of 82 /82
Algoritme de Needleman-Wunsh Un algoritme per obtenir la millor alineació global entre dues seqüències d’ADN

Algoritme alineacio

Embed Size (px)

Text of Algoritme alineacio

  1. 1. Algoritme de Needleman-Wunsh Un algoritme per obtenir la millor alineaci global entre dues seqncies dADN
  2. 2. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 1. Decidim la puntuaci dels premis i dels cstigs
  3. 3. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 1. Decidim la puntuaci dels premis i dels cstigs Coincidncia de carcters: +1 Disparitat de carcters: -1 Forat: -2
  4. 4. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 1. Decidim la puntuaci dels premis i dels cstigs Coincidncia de carcters: +1 Disparitat de carcters: -1 Forat: -2 Associem cada puntuaci a un dels moviments de casella que aplicarem en diagonal compararem: els carcters i puntuarem (+1 o -1) en horitzontal i vertical: no els compararem, sempre penalitzarem (-2)
  5. 5. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 1. Decidim la puntuaci dels premis i dels cstigs = +1 -1 -2 -2 Coincidncia de carcters: +1 Disparitat de carcters: -1 Forat: -2 Associem cada puntuaci a un dels moviments de casella que aplicarem en diagonal compararem: els carcters i puntuarem (+1 o -1) en horitzontal i vertical: no els compararem, sempre penalitzarem (-2)
  6. 6. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 2. Dibuixem una taula que ens ajudar a puntuar
  7. 7. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 2. Dibuixem una taula que ens ajudar a puntuar
  8. 8. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S A a) Colloquem la primera srie (CAUSA) per marcar les coordenades de les columnes, tot posant un gui (que representar un forat) a la casella inicial. Pas 2. Dibuixem una taula que ens ajudar a puntuar
  9. 9. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S - A S U C S a) Colloquem la primera srie (CAUSA) per marcar les coordenades de les columnes, tot posant un gui (que representar un forat) a la casella inicial. b) Colloquem la segona srie (SUCS) per marcar les files, tamb amb un gui. Pas 2. Dibuixem una taula que ens ajudar a puntuar
  10. 10. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A S U C S a) Colloquem la primera srie (CAUSA) per marcar les coordenades de les columnes, tot posant un gui (que representar un forat) a la casella inicial. b) Colloquem la segona srie (SUCS) per marcar les files, tamb amb un gui. c) Colloquem un zero a la primera casella. Pas 2. Dibuixem una taula que ens ajudar a puntuar
  11. 11. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A S U C S -2 -4 -6 -8 -10 a) Colloquem la primera srie (CAUSA) per marcar les coordenades de les columnes, tot posant un gui (que representar un forat) a la casella inicial. b) Colloquem la segona srie (SUCS) per marcar les files, tamb amb un gui. c) Colloquem un zero a la primera casella. d) Penalitzem acumulativament cap a la dreta la primera fila. Pas 2. Dibuixem una taula que ens ajudar a puntuar
  12. 12. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 a) Colloquem la primera srie (CAUSA) per marcar les coordenades de les columnes, tot posant un gui (que representar un forat) a la casella inicial. b) Colloquem la segona srie (SUCS) per marcar les files, tamb amb un gui. c) Colloquem un zero a la primera casella. d) Penalitzem acumulativament cap a la dreta la primera fila. e) Penalitzem acumulativament cap avall la primera columna. Pas 2. Dibuixem una taula que ens ajudar a puntuar
  13. 13. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode:
  14. 14. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode:
  15. 15. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2
  16. 16. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella.
  17. 17. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut.
  18. 18. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella
  19. 19. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella 0 -2 -2 C S
  20. 20. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella 0 -2 -2 0-1 = -1 C S
  21. 21. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella 0 -2 -2 0-1 = -1 -2-2 = -4 C S
  22. 22. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella 0 -2 -2 0-1 = -1 -2-2 = -4 -2-2 = -4 C S
  23. 23. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella 0 -2 -2 0-1 = -1 -2-2 = -4 -2-2 = -4 C S major puntuaci
  24. 24. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella 0 -2 -2 0-1 = -1 -2-2 = -4 -2-2 = -4 C S - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1
  25. 25. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: a) Calculem la puntuaci que sobt venint de les caselles del voltant. a c b a1 c-2 b-2 b) Triem la puntuaci ms gran i lanotem a la casella. c) Dibuixem una lnia que ens indiqui don hem vingut. Exemple de la 1a casella 0 -2 -2 0-1 = -1 -2-2 = -4 -2-2 = -4 C S - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 assenyalem don venim
  26. 26. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1
  27. 27. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -2-1 = -3 -1-2 = -3 -4-2 = -6
  28. 28. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -2-1 = -3 -1-2 = -3 -4-2 = -6 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3
  29. 29. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -4-1 = -5 -3-2 = -5 -6-2 = -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3
  30. 30. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -4-1 = -5 -3-2 = -5 -6-2 = -2 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5
  31. 31. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -6+1 = -5 -5-2 = -7 -8-2 = -10 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 Hi ha coincidncia de lletres S-S
  32. 32. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -6+1 = -5 -5-2 = -7 -8-2 = -10 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 Hi ha coincidncia de lletres S-S
  33. 33. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -8-1 = -9 -5-2 = -7 -10-2 = -12 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7
  34. 34. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -2-1 = -3 -4-2 = -6 -1-2 = -3 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7
  35. 35. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -2-1 = -3 -4-2 = -6 -1-2 = -3 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3
  36. 36. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -1-1 = -2 -3-2 = -5 -3-2 = -5 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2
  37. 37. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -3+1 = -2 -2-2 = -4 -5-2 = -7 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 Hi ha coincidncia de lletres U-U
  38. 38. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -5-1 = -6 -2-2 = -4 -5-2 = -7 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4
  39. 39. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -5-1 = -6 -4-2 = -6 -7-2 = -9 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6
  40. 40. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -4+1 = -3 -3-2 = -5 -6-2 = -8 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 Hi ha coincidncia de lletres C-C
  41. 41. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -3-1 = -4 -3-2 = -5 -2-2 = -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4
  42. 42. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -2-1 = -3 -4-2 = -6 -2-2 = -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3
  43. 43. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -2-1 = -3 -3-2 = -5 -4-2 = -6 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3
  44. 44. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -4-1 = -5 -3-2 = -5 -6-2 = -8 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5
  45. 45. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -6-1 = -7 -8-2 = -10 -3-2 = -5 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5
  46. 46. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -3-1 = -4 -5-2 = -7 -4-2 = -6 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4
  47. 47. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -4-1 = -5 -4-2 = -6 -3-2 = -5 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5
  48. 48. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -3+1 = -2 -5-2 = -7 -3-2 = -5 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 Hi ha coincidncia de lletres S-S
  49. 49. Algoritme de Needleman-Wunsh = +1 -1 -2 -2 Pas 3. Valorem les caselles amb el segent mtode: Continuem amb les altres caselles una per una -3-1 = -4 -2-2 = -4 -5-2 = -7 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4
  50. 50. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial.
  51. 51. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies.
  52. 52. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres.
  53. 53. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres.
  54. 54. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres.
  55. 55. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres.
  56. 56. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres.
  57. 57. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4
  58. 58. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4
  59. 59. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Busquem camins - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Han de portar de la darrera casella a la que t el zero inicial. b) Retrocedirem seguint les lnies. c) Si hi ha ms duna opci agafem un dels camins i desprs ja estudiarem els altres. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4
  60. 60. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4
  61. 61. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4
  62. 62. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4
  63. 63. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C S
  64. 64. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S -
  65. 65. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S -
  66. 66. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U
  67. 67. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C
  68. 68. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S
  69. 69. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S
  70. 70. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C -
  71. 71. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S
  72. 72. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U
  73. 73. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C
  74. 74. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S
  75. 75. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S
  76. 76. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S C S
  77. 77. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S C A S U
  78. 78. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S C A S U U C
  79. 79. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S C A S U U C S S
  80. 80. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S C A S U U C S S A -
  81. 81. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S C A S U U C S S A - Si valorem els emparellaments obtenim la puntuaci mxima (-4)
  82. 82. Algoritme de Needleman-Wunsh Pas 4. Reconstrum la cadena que representa cada cam - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 a) Comencem des de la casella del 0 sense anotar res. b) Seguirem el cam. c) Si ens movem baixant en diagonal anotarem les lletres que donen les coordenades de la casella (una a cada srie). d) Si en desplacem a la dreta anotarem la lletra de la columna a la primera srie i posarem un gui (un forat) a la segona. e) Si ens desplacssim avall anotarem la lletra de la fila a la segona srie i posarem un gui (un forat) a la primera. - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 - C A U S 0- A -2S -4U -6C -8S -2 -4 -6 -8 -10 -1 -3 -5 -5 -7 -3 -2 -2 -4 -6 -3 -4 -3 -3 -5 -5 -4 -5 -2 -4 C A S - U U S C A S C A - S U U S C A S C A S U U C S S A - Si valorem els emparellaments obtenim la puntuaci mxima (-4) -1 -2 +1 -1 -1 Valor -4 -2 -1 +1 -1 -1 Valor -4 -1 -1 -1 +1 -2 Valor -4