NCE/11/01741 — Apresentação do pedido ­ Novo ciclode estudos

Apresentação do pedido

Perguntas A1 a A4

A1. Instituição de ensino superior / Entidade instituidora:ISPA, Crl

A1.a. Descrição da Instituição de ensino superior / Entidade instituidoraISPA ­ Instituto Universitário de Psicologia Aplicada, Crl

A2. Unidade orgânica (faculdade, escola, instituto, etc.):ISPA ­ Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e da Vida

A2.a. Descrição da Unidade orgânica (faculdade, escola, instituto, etc.):ISPA ­ Instituto Universitário de Psicologia Aplicada

A3. Ciclo de estudos:Biologia Marinha e Conservação

A3. Study cycle:Marine Biology and Conservation

A4. Grau:Mestre

Perguntas A5 a A10

A5. Área científica predominante do ciclo de estudos:Biologia

A5. Main scientific area of the study cycle:Biology

A6.1. Classificação da área principal do ciclo de estudos de acordo com a Portaria n.º 256/2005, de 16 de Março(CNAEF).

421

A6.2. Classificação da área secundária do ciclo de estudos de acordo com a Portaria n.º 256/2005 de 16 de Março(CNAEF), se aplicável.

<sem resposta>

A6.3. Classificação de outra área secundária do ciclo de estudos de acordo com a Portaria n.º 256/2005 de 16 deMarço (CNAEF), se aplicável.

<sem resposta>

A7. Número de créditos ECTS necessário à obtenção do grau:120

A8. Duração do ciclo de estudos (art.º 3 DL­74/2006):2 anos

A8. Duration of the study cycle (art.º 3 DL­74/2006):2 years

A9. Número de vagas proposto:30

A10. Condições de acesso e ingresso:Podem candidatar­se ao acesso ao ciclo de estudos conducente ao grau de Mestre em Biologia Marinha eConservação os titulares do grau de licenciado ou equivalente legal em Biologia ou áreas similares,nomeadamente Ciências do Ambiente, Taxonomia, Botânica, Genética, Engenharia Zootécnica. No entanto,apenas ficarão habilitados como Biólogos os perfis de formação devidamente reconhecidos pelas entidadescompetentes para o efeito, nomeadamente a respectiva ordem profissional.

A10. Entry Requirements:Students may apply to this Masters study cycle if they have a bachelor’s degree or a legally equivalent title inBiology or similar areas such as Environmental Sciences, Taxonomy, Botany, Genetics, ZootechnicalEngineering. However, the title in Biology is only ascertained to the training profiles recognized by therespective competente entities, namely the respective professional order.

Pergunta A11

Pergunta A11

A11. Ramos, opções, perfis, maior/menor ou outras formas de organização de percursos alternativos em que ociclo de estudos se estrutura (se aplicável):

Não

A11.1. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ... (se aplicável)

A11.1. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras formas de organização de percursos alternativos em queo ciclo de estudos se estrutura (se aplicável) / Branches options, profiles, major/minor, or other forms oforganization of alternative paths compatible with the structure of the study cycle (if applicable)

Ramos/Opções/... (se aplicável): Branches/Options/... (if applicable):

<sem resposta>

A12. Estrutura curricular

Anexo I ­

A12.1. Ciclo de Estudos:Biologia Marinha e Conservação

A12.1. Study Cycle:Marine Biology and Conservation

A12.2. Grau:Mestre

A12.3. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras (se aplicável)<sem resposta>

A12.3. Branches, options, profiles, major/minor, or other forms (if applicable)<no answer>

A12.4. Áreas científicas e créditos que devem ser reunidos para a obtenção do grau / Scientific areas and creditsthat must be obtained for the awarding of the degree

Área Científica / Scientific Area Sigla /Acronym

ECTS Obrigatórios /Mandatory ECTS

ECTS Optativos* /Optional ECTS*

Ecologia e Conservação Marinha / Marine Ecology andConservation ECM 96 15

Biologia do Comportamento e Ética / Biology of Behaviourand Ethics BCE 6 6

Métodos e Técnicas de Investigação / Research Methodsand Techniques MTI 6 3

(3 Items) 108 24

Perguntas A13 e A14

A13. Regime de funcionamento:Diurno

A13.1. Se outro, especifique:<sem resposta>

A13.1. If other, specify:<no answer>

A14. Observações:Esclarecimento sobre o nome institucional:No sistema da A3ES o nome da unidade orgânica aparece referido como “ISPA ­ Instituto Universitário dePsicologia Aplicada”. Essa designação resultou da passagem do “ISPA – Instituto Superior de PsicologiaAplicada” a Instituto Universitário, com o reconhecimento pelo Ministro da Ciência, Tecnologia e EnsinoSuperior (D.L. 221/2009 de 8 de Setembro), tendo esse nome sido publicado pelo Ministério sem o conhecimentoda entidade instituidora. Posteriormente, e na sequência de um pedido de alteração de designação institucional,foi exarado despacho por Sua Ex.ª O Ministro da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior (Processo: 50.28/97.324;Entrada: 5835) tendo sido dado conhecimento dessa aprovação ao Exmo. Senhor Director­Geral do EnsinoSuperior, passando a designação oficial a: “ISPA ­ Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e daVida”.

O regime de funcionamento será diurno, mas existe a possibilidade de abrir uma turma em regime nocturnocaso haja candidatos suficientes para preencher a mesma.

A14. Observations:Clarification on the institutional name:In the A3ES system the name of the institute appears as “ISPA ­ Instituto Universitário de Psicologia Aplicada”.This designation resulted from the attribution to ISPA of the statue of “University Institute”, with the recognitionby the Minister of Science, Technology and High Education (D.L. 221/2009 from 8 Setember), but was publishedwithout the institution’s prior informed consent. After that, and following a request to change the institutionalname, his Excellency the Minister of Science, Technology and Higher Education pronounced favorably to thisrequest (Proc.: 50.28/97.324; Entry: 5835) and the Director­General of Higher Education was duly informed,being the new designation: “ISPA ­ Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e da Vida”.

The working regime is during the daytime, but there is a possibility to open na after­hours class, pending on thenumber of students.

Instrução do pedido

1. Formalização do pedido

1.1. Deliberações

Anexo II ­ Conselho Pedagógico / Pedagogical Council

1.1.1. Órgão ouvido:Conselho Pedagógico / Pedagogical Council

1.1.2. Cópia de acta (ou extrato de acta) ou deliberação deste orgão assinada e datada (PDF, máx. 100kB):1.1.2._Acta Conselho Pedagógico Mestrado Biologia Marinha e Conservação.pdf

Anexo II ­ Conselho Científico ­ Scientific Council

1.1.1. Órgão ouvido:Conselho Científico ­ Scientific Council

1.1.2. Cópia de acta (ou extrato de acta) ou deliberação deste orgão assinada e datada (PDF, máx. 100kB):1.1.2._Acta Conselho Científico Mestrado Biologia Marinha e Conservação.pdf

Anexo II ­ Reitor / Dean

1.1.1. Órgão ouvido:Reitor / Dean

1.1.2. Cópia de acta (ou extrato de acta) ou deliberação deste orgão assinada e datada (PDF, máx. 100kB):1.1.2._Homologação Reitor Mestrado Biologia Marinha e Conservação.pdf

1.2. Docente responsável

1.2. Docente responsável pela coordenação da implementação do ciclo de estudos A respectiva ficha curricular deve ser apresentada no Anexo V.

Emanuel João Flores Gonçalves

2. Plano de estudos

Anexo III ­ ­ 1 º Ano / 1º Semestre

2.1. Ciclo de Estudos:Biologia Marinha e Conservação

2.1. Study Cycle:Marine Biology and Conservation

2.2. Grau:Mestre

2.3. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras (se aplicável)<sem resposta>

2.3. Branches, options, profiles, major/minor, or other forms (if applicable)<no answer>

2.4. Ano/semestre/trimestre curricular:1 º Ano / 1º Semestre

2.4. Curricular year/semester/trimester:1st Year / 1st Semester

2.5. Plano de Estudos / Study plan

Unidades Curriculares / Curricular UnitsÁreaCientífica /Scientific Area

Duração /Duration

HorasTrabalho /Working Hours

HorasContacto /Contact Hours ECTS

Observações/Observations

(1) (2) (3) (4) (5)

Ecologia Marinha / Marine Ecology ECM S 225 45 (T); 15 (TC);15 (OT); 4 (AV) 9

Biodiversidade, Biologia Populacional eBiogeografia Marinha / Biodiversity, PopulationBiology and Marine Biogeography

ECM S 225 45 (T); 15 (TP);15 (OT); 4(AV) 9

Desenho Experimental e Análise Avançada deDados Ecológicos / Experimental Design andEcological Data Analysis

MTI S 150 30 (T); 15 (TP);10 (OT); 4 (AV) 6

Biologia e Ecologia de Peixes / Fish Biology andEcology ECM S 75

30 (TP); 15(PL); 5 (OT); 4(AV)

3 O

Genética Aplicada de Populações Marinhas /Applied Genetics in Marine Populations ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);

4 (AV) 3 O

Biologia e Conservação de Mamíferos Marinhos /Biology and Conservation of Marine Mammals ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);

4 (AV) 3 O

Biologia e Conservação de Aves e RépteisMarinhos / Biology and Conservation of MarineBirds and Reptiles

ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);4 (AV) 3 O

Bem­Estar Animal / Animal Welfare BCE S 75 30 (TP); 5 (OT);4 (AV) 3 O

Ética Ambiental / Environmental Ethics BCE S 75 30 (TP); 5 (OT);4 (AV) 3 O

Biologia Larvar e Recrutamento / Larval Biologyand Recruitment ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);

4 (AV) 3 O

Modelação Ecologica e Estatística Espacial /Ecological Modelling and Spatial Statistics MTI S 75 30 (TP); 5 (OT);

4 (AV) 3 O

(11 Items)

Anexo III ­ ­ 1º Ano / 2º Semestre

2.1. Ciclo de Estudos:Biologia Marinha e Conservação

2.1. Study Cycle:Marine Biology and Conservation

2.2. Grau:Mestre

2.3. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras (se aplicável)<sem resposta>

2.3. Branches, options, profiles, major/minor, or other forms (if applicable)<no answer>

2.4. Ano/semestre/trimestre curricular:1º Ano / 2º Semestre

2.4. Curricular year/semester/trimester:1st Year / 2nd Semester

2.5. Plano de Estudos / Study plan

Unidades Curriculares / Curricular UnitsÁrea Científica/ ScientificArea (1)

Duração /Duration(2)

Horas Trabalho/ WorkingHours (3)

Horas Contacto/ Contact Hours(4)

ECTSObservações/Observations(5)

Biologia da Conservação Marinha / MarineConservation Biology ECM S 225 45 (T); 15 (TC);

15 (OT); 4 (AV) 9

Governação do Oceano e Áreas Marinhas 30 (T); 15 (TP);

Protegidas / Ocean Governance and MarineProtected Areas

ECM S 225 15 (OT); 4 (AV) 9

Ecologia Comportamental e Sociobiologia /Behavioural Ecology and Sociobiology BCE S 150 45 (TP); 10

(OT); 4 (AV) 6

Biologia e Ecologia de Peixes / Fish Biology andEcology ECM S 75 30 (TP);15 (PL);

5 (OT); 4 (AV) 3 O

Genética Aplicada de Populações Marinhas /Applied Genetics in Marine Populations ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);

4 (AV) 3 O

Biologia e Conservação de MamíferosMarinhos / Biology and Conservation of MarineMammals

ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);4 (AV) 3 O

Biologia e Conservação de Aves e RépteisMarinhos / Biology and Conservation of MarineBirds and Reptiles

ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);4 (AV) 3 O

Bem­Estar Animal / Animal Welfare BCE S 75 30 (TP); 5 (OT);4 (AV) 3 O

Biologia Larvar e Recrutamento / Larval Biologyand Recruitment ECM S 75 30 (TP); 5 (OT);

4 (AV) 3 O

Modelação Ecológica e Estatística Espacial /Ecological Modelling and Spatial Statistics MTI S 75 30 (TP); 5 (OT);

4 (AV) 3 O

Ética Ambiental / Environmental Ethics BCE S 75 30 (TP); 5 (OT);4 (AV) 3 O

(11 Items)

Anexo III ­ Perfil 1 ­ 2º Ano

2.1. Ciclo de Estudos:Biologia Marinha e Conservação

2.1. Study Cycle:Marine Biology and Conservation

2.2. Grau:Mestre

2.3. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras (se aplicável)Perfil 1

2.3. Branches, options, profiles, major/minor, or other forms (if applicable)Profile 1

2.4. Ano/semestre/trimestre curricular:2º Ano

2.4. Curricular year/semester/trimester:2nd Year

2.5. Plano de Estudos / Study plan

Unidades Curriculares /Curricular Units

Área Científica /Scientific Area (1)

Duração /Duration (2)

Horas Trabalho /Working Hours (3)

Horas Contacto /Contact Hours (4) ECTS

Observações /Observations(5)

Estágio / Internship ECM A 1050 64 (S); 12 (OT); 2(AV) 42

Seminario de Dissertação /Dissertation Seminar ECM A 450 64 (S); 6 (OT); 2 (AV) 18

(2 Items)

Anexo III ­ Perfil 2 ­ 2º Ano

2.1. Ciclo de Estudos:Biologia Marinha e Conservação

2.1. Study Cycle:Marine Biology and Conservation

2.2. Grau:Mestre

2.3. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras (se aplicável)Perfil 2

2.3. Branches, options, profiles, major/minor, or other forms (if applicable)Profile 2

2.4. Ano/semestre/trimestre curricular:2º Ano

2.4. Curricular year/semester/trimester:2nd Year

2.5. Plano de Estudos / Study plan

Unidades Curriculares /Curricular Units

Área Científica /Scientific Area (1)

Duração /Duration (2)

Horas Trabalho /Working Hours (3)

Horas Contacto /Contact Hours (4) ECTS

Observações /Observations(5)

Estágio / Internship ECM A 450 64 (S); 6 (OT); 2 (AV) 18Seminário de Dissertação /Dissertation Seminar ECM A 1050 64 (S); 12 (OT); 2

(AV) 42

(2 Items)

3. Descrição e fundamentação dos objectivos

3.1. Dos objectivos do ciclo de estudos

3.1.1. Objectivos gerais do ciclo de estudos.A UIEE do ISPA, classificada com Excelente pela FCT, suporta o presente ciclo de estudos integrando algunsdos seus elementos doutorados nas diferentes unidades curriculares. Pretende­se fornecer uma formaçãoespecializada em Biologia Marinha e Conservação dos Ecossistemas Marinhos integrando as principais teoriase métodos de estudo e análise com uma abordagem prática às problemáticas da gestão dando em opção doisperfis no 2º ano com maior peso para: i) uma componente aplicada integrando­se os alunos em empresas,institutos ou instituições com quem o ISPA tem protocolos e realizando o seu estágio nas mesmas; ii) umacomponente mais científica e de desenvolvimento de trabalho de investigação. Este ciclo de estudos promove odesenvolvimento de competências de aprofundamento teórico e análise crítica, a aprendizagem de técnicasavançadas de estudo em laboratório e no campo e a realização de trabalhos científicos originais e estudosaplicados à biologia marinha e conservação.

3.1.1. Study cycle's generic objectives.ISPA’s UIEE R&D Unit, classified as Excellent by FCT supports this study cycle integrating some of its PhDmembers in the different curricular units. It will provide a specialized training in Marine Biology andConservation of Marine Systems, integrating the main theories and methods of study and analysis with apractical approach to the problems of management given the students the possibility of choosing two profiles inthe 2nd year: i) an applied profile integrating their work in an internship in institutes, institutions and corporationswith which ISPA establishes agreements; ii) a scientific and research profile. This study cycle promotes thedevelopment of competencies for deepening theoretical knowledge and critical analysis, the learning ofadvanced laboratory and field study techniques and the accomplishment of original scientific work and appliedstudies in marine biology and conservation.

3.1.2. Objectivos de aprendizagem.1. Compreender e integrar de modo aprofundado as principais teorias da Biologia Marinha e da Conservação deEcossistema e utilizar de forma profissional e competente os principais métodos e técnicas2. Compreender os fenómenos biológicos de base que influenciam os processos ecológicos marinhos e assuas implicações para as estratégias de conservação3. Dominar a análise estatística avançada de dados ecológicos e a interpretação dos resultados obtidos4. Conceber, projectar, adaptar e realizar investigação científica em Biologia Marinha e Conservação,respeitando os princípios éticos subjacentes ao processo de investigação e ao uso de animais emexperimentação5. Comunicar as conclusões dos trabalhos efectuados assim como os pressupostos teóricos e metodológicossubjacentes de forma clara e profissional a públicos diversos: cientistas, decisores, gestores e ao público emgeral6. Transmitir e promover o conhecimento científico e a sua integração no contexto social e cultural

3.1.2. Intended learning outcomes.1. Understand and integrate in a proficient manner the main theories of Marine Biology and Conservation ofEcossystems and use in a professional and competent way the main methods and techniques2. Understand the basic biological phenomena which influence marine ecological processes and theirimplications to conservation strategies3. Master the advanced statistical analysis of ecological data and the interpretation of the results obtained4. Design, project, adapt and execute scientific research in Marine Biology and Conservation, respecting theethical principles underlining the research process and the use of animals in research5. Communicate in a clear and professional way the conclusion of the research as well as its theoretical andmethodological assumptions to diverse audiences: scientists, decision makers, managers and the generalpublic, 6. Transmit and promote scientific knowledge and its integration in the social and cultural context

3.1.3. Coerência dos objectivos definidos com a missão e a estratégia da instituição de ensino.O ISPA iniciou a sua actividade em 1962 como Instituto de Ciências Psicológicas, passando a Instituto Superiorde Psicologia Aplicada (ISPA) em 1964. Desde então constituiu­se como uma referência incontornável noensino superior em Portugal.

Pioneiro no ensino e investigação das ciências psicológicas e do comportamento, o ISPA é reconhecidonacional e internacionalmente pela excelência do seu projecto científico, pedagógico e cultural, pela qualidadedo seu corpo docente e da sua actividade de investigação e desenvolvimento e pela relevância da sua extensãouniversitária.

Desde o início, o projecto ISPA estruturou­se segundo uma matriz de desenvolvimento institucional que conciliaseis linhas de força essenciais.1. Constituição de um corpo docente próprio e altamente qualificado e prestigiado; 2. Formação científica e pedagógica plural com um enfoque muito particular na multidisciplinaridade científica ena vertente cultural; 3. Produção científica relevante, internacionalmente reconhecida e referenciada; 4. Uma aposta clara na internacionalização através de parcerias fortes com instituições de referência noespaço Europeu, da América do Norte e Brasil; 5. Uma actividade editorial diversificada com títulos que são, actualmente, referências na área das ciênciassociais, psicológicas e do comportamento; 6. Intervenção social e comunitária relevante, permanente e diversificada;

Desde 1994, foi igualmente reconhecida pela FCT, a Unidade de Investigação em Eco­Etologia que obteve asmais elevadas classificações desde a sua constituição, tendo actualmente o nível de Excelente, sendo umareferência nas ciências do mar, nomeadamente na biologia marinha, ecologia, conservação, comportamento,fisiologia, evolução, biogeografia, entre outras.

O ano de 2009 representou mais um marco histórico do desenvolvimento institucional com a reconversão emInstituto Universitário, no quadro do novo modelo organizativo do ensino superior. O ISPA foi a segundainstituição em Portugal e a primeira no subsistema do ensino particular e cooperativo a satisfazer os requisitosformais e o nível de qualificação exigidos para esta adequação organizacional. Com esta nova matrizinstitucional o ISPA – Instituto Universitário de Ciências Psicológicas, Sociais e da Vida passou a ministrar, deforma autónoma, todos os graus académicos previstos no quadro da organização dos estudos introduzido peloProcesso de Bolonha alargando também a sua oferta formativa a outras áreas com particular destaque para aBiologia.

Neste contexto, é criado, em 2009, o Centro de Biociências e iniciou­se em 2010 o funcionamento daLicenciatura em Biologia. Esta nova realidade traduz a excelência do projecto pedagógico e científico do ISPA,alicerçado nas mais elevadas classificações atribuídas por entidades independentes. Neste sentido, a presenteproposta vem dar corpo às capacidades instaladas e constituirá uma peça fundamental do projecto de

desenvolvimento em curso.

3.1.3. Coherence of the defined objectives with the institution's mission and strategy.ISPA started its activity in 1962 as Instituto de Ciências Psicológicas and in 1964 adopted the name InstitutoSuperior de Psicologia Aplicada (ISPA). Since then it constituted an inescapable reference in the Portuguesehigher education system.

Pioneer in research and education in the psychological and behavioural sciences, ISPA is internationally andnationally recognized by the excellence of its scientific, pedagogical and cultural project, the quality of itsacademic staff and of its research and development activities and the relevance of the extension and outreachprograms.

From the beginning, ISPA project was built over an institutional development matrix which integrates six mainlines:

1. A highly qualified and prestigious academic staff fully committed to the institution;2. Plural scientific and pedagogical learning particularly focused in a scientific and cultural multidisciplinaryapproach;3. Relevant scientific production, internationally recognised and referenced 4. A clear investment on the internationalization through strong partnerships with universities and research andintervention centres of excellence in Europe, North America and Brasil; 5. A diversified editorial activity with titles that currently constitute reference citations in the social,psychological and behavioural sciences;6. Relevant, permanent and diversified social and community intervention and outreach.

Since 1994 the R&D Eco­Etology Research Unit was recognized by FTC and has obtained the highestclassifications from the beginning, currently being marked as Excellent, and a reference in the marine sciences,namely in marine biology, ecology, conservation, behavior, physiology, evolution, biogeography, among others.

The year 2009 represented another historical mark in the institutional development with the conversion inUniversity Institute (Instituto Universitário), in the framework of the new organizational model of highereducation. ISPA was the second institution in Portugal and the first one in the private and cooperativesubsystem to comply with the formal requisites and mandatory quality level.

With this new institutional matrix, ISPA – University Institute of Psychological, Social and Life Sciences is nowable to offer, in an autonomous way, all academic levels part of the study cycles organization established by theBolonha Process also widening the portfolio to other areas with special reference to Biology.

In this context, it is launched in 2009 the Biosciences Centre and initiated in 2010 the Biology 1st cycle degree.This new reality translated the excellence of the ISPA scientific and pedagogical project, sustained in the highestclassifications attributed by independent external evaluation bodies to scientific research and high levelactivities in the Biology domain. In this context, the current proposal will constitute a central piece of the on­going development project.

3.2. Adequação ao Projecto Educativo, Científico e Cultural da Instituição

3.2.1. Projecto educativo, científico e cultural da instituição.Ao longo de décadas o ISPA desenvolve um projecto universitário que se consolidou em torno de trêspreocupações estruturantes: i) constante produção e difusão do conhecimento, ii) intervenção social e, iii)desenvolvimento de uma cultura científica de base humanista e ambientalmente sustentável.i) A produção e difusão de conhecimento assentam numa estratégia de formação universitária caracterizadapela crítica sistemática do conhecimento estabelecido, dando expressão a uma intensa actividade deinvestigação que se desenvolve desde os primeiros anos de formação inicial até às estruturas associadas aoCentro de Investigação e Intervenção que integra as Unidades de Investigação com reconhecimentointernacional. Esta actividade é apoiada por recursos laboratoriais e de campo cujo acesso é aberto não só ainvestigadores como aos estudantes. A dinâmica pedagógica e científica apoia­se ainda, para lá da estimulaçãodo pensamento crítico, no desenvolvimento de competências geradoras de autonomia e de competênciassociais, favoráveis à difusão do conhecimento produzido, recorrendo às mais diversas formas (conferências,seminários, congressos e outras reuniões científicas, bem como edição de publicações periódicas deexpressão nacional e internacional). Neste sentido, os estudantes são sistematicamente estimulados à difusãocrítica do conhecimento através do treino em comunicações escritas e orais, em contexto de sala de aula,desde o primeiro ano de formação.ii) No âmbito da intervenção social, a actividade formativa é articulada com actividades de extensãouniversitária assegurada por estruturas como o Centro de Biociências, o Centro de Estudos Interculturais AzizAb’Saber, o Centro de Estudos da Criança e da Família e a Clínica Universitária. Para além da actividade deintervenção, estes centros garantem a incorporação constante de problemáticas de incidência ambiental esocial na actividade de investigação aplicada desenvolvida pelo ISPA, favorecendo igualmente o

desenvolvimento da consciência cívica dos nossos estudantes e alargando o espectro de intervençãoprofissional.iii) Finalmente, o desenvolvimento constante de actividades de expressão científica, cultural e artística,paralelamente à organização de ciclos de conferências orientados para o cruzamento de conhecimentocientífico de diferentes áreas disciplinares com preocupações emergentes nas sociedades actuais, são a basede uma cultura científica de base humanista e ambientalmente sustentável.Para alcançar estes objectivos, o ISPA criou uma vasta rede de cooperação nacional e internacional, commuitos projectos em parceria com outras instituições, a mobilidade de estudantes através de redes europeias,a validação científica e pedagógica do trabalho desenvolvido e a incorporação constante de factores deinovação nestes domínios. A qualificação do quadro de pessoal técnico e de um quadro de pessoal docentepróprio está na base de toda actividade desenvolvida no âmbito deste projecto.

3.2.1. Institution’s educational, scientific and cultural project.For decades, ISPA has developed a University Project strengthen over three main goals: i) constant knowledgecreation and outreach, ii) social intervention, iii) development of a scientific culture with a humanistic base andenvironmentally sustainable.i) Knowledge creation and outreach stand on a strategy of university culture characterized by the systematiccritique of the established knowledge, giving expression to an intense research activity developed from the firstyears of initial to the research structures associated to the Centre for Research and Intervention whichintegrates the internationally recognized Research Units. This activity is supported by laboratorial and fieldresources which are available not only to researchers but also to students. The pedagogical and scientificdynamics is also supported, not only by the stimulation of critical thought, but also on the development ofcapabilities which generate autonomy and social competencies and are favourable to the dissemination of thecreated knowledge, taking advantage of different type of means (conferences, seminars, conferences and otherscientific meetings, as well as the edition of national and international periodic journals). Therefore, students aresystematically stimulated to the critical transmission of knowledge through training in written and oralcommunication skills, in the classroom context, from the first year of the course.ii) In the social intervention, the educational activity is harmonized with outreach and intervention activitiesbased on structures such as the Biosciences Centre, the Intercultural Studies Centre Aziz Ab’Saber, the Childand Family Studies Centre and the University Clinic. Besides the intervention activities, these centresguarantee the regular incorporation of environmental and social problems in the applied research activitydeveloped by ISPA, further favouring the development of the civic conscience of our students and widening therange of professional involvement.iii) Finally, the constant development of activities in all forms of scientific, cultural and artistic expression,together with the organization of conference cycles aimed at crossing scientific knowledge from differentdisciplinary areas with emerging issues in the current societies, are the basis of a humanistic andenvironmentally sustainable based scientific culture.To achieve these goals, ISPA has created a vast network of national and international cooperation, with manyprojects in partnership with other institutions, the students’ mobility through European networks, the scientificand educational validation of the results achieved and the constant incorporation of innovation aspects in thesedomains. The qualification of the technical staff and its own academic and scientific staff is at the core of allactivity developed in this project.

3.2.2. Demonstração de que os objectivos definidos para o ciclo de estudos são compatíveis com o projectoeducativo, científico e cultural da instituição.

A Unidade de Investigação em Eco­Etologia do ISPA reconhecida pela Fundação para a Ciência e a Tecnologiadesde 1994 (FCT 331/94) e classificada como Excelente na última avaliação independente de painéisinternacionais da FCT, apresenta uma vasta e reconhecida actividade científica, de extensão e deenquadramento pedagógico dos ciclos de estudos e unidades curriculares da área das ciências da vida (1º cicloem Biologia; Mestrado em Psicobiologia; diversas unidades curriculares ministradas noutros ciclos deestudos).O corpo docente próprio qualificado em regime de exclusividade enquadra um conjunto significativo estudantesde mestrado e doutoramento, bem como de investigadores doutorados que desenvolvem um leque alargado deprojectos de investigação nacionais e europeus com uma produção científica de excelência. Desenvolvemainda actividade relevante de extensão universitária, prestação de serviços e participação na implementaçãode políticas públicas que conferem ao ISPA um reconhecimento inquestionável na área das ciências da vida e,em particular, da Biologia. Uma das áreas mais fortes na área da investigação em Biologia realizada no ISPA éa Biologia Marinha nas vertentes da ecologia marinha, comportamento de animais aquáticos, conservação deecossistemas marinhos, fisiologia, evolução, biogeografia e filogeografia.A recente passagem do ISPA a Instituto Universitário abriu a porta a que, de uma forma natural, o potencialcientífico, pedagógico e cultural na área das ciências da vida fosse aproveitado como o devido reconhecimentoe avaliação pelo Ministério da Ciência, Tecnologia e Ensino Superior com a entrada em funcionamento do 1ºciclo em Biologia.Assim, consolida­se na área das ciências da vida, a construção de um projecto sólido, sustentável e deexcelência, do qual a presente proposta é parte integrante.Este ciclo de estudos pretende fornecer uma sólida formação de base teórica em Biologia Marinha e emConservação dos Ecossistemas Marinhos, áreas centrais de investigação dos membros da equipa docente docurso. Desta forma, o conhecimento gerado no âmbito da investigação de excelência no ISPA nestas áreas do

conhecimento, será traduzido num plano de cursos centrado para o fornecimento de competências quepermitam uma completa e integrada compreensão do funcionamento dos ecossistemas marinhos.Adicionalmente, o ISPA trabalha há muitos anos em estreita articulação com as instituições públicas comacção na área da conservação marinha, tendo os estudos de base que justificaram a criação do ParqueMarinho da Arrábida, onde continuamos a trabalhar, sido realizados pelo ISPA sob coordenação do coordenadorda UI&D em Eco­Etologia e do coordenador do presente ciclo de estudos. Esta componente aplicada da gestãodos ecossistemas marinhos será uma mais­valia deste curso quando comparado com outros similaresexistentes em Portugal e permitirá aos estudantes aplicar os seus conhecimentos na prática durante os doisanos de formação do mestrado.

3.2.2. Demonstration that the study cycle's objectives are compatible with the institution's educational, scientificand cultural project.

The Eco­Ethology Research Unit of ISPA, recognised by the Portuguese Science and Technology Foundationsince 1994 (FCT 331/94) and ranked as Excellent by the last FCT evaluation from independent reviewers,presents a vast and internationally recognised scientific activity, extension and outreach programs andeducational support of the study cycles and curricular units in the life sciences (1st cycle in Biology; Mastersdegree in Psychobiology; several curricular units in other study cycles).

The qualified staff with exclusive activity at the institute organise a significant set of masters and PhD students,as well as PhD researchers which together are involved in a wide range of national and European researchprojects with a highly relevant scientific output. They further develop relevant activity of university extensionand outreach, acquisition of services and participation in the definition and implementation of public policieswhich award ISPA an unquestionable recognition in the life sciences and, in particular, in Biology. One of thestrongest areas of research in Biology performed at ISPA is Marine Biology in the areas of marine ecology,behaviour of marine animals, conservation of marine ecosystems, physiology, evolution, biogeography andphylogeography.

The recent conversion of ISPA in a University Institute opened the door to, in a natural way, take the bestadvantage of this scientific, educational and cultural potential in the life sciences, with the due recognition by theMinistry of Science, Technology and Higher Education with the launch of the 1st cycle in Biology. Therefore, asolid and sustainable project of excellence in the life sciences is consolidated, from which the current proposalis an integral part.

This study cycle aims at providing a solid theoretical background in Marine Biology and the Conservation ofMarine Ecosystems, central areas of research of the academic staff of this study cycle. In this way, knowledgegenerated by the research of excellence at ISPA in these areas, will be translated in a course plan centred toprovide competences that allow a complete and integrated understanding of how marine ecosystems function.Additionally, ISPA works at many years in close collaboration with the public institutions responsible forimplementing marine conservation policies in Portugal, and the baseline studies which justified the creation ofthe Arrábida Marine Park, where we continue to work, were performed by ISPA under the supervision of thecurrent R&D Unit coordinator and the coordinator of the present study cycle. This applied component ofmanagement of marine ecosystems will be an important comparative advantage for our students whencompared with similar courses existing in Portugal, allowing the students to apply their knowledge to concreteproblems during the two­year duration of the course.

3.3. Unidades Curriculares

Anexo IV ­ Biodiversidade, Biologia Populacional e Biogeografia Marinha

3.3.1. Unidade curricular:Biodiversidade, Biologia Populacional e Biogeografia Marinha

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Vítor Manuel Carvalho Almada

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:André Levy Martins CoelhoJoana Isabel Espírito Santo Robalo

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:A presente unidade curricular tem como objectivo introduzir os estudantes ao estado da arte e aos principaisproblemas actualmente em debate nos domínios da biologia populacional e biogeografia marinhas e ao estudoda biodiversidade existente no mar. No final o aluno deverá ser capaz de dispor de conceitos que lhe permitamabordar adequadamente problemas centrais neste domínio como: o papel de factores estocásticos edeterminísticos na determinação da biodiversidade e do tamanho das populações; a interacção entre

processos históricos e determinantes ecológicos na formação dos actuais padrões biogeográficos no meiomarinho; identificar os traços mais peculiares às populações marinhas e que as distinguem habitualmente daspopulações terrestres. A importância do estudo da biodiversidade atravessa todo o conteúdo da unidadecurricular e a importância do seu conhecimento para a conservação do meio marinho constitui um tópico finalque envolve a síntese dos conhecimentos obtidos

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:This course aims to introduce students to the state of the art and to the main issues currently under discussionin the fields of population biology and biogeography and the study of marine biodiversity that exists in the sea.In the end the student should be able to have concepts that allow it to adequately address the core problems inthis area as the role of stochastic and deterministic factors in determining the biodiversity and population size,the interaction between ecological and historical processes determining the formation of current biogeographicpatterns in the marine environment, to identify the traits peculiar to marine populations and that usuallydistinguish them from terrestrial populations. The importance of the study of biodiversity across the entirecontent of the course and the importance of their knowledge for the conservation of the marine environment isone final topic that involves the synthesis of knowledge gained in previous topics

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Conceitos básicos de biologia populacional: principais traços das populações marinhas, variações espacio­temporais e os efeitos na variação de recrutamento2. Modelos de regulação das populações marinhas: processos estocásticos e determinísticos3. Conceitos e medidas de biodiversidade 4. Padrões de variação geográfica e ecológica da biodiversidade marinha5. Conceitos básicos de biogeografia marinha6. Principais regiões biogeográficas e ecológicas no meio marinho 7. Os mares tropicais, costeiros, os mares temperados e glaciais, o oceano profundo e os ambientes pelágicos8. Factores históricos que afectam os padrões de biodiversidade e distribuição das espécies: o passado dosoceanos9. Factores ecológicos que afectam a biodiversidade marinha: porquê os picos de diversidade nos trópicos10. O problema da especiação no mar11. O estudo da biodiversidade e as suas aplicações na protecção e conservação marinhas

3.3.5. Syllabus:1. Basic concepts of population biology: the key traits of marine populations, spatiotemporal variations andeffects on recruitment variation2. Models for the regulation of marine populations: stochastic and deterministic3. Concepts and measures of biodiversity4. Patterns of geographic variation of marine biodiversity and ecological5. Basic concepts of marine biogeography6. Major biogeographical and ecological marine environment7. The tropical seas, coastal, glacial and temperate seas, the deep ocean and pelagic environments8. Historical factors that affect patterns of biodiversity and species distribution: the past of the oceans9. Ecological factors affecting the marine biodiversity: why the peaks of diversity in the tropics10. The problem of speciation in the sea11. The study of biodiversity and its applications in protecting and conserving marine

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

A presente unidade curricular tem como objectivos introduzir os estudantes ao estado da arte e aos principaisproblemas actualmente em debate nos domínios da biologia populacional e biogeografia marinhas e ao estudoda biodiversidade existente no mar.

Em primeiro lugar serão expostos os conceitos básicos de biologia populacional e os principais modelos deregulação das populações marinhas. De seguida serão abordados os conceitos e medidas de biodiversidadeassim como os padrões de variação geográfica e ecológica da biodiversidade marinha. No que respeita à componente biogeográfica da unidade curricular serão primeiro abordados os conceitosbásicos de biogeografia marinha assim como as principais regiões biogeográficas e ecológicas no meiomarinho. Os mares tropicais, costeiros, temperados e glaciais assim como o oceano profundo e os ambientespelágicos serão discutidos de seguida. Os factores históricos que afectam os padrões de biodiversidade edistribuição das espécies assim como os factores ecológicos que afectam a biodiversidade marinha serãooutros dos temas abordados nesta unidade curricular, assim como o problema da especiação no mar e oestudo da biodiversidade e as suas aplicações na protecção e conservação marinhas.

O programa desta unidade curricular é como se poderá constatar confrontando­o com os objectivos umaconcretização directa dos mesmos. Cada objectivo corresponde a um grupo de aulas teóricas. As aulaspráticas têm uma sequência própria mas acompanham os conceitos e metodologias apresentados nas aulasteóricas.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.This course aims to introduce students to the state of the art and the main issues currently under discussion inthe fields of population biology and biogeography and the study of marine biodiversity that exists in the sea.First we will show the basic concepts of population biology and the main regulatory models of marinepopulations. Then we will focus on concepts and measures of biodiversity and patterns of geographic variationand ecological marine biodiversity.Regarding the biogeographic component of the course will be first discussed the basics of marine biogeographyas well as key biogeographical and ecological marine environment. The tropical seas, coastal, temperate andglaciers as well as the deep ocean and pelagic environments will be discussed below. The historical factors thataffect patterns of biodiversity and species distribution and ecological factors affecting the marine biodiversity ofother issues will be addressed in this course, as the problem of speciation in the sea and the study ofbiodiversity and its applications in the protection and marine conservation.The program of this course is how we will see by comparing it with the direct targets of such an achievement.Each objective corresponds to a group of lectures. Practical classes have a proper sequence but follow theconcepts and methodologies presented in the lectures.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Com base na lista bibliográfica geral e em artigos de revisão específicos, será feito para cada tópico: i) umaapresentação oral pelo docente dos conceitos básicos e problemas actuais; ii) um ‘journal club’ no qual osalunos apresentam e discutem artigos ou capítulos de revisão relativos aos temas em discussão.Serão também realizadas aulas práticas:1­ Num pequeno trabalho de campo os alunos realizarão no litoral rochoso inventários de biodiversidade àescala de uma poça e de dois tipos de quadrados com dimensões diferentes. Os dados serão utilizados parailustrar a complexidade das relações entre biodiversidade e área e para discutir com os estudantes asmetodologias para realizar amostragens representativas.2­ No laboratório os estudantes serão introduzidos ao software relevante para a modelação da dinâmicapopulacional e para a identificação de padrões biogeográficos.A avaliação será contínua, valorizando desempenho em trabalhos práticos e nas discussões temáticas.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):Based on the general list of references and review articles specific to each topic will be: i) an oral presentationby the teacher of basic concepts and current issues, ii) a 'journal club' in which students present and discussarticles or chapters review relating to issues under discussion.We will also conduct practical classes:1 ­ In a small field work students will visit the rocky shore and make inventories of biodiversity at the scale of apool tide using two types of squares with different dimensions. The data will be used to illustrate the complexityof relations between biodiversity and area and to discuss with students the methodologies to achieverepresentative samples.2 ­ In the lab students will be introduced to the relevant software for the modeling of population dynamics and toidentify biogeographical patterns.The evaluation will be continuous, valuing performance in practical work and discussions topics.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os métodos de ensino descritos acima pretendem promover um estilo de aprendizagem activo nos alunos,através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, e responsabilizando os alunos pelapesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma.É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmica dapropagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação e formaçãode uma opinião esclarecida sobre um tema. Todos estes aspectos são coerentes com os objectivos genéricosexpressos acima.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

The teaching methods described above is intend to promote an active learning mode among the students,through the introduction of discussion moments within each class, and by assigning student chores forresearching specific issues and then informing the class mates on these. It is also valued the reading of primarysources as a mean for students to understand the dynamics of the scientific information spread and in order topromote a higher proactive attitude regarding literature research and the building up of an informed opinion onspecific topics. All these aspects are consistent with the generic objectives expressed above.

3.3.9. Bibliografia principal:Briggs, J.C. (1995). Global biogeography—developments in palaeontology and stratigraphy. Elsevier,Arnoldsville.

Cox, C.B. & Moore, P.D. (2010).Biogeography: An Ecological and Evolutionary Approach. Wiley; 8th edition.

Gebruck, A., Southward, E. & Taylor, P. (1997). Advances in Marine Biology, Volume 32: The Biogeography of theOceans. Academic Press.

Stenseth, N., Ottersen, G., Hurrell, JW & Belgrano, A. (2005) Marine Ecosystems and Climate Variation: TheNorth Atlantic: A Comparative Perspective. Oxford University Press.Neal, D. (2004). Introduction to population biology. Cambridge University Press.

Anexo IV ­ Biologia da Conservação Marinha

3.3.1. Unidade curricular:Biologia da Conservação Marinha

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Manuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos Santos

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Paulo Xavier Catry

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:1. Partindo dos conceitos essenciais da biologia da conservação, promover nos alunos a compreensão dosaspectos especiais da situação ecológica do meio marinho e a necessidade do equilíbrio entre a utilização dosrecursos e a protecção da biodiversidade marinha.2. Reforçar os conhecimentos sobre a distribuição da biodiversidade marinha e as regiões oceânicas.3. Preparar os alunos para a intervenção técnica em situações de regulação de actividades extractivas no meiomarinho, gestão de Áreas Marinhas Protegidas e noutros contextos relacionados com a conservação dabiodiversidade marinha.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:1. Starting from the essential concepts of conservation biology, to promote in students an understanding of thespecial aspects of the ecological situation in the marine environments, and the need to obtain a balance betweenthe use of resources and the protection of marine biodiversity.2. To increase knowledge on the distribution of marine biodiversity and oceanic zones.3. To prepare the students for technical interventions in situations of regulation of extractive activities in themarine environment, in the management of Marine Protected Areas and in other contexts related to marinebiodiversity conservation.

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Introdução à biologia da conservação; a necessidade de proteger a biodiversidade marinha.2. Padrões de distribuição de espécies, populações e metapopulações nos ambientes marinhos e suasconsequências.3. Grandes ecossistemas marinhos, eco­regiões e sub­regiões; A importância da noção de escala nasestruturas e nos processos ecológicos; valor e limitações da zonação.4. Extinções (naturais e antropogénicas) e espécies chave nos ecossistemas marinhos.5. Ameaças à biodiversidade marinha: sobre­exploração, poluição, degradação dos habitats, espéciesinvasoras e alterações climáticas globais.6. Estratégias para a conservação marinha e principais aspectos biológicos relevantes; a necessidade dasÁreas Marinhas Protegidas, suas vantagens e limitações.7. Regulação das pescarias e outras actividades extractivas; intervenções ao nível dos produtores comostakeholders, dos mercados, dos consumidores e dos decisores políticos.

3.3.5. Syllabus:1. Introduction to conservation biology; the need to protect marine biodiversity.2. Patterns in the distribution of species, populations and metapopulations in the marine environments and theirconsequences.3. Large marine ecosystems, eco­regions and sub­regions; the importance of the notion of scale in ecologicalstructures and processes; value and limitations of zonation.4. Extinctions (natural and anthropogenic) and key species in marine ecosystems.5. Threats to marine biodiversity: overexploitation, pollution, habitat loss and degradation, invasive species andglobal climate change.6. Strategies for marine conservation and their main biological aspects; the need for Marine Protected Areas

and their limitations.7. Regulation of fisheries and other extractive activities; dealing with producers as stakeholders, with marketand consumers, and with policy makers.

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

O programa desta Unidade Curricular está organizado em torno de 7 tópicos que cobrem as principais questõesrelativas à conservação da biodiversidade marinha, desde os conceitos básicos da biologia da conservação atéàs estratégias de gestão de Áreas Marinhas Protegidas, passando pela forte contextualização ecológica dadistribuição dos organismos e dos processos biológicos no meio marinho. A questão das possibilidades deintervenção técnica nas situações reais em que a proteção dos recursos é crítica toma uma importânciaespecial nesta Unidade Curricular.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The syllabus of this curricular unit is organized around 7 topics that cover the main issues related to theconservation of marine biodiversity, from the basic concepts of conservation biology to the managementstrategies of Marine Protected Areas, with strong ecological framing of the distribution of marine organisms andof the biological processes in the marine environment.The possibilities of technical intervention in real situations where resource protection is critical becomesespecially important in this curricular unit.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Os conceitos teóricos e as suas ilustrações práticas serão discutidos em ambiente de sala de aula no contextodas aulas teóricasHaverá visitas de estudo a 3 Áreas Marinhas Protegidas ou regiões costeiras de especial interesse em termosde conservação (ex. Arrábida, Berlengas e Sudoeste Alentejano).A avaliação será baseada em trabalhos de pequenos grupos sobre duas temáticas diferentes por grupo, aserem apresentados e discutidos nas aulas teórico­práticas.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):Theoretical concepts and their practical illustrations will be discussed in the classroom during the theoreticalclasses.Field visits will be made to 3 Marine Protected Areas or coastal regions of special interest in terms ofconservation (eg. Arrábida, Berlengas and Sudoeste Alentejano).Evaluation will be based on small­group projects on two different themes per group, to be presented anddiscussed in the practical­theoretical classes.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Uma abordagem fortemente baseada na apresentação de exemplos concretos, e aberta à participaçãointeractiva dos alunos com o docente, será a mais indicada para a aquisição das competências econhecimentos expressos nos objectivos da Unidade Curricular. O trabalho de campo e a visita a locais de especial interesse são essenciais para o alcance dos objectivos maisaplicados da Unidade Curricular.A formação de pequenos grupos (2­3 alunos) para a pesquisa dos recursos bibliográficos e electrónicosdisponíveis permitirá a exploração dos temas de uma forma mais criativa, enriquecedora da sua formação eaté de maior interesse para os docentes. No entanto, cada elemento dos grupos estará sujeito a um escrutíniooral durante as apresentações dos trabalhos, que permitirá uma apreciação da profundidade dosconhecimentos adquiridos acerca da biologia da conservação marinha e também a sua partilha por todo ogrupo.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

An educational approach strongly based on the presentation of real situations, and open to the interactiveparticipation of all students with the lecturer, will be the most suited to the acquisition by the students of theknowledge and competencies expressed in the curricular unit’s objectives.Field work and visits to special interest sites are essential to the achievement of the more applied objectives ofthis curricular unit.Small groups (of 2­3 students) will research the literature and the electronic resources available in a morecreative way, with more potential interest for the students and even for the lecturer. However, each student willhave to display, during the oral presentations in class, the depth of the knowledge acquired concerning marineconservation biology, and that knowledge will thus be shared with the whole group.

3.3.9. Bibliografia principal:Gubbay, S. (Ed.) (1995). Marine Protected Areas. Principles and Techniques for Management. London: Chapman

& Hall.

Kritzer, J. P. & Sale, P. F. (Eds) (2006). Marine Metapopulations. Amsterdam: Elsevier.

Nybakken, J. W. (2001). Marine Biology. An Ecological Approach, 5th Ed. San Francisco: Benjamin Cummings.

Pullin, A. S. (2002). Conservation Biology. Cambridge University Press.

Roff, J. & Zacharias, M. (2011). Marine Conservation Ecology. London: Earthscan.

Anexo IV ­ Desenho Experimental e Análise Avançada de Dados Ecológicos

3.3.1. Unidade curricular:Desenho Experimental e Análise Avançada de Dados Ecológicos

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):João Paulo Maroco Domingos

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Regina Maria Baltazar Bispo Carita

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Descrever os delineamentos experimentais mais comuns em Investigação em EcologiaDescrever técnicas avançadas de análise estatística multivariada com aplicação a dados ecológicosOs alunos irão desenvolver competências no planeamento e análise de projetos experimentais aplicados àInvestigação em EcologiaOs alunos irão desenvolver competências na utilização de técnicas de análise estatística multivariada aplicadaà Ecologia

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:To describe the major experimental designs in Ecological ResearchTo describe advanced multivariate statistical analysis techniques with application to Ecological DataStudents will develop competences in the planning and analysis of experimental designs applied to EcologicalResearchStudents will develop competences in the use of multivariate statistical analysis techniques as applied toEcological Research

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Introdução1.1. Estratégia de Experimentação1.2. Conceitos básicos1.3. Directrizes para o planeamento de experiências1.4. Algumas aplicações de desenho experimental2. Principais tipos de delineamento experimental2.1. Processos comparativos simples2.2. Processos com factor único2.3. Experiências em blocos aleatórios, quadrados latinos e quadrados greco­latinos 2.4. Desenhos factoriais2.5. Desenhos aninhados e Split­plot 3. Técnicas estatísticas exploratórias multivariadas3.1. Análise de Componentes Principais3.2. Análise de Clusters3.3. Escalonamento multidimensional3.4. Análise Discriminante

3.3.5. Syllabus:1. Introduction1.1. Strategy of Experimentation1.2. Basic Concepts1.3. Guidelines for the design of experiments1.4. Some applications of experimental design2. Major experimental designs 2.1. Simple comparative experiments

2.2. Single factor experiments2.3. Randomized Block designs , Latin Squares and Greco­Latin Squares2.4. Factorial Designs2.5. Nested and Split­plot designs3. Multivariate Exploratory Statistical techniques3.1. Principal Component Analysis3.2. Cluster Analysis3.3. Multidimensional Scaling3.4. Discriminant Analysis

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

O programa é composto por temas de delineamento experimental e análise avançada de dados multivariados.O objectivo é dar aos alunos a capacidade de planear experiências em investigação ecológica e fazer a análisedos dados respectivos.Começa por se introduzir os estudantes às diferentes estratégias de planeamento e desenho de experiênciasem ecologia, dando exemplo de diferentes estudos onde são aplicados diferentes tipos de desenhosexperimentais e discutidas as regras básicas de delineamento de experiências em ecologia. De seguida, sãosistematizados de forma mais específica alguns dos principais tipos de desenhos experimentais em ecologia,nomeadamente, processos comparativos simples, de factor único ou em blocos. Detalha­se o desenho emblocos aleatórios, quadrados latinos e greco­latinos. Serão depois apresentados e discutidos diferentes tiposde desenhos experimentais factoriais, aninhados (nested) e split plot. Após consolidação dos conceitos eaplicações dos diferentes tipos de desenhos experimentais, serão apresentados aos alunos os principais tiposde estratégias de tratamento de dados multivariados, nomeadamente as análises de componentes principais,de clusters, o escalonamento multidimensional e a análise discriminante. Com estes conteúdos será fornecida aos alunos uma sólida base teórica sobre estratégias de planeamento deexperiências em ecologia e de tratamento de dados ecológicos, com uma abundante apresentação deexemplos e casos de estudo que serão apresentados pelos alunos em grupo em contexto de sala de aula.Desta forma, cumprem­se os principais objectivos propostos para esta unidade curricular.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The syllabus is composed of themes in experimental design and advanced multivariate data analysis that willgive students the ability to plan experiments in Ecological research and perform data analysis.It will start by introducing the students to the different strategies of planning and experimental design in ecology,using as examples different studies where different experimental design types are applied and the basic rules ofplanning experiments in ecology are discussed. Next, some of the types of experimental designs in ecology aresystematized in a more specific way, namely, Simple comparative experiments, of single factors and in blocks.Randomized block designs, latin squares and greco­Latin squares are detailed. Then, different types of factorial,nested and split­plot designs are presented and discussed. After the consolidation of concepts and applicationof the different types of experimental designs students will learn the main types of multivariate data treatmentprocesses, namely principal component analysis, cluster analysis, multidimensional scaling and discriminantanalysis.These contents will provide to the students a solid theoretical basis on strategies for experimental planning ofexperiments in ecology and data treatment of ecological data, with a profusion of examples and case­studiesthat will be presented by the students in groups in classroom context. This way, the main objectives proposedfor this curricular unit are fulfilled.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):As aulas serão teóricas e teórico­práticas (com recurso a laboratórios de informática e software de análiseestatística). Os alunos serão chamados a resolver problemas práticos relacionados com o planeamento eanálise de experiências, bem como a efectuar análise de dados reais (usando sempre que possível dadosoriginais de investigação realizada na Unidade de Investigação em Eco­Etologia do ISPA) usando os softwareestatísticos (SPSS Statistics, Primer­E e R). Avaliação dos alunos será feita testando os conceitos teóricosnum exame, bem como em avaliações praticas (trabalhos de grupo e relatórios) usando software de análiseestatística nas aulas teórico­práticas.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):Lectures will be both theoretical and practical­theoretical (computer labs). Students will be proposed to solvespecific problems related to the planning and analysis of experiments as well as do real­data analysis (using asmuch as possible data originated from the research performed at the Eco­Ethology Research Unit of ISPA)using statistical software (SPSS Statistics, Primer­E and R). Evaluation of students will be done by testingtheoretical concepts in an exam as well as hands­on data analysis using statistical software in the practical­theoretical classes.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Teaching methodologies will include both theoretical classes to provide students the theoretical background ofexperimental design and data analysis of ecological experiments as well as hands­on computer lab practicesand group work. These two approaches will increase student theoretical competences as well as theircompetences to plan experiments, gather data and do their own data analysis.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

As metodologias de ensino incluirão quer aulas de exposição teórica (com o objetivo de transmitir aos alunosos fundamentos teóricos do desenho experimental e da análise de dados ecológicos) quer aulas práticas ondeserão resolvidos exercícios práticos no laboratório de informática e trabalhos de grupo. Estas duas abordagenstrarão aos estudantes competências teóricas de planeamento de experiências, bem como competências aonível do planeamento de experiências e da recolha e análise de dados.

3.3.9. Bibliografia principal:Maroco, J. (2011). Análise Estatística com o SPSS Statistics. 5a. Ed. ReportNumber, Pero Pinheiro, 990p.Montgmorey, D. (2009). Design and Analysis of Experiments. 7th. Ed. John wiley & Sons. LondonScheiner, S. M. & Jessica, G.(Eds) (2001). Design and Analysis of Ecological Experiments. 2nd Ed. OxfordUniversity Press. NewYork.

Anexo IV ­ Ecologia Comportamental e Sociobiologia

3.3.1. Unidade curricular:Ecologia Comportamental e Sociobiologia

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Maria Leonor Santos Galhardo

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Esta Unidade Curricular tem como objectivo apresentar a Ecologia Comportamental e a Sociobiologia como aciência que estuda os aspectos biológicos do comportamento animal e das interacções sociais entre osindivíduos numa perspectiva evolutiva e ecológica. Pretende­se ainda demonstrar a relevância do estudo docomportamento animal para a biologia da conservação, em particular do meio marinho. No final deste curso osalunos deverão estar aptos a:­ debater temas actuais de investigação em Ecologia Comportamental e Sociobiologia;­ avaliar de forma crítica a literatura primária relevante desta área;­ comunicar ideias e resultados de investigação oralmente, por escrito, e através da utilização de meios audio­visuais;­ compreender os mecanismos biológicos subjacentes ao comportamento e como estes estão sujeitos aprocessos evolutivos e ecológicos;­ compreender as implicações do estudo do comportamento para a Biologia da Conservação.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:The goal of this curricular unit is to introduce Behavioral Ecology and Scobiology as the science that studies thebiological aspects of animal behavior and of social interactions among individuals on an evolutionary andecological perspective. It is our aim also to demonstrate the implications of animal behavior for conservationbiology and wildlife management, in particular for marine species and environments. At the end of this coursestudents should be able to:­ discuss current research topics in Behavioral Ecology and Sociobiology;­ evaluate in a critical way original research papers in the area;­ communicate ideas and research data orally, in written form, and through the use of audio­visual support;­ understand the biological mechanisms underlying animal behavior and how these are part of ecological andevolutionary processes;­ understand the implications of the study of animal behavior for Conservation Biology.

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Introdução ao estudo do comportamento animal1.1. O estudo do comportamento como disciplina interdisciplinar e integrativa1.2. Genética do comportamento1.3. Aprendizagem, memória e cognição animal

1.4. Selecção natural, adaptação e comportamento1.5. Evolução e Comportamento2. Ecologia comportamental2.1. Relógios biológicos e ciclos de comportamento. 2.2. Selecção de habitats, orientação e navegação.2.3. Comportamento alimentar2.4. Comportamento anti­predatório3. Sociobiologia3.1. Comportamento reprodutor e selecção sexual3.2. Cuidados parentais e sistemas de acasalamento3.3. Comunicação animal3.4. Agressão e conflito3.5. Vida em grupo, altruismo e cooperação4. Comportamento Conservação e Gestão da Vida Selvagem4.1. Selecção de habitats4.2. Estratégias alimentares4.3. Comportmento anti­predatório4.4. Comunicação acústica4.5. Consequências demográficas da socialidade4.6. Consequências demográficas da selecão sexual e comportamento reprodutor

3.3.5. Syllabus:1. An introduction to the study of animal behaviour1.1. The study of behaviour as an interdisciplinary and integrative subject1.2. Genetics of behaviour1.3. Learning, memory and animal cognition1.4. Natural selection, adaptation and behaviour1.5. Evolution and behaviour2. Behavioural Ecology2.1. Biological clocks and behavioural cycles 2.2. Habitat selection, mechanisms of orientation nand navigation2.3. Foraging behaviour2.4. Antipredator behaviour3. Sociobiology3.1. Reproductive behaviour and sexual selection3.2. Parental care and mating systems3.3. Animal communication3.4. Agression and conflict3.5. Group living, altruism e cooperation4. Behaviour, Conservation and Wildlife Management4.1. Habitat Selection4.2. Foraging Behavior4.3. Antipredator Behavior4.4. Acoustic Communication4.5. Demographic Consequences of Sociality4.6. Demographic Consequences of Sexual Selection and Reproductive Behavior

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

O programa da cadeira está organizado em 4 módulos temáticos que cobrem os diferentes aspectos da biologiado comportamento, numa perspectiva evolutiva e ecológica, e a sua aplicação à Conservação. No primeiromódulo (Introdução) do programa apresentam­se os conceitos básicos do estudo do comportamento animal. Éintroduzido o conceito fundamental dos diferentes níveis de análise do comportamento que reflectem dois tiposdistintos de questões ­ o “Porquê” (a função e a evolução dos comportamentos) e o “Como” (i.e. odesenvolvimento e os mecanismos causais do comportamento), salientando­se assim a naturezainterdisciplinar e integrativa do estudo do comportamento. De seguida são abordados os mecanismos docomportamento na sua vertente genética e de aprendizagem e processos cognitivos. Este módulo termina comuma perspectiva evolutiva sobre o valor adaptativo do comportamento e a sua abordagem filogenética. Nosegundo módulo (Ecologia Comportamental) são abordados temas que ilustram o papel central docomportamento para a sobrevivência dos indivíduos, nomeadamente os aspectos ligados à organizaçãotemporal e espacial do comportamento, a encontrar e obter alimento e a evitar predadores. O terceiro módulo(Sociobiologia) incide sobre o estudo das interacções sociais e da organização social nos animais quer emcontextos de reprodução (sistemas de acasalamento, selecção sexual) e cuidados parentais, quer emcontextos sociais (cooperação e conflicto). No quarto e último módulo iremos aplicar os conhecimentosadquiridos nos módulos anteriores a problemas específicos de Conservação e gestão de vida selvagem,ilustrando deste modo a relevância da Ecologia Comportamental e da Sociobiologia para estas áreas. Como resultado no final do curso, e para além das competências genéricas descritas acima, os alunos devemser capazes de:

­ identificar os quatro níveis de análise utilizados no estudo do comportamento: mecanismos causais,desenvolvimento, evolução e função;­ estar familiarizados com o facto dos comportamentos e os seus mecanismos de controle estarem sujeitosaos mesmos processos básicos de evolução que afectam outros traços fenotípicos;­ ter uma visão crítica sobre as possiblidades e limitações do estudo científico do significado adaptativo docomportamento.­ utilizar o estudo do comportamento animal como ferramenta na conservação e gestão de vida selvagem.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The syllabus of this course is organized into four thematic modules that cover different aspects of the biology ofbehavior, from an evolutionary and ecological perspective, and their application to conservation. In the firstmodule (Introduction) the basics of animal behavior will be presented. The fundamental concept that behaviorcan be analyzed at different levels that reflect “Why” and “How” questions (i.e. the function and evolution ofbehavior vs. the development and the causal mechanisms of behavior), highlighting the integrative andinterdisciplinary nature of behavioral biology. The mechanisms of behavior, from genetics to learning andcognitive processes, will then be discussed. This module ends with an evolutionary perspective on the adaptivevalue of behavior and the phylogenetic approach to behavior. The second module (Behavioral Ecology) willfocus on topics that illustrate the central role of behavior for the survival of individuals, including aspects relatedto temporal and spatial aspects of behavior, finding and obtaining food and avoiding predators. The third module(Sociobiology) focuses on the study of social interactions and social organization in animals both in contexts ofreproduction (mating systems, sexual selection) and parental care, and in social contexts (cooperation andconflict). In the fourth and final module we will apply the knowledge acquired in previous modules to specificproblems of conservation and wildlife management, thereby illustrating the relevance of Behavioral Ecology andSociobiology for these areas.As a result at the end of the course, and beyond the general skills described above, students should be able to:­ Identify the four levels of analysis used in the study of behavior: causal mechanisms, development, evolutionand function;­ Be familiar with the fact that the behavior and its underlying mechanisms are subject to the same basicprocesses of evolution that affect other phenotypic traits;­ Have a critical view of the possibilities and limitations of the scientific study of the adaptive significance ofbehavior.­ Use the study of animal behavior as a tool in conservation and wildlife management.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Para cada tópico do programa existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:1. uma lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente;2. uma exposição oral pelo docente dos conceitos básicos e das abordagens experimentais para esse tópico;3. um “journal club” no qual os alunos apresentam e discutem artigos de investigação referentes aos temas dotópico em questão.4. tutorias nas quais o docente pode orientar os alunos na pesquisa de artigos para apresentar e discutir no“journal club”.Existirá um website dedicado a esta unidade curricular no qual serão disponilizados os materiais de apoio (e.g.programa, material audiovisual de apoio às aulas, artigos para o “journal club”, regras de funcionamento,calendário lectivo, métodos de avaliação, etc.). Será utilizado um método de avaliação contínuo baseado naapresentação e discussão de artigos, na participação nas aulas e em ensaios escritos sobre temas dos tópicosdo programa.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):For each topic of the syllabus the following learning tools will be used:1. a list of recommended references that students should read in advance;2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and experimental approaches for eachtopic;3. a "journal club" in which students present and discuss research papers related to the themes of the syllabus.4. tutorials in which the teacher can guide students in searching for research papers to be presented anddiscussed at the "journal club".There will be a dedicated website to this course in which supporting materials will be made available (e.g.syllabus, audiovisual materials to support lessons, articles for the "journal club", rules and procedures,academic calendar, evaluation methods, etc.). A continuous assessment method will be used based on thepresentation and discussion of articles, participation in lectures, and writing of written essays on topics of thesyllabus.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os métodos de ensino descritos acima pretendem promover um estilo de aprendizagem activo nos alunos,através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, e responsabilizando os alunos pelapesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma.É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmica da

propagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação e formaçãode uma opinião esclarecida sobre um tema. Finalmente, a introdução de métodos de ensino focados naaprendizagem cooperativa promovem a capacidade dos alunos trabalharem eficazmente em contexto de grupo,contribuindo para diminuir o ambiente competitivo entre os estudantes e para aumentar a sua auto­confiança.Todos estes aspectos são coerentes com os objectivos genéricos expressos acima.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

The teaching methods described above are intended to promote an active learning style in students byintroducing moments of discussion in class, promoting the research on specific issues on which studentsshould inform the class. It will also be valued the reading of primary sources as a means for students tounderstand the dynamics of the spread of scientific information and to promote a proactive approach insearching for information and formation of an informed opinion on a given topic. Finally, the introduction ofteaching methods focused on cooperative learning will promote the students' ability to work effectively in agroup setting, contributing to reduce the competitive environment among students and increase their self­confidence. All these aspects are consistent with the general objectives outlined above.

3.3.9. Bibliografia principal:1. Livros de texto:­ Blumstein D.T., Fernandez­Juricic E. (2010). A Primer of Conservation Behavior. Sinauer Associates Inc.­ Goodenough J., McGuire B., Jakob E. (2009). Perspectives on Animal Behavior, 3rd ed. John Wiley & Sons.

2. Leituras aprofundadas:­ Caro T., Ed.(1998). Behavioral Ecology and Conservation Biology. Oxford University Press.­ Clemmons J.R., Buchholz R., Eds. (1997). Behavioral Approaches to Conservation in the Wild. CambridgeUniversity Press.­ Gosling L.M., Sutherland W.J., Eds. (2000). Behaviour and Conservation. Cambridge University Press.­ Székely T., Moore A.J., Komdeur J., Eds. (2010). Social Behaviour: Genes, Ecology and Evolution. CambridgeUniversity Press.­ Westneat D., Fox C., Eds. (2010). Evolutionary Behavioral Ecology. Oxford University Press.

3. Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade.(3. Reviews and original research papers from scientific journals)

Anexo IV ­ Genética Aplicada de Populações Marinhas

3.3.1. Unidade curricular:Genética Aplicada de Populações Marinhas

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Joana Isabel Espírito Santo Robalo

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Carla Patrícia Cândido de Sousa Santos

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Os objectivos visam introduzir os vários domínios da genética marinha, da filogeografia à genómica, eapresentar as técnicas laboratoriais e estatísticas mais usadas actualmente na área. O aluno deverá adquirircompetências no domínio da extracção e amplificação de ADN e edição de sequências e leitura demicrossatélites. Deverá igualmente familiarizar­se com o software de análise filogenética, a análise decoalescência e de redes de haplótipos, aplicando esses conhecimentos à avaliação do tamanho efectivo daspopulações, à identificação de stocks e à detecção de barreiras que afectam o fluxo genético. Pretende­se queo estudante possa aplicar os conhecimentos teóricos e as ferramentas moleculares e de análise em situaçõespráticas como a gestão de stocks, identificação da biodiversidade críptica e o delineamento de instrumentos deconservação de espécies e habitats. Deverá compreender a utilização da genética na descoberta de novosrecursos com potencial biotecnológico.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:The objectives aim to introduce students to various fields of marine genetics, from phylogeography togenomics, and to present the laboratory and statistical techniques commonly used today in the area. Thestudent should acquire skills in the field of extraction and amplification of DNA sequences and editing andreading of microsatellites. It should also become familiar with the software of phylogenetic analysis, the analysisof networks and coalescence of haplotypes, applying this knowledge to evaluate the effective size of

populations, stock identification and detection of barriers that affect gene flow. It is intended that the student canapply the theoretical knowledge and molecular tools and analysis in practical situations such as stockmanagement, identification of cryptic biodiversity and the design of instruments for the conservation of speciesand habitats. It should understand the use of genetics in the discovery of new resources with biotechnologicalpotential.

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Conceitos básicos em genética de populações2. Conceitos básicos sobre as técnicas moleculares aplicadas à biologia das populações marinhas3. Principais padrões filogeográficos das populações marinhas4. Os métodos de coalescência e a utilização de marcadores genéticos para avaliação do tamanho e estruturadas populações 5. Genética aplicada à identificação de recursos marinhos e seus derivados6. Genética aplicada à identificação da biodiversidade e conservação7. Genómica e transcriptómica e a sua utilização na identificação de recursos com potencial biotecnológico.

3.3.5. Syllabus:1. Basic concepts in population genetics2. Basics on the techniques applied to molecular biology of marine populations3. Phylogeographic patterns of the major marine fish stocks4. The methods of coalescence and the use of genetic markers to assess the size and structure of populations5. Genetics applied to the identification of marine resources and their derivatives6. Genetics applied to the identification and conservation of biodiversity7. Genomics and transcriptomics and its use in identifying resources with biotechnological potential.

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os objectivos desta unidade curricular visam introduzir os estudantes aos vários domínios da genéticamarinha, da filogeografia à genómica, e familiarizá­los com as técnicas laboratoriais e estatísticas mais usadasactualmente na área.Serão abordados os conceitos básicos em genética de populações assim como as técnicas molecularesaplicadas à biologia das populações marinhas. Posteriormente serão apresentados os principais padrõesfilogeográficos das populações marinhas assim como os métodos de coalescência e a utilização demarcadores genéticos para avaliação do tamanho e estrutura das populações. Serão também discutidos osaspectos da genética aplicada à identificação de recursos marinhos e seus derivados e à identificação dabiodiversidade e conservação. Finalmente os avanços na genómica e transcriptómica e a sua utilização naidentificação de recursos com potencial biotecnológico serão também abordados.O programa desta unidade curricular é, como se poderá constatar confrontando­o com os objectivos, umaconcretização directa dos mesmos. Cada objectivo corresponde a um grupo de aulas teórico­práticas em queem paralelo com os conceitos teóricos serão explorados e discutidos os aspectos práticos de cada temática.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The objectives of this course aim to introduce students to various fields of marine genetics, phylogeography ofgenomics, and to familiarize them with the laboratory and statistical techniques commonly used today in thearea.It will examine the basic concepts in population genetics and molecular techniques applied to the biology ofmarine populations. Later we will present the main phylogeographic patterns of marine populations andcoalescence methods and the use of genetic markers to assess the size and structure of populations. Are alsodiscussed aspects of genetics applied to the identification of marine resources and derivative products and theidentification and conservation of biodiversity. Finally, advances in genomics and transcriptome and its use inidentifying resources with biotechnological potential will be addressed.The program of this course is how we will see by comparing it with the direct targets of such an achievement.Each objective corresponds to a group of practical­theoretical lectures in which, in parallel to the presentation oftheoretical concepts, the different applications of each theme will be explored and discussed.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Com base na lista bibliográfica e em artigos de revisão específicos fornecidos atempadamente, será feito paracada tópico: i) uma apresentação oral pelo docente dos conceitos básicos e assuntos actualmente emdiscussão; ii) um ‘journal club’ no qual os alunos apresentam e discutem artigos ou capítulos de revisãorelativos aos temas em discussão; iii) tutorias de orientação dos alunos para apresentar e discutir as temáticasno “journal club”.A componente prática das aulas teórico práticas será ainda composta por aulas de: procedimentosmoleculares em laboratório (extracção de ADN, PCR, RFLPs); análise de dados em computador (edição ealinhamento de sequências, análise filogenética, análise filogeográfica e demográfica com os diferentespacotes de software actualmente considerados mais interessantes). Um pequeno projecto de investigaçãodecorrerá ao longo do semestre. A avaliação será contínua valorizando a participação dos estudantes nas

aulas práticas e nas discussões temáticas.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):Based on the general list of references and review articles provided previously, for each topic: i) an oralpresentation by the lecturer of basic concepts and issues currently under discussion; ii) a 'journal club' in whichstudents present and discuss review articles or chapters on topics under discussion; iii) tutorial orientation ofstudents to present and discuss the themes in the "journal club".The practical component of the theoretical­practial classes will also be complemented with classes of:­ molecular procedures in the laboratory (DNA extraction, PCR, RFLPs)­ data analysis using computers (editing, sequence alignment, phylogenetic, phylogeographic and demographicanalysis with different software packages currently considered the most interesting).A small research project will be chosen to the class, and will be built throughout the semester.The evaluation will be continuous, considering the participation of students in classes and in thematicdiscussions.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os métodos de ensino descritos acima pretendem promover um estilo de aprendizagem activo nos alunos,através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, e responsabilizando os alunos pelapesquisa de determinados temas que serão depois apresentados e discutidos com toda a turma.É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmica dapropagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação e formaçãode uma opinião esclarecida sobre um tema. Todos estes aspectos são coerentes com os objectivos genéricosexpressos acima.Esta estratégia de ensino potencia a aplicação dos conceitos teóricos e metodologias transmitidas a casos deestudo e situações aplicadas sendo esta uma área extremamente dinâmica e de grande relevância no âmbitoda conservação de populações marinhas.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

The teaching methods described above is intend to promote an active learning mode among the students,through the introduction of discussion moments within each class, and by assigning student chores forresearching specific issues and then informing the class mates on these. It is also valued the reading of primarysources as a mean for students to understand the dynamics of the scientific information spread and in order topromote a higher proactive attitude regarding literature research and the building up of an informed opinion onspecific topics. All these aspects are consistent with the generic objectives expressed above.This teaching strategy amplifies the application of theoretical concepts and methodologies transmitted duringthe classes to case studies and applied situations, being this an extremely dynamic area of great relevant to theconservation of marine populations.

3.3.9. Bibliografia principal:Page RDM & Holmes EC (1998) Molecular Evolution: A Phylogenetic Approach. Blackwell Science, Oxford, U.K.

Salemi M & Vandamme A.M (2003) The Phylogenetic Handbook. A Practical Approach to DNA and ProteinPhylogeny. Cambridge University Press.

Cock JM, Tessmar­Raible, K. Boyen, C. & Viard, F. (eds) (2010). Introduction to Marine Genomics (Advances inMarine Genomics). Springer

Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade.(Reviews and original research papers from scientific journals)

Anexo IV ­ Biologia e Conservação de Aves e Répteis Marinhos

3.3.1. Unidade curricular:Biologia e Conservação de Aves e Répteis Marinhos

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Paulo Xavier Catry

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Maria Ana Figueiredo Peixe Dias

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Introduzir aspectos gerais da biologia e da ecologia das aves e dos répteis marinhos (particularmente astartarugas marinhas). Familiarizar os alunos com os grandes temas da ciência ornitológica e herpetológica emecossistemas marinhos, particularmente aqueles que têm relevância para a conservação da biodiversidade epara a monitorização dos oceanos. Dar a conhecer instrumentos e realidades ajustados aos contextosnacionais (sem perder a visão global) que permitam aos alunos vir a realizar investigação fundamental ouaplicada nestes domínios. Os alunos deverão conhecer as principais características ecológicas ecomportamentais das aves e das tartarugas marinhas, e a forma como elas as expõem às grandes ameaçasdo nosso tempo, tais como a introdução de espécies em ilhas, as pescas acessórias, a sobrepesca e asalterações climáticas. Deverão também conhecer e ser capazes de discutir quais as principais metodologiaspara o estudo e as técnicas e estratégias de conservação mais adequadas.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:To give a general overview of the biology and ecology of seabirds and marine reptiles (particularly sea turtles).To introduce the broad subjects of seabird and marine turtle science, particularly those with a relevance formonitoring and biodiversity conservation. To familiarize students with information and tools relevant in thePortuguese context (without loosing a broader, global perspective) that may allow them to incorporate researchor conservation programs. Students will be asked to learn the main ecological and behavioural traits of seabirdsand sea turtles, and the way those make them vulnerable to global threats such as species introductions,bycatch, overfishing and climate change. Students should also know and be able to discuss the main researchmethods and the main techniques and conservation strategies relevant for those groups.

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Introdução ao mundo das aves e dos répteis marinhos.2. Adaptações anatómicas, fisiológicas e comportamentais à vida no mar.3. Ciclos de vida e estratégias reprodutoras.4. Diversidade e distribuição global.5. Ecologia espacial e migrações.6. Ecologia trófica e papel nos ecossistemas.7. Demografia (factores limitantes e regulação das populações). 8. Técnicas de estudo (censos, captura e marcação, determinação de parâmetros demográficos, seguimentoremoto de movimentos, uso de isótopos estáveis, dieta, obtenção de dados oceanográficos)9. As aves e as tartarugas marinhas enquanto indicadores biológicos e parte de sistemas integrados demonitorização e exploração sustentada dos recursos marinhos.10. Estatutos, tendências demográficas e grandes ameaças em Portugal e no mundo. 11. Iniciativas, técnicas e estratégias de conservação. As aves e as tartarugas enquanto “espécies­bandeira”para a conservação da biodiversidade e dos ecossistemas marinhos.

3.3.5. Syllabus:1. Introduction to the world of seabirds and marine turtles.2. Anatomical, physiological and behavioural adaptations to life in the ocean.3. Life cycles and reproductive strategies.4. Diversity and global distribution.5. Spatial ecology and migration.6. Feeding ecology, diet and roles in ecosystems.7. Demography (limiting factors and population regulation). 8. Study techniques (census, capture and marking, estimating demographic parameters, tracking, stableisotope tools, diet, oceanographic data)9. Seabirds and sea turtles as tools for environmental monitoring and as part of ecosystem­based marinemanagement.10. Status, demographic trends and the main threats in Portugal and worldwide. 11. Initiatives, techniques and strategies for conservation. Seabirds and sea turtles as flagship species for theconservation of biodiversity and ecosystem function.

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Para que os alunos possam adquirir competências que lhes permitam vir a integrar programas de investigação,de monitorização ou de conservação, é indispensável que, (1) conheçam as características gerais dosorganismos em causa, (2) estejam ao corrente do estado da arte e das questões ainda mal resolvidas, (3)compreendam quais os factores que condicionam a dinâmica populacional, (4) se apercebam das principaisameaças e dos seus efeitos e (5) conheçam as soluções de conservação já encontradas ou emdesenvolvimento, de forma a poderem replicá­las, adaptá­las e desenvolvê­las em circunstâncias particulares.Assim sendo, começaremos por apresentar as aves e os répteis marinhos (com destaque para as tartarugas),relembrando as características gerais dos grupos, e as particularidades das espécies que habitam os oceanos.A vida no mar e nas ilhas exigiu um conjunto assinalável de adaptações específicas que têm implicaçõespráticas para a demografia e a ecologia das espécies. Os ciclos de vida também apresentam características

particulares, implicando soluções evolutivas, bem como vulnerabilidades específicas destes vertebradosmarinhos. As aves e as tartarugas marinhas não apresentam uma diversidade muito alta, mas em termos debiomassa e de papel ecológico nalguns sistemas são muito relevantes. Têm, além disso, uma distribuiçãoextraordinariamente ampla. As aves são grandes consumidores de peixe e cefalópodes, ao passo que astartarugas herbívoras bem como as que comem esponjas podem ser consideradas “espécies­chave” emcertos ecossistemas costeiros. Quase todas estas espécies apresentam capacidade de realizar movimentosde uma amplitude surpreendente, ou mesmo excepcional, e isso condiciona toda a sua estratégia de vida, bemcomo a sua exposição a factores naturais ou outros, com origem nas actividades humanas. Um aspecto central na formação dos alunos será uma boa compreensão das características demográficas dosorganismos em questão. As aves marinhas, por exemplo, constituem um extremo evolutivo de estratégiasdenominadas “tipo­K”, de grande interesse científico, mas também com enormes implicações demográficas eem termos de biologia de conservação. Já as tartarugas marinhas juntam características demográficasaparentemente “contraditórias”, com uma elevada longevidade máxima, mas também uma grandefecundidade. Uma boa compreensão dos factores que regulam e limitam as populações é essencial, quer de umponto de vista académico, quer do ponto de vista aplicado.Será dada uma ênfase especial aos aspectos metodológicos na pesquisa com aves e tartarugas. Longe de seapresentar informações como factos consumados, procurar­se­á transmitir uma boa compreensão dosmétodos que conduzem às principais teorias. Isto facilitará o desenvolvimento de um bom espírito crítico bemcomo, evidentemente, um conhecimento de base que permitirá a integração dos alunos em futuros trabalhos deinvestigação ou de monitorização.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.In order to acquire the basic skills and knowledge allowing them to be incorporated in research or conservationprograms, students will have to (1) be familiar with the main characteristics of the relevant organisms, (2) beaware of the state of the art and of current gaps in knowledge, (3) understand the main factors regulatingpopulations, (4) identify the main threats and their effects and (5) learn about the main current conservationstrategies, so that they can replicate or adapt them to particular contexts.We will start by presenting seabirds and marine reptiles (focusing on sea turtles), reviewing the main features ofthese broad groups and the special traits that characterize the species living in the sea. Life at sea and onoffshore islands has required a number of specific adaptations that are not only interesting per se, but whichhave important implications in the demography and ecology of those species. Life cycles of marine forms alsopresent characteristics that have lead to specific evolutionary solutions, but also to vulnerabilities of thesemarine vertebrates. Seabirds and sea turtles do not present a large diversity of species, but their overallbiomass and their ecological role are relevant in marine ecosystems. Furthermore, these groups have a verywidespread distribution. Birds are important consumers of fish and squid, while sea turtles that feed on plants oron sponges often play a “keystone” role in coastal or reef ecosystems. Almost all species of seabirds andturtles are wide­ranging, often engaging in long­distance migrations that end up by shaping their life strategies,and also expose them to a diversity of environmental conditions, including anthropogenic threats.A central aspect of the teaching will revolve around demography themes. Seabirds, for example, are clear “K­strategists”, presenting a considerable scientific interest, but also presenting, for this same reason, a greatvulnerability to a number of specific threatening factors that depress adult survival. Sea turtles, on the otherhand, present somewhat “contradictory” demographic traits, such as a high adult survival rate, but also a largefecundity. A good understanding of the factors that regulate populations is mandatory, both from an academicpoint of view, but also for a successful application of management and conservation strategies.There will be a special focus on methodological issues. Instead of presenting knowledge as a finished packageof information, the students will understand how wisdom is acquired. This will help the development of the abilityto question and evaluate, and will provide students with basic knowledge that is essential for future integration inresearch and conservation teams.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Para cada tema, será feita uma apresentação expositiva pelo docente, que permita transmitir conhecimentosgerais sobre a matéria, profusamente ilustrados com exemplos específicos, escolhidos com base na suarelevância, mas também com uma ênfase na situação portuguesa ou nos PALOP. Serão convidadosinvestigadores, bem como técnicos especialistas com experiência prática para fazer curtas exposições sobretemas específicos. Serão dinamizados debates sobre questões relacionadas com ameaças e problemáticas deconservação. Serão visitadas colecções de museu, bem como colecções de referência utilizadas em estudosde dieta. Serão feitas saídas de campo extra­curriculares, que incluirão trabalhos práticos de identificação ecensos, bem como sessões de captura e manuseamento de aves e recolha de amostras biológicas.A avaliação terá uma componente baseada num exame, e outra baseada numa avaliação contínua daparticipação nas aulas e debates.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):For each subject, there will be oral presentations by the lecturer offering general information, sustained bynumerous specific examples, selected by criteria such as quality, interest, and relevance given thegeographical context of the students (special focus on Portugal and Portuguese speaking countries in Africa).Researchers and conservation practitioners will be invited to make short presentations during the courses.Debates will be organized where students will discuss conservation issues. We will visit museum collections, as

well as reference collections used for dietary studies. Short extra­curricular field courses will be organized,where students will practice identification, census methods, capture and handling of birds and collection ofbiological samples. The evaluation of the students will be based on a written exam. This will be complemented bya continuous evaluation during classes and debates.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os métodos escolhidos permitirão a transferência de uma quantidade apreciável de informação através dasexposições teóricas. O convite a especialistas para realizarem curtas palestras enriquecerá o contacto com asrealidades da ciência em causa. Os debates ajudarão a promover o sentido crítico e uma melhor compreensãodos diferentes pontos de vista. As sessões práticas reforçarão os conhecimentos teóricos, numa perspectivade uma maior familiarização com as realidades da investigação, além de prepararem os alunos para futurasaprendizagens mais complexas.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

The chosen teaching methodologies will allow the transfer of a considerable amount of information throughclassical lectures. The invited talks will enrich the students’ experience and allow contact with different realitiesand persons. Debates will help students to develop their own ideas and critically evaluate the options favouredby others. Practical sessions will reinforce theoretical learning, making students familiar with the routine ofresearch and monitoring, preparing them for further learning.

3.3.9. Bibliografia principal:Schreiber EA & Burger J (eds) 2002. Biology of Marine Birds. CRC Press, Boca Raton.

Podulka S, Rohrbaugh RW & Bonney R (eds.) 2004. Handbook of Bird Biology. 2nd Edition. Cornell Lab ofOrnithology.

Spotila JR 2004. Sea Turtles. A Complete guide to their Biology, Behaviour and Conservation. Johns HopkinsUniversity Press, Baltimore.

Sutherland W, Newton I & Green RE 2004. Bird Ecology and Conservation. A Handbook of Techniques. OxfordUniversity Press.

Catry P, Costa H, Elias G & Matias R 2010. Aves de Portugal. Ornitologia do Território Continental. Assírio &Alvim, Lisboa.

Catry P, Barbosa C & Indjai B 2010. Marine Turtles of Guinea­Bissau. Status, Biology and Conservation. Institutoda Biodiversidade e das Áreas Protegidas, Bissau.

Ramírez I, Geraldes, P, Meirinho A, Amorim P & Paiva V 2008. Áreas Importantes para as Aves Marinhas emPortugal. SPEA, Lisboa

Anexo IV ­ Biologia Larvar e Recrutamento

3.3.1. Unidade curricular:Biologia Larvar e Recrutamento

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Rita Alexandra Duarte Borges

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Emanuel João Flores GonçalvesAna Margarida da Silva Faria

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Pretende­se que os alunos compreendam a diversidade de estratégias vitais e de formas embrionárias elarvares, transições ontogenéticas relevantes, aspectos fundamentais da biologia larvar relacionados com aalimentação, crescimento, capacidades sensoriais e comportamentais, a importância da fase larvar naconectividade entre populações e na variabilidade do recrutamento, os mecanismos biofísicos envolvidos notransporte larvar, teoria metapopulacional e consequências no design e gestão de áreas marinhas protegidas(AMP) e de populações marinhas, os modelos de recrutamento e os principais métodos de estudo em biologia eecologia larvar.

Pretende­se que os alunos compreendam a importância do estudo da fase larvar e recrutamento,desenvolvendo capacidades de pesquisa e análise crítica da literatura relevante e o debate esclarecido sobreas temáticas abordadas, a sua aplicação a contextos de gestão das populações marinhas bem como atitudesde cooperação e respeito pelos colegas.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:It is intended that the students recognize the diversity of early life histories and stages, the relevant ontogenetictransitions, fundamental aspects of larval biology such as feeding, growth, sensorial and behaviouralcapabilities, the role of larvae as propagules connecting populations and affecting recruitment dynamics, thebiophysical mechanisms involved in larval transport and survival, the metapopulation theory and consequencesfor marine protected areas (MPA) network design, recruitment models and methods used in larval ecologicalstudies.In the end of the curricular unit, it is meant that students understand the relevance of investigating early lifehistory stages, in addition to developing skills for critical search and analysis of relevant literature and theinformed debate of the focused themes, as well as cooperation and respect attitudes among colleagues.

3.3.5. Conteúdos programáticos:1.Diversidade de estratégias vitais, estados embrionários e larvares e relações evolutivas 2. Porquê a existência de estados larvares pelágicos?3. Breve contexto histórico do estudo da biologia larvar 4. Ontogenia e desenvolvimento. Transições relevantes na morfologia, função e habitat5. Variabilidade e padrões nos estados iniciais do ciclo de vida6. Métodos de amostragem e identificação dos estados larvares7. Alimentação e condição nutricional8. Idade e crescimento: estudos e métodos9. Mecanismos sensoriais e estímulos ambientais10. Comportamento larvar11. Mecanismos biofísicos de transporte larvar12. Conectividade vs auto­recrutamento: teoria metapopulacional e consequências para a gestão13. Modelos de recrutamento14. Influência da fase larvar no sucesso do recrutamento15. O papel das AMP no aumento da abundância larvar e recrutamento

3.3.5. Syllabus:1. Diversity of marine eggs, embryos and larval forms and evolutionary relationships 2. Why the existence of a pelagic larval stage?3. Historical context of the study of larval biology4. Ontogeny and Development. Relevant transitions in form, function and habitat5. Variety and patterns in early life history6. Sampling and identification methods7. Feeding and nutritional condition8. Age and growth studies and methods9. Sensing the environment: cues and sensorial channels 10. Larval behaviour11. Biophysical mechanisms influencing dispersal12. Connectivity vs self­recruitment: metapopulation concept and consequences to management13. Recruitment models14. Relationship between early life history and recruitment success15. The role of MPA’s in larval supply and recruitment

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os tópicos propostos cobrem os aspectos mais relevantes da biologia larvar, recrutamento e possíveisaplicações para a conservação.Inicialmente é feito um enquadramento geral da diversidade de estratégias de reprodução, embriões e larvas,numa abordagem transversal e comparativa entre grupos taxonómicos, bem como possíveis relaçõesfilogenéticas. Discutem­se as teorias sobre a evolução de um estado larvar pelágico e faz­se umenquadramento histórico dos estudos sobre biologia larvar.Seguidamente abordam­se aspectos fundamentais da biologia larvar, como o desenvolvimento e as transiçõesontogenéticas no início do ciclo de vida de organismos marinhos, desde o ovo à metamorfose, focandoaspectos morfológicos e funcionais e as consequências de alterações de habitat. São também explorados ospadrões comuns e a variabilidade que pode ocorrer nas características vitais dos estados ontogenéticos. Emseguida aborda­se os métodos de amostragem de estados larvares, salientando a sua selectividade ecomplementaridade, bem como as características utilizadas na sua identificação morfológica. A utilidade econtrovérsia sobre o uso de novas técnicas de identificação molecular será também explorada, recorrendo­seà discussão de artigos. Explicam­se, seguidamente, os aspectos críticos relacionados com a alimentação daslarvas, as técnicas de estudo da condição nutricional, as aplicações em aquacultura, bem como a importância e

métodos dos estudos de determinação de idade e crescimento larvar. No tema seguinte será explorada aimportância das capacidades sensoriais na resposta a estímulos ambientais, bem como os aspectoscomportamentais relevantes ao longo da ontogenia que levam a questionar o paradigma dos estados larvarescomo elementos passivos do plâncton.Os tópicos seguintes centram­se na importância do transporte de estados pelágicos para a conectividade entrepopulações, fundamental para o estudo da dinâmica de populações costeiras. Serão abordados os factoresoceanográficos relevantes para a dispersão no oceano, a diferentes escalas, e os aspectos biológicosrelevantes, como os padrões de postura e eclosão e os efeitos maternais na qualidade dos estados pelágicos,ou de que forma os aspectos de biologia larvar podem interagir com factores físicos, alterando o transportelarvar. O grau de dispersão ou retenção e auto­recrutamento e a sua consequência para a gestão daspopulações costeiras é actualmente alvo de forte debate em ecologia marinha, pelo que serão abordadosestudos recentemente publicados em revistas relevantes, estimulando o debate científico entre os alunos.Aborda­se em seguida a diversidade de modelos de recrutamento de peixes e a possível influência dosuplemento larvar e da variabilidade das características larvares no sucesso do recrutamento.Finalmente destaca­se a aplicação e importância dos aspectos explorados para o delineamento e gestão deAMP e consequências para a conservação e gestão de populações marinhas.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The programme of this curricular unit is organised in topics covering the most relevant aspects of LarvalBiology, recruitment ecology and applications for conservation.The first modules explore general diversity of life histories and early forms through a taxonomical comparison.Theories to explain the appearance of a pelagic larval stage are discussed and the general historical context oflarval biology is introduced.Next, fundamental aspects of larval biology are explored. These include ontogenetic development from the eggto the juvenile stage, highlighting important morphological and functional transitions, as well as in habitat.Common patterns and variability in early life history traits are also explored.Afterwards, an overview of selective but complimentary larval sampling methods is provided, as well as of themajor morphological features useful in larval identifications. The current debate on the use of these classicalmethods versus molecular methods will be discussed with relevant literature. Critical aspects related with larval feeding and nutrition, age and growth studies and relevant methods andapplications are explained.The relevance of sensorial capabilities and the ability to sense and react to environmental cues and theontogeny of larval behaviour are explored as fundamental aspects providing evidence that challenges thetraditional view of larvae as passive elements in the plankton.The subsequent topics are centered in the role of marine pelagic larvae as propagules connecting coastalpopulations, which is of great importance to our understanding of coastal population dynamics. Majoroceanographic factors acting at different scales will be highlighted, as well as the biological correlates such asspawning patterns and maternal effects on larval condition or the interaction between larval traits and behaviorinteracting with the physical environment to change larval trajectories.The debate centered on the degree of larval dispersal or retention and the extent of self­recruitment is a hottopic in marine ecology; its importance and consequences to coastal population and marine protected areasmanagement will be explored by promoting the scientific discussion of recently published papers in the class.The importance of the supply­side to explain recruitment variability is later discussed in the context of the mostrelevant recruitment models, as well as the relationship between variability in early life history traits andrecruitment success.Finally, the importance of the previous topics to the design and management of marine protected areas ishighlighted, as well as the consequences of the focused patterns and processes to marine conservation andfisheries management.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Os conceitos serão expostos oralmente e com recurso a meios audio­visuais, com base na bibliografia geralfornecida. Serão adicionalmente utilizados estudos relevantes de revisão ou elucidativos de controvérsia nostemas em debate, que irão sendo actualizados. Serão organizados grupos para apresentação desses trabalhossobre os assuntos em discussão, que serão debatidos em grupo. Pretende­se que os alunos sejam capazes depesquisar de forma autónoma e analisar de forma crítica os assuntos abordados nos trabalhos em discussão,bem como as metodologias e análises de resultados. Estas apresentações serão orientadas em tutorias.Os materiais de apoio (programa, material audiovisual, artigos e outra bibliografia, regras de funcionamento,calendário lectivo, métodos de avaliação, etc.) serão disponibilizados num website. A avaliação será baseadana apresentação e discussão de artigos, na participação nas aulas e em ensaios escritos sobre os temasabordados.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):Based on the general reference list provided to the students and in specific reviews or relevant paperspreviously made available, for each topic there will be an oral presentation by the lecturer, with audio­visualresources to explore the basic concepts and hot topics currently under discussion. Additionally, student groupswill present and critically discuss in the class relevant updated studies about the topics under analysis, aftersearching more relevant information on the topic; there will be tutorial guidance of students to present and

discuss these studies.All support materials will be provided in a dedicated website (programme, audiovisual material in support to theclasses, papers and other bibliographic sources, course rules and calendar, evaluation methods, etc.). Theevaluation method will be based on the papers presentations and discussion, participation in classes and writtenessays on the focused topics.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os métodos de ensino descritos acima pretendem promover a interiorização dos conceitos básicos em análisemas também uma aprendizagem activa pelos alunos através da pesquisa responsável e da exposição ediscussão de trabalhos na turma. A selecção de trabalhos de revisão permite uma abordagem global aos temasfocados; outros trabalhos destacarão o debate cienfíco actual de alguns dos temas expostos. A apresentaçãodestes trabalhos incentiva a reflexão e análise crítica pelos alunos, estimulando o debate científico. Estaabordagem promove ainda a capacidade dos alunos trabalharem eficazmente em contexto de grupo,incentivando atitudes de respeito mútuo e colaboração, de acordo com os objectivos expostos.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

The teaching methods described above is intended to promote an active learning mode among the students,through the introduction of discussion moments within each class, and by assigning student chores forresearching specific issues and then informing the class mates on these. It is also valued the reading of primarysources as a mean for students to understand the dynamics of the scientific information spread and in order topromote a higher proactive attitude regarding literature research and the building up of an informed opinion onspecific topics. Finally, the introduction of specific teaching methods relaying on cooperative learning will enablestudent ability to work efficiently in a group context, contributing in this way to diminish the competitiveatmosphere and to increase self­confidence. All these aspects are consistent with the generic objectivesexpressed above.

3.3.9. Bibliografia principal:Chambers RC; EA Trippel 1997. Early Life History and Recruitment in Fish Populations. Chapman & Hall,London. 596p.Fuiman LA; RG Werner 2002. Fishery Science: The Unique Contributions of Early Life Stages.Blackwell Sciences.Harris RP, Wiebe PH, Lenz J, Skjoldal HR, Huntley M. 2000. Zooplankton Methodology Manual. Acad.Press, 684p.Kritzer, JP & PF Sale 2006. Marine Metapopulations. Acad.Press, San Diego. 544p.McEdward L 1995. Ecology of Marine Invertebrate Larvae, CRC Press, BocaRaton, Florida 464p.Moser, HG, WJ Richards, DM. Cohen, M P Fahay, AW Kendall, Jr, Richardson 1984. Ontogeny and systematicsof fishes. 760 p.Sale, PF 2002. Coral reef fishes: dynamics and diversity in a complex ecosystem. Acad.Press, San Diego.549p.Whitfield, M, Matthews J, Reynolds C. 1999. Aquatic Life cycle strategies. Survival in a variable environment.Marine Biol. Ass. of the U.K. 149p.Williamson DI 2003. The origins of Larvae. Kluwer Acad. Publ. 261p.Additional review papers will be used.

Anexo IV ­ Ecological modelling and spatial statistics

3.3.1. Unidade curricular:Ecological modelling and spatial statistics

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Regina Maria Baltazar Bispo Carita

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:n/a

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Nesta unidade curricular pretende­se explorar as técnicas básicas de modelação estatística, tradicionalmenteusadas em ecologia, abrangendo teoria, aplicações e software. Espera­se que os estudantes adquiramconhecimentos sobre modelação estatística em ecologia. Em particular, os alunos devem ser capazes deexplorar os métodos estatísticos para os quais a localização espacial desempenha um papel importante. Osalunos devem ser capazes de reconhecer a abordagem estatística mais adequada dependendo do tipo devariável resposta. Pretende­se ainda que os alunos aprendem a incluir a variação espacial nos modelospreditivos e que sejam capazes de usar o software R como uma ferramenta para a modelação de dadosecológicos.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:With this curricular unit we aim to explore the basic statistical modeling strategies traditionally used in ecology.The course covers a blend of theory, applications, and software. It is expected that students acquire skills andknowledge regarding statistical modeling in ecology. In particular, students should be able to explore thestatistical methods for which spatial locations play an explicit role. By the end of the course students must beable to recognize the appropriate approach to model data depending on the type of the response variable and toimplement the analysis. Students will learn to include spatial variation into the models. The R software will beintroduced. By the end of the course students should be able to use R as a tool to model ecological data.

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Introdução1.1 Conceitos básicos em modelação estatística1.2 Introdução ao software R. Modelação estatística no R2. Modelação estatística3. Modelos lineares generalizados4. Modelos aditivos generalizados5. Estatística espacial5.1 Dados referentes a pontos5.2 Dados referentes a areas5.3 Processos pontuais

3.3.5. Syllabus:1. Introduction1.1 Basic statistical modeling concepts 1.2 Introducing R. Statistical modeling in R.2. Statistical modeling3. Generalized linear models4. Generalized additive models5. Spatial statistics:5.1 Model­based geostatistics (point level)5.2 Areal processes (block level)5.3 Spatial point process

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Na primeira parte do programa são abordados os conceitos básicos sobre modelação estatística sendoapresentado o software R que permitirá aos alunos executar na prática a análise dos dados. Serão abordadasduas áreas principais da modelação estatística. Os modelos lineares generalizados estendem os modeloslineares clássicos aos casos em que a variância não é constante e/ou os erros não são normalmentedistribuídos permitindo a introdução de métodos apropriados para variáveis resposta não contínuas, discretasou binárias. Estes modelos permitirão aos alunos modelar dados ecológicos, independentemente do tipo deobservações disponíveis. Estes dados serão, sempre que possível, baseados em investigação realizada naUnidade de Investigação em Eco­Etologia do ISPA a fim de mostrar aos alunos como aplicar estas técnicas asituações concretas. Os modelos aditivos generalizados são introduzidos para permitir aos alunos aprendercomo modelar dados quando nenhum modelo paramétrico descreve convenientemente a forma da relaçãoentre a variável resposta e a(s) variável exploratória(s). Em ecologia, as localizações espaciais podemdesempenhar um papel importante na análise de dados. A estatística espacial pode ser dividida considerandouma variação espacial discreta, uma variação espacial contínua ou de um processo pontual espacial. Estesmodelos cobrem de uma forma abrangente a análise de dados espaciais permitindo que os alunos estudempadrões espaciais bem como a sua influência sobre a variável resposta(s) e efectuem a predição para locaisnão observados. Será dada ênfase à aplicabilidade destas técnicas no estudo de populações marinhas e naconservação e gestão dos ecossistemas marinhos.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The first part of the syllabus includes an overview of the main concepts regarding statistical modeling and theintroduction of the analysis tool R that will enable students to analyze data in practice. Two main statisticalmodeling approaches will be introduced. The generalized linear models extend the classic linear models to thecases where variance is not constant and/or the errors are not normally distributed enabling to introducemethods appropriated to model response variables that are not continuous, being either discrete or binary.These models will enable students to model ecological data regardless the type of observations available. Thesedata will be obtained whenever possible, from the research performed in the Eco­Ethology Research Unit, toshow students how to apply these techniques to tangible case­studies. The generalized additive models areintroduced to allow students to learn how to model data when no particular parametric form describes the shapeof the relationship between the response variable and the exploratory variable(s). In ecology, spatial locationscan play an explicit role in the analysis of data. Spatial statistics can be divided considering a discrete spatialvariation, a continuous spatial variation or a spatial point process. The models will allow students to study

spatial patterns, their influence on the response variable(s) and to predict for non­observed locations. Particularemphasis will be centred on the application of these techniques in the study of marine populations and theconservation and management of marine ecosystems.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):As aulas incluirão uma parte onde serão apresentados oralmente os principais conceitos teóricos, seguindo­sea discussão e estudo de casos práticos. Em cada aula será apresentado aos alunos um conjunto diferente dedados para analisar e implementar as abordagens de modelação discutidas usando o software R. Um sitededicado à cadeira disponibilizará todos os materiais de apoio à docência (programa, material audiovisual deapoio às aulas, artigos e outras fontes bibliográficas, as regras do curso e do calendário, métodos de avaliação,etc.). A avaliação os alunos será baseada em relatórios práticos que incluam a descrição dos modelosestatísticos utilizados e os principais resultados obtidos na análise dos conjuntos de dados apresentados aolongo das aulas.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):The classes will include an oral presentation of the main theoretical concepts followed by the discussion ofpractical case studies. Students will have a different data set in each lecture to analyze and implement thediscussed modeling approaches using R software. A dedicated website will be use where all support materialswill be provided (programme, audiovisual material in support to the classes, papers and other bibliographicsources, course rules and calendar, evaluation methods, etc.). The students evaluation will be based onpractical reports summarizing the used methods and the main results obtained by analyzing the given data sets.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os métodos de ensino acima descritos pretendem estabelecer uma base teórica sólida, preparando os alunospara utilizar na prática as metodologias introduzidas. A apresentação de estudos de caso pretendeproporcionar aos alunos a exploração de aplicações práticas reais em ecologia. As sessões de laboratóriopráticas utilizando R permitirão que os alunos explorem os métodos apresentados promover um modo deaprendizagem activa.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

The teaching methods described above intend to establish a solid theoretical foundation, preparing students touse in practice the introduced methodologies. By presenting case­studies we intend to explore real practicalapplications in ecology. The practical lab sessions using R will allow students to explore the presented methodspromoting an active learning mode.

3.3.9. Bibliografia principal:Augustin, N.H., Mugglestone, M.A. and S. T. Buckland (1996), An Autologistic Model for the Spatial Distribution ofWildlife, The Journal of Applied Ecology, 33, 339­347 pp

Buckland, S..T. and D. A. Elston (1993). Empirical Models for the Spatial Distribution of Wildlife, The Journal ofApplied Ecology, 30, 478­495 pp.

Diggle, P. J. and Ribeiro, Jr (2007). Model­based Geostatistics. Springer, New York.

Faraway,J. J. (2006). Extending the Linear Model with R, Chapman & Hall / CRC

Zuur, A.F., Elena N. Ieno and Erik H.W.G. Meesters (2009) A Beginner’s Guide to R, Ed. Robert Gentleman andKurt Hornik and Giovanni G. Parmigiani, Springer

Zuur, A.F., Ieno, E.N., Walker, N., Saveliev, A.A., Smith, G.M. (2009). Mixed Effects Models and Extensions inEcology with R. Springer

Zuur, Ieno & Smith (2007). Analyzing Ecological Data, Springer

Wood, S. (2006). Generalized Additive Models: an introduction with R, CRC/Chapman & Hall

Anexo IV ­ Bem­Estar Animal

3.3.1. Unidade curricular:Bem­Estar Animal

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Maria Leonor Santos Galhardo

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Os objectivos desta unidade curricular são a apresentação dos principais conceitos relacionados com bem­estar, incluindo o seu significado em termos morais; a discussão de diferentes abordagens relacionadas com aavaliação científica do bem­estar animal; a abordagem a problemas específicos do bem­estar de animaismarinhos e formas de os reduzir; e o desenvolvimento de uma análise crítica dos mais vulgares problemas debem­estar dos animais marinhos.No final desta unidade curricular, os estudantes deverão ser capazes de:1. Descrever conceitos relacionados com bem­estar animal;2. Identificar diferentes abordagens à avaliação do bem­estar animal;3. Debater problemas vulgares de bem­estar de animais marinhos;4. Avaliar, sumarizar e apresentar artigos de fontes primárias;5. Escrever e falar acerca de ideias e resultados de investigação, usando meios audiovisuais para o efeito.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:The objectives of this curricular unit are to present the main concepts related to animal welfare, including itsmoral significance; to discuss different approaches to the scientific assessment and measurement of animalwelfare; to address specific welfare problems of marine animals and ways of reducing them; to develop acritical analysis of the currently debated marine animal welfare problems.By the end of this course students should be able to:1.Describe the animal welfare­related concepts;2. Identify different approaches to the assessment of animal welfare;3. Debate current marine animal welfare problems;4. Evaluate, summarise and present scientific articles from primary sources;5. Write and speak about ideas and results of research, using for that audio­visual means.

3.3.5. Conteúdos programáticos:A. Introdução ao bem­estar animal1. Diferentes abordagens ao conceito de bem­estar animal2. Significado moral do conceito de bem­estar animal3. Investigação em bem­estar animal

B. Avaliação científica do bem­estar animal 1. Saúde e bem­estar animal2. Bases neuroendócrinas do bem­estar animal e medidas fisiológicas associadas.3. Etologia aplicada: uso do comportamento como indicador do bem­estar animal4. Motivação, emoções e cognição: avaliação das experiências mentais dos animais

C. Problemas e gestão do bem­estar de animais pertencentes a espécies marinhas 1. Bem­estar de mamíferos marinhos 2. Bem­estar de peixes em aquacultura3. Bem­estar associado à pesca à linha, à pesca comercial e à caça à baleia4. Bem­estar e conservação de espécies marinhas5. Bem­estar e protecção legal de espécies marinhas

3.3.5. Syllabus:A. Introduction to Animal Welfare1. Different approaches to the concept of animal welfare2. Moral significance of the animal welfare concept3. Research on animal welfare

B. Scientific assessment of welfare 1. Health and welfare2. Neuroendocrine basis of welfare and related physiological measures3. Applied ethology: using behaviour as an indicator of welfare4. Motivation, emotions and cognition: assessing the mental experiences of animals

C. Welfare problems and management of marine species1. Welfare of marine mammals 2. Welfare in aquaculture3. Welfare of animals and angling, fisheries and whaling

4. Welfare and marine species conservation5. Welfare and legal protection of marine species

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Tal como mencionado no conteúdo programático, esta unidade curricular cobre os aspectos fundamentaisrelacionados com os conceitos gerais de bem­estar animal e sua avaliação e temas especificamente ligados aobem­estar de animais marinhos. O programa encontra­se dividido em três partes. A primeira é uma introduçãoao bem­estar animal , cobrindo conceitos gerais, uma breve perspectiva histórica e a descrição das diferentesabordagens ao bem­estar animal (funcional, emocional e natureza) e aspectos de ética animal com relevânciapara o conceito de bem­estar animal. Esta parte relaciona­se directamente com o primeiro dos objectivoscurriculares.

A segunda parte desta unidade curricular está relacionada com as diferentes abordagens que são levadas acabo na avaliação do bem­estar animal e os tópicos a abordar incluem a importância da saúde para o bem­estar; as bases mais relevantes da neuroendocrinologia do stress, da dor da motivação e do prazer e algumasdas medidas de bem­estar com elas relacionadas; a etologia aplicada e o uso do comportamento para medirbem­estar animal; e os conceitos de motivação, emoções e cognição e a sua importância para medirexperiências mentais nos animais. Esta parte relaciona­se directamente com o segundo dos objectivoscurriculares.

A terceira parte desta unidade curricular irá abordar diferentes problemas relacionados com o bem­estar deanimais pertencentes a espécies marinhas e a sua possível gestão. Inclui questões relacionadas comproblemas de mamíferos marinhos em cativeiro e no meio natural, aquacultura e aspectos relacionados com amanutenção de diferentes sistemas, transporte e abate de peixes, problemas relacionados com a pesca à linha,a pesca comercial e a caça à baleia; sinergias e colisões decorrentes de abordagens simultâneas de bem­estare conservação, e uma revisão crítica da legislação existente na EU sobre protecção do bem­estar de animaisde espécies marinhas. Esta parte relaciona­se directamente com o terceiro dos objectivos curriculares.

A natureza teórico­prática desta unidade curricular irá permitir o uso de muitos casos­estudo e exemplospráticos ao longo dos tópicos a serem abordados. Estes serão investigados, apresentados e discutidos pelosalunos na sala de aula, o que está relacionado directamente com o quarto e o quinto objectivo.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.As stated in the syllabus, this curricular unit covers the most fundamental aspects related to general conceptsof animal welfare, its assessment, and the specific marine animal welfare issues. The programme is divided inthree parts. The first is an introduction to animal welfare which covers general concepts, a brief historicalbackground, the different approaches to animal welfare (functional, emotional and naturalness) and aspects ofanimal ethics with relevance to the concept of animal welfare. This part relates directly to the first curricular unitobjectives.

The second part of this curricular unit is related to different approaches to undertake animal welfareassessment and topics to be addressed include the importance of health to welfare; relevantneuroendocrinological basis of stress, pain, motivation and pleasure and some of the related measures toassess welfare; applied ethology and the importance of using behavior to measure welfare; and the concepts ofmotivation, emotions and cognition and their importance to assess mental experiences on animals. This partrelates directly to the second curricular unit objectives.

The third part of this curricular unit will address different problems of marine animals welfare and their possiblemanagement, including marine mammals and their problems in captivity and in nature, aquaculture and aspectsrelated to the maintenance of different systems, transport and slaughter of animals, welfare problems andpossible ways to improve them in angling, fisheries and whaling; synergies, collisions and priorities createdwhen dealing simultaneously with animal welfare and conservation, and a critical review of the legal protectionof the marine species welfare. This part relates directly to the third curricular unit objectives.

The theoretical/practical nature of this curricular unit will allow the use of many case studies and practicalexamples throughout the topics to be addressed. These will be searched, presented and discussed by thestudents in the classroom, which covers the fourth and fifth objectives.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):As metodologias de ensino incluem:1. Exposição oral por parte do docente2. Leitura e discussão de casos­estudo3. Apresentação e discussão de artigos de revisão e empíricos pelos estudantes4. Tutorias de orientação para preparar e discutir os tópicos do programa5. Avaliação: continua, baseada em ensaios escritos, apresentações e discussões nas aulas acerca de tópicosespecíficos

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):Teaching methodologies will include:1. Oral presentations by the lecturer 2. Reading and discussion of case­studies3. Presentation and discussion of review or empiric papers by the students4. Tutorial assistance to prepare and discuss topics of the programme5. Evaluation: continuous, based on written essays and classroom presentation and discussion of specifictopics.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

As metodologias de ensino incluem:1. Exposição oral por parte do docente irá cobrir os objectivos 1­3.2. Leitura e discussão de casos­estudo irá cobrir os objectivos 1 e 3.3. Apresentação e discussão de artigos de revisão e empíricos pelos estudantes irá cobrir os objectivos 2­5.4. Tutorias de orientação para preparar e discutir os tópicos do programa irá cobrir os objectivos 2­5.5. Avaliação: continua, baseada em ensaios escritos, apresentações e discussões nas aulas acerca de tópicosespecíficos. Irá cobrir todos os objectivos.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

Teaching methodologies will include:1. Oral presentations by the lecturer will cover objectives 1 ­ 3.2. Reading and discussion of case­studies will cover objectives 1 and 3.3. Presentation and discussion of review or empiric papers by the students will cover objectives 2­5.4. Tutorial assistance to prepare and discuss topics of discussion will cover objectives 2­5.5. Evaluation: continuous, based on written essays and classroom presentation and discussion of specifictopics. It will cover all objectives.

3.3.9. Bibliografia principal:Appleby MC, Hughes BO, Mench JA, Olsson AC (editors) (2011) Animal Welfare. Oxfordshire: CAB International.Braithwaite VA (2010) Do Fish Feel Pain? Oxford: Oxford University Press.Branson EJ (editor) (2008). Fish Welfare. Oxford: Blackwell Publishing.Broom, D. M. and K. G. Johnson (1993). Stress and Animal Welfare. London: Chapman & Hall.Iwama GK, Pickering AD, Sumpter JP, Schreck CB. (1997) Fish Stress and Health in Aquaculture. Cambridge:Cambridge University Press.Pearce, J. M. (2008). Animal Learning & Cognition ­ An Introduction. New York: Psychology Press.Schusterman RJ, Thomas JA, Wood FG (editors) (1986) Dolphin cognition and behaviour: a comparativeapproach (Comparative Cognition and Neuroscience). NewJersey: Lawrence Erlbaum Associates.Wong, R. (2000). Motivation: A Biobehavioural Approach. Cambridge: Cambridge University Press.Wynne, C. D. L. (2001). Animal Cognition: the Mental Lives of Animals. New York: Palgrave Macmillan.

Anexo IV ­ Biologia e Conservação de Mamíferos Marinhos

3.3.1. Unidade curricular:Biologia e Conservação de Mamíferos Marinhos

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Manuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos Santos

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:n/a

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Esta Unidade Curricular tem por objectivo transmitir uma compreensão global da biologia dos mamíferosmarinhos, com enfoque especial nas suas adaptações comportamentais e sensoriais. Os alunos adquirirãonoções sobre a biodiversidade e distribuição dos mamíferos marinhos, complementadas por informação sobrea sua ecologia alimentar, migrações, questões de conservação e estratégias de mitigação.Espera­se ainda que os alunos adquiram a capacidade de identificar o tipo de técnica necessária parainvestigar uma determinada questão científica ou de conservação relacionada com mamíferos marinhos.

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:This course aims to provide students with a global understanding of marine mammal biology, focusing on theirbehavioural and sensorial adaptations. It is furthermore expected that a notion of marine mammal biodiversityand distribution is acquired, complemented by information on their feeding ecology, migrations, conservationissues and mitigation strategies.It is also expected that students will be able to identify the methodological approach better suited to investigatea given scientific or conservation question related to marine mammals.

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. A diversidade dos mamíferos aquáticos: cetáceos, carnívoros e sirénios.2. Sua distribuição em rios, lagos, águas costeiras e oceânicas, do Equador às regiões polares.3. Adaptações fisiológicas básicas dos mamíferos à vida aquática.4. Alimento e predadores dos mamíferos aquáticos, e seus papéis nas teias tróficas.5. Canais sensoriais usados pelos mamíferos aquáticos; o papel dominante da audição, e o biosonar comoadaptação especial dos odontocetos.6. Estratégias comportamentais na alimentação, acasalamento, cuidados parentais e evitamento depredadores.7. Modos de comunicação dos mamíferos marinhos.8. Principais ameaças às populações: capturas directas, capturas acidentais (by­catch), poluição e degradaçãodos habitats; o problema actual da excessiva pressão do turismo em alguns habitats.9. As espécies mais comuns em cativeiro e seu potencial de treino; estudos fisiológicos, sensoriais ecognitivos de mamíferos marinhos.10. Técnicas de investigação no meio natural.

3.3.5. Syllabus:1. The diversity of aquatic mammals: cetaceans, carnivores and sirenians.2. Aquatic mammals’ distribution in rivers, lakes, coastal and oceanic waters, from the equator to the polarregions.3. Basic physiological adaptations of mammals for aquatic life.4. Food and predators of aquatic mammals, their roles in trophic webs.5. Sensory channels used by aquatic mammals; the dominant role of audition and the special biosonaradaptation in odontocetes.6. Behavioural strategies of aquatic mammals for foraging, mating, rearing young and avoiding predators.7. Modes of communication by marine mammals.8. Major threats to marine mammal populations: direct captures, by­catch, pollution, habitat degradation; thecurrent problem of excessive tourism pressure in some habitats. 9. Species commonly maintained in captivity; uses of their training potential; physiological, sensory andcognitive studies of marine mammals.10. Field techniques of marine mammal research.

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Os temas do programa da Unidade Curricular, agrupados em 10 tópicos, cobrem todas as áreas essenciaispara um conhecimento geral da diversidade, classificação, distribuição, adaptações e comportamentos dosmamíferos aquáticos, bem como das ameaças à sobrevivência das populações. Será dado ênfase àsmetodologias de investigação que permitem o avanço do conhecimento nesta área, tanto em condiçõesartificiais (cativeiro), como no meio selvagem.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The syllabus is organized in 10 topics which cover all the essential areas for a general knowledge about thediversity, classification, distribution, adaptations and behaviour of aquatic mammals, as well as the threats tothe survival of their populations. Emphasis will be given to the research methodologies that may be used toobtain further knowledge, both in artificial environments (captivity) and in the wild.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Os temas da Unidade Curricular serão apresentados em aulas teórico­práticas de duas horas de duração, comfortes componentes audio­visual e interactiva. Exercícios de identificação de espécies e de indivíduos serãorealizados a partir de suportes fotográficos e videográficos.A avaliação será baseada em trabalhos realizados em pequenos grupos, que serão apresentados e discutidospela turma e pelo docente

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):Topics will be presented in two­hour lectures, with strong audio­visual and interactive components. Species andindividuals identification exercises will be carried out based on photo and video recordings.Evaluation will be based on small­group projects, to be presented in class for discussion.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Uma abordagem teórico­prática, fortemente baseada na apresentação de imagens e sons, e aberta àparticipação interactiva dos alunos com o docente, será a mais indicada para a aquisição das competências econhecimentos expressos nos objectivos da Unidade Curricular. A formação de pequenos grupos (2­3 alunos)para a pesquisa dos recursos bibliográficos e electrónicos disponíveis permitirá a exploração dos temas deuma forma mais criativa, enriquecedora da sua formação e até de maior interesse para o docente. No entanto,cada elemento dos grupos estará sujeito a um escrutínio oral durante a apresentação dos trabalhos, quepermitirá uma apreciação da profundidade dos conhecimentos adquiridos acerca da biologia dos mamíferosmarinhos e também a sua partilha por todo o grupo.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

An educational approach both theoretical and practical, strongly based on the presentation of images andsounds, and open to the interactive participation of all students with the lecturer, will be the most suited to theacquisition by the students of the knowledge and competencies expressed in the Curricular Unit’s objectives.Small groups of 2­3 students will research the literature and the electronic resources available in a morecreative way, with more potential interest for the students and even for the lecturer. However, each student willhave to display, during the oral presentation in class, the depth of the knowledge acquired concerning marinemammal biology, and that knowledge will thus be shared with the whole group.

3.3.9. Bibliografia principal:Boyd, I. L., Bowen, W. D. & Iverson, S. J. (2010). Marine Mammal Ecology and Conservation: A Handbook ofTechniques. Oxford: Oxford University Press.

Evans, P. G. & Raga, J. A. (Eds.) (2001). Marine Mammals: Biology and Conservation. New York: KluwerAcademic/Plenum Press.

Mann, Janet; Connor, Richard C., Tyack, Peter L., and Whitehead, Hal (Eds.) (2000). Cetacean Societies: FieldStudies of Dolphins and Whales. The University of Chicago Press, Chicago and London.

Perrin, W., Wursig, B. & Thewissen, J. G. M. (Eds.)(2008). Encyclopedia of Marine Mammals, Second Edition.Amsterdam: Elsevier (Academic Press).

Reynolds, J. E., Wells, R. S. & Eide, S. D. (2001). The Bottlenose Dolphin: Biology and Conservation. UniversityPress of Florida.

Anexo IV ­ Ética Ambiental

3.3.1. Unidade curricular:Ética Ambiental

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Emanuel João Flores Gonçalves

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:n/a

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Avaliação global dos impactos humanos no ambiente. Harmonização da vertente social, económica e ecológicado desenvolvimento. Relação entre a ética ambiental e desenvolvimento sustentável, no pressuposto de que asprincipais questões que se colocam na tomada de decisões passam pela ponderação da valia ética dosecossistemas naturais como caminho para compatibilizar os objectivos sociais e económicos actuais com osinteresses e opções das sociedades vindouras.Adquirir os princípios básicos da ética ambiental. Estruturar o edifício ético que se coloca à sociedade na suarelação com os ecossistemas naturais. Avaliar o conceito de desenvolvimento sustentável à luz dos princípiosda ética ambiental. Consciencialização do papel individual e colectivo no desenvolvimento das sociedades.Adquirir competências básicas dos conceitos e princípios subjacentes à economia ecológica. Avaliar osimpactos globais das sociedades humanas no planeta e soluções para a construção de um futuro sustentável

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:Evaluation of global Human impacts on the environment. Harmonizing social, economic and ecological aspects

of development. Relationships between environmental ethics and sustainable development, assuming that themain issues in decision­making processes have to deal with valuing the natural ecosystems from an ethicalperspective as a way to harmonize social and economic objectives of contemporary societies with the interestsand options of future societies.

To learn the basic principles of environmental ethics. Build the ethical framework that society faces on itsrelation with natural ecosystems. To evaluate the concept of sustainable development in light of environmentalethics principles. Awareness of individual and collective roles in the development of societies. Acquire basicprinciples underlining ecological economics. Evaluate global impacts of human societies on the Planet andsolutions for building a sustainable future

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Conceitos gerais de ética2. Introdução à ética ambiental3. As grandes correntes da ética ambiental; 4. Valor da ética ambiental para a sustentabilidade das actividades humanas – economia, tecnologia e valoresambientais;5. Desenvolvimento social e valores ambientais, responsabilidade individual e colectiva;6. O papel da economia ecológica para o desenvolvimento sustentável; 7. O ambiente global (natural e artificial), biodiversidade, e os serviços dos ecossistemas

3.3.5. Syllabus:1. General Ethical Concepts;2. Introduction to Environmental Ethics;3. The Main Approaches to Environmental Ethics; 4. Environmental Ethics Value for the Sustainability of Human Activities – Economy, Technology andEnvironmental Values;5. Social Development and Environmental Values, Individual and Collective Responsibility;6. The Role of Ecological Economics for Sustainable Development; 7. The Global Environment (Natural and Artificial), Biodiversity and Ecosystem Services

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para uma abordagem ética aos problemas ambientais, comparticular destaque para os desafios da gestão e conservação do ambiente marinho. A parte introdutória docurso inicia­se com uma apresentação geral da definição de ética enquanto ramo da filosofia que estuda amoral, distingue­se a moral de moralidades ou códigos de conduta e serão usados exemplos práticos dodesafio da abordagem ética em problemas ambientais. Em seguida, apresentam­se as principais correntes daética ambiental, as suas forças e fraquezas, enquadramento teórico, e consequências práticas na aplicação decasos de estudo com incidência marinha. Discutem­se depois as implicações das consequências dadegradação ambiental e a forma como a ética ambiental pode contribuir para a sustentabilidade das actividadeshumanas, fornecendo uma base conceptual de decisão para alguns dos principais dilemas ambientais. A esterespeito serão abordados os contributos da valorização do ambiente para uma sociedade socialmente maisjusta e ambientalmente sustentável e avaliados os contributos individuais e colectivos na procura de soluçõespara os grandes problemas ambientais. Finalmente, na última parte desta Unidade Curricular, será dada uma introdução à Economia Ecológicaenquanto disciplina integradora da economia, ecologia, ética, ciências sociais e naturais e dados exemplos dotipo de mudanças de fundo que precisam de ocorrer para a teoria económica tradicional abraçar odesenvolvimento sustentável como o seu paradigma central. Serão dados exemplos de aplicação deinstrumentos associados e esta nova disciplina, como a pegada ecológica, e apresentados alguns dosindicadores globais da degradação ambiental, dos ecossistemas naturais e da artificialização do planeta. Osbens e serviços dos ecossistemas é outra área à qual será dado particular destaque como forma de introduzirna teoria económica vigente formas de valorização ambiental que alterem o equilíbrio de forças no sentido deuma maior sustentabilidade.Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos adquirir osprincípios básicos da ética ambiental, avaliar o conceito de desenvolvimento sustentável à luz dos princípios daética ambiental, adquirir uma consciencialização do papel individual e colectivo no desenvolvimento dassociedades contemporâneas, conhecer os princípios e ferramentas da economia ecológica e avaliar osimpactos globais das sociedades humanas no planeta.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.This Curricular Unit will provide the basis for an ethical approach to Environmental problems, with special focusfor the challenges of managing and preserving the marine environment. The introductory part of the programstarts with a general presentation on the definition of ethics as a branch of philosophy that studies the moral, adistinction between moral and moralities or codes of conduct is provided and practical examples of thechallenge of the ethical approach in environmental problems will be given. Next, the main approaches toenvironmental ethics will be presented, their strengths and weaknesses, the theoretical framework and

practical consequences in the application to marine­related case studies. The implications of the consequencesof environmental degradation will be discussed, as well as the way environmental ethics may contribute to thesustainability of human activities, providing a conceptual basis for decision for some of the main environmentaldilemmas. In this context, the role of environmental valuation for a fair and environmentally sustainable societywill be tackled and the individual and collective efforts in the search for solutions for the major environmentalproblems will be evaluated.Finally, in the last part of this Curricular Unit, an introduction to Ecological Economics as an integrativediscipline of economy, ecology, ethics, social and natural sciences will be presented and examples of the type ofdeep changes that need to be done for the classical economic theory to embrace sustainable development asits central paradigm. Examples will be given on the application of instruments associated to this discipline, suchas the ecological footprint, and some of the indicators of global environmental degradation, of natural systemsand artificialization of the planet will be presented and discussed. The ecosystem goods and services will alsobe given particular attention as a way to insert in the mainstream ecological theory methods of environmentalvaluation that may change the force equilibrium to a greater sustainability.This program fulfills the objectives defined for this curricular unit allowing the students to learn the basicprinciples of environmental ethics, evaluate the concept of sustainable development in light of environmentalethics principles, be aware of the individual and collective roles in the development of contemporary societies,understand the ecological economics principles and tools and evaluate global impacts of human societies onthe Planet.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):As aulas teórico­práticas serão utilizadas para a apresentação teórica das principais problemáticas, discussãode casos de estudo e apresentação de relatórios pelos alunos. A partir de um caso de estudo aplicado aorganismos marinhos e de bibliografia de base sobre ética ambiental, serão trabalhados nas aulas a análiseaos principais aspectos identificadores da problemática em questão e possíveis soluções para as mesmas. Osalunos trabalharão em grupo na questão escolhida e apresentarão perante toda a turma as principaisconclusões a que chegaram. O aprofundamento das análises a efectuar será feito em contexto de tutoria.Com base no e­campus do ISPA em plataforma Moodle serão disponibilizados os materiais de apoio (e.g.programa, casos de estudo, artigos para discussão, regras de funcionamento, métodos de avaliação, etc.) Seráutilizado um método de avaliação contínuo baseado na apresentação e discussão de trabalhos de análise acasos de estudo e na participação nas aulas

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):The theoretical­practical classes will be used to the theoretical presentation of the main topics, discussion ofcase studies and presentation of reports by the students. From a case study applied to marine organisms and ofbaseline bibliography on environmental ethics, the analysis of the main aspects which allow the identification ofthe questions at hand and possible solutions to the problem will be discussed and analysed in the classroom.Students will work in groups in the chosen question and will present to all classmates their main conclusions.The deepening of the analysis to be made and specific contents will be done in tutorial context.Based on ISPA e­campus in Moodle platform, all materials will be available (e.g. program of the unit, casestudies, papers for discussion, functioning rules, calendar, evaluation methods, etc. A continuous evaluationmethod will be used based on the presentations and discussion and analysis of case studies and participation inclasses.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Numa Unidade Curricular onde se pretende que os estudantes adquiram os conhecimentos necessários para oenquadramento das problemáticas abordadas e os apliquem a contextos práticos, as aulas teórico práticasserão utilizadas para estes fins. Após uma breve introdução a conceitos gerais de ética e à ética ambiental, aexploração das diferentes correntes da ética ambiental e das suas implicações será feita recorrendo a leiturasde artigos originais que constituam casos de estudo que possam ser discutidos e trabalhados em grupo pelosalunos. Serão então apresentados a toda a turma e constituirão parte integrante do processo avaliativo. Paramelhor abordar as questões em análise, serão sempre usados exemplos do dia­a­dia em que os alunosconsigam fazer a ponte entre as consequências do comportamento individual e colectivo e a degradaçãoambiental e discutir de que forma a solução para os principais problemas ambientais passa pela integração deuma dimensão ética na teoria económica e práticas comportamentais. Com esta componente fortementeaplicada, as metodologias de ensino e avaliação através de trabalhos de grupo que analisem casos de estudoaplicados às principais temáticas do programa, serão as mais eficazes para os objectivos que se definirampara esta da Unidade Curricular. A introdução de métodos de ensino focados na aprendizagem em grupopromovem o espírito de equipa e o trabalho colaborativo, contribuindo para diminuir o ambiente competitivoentre os estudantes e para aumentar a sua auto­confiança.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

In a Curricular Unit where is pretended that the students acquire the necessary skills for the framework of themain problems discuss and apply them to practical contexts, the theoretical­practical classes will be used withthat purpose. After a brief introduction to general concepts in ethics and environmental ethics, the different

approaches in environmental ethics and their implications will be explored using original articles which may beused as case studies to be read and discussed by the students in groups. They will them be presented to allclass and will be an integral part of the evaluation process. To better approach the questions under analysis,day­to­day examples in which students are able to relate the consequences of individual and collectivebehaviour and environmental degradation will be used, as well as ways to solve the present issues byintegrating an ethical dimension in the economic theory and behavioural frameworks. With this strongly appliedcomponent, teaching methodologies and evaluation through group work to analyse case studies applied to themain themes of the program, will be the most effective to fulfill the objective foreseen for the Curricular Unit. The introduction of teaching methods focused on cooperative learning will promote team work and the students'ability to work effectively in a group setting, contributing to reduce the competitive environment among studentsand increase their self­confidence.

3.3.9. Bibliografia principal:Louis P. Pojman (2004). Environmental Ethics: Readings in Theory and Application. 4th edition. ThomsonLearningSusan J Armstrong & Richard G Botzler (2003). Environmental Ethics: Divergence and Convergence. 3rdedition. McGraw HillRichard L. Knight & Suzanne Riedel (2002). Aldo Leopold and the ecological conscience. Oxford UniversityPress Costanza, R.; Cumberland, J.; Daly, H.; Goodland, R. & Norgaard, R.B. (eds.) (1997). An Introduction to EcologicalEconomics. St. Lucie Press, Boca Raton, FLFiedler, P.L. & Jain, S.K. (eds.) (1992). Conservation Biology. Chapman & Hall James Rachels (2004). Elementos de Filosofia Moral. Gradiva, Lisboa.Varner, G. (1998). In Nature’s Interests? Interests, Animal Rights and Environmental Ethics. Oxford UniversityPressAldo Leopold (2007). Pensar como uma Montanha. Editora Sempre em Pé

Anexo IV ­ Biologia e Ecologia de Peixes

3.3.1. Unidade curricular:Biologia e Ecologia de Peixes

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Emanuel João Flores Gonçalves

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Vítor Manuel Carvalho Almada

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Esta Unidade Curricular tem como objectivo apresentar a Biologia e Ecologia de Peixes como áreamultidisciplinar onde se cruzam aspectos taxonómicos, ecológicos, biológicos, de conservação e gestão,comportamentais e fisiológicos. Pretende­se demonstrar a importância dos peixes nos ecossistemas marinhoscomo elementos estruturantes dos mesmos, as suas principais adaptações aos diferentes tipos de habitatsonde ocorrem, o papel funcional que desempenham nesses ecossistemas, a sua história evolutiva eontogenética e os desafios actuais da conservação destas comunidades e espécies.Tem como objectivo fornecer aos alunos uma base conceptual para:­ compreender o papel dos peixes nos ecossistemas marinhos e os desafios da sua conservação­ debater as principais teorias sobre a ecologia dos peixes, o modo de estruturação das comunidades e osmecanismos de recrutamento larvar­ compreender os mecanismos ecológicos e evolutivos das comunidades de peixes nos ecossistemas doplaneta

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:The goal of this curricular unit is to introduce Fish Biology and Ecology as a multidisciplinary area wheretaxonomy, ecology, biology, conservation and management, behaviour and physiology meet. It is our aim also todemonstrate the importance of fish as structural elements of marine ecosystems, their main adaptations to thedifferent types of habitats where they occur, the functional role they have in those ecosystems, theirevolutionary and ontogenetic history and the current challenges of conservation of those species andcommunities.It aims at provide the students a conceptual basis to:­ understand the role of fish in marine ecosystems and the challenges of their conservation­ discuss the main theories on fish ecology, the way communities are structured and the mechanisms of larvalrecruitment­ understand the ecological and evolutionary mechanisms of fish communities on the main ecosystems of the

planet

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. A diversidade dos peixesO que é um peixe?2. Estrutura e funçãoAnatomia externa e formas do corpo, estruturas esqueléticas, principais sistemas, metabolismo e energia,morfologia funcional 3. Padrões de história vitalCiclos de vida,ontogenia e desenvolvimento, estados larvares, idade e crescimento 4. Ecologia dos peixesHabitats, adaptações morfológicas, fisiológicas e comportamentais, predadores e presas, padrões emecanismos de reprodução5. Comportamento dos peixesCorte, desova e cuidados parentais, estratégias e tácticas alternativas de reprodução, comunicação, agressãoe agregações, relações interespecíficas, padrões temporais, migrações6. Comunidades, ecossistemas e o papel funcional dos peixesInteracções ao nível da comunidade, posições tróficas, papel nos ecossistemas, influência de factores físicos7. Desafios da conservação de peixesExtinções e perda de biodiversidade, ecossistemas perturbados, principais impactos, estratégias deconservação

3.3.5. Syllabus:1. Fish diversityWhat is a fish?2. Structure and functionExternal anatomy and body shapes, skeleton, main systems, metabolism and energy, functional morphology3. Life history patternsLife cycles, ontogeny and development, larval stages, age and growth4. Fish ecologyMain habitats, morphological and behavioural adaptations, predators and prey, breeding patterns andmechanisms5. Fish behaviourCourtship, spawning and parental care, alternative reproductive strategies and tactics, communication,aggression and aggregations, interspecific relationships, temporal patterns, migrations6. Communities, ecosystems and the functional role of fishInteractions at the community level, trophic positions, role in ecosystems, influence of physical factors7. Fish conservation challengesExtinctions and biodiversity loss, dysfunctions in disturbed ecosystems, main impacts, conservation strategies

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para a compreensão da Biologia e Comportamento dos Peixes e doseu papel nos ecossistemas marinhos. Começa por se abordar a diversidade dos peixes enquanto grupofileticamente diverso, colocando numa perspectiva evolutiva a diversidade dos grupos de peixes actuais. Emseguida fala­se dos aspectos da forma dos peixes e função das suas principais estruturas morfológicas efisiológicas. Depois apresenta­se a diversidade de padrões de história vital que é possível observar nestesorganismos, em concreto, os diferentes tipos de ciclos de vida e sua adaptação ao meio marinho, os padrõesde ontogenia e desenvolvimento dos estados larvares e de que forma os mesmos influenciam a dinâmicapopulacional das espécies de peixes e, finalmente, os padrões de idade e crescimento referindo­se aospadrões ontogenéticos e evolutivos do crescimento. No módulo seguinte, são abordadas questões da ecologiados peixes nomeadamente os principais habitats onde ocorrem e respectivas adaptações morfológicas,fisiológicas e comportamentais, os peixes como predadores e presas nos ecossistemas marinhos e ospadrões e mecanismos de reprodução dando nota da enorme diversidade de estratégias existentes. O tópicoseguinte é centrado na diversidade dos comportamento dos peixes, nomeadamente de corte, desova ecuidados parentais (mostrando os diferentes caminhos evolutivos, convergências e divergênciasfilogenéticas), as estratégias e tácticas alternativas de reprodução, e serão ainda abordados mecanismos decomunicação, agressão e agregações em peixes, os diferentes tipos de relações interespecíficas, os padrõesde comportamento temporais e, finalmente, as estratégias de migração nos peixes. O sexto tópico é centradonas comunidades, ecossistemas e no papel funcional dos peixes apresentando­se os diferentes tipos deinteracção a nível das comunidades, as posições tróficas e os efeitos dos peixes na distribuição e abundânciade outros organismos, o seu papel nos ecossistemas enquanto elementos estruturantes dos mesmos e, porfim, a influência de factores físicos como a perturbação nessas comunidades. O último módulo apresenta ediscute os desafios da conservação dos peixes falando das extinções e perda da biodiversidade a que osecossistemas marinhos estão actualmente sujeitos, as disfunções observáveis em ecossistemas perturbadose as suas consequências e dos impactos das actividades humanas a nível específico, genético e deecossistemas. Termina­se com a discussão das principais estratégias de conservação que permitem

responder às actuais pressões e impactos, bem como ao tipo de respostas esperadas nas comunidades depeixes em diferentes sistemas.Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos conhecer abiologia e ecologia dos peixes como área multidisciplinar onde se cruzam aspectos taxonómicos, ecológicos,biológicos, de conservação e gestão, comportamentais e fisiológicos.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The syllabus of this course will provide the basis for the understanding of Fish Biology and Ecology and the roleof fish in marine ecosystems. It starts by approaching fish diversity as a phyletically diverse group, putting in anevolutionary perspective the current diversity of fish groups. Next, aspects of fish form and function of themajor morphological and physiological features are discussed. Then, the diversity of life­history patterns ispresented, namely the different types of life cycles and their adaptations to the marine environment, ontogeneticand developmental patterns of larval stages and the ways they influence population dynamics of fish speciesand, finally, growth and age patterns referring to the ontogenetic and evolutionary growth patterns. In the nextmodule, topics in fish ecology will be discussed, namely the main habitats where fish occur and their particularmorphological, physiological and behavioural adaptations, fish as predators and prey in marine ecosystems andtheir breeding patterns and mechanisms, noting the huge diversity of existing strategies. Next topic is centred inthe diversity of fish behavior, namely, courtship, spawning and parental care (showing the different evolutionarypathways, and phyletic convergences and divergences), the breeding strategies and tactics, and alsomechanisms of communication, aggression and aggregation in fish, the different types of interspecificrelationships, temporal behavioural patterns and, finally, migration strategies in fish. The sixth topic in centred inthe communities, ecosystems and fish functional role presenting the different types of interaction at thecommunity level, the trophic positions and the effects of fish in the distribution and abundance of otherorganisms, their role in ecosystems as structuring elements an, finally, the influence of physical factors such asdisturbance in those communities.The last module presents and discusses the conservation challenges applied to fishes namely extinction risks,loss of biodiversity currently under way in marine ecosystems, the consequences of the dysfunctions ofdisturbed ecosystems and the impacts on human activities at the specific, genetic and ecosystem levels. It willend with a discussion of the main conservation strategies that allow to tackle the current pressures andimpacts, as well as with the type of responses of fish communities in different systems.This syllabus fulfills the objectives foreseen for this curricular unit allowing the students to understand the fishbiology and ecology as a multidisciplinary area where taxonomy, ecology, biology, conservation andmanagement, behaviour and physiology meet.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Esta unidade curricular está estruturada em aulas teóricas e práticas laboratoriais. Para cada tópico doprograma, existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:1. uma lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente2. uma exposição oral pelo docente dos conceitos básicos e das abordagens para esse tópico3. um “journal club” no qual os alunos apresentam e discutem artigos de investigação sobre os diferentestópicos4. práticas laboratoriais onde serão observados diferentes grupos de peixes e a respectiva diversidade,anatomia e comportamento5. tutorias nas quais o docente orienta os alunos na preparação para o “journal club”.Com base no e­campus do ISPA serão disponibilizados os diversos materiais de apoio (artigos, programa,meios audiovisuais de apoio às aulas, métodos de avaliação, etc.). A avaliação terá uma componente teórica euma avaliação contínua baseada na apresentação e discussão de trabalhos.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):This curricular unit is structured in theoretical and practical laboratory classes. For each topic of the syllabusthe following learning tools will be used:1. a list of recommended references that students should read in advance;2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and approaches for each topic;3. a "journal club" in which students present and discuss research papers related to the themes of the syllabus.4. laboratory classes where the different fish groups, their diversity, anatomy and behaviour will be observed5. tutorials in which the teacher guide students in preparing the "journal club".Based on ISPA e­campus, all materials will be available (e.g. program of the unit, case studies, papers fordiscussion, evaluation methods, etc. The evaluation will have a theoretical component and a continuousevaluation based on the presentation and discussion of essays

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Nesta Unidade Curricular pretende­se que os estudantes adquiram uma sólida base teórica sobre a Biologia eEcologia de Peixes bem como adquiram os conhecimentos práticos sobre a diversidade, anatomia,comportamento e conservação de peixes. Para isso, serão expostos em contexto de aula teórico­prática osprincipais conceitos associados aos diferentes tópicos do programa onde serão igualmente apresentados ediscutidos trabalhos pelos alunos em grupos, baseados em informação científica recorrendo a fontes

primárias. Nas aulas práticas de laboratório serão mostrados exemplos da diversidade, anatomia ecomportamento de peixes recorrendo a exemplares de diferentes grupos taxonómicos, vídeos e outro materialaudiovisual e aquários, estando prevista a visita a lotas, aquários e oceanários para demonstração de questõesrelacionadas com a diversidade dos grupos de peixes e as problemáticas da sua conservação.Estas componentes de uma sólida formação teórica e de uma componente prática e aplicada permitirá cumprirda melhor forma os objectivos que se definiram para esta Unidade Curricular. Em concreto, apresentar aBiologia e Ecologia de Peixes como área multidisciplinar onde se cruzam aspectos taxonómicos, ecológicos,biológicos, de conservação e gestão, comportamentais e fisiológicos. Pretende­se demonstrar a importânciados peixes nos ecossistemas marinhos como elementos estruturantes dos mesmos, as suas principaisadaptações aos diferentes tipos de habitats onde ocorrem, o papel funcional que desempenham nessesecossistemas, a sua história evolutiva e ontogenética e os desafios actuais da conservação destascomunidades e espécies.A introdução de métodos de ensino focados na aprendizagem em grupo pretendem promover um estilo deaprendizagem activo nos alunos, através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, eresponsabilizando os alunos pela pesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma epromovem o espírito de equipa e o trabalho colaborativo, contribuindo para diminuir o ambiente competitivoentre os estudantes e para aumentar a sua auto­confiança. É também valorizada a leitura de fontes primáriascomo meio dos estudantes entenderem a dinâmica da propagação de informação científica e de promover umaatitude proactiva na busca de informação e formação de uma opinião esclarecida sobre um tema.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

In this Curricular Unit it is intended that the students will acquire a solid theoretical basis on Fish Biology andEcology as well as promote the practical approaches to the diversity, anatomy, behavior and conservation offish. For that purpose, the main concepts associated to the different topics of the program will be present intheoretical­practical classes where students will present and discuss in work groups specific topics based onscientific information collected from primary sources. In the laboratory practical classes examples of fishdiversity, anatomy and behaviour will be shown through animals collected in fish markets belonging fromdifferent taxonomic groups, videos and other audiovisual materials, as well as aquaria, and it is foreseen thevisit to fish markets, aquariums and oceanarium to demonstrate questions related with the diversity of fishgroups and the problems of their conservation. These components of a solid theoretical framework and apractical and applied component will be the most effective to fulfill the objectives foreseen for this curricularunit. Namely, to introduce Fish Biology and Ecology as a multidisciplinary area where taxonomy, ecology,biology, conservation and management, behaviour and physiology meet. It is our aim also to demonstrate theimportance of fish as structural elements of marine ecosystems, their main adaptations to the different types ofhabitats where they occur, the functional role they have in those ecosystems, their evolutionary and ontogenetichistory and the current challenges of conservation of those species and communities.The introduction of teaching methods based on group learning allow to promote an active learning style instudents by introducing moments of discussion in class, promoting the research on specific issues on whichstudents should inform the class and promote the students' ability to work effectively in a group setting,contributing to reduce the competitive environment among students and increase their self­confidence. It willalso be valued the reading of primary sources as a means for students to understand the dynamics of thespread of scientific information and to promote a proactive approach in searching for information and formationof an informed opinion on a given topic.

3.3.9. Bibliografia principal:Bone, Q. & Moore, R. 2008. Biology of Fishes. Third Edition. Taylor & Francis Group, New York.

Helfman, G.S., Collete, B.B., Facey, D.E. & Bowen, B.W. 2009. The diversity of fishes: biology, evolution, andecology. Third Edition. Wiley­Blackwell, Oxford, UK.

Long, J. 2010. The Rise of Fishes: 500 Million Years of Evolution. Second Edition. Johns Hopkins UniversityPress, Baltimore.

Moyle, P.B. & Cech, J.J. 2004. Fishes: An Introduction to Ichthyology. Fifth Edition. Benjamin Cummings.

Nelson, J.S. 2006. Fishes of the World. Fourth Edition. John Wiley & Sons, Inc. New Jersey.

Sale, P.F. 2002. Coral Reef Fishes: Dynamics and Diversity in a Complex Ecosystem. Academic Press,Amsterdam

Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade(Reviews and original research papers from scientific journals)

Anexo IV ­ Ecologia Marinha

3.3.1. Unidade curricular:Ecologia Marinha

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Emanuel João Flores Gonçalves

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Ana Margarida da Silva FariaRita Alexandra Duarte Borges

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Esta é uma das Unidades Curriculares centrais e tem como objectivo dar aos estudantes uma sólida formaçãoem ecologia marinha, estruturante para as restantes temáticas do curso. Pretende­se apresentar os principaispilares da ecologia marinha moderna, discutir de forma crítica as teorias explicativas dos padrões e processosobservados no meio marinho e relacionar os padrões de distribuição, história vital, evolutivos e ecológicos comos desafios da conservação e gestão destes ecossistemas.Serão utilizados exemplos que ilustrem os pontos em questão e visões alternativas dos processos explicativose será consolidada a noção do ecossistema marinho como um todo funcional.Tem como objectivo fornecer aos alunos uma base conceptual para:1compreender os tipos de sistemas e processos no meio marinho2debater as principais teorias sobre a ecologia marinha e as suas consequências práticas3compreender mecanismos ecológicos e evolutivos das comunidades marinhas nos principais ecossistemas

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:This is one of the core curricular units of this study cycle and its main objectives are to give students a solidbasis in marine ecology, structuring for the other themes of the course. The main pillars of modern marineecology are presented, the theories explaining patterns and processes in the marine environment will bediscussed and the patterns of distribution, life history, evolutionary and ecological will be related to thechallenges of conservation and management of these ecosystems.Examples to illustrate the points in questions will be used and alternative vision of explanatory processes will bediscussed in order to consolidate the view of the marine ecosystem as a functional whole.It aims at provide the students a conceptual basis to:­ understand the systems and processes in the marine environment­ discuss the main theories of marine ecology and their consequences­ understand the ecological and evolutionary mechanisms of marine communities on the main ecosystems

3.3.5. Conteúdos programáticos:1. Princípios de oceanografia e ecologia marinha1.1. Aspectos históricos1.2. O ambiente oceânico1.3. Princípios ecológicos e evolutivos2. Processos, padrões e sistemas no ambiente marinho2.1. Comunidades planctónicas, nectónicas e bentónicas2.2. Produção primária, produção microbiana e decomposição2.3. Larvas e ecologia larvar3. Sistemas ecológicos 3.1. Ecologia estuarina e ambientes costeiros3.2. Ecologia intertidal3.3. Meiofauna e sua importância3.3. Sistemas pelágicos e fundos marinhos3.4. Ecologia do mar aberto e do mar profundo3.5. Comparação de ecossistemas marinhos e terrestres4. O ecossistema marinho como um todo funcional

3.3.5. Syllabus:1. Principles of oceanography and marine ecology1.1. Historical aspects1.2. The oceanic environment1.3. Ecological and evolutionary principles2. Processes, patterns and systems in the marine environment2.1. Planktonic, nektonic and benthic communities2.2. Primary production, microbial production and decomposition2.3. Larvae and larval ecology3. Ecological systems3.1. Estuarine and coastal ecology

3.2. Intertidal ecology3.3. Meiofauna and its importance3.3. Pelagic systems and seabed environments3.4. Open ocean and deep sea ecology3.5. Comparison of marine and terrestrial ecosystems4. The marine ecosystem as a functional whole

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para a compreensão da Biologia Marinha como área estruturantedeste ciclo de estudos. Serão primeiro abordados princípios gerais de oceanografia e ecologia marinha, dandonota de aspectos históricos que condicionaram a actual distribuição de organismos e ecossistemas, osmétodos de estudo do ambiente marinho, os domínios do ambiente oceânico (em coordenação com a unidadecurricular Biodiversidade, Biologia Populacional e Biogeografia Marinha), e as principais abordagens ecológicae evolutivas à compreensão do funcionamento dos ecossistemas marinhos. No segundo módulo, apresentam­se os processos, padrões e sistemas no ambiente marinho, com ênfase nos mecanismos que condicionam adistribuição das espécies e a constituição dos principais sistemas oceânicos e costeiros: das comunidadesplanctónicas ao nécton e bentos marinho, os mecanismos de produção primária, microbiana e dedecomposição e os ciclos biogeoquímicos subjacentes, e, finalmente, a biologia e ecologia larvar cujasparticularidades condicionam a forma como os organismos marinhos evoluíram diferentes estratégias dehistória vital. O terceiro módulo é dedicado aos sistemas ecológicos marinhos com uma descrição detalhadados principais processos que condicionam cada um deles: dos estuários aos recifies de coral, recifesrochosos, mangais e sapais e pradarias marinhas; ao intertidal rochoso e arenoso e respectivas adaptaçõesanatómicas, fisiológica e comportamentais dos organismos que aí vivem; passando pela meiofauna e suaimportância na transferência de energia nos sistemas costeiros. Serão ainda apresentados os sistemaspelágicos e as comunidades dos fundos marinhos, bem como a ecologia do mar aberto e do mar profundo comdestaque para as particularidades que as caracterizam. Este tópico termina com uma comparação entre osecossistemas marinhos e terrestres e consequências para a teoria ecológica do modo como os organismosmarinhos estruturam as suas comunidades e se dispersam no oceano. Finalmente o quarto módulo apresentauma integração da informação apresentada, dando­se nota da importância de considerar o ecossistemamarinho como um todo funcional e as suas implicações para as estratégias de conservação.Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos conhecer osprincipais processos, padrões e sistemas do ambiente marinho.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The syllabus of this curricular unit will provide the basis for the understanding of Marine Biology as a core areaof this study cycle. It will start by approaching general principles of oceanography and marine ecology, notingthe historical aspects that influenced the current distribution of organisms and ecosystems, the methods tostudy the marine environment, the marine domains (in coordination with the curricular unit Biodiversity,Population Biology and Marine Biogeography) and the main ecological and evolutionary approaches tounderstand how marine ecosystems work.In the second module, the processes, patterns and systems of the marine environment are presented, withemphasis on the mechanisms that influence species distribution and the structuring of the ain oceanic andcoastal systems: from the plankton to the nekton and benthos, the mechanisms of primary and microbialproduction and of decomposition and the underlying biogeochemical cycles, and, finally, the larval ecology andbiology and the way they influence how marine organisms have evolved different life history strategies. Thethird module is dedicated to marine ecological systems with a detailed description of the main processes whichprevail in each: from estuaries to coral and rocky reefs, mangroves, saltmarshes and seagrass beds; to therocky and sandy intertidal and respective anatomical, physiological and behavioural adaptations of organismsthat live there; to the meiofauna and its importance in energy transfer in coastal systems. Pelagic systems andseabed communities will also be presented, as well as the ecology of the open ocean and deep sea withparticular emphasis for their peculiarities. This topic ends with a comparison between marine and terrestrialsystems and its consequence to the ecological theory and the way marine organisms structure their respectivecommunities and disperse in the ocean. Finally, the fourth module integrates all previous information and willhighlight the importance of considering the marine ecosystem as a functional whole and the implications of thisconcept to conservation strategies.This syllabus fulfills the objectives foreseen for this curricular unit allowing the students to understand the mainprocesses, patterns and systems in the marine environment.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Esta unidade curricular está estruturada em aulas teóricas e trabalho de campo. Para cada tópico do programa,existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:1. uma lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente2. uma exposição oral pelo docente dos conceitos básicos e das abordagens para esse tópico3. uma apresentação e discussão em grupo de tópicos a seleccionar4. trabalho de campo que consistirá em saídas para o intertidal rochoso e arenoso/vasoso onde serãoobservados diferentes grupos taxonómicos e avaliados os seus padrões de distribuição

5. tutorias nas quais o docente orienta os alunos na preparação para o trabalho de campo e relatórios.Com base no e­campus do ISPA serão disponibilizados os diversos materiais de apoio (artigos, programa,meios audiovisuais de apoio às aulas, métodos de avaliação, etc.). A avaliação terá uma componente teórica euma avaliação contínua baseada na apresentação e discussão de trabalhos.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):This curricular unit is structured in theoretical classes and field work. For each topic of the syllabus the followinglearning tools will be used:1. a list of recommended references that students should read in advance;2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and approaches for each topic;3. a presentation and discussion in groups of topics to be chosen4. field work consisting of visits to the rocky and sand/muddy intertidal where different taxonomic groups will beobserved and their distribution patterns will be studied5. tutorials in which the teacher guide students in preparing the field work and reports.Based on ISPA e­campus, all materials will be available (e.g. program of the unit, case studies, papers fordiscussion, evaluation methods, etc. The evaluation will have a theoretical component and a continuousevaluation based on the presentation and discussion of essays

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Nesta Unidade Curricular pretende­se que os estudantes adquiram uma sólida base teórica sobre a EcologiaMarinha bem como adquiram os conhecimentos práticos sobre os padrões de distribuição e zonamento deorganismos marinhos e as suas adaptações. Para isso, serão expostos em contexto de aula teórica osprincipais conceitos associados aos diferentes tópicos do programa onde serão igualmente apresentados ediscutidos trabalhos pelos alunos em grupos, baseados em informação científica recorrendo a fontesprimárias. Nas saídas de campo serão mostrados exemplos da diversidade de diferentes grupos taxonómicosem alguns ambientes costeiros e das respectivas adaptações, serão ainda usados vídeos e outro materialaudiovisual pra reforçar aspectos centrais da matéria, estando prevista a visita uma costa rochosa, uma praiae um estuário para demonstração de questões relacionadas com a diversidade dos grupos marinhos e asproblemáticas da sua conservação.Esta sólida formação teórica em conjunto com uma componente prática e aplicada permitirá cumprir da melhorforma os objectivos que se definiram para esta Unidade Curricular. Em concreto, apresentar os principaispilares da ecologia marinha moderna, discutir de forma crítica as teorias explicativas dos padrões e processosobservados no meio marinho e relacionar os padrões de distribuição, história vital, evolutivos e ecológicos comos desafios da conservação e gestão destes ecossistemas.A introdução de métodos de ensino focados na aprendizagem em grupo pretendem promover um estilo deaprendizagem activo nos alunos, através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, eresponsabilizando os alunos pela pesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma epromovem o espírito de equipa e o trabalho colaborativo, contribuindo para diminuir o ambiente competitivoentre os estudantes e para aumentar a sua auto­confiança. As saídas de campo reforçam esta componentebem como valorizam a experiência prática dos conceitos, padrões e processos abordados em contexto de salade aula. É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmicada propagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação eformação de uma opinião esclarecida sobre um tema.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

In this Curricular Unit it is intended that the students will acquire a solid theoretical basis on Marine Ecology aswell as promote the practical approaches to the distribution patterns and zoning of marine organisms and theiradaptations. For that purpose, the main concepts associated to the different topics of the program will bepresent in theoretical­practical classes where students will present and discuss in work groups specific topicsbased on scientific information collected from primary sources. In the field work, examples of diversity ofdifferent taxonomic groups in some coastal environments and their respective adaptations will be shown, andvideos and other audiovisual materials will also be used to reinforce central aspects of the topics, beingforeseen a visit to a rocky coast, a beach and an estuary to demonstrate issues related to the diversity ofmarine groups and the problems of their conservation.This solid theoretical framework and a practical and applied component will be the most effective to fulfill theobjectives foreseen for this curricular unit. Namely, present the main pillars of modern marine ecology, thetheories explaining patterns and processes in the marine environment and the patterns of distribution, lifehistory, evolutionary and ecological which will be related to the challenges of conservation and management ofthese ecosystems.The introduction of teaching methods based on group learning allow to promote an active learning style instudents by introducing moments of discussion in class, promoting the research on specific issues on whichstudents should inform the class and promote the students' ability to work effectively in a group setting,contributing to reduce the competitive environment among students and increase their self­confidence. Fieldstudies reinforce this component as well as value the practical experience of concepts, patterns and processespresented in classroom context. It will also be valued the reading of primary sources as a means for students to

understand the dynamics of the spread of scientific information and to promote a proactive approach insearching for information and formation of an informed opinion on a given topic.

3.3.9. Bibliografia principal:Barnes, R.S.K. & Hughes, R.N. 1999. An Introduction to Marine Ecology. Third Edition. Blackwell, Oxford, Uk.

Levinton, J.S. 2001. Marine Biology: Function, Biodiversity, Ecology. Second Edition. Oxford University Press,Oxford, UK.

Kaiser, M.J., Attrill, M.J., Jennings, S., Thomas, D.N., Barnes, D.K.A., Brierley, A.S. Polunin, N.V.C., Raffaelli, D.G.& Williams, P.J.Ie B. 2005. Marine Ecology: Processes, Systems and Impacts. Oxford University Press, Oxford,UK.

Nybakken, J. W. (2001). Marine Biology. An Ecological Approach, 5th Ed. San Francisco: Benjamin Cummings.

Roff, J. & Zacharias, M. (2011). Marine Conservation Ecology. London: Earthscan.

Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade(Reviews and original research papers from scientific journals)

Anexo IV ­ Governação do Oceano e Áreas Marinhas Protegidas

3.3.1. Unidade curricular:Governação do Oceano e Áreas Marinhas Protegidas

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Emanuel João Flores Gonçalves

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Manuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos Santos

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:Esta é uma das Unidades Curriculares centrais e tem como objectivo dar aos estudantes uma sólida formaçãoem gestão e conservação dos oceanos. Pretende­se apresentar os principais desafios da governação dosoceanos e o papel que as áreas marinhas protegidas (AMPs) podem desempenhar numa mais eficaz eduradoura protecção dos ecossistemas marinhos. São apresentados casos de estudo e mecanismos paraavaliar a eficácia das AMPs e estes mecanismos de gestão e conservação são enquadrados na temática maisglobal da conservação dos oceanos fazendo referência ao quadro legal actual e suas implicações. Tem como objectivo fornecer aos alunos uma base para:­ compreender os desafios da conservação marinha­ debater os efeitos dos principais mecanismos de conservação e gestão e as sua consequências práticas­ compreender o papel das AMPs na governação dos oceanos

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:This is one of the core curricular units and its main objectives are to give students a solid basis in conservationand management of the oceans. The main challenges of ocean governance will be presented and the role marineprotected areas (MPAs) may have in a sustainable and lasting protection of the marine ecosystems. Casestudies will be presented to evaluate the efficacy of MAPs and these mechanisms of conservation andmanagement are seem in the global framework of ocean conservation referring to the current legal frameworkand its consequences.It aims at provide the students a basis to:­ understand the challenges of marine conservation­ discuss the effects of the main mechanisms of conservation and management and its practical consequences­ understand the role of MPAs in ocean governance

3.3.5. Conteúdos programáticos:1 Desafios da conservação marinha a nível global, regional e local1.1 Breve história da gestão e conservação dos oceanos1.2 Principiais instrumentos ­ prós e contras2 O que são áreas marinhas protegidas (AMPs)?2.1 Tipos e definições de AMPs3 Porque razão são as AMPs necessárias?3.1 Ameaças aos ecossistemas marinhos e suas consequências

3.2 Pressões e impactos de actividades humanas3.3 A ecologia dos ecossistemas marinhos e implicações para a conservação4 Selecção de AMPs4.1 Princípios e critérios de selecção de AMPs4.2 Planos de gestão4.3 Casos de estudo4.4 Redes de AMPs6 Quadro legal e suas implicações6.1 Enquadramento legal a nível nacional, regional e global 6.2 Zonas de responsabilidade dos estados6.3 O alto mar e a comunidade internacional7 Formas de monitorização e objectivos de longo­termo8 Planeamento espacial marinho e papel das AMPs9 Educação ambiental e dimensão ética no uso dos oceanos10 Caminhos futuros para a conservação do oceano

3.3.5. Syllabus:1 Challenges of marine conservation at the global, regional and local level1.1 Brief history of ocean management and conservation1.2 Main instruments ­ pros and cons2 What are marine protected areas (MPAs)?2.1 Types and definitions of MPAs3 Why do we need marine protected areas?3.1 Threats to marine ecosystems and their consequences3.2 Pressures and impacts of human activities3.3 Ecology of marine ecosystems and implications for conservation4 Selection of MPAs 4.1 Guiding principles and criteria for the selection of MPAs4.2 Management plans4.3 Case studies 4.4 Networks of MPAs6 Legal framework and its implication6.1 Legal framework at national, regional and global level 6.2 State responsibility areas6.3 The high seas and the international community7 Monitoring procedures and long­term objectives8 Marine spatial planning and the role of MPAs9 Marine education and ethical issues in the use of the ocean10 Future prospects for ocean conservation

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Esta Unidade Curricular fornecerá as bases para a compreensão da Gestão e Conservação do Oceano e, emparticular, o papel das Áreas Marinhas Protegidas (AMPs). Serão abordados os desafios da conservaçãomarinha a nível global, regional e local, apresentando uma breve história sobre a gestão e conservação dosoceanos. Os principiais instrumentos de gestão serão apresentados e os prós e contras da sua utilização serãodiscutidos. De seguida clarifica­se o que se entende por áreas marinhas protegidas (AMPs), referindo­se aostipos e definições de AMPs. Enquadra­se a sua utilização devido às actuais ameaças aos ecossistemasmarinhos e suas consequências bem como às principais pressões e impactos de actividades humanas.Apresenta­se os princípios e critérios para a selecção de AMPs, os diferentes tipos de planos de gestão ealguns casos de estudo exemplificando sucessos e falhanços na sua implementação. Dá­se igualmentedestaque ao desafio da implementação de redes de AMPs e da sua importância para a eficaz gestão dosecossistemas marinhos. No módulo seguinte, é dada nota do quadro legal existente e suas implicações a nívelnacional, regional e global. Fala­se das zonas de responsabilidade dos estados no oceano, da problemática doalto mar e do papel da comunidade internacional. São se seguida referidos os principais mecanismos demonitorização e objectivos de longo­termo e ainda dos processos de planeamento espacial marinho e o papeldas AMPs nos mesmos. Finalmente, refere­se a importância da educação ambiental e da dimensão ética do usodos oceanos como enquadradoras dos caminhos futuros para a conservação do oceano e o desenvolvimentosustentável.Este programa cumpre os objectivos definidos para esta unidade curricular permitindo aos alunos conhecer osprincipais desafios da conservação marinha.

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.The syllabus of this curricular unit will provide the basis for understanding the challenges of Ocean Managementand Conservation and, in particular, the role of Marine Protected Areas (MPAs). The challenges of marineconservation at the global, regional and local level will be discussed presenting a brief history of oceanmanagement and conservation. The main management instruments will be presented and pros and cons of their

use will be discussed. Next, the question what are marine protected areas (MPAs) is approached, referring tothe types and definitions of MPAs. Their use is related to the threats to marine ecosystems and theirconsequences as well as the pressures and impacts of human activities. The principles and criteria forselecting MPAs are presented, as well as different types of management plans and some case studiesillustrating successes and failures in their implementation. Particular attention will be given to the challenge ofimplementing networks of MPAs and their importance to the successful management of marine ecosystems. Inthe next module, the existing legal framework and its implication at the national, regional and global level will bepresented. The state responsibility areas and the problem of the management of the high seas and theinternational community role are discussed. The main monitoring procedures and long­term objectives arerefereed next as well as the marine spatial planning processes and the role of MPAs on those. Finally, theimportance of marine education and ethical issues in the use of the ocean as central aspects of futureprospects for ocean conservation are referred.This syllabus fulfills the objectives foreseen for this curricular unit allowing the students to understand the mainchallenges of marine governance and conservation.

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Esta unidade curricular está estruturada em aulas teóricas e aulas teórico­práticas. Para cada tópico doprograma, existem os seguintes instrumentos de aprendizagem:1. lista de referências bibliográficas recomendadas que os alunos devem ler antecipadamente2. uma exposição oral pelo docente dos conceitos básicos e das abordagens para esse tópico3. uma apresentação e discussão em grupo de tópicos a seleccionar e com a definição de um plano deordenamento de uma AMP a ser feita nas aulas teórico­práticas4. uma visita de estudo a uma área marinha protegida onde serão constatados os principais desafios deconservação5. tutorias nas quais o docente orienta os alunos na preparação para os relatórios.Com base no e­campus do ISPA serão disponibilizados os diversos materiais de apoio (artigos, programa,meios audiovisuais de apoio às aulas, métodos de avaliação, etc.). A avaliação terá uma componente teórica euma avaliação contínua baseada na apresentação e discussão de trabalhos.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):This curricular unit is structured in theoretical and theoretical­practical classes. For each topic of the syllabusthe following learning tools will be used:1. a list of recommended references that students should read in advance2. an oral presentation by the teacher introducing the basic concepts and approaches for each topic3. a presentation and discussion in groups of topics to be chosen and the elaboration of a management plan fora MAPS to be done at the theoretical­practical classes4. a field visit to a marine protected area where the main challenges of marine conservation will be presented tothe students5. tutorials in which the teacher guide students in preparing the reports.Based on ISPA e­campus, all materials will be available (e.g. program of the unit, case studies, papers fordiscussion, evaluation methods, etc. The evaluation will have a theoretical component and a continuousevaluation based on the presentation and discussion of essays

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

Nesta Unidade Curricular pretende­se que os estudantes adquiram uma sólida base teórica e aplicada sobre osdesafios da gestão e conservação marinha. Para isso, serão expostos em contexto de aula teórica osprincipais conceitos associados aos diferentes tópicos do programa. Nas aulas teórico­práticas serãoapresentados e discutidos trabalhos pelos alunos em grupos, baseados em informação científica recorrendo afontes primárias. Na saída de campo os alunos constatarão no local alguns dos principais desafios da gestãode áreas marinhas protegidas, e serão ainda usados vídeos e outro material audiovisual para reforçar aspectoscentrais da matéria.Esta sólida formação teórica em conjunto com uma componente prática e aplicada permitirá cumprir da melhorforma os objectivos que se definiram para esta Unidade Curricular. Em concreto, apresentar os principaisdesafios da governação dos oceanos e o papel que as áreas marinhas protegidas (AMPs) podem desempenharnuma mais eficaz e duradoura protecção dos ecossistemas marinhos através, nomeadamente, daapresentação de casos de estudo e mecanismos para avaliar a eficácia das AMPs enquadrando essesmecanismos de gestão e conservação na temática mais global da conservação dos oceanos fazendoreferência ao quadro legal actual e suas implicações.A introdução de métodos de ensino focados na aprendizagem em grupo pretendem promover um estilo deaprendizagem activo nos alunos, através da introdução de momentos de discussão da matéria nas aulas, eresponsabilizando os alunos pela pesquisa de determinados temas sobre os quais devem informar a turma epromovem o espírito de equipa e o trabalho colaborativo, contribuindo para diminuir o ambiente competitivoentre os estudantes e para aumentar a sua auto­confiança. As saídas de campo reforçam esta componentebem como valorizam a experiência prática dos conceitos, padrões e processos abordados em contexto de salade aula. É também valorizada a leitura de fontes primárias como meio dos estudantes entenderem a dinâmicada propagação de informação científica e de promover uma atitude proactiva na busca de informação e

formação de uma opinião esclarecida sobre um tema.

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

In this Curricular Unit it is intended that the students will acquire a solid theoretical and applied basis on thechallenges of marine conservation and management. For that purpose, the main concepts associated to thedifferent topics of the program will be present in theoretical classes. In theoretical­practical classes, studentswill present and discuss in work groups specific topics based on scientific information collected from primarysources. In the field work, students will be exposed to some of the main challenges of managing marineprotected areas, and videos and other audiovisual materials will also be used to reinforce central aspects of thetopics. This solid theoretical framework and a practical and applied component will be the most effective to fulfillthe objectives foreseen for this curricular unit. Namely, present the main challenges of ocean governance andthe role marine protected areas (MPAs) may have in a sustainable and lasting protection of the marineecosystems, through the presentation of case studies and framing the mechanisms of conservation andmanagement in the global framework of ocean conservation referring to the current legal framework and itsconsequences.The introduction of teaching methods based on group learning allow to promote an active learning style instudents by introducing moments of discussion in class, promoting the research on specific issues on whichstudents should inform the class and promote the students' ability to work effectively in a group setting,contributing to reduce the competitive environment among students and increase their self­confidence. Fieldstudies reinforce this component as well as value the practical experience of concepts, patterns and processespresented in classroom context. It will also be valued the reading of primary sources as a means for students tounderstand the dynamics of the spread of scientific information and to promote a proactive approach insearching for information and formation of an informed opinion on a given topic.

3.3.9. Bibliografia principal:Claudet, J. (Ed.) 2011. Marine Protected Areas: A Multidisciplinary Approach. Cambridge University Press,Cambridge, UK.

Gubbay, S. (Ed.) 1995. Marine Protected Areas. Principles and Techniques for Management. Chapman & Hall,London.

Hennessey, T.M. & Sutinen, J. G. 2005. Sustaining Large Marine ecosystems: The Human Dimension. Elsevier,Amsterdam.

Roff, J. & Zacharias, M. 2011. Marine Conservation Ecology. London: Earthscan.

Techera, E. 2011. Marine Environmental Governance: From International Law to Local Practice. Routledge.

Artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade(Reviews and original research papers from scientific journals)

Anexo IV ­ Estágio

3.3.1. Unidade curricular:Estágio

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Emanuel João Flores Gonçalves

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Joana Isabel do Espírito Santo RobaloJoão Paulo Maroco DomingosManuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos SantosPaulo Xavier CatryRegina Maria Baltazar Bispo CaritaRui Filipe Nunes Pais de Oliveira Vítor Manuel Carvalho Almada

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:O estágio pretende dar aos alunos a oportunidade de se integrarem em entidades ou instituições com quem oISPA tem protocolos de colaboração no sentido de aprenderem a resolver questões aplicadas directamenterelacionadas com os conteúdos deste ciclo de estudos. Alguns exemplos são: o Oceanário de Lisboa, o AquárioVasco da Gama, o Zoomarine de Albufeira, o Instituto de Conservação da Natureza e da Biodiversidade, etc.

Apresentam­se neste curso dois perfis, dando a escolher aos alunos uma componente mais aplicada eprofissionalizante (onde o estágio tem maior peso) ou uma componente mais científica e académica (onde adissertação tem maior peso). Definem­se como objectivos:1. Colocar o aluno perante um contexto aplicado onde se inserirá numa equipa de trabalho2. Aprender a definir um modelo de abordagem à problemática em causa3. Produzir um relatório baseado na mais actual bibliografia, recorrendo a fontes primárias, relacionado com atemática do estágio

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:The internship will provide the opportunity for the student to work in entities or institutions with which ISPA hascollaboration agreements to learn how to solve applied problems directly related to the contents of this studycycle. Some examples are: Lisbon Oceanarium, Vasco da Gama Aquarium, Zoomarine in Albufeira, the Institutoof Nature Conservation and Biodiversity, etc.In this course, two profiles are possible, and the students may choose a more applied and professionalizedcomponent (where the internship has a greater weight) or a more scientific and academic component (where thedissertation has a greater weight).The objectives are:1. Place the student under an applied context as part of a work team2. Learn to define an approach model for the issue at hand3. Present a report based on the most current literature, mainly primary sources, related with the theme of theinternship

3.3.5. Conteúdos programáticos:O conteúdo do estágio depende do assunto escolhido e da instituição onde o mesmo decorrerá. Cada ano oGabinete de estágios do ISPA oferecerá uma lista de locais que podem ser escolhidos pelos alunos.

3.3.5. Syllabus:The contents of the internship will depend on the issue chosen and the institution where the work takes place.Each year, ISPAs internship office will present a number of places students may choose.

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

n/a

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.n/a

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Apresentam­se neste curso dois perfis, dando a escolher aos alunos uma componente mais aplicada eprofissionalizante (onde o estágio tem maior peso) ou uma componente mais científica e académica (onde adissertação tem maior peso). No âmbito do estágio, a supervisão será assegurada por um dos elementos docorpo docente destacado para o efeito, em articulação com quem nos locais de estágio tenha a formação ecompetências necessárias para supervisionar o trabalho. A orientação será tutorial e o estudante será igualmente inserido em seminários de supervisão onde serãoavaliados os progressos do trabalho e aferidas as metodologias empregues e os resultados obtidos. Serãoapresentadas pelo estudante, periodicamente, as principais conclusões do seu trabalho ao resto do grupo. Aavaliação terá uma componente contínua avaliada em conjunto pelo supervisor interno da instituição deacolhimento e pelo supervisor do ISPA e uma componente associada ao relatório final de estágio.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):In this course, two profiles are possible, and the students may choose a more applied and professionalizedcomponent (where the internship has a greater weight) or a more scientific and academic component (where thedissertation has a greater weight). The supervision of the internship will be made by an element of the academicstaff in articulation with who, in the institution where the internship will take place, have the necessarycompetencies and skills to supervise the work.Orientation will be tutorial and the student will also be included in supervision seminars where work progressand results will be evaluated and the methodologies are adjusted if needed. The student will present periodicallythe main conclusions of the work to the rest of the group. Evaluation will have a continuous componentevaluated by the intern supervisor of the host institution together with the academic staff member of ISPA and acomponent associated to the final internship report.

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

n/a

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

n/a

3.3.9. Bibliografia principal:Varia com o tópico escolhido e a temática específica em análise. Será definida pelo supervisor baseado emartigos de revisão e artigos originais de revistas científicas da especialidade.

Varies according to the chosen topic and the specific theme in analysis. Will be defined by the supervisor basedon Reviews and original research papers from scientific journals

Anexo IV ­ Seminário de Dissertação

3.3.1. Unidade curricular:Seminário de Dissertação

3.3.2. Docente responsável (preencher o nome completo):Emanuel João Flores Gonçalves

3.3.3. Outros docentes que leccionam a unidade curricular:Joana Isabel do Espírito Santo RobaloJoão Paulo Maroco DomingosManuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos SantosPaulo Xavier CatryRegina Maria Baltazar Bispo CaritaRui Filipe Nunes Pais de Oliveira Vítor Manuel Carvalho Almada

3.3.4. Objectivos de aprendizagem da unidade curricular:O seminário de dissertação pretende orientar os alunos para a realização de um trabalho científico, preparandoe acompanhando o aluno na identificação da temática a estudar, levantamento do problema, pesquisabibliográfica, definição da metodologia, escolha dos instrumentos e procedimento a seguir, tratamento dosdados e compreensão dos resultados, discussão das principais conclusões e elaboração da dissertação.Pretende­se que o aluno desenvolva:1. Capacidade de escolha de um problema científico de estudo2. Capacidade para proceder a uma pesquisa bibliográfica adequada e relevante para a temática em análise3. Capacidade para escolher a metodologia e técnicas de investigação adequadas4. Capacidade para discutir e programar as fases de execução de um projecto de investigação5. Capacidade de tratamento de dados e discussão de resultados.6. Capacidade de redigir um trabalho de investigação

3.3.4. Intended learning outcomes of the curricular unit:The dissertation seminar aims at guiding the student to perform a scientific work, preparing and supervising thestudent in the identification of the theme of interest, raising the research issue, bibliographic research,methodology definition, choice of instruments and procedures to follow, data treatment and interpretation ofresults, discussion of main conclusions and elaboration of the dissertation.It is intended that the student will develop:1. Capacity to choose a scientific problem to study2. Capacity to perform an adequate and relevant bibliographic research for the theme under analysis3. Capacity to choose the methodology and adequate research techniques4. Capacity to discuss and program the different phases of implementation of a research project5. Capacity to treat data and discuss results6. Capacity to write a scientific paper

3.3.5. Conteúdos programáticos:Os conteúdos programáticos do seminário de dissertação são variáveis consoante as temáticas em estudo.Contudo são focadas questões genéricas relacionadas com a investigação:­ Pesquisa bibliográfica­ Elaboração de problemas de investigação­ Métodos e técnicas de investigação em biologia marinha e conservação

­ Análise e discussão de resultados­ Redacção das diferentes partes de uma dissertação­ Apresentação final e discussão de uma dissertação

3.3.5. Syllabus:The contents of the dissertation seminar are variable and will depend on the issue chosen. However, somegeneric topics related to scientific research will be presented:­ Bibliographic research­ Defining the research problem­ Methods and techniques of research in marine biology and conservation­ Analysis and discussion of results­ Writing the different sections of a dissertation­ Final presentation and discussion of the dissertation

3.3.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

n/a

3.3.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit’s intended learning outcomes.n/a

3.3.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):Apresentam­se neste curso dois perfis, dando a escolher aos alunos uma componente mais aplicada eprofissionalizante (onde o estágio tem maior peso) ou uma componente mais científica e académica (onde adissertação tem maior peso). No âmbito do seminário de dissertação, a supervisão será assegurada por umdos elementos do corpo docente destacado para o efeito, podendo ou não estar em articulação com umsupervisionar externo caso o trabalho se realize noutra instituição científica. A orientação será tutorial e o estudante será igualmente inserido em seminários de dissertação onde serãoavaliados os progressos do trabalho e aferidas as metodologias empregues e os resultados obtidos. Serãoapresentadas pelo estudante, periodicamente, as principais conclusões do seu trabalho ao resto do grupo. Aavaliação será feita com base nos seminários de dissertação e na apresentação e defesa da dissertação.

3.3.7. Teaching methodologies (including evaluation):In this course, two profiles are possible, and the students may choose a more applied and professionalizedcomponent (where the internship has a greater weight) or a more scientific and academic component (where thedissertation has a greater weight). The supervision of the dissertation seminar will be made by an element of theacademic staff which may or not be in articulation with an external supervisor in case the work is performed inanother scientific institution. Orientation will be tutorial and the student will also be included in supervision seminars where work progressand results will be evaluated and the methodologies are adjusted if needed. The student will present periodicallythe main conclusions of the work to the rest of the group. Evaluation will be based on the dissertation seminarsand on the presentation and discussion of the dissertation

3.3.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objectivos de aprendizagem da unidadecurricular.

n/a

3.3.8. Demonstration of the teaching methodologies coherence with the curricular unit’s intended learningoutcomes.

n/a

3.3.9. Bibliografia principal:Varia com o tópico escolhido e a temática específica em análise. O estudante procurará fontes bibliográficasadequadas guiado pelo supervisor baseadas em artigos de revisão e artigos originais de revistas científicas daespecialidade.

Varies according to the chosen topic and the specific theme in analysis. The student will search for adequatebibliographic sources guided by the supervisor based on reviews and original research papers from scientificjournals

4. Descrição e fundamentação dos recursos docentes

4.1 Descrição e fundamentação dos recursos docentes

4.1.1. Fichas curriculares dos docentes

Anexo V ­ Emanuel João Flores Gonçalves

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Emanuel João Flores Gonçalves

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Associado ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Ana Margarida da Silva Faria

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Ana Margarida da Silva Faria

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ André Levy Martins Coelho

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):André Levy Martins Coelho

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Carla Patrícia Cândido de Sousa Santos

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Carla Patrícia Cândido de Sousa Santos

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Joana Isabel do Espírito Santo Robalo

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Joana Isabel do Espírito Santo Robalo

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ João Paulo Maroco Domingos

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):João Paulo Maroco Domingos

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Associado ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Maria Leonor Santos Galhardo

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Maria Leonor Santos Galhardo

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Manuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos Santos

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Manuel Eduardo de Noronha Gamito Afonso dos Santos

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Associado ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Maria Ana Figueiredo Peixe Dias

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):

Maria Ana Figueiredo Peixe Dias

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Paulo Xavier Catry

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Paulo Xavier Catry

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Regina Maria Baltazar Bispo Carita

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Regina Maria Baltazar Bispo Carita

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:

Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Rita Alexandra Duarte Borges

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Rita Alexandra Duarte Borges

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Auxiliar ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):10

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Rui Filipe Nunes Pais de Oliveira

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Catedrático ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo V ­ Vítor Manuel Carvalho Almada

4.1.1.1. Nome do docente (preencher o nome completo):Vítor Manuel Carvalho Almada

4.1.1.2. Instituição de ensino superior (preencher apenas quando diferente da instituição proponente mencionadaem A1):

<sem resposta>

4.1.1.3 Unidade Orgânica (preencher apenas quando diferente da unidade orgânica mencionada em A2.):<sem resposta>

4.1.1.4. Categoria:Professor Catedrático ou equivalente

4.1.1.5. Regime de tempo na instituição que submete a proposta (%):100

4.1.1.6. Ficha curricular de docente:Mostrar dados da Ficha Curricular

4.1.2 Equipa docente do ciclo de estudos

4.1.2. Equipa docente do ciclo de estudos / Study cycle’s academic staff

Nome / Name Grau /Degree Área científica / Scientific Area Regime de tempo /

Employment linkInformação/Information

Emanuel João Flores Gonçalves Doutor Ecologia e Biossistemática / Ecologyand Biossystematics 100 Ficha submetida

Ana Margarida da Silva Faria Doutor Ecologia Marinha / Marine Ecology 100 Ficha submetida

André Levy Martins Coelho Doutor Ecologia e Evolução / Ecology andEvolution 100 Ficha submetida

Carla Patrícia Cândido de SousaSantos Doutor Biologia Evolutiva / Evolution Biology 100 Ficha submetida

Joana Isabel do Espírito SantoRobalo Doutor Biologia 100 Ficha submetida

João Paulo Maroco Domingos Doutor Fisiologia e Bioquímica / Physiologyand Biochemistry 100 Ficha submetida

Maria Leonor Santos Galhardo Doutor Ciência Animal / Animal Sciences 100 Ficha submetidaManuel Eduardo de Noronha GamitoAfonso dos Santos Doutor Biologia Animal / Animal Biology 100 Ficha submetida

Maria Ana Figueiredo Peixe Dias Doutor Ecologia 100 Ficha submetidaPaulo Xavier Catry Doutor Zoologia / Zoology 100 Ficha submetida

Regina Maria Baltazar Bispo Carita Doutor Engenharia Agronómica / AgronomicEngineering 100 Ficha submetida

Rita Alexandra Duarte Borges Doutor Ecologia Marinha / Marine Ecology 10 Ficha submetidaRui Filipe Nunes Pais de Oliveira Doutor Biologia / Biology 100 Ficha submetidaVítor Manuel Carvalho Almada Doutor Evolução / Evolution 100 Ficha submetida 1310

<sem resposta>

4.2. Dados percentuais da equipa docente do ciclo de estudos

4.2.1.a Número de docentes em tempo integral na instituição13

4.2.1.b Percentagem dos docentes em tempo integral na instituição (campo de preenchimento automáticocálculado após a submissão do formulário)

99,2

4.2.2.a Número de docentes em tempo integral com uma ligação à instituição por um período superior a três anos8

4.2.2.b Percentagem dos docentes em tempo integral com uma ligação à instituição por um período superior a trêsanos (campo de preenchimento automático cálculado após a submissão do formulário)

61,1

4.2.3.a Número de docentes em tempo integral com grau de doutor14

4.2.3.b Percentagem dos docentes em tempo integral com grau de doutor (campo de preenchimento automáticocálculado após a submissão do formulário)

106,9

4.2.4.a Número (ETI) de docentes do ciclo de estudos inscritos em programas de doutoramento há mais de um ano<sem resposta>

4.2.4.b Percentagem dos docentes do ciclo de estudos inscritos em programas de doutoramento há mais de umano (campo de preenchimento automático cálculado após a submissão do formulário)

<sem resposta>

4.2.5.a Número (ETI) de docentes do ciclo de estudos não doutorados com grau de mestre (pré­Bolonha)<sem resposta>

4.2.5.b Percentagem dos docentes do ciclo de estudos não doutorados com grau de mestre (pré­Bolonha) (campoautomático cálculado após a submissão do formulário)

<sem resposta>

4.3. Procedimento de avaliação do desempenho

4.3. Procedimento de avaliação do desempenho do pessoal docente e medidas para a sua permanenteactualização.

O desempenho global dos docentes do ISPA­IU é avaliado em 4 vertentes: científica, pedagógica, extensãouniversitária e gestão. O sistema implementado envolve a participação de colegas, alunos, responsáveisdirectos e os Concelhos Científico e Pedagógico e indicadores objectivos de actividade científica (publicaçõesinternacionais, projectos de investigação, comunicações em eventos científicos) e pedagógica (regularidade deencontros, supervisão dos trabalhos dos alunos). O desempenho é expresso em 4 categorias: Excelente; MuitoBom; Relevante; Insuficiente. A actualização científica dos docentes é promovida através da sua participaçãoem encontros científicos internacionais de excelência, como tem sido prática desde sempre. A constanteprocura do saber e criação de conhecimento promovem igualmente essa actualização. A nível pedagógico, aavaliação pelos alunos é fornecida no final de cada unidade curricular ao docente a fim manter um nível deexcelência na transmissão e consolidação de conhecimentos.

4.3. Academic staff performance evaluation procedures and measures for its permanent updating.The academic staff performance evaluation uses for field; scientific, pedagogic, university extension andoutreach, management. It involves the participation of peers, students, supervisors and the Scientific andPedagogical Councils as well as objective indicators of scientific (international publications, research projects,communications in scientific events) and pedagogical performance (regularity of meetings, studentssupervision). Performance is expressed in 4 categories: Excellent, Very Good, Relevant, Insufficient. Thescientific updating is promoted through the participation in international scientific meetings, as has beenpractice since the beginning. The constant search for and the creation of knowledge also promote this updating.At the pedagogical level, the students perform an evaluation which is passed to the lecturer at the end of eachcurricular unit with the aim to maintain a level of excellence in the diffusion and strengthen of knowledge.

5. Descrição e fundamentação de outros recursos humanos e materiais5.1. Pessoal não docente adstrito ao ciclo de estudos.

O Curso terá a colaboração dos seguintes recursos humanos não docentes, para além do apoio dos serviçosadministrativos do ISPA:2 Técnicos superiores de manutenção laboratorial3 Técnicos de sistemas e tecnologias da informação3 Técnicos de documentação2 Técnicos superiores de administração académica1 Técnico de manutenção geral1 Técnico superior de gestão de projectos1 Técnico superior de contabilidade

5.1. Non academic staff allocated to the study cycle.This PhD program will have the collaboration of the following non academic staff, besides the support from ISPAadministrative personnel:2 Technician for laboratory maintenance3 Technicians of systems and information technology 3 Documentation technicians2 Technicians of academic administration

1 Technician of general maintenance 1 Technician of Project management 1 Technician of accounting

5.2. Instalações físicas afectas e/ou utilizadas pelo ciclo de estudos (espaços lectivos, bibliotecas, laboratórios,salas de computadores, etc.).

As instalações do ISPA foram classificadas com Muito Bom pela Comissão de Avaliação Externa do EnsinoSuperior. Todo o edifício está climatizado, é coberto por uma rede informática “wireless” e por um sistemaáudio.O ISPA dispõe de:Centro de Documentação (260 m2, 160 alunos em simultâneo)Laboratório de aulas de Biologia (132 m2, 30 alunos) e três laboratórios de investigação 30 salas de aula (1650lugares) com internet e multimédiaDois auditórios (172 e 224 lugares), com vídeo e vídeo­conferênciaSala de actos (80 lugares), com internet e multimédiaSala de informática para aulas (30 lugares)Sala de informática de acesso livre (50 lugares)Três salas de estudo para alunosSalão nobre para actos solenes, conferências e outros eventos científicos e culturais.Espaço multiusos (220 m2) para exposições e outras actividades culturaisBar Cantina, (350 m2, 300 lugares)Bar Esplanada (50 lugares)Livraria (101 m2)Reprografia gerida pela Associação Estudantes.

5.2. Facilities allocated and/or used by the study cycle (teaching spaces, libraries, laboratories, computer rooms,etc.).

ISPA facilities were classified as Very Good by the External Higher Education Evaluation Commission. Theentire building is acclimatized and covered by a wireless internet access and an audio and video system in allclassrooms.ISPA has:A Documentation Centre (260 m2, 160 students simultaneously)Biology Laboratory for classes (132.3 m2, 30 students) and three research laboratoriesThirty classrooms (1650 seats) with internet and multimedia.Two auditorium (172 e 224 seats), with video and video­conferenceFormal events room (80 seats) with internet and multimediaComputers classroom (30 seats)Computer room freely accessible (50 seats)Three study rooms for students onlyNoble saloon for solemn acts, conferences and other cultural and scientific eventsMultiuse space (220m2) for exhibitions and other cultural activitiesBar Cantina (350 m2, 300 seats).Bar Esplanade (50 seats).Bookstore (101 m2).Reprography services managed by the Students Association

5.3. Indicação dos principais equipamentos e materiais afectos e/ou utilizados pelo ciclo de estudos (equipamentosdidácticos e científicos, materiais e TICs).

Estão disponíveis os seguintes laboratórios e equipamentos:1) Neuroendocrinologia comportamental: equipamento para doseamento hormonal e para estudos deexpressão génica de receptores hormonais neurais e de neuroanatomia comparada2) Genética Molecular: equipamentos para extracção e amplificação de DNA para trabalhos de filogenia efilogeografia3) Ecologia: lupas, microscópios e material de cirurgia e de histologia para estudos na área da microscopia,histologia pequenas cirurgias e amostragem biológica4) Biotério: uma sala de manutenção e quatro salas de experimentação animal5) Laboratório Biológico de Apoio às Aulas: espaço multifuncional onde decorrem as aulas. Tem equipamentospara microscopia, fisiologia, histologia, ecologia, genética molecular, bioquímicaEstão também disponíveis duas embarcações motorizadas, um ROV, sondas e vários equipamentos demergulho para apoio ao trabalho no mar. Para água doce existem 3 equipamentos de pesca eléctrica e sondasmultiparâmetros

5.3. Indication of the main equipments and materials allocated and/or used by the study cycle (didactic andscientific equipments and materials and ICTs).

The following laboratories and equipment are available:1) Behavioural Neuroendocrinology: equipment for hormone level quantification and gene expression ofhormonal neural receptors and comparative neuroanatomy;

2) Molecular genetics: equipment to extract and amplify DNA for phylogenetic and phylogeographic studies;3) Ecology: stereomicroscopes, microscopes and surgical material for microscopy, histology and small surgeryand biological sampling;4) Fish facilities: one maintenance room and 4 observation rooms.5) Biological Lab: multifunctional lab where classes take place. It has equipment for microscopy, physiology,histology, ecology, molecular genetics, biochemistry.Also available are two boats, one ROV, probes and several diving equipments for work in the sea. For freshwaterstudies 3 electrofishing equipments and multi­parameter probes are available.

6. Actividades de formação e investigação6.1. Indicação do(s) Centro(s) de Investigação devidamente reconhecido(s), na área científica predominante dociclo de estudos e respectiva classificação.

A Unidade de Investigação em Eco­Etologia (FCT 331/94) teve origem num grupo inicial de investigadoresdedicados ao estudo do comportamento de peixes litorais. Estes trabalhos estenderam­se à ecologia de peixes,biologia larvar, monitorização e conservação, biogeografia, filogenia, filogeografia e evolução. Peixesestuarinos e de água doce foram também incluídos, assim como mamíferos e aves marinhas. O estudo docomportamento também levou a uma abordagem integrativa sobre endocrinologia comportamental devertebrados. É coordenada por Vítor Almada e encontra­se dividida na linhas de investigação – Biologia eConservação de Organismos Aquáticos, liderada pelo coordenador, com 15 doutorados, e BiologiaComportamental Integrativa (coordenador: Rui Oliveira) com 5 doutorados. Na última avaliação da FCT estaunidade foi a única a ser classificada com “Excelente” nas Ciências do Mar.http://alfa.fct.mctes.pt/apoios/unidades/avaliacoes/2007/painel?uid=66FC8A39­0EC8­48E9­85EE­AD36680FF747

6.1. Research Centre(s) duly recognised in the main scientific area of the new study cycle and its mark.The Eco­Ethology research unit (FCT 331/94) grew from an initial core of researchers dedicated to the study oflittoral fish behaviour. These studies led the team to the study of fish ecology, larval biology, monitoring andconservation, biogeography, phylogeny, phylogeography and evolution; estuarine and freshwater fish and alsomarine mammals and birds were also integrated. The study of behaviour also led to an integrative approach withstudies in behaviour endocrinology of vertebrates. The Unit is led by a coordinator (Vítor Almada) and is dividedin two research groups – Biology and conservation of aquatic organisms, led by the coordinator, with 15 PhDs,and integrative behavioral biology, led by Rui Oliveira, with 5 PhDs. In the last FCT evaluation this unit was theonly classified with Excellent in Marine Sciences. http://www.ispa.pt/ui/uie/index.asphttp://alfa.fct.mctes.pt/apoios/unidades/avaliacoes/2007/painel?uid=66FC8A39­0EC8­48E9­85EE­AD36680FF747

6.2. Indicação do número de publicações científicas da unidade orgânica, na área predominante do ciclo deestudos, em revistas internacionais com revisão por pares nos últimos três anos.

127

6.3. Lista dos principais projectos e/ou parcerias nacionais e internacionais em que se integram as actividadescientíficas, tecnológicas, culturais e artísticas desenvolvidas na área de ciclo de estudos.

Projectos em curso FCTPTDC/MAR/69749/2007, PTDC/AAC­CLI/103110/2008, PTDC/MAR/101639/2008, PTDC/BIA­BEC/099416/2008,PTDC/MAR/099366/2008, PTDC/MAR/105276/2008, HC/0009/2009, PTDC/AAC­AMB/111349/2009, PTDC/PSI­PCO/118776/2010, PTDC/MAR/118767/2010, PTDC/MAR/121071/2010Projectos Europeus em CursoMARIN­ERA/MAR/0001/2008BIOMARES (LIFE06 NAT/P/000192)COPEWELL. FP7­KBBE­2010­4. Project 265957 Mais em http://www.ispa.pt/ui/uie/collaborations.asp

Parcerias Intern. (selecção)James Cook Univ., AustraliaUniv. of Salzburg, AustriaUniv. Federal de Juiz de Fora, BrazilUniv. Bremen, GermanyUniv. de Pádua, ItalyUniv. Eduardo Mondlane, MozambiqueUniv. of Stellenbosch, South Africa Univ. de Barcelona, Spain

Univ. of La Laguna, SpainUniv. Bern, SwitzerlandUniv. Neuchatel, SwitzerlandBritish Antarctic Survey, UKUniv. of Aberdeen, UKUniv. of Glasgow, UKUniv. of Hull, UKMarine Science Inst., UCSB, USAScripps, UCSD, USAMarine Science Inst., U Texas, USA

6.3. Indication of the main projects and/or national and international partnerships where the scientific, technological,cultural and artistic activities developed in the area of the study cycle are integrated.

Ongoing FCTprojectsPTDC/MAR/69749/2007, PTDC/AAC­CLI/103110/2008, PTDC/MAR/101639/2008, PTDC/BIA­BEC/099416/2008,PTDC/MAR/099366/2008, PTDC/MAR/105276/2008, HC/0009/2009, PTDC/AAC­AMB/111349/2009, PTDC/PSI­PCO/118776/2010, PTDC/MAR/118767/2010, PTDC/MAR/121071/2010European ongoing projectsMARIN­ERA/MAR/0001/2008BIOMARES (LIFE06 NAT/P/000192)COPEWELL. FP7­KBBE­2010­4. Project 265957 http://www.ispa.pt/ui/uie/collaborations.asp

Intern. cooperation (selection)James Cook U, AustraliaUniv. of Salzburg, AustriaUniv. Federal de Juiz de Fora, BrazilUniv. Bremen, GermanyUniv. de Pádua, ItalyUniv. Eduardo Mondlane, MozambiqueUniv. of Stellenbosch, South Africa Univ. de Barcelona, SpainUniv. of La Laguna, Canary Islands, SpainUniv. Bern, SwitzerlandUniv. Neuchatel, SwitzerlandBritish Antarctic Survey, UKUniv. of Aberdeen, UKUniv. of Glasgow, UKUniv. of Hull, UKMarine Science Inst., UCSB, USAScripps, UCSD, USAMarine Science Inst., U Texas, USA

7. Actividades de desenvolvimento tecnológico, prestação de serviços àcomunidade e formação avançada7.1. Descreva estas actividades e se a sua oferta corresponde às necessidades do mercado, à missão e aosobjectivos da instituição.

O Centro de Biociências é uma estrutura do ISPA destinada a articular as actividades de ensino, investigaçãoaplicada, realização de estudos, pareceres, etc. e de divulgação do conhecimento na área da Biologia. Do pontode vista científico é uma estrutura apoiada pela Unidade de Investigação em Eco­Etologia. Apesar da unidadeter a sua investigação predominantemente centrada na área das ciências do mar e, em sentido lato, na biologiaaquática, o Centro de Biociências realiza a sua actividade de educação, formação e prestação de serviços emmúltiplas vertentes da Biologia Aplicada.O ISPA tem também beneficiado da experiência científica no domínio da Biologia do Comportamento comosuporte ao Mestrado em Psicobiologia e à Pós Graduação em Comportamento e Bem­Estar Animal. Para maisinformações:http://centrodebiociencias.webnode.com/http://www.ispa.pt/

7.1. Describe these activities and if they correspond to market needs and to the mission and objectives of theinstitution.

The “Centro de Biociências” (Bioscience Center) is an ISPA structure devoted to the aim of articulating theactivities of teaching, applied research, scientific reports etc, and outreach activities in the area of Biology. It is

scientifically supported by the Eco­Ethology Research Unit. Although the unit has its research predominantlycentred in the Marine Sciences and aquatic biology the centre’s activities occur in multiple areas of appliedbiology mainly in education, general outreach and services. ISPA has also benefited from the scientificexpertise of the Eco­Ethology Unit researchers. They support the Mestrado em Psicobiologia (PsychobiologyMaster) and Pós Graduação em Comportamento e Bem­Estar Animal (Post Graduation in Behaviour and AnimalWelfare). For further information:http://centrodebiociencias.webnode.com/http://www.ispa.pt/

8. Enquadramento na rede de formação nacional da área (ensino superiorpúblico)8.1. Avaliação da previsível empregabilidade dos graduados por este ciclo de estudos com base nos dados doMTSS.

Não aplicável

8.1. Evaluation of the graduates' forseen employability based on MTSS data.Not applicable

8.2. Avaliação da capacidade de atrair estudantes baseada nos dados de acesso (DGES).Não aplicável

8.2. Evaluation of the capacity to attract students based on access data (DGES).Not applicable

8.3. Lista de eventuais parcerias com outras instituições da região que leccionam ciclos de estudos similares.Não aplicável

8.3. List of eventual partnerships with other institutions in the region teaching similar study cycles.Not applicable

9. Fundamentação do número total de ECTS do novo ciclo de estudos9.1. Justificação do número total de unidades de crédito e da duração do ciclo de estudos com base nodeterminado nos artigos 8.º ou 9.º (1.º ciclo), 18.º (2.º ciclo), 19.º (mestrado integrado) e 31.º (3.º ciclo) do Decreto­Lein.º 74/2006.

O presente ciclo de estudos conducente ao grau de mestre tem 180 créditos, estando de acordo com o exigidopelo artigo 31º do Decreto­Lei nº 74/2006. Os primeiros 60 ECTS (1º ano) serão obtidos através da realização de5 unidades curriculares semestrais (duas com 9 ECTS cada, uma com 6 ECTS e duas opcionais à escolha com3 ECTS cada). Os segundos 60 ECTS (2º ano) são obtidos a partir de duas unidades curriculares anuais(Seminário de Dissertação e Estágio) onde os alunos optarão por um de dois perfis: um em que o Estágio tem18 ECTS e o Seminário de Dissertação 42 ECTS e outro mais aplicado em que o Estágio tem 42 ECTS e aDissertação 18 ECTS.

9.1. Justification of the total number of credit units and of the duration of the study cycle, based on articles no.8 or 9(1st cycle), 18 (2nd cycle), 19 (integrated master) and 31 (3rd cycle) of Decreto­Lei no. 74/2006.

This study cycle directed to obtain a Master’s degree has 180 credits, in accordance with article 31st of Law­Decree nº 74/2006. The first 60 ECTS (1st year) will be obtained from attendance and approval to 5 curricularunits of one semester duration (two with 9 ECTS each, one with 6 ECTS and two optional units with 3 ECTS each).The second 60 ECTS (2nd year) will be obtained in two annual curricular units (Dissertation Seminar andInternship) where students will choose from one of two profiles: one where the Internship has 18 ECTS and theDissertation Seminar 42 ECTS and other more applied where the Internship has 42 ECTS and the DissertationSeminar 18 ECTS.

9.2. Metodologia utilizada no cálculo dos créditos ECTS das unidades curriculares.

O cálculo dos ECTS de cada unidade curricular tem em consideração a natureza das suas componenteslectivas (T, TP e PL), de tutorias (OT) e de trabalho de campo (TC) e baseou­se no tempo estimado necessáriopara se atingirem os objectivos de cada UC. Considerou­se ainda a avaliação (AV). Houve uma preocupaçãoem limitar o número de horas teóricas ao necessário para a apresentação das temáticas e discussão ostrabalhos, direccionando a aprendizagem do aluno para um trabalho de pesquisa e reflexão sobre as temáticasabordadas nos ensinos TP e OT. No 1º ano, existem em cada semestre duas UC de 9 ECTS com 30 ou 45 T e 15TP ou PL (e 15 OT), constituindo as unidades nucleares deste curso, em conjunto com um UC de 6 ECTS com 45TP ou 30 T e 15 TP (e 15 OT). Os alunos podem ainda optar por duas UC de 3 ECTS em cada semestretipicamente com 30 TP e 5 OT. No 2º ano, a maioria do trabalho é realizado no contexto do estágio ou doseminário de dissertação, e ambos têm 64 (S) e 6 ou 12 OT.

9.2. Methodology used for the calculation of ECTS creditsThe ECTS calculation of credit units considered the nature of lecture components (T, TP and PL), tutorial (OT)and field work (TC) and was based on the estimated time required to attain the objectives of each CU. Theevaluation time was also considered (AV). There was a central concern to limit the number of hours in thetheoretical classes, with most learning being directed to research and self­learning work on the topicsintroduced during the TP and OT work. In the 1st year, there are two CU of 9 ECTS each in each semester with 30or 45 T and 15 TP or PL (and 15 OT), being the nuclear CU of this course, together with one CU of 6 ECTS with 45TP or 30 T and 15 TP (and 15 OT). Students may also choose two optional CU of 3 ECTS in each semester,typically with 30 TP and 5 OT. In the 2nd year, most work is done in the context of the internship or thedissertation seminar, and both have 64 (S) and 6 or 12 OT.

9.3. Indicação da forma como os docentes foram consultados sobre o método de cálculo das unidades de crédito.O método de cálculo e a distribuição das unidades de crédito foram aprovados pelos coordenadores dasunidades curriculares, envolvendo os restantes docentes, no sentido de determinar o número de ECTS de cadaUnidade Curricular, a partir do número de horas de contacto previstas assim como do número de horasdedicadas a estudo, preparação de trabalhos e projectos e de avaliação previsto. Apesar de não terem sidorealizados inquéritos formais aos estudantes e docentes com este fim, uma vez que se trata de um novo ciclode estudos, recolheu­se a experiência existente nos órgãos do ISPA tendo sido consultados formalmente oConselho Científico e o Conselho Pedagógico. Comparam­se ainda outros ciclos de estudos semelhantes anível nacional e internacional.

9.3. Indication of the way the academic staff was consulted about the method for calculating the credit units.The method of calculating and distributing the credit units were approved by the coordinators of each curricularunit, consulting the other staff members, to determine the number of ECTS of each curricular unit, based on thenumber of contact hours as well as the number of hours dedicated to the study, preparation of oral and writtenworks, projects and evaluation. Although formal inquires to students or staff members were not undertaken withthis specific objective, as this is a new study cycle, we gathered the institutional experience or differentstructures in ISPA with formal consultation of the Scientific and Pedagogical Councils. Other similar studycycles at the national and international levels were also compared.

10. Comparação com ciclos de estudos de referência no espaço europeu10.1. Exemplos de ciclos de estudos existentes em instituições de referência do Espaço Europeu de EnsinoSuperior com a duração e estrutura semelhantes à proposta.

A implementação do novo curriculum de 2º ciclo em Biologia Marinha e Conservação no ISPA obedece às linhasorientadoras do Decreto­Lei nº 74/2006, de 24 de Março. O plano de estudos segue o modelo em curso nageneralidade das universidades europeias e portuguesas que adoptaram as directrizes da European HigherEducation Area e que oferecem formação nesta área do conhecimento. Em particular, foi seguido o modelo queobriga à obtenção de 60 ECTS em unidades curriculares dirigidas à formação em causa (formação teórica,técnica, participação em seminários, desenvolvimento de pequenos projectos de investigação) com vista àprossecução do programa de estudos de dois anos (180 ECTS) para recolha e tratamento dos dados eelaboração da dissertação. Embora existam diversos 2ºs ciclos em Biologia Marinha na Europa (e.g. Groningen,Essex, Bremen, Stockholm, Stirling), não encontrámos nenhum focado na ligação entre a Biologia Marinha e aConservação o que atesta o carácter pioneiro desta proposta.

10.1. Examples of study cycles offered in reference institutions of the European Area of Higher Education withsimilar duration and structure to the proposed study cycle.

The implementation of the new 3rd cycle curriculum in ISPA follows the guidelines of the Law Decree nº 74/2006of 24 March. The study plan follows the current model adopted in many European and Portuguese universitieswhich adopted the European Higher Education Area guidelines and offer curriculum in this area of knowledge. Inparticular, the model which makes the completion of 60 ECTS in curricular units centred on the proposed course

contents (theoretical and technical skills, participation in seminars, development of small and focused researchprojects) aimed at continuing the study program of two years (180 ECTS) with data collection and analysis andcompletion of the Dissertation. Although there are several master’s in Marine Biology in Europe (e.g. Groningen,Essex, Bremen, Stockholm, Stirling) we couldn’t find any centred in bridging Marine Biology and Conservation,which concurs to the innovative character of the current proposal.

10.2. Comparação com objectivos de aprendizagem de ciclos de estudos análogos existentes em instituições dereferência do Espaço Europeu de Ensino Superior.

Os objectivos e competências definidos para o 2º ciclo de estudos em Biologia Marinha e Conservação do ISPAforam delineados tendo em consideração o modelo actual vigente na generalidade das universidadeseuropeias. Durante o primeiro ano, o ciclo de estudos promove o desenvolvimento das competênciasnecessárias à produção de conhecimento científico na área da Biologia Marinha e Conservação e à suatransmissão a públicos especializados e generalistas. O ano subsequente consiste no desenvolvimento de umprojecto de investigação com elevado grau de autonomia conducente à elaboração da dissertação, bem como aum estágio de carácter profissionalizante em instituições de relevo para este ciclo de estudos. Estes objectivose competências são semelhantes aos traçados na generalidade dos 2ºs ciclos em Biologia Marinha existentesem universidades europeias e portuguesas, destacando­se a presente proposta pelo seu carácter inovador aoassociar a Conservação à Biologia Marinha e diferenciar dois perfis no 2º ano (um em que o estágio tem maiorpeso e outro em que a dissertação tem mais ECTS atribuídos). Alguns exemplos a nível europeu de programasde 2º ciclo em universidades de referência na área da Biologia Marinha partilham de forma genérica osobjectivos definidos para este ciclo de estudos.

10.2. Comparison with the intended learning outcomes of similar study cycles offered in reference institutions of theEuropean Area of Higher Education.

The objectives and competencies defined for the 2nd cycle of studies in Marine Biology and Conservation atISPA were designed considering the current model implemented in most European universities. During the firstyear, the study cycle promote the development of the necessary competencies for the creation of scientificknowledge in Marine Biology and Conservation and its communication to both specialized and generalizedaudiences. The subsequent year consists in the execution of a research project with high level of autonomywhich will lead to the Master’s thesis, as well as an internship with a professionalization character in institutionsof interest to this study cycle. These objectives and competencies are similar to most 2nd cycles in MarineBiology in European and Portuguese universities, but the current proposal stands out through its innovativecharacter by association Conservation with Marine Biology and differentiating two profiles in the 2nd year (onein which the internship has a greater weight and another where the dissertation has more ECTS). Someexamples at the 2nd cycle programs at the European level in reference Universities in Marine Biology generallyshare the goals defined to this study cycle.

11. Estágios e Períodos de Formação em Serviço

11.1. Indicação dos locais de estágio e/ou formação em serviço (quando aplicável)

Anexo VI ­ Protocolos de Cooperação

Anexo VI ­ Protocolos de Cooperação

11.1.1. Entidade onde os estudantes completam a sua formação:<sem resposta>

11.1.2. Protocolo (PDF, máx. 100kB):<sem resposta>

Anexo VII. Mapas de distribuição de estudantes

11.2. Anexo VII. Mapas de distribuição de estudantes. Plano de distribuição dos estudantes pelos locais de estágio.(PDF, máx. 100kB)Documento com o planeamento da distribuição dos estudantes pelos locais de formação em serviçodemonstrando a adequação dos recursos disponíveis.

<sem resposta>

11.3. Recursos próprios da instituição para acompanhamento efectivo dos seus estudantes noperíodo de estágio e/ou formação em serviço.

11.3. Indicação dos recursos próprios da instituição para o acompanhamento efectivo dos seus estudantes nosestágios e períodos de formação em serviço.

<sem resposta>

11.3. Indication of the institution's own resources to effectively follow its students during the in­service trainingperiods.

<no answer>

11.4. Orientadores cooperantes

Anexo VIII. Normas para a avaliação e selecção dos elementos das instituições de estágio responsáveis poracompanhar os estudantes

11.4.1 Anexo VIII. Normas para a avaliação e selecção dos elementos das instituições de estágio responsáveis poracompanhar os estudantes (PDF, máx. 100kB)Documento com os mecanismos de avaliação e selecção dos monitores de estágio e formação em serviço,negociados entre a instituição de ensino e as instituições de formação em serviço.

<sem resposta>

Anexo IX. Orientadores cooperantes de estágio e/ou formação em serviço

11.4.2. Anexo IX. Orientadores cooperantes de estágio e/ou formação em serviço (para ciclo de estudos deformação de professores) / External supervisors responsible for following the students activities (only forteacher training study cycles)

Nome /Name

Instituição ou estabelecimento aque pertence / Institution

Categoria Profissional /Professional Title

Habilitação Profissional /Professional qualifications

Nº de anos de serviço /Nº of working years

<sem resposta>

12. Análise SWOT do novo ciclo de estudos12.1. Apresentação dos pontos fortes.

Elevada qualificação do corpo docente que apresenta actividades profissionais e científicas de nívelinternacional nas áreas de especialidade do programa de mestradoExistência de uma Unidade de Investigação que integra a rede FCT com classificação de ExcelenteCarácter inovador da propostaDisponibilidade de recursos laboratoriais, bibliográficos, documentais e de trabalho de investigação no campoespecíficos e adequadosExistência de parcerias de colaboração com outras Instituições de Ensino Superior, Centros de Investigação,ONG’s e Institutos Públicos e Privados. A título de exemplo temos as Câmaras de Cascais, Lisboa e Oeiras, asUniversidades de Lisboa, Algarve e Porto, o Instituto Gulbenkian de Ciência, o Instituto da Conservação daNatureza e da Biodiversidade, o Oceanário, o Zoomarine e o Aquário Vasco da Gama, entre muitos outrosCentralidade geográficaAmbiente pedagógicos de excelência para o sucesso escolar dos alunos

12.1. Strengths.High qualification of the lecturers which present professional and scientific activities of international level in theareas of speciality of the master’s program.The existence of a Research Unit which integrates the FCT network, classified as ExcellentInnovative character of the proposalSpecific and adequate Laboratorial, bibliographic, documental and field work resourcesThe existence of collaboration partnerships with many Higher Education, Research Centres, NGO’s and Publicand Private Institutions. As an example: Cascais, Lisboa and Oeiras City Halls, Lisboa, Algarve and PortoUniversities, the Gulbenkian Science Institute, the Institute for Nature Conservation and Biodiversity, LisbonOceanarium, Zoomarine and Vasco da Gama Aquarium, among many others.

Geographical centralityExcellent pedagogical environment for the students scholar success

12.2. Apresentação dos pontos fracos.Ciclo de estudos recente, logo com pouca notoriedade

12.2. Weaknesses.Recent study cycle, therefore with low profile

12.3. Apresentação das oportunidades criadas pela implementação.As actuais perspectivas de desenvolvimento das ciências da vida e do ambiente e a aposta estratégicanacional na área do marOportunidade de potenciar as competências I&D específicas e distintivas do ISPA na área das ciências da vidae no desenvolvimento de instrumentos de transferência de conhecimento aplicado nesta área. Com apassagem a Instituto Universitário, as ciências da vida e em particular a Biologia, são áreas dedesenvolvimento estratégico e estruturanteA criação da Agência de Avaliação e Acreditação do Ensino Superior cria a expectativa de uma maiorregulação e exigência com os ciclos de estudos no ensino público e no ensino particular e cooperativo,especificamente, com investimento em infra­estruturas laboratoriais próprias, recursos humanos qualificadose em regime de tempo integral, unidades de investigação credenciadas pela FCT e produção científica deexcelência a nível internacional

12.3. Opportunities.The current perspectives of development of the life and environmental sciences and the strategic nationalinvestment in the areas of the marine sciencesOpportunity to potentiate the R&D specific and distinctive competencies in the life sciences and in thedevelopment of instruments for applied knowledge transfer in this area. With the conversion in a UniversityInstitute, life sciences and in particular Biology, are areas of strategic developmentThe creation of the Agency for Evaluation and Accreditation of Higher Education raises the expectation that abetter regulation and greater control of the study cycles in the public and private systems, specifically withinvestments in own laboratorial infra­structures, qualified human resources in full time, research unitsaccredited by the Science and Technology Foundation and scientific output of excellence at the internationallevel

12.4. Apresentação dos constrangimentos ao êxito da implementação.Contexto sócio­económico actual fortemente restritivoIncertezas nas perspectivas de evolução nas políticas de financiamento do sistema científico e tecnológiconacionalIncertezas acerca do papel do ensino particular e cooperativo de excelência no panorama do sistema de ensinosuperior em Portugal face às enormes assimetrias existentes e fraca exigência na aplicação dos critérios dequalidade

12.4. Threats.Highly demanding and restrictive socio­economic contextUncertainties on the evolution perspectives of the funding policies of the scientific and technological system Uncertainties on the role of the private and cooperative system of excellence in the context of the highereducation system in Portugal considering the current enormous asymmetries and low requirements in theapplication of the quality criteria

12.5. CONCLUSÕESApesar do contexto sócio­económico actual fortemente restritivo e das incertezas associadas aosconstrangimentos e pontos fracos apontados, o sólido projecto do ISPA – Instituto Universitário de CiênciasPsicológicas, Sociais e da Vida garante o sucesso da implementação do presente ciclo de estudos. A existênciade uma Unidade de Investigação na área das Ciências da Vida classificada com Excelente pela FCT, odinamismo e produção científica de excelência dos seus membros doutorados que são a base do corpodocente deste curso, a grande experiência na orientação de licenciados, mestrados, doutoramentos e pós­doutoramentos do corpo docente do ISPA, as colaborações mantidas com universidades nacionais eestrangeiras de referência, empresas, institutos públicos e privados e organizações não­governamentais, sãomais­valias decisivas para o êxito deste curso. O ISPA possui os necessários meios humanos, materiais efinanceiros para garantir um acolhimento de excelência aos estudantes deste ciclo de estudos. O programaproposto enquadra­se com outros planos de estudo do mesmo ciclo quer de Universidades nacionais, quer deoutras Universidades Europeias, possibilitando a circulação dos alunos por diferentes instituições e aacreditação dos planos de estudos. Este intercâmbio de estudantes e colaborações internacionais é práticacorrente no ISPA e este ciclo de estudos permitirá reforçar estas parcerias bem como procurar novosprogramas de colaboração. Ao assegurar a formação criativa e original e a actualização permanente de

quadros superiores, com elevada qualidade, numa área prioritária do conhecimento responde ainda à procurado mercado e às necessidades de qualificação do País.

12.5. CONCLUSIONSIn spite of the highly restrictive socio­economic context and the uncertainties associated to the identifiedconstraints and weaknesses, the solid project of ISPA – University Institute of Psychological, Social and LifeSciences, guarantees the success of the implementation of the present study cycle. The existence of aResearch Unit in the area of the Life Sciences classified with Excellent by FCT, the dynamism and scientificproduction of excellence of its doctorate members who are the basis for the academic staff of this course, thelarge experience of ISPA lecturers and researchers in supervising bachelors, masters, doctorates and post­doctorates, the many collaborations with national and foreign universities of reference, corporations, public andprivate institutes and non­governmental organizations, are decisive factors for the success of this course. ISPAhas all necessary human, material and financial resources to guarantee the highest quality reception forstudents of this study cycle. The proposed program is in line with other study programs of the same cycle innational and European universities, allowing the interchange of students in different institutions and theaccreditation of the study plan. This interchange of students and collaborations is current practice at ISPA­IUand this study cycle will allow the reinforcement of these partnerships as well as the establishment of newcollaboration programs. By guaranteeing de creative and original training and the constant update of senioremployees with high quality in a priority area of knowledge, it will also contribute to the market demand and thequalification needs of the country.