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Les conférences de l’Institut de l’Elevage Space 2014 LES ANOMALIES GÉNÉTIQUES : LES DÉTECTER, LES COMPRENDRE, LES ÉRADIQUER

Les anomalies génétiques : les détecter, les comprendre, les éradiquer

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Conférence organisée par l'Institut de l’Elevage et présidée par Didier Boichard, Inra - Rédacteur en chef de Genetics Selection Evolution

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LES ANOMALIES GÉNÉTIQUES : LES DÉTECTER, LES COMPRENDRE, LES ÉRADIQUER

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Introduction

Impact de la sélection génomique sur la diffusion des taureaux d'IA

Testage sur descendance Sélection génomique

Utilisation massive de quelques taureaux d’élites

Diffusion plus large de taureaux d’IA

Diffusion progrès génétique + ++

Variabilité génétique - +

Détection d’anomalies génétiques - Si problème déclaré lors de la période de testage, possibilité d’éliminer le taureau- Si problème déclaré après la période de testage, contribution et propagation de l’anomalie élevées

- Si problème déclaré, diffusion stoppée tardivement (carrière courte mais nombre de descendants plus ou moins limité)

La prise en compte de la gestion des anomalies génétiques devient de plus en plus stratégique dans la conduite des dispositifs de création génétique

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Comment s’organise le dispositif de création Evolution pour limiter/maîtriser l’émergence d’

anomalies génétiques?

Les outils développés au travers de la sélection génomique permettent d'orienter les dispositifs de création

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Dispositif de création Evolution (race Holstein)

3200 femelles génotypées + 25 000 femelles Grand Compte

220 mâles station100 diffusés + 50 export sur pied

3000 mâles génotypés 15 000 IA 300 embryons achat extérieur

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Maîtrise de l'accroissement de la consanguinité

• Stratégie MAT

Objectif: 25 embryons/donneuse (3-4 TE + OPU/FIV) En moyenne, 8 PAT différents/donneuse

• Stratégie PAT

Valorisation des données mutations disponibles sur des anomalies clairement identifiées (BLAD, CVM, Brachyspina) et haplotypiques (fertilité)

Juin 2013 – Juin 2014

Nbre de PAT utilisés

Nbre d’accouplements programme

% utilisation maximum

HO 172 1 500 TE – 15 000 IA 80 embryons/PAT ou 20 TE/PAT

PR 23 55 TE – 400 IA 20 embryons/PAT ou 4-5 TE/PAT

NO 68 300 TE – 7 000 IA 25 embryons/PAT ou 5-6 TE/PAT

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Maîtrise de l'accroissement de la consanguinité

• Gestion des accouplements programme

Mise en place d’un outil d’accouplements pour les techniciens génétiques Remontée des généalogies et prise en compte de toutes les informations disponibles

calcul de la parenté du produit à naître Valorisation des données haplotypiques disponibles (fertilité)

• Voyant vert, l’accouplement ne présente aucun risque.

• Voyant rouge, l’accouplement présente un risque.

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En termes de gestion de la variabilité, Evolution vise une:

• Utilisation croissante et homogène d’un grand nombre de taureaux génomiques comme PAT, de haut niveau génétique

• Rotation rapide de ces PAT génomiques

• Diversification des origines paternelles des jeunes PAT

• Restriction de l’utilisation individuelle intensive PAT

• Recrutement des futurs reproducteurs: sélection restrictive sur la voie paternelle (6-7 fils /PAT maxi)

Fin du Star Système

Meilleure gestion de la variabilité génétique!

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Maîtrise de l'accroissement de la consanguinité

• Stratégie de diffusion

Cadre réglementaire: pas de diffusion de mâles porteurs de tares génétiques De plus en plus de jeunes taureaux diffusés avec une production de semences plus

faibles limite la diffusion à grande échelle de nouvelles tares génétiques

• Nouvelle solution biotechnologique: génotypage de l’embryon

Voie femelle- Entrée de femelles de haut niveau génétique mais porteuses de tares génétiques en

station de donneuses- Tri des embryons conservation des embryons « non porteurs »

Voie mâle- Stratégie envisageable, à usage exclusif PAT, pour éviter de se priver de haute

valeur génétique, variable mais porteur de tare

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Gestion de l'émergence de nouvelles anomalies

• Echanges avec l'ONAB Alertes sur des cas de remontées fiches terrain / statistiques nationales Vigilance accrue sur les naissances attendues Analyse des données disponibles sur la zone

• Mise en place d’outils de reporting sur les IA et déclaration de naissance éleveurs de la zone Evolution

Alerte sur des taux de mortalité supérieurs à la moyenne (dans les jours, mois suivants la naissance,…)

Alerte sur des poids de naissance supérieurs à la moyenne Difficultés de naissance/vêlage …

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Sensibilisation du réseau ''terrain"

• Surveillance des cas répertoriés par l’observatoire

Communication auprès des réseaux inséminateurs, techniciens génétiques (supports en cours d’élaboration)

Mise en place de procédures spécifiques en fonction du cas (collecte de phénotypes, matériel biologique, vigilance,…)

• Remontée de nouveaux cas vers l’ONAB

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Conclusion

• Gestion de la variabilité génétique / consanguinité permet de limiter les risques d'apparition et/ou propagation de nouvelles anomalies

• L’incidence économique varie d’une anomalie à l’autre Anomalies (BLAD, CVM): impact économique fort Haplotypes de fertilité: impact économique plus limité

• Recherche du bon équilibre entre progrès génétique et variabilité génétique

• Clé de la réussite: meilleure maîtrise des accouplements!

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Présentation disponible en téléchargement sur www.idele.fr

Retrouvez aussi l’Institut de l’Elevage sur le stand A6 - hall 4