Asam nukleat

  • Published on
    14-Jul-2015

  • View
    153

  • Download
    1

Embed Size (px)

Transcript

  • ASAM NUKLEATADALAH GOLONGAN SENYAWA NUKLEOPROTEIN, DARI PROTEIN KOMPLEK (CONYUGATED PROTEIN), YANG TERSUSUN DARI SENYAWA NUKLEOTID.

    CONTOH SENYAWA ASAM NUKLEAT ADALAH DNA DAN RNA.

    HASIL HIDROLISA SENYAWA ASAM NUKLEAT :

    ASAM NUKLEAT NUKLEOTID NUKLEOSID + H3PO4

  • PURINEADALAH SALAH SATU BASA NITROGEN, PENYUSUN ASAM NUKLEAT

    ADENIN GUANIN

  • PIRIMIDINADALAH SENYAWA BASA SELAIN PURINE, SEBAGAI PENYUSUN UTAMA ASAM NUKLEAT, DENGAN TIGA TURUNANNYA, MASING- MASING ADALAH SITOSIN, TIMIN DAN URACIL.

    CYTOCIN THYMIN URACYL

  • PENTOSAADALAH SALAH SATU GOLONGAN SENYAWA KARBOHIDRAT ATAU MONOSAKARIDA YANG MENGANDUNG 5 ATOM C, SEBAGAI PENYUSUN UTAMA ASAM NUKLEAT.

  • NUKLEOSIDNUKLEOSID ADALAH BERSATUNYA SENYAWA PURINE ATAU PIRIMIDIN DENGAN PENTOSE ( RIBOSA ATAU DEOKSI RIBOSA)

    NUKLEOSID TURUNAN DARI PURINE MEMPUNYAI NAMA DENGAN AKHIRAN OSINE. SEDANGKAN TURUNAN PIRIMIDIN MEMPUNYAI AKHIRAN IDINE

  • TABEL SENYAWA NUKLEOSID--------------------------------------------------------TURUNAN KOMBINASI DGN RIBOSA KOMBINASI DGN DEOKSI RIBOSA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------PURINE ADENIN ADENOSINDEOKSI ADENOSINGUANINGUANOSINE DEOKSI GUANOSIN

    PIRIMIDINTIMIN TIMIDIN DEOKSI TIMIDINCYTOSIN CYTODIN DEOKSI CYTODINURASIL URIDINE DEOKSI URIDINE

  • STRUKTUR NUKLEOSIDNUKLEOSID MEMPUNYAI STRUKTUR SEBAGAI N GLIKOSIDA, BERUPA IKATAN ANTARA SENYAWA KARBOHIDRAT (GULA) DENGAN SENYAWA BASA ( PURINE ATAU PIRIMIDIN).

    BASA PURINE ATAU PIRIMIDIN, TERIKAT PADA ATOM KARBON NOMOR 1 (C1) DARI DEOKSI RIBOSA (GULA).

    PIRIMIDIN DIHUBUNGKAN MELALUI N NOMOR 1. SEDANGKAN PURINE PADA N NOMOR 9

  • RUMUS BANGUN NUKLEOSID

  • NUKLEOTIDMERUPAKAN ESTER FOSFAT DARI GUGUS HIDROKSIL GULA, YANG DIESTERIFIKASI OLEH ASAM FOSFAT.

    PADA NUKLEOTID DNA, GUGUS HIDROKSIL 5 ATAU 3 DARI 2 DEOKSI ROBOSA DAPAT DIESTERIFIKASI.

  • Nucleotides Linked by Phosphodiester Bond OHPhosphodiester bond531235A kind of phospho-polysaccharidesJuang RH (2004) BCbasics

  • ATURAN PENULISAN SINGKAT ASAM NUKLEATMENURUT KONVENSI, RANTAI ASAM NUKLEAT DITULIS MENURUN ARAH DARI 5 MENUJU 3 . SENYAWA BASA NITROGEN DITULIS DENGAN HURUF BESAR.

    MISALNYA SINGKATAN dp Ap Cp Gp TP, BERARRTI SUATU TETRANUKLEOTID YANG MENGANDUNG BERTURUT- TURUT A, C, G, DAN T. HURUF KECIL d MENUNJUKKAN BAHWA GULANYA ADALAH DEOKSI-D- RIBOSA.

    PENULISAN SECARA PANJANG SEPERTI DI ATAS

  • The Two Chains of DNA Are Antiparallel5 pCpGpApTpCpGpApT-OH 35 pApTpCpGpApTpCpG-OH 35335Juang RH (2004) BCbasics

  • DAPAT DIHILANGKAN, JIKA KITA MENGETAHUI BAHWA YANG KITA BICARAKAN ADALAH DNA, BUKAN ASAM NUKLEAT YANG LAIN.

    KARENA GUGUS HIDROKSI 3 DARI 2 DEOKSI ADENOSIN BERHUBUNGAN DENGAN GUGUS 5 DARI DEOKSI SITOSIN, BEGITU SETERUSNYA. MAKA KODE YANG PANJANG DI ATAS BISA DISINGKAT MENJADI dpACGTp.

  • PERANAN DNA DAN RNA DALAM SINTESIS PROTEINKROMOSOM DAPAT MENURUNKAN SIFAT PADA GENERASI BERIKUTNYA. KROMOSOM TERSUSUN DARI GENE. GENE TERSUSUN DARI DNA, YANG DAPAT MENURUNKAN SIFAT.

    TEORI MODEL WATSON CRICK, DIKENAL PULA SEBAGAI TEORI DOUBLE PITA. YANG SATU DENGAN LAINNYA SALING BERHUBUNGAN.

    MASING- MASING RANTAI BENANG/ PITA TERSUSUN DARI GULA DEOKSI RIBOSA (S), DIHUBUNGKAN DENGAN BAGIAN PITA LAIN, MELALUI SENYAWA HITEROSIKLIK, ATAU SENYAWA

  • SENYAWA BASA ORGANIK, SEPERTI ADENIN (A), GUANIN (G), CYTOSIN DAN TIMIN (T) DENGAN BENTUK MODEL IKATAN SEBAGAI BERIKUT :

    ADENIN (A) SELALU BERIKATAN DENGAN (T), SEDANGKAN CITOSIN SELALU BERIKATAN DENGAN GUANIN (G)

    SEMUA MOLEKUL DNA MEMPUNYAI SUSUNAN YANG SAMA PADA MOLEKUL DEOKSI RIBOSA DAN ASAM PHOSFATNYA PADA RANTAI UTAMANYA. YANG BERBEDA HANYA PADA BASANYA SEPERTI ADENIN, GUANIN, TIMIN DAN CITOSINNYA.

  • APABILA SUATU SEL MEMBELAH, MOLEKUL DNA NYA AKAN TERPUTUS MENJADI DUA, SEHINGGA TERBENTUK RANTAI YANG BARU. SELAMA PEMBELAHAN SEL , AKAN TERBENTUK MOLEKUL DNA YANG BARU, YANG SAMA SUSUNANNYA DENGAN MOLEKUL ASALNYA.

    AKAN TETAPI APABILA MOLEKUL DNA MENSINTESIS RNA, MAKA AKAN TERPUTUS, DAN HANYA SEBAGIAN BENANG SAJA YANG BERPERAN, TERUTAMA PADA BAGIAN YANG TIDAK MELIPAT SEBAGAI DNA. SEDANGKAN BENANG YANG LAIN BERFUNGSI SEBAGAI TEMPAT ( TEMPLETE) UNTUK PEMBENTUKAN RNA, DENGAN BANTUAN ENZIM RNA POLIMERASE.

  • PENGGOLONGAN DAN STRUKTUR RNA1. RIBOSOMAL RNA (rRNA)2. MESENGGER RNA (mRNA) 3. TRANSFER RNA (tRNA) 4. HITEROGENIUM RNA (hRNA).

    SINTESIS PROTEINAPABILA mRNA TERBENTUK DARI DNA, mRNA MENEMBUS SITOPLASMA, MENUJU RIBOSOM, RIBOSOM BERPERAN SEBAGAI TEMPAT (TEMPLETE) UNTUK PEMBENTUKAN PROTEIN.

    rRNA , MERUPAKAN BAGIAN TERBESAR DARI RNA, AKAN BERGABUNG DENGAN PROTEIN LAIN, MEMBENTUK RIBOSOM. RIBOSOM SEBAGAI PENTERJEMAH PESAN- PEASAN DNA.

  • RIBOSOM MENGANDUNG tRna. tRNA BERPERAN DALAM MEMBAWA ASAM- ASAM AMINO MENUJU PADA mRNA DAN BEGITU SETERUSNYA.

    TAHAP- TAHAP REAKSI SINTESIS PROTEIN

    1. AA + ATP AMP AA + PP2. AMP- AA + tRNA AA tRNA + AMP3. (AAtRNA )n ribosome, rRNA AA1- AA2 AAn. mRNA

  • PERBEDAAN STRUKTUR DAN DAN RNAMENURUT WATSON CRICKDNA TERSUSUN DARI 1. H3PO42. PENTOSA ( DEOKSI RIBOSA )3. PURINE ( ADENIN DAN GUANIN)4. PIRIMIDIN ( CYTOSIN DAN TIMIN )

    RNA TERSUSUN DARI H3PO4PENTOSA (RIBOSA)PURINE ( ADENIN DAN GUANINE)PIRIMIDIN ( CYTOSIN DAN URACIL)

  • Large grooveSmall groove1 Twist = 10.5 bp36 Characteristics of Double Helix Juang RH (2004) BCbasics

  • TIGA TAHAP UTAMA DALAM TRANSFER GENITIK1. REPLIKASI DNA ADALAH PROSES PEMBENTUKAN KOPI DNA, DIMANA PITA DOUBLE HELIX DARI DNA SALING MEMISAH, DENGAN BANTUAN ENZIM DNA POLIMERASE, AKAN TERBENTUK DUA MOLEKUL DNA.

    2. TRANSKRIPSIADALAH PROSES MEMPRODUKSI RNA OLEH DNA. BAGIAN SIGMEN PITA DOUBLE HELIX DARI DNA MEMISAH. RIBONUKLEOTID COMPLEMEN, MENYUSUN DIRI PADA BAGIAN ATAS DNA TEMPLETE, YANG MEMISAHKAN DIRI. RNA TERBENTUK..

    3. TRANSLASI

  • TRANSLASI ADALAH PROSES SINTESIS PROTEIN OLEH RNA. TIAP mRNA MEMPUNYAI TIGA SEGMEN SENYAWA BASA, YANG DIKENAL SEBAGAI KODON. MASING- MASING KODON AKAN DIMASUKI OLEH ANTIKODON DARI tRNA YANG MEMBAWA ASAM AMINO, UNTUK DISINTESIS PROTEIN.

    KODON DAN ANTIKODON KODONADALAH SUSUNAN SENYAWA BASA YANG TERDAPAT PADA mRNA .

  • ANTIKODONADALAH SUSUNAN SENYAWA BASA (KODE ASAM AMINO) YANG DIBAWA OLEH tRNA .

    HUBUNGAN ANTARA SENYAWA BASA YANG TERDAPAT PADA DNA, mRNA , dan t RNA ADALAH SEBAGAI BERIKUT : DNA mRNA tRNA Adenin (A) Urancil (U) Adenin (A) Cytocin (C) Guanin (G) Cytosin(C) Guanin (G) Cytocin (C) Guanin (G) Thymin ( T) Adenin (A) Uracyl (U)

  • LATIHAN SOAL Apabila diketahui kode- kode senyawa basa pada DNA adalah TCG ACG dan AGT. Tulislah kode senyawa basa kodon dan antikodonnya.Tulislah senyawa komplemennya, apabila diketahui urutan senyawa basa salah satu rantai DNAadalah AGCC ATGT

  • TIGA TAHAP UTAMA DALAM TRANFER GENITIK

    * (1) 3-OH (2) 5- (phosphodiester bond) -OH 5-P 3-OH N- C- N-C-C-N-C-C-N-C - P-R-P-R-P-R * DNA 5-3 DNA * B DNA 10.5 bp 3.6 nm DNA DNA DNA DNA (TE buffer)