Komputerowa obróbka i analiza obrazu.

• Mikroskop konfokalny a fluorescencyjny • Dekonwolucja• Oprogramowanie• Techniki obróbki i analizy.

Mikroskop konfokalny

Zalety:– Lepsza rozdzielczość i

kontrast– Rejestrowanie obrazów

cienkich warstw preparatu

Wady:– Powolny– Obraz o słabej

intensywności– Drogi

Porównanie obrazów.

Mikroskop Fluorescencyjny Zastosowanie algorytmu Dekonwolucji

Dekonwolucja. Algorytmy dekonwolucji służą do likwidacji zakłóceń, które wpłynęły na

jakość obrazu. Oryginalny Blind

Zdjęcie: M. Zaremba

Dekonwolucja. Algorytmy dekonwolucji służą do likwidacji zakłóceń, które wpłynęły na

jakość obrazu. Inverse Filter Gold’s Method

• ImageJ• Leica Confocal Software• Leica AF

Oprogramowanie

ImageJ

Formaty plików:

•TIFF, pojedynczy oraz multi-plik(serie) •Otwiera i zapisuje w wielu formatach (BMP,GIF, JPG, PNG, …)•Pluginy dla specjalnych formatów (Leica,Zeiss LSM, DICOM,...) •Raw - jeżeli znamy parametry zdjęcia•Eksportowanie serii zdjęć jako filmów(avi, quicktime, animowany GIF)

Techniki obróbki i analizy obrazuTechniki obróbki i analizy obrazu

Redukcja szumów.

Pojedynczy obraz.

Oryginalny Mean Median

Zdjęcie: mgr G. Schneider

Redukcja szumów.

Seria czasowa - Filtr Kalmana

Zdjęcie: mgr A. Sozańska

Seria w osi Z – Median3D

Zdjęcie: mgr G. Schneider

Praca ze zdjęciami LUT oraz RGB

Zdjęcie: dr G. Wilczyński

R G B RGB

Praca ze zdjęciami LUT oraz RGB

Zdjęcie: mgr K. Szydłowska

Zdjęcie: mgr M. Stefaniuk

Pomiary i Analiza.

Zdjęcie: Z. Kurowska

Obliczanie ilości komórek.

Pomiary i Analiza.

Zdjęcie: dr G. Wilczyński

Pomiar intensywności w czasie.

Pomiary i Analiza.

Zdjęcie: mgr K. Szyfłowska

Pomiar intensywność.

Pomiary i Analiza.

Zdjęcie: mgr A. Sozańska

Śledzenie obiektów: ręczne i automatyczne.

Obrazowanie 3D• Renderowanie powierzchni.

Zdjęcie: dr K. Kwiatkowska

Dziękuję za uwagę!