Prof. dr. sc. Mladen Petrovečki Katedra za medicinsku informatiku

Prof. dr. sc. Mladen Petrovečki

Katedra za medicinsku informatikuMedicinski fakultet Sveučilišta u Rijeci

Znanstvenoistraživačka metodologija u medicini (od ideje do publikacije)

Doktorski studij “BIOMEDICINA”

akad. god. 2006./07.

NastavaNastava

obvezatni predmetobvezatni predmet

DSM302DSM302

http://www.medri.hr/studiji/postdiplomski/biomhttp://www.medri.hr/studiji/postdiplomski/biom

edicina/program%20Biomedicina.pdfedicina/program%20Biomedicina.pdf

((www.medri.hrwww.medri.hr) ) SStudiji tudiji PPoslijediplomskoslijediplomskii studijistudiji

BiomedicinaBiomedicina

16 (nastava) + 416 (nastava) + 4 (seminarski rad) (seminarski rad) šk. satišk. sati

RasporedRaspored

Sadržaj nastaveSadržaj nastave

3temeljne smjernice/pitanja

1. Struktura znanstvenog1. Struktura znanstvenog rada i istraživanja rada i istraživanja

usvajanje temeljnih znanja (činjenica, usvajanje temeljnih znanja (činjenica,

podataka) o strukturi znanstvenog rada podataka) o strukturi znanstvenog rada

što je znanost? što je znanost?

koje su osobine medicinske znanosti? koje su osobine medicinske znanosti?

što je znanstveno istraživanje i kako je što je znanstveno istraživanje i kako je

strukturirano?strukturirano?

1. Struktura znanstvenog1. Struktura znanstvenog rada i istraživanja rada i istraživanja

što je znanstveni rad i od kojih se cjelina što je znanstveni rad i od kojih se cjelina

sastoji? sastoji?

koja su pravila oblikovanja znanstvenog koja su pravila oblikovanja znanstvenog

rada? rada?

što u znanosti jest dopušteno, a što što u znanosti jest dopušteno, a što

nnijije? e?

2. Kako sprovesti vlastito 2. Kako sprovesti vlastito znanstveno istraživanje?znanstveno istraživanje?

kako obaviti vlastito istraživanje? kako obaviti vlastito istraživanje?

spoznaja problema i pronalaženje spoznaja problema i pronalaženje

objavljenih podataka objavljenih podataka

postavljanje pitanja i hipoteza postavljanje pitanja i hipoteza

istraživanja istraživanja

provedba istraživanja provedba istraživanja

2. Kako sprovesti vlastito 2. Kako sprovesti vlastito znanstveno istraživanje?znanstveno istraživanje?

prikupljanje podataka s razumijevanjem prikupljanje podataka s razumijevanjem

statističke i informatičke metodologije i statističke i informatičke metodologije i

tehnologije tehnologije kkoja će se potom rabiti oja će se potom rabiti

definiranje rezultata, rasprava o definiranje rezultata, rasprava o

istraživanju, kritički osvrt na istraživanje istraživanju, kritički osvrt na istraživanje

3. Kako, gdje i zašto3. Kako, gdje i zaštoobjaviti rezultate istraživanja?objaviti rezultate istraživanja?

kako oblikovati vlastito znanstveno djelo kako oblikovati vlastito znanstveno djelo

kao rezultat vlastita istraživanja? kao rezultat vlastita istraživanja?

logika znanstvenog izvješća – opće logika znanstvenog izvješća – opće

osobine i specifičnosti vezane uza osobine i specifičnosti vezane uza

časopise časopise

definiranje koncepta znanstvenog rada definiranje koncepta znanstvenog rada

3. Kako, gdje i zašto3. Kako, gdje i zaštoobjaviti rezultate istraživanja?objaviti rezultate istraživanja?

priprema podataka za obradpriprema podataka za obradbbuu;; obrad obradbba a

podataka podataka i tumačenje rezultata i tumačenje rezultata

pisanje izvješća, strogost primjene stilapisanje izvješća, strogost primjene stila

komuniciranje s izdavačem, recenzija i komuniciranje s izdavačem, recenzija i

citiranost citiranost

Obrazloženje kolegijaObrazloženje kolegija

Predmet na način primjeren poslijediplomskoj Predmet na način primjeren poslijediplomskoj izobrazbi u medicinskoj znanosti objedinjuje tri izobrazbi u medicinskoj znanosti objedinjuje tri tematske cjeline:tematske cjeline:

metodiku i teorijska načela znanstvenog istraživanja u metodiku i teorijska načela znanstvenog istraživanja u biomedicinibiomedicini

načela primjene statističkih postupaka u prirodnim načela primjene statističkih postupaka u prirodnim znanostima, teznanostima, te

načela načela primjene informatičkih postupaka i uporabe primjene informatičkih postupaka i uporabe elektroničkih računala u tijeku znanstvenih elektroničkih računala u tijeku znanstvenih istraživanjaistraživanja

ZNANJE

ISTRAŽIVANJE

OBJAVLJIVANJE

ZNANSTVENOISTRAŽIVAČKA METODOLOGIJA

POPULACIJA

UZORAK

ENTITETI

ATRIBUTI

MJERENJE

PODACI

OBRADAREZULTATI

USPOREDBA

INFORMATIKASTATISTIKA

Logika znanstvenoga radaLogika znanstvenoga rada

...Uporaba ...Uporaba logičkih pravila i logikelogičkih pravila i logike uopće kao područja uopće kao područja izraženih oblika valjane misli još je izraženih oblika valjane misli još je izrazitija i stroža u izrazitija i stroža u znanostimaznanostima i filozofiji. Budući posebne znanosti prepoznajemo i filozofiji. Budući posebne znanosti prepoznajemo po spoznajnoj metodi i predmetu ili objektu istraživanja, po spoznajnoj metodi i predmetu ili objektu istraživanja, nedvojbeno je nedvojbeno je logičnost nužna pretpostavka svake logičnost nužna pretpostavka svake znanstvene metodologijeznanstvene metodologije. To je posebice vidljivo u neprestanoj . To je posebice vidljivo u neprestanoj uporabi logičkih oblika misli kao što su uporabi logičkih oblika misli kao što su sudovi, zaključci, sudovi, zaključci, definicije, razdiobe, dokazi itd.definicije, razdiobe, dokazi itd. Kako logika izražava formalne Kako logika izražava formalne uvjete valjanosti, neprestan je trud znanstvenika usklađivanje uvjete valjanosti, neprestan je trud znanstvenika usklađivanje te nužne pretpostavke s metodologijskim uputstvima svrha te nužne pretpostavke s metodologijskim uputstvima svrha kojih je otkrivanje istinitosti, tj. produbljenje spoznaje.kojih je otkrivanje istinitosti, tj. produbljenje spoznaje.

Mirko Jakić. Logika. Školska knjiga, Zagreb 2003.Mirko Jakić. Logika. Školska knjiga, Zagreb 2003.

Logika “znanstvenoga” rada!Logika “znanstvenoga” rada!

Neznanstveni postupciNeznanstveni postupci

Neznanstveni postupciNeznanstveni postupci

ustrajnostustrajnost(navika, stav, vjerovanje, inercija)(navika, stav, vjerovanje, inercija)

autoritetautoritet

intuicija (očiglednost)intuicija (očiglednost)

PristranostPristranost

PristranostPristranost

Logičke postavke istraživanjaLogičke postavke istraživanja

dokaz – sve prije nego jednostavna radnja!

Statistička hipotezaStatistička hipoteza

i.i. elementarna tvrdnjaelementarna tvrdnja

ii.ii. točna (istinita) ili netočna (neistinita)točna (istinita) ili netočna (neistinita)

iii.iii. provjera hipoteze provjera hipoteze traženje istinetraženje istine

Kako je Potjeh tražio istinu (www.bulaja.com)

Statistička hipotezaStatistička hipoteza

iv.iv. istina – stvarno, objektivno stanjeistina – stvarno, objektivno stanje

v.v. probabilistički sustav:probabilistički sustav:istina istina vjerojatnostvjerojatnost

vi.vi. značajno – ono što se ostvaruje na svaki značajno – ono što se ostvaruje na svaki drugi način osim slučajnodrugi način osim slučajno::iskaz vjerojatnosti iskaz vjerojatnosti razina značajnostirazina značajnosti

MaskiranjeMaskiranje

jednostrukojednostruko

dvostrukodvostruko

trostrukotrostruko

četverostrukočetverostruko

NastavniciNastavnici

Prof. dr. sc. Matko Marušić (Prof. dr. sc. Matko Marušić (MF ZagrebMF Zagreb, CMJ), CMJ)

Prof. dr. sc. Ana Marušić (MF ZagrebProf. dr. sc. Ana Marušić (MF Zagreb, CMJ, CMJ))

Doc. dr. sc. Jelka Petrak (MF ZagrebDoc. dr. sc. Jelka Petrak (MF Zagreb) )

Prof. dr. sc. Mladen Petrovečki (MF Rijeka)Prof. dr. sc. Mladen Petrovečki (MF Rijeka)

Darko Hren, prof. (MF Zagreb, CMJ)Darko Hren, prof. (MF Zagreb, CMJ)

Doc. dr. sc. Vedran Katavić (MF Zagreb, CMJ)Doc. dr. sc. Vedran Katavić (MF Zagreb, CMJ)

Prof. dr. sc. Prof. dr. sc. Blaženka Divjak Blaženka Divjak ((FOI ZagrebFOI Zagreb))

Dr. sc. Lidija Bilić-Zulle Dr. sc. Lidija Bilić-Zulle (MF Rijeka)(MF Rijeka)

LiteraturaLiteratura

Marušić MMarušić M i sur. i sur.

Uvod u znanstveni rad Uvod u znanstveni rad u mediciniu medicini

3. obnovljeno i dopunjeno 3. obnovljeno i dopunjeno izdanje.izdanje. Zagreb: Zagreb: Medicinska naklada, 200Medicinska naklada, 20044..

LiteraturaLiteratura

Croatian Medical Journal. Guidelines for Croatian Medical Journal. Guidelines for authors. Croat Med J 200authors. Croat Med J 20044;4;455::119119-2-266..

Croatian Medical Journal. Uniform Croatian Medical Journal. Uniform Requirements for Manuscripts Submitted to Requirements for Manuscripts Submitted to Biomedical Journals: Writing and Editing for Biomedical Journals: Writing and Editing for Biomedical Publication (International Biomedical Publication (International Committee of Medical Journal Editors).Committee of Medical Journal Editors).Croat Med J 2003;44:770-83. Croat Med J 2003;44:770-83.

www.cmj.hrwww.cmj.hr

Dopunska literaturaDopunska literaturaLacković Z, ur. Struktura, metodika i funkcioniranje Lacković Z, ur. Struktura, metodika i funkcioniranje znanstvenog rada. Zagreb: Medicinska naklada, 2001.znanstvenog rada. Zagreb: Medicinska naklada, 2001.

Petrie A, Sabin C. Medical statistics at a glance. London: Petrie A, Sabin C. Medical statistics at a glance. London: Blackwell Science, 2000.Blackwell Science, 2000.

Dawson-Saunders B, Trapp RG. Basic and clinical Dawson-Saunders B, Trapp RG. Basic and clinical biostatistics. London-Singapore: Prentice-Hall Int. Inc., 2001.biostatistics. London-Singapore: Prentice-Hall Int. Inc., 2001.

StatSoft Inc. Electronic Statistics Textbook. Tulsa, OK: StatSoft Inc. Electronic Statistics Textbook. Tulsa, OK: StatSoft, 2002. StatSoft, 2002. Http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html.Http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html.

Van Bemmel JH, Musen MA, ur. Handbook of medical Van Bemmel JH, Musen MA, ur. Handbook of medical informatics. Heidelbeg: Springer, 1997. informatics. Heidelbeg: Springer, 1997. (http://www.mieur.nl/mihandbook/r_3_3/handbook/)(http://www.mieur.nl/mihandbook/r_3_3/handbook/)

Savjet glede literature :)Savjet glede literature :)

A hard plus if your looking for introductory A hard plus if your looking for introductory clinical biostatistics… better examples with a little more clinical biostatistics… better examples with a little more detail. Some of the examples in the book are excellent. detail. Some of the examples in the book are excellent. I, especially, liked …I, especially, liked …

If you are looking for a book that will teach and If you are looking for a book that will teach and train you in the concepts and mechanics of biostatistics, train you in the concepts and mechanics of biostatistics, don't buy this one. The lay-out of the text is too don't buy this one. The lay-out of the text is too cramped. The definitions and explanations are often cramped. The definitions and explanations are often poorly worded. The sections within a chapter seem to be poorly worded. The sections within a chapter seem to be presented in an anti-logical manner...presented in an anti-logical manner...

http://www.amazon.com/ Dawson-Sauders-Trapp...

IspitIspit

praktičanpraktičan – pisanje prijave teme na zadanu ili – pisanje prijave teme na zadanu ili samostalno izabranu (ali odobrenu!) istraživačku samostalno izabranu (ali odobrenu!) istraživačku temutemu prema pravilniku o oblikovanju prijave teme prema pravilniku o oblikovanju prijave teme magistarskog rada i disertacije Fakultetamagistarskog rada i disertacije Fakulteta ((http://http://www.medri.hr/dokumenti/assets/UputaMD.pdfwww.medri.hr/dokumenti/assets/UputaMD.pdf))

usmeniusmeni – rasprava o prijavi teme (obrana teme) – rasprava o prijavi teme (obrana teme)

(mladen(mladen..ppetrovecki@metrovecki@medri.hr)edri.hr)