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Introdução à
Bioinformática
Danillo Oliveira de Alvarenga
Departamento de TecnologiaUniversidade Estadual Paulista
Jaboticabal-SP
● Área interdisciplinar
– Biologia Molecular
– Bioquímica
– Tecnologia da Informação
– Ciência da Computação
● Desenvolvimento
– escrita de algoritmos
– implementação de métodos
● Análise
– utilização de programas para análise
– interpretação de informação
Bioinformática
● Outros nomes
– biologia computacional
– computação biológica
● Controvérsia
– várias definições
– várias discussões
● Diferenças sutis
– análise
– desenvolvimento
Bioinformática
No nascimento da biologia molecular, reconheceu-se que um tema de pesquisa central deveria ser como os organismos vivos reúnem, processam, armazenam e
utilizam informação. No início dos anos 1970, definimos bioinformática como o estudo dos processos informáticos em sistemas bióticos em múltiplos níveis.
Impulsionada pelo aumento exponencial dos dados de sequências, bioinformática passou a significar, a partir dos anos 1980, o desenvolvimento e o
uso de métodos computacionais para gerenciamento e análise de dados de sequências, determinação de estrutura proteica, predição funcional
baseada em homologia e filogenia.
Paulien Hogeweg
The Roots of Bioinformatics in Theoretical BiologyPLOS Comp Biol 7: e1002021, 2011
Bioinformática
● Mágica
– solução para alguns problemas
– dados ruins resultados ruins→– tão ampla quanto a própria biologia
● Totalmente inacessível
– prática
– diferentes níveis
● Uma disciplina completamente distinta
– necessária em praticamente todas as áreas
– biologia do século XXI
Bioinformática Não É
Margaret Oakley Dayhoff(1925-1983)
Atlas of Protein Sequence and Structure (1985)
Evolution of the Structure of Ferredoxin Based on Living Relics of Primitive Amino Acid Sequences (1966)
Histórico
Histórico
Histórico
Histórico
● Avanços tecnológicos e científico
– computação
– biologia molecular
– sequenciamento
● Volume de dados
– larga escala
– alta velocidade
– grande complexidade
● Bioinformática
– ferramenta mais viável
Relevância
Sequências Disponíveis
GenBank
● Dezembro 1982– 680.338 bases– 606 sequências
● Junho 2017– 234.997.362.623 bases– 201.663.568 sequências
WGS
● Abril 2002– 692.266.338 bases– 172.768 sequências
● Junho 2017– 2.164.683.993.369 bases– 487.891.767 sequências
Genomas Disponíveis
Distribuição de Genomas por Domínio
Ômicas
DNA
↓
RNA
↓
proteínas
↓
metabólitos
diversos
← Genômica, Metagenômica
← Transcritômica, Metatranscritômica
← Proteômica, Metaproteômica
← Metabolômica, Metametabolômica
● Estudo do DNA total em uma célula ou cápsula
● Etapas
– extração de DNA do organismo desejado
– fragmentação do DNA extraído
– sequenciamento do genoma-alvo
– reconstituição a partir dos fragmentos sequenciados
– predição de genes e anotação
Genômica
Genômica
● Estudo do RNA mensageiro total em uma célula
● Etapas
– caracterização do genoma-alvo
– extração de RNA do organismo desejado
– eliminação de RNA ribossômico e transportador
– transcrição reversa e sequenciamento
– mapeamento dos transcritos contra referência
– avaliação de diferenças em relação às condições
Transcritômica
Transcritômica
● Estudo de moléculas em amostras mistas
– metagenômica
– metatranscritômica
– metaproteômica
– metametabolômica
● Etapas
– extração das moléculas da amostra
– tratamento das moléculas extraídas
– sequenciamento e reconstituição
– identificação e separação de sequências
– predição e anotação de táxons e funções
Meta*ômicas
● Genômica
– um organismo
– linhagem cultivada
– ambiente estranho
● Metagenômica
– vários organismos
– não cultivados ou em cocultivo
– genômica de comunidades
Metagenômica
Metagenômica
● Recursos computacionais
– capacidade de processamento
– espaço para armazenamento
● Fonte de dados
– organismos
– alvos
● Recursos humanos
– analistas
– programadores
Estrutura
● Composição biológica
– sequências
● Informação biológica
– anotação
– comparação
– predição
● Bancos
– públicos
– privados
Dados
● Biomoléculas
– ácidos nucleicos
– proteínas
● Conjuntos de caracteres alfabéticos
– 5 + 12 bases
– 20 + 13 aminoácidos
Sequências Biológicas
Nucleotídeos
Bases Nitrogenadas
Mutações
Nucleotídeos
Ácido Desoxirribonucleico (DNA)
Ácido Ribonucleico (RNA)
Gene
Operon
Agrupamento Gênico
● Homologia
– Caractere compartilhado presente no ancestral comum
– Mesma origem, não necessariamente a mesma função
– Revela relação evolutiva
● Homoplasia
– Caractere compartilhado não presente no ancestral comum
– Origem diferente, função semelhante
– Não revela relação evolutiva
Origem de Genes
● Ortólogos
– Transferência vertical
● Xenólogos
– Transferência horizontal
● Parálogos
– Duplicação gênica
Homólogos
Aminoácidos
Aminoácidos
Proteínas
Estrutura Primária de Proteínas
Estrutura Secundária de Proteínas
Estrutura Secundária de Proteínas
Estrutura Secundária de Proteínas
Estrutura Terciária de Proteínas
Estrutura Terciária de Proteínas
Estrutura Terciária de Proteínas
Estrutura Quaternária de Proteínas
Bases Nitrogenadas
Base 1 letra Base 1 letra
adenina A guanina ou citosina S
citosina C adenina ou timina W
guanina G guanina ou timina K
timina / uracila T / U adenina ou citosina M
desconhecida Nadenina ou guanina ou timina D
lacuna – adenina ou citosina ou timina
H
purina R adenina ou guanina ou citosina V
pirimidina Yguanina ou timina ou citosina B
Aminoácidos
Aminoácido 3 letras 1 letra Aminoácido 3 letras 1 letra
alanina Ala A metionina Met M
cisteína Cys C asparagina Asn N
aspartato Asp D prolina Pro P
glutamato Glu E glutamina Gln Q
fenilalanina Phe F arginina Arg R
glicina Gly G serina Ser S
histidina His H treonina Thr T
isoleucina Ile I valina Val V
lisina Lys K triptofano Trp W
leucina Leu L tirosina Tyr Y
Aminoácidos
Outros 3 letras 1 letra
desconhecido Xaa X
selenocisteína Sec U
pirrolisina Pyl O
asparagina ou aspartato Asx B
glutamina ou glutamato Glx Z
leucina ou isoleucina Xle J
hidrofóbico inexistente Φ
aromático inexistente Ω
alifático inexistente Ψ
pequeno inexistente π
hidrofílico inexistente ζ
positivo inexistente +
negativo inexistente –
Código Genético
● Códon de início
– Aqui Tem um Gene
● Códons de terminação
– Termine AgorA
– Termine AGora
– Termine aGorA
Código Genético
5’- ATG TGA CTA GCT ACT ACG TAC TAG CGA TCG ATG CAT CGT ACA TGA -3’
5’- ATG AGC TAC GTA CGT ACG ATC CGT AGT CTG ACT GAG AGT AGC TAG -3’
5’- ATG CTA GTC GTA CTG AGT CAT GCG ATC TAA CGA TCA GTT GGG TGA -3’
● Bases/Aminoácidos
– Fasta
● Qualidades
– Qual
– Fastq
● Anotações
– GenBank
– GFF
– EMBL
Formatos de Sequências
● Fasta (.fasta, .fas, .fa, .fna)
>Sequência 1ATCGAGTCAGTCGTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATGTCATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTAGTTGCAGTCGTATCGAT
>Sequência 2AGTCGTAGTCAGTCGATCGTAGTCGATCGTAGTCCCAGCGATTCGATCGTAGTCGATCGTAGTCGATCGTCAGTCTGATGCAGTCGTAGTCAGTCGATGCTGATA
>Sequência 3GACGTACGTAGCTAGTCGATCGTAGTCGATCGTAGCGTATCAGTCGTAGTCAGTCGTAGTCAGTCGTAGTCGAGTCTGACGTAGTCGATCGTAGTCGATCGTACG
Formatos de Sequências
● Fasta (.fasta, .fas, .fa, .faa)
>Sequência 1KLLAKKCACJALCJALKKLVLKEKLFLKEICIIOSKALKJFSDJOFJEHVEUCIAWKLCKJSVUIEFIALHFEYFHADJASJFOSDUSDUFJAOPKFSKAUOAAC
>Sequência 2AUFGEWYFWEJOKAMVJASDTRSRSUYIEKFKFMVAUDTWTYHVMVKSVISYGAJSJKAMAOIVHDSYWUAOIWYYEEUHGJLKOAIVTAGGBVKDVIWEIEJEI
>Sequência 3OIEIWUTIOEJGIEKGLMJHFUIHSFJAOFJAJGHIWEJUHERUIGSKDFMKSDMFIOSJDIJSDIGOJSAIOJDSGEHGUIEHUWIURGOSOJWUWQIJJISJS
Formatos de Sequências
● Grau de confiança
– probabilidade de erro
– escala logarítmica
● Phred
– 10: 1 em 10 (90 %)
– 20: 1 em 100 (99 %)
– 30: 1 em 1000 (99,9 %)
– 40: 1 em 10.000 (99,99%)
Qualidade de Sequenciamento de DNA
● Qual (.qual)
>Sequência 110 20 30 40 50 50 50 50 50 20 25 2530 30 20 15 20 35 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 5050 50 50 20 30 20 10 10
Formatos de Sequências
● Fastq (.fastq)
@Sequência 1TTGCCTGCCTATCATTTTAGTGCCTGTGAGGTGGAGATGTGAGGATCAGT+Sequência 1hhhhhhhhhhghhghhhhhfhhhhhfffffe`ee[`X]b[d[ed`[Y[^Y
@Sequência 2GATTTGTATGAAAGTATACAACTAAAACTGCAGGTGGATCAGAGTAAGTC+Sequência 2hhhhgfhhcghghggfcffdhfehhhhcehdchhdhahehffffde`bVd
@Sequência 3TGCATGATCTTCAGTGCCAGGACCTTATCAAGCGGTTTGGTCCCTTTGTT+Sequência 3dhhhgchhhghhhfhhhhhdhhhhehhghfhhhchfddffcffafhfghe
Formatos de Sequências
● GenBank (.gb, .gbk)
LOCUS BX571963 240 bp DNA linear DEFINITION Rhodopseudomonas palustris CGA009 DnaA.ACCESSION BX571963VERSION BX571963.1
FEATURES Location/Qualifiers source 1..480 /organism="Rhodopseudomonas palustris CGA009" /strain="CGA009" gene 101..340 /gene="dnaA" /locus_tag="RPA0001" CDS 101..340 /gene="dnaA" /locus_tag="RPA0001" /product="chromosomal replication protein DnaA"
Formatos de Sequências
● EMBL (.embl)
ID BX571963 standard; DNA; 240 BP.XXAC BX571963;XXDE Rhodopseudomomnas palustris CGA009 chromosomalDE replication protein DnaA, complete cds.XXSQ Sequence 240 BP; acaagatgcc attgtccccc ggcctcctgc tgctgctgct 40 ctgccctgcc cctggagggt ggccccaccg gccgagacag 80 caggaataag gaaaagcagc ctcctgactt tcctcgcttg 120 aggccagtgc cgggcccctc ataggagagg aagctcggga 160 gcgcaccccc ccagcaatcc gcgcgccggg acagaatgcc 200 agaccttctc ctcctgcaaa taaaacctca cccatgaatg 240//
Formatos de Sequências
● GFF (.gff)
##gff-version 3##sequence-region BX571963 1 240seq1 gene 1 240 ID=C114_00001;product=DnaA##FASTA>BX571963 BX571963 Rhodopseudomomnas palustris CGA009 chromosomal replication protein DnaA, complete cds.acaagatgccattgtcccccggcctcctgctgctgctgctctgccctgcccctggagggtggccccaccggccgagacagcaggaataaggaaaagcagcctcctgactttcctcgcttgaggccagtgccgggcccctcataggagaggaagctcgggagcgcacccccccagcaatccgcgcgccgggacagaatgccagaccttctcctcctgcaaataaaacctcacccatgaatg
Formatos de Sequências
● Alinhamentos
– verificar similaridades
– apontar dissimilaridades
● Identificação de sítios homólogos
– regiões conservadas
– regiões variáveis
● Tipos
– emparelhado/múltiplo
– local/global/semiglobal
Comparação entre Sequências
● Alinhamento de regiões
– subsequências
– maximização de correspondência
– eliminação de colunas
● Matriz de substituição
– tempo de divergência
– penalização
– pontuação
Alinhamento Local
● Stephen Altschul et al.
– Basic Local Alignment Search Tool (1990)
● Alinhamento local
– nucleotídeos × nucleotídeos
– aminoácidos × aminoácidos
– nucleotídeos × aminoácidos
– aminoácidos × nucleotídeos
● Banco de dados diversos
– remoto
– local
BLAST
● BLASTn
Query=Sequência_1Length=1309 Score ESequences producing significant alignments: (Bits) Value Sequência_2 86.1 1e-9
> Sequência_2Length=1103
Score = 86.1 bits (40), Expect = 1e-9 Identities = 35/40 (88%), Gaps = 0/46 (0%) Strand=Plus/Minus
Query 1213 TTTTTTGTCTGAATCAGGATGTCCAGGATTTAAGGATTTT 1253 |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||Sbjct 779 TTTTTTGTCTGCATCAGGTACTCCAGGATTTAAGGATTTT 819
BLAST
● BLASTx
Query=Sequência_1Length=1309 Score ESequences producing significant alignments: (Bits) Value Sequência_3 45.1 9e-7
> Sequência_3Length=309
Score = 45.1 bits (105), Expect = 9e-7 Identities = 23/57 (40%), Positives = 36/57 (63%), Gaps = 1/57 (2%) Frame = +3
Query 807 IRLKGTRVGIETILFDYLFHAKSPEEIAKTYTSLTLEQVYATILYYLHNQQSVDEYI 977 + ++ +RV ++TI+ + + EEIA Y SL L VYA I +YLH+Q+ VD Y+Sbjct 28 VVIRNSRVTLDTIVAVF-NQGVTAEEIAYRYPSLMLADVYAAIAFYLHHQEEVDSYL 83
BLAST
● Alinhamento de ponta a ponta
– sequências completas
– utilização de todos os sítios
● Sequências utilizadas
– homólogas
– tamanho semelhante
– mesmo sentido
Alinhamento Global
● Fasta (.fasta, .fas, .fa, .fna)
>Seq_1ATCGGTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATGATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTAGTTGCATATCGAT
>Seq_2ATCGAGCTAGCGGTAGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATGAGATGCGATGTCGATCACGTAGTAGCAGTAGTTGCAACGTTATCGAT
>Seq_3ATCGAGCTAGCGGTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATGATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTAGTTGCATATCGAT
Formatos de Alinhamento
● Fasta (.fasta, .fas, .fa, .fna)
>Seq_1ATCG--------GTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATG--ATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTAGTTGCA----TATCGAT
>Seq_2ATCGAGCTAGCGGTA---GATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATGAGATGCGATGT----CGATCACGTAGT-AG-C--AGTAGTTGCAACGTTATCGAT
>Seq_3ATCGAGCTAGCGGTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATG--ATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTAGTTGCA----TATCGAT
Formatos de Alinhamento
● Clustal (.aln)
Seq_1 ATCG--------GTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGSeq_2 ATCGAGCTAGCGGTA---GATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGSeq_3 ATCGAGCTAGCGGTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAG **** *** **************************
Seq_1 TCGATG--ATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTASeq_2 TCGATGAGATGCGATGT----CGATCACGTAGT-AG-C--AGTASeq_3 TCGATG--ATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTA ****** ********* ************ ** * ****
Seq_1 GTTGCA----TATCGATSeq_2 GTTGCAACGTTATCGATSeq_3 GTTGCA----TATCGAT ****** *******
Formatos de Alinhamento
● Phylip (.phy)
3 105Seq_1 ATCG------ --GTAGTCGA TCGTAGTCTG ACGTACGATGSeq_2 ATCGAGCTAG CGGTA---GA TCGTAGTCTG ACGTACGATGSeq_3 ATCGAGCTAG CGGTAGTCGA TCGTAGTCTG ACGTACGATG
TCAGTCGATG --ATGCGATG TCAGTCGATC ACGTAGTCAG TCAGTCGATG AGATGCGATG T----CGATC ACGTAGT-AG TCAGTCGATG --ATGCGATG TCAGTCGATC ACGTAGTCAG
TCGTAGTAGT TGCA----TA TCGAT -C--AGTAGT TGCAACGTTA TCGAT TCGTAGTAGT TGCA----TA TCGAT
Formatos de Alinhamento
● Nexus (.nex)
#NEXUSBEGIN DATA;dimensions ntax=3 nchar=105;format missing=? interleave=yes datatype=DNA gap=- match=.;
matrixSeq_1 ATCG--------GTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATGSeq_2 ATCGAGCTAGCGGTA---GATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATGSeq_3 ATCGAGCTAGCGGTAGTCGATCGTAGTCTGACGTACGATGTCAGTCGATG
Seq_1 --ATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTAGTTSeq_2 AGATGCGATGT----CGATCACGTAGT-AG-C--AGTAGTTSeq_3 --ATGCGATGTCAGTCGATCACGTAGTCAGTCGTAGTAGTT;end;
Formatos de Alinhamento
Montagem
ATGCGGCATCGCATGAGTGC
ATGAGTGCACGCAGCTGA
CAGCTGAGTCTAATATG
TCGCATGAGTGCACGCAGCTGAGTC
Montagem
ATGCGGCATCGCATGAGTGC
ATGAGTGCACGCAGCTGA
CAGCTGAGTCTAATATG
TCGCATGAGTGCACGCAGCTGAGTC
Montagem
ATGCGGCATCGCATGAGTGCATGAGTGCACGCAGCTGA
CAGCTGAGTCTAATATGTCGCATGAGTGCACGCAGCTGAGTC
ATGCGGCATCGCATGAGTGCATGCTAGCTGAGTCTAATATG
Conhecendo o (GNU/)Linux
● Físicas (hardware)
– processador
– memória
– disco rígido
– placas e controladores
– dispositivos de entrada/saída
● Lógicas (software)
– sistema operacional
– interface
– bibliotecas
– aplicativos
– documentação
Componentes de um Computador
● Gerenciador de recursos
– controla dispositivos
– coordena tarefas
– administra pedidos
– regula processos
– manipula dados
● Coração da máquina
– inicialização
– execução
– processamento
Sistema Operacional
Microsoft Windows
Apple macOS
GNU/Linux
Sistemas Operacionais
Microsoft Windows
Apple macOS
GNU/Linux
Sistemas Operacionais
● Ken Thompson & Denis Ritchie (1969)
– AT&T
● Inovações
– multitarefa
– multiusuário
● Variantes proprietárias
– código fechado
– licença restritiva
UNIX
● “Clones”
– GNU/Linux
– BSD
– Solaris
– Xenix
● Padronização
– Portable Operating System Interface (POSIX)
– Executable and Linkable Format (ELF)
UNIX
UNIX
● Richard Matthew Stallman (1983)
– GNU’s Not Unix
– Free Software Foundation
● Linha de comando
– utilitários
– aplicativos
– compiladores
● GNU Public License
GNU
● Linus Benedict Torvalds (1991)
– Linus’ Unix
– Linux Foundation
● Núcleo operacional
– física lógica←→– entrada saída←→– gerenciamento
● GNU Public License
Linux
Linux
Linux
Distribuições
● Coleções coerentes de projetos
– GNU
– Linux
– SystemD/Upstart/SysV
– Deb/RPM/tar.gz
– X/Wayland
– Gnome/KDE/XFCE/LXDE
– aplicativos
– customizações
● Slackware e Debian (1993)
– mais antigas na ativa
Distribuições
Distribuições
● Baseadas no Debian
– Debian
– Ubuntu
– Mint
● Baseadas no Red Hat
– Red Hat
– CentOS
– Fedora
● Outras bases
– Slackware
– Gentoo
– OpenSUSE
– Arch
Distribuições
Distribuições
Por Quê?
● Sistema dominante
– servidores
– computação científica
– supercomputadores
– dispositivos móveis
● Muitas vantagens
– gratuito
– livre e com código aberto
– alterações são compartilhadas
● Grande estabilidade
– segurança
– suporte
Linux na Bioinformática
● Flexibilidade
– gratuito
– customizável
● Diversidade
– programas otimizados
– programas exclusivos
● Colaborativo
– desenvolvido em comunidades
– aberto e reproduzível
Bio-Linux
● UK National Environmental Research Council (2006)
– Open Software for Biologists: From Famine to Feat
● Voltada para bioinformática
– sistema operacional
– conjunto de pacotes
– mais de 250 programas
● Várias formas
– SO independente (baseado no Ubuntu)
– adicionar a um sistema pré-instalado
Preciso Mudar de SO?
● Não
– trabalho remoto
– servidores disponíveis na Internet
– programas comerciais
● Sim
– compatível com todas as configurações
– sem limitações
– toda a capacidade disponível
– melhor forma de aprender
Preciso Mudar de SO?
● Sem alterações
– virtualização
– mídia externa
● Execução direta
– substituir o sistema atual
– instalar ao lado do sistema atual
Subsistema Windows para Linux
Terminais para Android
Servidores
● Fornecem serviços
– “nuvem”
– atendem clientes
– maior capacidade de processamento
– maior espaço para armazenamento
● Plataforma-padrão
– mesmas ferramentas
– favorece comparações entre a equipe
– facilita acesso às últimas versões
– reduz o número de especialistas
Servidores
● Secure Shell (SSH)
– terminal
– PuTTY
– Cygwin
● Virtual Network Computing (VNC)
– gráfico
– VNC Viewer
● WinSCP
Interfaces de Programas
● Gráfica
– Galaxy
– CLCBio
– Geneious
● Linha de comando
– maior parte dos programas
Linha de Comando
● Interface de texto
– instruções comandos→
● Mais eficiente
– mais leve
– mais rápida
– mais objetiva
● Permite automação
Programação
● Conjunto de instruções para algum processo
– comandos em sequência lógica
● Linguagens distintas
– compiladas
– interpretadas
● Bioprojetos
– Open Bioinformatics Foundation
Programas Compilados
● Linguagens de menor abstração
– mais complexas
– mais rápidas
● Compilador
– tradução em código binário
– maior número de detalhes
● Principais linguagens
– C
– C++
● Instalação mais trabalhosa
Programas Interpretados
● Linguagens de maior abstração
– mais simples
– mais lentas
● Interpretador
– maior abstração
– instruções legíveis
● Principais linguagens
– Perl
– Python
– R
● Instalação simples
Licenças
● Questões legais
– direitos autorais
– patentes
● Permissão
– o que fazer
– como fazer
– distribuição
Licenças
● Proprietária
– variável
● Livre/permissiva
– domínio público
– BSD
– MIT
– Apache
● Livre/viral
– GPL
Prática
1) https://cygwin.com/;
2) mover instalador para a Área de Trabalho;
3) Prompt de Comando;
4) cd Desktop;
5) setup-x86.exe --no-admin.
Cygwin
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