Upload
others
View
3
Download
1
Embed Size (px)
Citation preview
VII SEMINAR ODGAJIVAČKIH ORGANIZACIJA
U STOČARSTVU REPUBLIKE SRBIJE
01.-04. April 2018., Kladovo
SAVREMENI TRENDOVI U SELEKCIJI
SVINJA
Dr Dragan Radojković
Uvodna razmatranja
Selekcija svinja, pored odgajivanja i ishrane, predstavlja jedan od tri
osnovna temelja na kojima se zasniva savremeno svinjarstvo.
Napredak koji se postiže sprovođenjem selekcije u pogledu proizvodnih i
ostalih osobina trajno ostaje u populaciji svinja.
Pojedinačni pomaci koji se ostvaruju selekcijom tokom vremena u
različitim generacijama se praktično sabiraju i doprinose ukupnoj genetskoj
vrednosti životinja.
U poslednjih 100 godina debljina leđne slanine kod savremenih rasa
svinja je smanjena za 75%, brzina rasta je povećana za 100%, dok je
nešto manji napredak učinjen na polju plodnosti svinja.
U većini evropskih odgajivačkih programa u svinjarstvu ostvaruje se
godišnji genetski progres za dnevni prirast od + 20 g/dnevno, mesnatost
od + 0.5 % i veličinu legla od + 0.2 prasadi/leglu.
Većina ovih promena je rezultat poboljšanja u oblasti evidentiranja
proizvodnih podataka na farmskom nivou i uvođenja savremenih
informacionih sistema na nivou asocijacija proizvođača svinja ili na
nacionalnom nivou, kao i usavršavanja metoda za genetsku procenu
životinja (procenu priplodne vrednosti).
Veliki uticaj na postizanje visokih proizvodnih rezultata u svinjarstvu,
posebno kada je reč o osobinama kvaliteta trupa i mesa, imalo je
povećanje preciznosti merenja fenotipa ovih osobina kako na liniji klanja
tako i na kandidatima za selekciju.
Uprkos velikom genetskom napretku ostvarenom u poslednje dve decenije
u pogledu proizvodnih osobina svinja biološki limiti još nisu dostignuti.
Dostignuća na polju molekularne genetike dovešće do široke primene
genomske selekcije koja može da poveća tačnost procene genetske
vrednosti životinja, smanji generacijski interval i tako dovede do
povećanja efekata selekcije.
Uvodna razmatranja
Principi selekcije
P = G + E
CILJ = Napredak – unapređenje populacije!!
“Izbor (odabiranje) najboljih jedinki (roditeljskih parova) sa
ciljem unapređenja populacije”
Merimo fenotip fenotipska vrednost
Parimo najbolje♀ sa najboljim♂
Principi selekcije
INDIVIDUA
PRECI SRODNICI POTOMCI
BRAĆA
(POLUBRAĆA)
SESTRE
(POLUSESTRE) SINOVI KĆERI
OTAC
MAJKA
rPG <
rPG >
Principi selekcije
Priplodna vrednost životinje (PV) – zajednički učinak
gena koji se prenosi na potomke
Procena PV – na osnovu sličnosti između srodnika
Efikasnost (uspeh) selekcije
ΔG = (i × r × σa) / g <=> h2 × S / g
i – intenzitet selekcije
r – tačnost PV
σa – standardno odstupanje PV
g – generacijski interval
h2 – heritabilitet osobine
S – selekcijski diferencijal
Principi selekcije
Konvencionalne metode procene PV
FENOTIPSKA (MASOVNA) SELEKCIJA
METODA SELEKCIJSKIH INDEKSA
METODA MEŠOVITIH MODELA (BLUP)
METODA SLUČAJNE REGRESIJE
BAJESOV METOD
ANALIZA PREŽIVLJAVANJA (Kaplan - Meier,
Cox Reg. Mod., Weibull Reg. Mod.)
OSOBINE
- PORAST
- KONVERZIJA HRANE
- KVALITET TRUPA
- VELIČINA LEGLA
- LONGITUDINALNE
- NISKONASLEDNE
- DUGOVEČNOST
METODE
Principi selekcije
Molekularno genetske metode procene PV
LANČANA REAKCIJA POLIMERAZOM - PCR
SEKVENCIONIRANJE DNK – MAPIRANJE GENA
- GENETSKI MARKERI
MIKROSATELITI (STR)
POLIMORFIZAM JEDNOG NUKLEOTIDA (SNP)
- OTKRIVANJE LOKUSA KVANTITATIVNIH OSOBINA (QTL)
ANALIZA GENA KANDIDATA
MAPIRANJE QTL-a
- GENOMSKI PROCENJENA PRIPLODNA VREDNOST (gPV)
Konvencionalne metode
Primena uređaja koji omogućavaju merenje debljine slanine i dubine
mišića, kako na živim životinjama, tako i na trupovima svinja, sa
maksimalnom tačnošću.
Prenosivi ultrazvučni aparati (A Mode i Real Time Ultrasound Technology)
pogodnih za merenja na živim životinjama na farmama
Konvencionalne metode
Različiti tipovi ubadajućih sondi koje se koriste za ocenu mesnatosti
trupova na liniji klanja (Fat-O-Meter, Ulster Probe, Hennessy Grading Probe
itd.). Koriste se i složeniji sofisticirani sistemi za ocenu mesnatosti na liniji
klanja kao što su Auto FOM ili Danski Klasifikacioni Centar.
Fat-O-Meter Hennessy Grading Probe
Konvencionalne metode
Auto FOM
Konvencionalne metode
Najveći progres koji je do danas učinjen u ovom pravcu je uvođenje
kompjuterske tomografije (CT) kao rutinske metode za ocenu udela tkiva u
trupovima nerastova kandidata za selekciju od 2008. godine u okviru
kompanije NORSVIN. Procena da će zahvaljujući ovoj novini godišnji
genetski progres biti između 17 i 30 %.
Konvencionalne metode
U okviru aktivnosti za izradu “Pravilnika o kvalitetu svinjskih trupova i
polutki” konstruisane su dve jednačine za ocenu mesnatosti svinjskih
trupova na liniji klanja.
METODA DVE TAČKE
PM = 65,93356 – 0.17759 × S + 0,00579 × M – 52,54737 × S/M
R2 > 0.64
RMSEP < 2.5 %
Konvencionalne metode
METODA JEDNE TAČKE
PM = 55,69165 – 0.35173 × F1 + 0,04283 × F2 + 0,77916 × F2/F1
R2 > 0.64
RMSEP < 2.5 %
Konvencionalne metode
FENOTIPSKA (MASOVNA) SELEKCIJA
- PERFORMANS TEST
- SIB TEST
- PROGENI TEST
h2
Broj potomaka
Tačnost (r
)
Konvencionalne metode
Kontinuirano poboljšanje proizvodnih osobina svinja omogućila je
primena linearnih metoda za procenu priplodne vrednosti:
- METODA SELEKCIJSKIH INDEKSA
- METODA MEŠOVITIH MODELA (BLUP)
Prednosti:
- istovremena selekcija na više
osobina
- uvažava ekonomsku vrednost
- jednostavnost praktične primene
Nedostaci:
- procenjena priplodna vrednost se ne
menja tokom proizvodnog života
- pretpostavka da životinje proizvode
u približno jednakim uslovima
METODA SELEKCIJSKIH INDEKSA
)xx(b)xx(b...)xx(b)xx(bIn
iiiinnn
1
222111
GvPb GvPb 1
Gvv
Pbb
ˆ
ˆr
,
,
H
IIH
→
Konvencionalne metode
SELEKCIJSKI INDEKS
SI1 = 0,0986 (x1 - 1x ) + 0,0655 (x2 - 2x )
SI2 = 0,0625 (x1 - 1x ) + 0,0430 (x2 - 2x )
SI3 = 0,0729 (x1 - 1x ) + 0,0328 (x2 - 2x )
SELEKCIJSKI INDEKS SI = 1,3942 (x1 – X 1) + 0,2970 (x2 – X 2)
Primer 1. X1 – Broj živorođene prasadi; X2 – Broj odgajene prasadi
Primer 2. X1 - % mesa; X2 – Životni dnevni prirast
Konvencionalne metode
Prednosti:
- sistematski i slučajni uticaji se
rešavaju istovremeno
- uzimaju se u obzir rezultati
srodnika
- procena priplodne vrednosti i za
životinje koje nemaju rezultate
- omogućena je selekcija na više
nivoa jer se priplodna vrednost
menja tokom proizvodnog života
Nedostaci:
- potreba za relativno čestim
izračunavanjima priplodne
vrednosti
- korišćenje efikasnog informacionog
sistema
- korišćenje računara velikih
mogućnosti i savremenih softvera
- smanjenje genetske varijabilnosti i
povećanje koeficijenta srodstva
METODA MEŠOVITIH MODELA (BLUP)
Konvencionalne metode
Y = Xb + Za + e
Konvencionalne selekcijske metode koje se baziraju na korišćenju
proizvodnih podataka i podataka o poreklu životinja u poslednje dve
dekade dale su veoma dobre rezultate.
Primeri:
• U periodu od 2000.-2005. godine godišnji genetski napredak u 25 %
najbolje rangiranih farmi australijske populaciji svinja iznosio je + 9,52
g/dan za prosečan dnevni prirast, - 0.28 mm za debljinu leđne slanine,
- 0.028 kg/kg za konverziju hrane, + 0.20 mm za dubinu mišića i + 0,28
prasadi po leglu.
• Od 2007 do 2011 DanBred je postigla prosečan godišnji genetski progres
od + 2.10 g/dan za prosečan dnevni prirast, + 0.10% mesa u polutkama i
+ 0.40 žive prasadi 5-tog dana posle prašenja po leglu (LP5).
• TOPIGS u 2011., beleži povećanje dnevnog prirasta od 5 g/dan,
mesnatosti od 0.5% i broja živorođene prasadi po leglu od 0.7 u poređenju
sa 2010. godinom.
Konvencionalne metode
Ovako dobri rezultati su ostvareni zahvaljujući primeni savremenog
pristupa selekciji svinja koji podrazumeva stvaranje najšire moguće baze
za prikupljanje proizvodnih podataka i podataka o poreklu životinja.
To je omogućeno:
• Uvođenjem modernih informacionih sistema na farmama svinja i u
okviru odgajivačkih organizacija.
• Većom razmenom genetskog materijala između farmi (VO).
• Korišćenjem rezultata performans testa organizovanog u farmskim
uslovima za procenu PV nerasta i nazimica.
• U zemljama sa razvijenim svinjarstvom danas se rutinski primenjuje
višeosobinski BLUP-AM koji u potpunosti koristi raspoložive podatke i
obezbeđuje maksimalnu korelaciju između procenjene priplodne
vrednosti i agregatnog genotipa životinja.
Konvencionalne metode
U cilju povećanja tačnosti procene priplodne vrednosti, od koje
direktno zavisi i ostvareni genetski progres, danas se intenzivno radi i na
uvođenju savremenijih metoda za procenu genetskih parametara i
priplodne vrednosti.
Primeri:
• Za longitudinalne podatke kao što je na primer veličina legla u
uzastopnim prašenjima ili dnevni prirast pri različitim uzrastima primenjuje
se model slučajne regresije (Random Regresion Model).
• Kod osobina koje delimično odstupaju od normalne raspodele kao i kod
niskonaslednih osobina sve više se za ocenu genetskih parametara
koristi Bajesov pristup (Bayesian approach).
• Za procenu PV dugovečnosti krmača koristi se analiza preživljavanja
(Survival Analysis: Kaplan - Meier, Cox Reg. Mod., Weibull Reg. Mod.).
Konvencionalne metode
Genetske kompanije i/ili nacionalne asocijacije proizvođača svinja u zemljama
sa razvijenom svinjarskom proizvodnjom su već izvršile ozbiljne rekonstrukcije
svojih odgajivačkih ciljeva.
Table 1. Selection traits used by Nordic breeding organizations (Rydhmer, 2005)
Type of trait Organisation Selection trait
Reproduction Norsvin Age at 1st service; Litter size, born alive; Number of teats; Litter weight at 3 wk; Weaning to service interval
Danbred Litter size, alive at 5 days FABA Age at 1st farrowing; Litter size, total born; Stillborn;
Mortality of liveborn; Farrowing interval Quality Genetics Litter size, born alive; Farrowing interval
Production Norsvin Growth rate (age at 100 kg); Carcass leanness; Feed efficiency (25-100 kg); Dressing percentage; Bacon side quality
Danbred Growth rate (0-30 kg); Growth rate (30-100 kg ); Carcass leanness; Feed efficiency (30-100 kg); Dressing percentage
FABA Growth rate (30-100 kg); Carcass leanness; Feed efficiency (30-100 kg)
Quality Genetics Growth rate (birth-100 kg); Carcass leanness; Feed efficiency (30-100 kg)
Health Norsvin Conformation score; Osteochondrosis Danbred Conformation scores; E.coli (MAS) Quality Genetics Conformation scores; Osteochondrosis
Meat quality Norsvin Ultimate pH; Reflection; Intramuscular fat (Duroc) FABA Ultimate pH; Reflection Quality Genetics RN- allele (Hampshire)
Konvencionalne metode
Molekularno genetske metode
Kraj 20. i početak 21. veka obeleženi su veoma intenzivnim istraživanjima i
saznanjima koja su donela veliki napredak u oblasti molekularne genetike.
Molekularne informacije mogu da povećaju tačnost selekcije, omoguće
selekciju na polom ograničene osobine i da omoguće selekciju za osobine koje
je teško meriti kao što je kvalitet mesa.
Table 2. Molecular Genetic Tests Used by the Swine Industries (Rothschild, 2010)
Gene or test Industry Use
Parentage tests exclusive use within some companies, commercially available HAL meat quality, commercially available ESR, EPOR litter size, commercially available KIT white color - exclusive use MC1R red/black color, use unknown MC4R growth and fatness, commercially available FUT1 edema E. coli F18, exclusive use RN meat quality, commercially available AFABP, HFABP intramuscular fat, use unknown PRKAG3 meat quality, commercially available CAST tenderness, commercially available IGF2 carcass composition, commercially available Trade secret tests several traits – many companies
Poslednjih godina je učinjen značajan progres na polju istraživanja genetike i
genomike svinja zahvaljujući integraciji unapređenih tehnika molekularne
biologije, bioinformatike i računarske biologije i zajedničkim naporima istraživača
uključenih u proučavanje genomike svinja.
Broj mapiranih QTL se i dalje povećava.
Učinjen je veliki napredak u proučavanju ekspresije gena. Broj identifikovanih
nekodiranih RNA je rapidno povećan i njihova egzaktna regulatorna funkcija se
istražuje.
Na projektu sekvencioniranja genoma svinje radi međunarodni konzorcijum
SGSC (Swine Genome Sequencing Consortium) i brojni drugi istraživački instituti
i učinjen je ogroman napredak.
Najnovija dostignuća na sekvencioniranju genoma svinje i naredna generacija
sekvencionih tehnologija je dovela do proizvodnje 60K SNP čipa visoke gustine
za svinje. Ovaj SNP čip je dizajniran izborom 64232 SNP odabranih od ukupno
preko 549000 poznatih SNP.
Molekularno genetske metode
Ovaj tip čipova je neophodan za primenu genomske selekcije koja predstavlja
budućnost selekcije svih vrsta domaćih životinja.
Ovaj metod integriše genotipske, fenotipske i podatke o poreklu za procenu
priplodne vrednosti i selekciju asistiranu markerima zasnovanu na širokoj
pokrivenosti celokupnog genoma.
Genomska selekcija može da omogući selekciju životinja na osobine kod kojih je
genetsko unapređenje ranije bile veoma komplikovano (otpornost na bolesti,
kvalitet mesa, polom limitirane osobine).
Različite metode za genomsku selekciju su razvijene tokom protekle dekade
(GBLUP, Bayes A, Bayes B, Bayes C, PLSR) i simulacije pokazuju da one mogu da
povećaju tačnost procene gPV i dovedu do smanjivanja generacijskog intervala.
Neke genetske kompanije u svinjarstvu su već objavile da su počele sa primenom
genomske selekcije (DanBred, TOPIGS, Hypor, IFIP, PIC, GENESUS).
Molekularno genetske metode
Molekularno genetske metode
Šematski prikaz genomske selekcije (procena genomske priplodne vrednosti - gPV)
Očekivani pravci selekcije svinja u budućnosti
Da li treba očekivati, u skladu sa aktuelnim genetskim trendovima, da se do 2050.
godine postigne prosečan dnevni prirast od oko 1.5 kg/dan, plodnost od oko 20
prasadi po leglu i debljina slanine manja od 8 mm ili će trendovi biti sporiji?
Koliko brzo će se povećavati proizvodni kapaciteti svinja u budućnosti i koji su
krajnji nivoi koji će biti dostignuti zavisiće od razvoja odnosa u proizvodnom lancu
u svinjarstvu i od raspoložive tehnologije koja treba da omogući realizaciju
postavljenih odgajivačkih ciljeva i genetskog progresa.
Odgajivači neće moći da gaje svinje kao nekada. Potrebni su novi odgajivački
ciljevi koji neće samo smanjivati troškove već će ići i u pravcu bolje dobrobiti
životinja, smanjenja korišćenja antibiotika, smanjenju emisije ugljenika i
odgovarajuće organske proizvodnje pored konvencionalne proizvodnje svinja.
Za ostvarivanje ovih ciljeva biće potrebni novi fenotipovi za: (a) vitalnost, (b)
ujednačenost, (c) robustnost, (d) dobrobit i zdravlje i (e) smanjenje emisije
ugljenika, a da pri tome zadrže efikasnost proizvodnje.
Videli smo da su genetska selekcija i bolja kontrola okruženja dovele do značajnog
povećanja nivoa produktivnosti svinja. Tako visoke performanse za posledicu
imaju visoke fiziološke zahteve koji mogu da pogoršaju zdravlje i dobrobit.
Pri selekciji na određenu osobinu treba da budu sagledane moguće posledice po
druge osobine kako bi se izbeglo pogoršanje bilo koje druge osobine, posebno
onih koje su povezane sa zdravljem i dobrobiti. Takođe je važno oceniti efekte
selekcije tokom celog života životinja, a ne samo tokom pojedine faze njihovog
života.
Očekivani pravci selekcije svinja u budućnosti
Poslednjih godina svedoci smo narastajuće pažnje stanovništva i potrošača
prema uslovima i opštem uticaju stočarske proizvodnje na okruženje. Razvoj
društva i društvenih odnosa doveo je do povećane svesti o etičkim i sociološkim
aspektima stočarstva.
Ovo je dovelo do potrebe da se u okviru odgajivačkih programa veći značaj daje
socijalno značajnim osobinama kao što su dobrobit i zdravlje svinja, uticaj
proizvodnje svinja na ekologiju i zdravstvena ispravnost i senzorski kvalitet
svinjetine. Većina ovih osobina ima ekonomski i neekonomski značaj i većinom su
dovoljno nasledne za uspešnu genetsku selekciju.
Odgajivačke organizacije često ne znaju kako da se nose sa neekonomskom
vrednošću tih osobina i na koji način da ih uključe u odgajivačke programe. Neke
od ovih osobina još nisu dovoljno tačno definisane i naslednost ovih osobina nije
dovoljno poznata da bi bile uključene u odgajivačke programe.
Očekivani pravci selekcije svinja u budućnosti
GDE JE NAŠE MESTO???
HVALA NA PAŽNJI!!!