Upload
gersemi-hannes
View
80
Download
7
Embed Size (px)
DESCRIPTION
Три надцарства: Бактерии, Археи и Эукариоты. Что верно для E . coli , то верно для слона Жак Моно. Но эукариоты преподнесли ряд сюрпризов:. «гены кусками» огромное количество некодирующей ДНК Число генов оказалось меньше, чем ожидали, исходя из сложности организмов - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
Что верно для E.coli, то верно для слона
Жак Моно
• «гены кусками»
• огромное количество некодирующей ДНК
• Число генов оказалось меньше, чем ожидали, исходя из сложности организмов
• Сходство давно дивергировавших таксонов на уровне генов оказалось гораздо большим, чем на уровне морфологии.
Но эукариоты преподнесли
ряд сюрпризов:
Что есть в геноме?
• Гены• Мобильные элементы• Некодирующая ДНК
• Соотношение этих компонентов – разное у разных организмов.
• Наиболее резкое отличие – между про- и эукариотами.
Геном прокариот и эукариот
Прокариота (E.coli ) Эукариота (человек)
Гены – 90%
10%
1%
50%
Гены – 30%
20%
МГЭ и умеренные
повторы
Сателлит-ная ДНК
Экзоны – 1.5%
С-парадокс
• Размер генома (т.е. С – количество ДНК) в целом возрастает в эволюции от простых организмов к сложным, как и следовало ожидать.
• Парадокс в том, что иногда у видов одного уровня сложности количество ДНК отличается в 100-1000 раз
Объяснение С-парадокса: размер генома возрастает в основном за счет
некодирующей ДНК.
Прокари- Простей- Грибы, Беспозв. Хордов. Млекопи- Чел. оты шие Растения тающие
Процент некодирующей
ДНК
Разницу в размере генома в 100 раз трудно объяснить исходя из сходства таксономического положения и морфологии видов.
Горный кузнечик Podisma pedestris
Плодовая мушка Drosophila melanogaster
18 000 Mb 180 Mb
Примеры С-парадокса
Примеры С-парадокса
Простейший организм – амеба имеет размер генома 670 млрд.н.п.
человек - 3 млрд.н.п
амеба > в 200 раз
Amoeba dubia
Число генов – растет ли оно пропорционально уровню
сложности?
• Число генов тоже возрастает в ходе эволюции от простых форм к сложным.
• Но это возрастание гораздо меньше, чем можно было предполагать исходя из сложности морфологического строения.
Число генов и сложность организма
Геном Число генов
• Человек 3 000 Мb ~ 25000
• Нематода C.elegans 00 Mb ~ 20 000
1 мм959 клеток
Геномы бактерий
• Состоят из одной кольцевой ДНК и одной-нескольких плазмид – кольцевых ДНК меньшего размера.
Основная ДНКПлазмида
Геном бактерии E.coli
• Большинство генов уникальны – представлены в геноме одной копией.
• Гены т-РНК и р-РНК собраны в кластеры и повторены несколько сотен раз.
• Средний размер гена – 1 тысяча н.п., среднее расстояние между генами – 120 н.п.На некодирующую высокоповторенную ДНК приходится 1% генома. Функция неизвестна.
• Мобильные элементы занимают ~ 10% генома
1997
Второй компонент бактери-ального генома – плазмиды
• Плазмиды – кольцевые ДНК длиной
104-105 н.п. (до 8% длины основного генома)
• Число – от 1 до 10-15 на клетку.
• Обладают автономной репликацией.
• Крупные плазмиды участвуют в конъюгации, мелкие – накапливают гены устойчивости к антибиотикам.
• Несомненно родство некоторых плазмид и профагов – многие профаги могут долго существовать в плазмидной форме.