。

由于真菌的分类还远未完善,因此对于给定的生物体,

应由作者负责确定合理的双名。可查找这些名称的资源有 The

Yeasts: a Taxonomic Study 第 5 版 (C. P. Kurtzman, J. W. Fell, T.

Boekhout ed., Elsevier Science, Amsterdam, Netherlands, 2011) 和

《真菌词典》第 10 版 (Dictionary of the Fungi, P. M. Kirk, P. F.

Cannon, D. W. Minter, and J. A. Stalpers, ed., CABI International,

Wallingford, Oxfordshire, United Kingdom, 2008);也可参见:

http://www.speciesfungorum.org/Names/Fundic.asp。

病毒的名称必须得到国际病毒分类委员会 (International

Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV) 的认可并进入 ICTV 的

Virus Taxonomy 网站报告 (http://www.ictvonline.org/index.asp)。

此外,一般还应遵守 ICTV 关于种名用法的建议:将整个种作

为一个他分类名一样采用斜体字,并将首字母和其他专有名词

大写(如Tobacco mosaic virus、Murray Valley encephalitis virus)。

类群实体 (taxonomic entity) 进行讨论时,种名应当和其讨论

单个病毒的行为或操作时,应使用俗名(如 tobacco mosaic

virus、Murray Valley encephalitis virus)。可在首次提到该名称

时,将其别名放在括号中插入。也可加上正式的科名和属名(

或类群名)。

微生物、病毒和质粒的命名必须为字母加序列号。一般建

议用处理工作者的姓名首字母或发现地、实验室等描述性的符

号进行命名。凡新型菌株、突变型菌株、分离或衍生的品系都

必须给出新的(序列号)名称。该名称必须能够与其他同一个

基因型和表型的命名相区分,也不能包含基因型和表型的

符号。

基因命名

为保障准确交流,应尽量使用标准的基因命名法,如需作

出调整或提出新的命名体系,则必须得到权威机构的认可支

持。若提交稿件中含有新的或非标准的命名,编辑或期刊部可

能会推迟审稿和/或刊发以进行必要的查阅检验。

原核生物。原核生物的遗传基因特性应按照表型和基因型

进行描述。表型用于描述某微生物上能够观察到的特性。基因

型则代表微生物的基因构成,一般通过与某种标准野生型进行

对比来描述。稿件中应遵守 Demerec 等的建议 (Genetics 54:61–

76, 1966) 和《细菌学杂志》 (Journal of Bacteriology) 在“投稿要

求”中的相关规定。下面是简要的说明。

(i) 若尚未对突变位点定位或作图,则必须用表型来命名。

也可用表型来表示基因的蛋白表达,如外膜蛋白 A (OmpA)。

表型的表示一般由三个字母组成;这些不用斜体,但首字母要

大写(如 Pol)。野生型特征可表示为加号上标 (Pol+);为了区

分,也可用负号上标 (Pol-) 表示变异特征。可用小写字母做上

标来进一步描述表型(如用 Strr 表示链霉素耐受性)。应对表

型命名进行定义。

(ii) 基因型的表示同样采用三字母符号。与表型名称不同

的是,基因型名称应写作斜体小写字母(如 ara his rps)。若有

多个基因座管理某些关联的功能,则在基因座符号后面用一个

斜体大写字母表示(如 araA araB araC)。因此表示突变位点

时,应该在基因座符号后面添加一串唯一的数字来表示(例如

ara-1 hisB5)。表示启动子、终止子和操纵基因的位点时,应

遵照 Bachmann 和 Low 的意见 (Microbiol Rev 44:1–56, 1980):例

如 lacZp、lacAt 和 lacZo。对于报告新变种株分离的论文,则必

须为变种给出等位基因数。埃希氏大肠杆菌 (Escherichia coli) 专

门的等位基因数登记中心为 E. coli Genetic Stock Center (http://

cgsc.biology.yale.edu/)。沙门氏菌属 (Salmonella) 的登记中心是

Salmonella Genetic Stock Centre (http://people.ucalgary.ca/~ke

sander)。

(iii) 野生型等位基因表示为加号上标 (ara+ his+)。突变基因

座并不用减号上标表示,所以我们一般有 ara 突变株但没

有 ara- 菌株。

(iv) 应避免使用上标表示基因型(表示野生型等位基因除

外)。指示琥珀型突变 (Am)、温敏型突变 (Ts)、组成型突变

(Con)、冷敏型突变 (Cs)、生成杂合蛋白 (Hyb) 的标记都应该跟

在等位基因数之后 [如 araA230(Am) hisD21(Ts)]。其他表型的表

Page 17: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 17

投稿要求

示法必须在首次出现时定义。如需使用上标,则必须得到编辑

的认可,并在首次出现时定义。

有两种情况可以使用下标。可以用下标来区分(同名)生

物体或菌株的基因,如用 hisE. coli

与 hisK-12

来分别表示大肠杆菌

(E. coli ) 与 K-12 菌株的 his 基因,使其区别于其他菌种或菌株中

的 his 基因。其他缩写也可使用,但应当加以解释。类似地,

还可用下标区分其他同名遗传因子。例如 gln 操纵子的启动子

可表示为 glnAp1 和 glnAp

2。

(v) 要避免用基因型作为名称(例如“用 leuC6 作转导”)。

若尚未进行株系划分,则请选择一个合适的语言搭配(例如“

另一种含有 leuC6 突变的 PA3092 或其他菌株”)。

Locus tags。Locus Tag 是 GenBank 数据库中为每个基因所

分配的系统化唯一识别符号。凡在稿件中出现的基因,必须保

证读者能够查询其序列,因此可在稿件中使用 Locus Tag 以确

认未定性的基因。此外,作者还应对照 GenBank 检查确定所用

Locus Tag 的格式正确并符合最新格式(如字母的大小写、下划

线的有无等)。不同微生物的 Locus Tag 格式也有差异,某些

微生物可能出现更新,因此拟定稿件时也必须根据 GenBank 进

行核对。

病毒。大部分情况下,病毒都没有表现型,因为它们在宿

主细胞之外并无代谢活动。因此也就无需区分表现型和基因

型。这里用上标表示杂合基因组。基因符号可为一、二、三个

字母。例如可将某种噬菌体基因 (lambda) 突变表示为 cI857 int2

red114 Aam11;这代表出现变异的基因是 cI、int 和 red,同时基

因 A 有琥珀型抑制基因 (am)。将宿主 DNA 插入到病毒内后,

应当用方括号表示,且插入 DNA 基因的命名应遵循宿主基因

组的命名规范。

真核生物。目前对于低等真核微生物的基因命名法尚未达

到与细菌和噬菌体相同的完备水平。一般应遵守目前在突变系

及其基因型鉴别中的规范。对于下文没有提及的生物体,建议

参考《微生物学手册》第 2 版 (Handbook of Microbiology, A. I.

Laskin and H. A. Lechevalier, ed., CRC Press, Boca Raton, FL, 1988)

或《遗传学手册·第一卷·细菌、噬菌体和真菌》(Handbook of

Genetics, vol. 1, Bacteria, Bacteriophages, and Fungi, R. C. King, ed,

Plenum Publishing Corp, New York, NY, 1974)。

只有在讨论源自不同微生物的同名基因时,才出于表述清

楚的需要而加上前缀,以便区分其来源属种(如 ScURA3 和

CaURA3);这里的前缀不属于基因正式名称的组成部分,因

而不用斜体。

网柄菌属 (Dictyostelium) 的基因命名法可参见:Trends in

Genetics “Genetic Nomenclature Guide”(p. S.5–S.6; Elsevier

Science Ltd., Cambridge, United Kingdom, 1998;已绝版)。最新

订正版可访问:http://dictybase.org/。

啤酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的基因名应始终用斜

体,且其野生型等位基因(或显性等位基因)应当大写(如

URA3)。功能弱化(亚效)或功能改变(新效)的等位基因

应始终用斜体小写字母(如 ura3D)。基因产物(即蛋白质)

的名称应为首字大写的罗马体(如 Ura3)。蛋白质的符号一般

不需要添加后缀“p”;但是在极少数情况下,可能为了避免

混淆,必须明确标示该符号代表蛋白质,此时需要添加后

缀“p”(如 Ura3p)。关于啤酒酵母 (S. cerevisiae) 基因名的最

新信息,请参考 Saccharomyces Genome Database (SGD):http://

www.yeastgenome.org/。关于啤酒酵母基因座和等位基因名称

的详细格式,可参见 SGD 的规定,也可参考 Cherry 的文章

(Trends Genet March:11–12, 1995),(可在 SGD 下载 PDF 版:

http://www.yeastgenome.org/sgdpub/Saccharomyces_cerevisiae.

pdf)。提交稿件中要求使用 SGD 所列 S. cerevisiae 标准基因

名,新的基因名应在 SGD 登记注册,时间不得迟于修改阶段。

粗糙脉孢菌 (Neurospora crassa) 的最新信息可参考 The

Neurospora Compendium: Chromosomal Loci (D. R. Perkins et al.,

Academic Press, San Diego, CA, 2001)。曲霉属 (Aspergillus) 真菌基

因的命名应遵守发表在 http://www.aspergillus.org.uk/indexhome.

htm?secure/sequence_info/nomenclature.htm 上的命名法,同时

还应搜索 Aspergillus Genome Database (http://www.aspgd.org/) 以

检查新的名称是否已被使用。在 1998 年出版的Trends in Genet-

ics “Genetic Nomenclature Guide”(Elsevier Science Ltd., Cam-

bridge, United Kingdom;已绝版)包含了几种真核微生物的命

名规则: Schizosaccharomyces pombe (p. S.7–S.9)、Chlamydomonas

reinhardtii (p. S.18–S.19)、Neurospora crassa (p. S.14–S.15) 和

Aspergillus nidulans (p. S.12–S.13)。此外,粟酒裂殖酵母还可查

阅网站 http://www.pombase.org/submit-data/gene-naming-guide

lines 和 http://www-bcf.usc.edu/~forsburg/plasmids.html;莱茵衣

藻 (C. reinhardtii) 也可访问 http://www.chlamy.org/nomenclature.

html。

对于锥体虫 (Trypanosoma) 和利什曼虫 (Leishmania),可参考

Clayton 等人的文章 (Mol Biochem Parasitol 97:221–224, 1998)。

关于白色念珠菌 (Candida albicans) 的最新信息,可参考

Candida Genome Database (CGD):http://www.candidagenome.

org/。关于白色念珠菌 (C. albicans) 基因命名法的详细格式,可

参考 http://www.candidagenome.org/Nomenclature.shtml。

Page 18: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

18 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org

投稿要求

C. albicans 标准基因名,新的基因名应在 CGD 登记注册,

时间不得迟于修改阶段。

果蝇 (Drosophila) 突变体和染色体畸变都应为斜体;不能包

含希腊字母、下标或空格。突变型的符号一般都是名称的简

写,并使用相同的第一个字母。显性和隐性突变分别使用大小

写的首字母表示(如 R 表示毛糙眼 (roughened),r 表示残翅

(rudimentary)。FlyBase (http://flybase.org/) 则是黑腹果蝇 (Dro-

sophila melanogaster) 基因命名法的权威。

WormBase (http://www.wormbase.org/#01-23-6) 是秀丽隐杆

线虫 (Caenorhabditis elegans) 基因命名法的权威。

区分“突变菌株 (mutant)” 与“突变 (mutation)”。请留

意突变(遗传物质原始序列的改变)与突变菌株(发生一种或

多种突变的菌株)之间的区别。我们可以“对突变作图”,但

无法“对突变菌株作图”。同理,突变菌株不存在“基因座”,

只有“表现型”。

区分“同源性 (homology)” 与“相似性 (similarity)”。欲

了解描述基因之间相互关系的正确术语,请参考Theissen (Na-

ture 415:741, 2002) 和 Fitch (Trends Genet 16:227–231, 2000) 的文

章。“同源性”表示几种基因的进化起源相同;不存在“部分

同源”这样的概念。讨论基因序列比对时,用“序列相似度”

(percent sequence similarity) 或“序列相同度”(percent sequence

identity) 更为妥当。

转座因子、质粒与限制性内切酶。转座因子(插入序列、

转座子和 Mu 噬菌体等)的命名法应遵循 Campbell 等人的建议

(Gene 5:197–206, 1979),以及《细菌学杂志》(Journal of Bacteri-

ology) 的修订版“投稿要求”。以下网址介绍了真细菌和古细菌

插入序列并记录新序列的网站是:https://www-is.biotoul.fr/。

关于在没有已知基因座的位点插入转座子(如 zef-123::

Tn5),其命名体系可参见 Chumley 等人的建议。(Genetics 91:

639–655, 1979)。在使用命名法时,请参考 Novick 等人 (Bacteriol

Rev 40:168–189, 1976) 关于质粒和受质粒控制的活动的建议和

Low (Bacteriol Rev 36:587–607, 1972) 关于 F 因子的建议,以及

Roberts 等(Nucleic Acids Res 31:1805–1812, 2003) 关于限制性内切

酶、DNA 甲基转移酶、归位内切酶及其基因的建议。体外重组

DNA 分子的命名法一般遵循插入序列的规定。

描述插入到重组 DNA 分子的DNA 时,应使用获取该段

DNA 的生物体所用的基因符号及规定。

缩写和惯例

动词时态

为了实现表述的清晰性,ASM 强烈建议作者在提到过去的

某个事件(包括实验过程、现象和实验数据)时使用过去时。

介绍您本人研究结论、前人的研究结论和一般公认的事实等,

则使用现在时。因此,“摘要”、“材料与方法”、“结果”

等部分基本使用过去时,而“前言”的大部分和“讨论”的一

部分则多使用现在时。

请注意:同一句话中完全可能出现时态改变的情况。例

如“White (30) demonstrated that XYZ cells grow at pH 6.8”、

“Figure 2 shows that ABC cells failed to grow at room tempera-

ture”和“Air was removed from the chamber and the mice died,

which proves that mice require air.”就都是正确的说法。在报告统

计结果和计算结果时,以下描述是正确的:“The values for

the ABC cells are statistically significant, indicating that the drug

inhibited. . . .”

关于科技写作中时态问题的深入探讨,请参阅 How To

Write and Publish a Scientific Paper(如何撰写和发表科技论文,

第 7 版)。

缩写词

一般规则。使用缩写词的原则是帮助读者阅读而非方便作

者写作,因此应限制其使用。除 IUPAC-IUB 所建议的缩写词

(《生物化学命名法及相关文档》(Biochemical Nomenclature

and Related Documents, 1992)之外,除非确有必要(如表格和图

片),否则尽量不使用缩写词。

若某个名称较长,一般首次使用之后都可以用代词或变通

的方式表达(如“该药”、“该基质”)。也可使用标准化

学符号、别名或符号(如“叶酸”、亚麻酸 Ala 和亮氨酸 Leu

等)。

缩写词首次出现时必须在括号中定义,如“cultures were

grown in Eagle minimal essential medium (MEM)”。若某个缩写

词在论文中出现的次数不到三次(含表格和图片说明),一般

应取消使用。

无需说明的情况。除国际单位制 (SI) 单位缩写词之外,其

他常见单位(如 bp、kb、Da)、元素符号以及以下所列都不

需要定义,不论是出现在标题、摘要、正文、图片说明还是表

格中。

Page 19: 投稿要求 - mcb.asm.orgmcb.asm.org/site/misc/CLMCBITA.pdf · 2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志 ... (Centers for单的连锁分析 ... ASM 的稿件中,应在签署好的授权书原件

2015 年 1 月,投稿要求 《分子与细胞生物学杂志》 mcb.asm.org 19

投稿要求

DNA(脱氧核糖核酸)

cDNA(互补 DNA)

RNA(核糖核酸)

cRNA(互补 RNA)

RNase(核糖核酸酶)

DNase(脱氧核糖核酸酶)

rRNA(核糖体 RNA)

mRNA(信使 RNA)

tRNA(转运 RNA)

AMP、ADP、ATP、dAMP、

ddATP、GTP 等

(分别对应几种磷酸腺苷

和其他核苷,必要时可添加

2′-、3′-、5′- 以作区分)

ATPase 和 dGTPase 等

(三磷酸腺苷酶和

鸟苷三磷酸酶等)

NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)

NAD+(被氧化的

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)

NADH(被还原的

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)

NADP(烟酰胺腺嘌呤

二核苷酸磷酸)

NADPH(被还原的

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)

NADP+(被氧化的

烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)

poly(A) 和 poly(dT) 等

(聚腺苷酸和聚脱氧胸苷酸等)

oligo(dT) 等(寡脱氧胸苷酸等)

UV(紫外线)

PFU(噬菌斑形成单位)

CFU(菌落形成单位)

MIC(最低抑菌浓度)

Tris [三(羟甲基)氨基甲烷]

DEAE(二乙氨乙基)

EDTA(乙二胺四乙酸)

EGTA(乙二醇双

(2-氨基乙基醚)四乙酸)

HEPES(羟乙基哌嗪乙硫磺酸)

PCR(聚合酶链式反应)

AIDS(获得性免疫缺陷综合症)

细胞系的缩写(如 HeLa)同样无需定义说明。

以下缩写无需定义即可在表格中使用:

amt(总量)

approx(约)

avg(平均)

concn(浓度)

diam(直径)

expt(实验)

exptl(实验的)

ht(高)

mo(月)

mol wt(分子量)

no.(编号)

prepn(制备)

SD(标准偏差)

SE(标准误差)

SEM(标准误差均值)

sp act(比活力)

sp gr(比重)

temp(温度)

tr(踪迹)

vol(体积)

vs(比)

wk(周)

wt(重量)

yr(年)

数字结果

长度、重量和体积应使用标准公制单位。在这些单位和摩

尔浓度单位前,请用前缀 m、μ,n 和 p 以分别表示 10-3、10-6,

10-9 和 10-12。同时还可使用前缀 k 表示 103。

请避免前缀合用(如 mμ、μμ)。请使用 μg/ml 或 μg/g 代

替容易混淆的 ppm。温度单位写法如下:37°C 或 324 K。

使用分数形式表示单位(如酶活性)时,分母位最好用整

数单位(如 g、min)而非分数单位或乘积单位(如 μg、10 min)。

例如“pmol/min”比“nmol/10 min”更好,“μmol/g”比

“nmol/μg”更好。同时建议用无歧义的形式(如指数计数

法),例如“μmolg-1 min-1”比“μmol/g/min”更可取。所有数

据都请选择合适的 SI 国际单位。

关于统计分析与报告中常见的错误以及相应的避免方法,

可参阅 Olsen 撰写的文章 (Infect Immun 71:6689–6692, 2003;

Infect Immun 82:916–920, 2014)。

关于病毒学实验中需要考虑的基本统计学问题,可参阅

Richardson 和 Overbaugh 的文章 (J Virol 79:669–676, 2005)。

同位素标记化合物

对于较为简单的分子,只需直接在化学式中添加同位素标

记(如 14CO2, 3H

2O, and H

235SO

4)。如果某种化合物在自然状态

下并不包含某种元素,则在其名称上附加同位素符号时不加括

号(如 32S-ATP),不属于具体化学名称的情况也不加括号(如

131I-标记的蛋白质、14C-氨基酸、3H-配体)。

若为具体化学物质,则引入的同位素符号应加方括号,并

直接放在名称中表示被标记体的部分之前。请注意结构符号和

标志放在同位素符号之前。下面是正确用法的示例:

[14C]尿素 [γ-32P]ATP

L-[甲基-14C]蛋氨酸 UDP-[U-14C]葡萄糖

[2,3-3H]丝氨酸 大肠杆菌 [32P]DNA

[α-14C]赖氨酸 果糖 1,6-[1-32P]二磷酸