王世鑫 武警医学院科研部

武警医学院蛋白质组学实验室

医学科研思维方法医学科研思维方法

第一节 医学科研的思维方法第一节 医学科研的思维方法一、白色、黑色和灰色系统与医学研究（一）客观世界划分为白色、黑色和灰色系统 系统论、信息论和控制论自从上世纪诞生以来，很快成为人们认识复杂客观世界新的哲学思想和方法体系。白色、黑色和灰色系统三个系统的划分，为科学研究从总体思维上廓清了大环境，为探索繁杂艰难的医学问题提出了一个可共选择的思维格局，便于根据问题的系统性状，来选择合理有效的研究技术和方法。从宏观上为医学科学研究建立了一个科学思维的框架。

1 、白色系统 系统的组成、结构、功能和机制四个因素的信息都完全清楚的系统称为白色系统。如一台 CT 他的全部组成成分、内在结构、所具有的功能及操作运行机制都是完全清楚的。 白色系统是明朗的，过程是确切的。以往我们熟悉的科学研究大多属于白色系统问题。

22 、黑色系统、黑色系统 系统的组成、结构、功能和机制四个因素的信息所知甚微的系统，称之。比如：人的大脑神经系统的思维活动、生物遗传系统、生长发育的基因调控等。由于黑色系统问题认识很少，就决定了对黑色系统类问题研究的探索性，研究过程的复杂性和研究结果的不确切性。甚至表现出一定的被动性和盲目性。

33 、灰色系统、灰色系统系统的组成、结构、功能和机制等方面的信息都

有部分把握的系统，称之。是介于白色与黑色之间的一类系统。比如人体生命过程，已了解了大体组成结构，基本生理功能及部分起支配作用的原理，然而，还有许多未知问题。如大脑、衰老、癌症等过程。

（二）白色、黑色和灰色系统间的相互关系

从黑色系统到灰色系统，再到白色系统，不仅仅只是一种划分客观世界的思维框架，而且反映了人们认识客观事物研究认识层次的深化。

灰色系统

黑色系统

白色系统 科学研究

白色、黑色和灰色系统间的相互关系

（三）统计学是进出白色和和黑色系统的钥匙统计学是应用数学的一个分支，不仅可研究白色系统问题，更为重要的是，它能协助分析处理属于黑色系统领域的问题。 黑色系统里的问题往往很难得到确切的结论，而统计学恰恰可以帮助对这种“不确定性”做出定量推测性结论。

白色系统类问题

灰色系统类问题

黑色系统类问题

一 般 数 理 化技术与方法

模 糊 数 学 技术与方法

统 计 学 技 术与方法

专业知识技术与方法

图 研究不同系统类问题所需的知识技术结构

二、整体、系统的思维方式 系统生物学根据胡德的定义，系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分（基因、 mRNA 、蛋白质等）的构成，以及在特定条件下这些组分间的相互关系的学科。 也就是说，系统生物学不同于以往的实验生物学——仅关心个别的基因和蛋白质，它要研究所有的基因、所有的蛋白质、组分间的所有相互关系。系统生物学是以整体性研究为特征的一种大科学。

系统生物学系统生物学————全球发展热点全球发展热点 美国能源部 2002 年启动了 21 世纪系统生物学技术平台 麻省理工学院和哈佛大学成立了系统生物学研究机构 中国科学院生命科学研究所与上海交大于 2003 年联合成立了上海系统生物学研究所 德国、日本、韩国、新加坡、菲律宾等国成立了系统生物学研究机构

系统生物学将是 21 世纪医学和生物学的核心驱动力。Leroy Hood ，人类基因组计划的发起人之一

世界上第一个系统生物学研究所Institute for Systems Biology

founded by Leroy Hood in 1999

系统生物学的灵魂就是整合性思维方法，是指研究思路和方法的整合。和以往科学研究的区别：— 经典的分子生物学研究是一种垂直型的研究。 即采用多种手段研究个别的基因和蛋白质。首先是在 DNA 水平上寻找特定的基因，然后通过基因突变、基因剔除等手段研究基因的功能；在基因研究的基础上，研究蛋白质的空间结构，蛋白质的修饰以及蛋白质间的相互作用等等。— 基因组学、蛋白质组学和其他各种“组学”则是水平型研究。 即以单一的手段同时研究成千上万个基因或蛋白质。

系统生物学系统生物学————整合性整合性的研究方法的研究方法

模型 模拟 预测 数据 实 验

比 较建立 / 修改模型

生物学知识

生物系统

系统生物学的思维特点，则是要把水平型研究和垂直型研究整合起来，成为一种“三维”的研究。 此外，系统生物学还是典型的多学科交叉研究，它需要生命科学、信息科学、数学、计算机科学等各种学科的共同参与。系统生物学研究所的第一篇研究论文，就是整合酵母的基因组分析和蛋白质组分析，研究酵母的代谢网络。

VEGF protein is secreted outside the cells and binds to its

receptor on the endothelial cells to promote their growth.

第二节 医学科研选题与创新第二节 医学科研选题与创新

一、创新的意义 创新是一个民族发展的灵魂，是科学研究的生命线，研究内容上的创新性是科研选题得以成立的根本条件。

科学创新有三个层面的涵义：原始性创新；集成性创新；引进、消化型创新。 衡量课题的先进性，主要考核它的创新性如何。

二、创新度评价（理论） 科技成果的创新度往往与其科研成果发表前论文检索的重复率和发表后论文检索的引用率具有一定的相关性。这种相关性主要表现为论文检索的重复率越大，其创新性越小，重复性越小，其创新性越大；论文检索的引用率越大，其创新性越大，引用率越小，其创新性越小。

从科学计量学上，科技成果论文检索的重复率曲线 (D)和论文检索的引用率曲线(S) 之间在坐标系里必然存在一个均衡点。我们可以根据这个均衡点和均衡状态评价科技成果创新的程度。

创新度（ P ） 创新度（ P ）

创新度（ P ）

DS

E

DS

科技成果数（ Q ）QeO

Pe

P1

P2

Q2 Q1 Q3Q4

第一种情形是：当科技创新度为 P1 时，科技成果的引用数为 Q1 ，而科技成果的重复数为 Q2 ，形成科技成果引用率大于科技成果重复率。即 OQ1>OQ2 。科技创新度高。第二种情形是：当科技创新度为 P2 时，科技成果的重复数为 Q3 ，而科技成果的引用数为 Q4 ，形成科技成果重复率大于科技成果引用率。即 OQ3>OQ4 。科技创新度低。

科技创新的一般均衡曲线和均衡科技创新度的形成示意图

根据以上科技创新的一般均衡曲线可以看出以下几种情况： (1) 从一般均衡曲线上可以看到， E点以上部位的科研成果，由于其重复率小、引用率大，因此，其科技创新性就强，科技成果价值就大。反之，在 E点以下，其创新性就弱，科技价值就小。 (2)当某项科研成果其重复率为零时，其科技成果引用率即反映出其创新程度；当其引用率为零时，其重复率即反映出其创新程度。 (3)当某项科技成果的重复率和引用率都为零时，表明此项科技成果的创新度为零。 (4)衡量科技成果创新度（科技价值）的大小既取决于其科技成果重复率大小，也取决于其科技成果引用率大小。重复率和引用率可以看成是科技研究领域非常重要的两种基本力量，它们之间的相互作用决定了科技成果创新性的大小。

创新人才；创新环境和平台；创新制度；创新思维与学科交叉。

三、科研创新的来源

第三节 临床蛋白质组学第三节 临床蛋白质组学

人类基因组计划

国际大合作：英、美、法、日、德、中主要包括基因定位和全序列测序 遗传图、物理图、全序列

Dulbecco 于 1986 年提出1990 年由美国能源部和国立卫生院启动。

Many GenomeMany Genome

The public project estimates that there are 31000 protein-encoding gene, whereas Celera finds –26000, with many more still to be found.

6000 for a yeast 13000 for a fly 18000 for a worm 26000 for a plant

(Genomes Online Database)

ProteomeProteome

“The total PROTEin composition of a genOME.”

M. Wilkins et al. Electrophoresis 1995, 16, 1090-1094

Proteome describes the complete set of proteins that is expressed, and modified following expression, by the entire genome in the lifetime of a cell.

It describes the composition of proteins expressed by a cell at any one time.

Proteomes are dynamic!!!!!!

mRNA ExpressionProtein ExpressionDuodenum smooth muscleDuodenum smooth muscle

Brain hippocampusBrain hippocampus

Blood vessel basal arteryBlood vessel basal artery

Lung 3 bronchusLung 3 bronchus

Brain substantia nigriaBrain substantia nigria

Cell line HeK293Cell line HeK293

Brain caudate putamenBrain caudate putamen

Kidney renal cortexKidney renal cortex

Lung 4 bronchusLung 4 bronchus

Stomach body smooth muscleStomach body smooth muscle

Umbilical cord wholeUmbilical cord whole

Ceacum smooth muscleCeacum smooth muscle

Tonsil (lymph node)Tonsil (lymph node)

Cell line 132N1Cell line 132N1

Brain amygdalaBrain amygdala

Ileum mucosaIleum mucosa

Pituitary gland wholePituitary gland whole

Brain cerebellumBrain cerebellum

Lung parenchymaLung parenchyma

Brain frontal cortexBrain frontal cortex

ForeskinForeskin

Stomach antrum smooth muscleStomach antrum smooth muscle

Jejunum mucosaJejunum mucosa

Pancreas wholePancreas whole

Colon mucosaColon mucosa

Bladder fundus outer wallBladder fundus outer wall

Lung whole Lung whole

Oesphagus mucosaOesphagus mucosa

Stomach fundus smooth muscleStomach fundus smooth muscle

Brain putamenBrain putamen

Brain medulla oblongataBrain medulla oblongata

Ileum adiposeIleum adipose Thyroid glandThyroid gland

Placenta wholePlacenta whole

Oesphagus smooth muscleOesphagus smooth muscle

Ileum smooth muscleIleum smooth muscle

Kidney pelvisKidney pelvis

Liver anterior right lobeLiver anterior right lobe

Blood vessel pulmonary arteryBlood vessel pulmonary artery

Colon taeni coliColon taeni coli

Uterus myometrium (myometrial)Uterus myometrium (myometrial)

Blood vessel cerebral arteryBlood vessel cerebral artery

Lung 2 bronchusLung 2 bronchus

Lung trachae wholeLung trachae whole

Stomach fundus mucosaStomach fundus mucosa

Stomach body mucosaStomach body mucosa

Heart pericardiumHeart pericardium

Ceacum mucosaCeacum mucosa

Spleen wholeSpleen whole

Gall bladder wholeGall bladder whole

Brain hypothalamusBrain hypothalamus

Brain caudateBrain caudate

Aorta wholeAorta whole

Bladder trigoneBladder trigone

Testes wholeTestes whole

Colon smooth muscleColon smooth muscle

Brain superior frontal gyrusBrain superior frontal gyrus

Brain striatumBrain striatum

Lung 1 bronchusLung 1 bronchus

Kidney renal medullaKidney renal medulla

Skeletal muscleSkeletal muscle

Brain choroid plexusBrain choroid plexus

Kidney ureterKidney ureter

Duodenum mucosaDuodenum mucosa

5

4

0

1

3

2

Differential ExpressionDifferential Expression at at Differential temperatureDifferential temperature

A B

E. Coli grown at 30º C E. Coli grown at 42º C

ProteomicsProteomics

Proteomics is the study of

protein properties on a

large scale to obtain a

global, integrated view of

disease processes, cellular

processes and networks at

the protein level.Cytoplasmic proteins

蛋白质组学包括：蛋白质组学包括：

表达蛋白质组学 功能蛋白质组学

结构蛋白质组学

P07155 P07155

Y43753Y43753

A BkDa

25

5.55.5 pI

Structural Genomics DNA

Functional Genomics RNA

Structural Proteomics PROTEIN

Functional Proteomics PROTEIN

SequencingMappingDNA ArraysBioinformatics

Gene ExpressionDNA ArraysTransgenesis

2-D GelsMass SpecProtein ChipsBioinfomatics

Protein ChipsYeast 2-HybridTransgenics3-D StructureBioinformatics

Genomics and Proteomics

VEGF protein is secreted outside the cells and binds to its

receptor on the endothelial cells to promote their growth.

一条是力图“查清”人类大约 3万到 4万多基因编码的所有蛋白质，建立蛋白质组数据库，即组成蛋白质组学；另一条途径，则是着重于寻找和筛选引起 2 个样本之间的差异蛋白质谱，揭示细胞生理和病理状态的进程与本质，以及细胞调控机制，同时获得对某些关键蛋白的定性和功能分析，即比较蛋白质组学研究。

蛋白质组学研究途径

这是一种针对有基因组或转录组数据库的生物体或组织、细胞，建立其蛋白质或亚蛋白质组 (或蛋白质表达谱 ) 及其蛋白质组连锁群的一种全景式的蛋白组学研究，从而获得对生命活动的全景式认识。 但目前在短时间内建立人类蛋白质组学“完整的”数据库和实现网络资源共享的条件尚未成熟。

组成蛋白质组学研究 ( 结构蛋白质组学 )

虽然在微生物中，基因组、转录组基础上的蛋白质全谱研究已有成功报道，但在高等生物尤其是哺乳动物中未见报道，人类组织或细胞的蛋白质组全谱刚刚起步 (肝 ) 。开展筛选特定情况 (疾病 )下的蛋白质组中特殊标志蛋白与关键蛋白的研究 (差异蛋白质组学 ) ，迅速推广应用，是一种更符合中国国情的切实可行的研究途径。

比较蛋白质组学研究比较蛋白质组学研究 ((差异蛋白差异蛋白组学、功能蛋白质组学组学、功能蛋白质组学 ))

以生命过程或人类重大疾病为对象，进行重要生理、病理过程的比较蛋白质组学研究，是比较蛋白质组学研究的核心。

正常对照组 矽尘暴露 (0) 组 可疑矽肺 (0+) 组 一期矽肺 (I) 组

补体 C4

富含亮氨酸的 α-2糖蛋白

α-1抗胰蛋白酶

α-1抗胰蛋白酶

图 3 可疑矽肺（ 0+ ）组血清中表达有显著差异的蛋白质

转铁蛋白

可以说差异蛋白质组学是功能蛋白质组学研究的一部分，通过参与不同生理病理过程蛋白质种类和数量的比较，寻找重要生理过程中的关键蛋白和导致疾病发生的标志性蛋白的这类研究，现在正获得国内外临床蛋白质组学研究者日益增多的关注。 Diseased

Healthy

临床蛋白质组学 (clinical proteomics)(clinical proteomics)

蛋白质组学的研究已涉及到临床的各个方面： 1.诊断：如疾病筛查、疾病分期分型等。生物标志物 (biomarker) 。对于在特定疾病中的特定蛋白质的深入研究，为疾病的病因、

发病机制，疾病临床分期分型提供了分子基础。 2. 指导治疗：如病程分析、用药、手术时机的选择等。 　 3. 提供药物开发的临床依据：如确定药物靶点、新药开发等。 　 4.预后判断：根据生物标志物在不同疾病中的变化，判断疾病性质和严重程

度等。

临床蛋白质组学研究技术简介

临床蛋白质组学（生物标志物发现）经典技术方案生物样品 ( 组织、体液、细胞、细菌或病毒等 )

2

cICAT(Duplex Samples)与iTRAQ(Multiplex Samples)生物标志物的发现 (BioMarker)

2-D 胶

染色图象分析酶解

肽 混 合 物

4800

MADI-TOF-TOF

肽碎片序列测定 (MSMS)肽质量指纹谱 (PMF)

蛋白质信息学 /数据库检索Bioinformatics

样本预处理总蛋白酶解混合物

蛋白质鉴定PROTEIN ID

Biomarkers 功能研究

蛋白质翻译后修饰鉴定

A

蛋白质研究关键技术产 品

Products

结构研究 /

细胞筛选cDNA克隆 /重组表达 /

药物设计 /

疾病诊断等

Nano-HPLC

BC

(( 一一 )) 蛋白质指纹技术（蛋白质指纹技术（ SELDI-TOF/SELDI-TOF/MSMS））

疾病早期预警新里程碑

化学表面 – 蛋白质表达剖析 :

(反相疏水 ) (阴离子 ) (金属离子 ) (正相亲水 )(阳离子 )

蛋白芯片表面介绍蛋白芯片表面介绍

(PS-1 or PS-2)

( – 抗体 抗原 ) (受体 - 配体 ) (DNA – 蛋白质 )

生物表面 – 蛋白质相互作用检测 :

化学表面芯片的蛋白质剖析过程化学表面芯片的蛋白质剖析过程

OrganicOrganic

DetergentDetergent

SaltSalt

Water

Water

pHpHUreaUreaCHAPSCHAPSIm

idazolIm

idazol

洗脱条件洗脱条件Wash Wash

ConditionsConditions

芯片表面

类型

芯片表面

类型 Su

rface

Typ

eSu

rface

Typ

e

飞行质谱检测飞行质谱检测Measured m/zMeasured m/z

2500 5000 7500 100000

20

40

60

5807.5

((二二 ))液体芯片技术路线简图液体芯片技术路线简图

1. 血清总蛋白差异蛋白组分析

3. 血清低分子量蛋白蛋白组分析

2. 血清糖蛋白差异蛋白组分析血清蛋白组学分析

血清蛋白组学分析策略

((三三 )) 基于双向电泳的血清蛋白质组学研基于双向电泳的血清蛋白质组学研究究血清

样品处理

切点酶解

MS 图谱结果鉴定

二维电泳

MALDI TOF/TOF 鉴定

Western Blotting 验证 Real time PCR 验证

生物信息学分析

血清样品处理

ESI MS/MS 鉴定

数据分析及差异点切割

成功否

进一步的功能实验及药物靶标的分析

成功

技术路线技术路线

( 四 ) 悬浮芯片及临床应用

悬浮芯片技术悬浮芯片技术 ((SATSAT))

由 100 种不同颜色标记的一系列微球体（ xMAP 技术）组成，每个微球体可偶联一个对应的不同靶分子特异反应物。

能同时对在不同基质包括细胞培养悬浮液、血清和血浆中的细胞因子、生长因子等进行定量测试。

大多数试验，每次仅需 12µL 的样本量。

xMAPxMAP 的标记的标记 抗体共价结合在微球表面 每个小球通常结合几千个抗体 也可以是探针、抗原、酶、核酸、糖蛋白、其它配体等

悬浮芯片技术原理

xMAPxMAP混合混合

多种微球对应多种目标分子

反应原理反应原理 混合好的微球与样品反应 样品中的目标分子（抗原）与微球上的第一抗体结合

加入生物素标记的检测抗体 用第二抗体检测可

以增加特异性 二抗标记有生物素，

可以方便的加上荧光分子

fluorescent tagfluorescent tag是为了方便定量

DATA!DATA!DATA!DATA!

Ex1

Ex2

Em1

Em3

Em2

DD • Read 100 each color bead in assay• 1 - 100 bead sets avail.

悬浮芯片检测过程图示

技术特点技术特点 线性范围： 可调（ 1.95 ~32000pg或 0.2~3200pg ）

检测效率：35min/96孔板 20s 完成一个样品的 100 种指标的检测。

悬浮芯片的应用悬浮芯片的应用临床辅助诊断药物筛选中低密度基因、蛋白多项目检测生理学病理学药理学研究

二、开展项目

（一）（一） CytokinesCytokines

IL-1α IL-1ß IL-1ra

IL-2 IL-2Rα

IL-3 IL-4 IL-5

IL-6 IL-7

IL-8 IL-9

IL-10 IL-12(p40) IL-12(p70) IL-13

IL-15 IL-16

IL-17 IL-18 Basic FGF

G-CSFGM-CSFGRO- αHGFICAM-1IFN- α2IFN-γIP-10LIFMCP-1(MCAF)MCP-3M-CSFMIFMIGMIP-1αMIP-1ββ–NGFPDGF-BBCTACKEotaxin

RANTESSCFSCGF- βSDF-1αTNF- αTNF- βTRAILVCAM-1VEGF

Human(50Human(50 ））

小鼠（ 32 ）IL-1α Basic FCF TNF-α IL-1β Eotaxin VEGFIL-2 G-CSFIL-3 GM-CSFIL-4 IFN- γIL-5 KCIL-6 LIFIL-9 MCP-1(MCAF)IL-10 M-CSFIL-12(p40) MIGIL-12(p70) MIP-1αIL-13 MIP-1βIL-15 MIP-2IL-17 PDGF-BBIL-18 RANTES

大鼠（ 9 ）IL-1α

IL-1β

IL-2

IL-4

IL-6

IL-10

GM-CSF

IFN-γ

TNF-α

（二）（二） BiomarkerBiomarker

多肿瘤标志物联合检测多肿瘤标志物联合检测 艾芯 TM （肿瘤全套 9项）AFP&CEA双检液芯（常规体检 2项）肺芯 TM （肺癌 4项）消芯 TM （消化肿瘤 5项）妇芯 TM （妇科肿瘤 5项）PSA双检液芯（前列腺癌 2项）

（三）磷酸化蛋白和总靶蛋白（人、鼠、猴）（三）磷酸化蛋白和总靶蛋白（人、鼠、猴）磷酸化蛋白（ 26 ）Akt(Ser473) JNK (Thr183/Tyr185)ATF-2(Thr71) MEK1 (Ser271/Ser221)c-Jun(Ser63) NK-κBp65(Ser536 )CREB (Ser133) p38 MAPK(Thr180/Tyr182)EGFR(Tyr) p53 (Ser15)ERK1(Thr202/Tyr204) p70 S6 kinase(Thr421/ Ser424)ERK2(Thr185/Tyr187) p90 RSK(Thr359/ Ser363)ERK1/2(Thr202/Tyr204, Thr185/Tyr187) PDGF receptor-β(Tyr751)GSK-3α/β(Ser21/Ser9) S6 ribosomal protein (Ser235/Ser236) Histone H3(Ser10) STAT2 (Tyr689)HSP27 (Ser78) STAT3 (Tyr705)IκB-α (Ser32/Ser36) STAT6 (Tyr641)IRS-1 (Ser636/Ser639) TrkA (Tyr496)

总靶蛋白（ 12 ）Akt(Ser473) HSP27 (Ser78)

ATF-2(Thr71) IκB-α (Ser32/Ser36)

c-Jun(Ser63) JNK (Thr183/Tyr185)

CREB (Ser133) MEK1 (Ser271/Ser221)

ERK2(Thr185/Tyr187) p38

MAPK(Thr180/Tyr182)

ERK1/2(Thr202/Tyr204, Thr185/Tyr187) p90 RSK(Thr359/ Ser363)

mLpgsx /66.12545.162

我们建立的部分血清细胞因子正常参考值IL-8

IL-10

IL-6

4.75±2.54pg/mL

0.29±0.07 pg/mL

武警医学院临床蛋白质组学研究平台武警医学院临床蛋白质组学研究平台 (ProteomeWorks (ProteomeWorks SystemSystem))

Part I样品制备区Sample Preparation公用实验区Public Instruments

Prep 491分子量分离系统( 分子量不同将蛋白分开）

Part IV自动蛋白切取及质谱接入Spot Cutter&Mass 公用实验区Public Instrument

EXQuest Spot Cutter with Fluorescent蛋白自动切取系统（带荧光）

Mass Import 质谱接入Bio-Plex悬浮蛋白芯片鉴定系统

Part III成像分析区Imaging Analysis公用实验区

Public Instruments

ChemiDoc XRS荧光化学发光成像系统

生物信息学工作站Worksbase Bioinformatics Workstation

消耗品供应 Consumable Supply

IEF(一维等电聚焦系统） +Mini P 3

+PROTEAN II XL( 二维凝胶电泳系统 2 块胶）

+ PROTEAN II Dodeca Cell(12块胶系统）高通量工作DodecaStainer全自动染色仪

Part II双向电泳区2D Electrophoresis

PDQuest二维分析数据库软件

王世鑫，男，学历： Ph. D. 职称：教授。享受政府特殊津贴和军队一类岗位津贴。博士、硕士导师。指导研究生 30 人，主编和参编学术专著 8 部，发表学术论文 120余篇 ,SCI收录 8 篇。

研究方向 :1 、武警军事职业危害因素防治。 2 、器官纤维化的蛋白组学。 学术兼职：1 ．国家自然科学基金委评审专家库成员2 ．天津市科委评审专家库成员3 ．天津市劳动卫生职业病学会 副主任委员3 ．中华预防医学杂志编委会委员4 ．中国实用内科学杂志编委会委员5 ．武警医学杂志编委会委员6 ．武警医学院学报编委会委员7 ．武警部队科委会委员

承担的主要科研项目 矽尘暴露人群血清相关效应蛋白及其变化时间窗研究（项目负责人）， 2007 年国家自然科学基金面上项目，编号： 30771788, 资助经费 32万元。 矽肺早期诊断（筛检）生物标志物研究（项目负责人）， 2006 年天津市卫生局科技攻关项目， 资助经费 20万元。 矽肺早期诊断（筛检）生物标志物研究， 2006 年天津市卫生局科技攻关项目， 资助经费 20万元。

手掌参对染矽尘大鼠肺组织Ⅰ、Ⅲ型胶原的影响及其抗氧化机制的研究 2006 年国家自然科学基金项目，项目负责人， 26万元

SARS康复人员基因多态性及蛋白质指纹图谱研究， 2005 年天津市科委重大攻关重点项目 ，课题负责人， 30万元。

SARS暴发流行后医院内感染危险因素及疫源地血清流行病学研究 , 2003 年天津市卫生局重点项目，课题负责人， 12万元。

矽肺早期诊断（筛检）特异性生物标记物及蛋白质芯片指纹图谱的建立 2003 年天津市科技攻关计划培育项目 课题负责人， 20万元。

牛磺酸与烟酸对矽尘致纤维化的保护及机制研究， 2001 年国家基金项目 ，课题负责人， 16万元。

发表的主要论文发表的主要论文[1] Lianteng Zhi, Gangqiao Zhou, Hongxing Zhang, Yun Zhai, Hao Yang, Fang Zhang, Shixin

Wang,Maoti Wei, Wuchun Cao &Fuchu He． Lack of support for an association between CLEC4M homozygosity and protection against SARS coronavirus infection． NATURE GENETICS， 2007,39(6):692-694( SCI收录 ,IF24.59)

[2] Shi-Xin WANG, Xue-Feng ZHAO, Jia-Wei Zeng, et al. Screening of serum biomarkers and establishment of decision-tree in silica-exposed populations by SELDI-TOF-MS [J]． JOEM. 2007,49(7):764-770 (SCI收录 ,IF1.88)

[3] WANG Shixin, LIU Ping, Wei Maoti, et al. The roles of serum CC16 and SP-D on early diagnosis and progression of silicosis [J]． JOEM. 2007,49(8):834-839 (SCI收录 ,IF1.88)

[4] Sh.X. Wang, Y.M. LI, B.C. Sun, S.W.Zhang, W.H.Zhao, M.T.Wei, K.X,Chen, X.L.Zhao, Z.L.Zhang, M.K.,A.C.Cheung, and P.P.Wang. The SARS outbreak in a general hospital in Tianjin, China-the case of super spreader. Epidemiology and Infection. 2006,134:786-791（www.outbreak-database.com收录） (SCI收录 ,IF1.79)

[5] PEI Li-ying, GAO Zhan-cheng, YANG Zhen, WEI Dong-guang, WANG Shi-xin, JI Jian-min, JIANG Bao-guo. Investigation of the influencing factors on severe acute respiratory syndrome among health care workers. Journal of peking university(health sciences). 2006,38(3):271-275

[6] WangShiXin,Weimaoti,Yangzhen, et al. A seroepidemiological study on SARS after the outbreak in a hospital .International Workshop on Epidemiological Studies of the SARS Outbreak in China

[7] WANG Shixin,DU Haike,ZHANG Xizheng,CAI Shaoxi,FAN Huaquan,WANG Chang'en. Effects of niacin on nitric oxide synthase expression in rat lungs exposed to silica. PROGRESS IN NATURAL SCIENCE,2004,14 (12):1069-1073(SCI收录 ,IF0.58)

[8] Zhen Yang, Peizhong Peter Wang, Maoti Wei, Shixin Wang, Zhanliang Cao1 , Yuming Li, Zhenshan Jiao, Shulin Yuan and ZhilunZhang. A longitudinal sero-epidemiological study in recovered SARS patients and controls after an outbreak in a general hospital, Clinical and Vaccine Immunology （ 2007 submitted ）（通讯作者）

[9] Maoti wei ， yi han ， li he ， keju zhang ， zhen yang ， bin su ， zhilun zhang， shixin wang. Roles of TGF-β1 polymorphism in the occurrence and progress of SARS-Cov infection， Europe Journal of Epidemiology（ 2007 submitted ）（通讯作者）

[10] Wang Shixin, Wei Maoti, Li Yuming, Chang Aihua, Gao Xiuxia, , LiuYan,Yang Zhen，The Emergence and Containment of Severe acute respiratory syndrome epidemic in a general hospital， International Journal of Public Health and Tropical Medicine（ 2007 submitted ）

[11] Shixin Wang, Maoti Wei, Zhen Yang, Yi Han, Li He, Keju Zhang, Bing Su, Hongsheng Gao, Yilan Hu, Wuli Hui, Zhilun Zhang ， The influence of TNF-α gene polymorphism to the occurrence and progress of SARS-Cov infection, BMC Infectious Disease （ 2007 submitted ）

[12] 曾家伟，王世鑫，涂植光，等．利用 2-DE和MALDI-TOF MS/MS 技术筛选矽肺血清差异蛋白 [J]．中华劳动卫生职业病杂志， 2007 ,25(3),56-61 （通讯作者）

请各位教授请各位教授 批评指正批评指正

谢谢 谢谢！！