Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

Embed Size (px)

Citation preview

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    1/73

    MetabolismulBioenergeticaCiclul Krebs

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    2/73

    Noiuni generale de metabolism. Catabolismui i anabolismul.Cile metabolice centrale, ciclice i specifice.

    Metabolismul intermediar. Metode de studiere. Noiuni de energie liber standard. Compuii macroergici -

    structura chimic i rolul lor. Ciclul ATP-ului.

    Caracteristica strii energetice a celulei. Indicii ce ocaracterizeaz. Reglarea metabolismului celular. Decarboxilarea oxidativ a acidului piruvic - enzimele, cofactorii,

    reglarea. Ciclul Krebs - reaciile pariale. Esena biologic a ciclilui Krebs,

    reglarea lui. Noiune de fosforilare la nivel de substrat.

    Stoichiometria ciciului Krebs. Reaciile anaplerotice (reaciile care furnizeaz produse

    intermediare al ciclului acizilor tricarboxilici).

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    3/73

    Metabolismul

    Metabolismulsistem coordonat de transformri asubstanelor i energiei sub aciunea sistemelormultienzimatice.

    Deosebim: metabolismul extern i intermediar Metabolismul externinclude procesele necesare

    pentru: asimilarea substanilor nutritive , transportulmetaboliilor intermediarintre celulele diferitor organe iesuturi i eliminarea produselor finale din organism.

    Metabolismul intermediartotalitatea reaciilor chimicece decurg ntr-o singur celul vie (i asigur viabilitatea,creterea i reproducerea ei).

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    4/73

    Funciile metabolismului:

    1. aprovizionarea celulelor cu energiechimic(ce se formeaz la scindareasubstanelor nutritive);

    2. transformarea substanelor nutritive n

    precursori necesari pentru sintezamacromoleculelor3. asamblarea macromoleculelor n

    componeni celulari;

    4. biosinteza i degradarea biomoleculelorcu destinaie special(h, mediatori,cofactori);

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    5/73

    Fazele metabolismului

    Evideniem 2 faze:1. Catabolismulfaza de degradarea

    macromoleculelor n micromolecule.

    este nsoit de eliberarea energiei (carepoate fi acumulat sub form deATPsauNADPH+H+

    2. Anabolismulfaza de sintez amacromoleculelor din micromolecule, necesit utilizareaATPsau NADPH+H+

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    6/73

    Etapele catabolismului:

    I etap - decurge n TGI (fr eliminarede E). Macromolecule alimentare sescindeaz n monomerii si.

    II etap monomerii se transform ntr-un precursor comun Acetil-CoA (are locgenerare de energie).

    III etap amfibolic - ciclul Krebs sifosforilarea oxidativ(FO) H2O+ CO2are loc generare de energie

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    7/73

    Proteine Glucide Lipide

    AA monozaharide AG+glicerol

    Piruvat

    Acetil -CoA

    c. Krebs

    H2O

    L.R

    FO

    CO2

    gluco Ceto-

    I

    II II

    III

    ADP + Pi ATP

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    8/73

    Deosebirile cilor catabolicede anabolice

    considerentul energetic;

    succesiunea reaciilor este reglatseparat;

    difer dup localizarea n celul.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    9/73

    CILE METABOLICE

    - reprezint reaciile chimice in lant, cu o anumitfuncie. S ==>A ==> B ==> C ==> P

    DEOSEBIM CIMETABOLICE:A. a) centrale (comune pentru degradarea isinteza

    principalelor macromolecule)b) specifice (caracteristice doar pentru substane

    individuale (cofactor).B. a) liniare (glicoliza)

    b) ciclice (ciclul Krebs)C. a) anaboliceb) catabolicec) amfibolice

    D. a) aerobe

    b) anaerobe

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    10/73

    Metode de studiu a cilormetabolice

    Pe organismele intactaporteliminareseaplic att pe organismele sntoase ct i peorganismele bolnave (infectate) i stresate. Se

    efectuiaz prin marcarea metaboliilor cu izotopi. Studiul experimental prin perfuzarea organelor

    intacte.

    Studiul seciunilor tisulare. La nivel celular.

    La nivelul organitelor celulare.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    11/73

    REGLAREA METABOLISMULUI

    Se realizeaz la diferite nivele:

    1. la nivelul proprietilor specifice enzimelor(cantitatea de E i S,prezena Co, pH, t);

    2. la nivelul E reglatoare alosterice;3. Majoritatea reaciilor sunt reglate de starea energetic a celulei.

    Indicatorul ei este sarcina energetic

    - SE = [ATP]+1/2[ADP][ATP]+[ADP]+[AMP] SE= 0,8-0,95

    PF = [ATP]/[ADP]*[Pa] = 500

    Se = 0 ( AMP); Se=1 (ATP). Atkinsoncile metabolice, responsabilede sinteza ATP sunt inhibate de Se nalt; dar cile de utilizare ale ATPsunt stimulate.

    Cile catabolice ca regul sunt inhibate de ATP, NADH2 i activate deAMP, ADP, NAD+. Pentru cile anabolice aciunea acestor compui esteinvers.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    12/73

    4. reglare prin modificarea covalent aenzimelor(fosforilare-defosforilare), modulatde hormoni (adrenalina, glucagon .a)

    5. inducia i represia enzimatic-modificarea concentraiei E la nivel detranscripie a genelor corespunztoare subaciunea hormonilor steroizi.

    6. Reglarea dependent de hormonii careaccelereaz activitatea E (adaptare imediat)sau de viteza sintezei enzimelor (adaptare delung durat)

    Exemple: adrenalina i steroizii

    7. Influiena medicamentelor dediferit origine

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    13/73

    Bioenergetica.Bioenergetica- tiina ce studiaz

    transformrile i utilizarea energiei. n lumea vie sistemul termodinamic

    poate fi reprezentat de un organismntreg; un organ; o celul; o reaciechimic.

    O i l ii fi id i

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    14/73

    Organismele vii pot fi considerate sistemetermodinamice, pentru care sunt valabile legile

    termodinamicei:

    I. Principiul conservriienergiareaciilor chimice nu dispare i nu apare dinnimic, dar se transform dintr-o form n

    alt.Ex.: E chimic se transform n E termic,electric, mecanic.

    II Principiul evoluieitoate procesele

    asociate cu transfer de energie sedesfoar de la sine numai ntr-o direcie inumai pn la o anumit limit - cecorespunde entropiei maximale.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    15/73

    Sistemele biologicesunt sistemedeschise (schimb de energie i materie

    cu mediul nconjurtor) Fiecare sistem are o energie intern

    (E), care este constituit din energie

    liber (G) i energie dependent devariaiile TS (energie legat).E= G + TS

    Fora motrice a reaciilor este tendinasistemului att de a-i spori gradul dedezordine, ct i de a-i reduce coninutulde energie liber ordonat.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    16/73

    Noiune de energie liber standard. Energie liberreprezint acea parte din energia (total)

    intern a sistemului, capabil s efectuieze un lucruasupra mediului n condiii constante de T i presiune -G kcal/mol

    Dac E= G + TS G = E - TS.

    TS - energia legat - nu poate fi utilizat pentruefectuarea lucrului (T- t absolut; Svariaia entropiei

    (gradul de dezordine al sistemului).

    Creterea entropiei mpedic revenirea la stareainiial, de aceea reaciile nsoite de creterea entropiei

    - sunt ireversibile. Energia liber standardeste partea de energie total a

    sistemului, convertit n lucru n condiii standard (G0)T=298K, C% iniiala 1,0 mol, pH = 7, presiunea760 torii (1 atm).

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    17/73

    Referitor la o singur reacie chimic - variaiaenergiei libere standard este diferena dintresuma energiilor libere ale produilor i suma

    energiilor libere ale reactanilor. G pozitiv 0cnd produii conin mai

    mult energie dect reactanii (substaneleiniiale) endergonice(nu pot efectua un

    lucru spontan, necesit energie din exterior).AB GB GA G negativ 0produii conin mai puin

    energie dect substanele iniiale exergonice(fr folosirea energiei) stnga la dreapta pot efectua un lucru.

    G = 0nu evalueaz nici ntr-un sens. Reaciile catabolice exergoniceAnabolice endergonice Legtura (conexiunea) ntre ele este ATP.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    18/73

    Ciclul ATP ATP-transportor universal al

    energiei n forma sa activ este un

    complex cu ionii de Mg sauMn

    ATP2 legturimacroergice(valoare negativ

    ridicat a G0), Servete ca surs de energie

    n:

    1. Lucrul mecanic: micare,contracie

    2. Biosintezamoleculelorbiologice3. Transport: transportul prin

    membran4. n transmiterea

    informaiei genetice

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    19/73

    Ciclul ATP

    n condiii standard hidroliza ATP are locpe 2 ci:

    ATP

    ADP H3PO4 AMP PP

    2H3PO47,3kcal/mol

    14,6 kcal/mol

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    20/73

    Sinteza ATP din ADP i Pi este posibilpe 2 ci:

    1. FO

    2. fosforilare la nivel de substratreaciilen care energia necesar pentru sintezalegturii macroergice fosfat e furnizat deun substarat supermacroergic.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    21/73

    Particularitile structurale ale ATPca donor de energie

    la pH=7 are 4 sarcininegative, care seresping mai puterniccomparativ cu cele 3 din

    ADP Leg macroergice sunt de

    tip anhidrid (unesc 2resturi acide)

    Prezena ionilor de Mg(afinitatea ADP este de6 ori mai marehidroliza este spreformarea ADP+Pi)

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    22/73

    Legtura macroergic. Substane macroergice

    Transportul principal al energiei de la

    procesele catabolice spre cele anabolice iforma major de stocare a ei n organismsunt legturile macroergice fosfat i

    tioesterice din diverse substane Legtura macroergic care la hidroliza

    ei se elibereaz mai mult de 5,2kcal/mol

    (21 kJ/mol)

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    23/73

    Legtura macroergic. Substane macroergice Compuii supramacroergici G0 (kJ/mol) kcal/mol

    1. fosfoenolpiruvat -61,9 -14,82. 1,3difosfoglicerat -49,3 -11,83. creatinfosfat -43,1 -10,3

    Compuii macroergici -G0 (kJ/mol)

    1. ATP ADP +H3PO4 -30,4 -7,3 (7,6)2. ADP AMP + H3PO4 -28,4

    3. H4P2O7 2Pi+H+ -28,4 - 6,9 (-7,3-8)

    4. acil~CoA -31,4 -7,5

    Compuii submacroergiciGlucozo-1 P -5,0

    Fructozo 6 P - 3,8

    Glucozo- 6- P - 3,3

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    24/73

    Decarboxilarea oxidativ apiruvatului

    DOP la eucariote e localizat n mitocondrii; la procariotecitozol. Are loc sub aciunea complexului multienzimatic PDH, alctuit din:1. E1PDH Co1-TPP2. E2dehidrolipoiltransacetilaz

    S

    Co 2- ALS

    3. E3dehidrolipoilDH HSCoAa.pantotenicCo3FAD NAD+ Kkinaza specific

    Ffosfotaza specific, dependent de Ca2+ i Mg2+ Xproteina ligand (n E3) Caracteristica: la E.Coli compus din 48 de lanuri polipeptidice.

    Nucleul l ocup E2; iar E1 i E3 se leag n exterior de nucleu. Lanurilesunt legate prin fore necovalente.

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    25/73

    1. Atacul nucleofil - hidroxietiltiaminoPP,2. gruparea hidroxiettilic se oxideaz cu gr disulfidic- trece n

    sulfhidrilic se formeaz acetillipoamid

    CH3-CO-COOH +E1-TPP E1- TPP-CH-CH3

    OH

    E1-TPP-CH-CH3 + E2 AL

    OH

    S

    SE1-TPP + E2-AL

    SH

    S-C-CH3

    + CO2

    O

    pyruvate e y rogenase

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    26/73

    pyruvate e y rogenasecomplex

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    27/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    28/73

    E2-ALSH

    C-CH3

    OO

    O

    + HS-CoA E2-ALSH

    SH+ CH3COSCoA

    E2-ALSH

    SH

    + E3-FAD E2-ALS

    S

    + E3-FADH2

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    29/73

    E3-FADH2 +NAD E3-FAD+ NADH+H

    Reacia sumar:

    CH3-CO-COOH CH3-CO - S CoA + CO2+NADH+H

    Complexul PDH:

    E1-TPP, E2-ALS

    SE3-FAD HS-CoA, NAD

    Ciclul Krebs LR =3 ATP

    +

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    30/73

    H3C C C O

    O O

    C S

    O

    H3C CoA

    HSCo A

    NAD+ NADH

    + CO2

    Pyruvate Dehydrogenase

    pyruvate acetyl-CoA

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    31/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    32/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    33/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    34/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    35/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    36/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    37/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    38/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    39/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    40/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    41/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    42/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    43/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    44/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    45/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    46/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    47/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    48/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    49/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    50/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    51/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    52/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    53/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    54/73

    Reglarea complexului PDH

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    55/73

    Reglarea complexului PDH Inhibat prin retroinhibiie:AcetilCoAE2; NADHE3

    Efectul e reversibil la aciunea NAD i HSCoA Inhibiia alostericeste amplificat de AG

    macromoleculari

    Reglare nucleotidic, prin sarcina energetic: inhibat

    de GTP i activat de AMP Reglare covalent:complexul PDH este inhibat prin

    fosforilare (kinaza PDH), activat prin defosforilare(fosfataza PDH).

    Fosforilarea se amplific la raportul nalt ATP/ADP; acetilCoA/HSCoA; NADH/NAD; defosforilareala concentraiimari de piruvat i Ca

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    56/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    57/73

    Ciclul Krebs Rolul

    Const dintr-o secven de reacii ce sedesfoar n ciclu (realizeaz degradarea luiAcetil Co A pn la 2 mol de CO2 i produceenergie stocat n GTP, NADH+H, FADH2

    Are loc n matricea mitocondrial Caracter aerob Rolul:1. Donor de protoni i electroni pentru LR2. Integrativ3. Amfibolic4. energetic

    1 Condensarea lui Acetil CoA cu

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    58/73

    1. Condensarea lui Acetil CoA cuOA

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    59/73

    2. Izomerizaea citratului n izocitrat

    3 DH i decarboxilarea

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    60/73

    3. DH i decarboxilareaizocitratului

    d d l l

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    61/73

    IDH NAD dependent- localizat n MCIDH NADP dependent- att n MC ct i n citozol

    4 Decarboxilarea oxidativ a alfa

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    62/73

    4. Decarboxilarea oxidativ a alfacetoglutaratului

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    63/73

    5. Fosforilare la nivel de substrat

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    64/73

    6. DH succinatului

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    65/73

    7. Hidratarea fumaratului

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    66/73

    8. DH malatului

    Ciclul acizilor tricarboxilici1 Condensarea

    2. Trecerea Citratului la

    Izocitrat

    3. Oxidarea Izocitratului la Alfa-t l t t E I it tDH

    4. Oxidarea alfa cetoglutaratuluila succinil CoA sub actiuneacomple l i polien imatic Alfa

    Diacilarea SuccinilCoA cuformare de Succinat iGTP lt t l

    6.Dehidrogenarea

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    67/73

    Ciclul acizilor tricarboxilici(Krebs)

    Acetyl CoA

    ICit

    AC

    Mal

    FR

    a-KG

    ICDHNAD+

    NADH

    SCoA

    aKGDH NAD+NADH

    SucSCoAS

    GDP

    GTP

    CitOAACS

    Fum

    SDH

    FAD+

    FADH2

    MDHNAD+

    NADH

    3NADH+H+=> LR

    FADH2 =>LR

    1 CondensareaAcetil CoA cu OAE-Citrat sintetazacu formare deCitrat.

    CH3-C=OI

    SCoACOOH

    I

    CH2

    I

    C=O

    I

    COOH

    COOH

    I

    CH2I

    OH-C-COOH

    I

    CH2

    I

    COOH

    COOH

    I

    CH2

    I

    H-C-COOH

    I

    CH- OH

    ICOOH

    COOH

    I

    CH2

    I

    CH2

    I

    CH=OI

    COOH

    COOH

    I

    CH2

    I

    HC-OH

    I

    COOH

    COOH

    I

    CH2

    I

    CH2

    I

    C=O

    I

    SCoA

    COOH

    I

    CH2

    I

    CH2

    I

    COOH

    EAconitaz- ce contine Fe iglutation redus.

    Enzima exist sub 2 formeizoenzimatice: a. n MC

    b. Citoplasm

    cetoglutarat . E-IzocitratDH, careare ca coenzim NAD, necesitMg2+, const din 8 subunitti(380000D)- este activat de:

    ADP- inhibat de: NADH+H+ATP

    complexului polienzimatic AlfacetoglutaratDH asemntorcu complexul Piruvat DHcompus din 5 coenzime i 3enzime. Procesul se

    desfoarn cinci etape.

    GTP, ca rezultat alfosforilrii la nivel desubstrat

    gSuccinatului la FumaratE- SDH FADdependent-

    8. Oxidarea Malatului la OA E- MDH7. Hidratarea Fumaratului la Malat

    COOH

    I

    CH

    II

    CH

    I

    COOH

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    68/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    69/73

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    70/73

    Reglarea ciclului Krebs

    Citrat sintaza:Inhibat - succinil CoA; AG; NADH; citrat

    Activat: S- OA, Acetil CoA IzocitratDH:

    Activat: ADP, Mg, MnInhibat: NADH2i NADPH2,ATPAlfa cetoglutaratDHInhibat: succinil CoA; NADH2; Se mare

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    71/73

    Reaciile anaplerotice

    Reaciile ce furnizeaz produii intermediari aiciclului Krebs

    1. Formarea de OAPiruvat +CO2+ATP

    OA+ADP+PiE- piruvatcarboxilaza (biotin dependent)Asp+cetoglutarat OA+Glun miocard i muchi:

    Fosfoenolpiruvat +CO2+GDP OA +GTPE- fosfoenolpiruvatcarboxikinaza

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    72/73

    Reaciile anaplerotice

    2. Formarea alfa cetoglutaratului:

    Glu+Piruvat Ala + cetoglutarat + Ala

    3. Formarea lui succinil CoAdin propionilCoA (1. din oxidarea AG cu numr imparde atomi de C; 2. din catabolismul Val, Ile,Met)

    4. Formarea fumaratului(din catabolismulFen i Tyr)

  • 8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs

    73/73