Upload
ivan-rogachev
View
258
Download
4
Embed Size (px)
DESCRIPTION
Филогенетични връзки и генетично разнообразие на някои местни (отечествени) породи кучета
Citation preview
() ( )
. , , , . , , . ( , ) , , , . , , . ; , - , , . , . , .
. , , .
:1. ;2. ()
1
;3. ;4 , , , , .
. , ( , , ) , . . , . , , .
. , , , .
. : (, 2007.) (, 2006.) (, 2007.) 40 - .. (, 2006.)6 (, 2007.)10 50 (, 2006.)3 (, 2002.)
. 8 .
2
. 117 : , , , , , ( 44 169 ) . 16 13 ( ), 3 4 (). . , , . : ; ; ; , ; . (Vila et al., 1997, Savolainen et al., 2002, van Ash et al., 2005), . , GenBank, , .( 1.) - , GenBank; , (Savolainen et al., 2002).
3
. . PCR , . PCR ABI-Prism 3100-Avant (Applied Biosystems, USA). , , .(GenBank accession number NC_002008) , , GenBank, BLAST( NCBI, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST )
, , , (AMOVA)
4
rlequin v.3.0 (Excoffier et al., 2005). () TCS v.1.21 (Clement et al., 2002). , - A, B, C, D, E (Savolainen et al., 2002), , - ( ) . (neighbor-joining) Mega v.2.1 (Kumar et al., 2001,) UPGMA Phylip 3.65 (Felsenstein, 2004). FST (Fixation index), ( -) 6.0 (StatSoft, 2001). 321 , 15459-15779 (GenBank accession number NC_002008). GenBank : DQ403817, DQ403818, DQ403819, DQ403820, DQ403821, DQ403822, DQ403823, DQ403824, DQ403825, FJ392757, FJ392758, FJ392759, FJ392760, FJ392761.
1. (S = 48) .RH . , , ( ) , (Savolainen et
5
al.,2002), . 321 28 .( 1.) 14 , , . 7 , D, 2 , C . , (la5) , , . la5 GenBank, , , Canis, .
( ), , ( ) . (Posada & Crandal, 2001).
, (Savolainen et al.,2002). 2.
(Savolainen et al., 2002). .
, , , . , , .
D RH 24, . , D, , RH 26.
6
2 , . , (Savolainen et al. 2002). , . RH . , , - , , (Savolainen et al., 2002) , . , , , 2. , ( ) E/W, . , D, , .
2 - , , .
7
1. ;2. , (van Ash et al., 2005). 321 .3. , (Savolainen et al., 2002). 321 . D .
RH 24 (.2), , , D. 27 11=12=13=14=54, ( /, ). D 5, D, RH 24 .
RH 26, , D RH 24 .
, ( ) D , .
D 6, , D 5. , , D1, D2, D3, D4, . D 5,
8
, , D 6 . D 6, (van Asch et al., 2005) , , .. . , D 5, D 6 D, .
, , D.
(. 2.), D . RH 24, , , . D .
D .
( ) , , W . (RH 2, RH 14), . . 1, . 1 . , , , 29, (Savolainen et al., 2004) (Savolainen et al., 2002) (, , ), . , , , , W .
FST (Fixation index) - FST ( 3.) FST = 0.00 : . FST = 0.08 , ,
9
. , , , , , , .
3. FST . , p>0.05.
.1. .2. , (van Asch et al., 2005). 321 .3. , (Savolainen et al., 2002). 321 .
.
/ , , (-
10
). , , . , , (UPGMA) . (.3.)
, , , , , , .
. /: , : , . : , . , ( ), , .
3. , , UPGMA , . , , . , . , , . , ,
11
, , . , , , , : (.4) FST (. 5)
4. . , .
(): 1. , 2. , 3. , 4. -, 5. , 6. , 7. (, ), 8. , 9. , 10. , 11. , 12.
FST, () , 70 % , 21 %. , , / , , , , . ( ( . 3 4), FST (. 5).
12
5. , FST.(): 1. , 2. , 3. , 4. -, 5. , 6. , 7. (, ), 8. , 9. , 10. , 11. , 12.
, , , .
(AMOVA), , ( ) . , , , . (1. , , 2. , 3. , 4. ) , . , . ( ) ,
13
. . , 75 85 % .
, , , , . , , , , . ( .3 .3, ( D 6 ) ), (Pereire et al., 2006), , , . , , , . , , , ( ) , - .
. /, ( 4): (S) ; (/L) ; () ; (H).
14
4 ..1. ;2. , (van Ash et al., 2005). 321 ;3. , (Savolainen et al., 2002). 321 4 , , , , . , , , . () . , /. , ,
15
, . , , () , , , . , , - . , , , , ( - ).
.
1. , (, ) .
2. , , , .
3. ( ) , .
4. , , .
5. .
6. , D . D, .
16