GALEN Claudia Bärthel 08.01.2004. Inhalt Was ist GALEN? –Entwicklung –Komponenten Top Level...

GALEN

Claudia Bärthel

08.01.2004

Inhalt

• Was ist GALEN?– Entwicklung– Komponenten

• Top Level Ontologie– Category Ontologie– Attribute Ontologie

Was ist GALEN?

• Generalized Architecture for Languages, Encyclopaedias and Nomenclatures in Medcine

• Repräsentation klinischer Information in neuer Art und Weise

• Neuartiges mehrsprachiges Kodiersystem für die Medizin

• Handhabbarkeit der Komplexität medizinischer Begriffsysteme

Was ist GALEN?

• Arbeitet unabhängig vom verwendeten Kodiersystem und verwendeter Eingabesprache

• Brücke zwischen Klassifikationssystemen und klinischen Anwendungen

Entwicklung

• 1992 - 1995– The GALEN Projekt

• 1995 - 1999– The GALEN-IN-USE Projekt

• 1999 –– OpenGALEN

The GALEN Project

• Basis: PEN&PAD Projekt der University of Manchester

• Finanziert durch Europäische Kommission• Bildung eines Konsortiums aus 11 Mitglieder

(UK, Schweiz, Niederlande, Schweden, Finnland, Deutschland und Italien)

• Entwicklung GRAIL und GALEN Referenzmodell

GALEN-IN-USE Projekt

• Förderung durch Europäische Kommission• Europäisches Referenzmodell für

medizinische Prozeduren• Unterstützung bei Entwicklung nationaler

Klassifikationen und Ontologien, Medikamentenlexika und chirurgische Prozeduren

• GRAIL-Implementationen

OpenGALEN

• Gegründet durch Universitäten Manchester u. Nijmengen

• Non-for-profit Organinsation

• Vorstand: Prof. Alan Rector, Prof. Pieter de Vries Robbe und Pieter Zanstra

Komponenten

• GALEN Common Reference Model

• GRAIL

• Terminologieserver

CORE Modell (1)

• Modell für medizinische Konzepte– Wiederverwendbar– Anwendungsunabhängig– Sprachunabhängig

• „Herz“ von GALEN

CORE Modell (2)

• Verwendung für– Elektronische Krankenakte– Klinische Benutzerschnittstellen– Klassifikations- und Kodiersysteme– Entscheidungsunterstützung– Wissens-Management-Systeme– Natürliche Sprachprozesse

CORE Modell (3)

GRAIL

• Basis für CORE Modell• Spezialisierte Beschreibunglogik• Entities

Categories Individuals

• Statements• Kriterien• Zusammengesetze Entitäten

Terminologieserver

High Level Ontologie

• Category Ontologie– Primary High Level Ontologie– Secondary High Level Ontologie

• Attribute Ontologie

High Level OntologieCategory Ontologie

Primary High Level OntologieCategory Ontologie

Primary High Level OntologieCategory Ontologie

Primary High Level OntologieCategory Ontologie

Primary High Level OntologieCategory Ontologie

• Ausdruck veränderlicher Eigenschaften durch Feature-State-Pairsz.B. Disease which hasFeature (Severity

which hasState severe)

• Selectors u. Statuses immer mit der Entität, die sie näher bestimmen, durch einzelnen semantischen Link verbundenz.B. Hand which hasLeftRightSelector right

Selection

Primary High Level OntologieCategory Ontologie

Secondary High Level OntologieCategory Ontologie

Secondary High Level OntologieCategory Ontologie

• Disease wird definiert als:Phenomenon which hasPathologicalStatus

pathological

• Disorder wird definiert als:Phenomenon which hasAbnormalityStatus

nonNormal

High Level OntologieAttribute Ontologie

• DomainAttribute

ConstructiveAttribute ModifierAttribute

TemporalAttribute

High Level OntologieAttribute Ontologie

• ConstructiveAttribute

PartitiveAttribute StructuralAttribute

FunctionalAttribute LocativeAttribute

z.B. (Phenomenon whichG <LocativeAttribute Heart hasPathologicalStatus phatological>) name Heart Disease

High Level OntologieAttribute Ontologie

High Level OntologieAttribute Ontologie

High Level OntologieAttribute Ontologie

High Level OntologieAttribute Ontologie

• ModifierAttributes

hasFeature hasState hasStatus

hasSelector hasModality

z.B. Disease which hasSeverityFeature (Severity which hasSeverityState severe)

High Level OntologieAttribute Ontologie

• Roles and RoleDesignatingAttributes– Roles

• XRole

– RoleDesignatingAttributes• playsXRole• hasXRole

Modelle basierend auf High Level Ontologie

• Chirurgische Prozeduren

• Anatomie

• Krankheiten

• Arzneimittel

GALEN Arzneimittel Ontologie