Nyheter

Sök inyhetsarkivet

Senaste numret

e-tidning

Tidningsarkiv

Jobb & Karriär

Ledare

Krönika

Intervju

Kemimarknaden

Kalendarium

Marknadstorget

Redaktionen

Om tidningen

Prenumerera

Annonsera

Utgivningsplan

Ond Kemi -berättelser ommänniskor, mordoch molekyler

Läs recension avUlf Ellerviksomtalade bok

Den gränslösavetenskapen

Läs recensionenLadda nedkemibokenKöp kemiboken

Kjemi

Tools of science

Mask testar nya läkemedel

2012-04-25

Forskare vid bland annat Uppsala Universitet har utvecklat nyaautomatiserade bildanalysverktyg för att studera effekten av nyaläkemedel på infekterade C. elegans-maskar.

Den 1 millimeter långa masken C. elegans används av tusentals forskare runtom i världen för att studera komplexa biologiska processer.

Arbetet, som skett i samarbete med Broad Institute of Harvard & MIT,publiceras i tidskriften Nature Methods.

I dag testas många potentiella nya läkemedelsmolekyler på celler somhanteras av robotar. Cellerna odlas i storskaligt format och fotograferasgenom mikroskop, varefter effekten av läkemedlet analyseras med hjälp avdigital bildanalys.

METODEN ÄR BEGRÄNSAD eftersom många sjukdomar involverar komplexasystem av celler och organ, som inte kan studeras på cellnivå.

Masken C. elegans var först med att få sin arvsmassa kartlagd och insjuknar imånga av de infektionssjukdomar som drabbar människor.

Eftersom masken är så liten kan den hanteras med samma robotik somanvänds för celler, men det krävs nya bildanalysmetoder för att mäta effektenav läkemedel på maskar.

Carolina Wählby

”I PRINCIP använder vi samma robotik somför cellbaserade experiment, men testartusentals potentiella läkemedel på infekterademaskar”, kommenterar studiensförsteförfattare Carolina Wählby, forskare vidCentrum för Bildanalys och vid SciLifeLab,Uppsala universitet.

”Bildanalysen hjälper oss att hitta de maskarsom återhämtat sig från infektionen, och på såsätt kan vi identifiera de kemiska molekylersom är intressanta att studera noggrannarevid infektioner hos människan.”

Genom att testa potentiella läkemedel på organismnivå får man reda på omläkemedlet har önskad effekt, om det tas upp av organismen och om det ärtoxiskt.

”SJÄLVKLART är C. elegans en betydligt enklare organism än människan,men många grundläggande molekylära mekanismer har bevarats genomevolutionen, och med denna typ av storskaliga experiment kan vi hitta demolekyler som är mest intressanta att studera noggrannare”, förklararCarolina Wählby.

”Användning av mycket enkla modellorganismer som maskar gör att vi kansnabba upp processen och begränsa användandet av andra djurförsök.”

Uppsalaforskarna använder bland annat metoden för att leta efterbehandlingar mot multiresistenta stafylokocker.

BILDANALYSMETODERNA kan också användas för att mäta effekten avolika gener som stängs av med hjälp av RNA-interferens. Just nu studerasgener kopplade till fettmetabolism i samarbete med forskare vid HarvardMedical School.

”Automatiserad bildanalys kan mäta förändringar hos maskarna på ett robustoch reproducerbart sätt, och ett typiskt experiment resulterar i cirka 100 000

Våra Event

Läs mer om våra event

Jobb och karriär

PÅ NYTT JOBB

Brennan lämnarAstraZeneca

Håkan Englund till AroCell

Leif Johansson tillAstraZeneca

Välkommen tillKemivarldenbiotech.seHör av dig med tips, synpunkteroch frågor!

Boel Jönsson, Chefredaktörboel.j@mentoronline.se

SENASTE NUMRET

Nr 4 2012

Medlemstidning för SvenskaKemistsamfundet, SKR ochSwedenBIOPrenumerera

NYHETSBREV

Färska nyheter på mailen varjevecka, helt gratis!Beställ nyhetsbrevet!

KEMINS ÅR

Vetenskapliga stamträd -släkten är värst

INTERVJU

Länk mellan Sverige och Indien

MÅNADENS EXPERIMENT

Månadens experiment april

DEBATT

Exempel på lediga tjänsterhos Proffice Life Science;

Stability QA Manager, ProfficeLife Science, Södertälje

Apotekare, Proffice Life Science,Södertälje

Produktionstekniker, ProfficeLife Science, Malmö

Disputerad immunolog, ProfficeLife Science, Danmark

CMC Compliance Manager,Proffice Life Science, Uppsala

ÖVRIGA PLATSANNONSER

Astra Tech söker AnalyticalChemist

ABB söker Projektsäljare inomKemi-, Livs- &Läkemedelsindustrin

Analytisk kemist – FOI

Kemivarldenbiotech.se - Kemi, Bioteknik, Bioteknikföretag,... http://www.chemicalnet.se/iuware.aspx?pageid=792&ssoid=...

1 av 4 2012-05-02 08:17

bilder. Om någon skulle analysera bilderna för hand skulle det ta ungefär ettår, medan ett datorkluster kan göra det på några timmar.”

Bildanalysverktyget Worm Toolbox finns tillgängligt via projektet CellProfiler

Länk till abstract: An image analysis toolbox for high-throughput C. elegansassays

(chemicalnet.se)

Tipsa en vän

Annons:

Storspiggens sötvattentålighet kartläggsStorspiggens arvsmassa har nu kartlagts av en internationell forskargruppledd av forskare vid Uppsala universitet, Broad Institute och StanfordUniversitet i USA.

Groblad kan läka sår

En forskare på Sveriges Lantbruksuniversitet (SLU) visar i en ny avhandlingatt groblad har sårläkande egenskaper, vilket folktron har hävdat i hundratalsår.

Stress hos apatiska barn bevisadDebatten kring orsaken till varför flera barn till asylsökande i Sverige drabbatsav ett apatiskt tillstånd gick för några år sedan hög. Nu visar en studie frånUppsala universitet att stresshormonkoncentrationerna i blodprover från sjukabarn stämmer på sjukdomsbilden.

Biocid mot mygglarver tillåtsDet är ok för Naturvårdsverket att tillåta bekämpning av stickmygglarver medVectoBac G i de så kallade Natura 2000-områden i Dalälvensöversvämningsvåtmarker. Det beslutade regeringen den 26 april.

Majs blir lösningsmedelDet kinesiska polymerföretaget Shengquan Group och danska Novozymes haringått samarbetsavtal för att Shengquan ska kunna starta kommersielltillverkning av cellulosaetanol för lösningsmedelsproduktion.

Sensorer i membran kartläggsForskare vid Linköpings universitet har kartlagt hur spänningssensorer icellmembrans jonkanaler fungerar. Det kan leda till nya läkemedel motepilepsi och hjärtarytmi.

Brennan lämnar AstraZenecaAstraZenecas koncernchef David Brennan harbeslutat att avgå. Leif Johansson kommer attträda in som styrelseordförande redan 1 juni –tre månader tidigare än planerat – och ledaurvalsprocessen för en efterträdare.

Chemrec skriver Kina-avtal

"Jobba mer med molvolymer"(Longer version, in english)

EXTRA

Få nya läkemedelUtförligare version av "Därför blirdet så få nya läkemedel" av AlfClaesson

Nyheter från Processnet.se

KK4-haveriet lindrigare änbefarat

Outokumpu presenterarnya ledningsgruppen

Stor mineraljakt iBergslagen

SSAB tappade 10 000 tonpå haveriet

Kemivarldenbiotech.se - Kemi, Bioteknik, Bioteknikföretag,... http://www.chemicalnet.se/iuware.aspx?pageid=792&ssoid=...

2 av 4 2012-05-02 08:17

Chemrec skrev 24 april under ett samarbetsavtal med China TianchenEngineering Corporation, TCC, för att globalt erbjuda kompletta ochnyckelfärdiga anläggningar baserade på Chemrecs svartlutsförgasningsteknik.

Mask testar nya läkemedel

Forskare vid bland annat Uppsala Universitet har utvecklat nyaautomatiserade bildanalysverktyg för att studera effekten av nya läkemedelpå infekterade C. elegans-maskar.

Novo Nordisk samarbetar med OxfordI samarbete med Oxfords universitet ska det danska läkemedelsbolaget NovoNordisk identifiera nya biomarkörer och behandlingsmåltavlor för reumatoidartrit och andra autoimmuna inflammatoriska sjukdomar.

EU bannlyser fosfat i tvätt- och diskmedelÖvergödningen ska minska, och därför har EU klubbat igenom nya regler föratt begränsa fosfater i tvätt- och diskmedel.

Nya verktyg kan förklara amyloidbildningKemisten Magnus Sellstedt har identifierat småorganiska molekyler som påverkarhopklumpningen av amyloida proteiner(proteiner som kan bilda proteinfibrer).

KemI granskar bisfenol A-användningKemikalieinspektionen kommer att få i uppdrag av regeringen att kartläggaanvändningen av bisfenol A.

De kan få prestigefyllt prisAtlas Antibodies, Moberg Derma och Vitrolife är nominerade till åretsSwedenBio Award. Vinnaren utses den 24 maj.

Prioner slås ut med polymerer

Giftiga prioner i hjärnan kan oskadliggöras med självlysande polymerer, visarforskare vid Linköpings universitet.

AstraZeneca köper USA-bolagAstraZeneca förvärvar det amerikanska bioteknikbolaget Ardea Biosciencesför motsvarande 8,4 miljarder kronor, inklusive en läkemedelskandidat motgikt i klinisk fas III.

Ny Heck-variant kopplar ihop kol och kiselAmerikanska forskare har lyckats byta ut ett vinyliskt väte mot en kiselgrupp ien mild, palladiumkatalyserad reaktion. Professor och Heck-experten MatsLarhed kommenterar upptäckten.

Omgörning av Eka ChemicalsFärg- och kemikoncernen AkzoNobel omorganiserar affärsenheten EkaChemicals som byter namn till AkzoNobel Pulp and Performance Chemicals.Globalt kommer ett hundratal tjänster att försvinna. I Bohus pågår fackligaförhandlingar.

Bröstcancer tio olika sjukdomarEn ”molekylär karta” kan dela in bröstcancer i tio olika subtyper. Det visar denhittills största globala bröstcancerstudien som undersökt genetiska faktorer.

Kemivarldenbiotech.se - Kemi, Bioteknik, Bioteknikföretag,... http://www.chemicalnet.se/iuware.aspx?pageid=792&ssoid=...

3 av 4 2012-05-02 08:17

Kemivarldenbiotech.se - Kemi, Bioteknik, Bioteknikföretag,... http://www.chemicalnet.se/iuware.aspx?pageid=792&ssoid=...

4 av 4 2012-05-02 08:17