20
Илтгэгч: Х. Энхжаргал Т. Нандин – Эрдэнэ Удирдагч багш: Д. Дөлгөөн ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION/ ШУТИС – ҮТС

ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

Илтгэгч: Х. ЭнхжаргалТ. Нандин – Эрдэнэ

Удирдагч багш: Д. Дөлгөөн

ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй

/MinION/

ШУТИС – ҮТС

Page 2: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

2

АГУУЛГА

Нуклейн хүчилДНХ секвенсинг Минайон /MinION/ нанопоре секвенатор Технологийн ашиглалтын ойрын болон ирээдүйн чиг хандлагаТүгээмэл тохиолддог бэрхшээлүүд, тэдгээрийг шийдвэрлэх арга замДүгнэлт

2

Page 3: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

3

НУКЛЕЙН ХҮЧИЛ

Нуклейн хүчлийн молекул нь хоорондоо тодорхой дарааллаар холбогдсон 4 төрлийн нуклеотидаас тогтох полимер нэгдэл үүсгэдэг.

3

Page 4: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

ДНХ СЕКВЕНСИНГ

ДНХ-ийн нуклеотидуудын дарааллыг тогтоох арга.Максам-ГилбертСангерПиросеквенсингШинэ үеийн буюу геномийн секвенатор

ÞIllumina solexaÞRoche 454ÞABI – SOLID ÞIon Torrent 4

Page 5: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МАКСАМ ГИЛБЕРТИЙН БУЮУ ГИНЖ ТАСЛАХ ХИМИЙН АРГА

5

Page 6: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

САНГЕРИЙН БУЮУ ГИНЖ ЗОГСООХ ЭНЗИМИЙН АРГА

Энэ аргын үндэс – Полимераз энзимийн ажиллагааг ддНТФ буюу дидезоксирибонуклеозид ашиглан зогсоох

6

Page 7: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

LIFE TECHNOLOGY-GENETIC ANALYZER

Сангерийн шинэчлэгдсэн хувилбар Капилляр секвенсинг

7

Page 8: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

ШИНЭ ҮЕИЙН БУЮУ геномын секвенаторууд

Illumina solexa

Roche 454

Ion torrentaABI–SOLID

8

Page 9: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МИНАЙОН нанопоре секвенатор

Оксфорд Нанопоре Технологи зохион бүтээж, 2015 оны хавар худалдаанд оруулсан. 9

Page 10: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МИНАЙОН МКI аппарат

Урсгал хэсгийн байрлуулсан зөөврийн Минайон аппаратыг USB порт ашиглан зөөврийн болон ширээний компютертэй холбон ажиллуулна.1

0

Page 11: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МИНАЙОН давуу тал

АвсаарханТээвэрлэх боломжтойХямдШинжилгээнд нэгхэн ширхэг гинжин молекул хангалттайДНХ төдийгүй РНХ, уургийн молекулуудын секвенсийг тодорхойлдог. Үр дүнг бодит хугацаанд хянаж чаддаг.1

1

Page 12: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МИНАЙОН ажиллах зарчим

Нано сувгаар зөвхөн цахилгаан гүйдэл урсах бөгөөд ямар нэгэн молекул сувгаар дамжин өнгөрөх үед гүйдлийн хүчинд өөрчлөлт үүсгэнэ.

12

Page 13: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

НАНОПОРИЙН МЭДРЭМТГИЙ ЧАНАР

Энэ өөрчлөлтийн хэмжээ ямар молекул сувагт орсоноос шууд хамааралтай. 1

3

Page 14: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МИНАЙОН секвенаторын бүтэц

Урсгал нэгж (Flow

cell)

Бичил таваг (array of

microscaffolds)

Полимер мембран ( polymer

membrane)

Нано нүх (nanopore)

14

Page 15: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МИНАЙОН аппаратын дэвшилт

ДНХ-ийн метилжилтийг илрүүлэх чадвар100кс хүртэл амжилттай ажилладаг. Оксфорд нанопоре секвенсинг мэдээллийн сан нээлттэй, үнэ төлбөргүй.Өөрийн мэдээллийг үүлэн системд хадгалж,Хадгалагдсан мэдээллүүдтэй бодит хугацааны турш харьцуулах боломжтой.

15

Page 16: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

МИНАЙОН секвенаторын хэрэглээ

Эбола вирусын генотипийг газар дээр нь тодорхойлсон.Ургийн гажгийн нэг хувилбар болон хромосомын мутацийг илрүүлсэн.Хүнсээр дамждаг өвчин үүсгэгчийн төрөл зүйлийг газар дээр нь тодорхойлсон.Хөрсний микробийн найрлагыг тогтоох гэх мэтээр ашиглаж чадсан. 1

6

Page 17: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

ХЭРЭГЛЭЭНИЙ ДАВУУ ТАЛ

Ноцтой өвчин үүсгэгчийг нэг улсаас нөгөө улсруу тээвэрлэхгүй байх боломжтой.Мөн судалгааны материал тээвэрлэлтийн орчноос хамаарч өөрчлөлтөнд орохгүй.Газар дээр шинжлэх нь хугацаа алдахгүй гэх мэт. 1

7

Page 18: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

ОКСФОРД НАНОПОРЕ байгууллага

PromethION

GridION

18

Page 19: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

БЭРХШЭЭЛ БОЛОН ШИЙДВЭРЛЭХ АРГА ЗАМ

Хэдэн зуун нано сувгаар урт гинжин молекулууд зэрэг дамжин өнгөрдөг болохоор алдаа гарах магадлалтай. Гэхдээ алдааг засах, багасгах тал дээр нанопоре хамтын нийгэмлэгийн гишүүд, судлаач нар цаг тухайд нь нягт хамтын ажиллагаа явуулдаг.

19

Page 20: ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /MinION

ДҮГНЭЛТ

Анхаарал хандуулсанд баярлалаа! 20