Upload
ioana-manole
View
330
Download
21
Embed Size (px)
Citation preview
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
1/73
MetabolismulBioenergeticaCiclul Krebs
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
2/73
Noiuni generale de metabolism. Catabolismui i anabolismul.Cile metabolice centrale, ciclice i specifice.
Metabolismul intermediar. Metode de studiere. Noiuni de energie liber standard. Compuii macroergici -
structura chimic i rolul lor. Ciclul ATP-ului.
Caracteristica strii energetice a celulei. Indicii ce ocaracterizeaz. Reglarea metabolismului celular. Decarboxilarea oxidativ a acidului piruvic - enzimele, cofactorii,
reglarea. Ciclul Krebs - reaciile pariale. Esena biologic a ciclilui Krebs,
reglarea lui. Noiune de fosforilare la nivel de substrat.
Stoichiometria ciciului Krebs. Reaciile anaplerotice (reaciile care furnizeaz produse
intermediare al ciclului acizilor tricarboxilici).
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
3/73
Metabolismul
Metabolismulsistem coordonat de transformri asubstanelor i energiei sub aciunea sistemelormultienzimatice.
Deosebim: metabolismul extern i intermediar Metabolismul externinclude procesele necesare
pentru: asimilarea substanilor nutritive , transportulmetaboliilor intermediarintre celulele diferitor organe iesuturi i eliminarea produselor finale din organism.
Metabolismul intermediartotalitatea reaciilor chimicece decurg ntr-o singur celul vie (i asigur viabilitatea,creterea i reproducerea ei).
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
4/73
Funciile metabolismului:
1. aprovizionarea celulelor cu energiechimic(ce se formeaz la scindareasubstanelor nutritive);
2. transformarea substanelor nutritive n
precursori necesari pentru sintezamacromoleculelor3. asamblarea macromoleculelor n
componeni celulari;
4. biosinteza i degradarea biomoleculelorcu destinaie special(h, mediatori,cofactori);
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
5/73
Fazele metabolismului
Evideniem 2 faze:1. Catabolismulfaza de degradarea
macromoleculelor n micromolecule.
este nsoit de eliberarea energiei (carepoate fi acumulat sub form deATPsauNADPH+H+
2. Anabolismulfaza de sintez amacromoleculelor din micromolecule, necesit utilizareaATPsau NADPH+H+
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
6/73
Etapele catabolismului:
I etap - decurge n TGI (fr eliminarede E). Macromolecule alimentare sescindeaz n monomerii si.
II etap monomerii se transform ntr-un precursor comun Acetil-CoA (are locgenerare de energie).
III etap amfibolic - ciclul Krebs sifosforilarea oxidativ(FO) H2O+ CO2are loc generare de energie
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
7/73
Proteine Glucide Lipide
AA monozaharide AG+glicerol
Piruvat
Acetil -CoA
c. Krebs
H2O
L.R
FO
CO2
gluco Ceto-
I
II II
III
ADP + Pi ATP
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
8/73
Deosebirile cilor catabolicede anabolice
considerentul energetic;
succesiunea reaciilor este reglatseparat;
difer dup localizarea n celul.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
9/73
CILE METABOLICE
- reprezint reaciile chimice in lant, cu o anumitfuncie. S ==>A ==> B ==> C ==> P
DEOSEBIM CIMETABOLICE:A. a) centrale (comune pentru degradarea isinteza
principalelor macromolecule)b) specifice (caracteristice doar pentru substane
individuale (cofactor).B. a) liniare (glicoliza)
b) ciclice (ciclul Krebs)C. a) anaboliceb) catabolicec) amfibolice
D. a) aerobe
b) anaerobe
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
10/73
Metode de studiu a cilormetabolice
Pe organismele intactaporteliminareseaplic att pe organismele sntoase ct i peorganismele bolnave (infectate) i stresate. Se
efectuiaz prin marcarea metaboliilor cu izotopi. Studiul experimental prin perfuzarea organelor
intacte.
Studiul seciunilor tisulare. La nivel celular.
La nivelul organitelor celulare.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
11/73
REGLAREA METABOLISMULUI
Se realizeaz la diferite nivele:
1. la nivelul proprietilor specifice enzimelor(cantitatea de E i S,prezena Co, pH, t);
2. la nivelul E reglatoare alosterice;3. Majoritatea reaciilor sunt reglate de starea energetic a celulei.
Indicatorul ei este sarcina energetic
- SE = [ATP]+1/2[ADP][ATP]+[ADP]+[AMP] SE= 0,8-0,95
PF = [ATP]/[ADP]*[Pa] = 500
Se = 0 ( AMP); Se=1 (ATP). Atkinsoncile metabolice, responsabilede sinteza ATP sunt inhibate de Se nalt; dar cile de utilizare ale ATPsunt stimulate.
Cile catabolice ca regul sunt inhibate de ATP, NADH2 i activate deAMP, ADP, NAD+. Pentru cile anabolice aciunea acestor compui esteinvers.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
12/73
4. reglare prin modificarea covalent aenzimelor(fosforilare-defosforilare), modulatde hormoni (adrenalina, glucagon .a)
5. inducia i represia enzimatic-modificarea concentraiei E la nivel detranscripie a genelor corespunztoare subaciunea hormonilor steroizi.
6. Reglarea dependent de hormonii careaccelereaz activitatea E (adaptare imediat)sau de viteza sintezei enzimelor (adaptare delung durat)
Exemple: adrenalina i steroizii
7. Influiena medicamentelor dediferit origine
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
13/73
Bioenergetica.Bioenergetica- tiina ce studiaz
transformrile i utilizarea energiei. n lumea vie sistemul termodinamic
poate fi reprezentat de un organismntreg; un organ; o celul; o reaciechimic.
O i l ii fi id i
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
14/73
Organismele vii pot fi considerate sistemetermodinamice, pentru care sunt valabile legile
termodinamicei:
I. Principiul conservriienergiareaciilor chimice nu dispare i nu apare dinnimic, dar se transform dintr-o form n
alt.Ex.: E chimic se transform n E termic,electric, mecanic.
II Principiul evoluieitoate procesele
asociate cu transfer de energie sedesfoar de la sine numai ntr-o direcie inumai pn la o anumit limit - cecorespunde entropiei maximale.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
15/73
Sistemele biologicesunt sistemedeschise (schimb de energie i materie
cu mediul nconjurtor) Fiecare sistem are o energie intern
(E), care este constituit din energie
liber (G) i energie dependent devariaiile TS (energie legat).E= G + TS
Fora motrice a reaciilor este tendinasistemului att de a-i spori gradul dedezordine, ct i de a-i reduce coninutulde energie liber ordonat.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
16/73
Noiune de energie liber standard. Energie liberreprezint acea parte din energia (total)
intern a sistemului, capabil s efectuieze un lucruasupra mediului n condiii constante de T i presiune -G kcal/mol
Dac E= G + TS G = E - TS.
TS - energia legat - nu poate fi utilizat pentruefectuarea lucrului (T- t absolut; Svariaia entropiei
(gradul de dezordine al sistemului).
Creterea entropiei mpedic revenirea la stareainiial, de aceea reaciile nsoite de creterea entropiei
- sunt ireversibile. Energia liber standardeste partea de energie total a
sistemului, convertit n lucru n condiii standard (G0)T=298K, C% iniiala 1,0 mol, pH = 7, presiunea760 torii (1 atm).
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
17/73
Referitor la o singur reacie chimic - variaiaenergiei libere standard este diferena dintresuma energiilor libere ale produilor i suma
energiilor libere ale reactanilor. G pozitiv 0cnd produii conin mai
mult energie dect reactanii (substaneleiniiale) endergonice(nu pot efectua un
lucru spontan, necesit energie din exterior).AB GB GA G negativ 0produii conin mai puin
energie dect substanele iniiale exergonice(fr folosirea energiei) stnga la dreapta pot efectua un lucru.
G = 0nu evalueaz nici ntr-un sens. Reaciile catabolice exergoniceAnabolice endergonice Legtura (conexiunea) ntre ele este ATP.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
18/73
Ciclul ATP ATP-transportor universal al
energiei n forma sa activ este un
complex cu ionii de Mg sauMn
ATP2 legturimacroergice(valoare negativ
ridicat a G0), Servete ca surs de energie
n:
1. Lucrul mecanic: micare,contracie
2. Biosintezamoleculelorbiologice3. Transport: transportul prin
membran4. n transmiterea
informaiei genetice
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
19/73
Ciclul ATP
n condiii standard hidroliza ATP are locpe 2 ci:
ATP
ADP H3PO4 AMP PP
2H3PO47,3kcal/mol
14,6 kcal/mol
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
20/73
Sinteza ATP din ADP i Pi este posibilpe 2 ci:
1. FO
2. fosforilare la nivel de substratreaciilen care energia necesar pentru sintezalegturii macroergice fosfat e furnizat deun substarat supermacroergic.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
21/73
Particularitile structurale ale ATPca donor de energie
la pH=7 are 4 sarcininegative, care seresping mai puterniccomparativ cu cele 3 din
ADP Leg macroergice sunt de
tip anhidrid (unesc 2resturi acide)
Prezena ionilor de Mg(afinitatea ADP este de6 ori mai marehidroliza este spreformarea ADP+Pi)
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
22/73
Legtura macroergic. Substane macroergice
Transportul principal al energiei de la
procesele catabolice spre cele anabolice iforma major de stocare a ei n organismsunt legturile macroergice fosfat i
tioesterice din diverse substane Legtura macroergic care la hidroliza
ei se elibereaz mai mult de 5,2kcal/mol
(21 kJ/mol)
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
23/73
Legtura macroergic. Substane macroergice Compuii supramacroergici G0 (kJ/mol) kcal/mol
1. fosfoenolpiruvat -61,9 -14,82. 1,3difosfoglicerat -49,3 -11,83. creatinfosfat -43,1 -10,3
Compuii macroergici -G0 (kJ/mol)
1. ATP ADP +H3PO4 -30,4 -7,3 (7,6)2. ADP AMP + H3PO4 -28,4
3. H4P2O7 2Pi+H+ -28,4 - 6,9 (-7,3-8)
4. acil~CoA -31,4 -7,5
Compuii submacroergiciGlucozo-1 P -5,0
Fructozo 6 P - 3,8
Glucozo- 6- P - 3,3
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
24/73
Decarboxilarea oxidativ apiruvatului
DOP la eucariote e localizat n mitocondrii; la procariotecitozol. Are loc sub aciunea complexului multienzimatic PDH, alctuit din:1. E1PDH Co1-TPP2. E2dehidrolipoiltransacetilaz
S
Co 2- ALS
3. E3dehidrolipoilDH HSCoAa.pantotenicCo3FAD NAD+ Kkinaza specific
Ffosfotaza specific, dependent de Ca2+ i Mg2+ Xproteina ligand (n E3) Caracteristica: la E.Coli compus din 48 de lanuri polipeptidice.
Nucleul l ocup E2; iar E1 i E3 se leag n exterior de nucleu. Lanurilesunt legate prin fore necovalente.
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
25/73
1. Atacul nucleofil - hidroxietiltiaminoPP,2. gruparea hidroxiettilic se oxideaz cu gr disulfidic- trece n
sulfhidrilic se formeaz acetillipoamid
CH3-CO-COOH +E1-TPP E1- TPP-CH-CH3
OH
E1-TPP-CH-CH3 + E2 AL
OH
S
SE1-TPP + E2-AL
SH
S-C-CH3
+ CO2
O
pyruvate e y rogenase
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
26/73
pyruvate e y rogenasecomplex
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
27/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
28/73
E2-ALSH
C-CH3
OO
O
+ HS-CoA E2-ALSH
SH+ CH3COSCoA
E2-ALSH
SH
+ E3-FAD E2-ALS
S
+ E3-FADH2
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
29/73
E3-FADH2 +NAD E3-FAD+ NADH+H
Reacia sumar:
CH3-CO-COOH CH3-CO - S CoA + CO2+NADH+H
Complexul PDH:
E1-TPP, E2-ALS
SE3-FAD HS-CoA, NAD
Ciclul Krebs LR =3 ATP
+
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
30/73
H3C C C O
O O
C S
O
H3C CoA
HSCo A
NAD+ NADH
+ CO2
Pyruvate Dehydrogenase
pyruvate acetyl-CoA
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
31/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
32/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
33/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
34/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
35/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
36/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
37/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
38/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
39/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
40/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
41/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
42/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
43/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
44/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
45/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
46/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
47/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
48/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
49/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
50/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
51/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
52/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
53/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
54/73
Reglarea complexului PDH
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
55/73
Reglarea complexului PDH Inhibat prin retroinhibiie:AcetilCoAE2; NADHE3
Efectul e reversibil la aciunea NAD i HSCoA Inhibiia alostericeste amplificat de AG
macromoleculari
Reglare nucleotidic, prin sarcina energetic: inhibat
de GTP i activat de AMP Reglare covalent:complexul PDH este inhibat prin
fosforilare (kinaza PDH), activat prin defosforilare(fosfataza PDH).
Fosforilarea se amplific la raportul nalt ATP/ADP; acetilCoA/HSCoA; NADH/NAD; defosforilareala concentraiimari de piruvat i Ca
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
56/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
57/73
Ciclul Krebs Rolul
Const dintr-o secven de reacii ce sedesfoar n ciclu (realizeaz degradarea luiAcetil Co A pn la 2 mol de CO2 i produceenergie stocat n GTP, NADH+H, FADH2
Are loc n matricea mitocondrial Caracter aerob Rolul:1. Donor de protoni i electroni pentru LR2. Integrativ3. Amfibolic4. energetic
1 Condensarea lui Acetil CoA cu
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
58/73
1. Condensarea lui Acetil CoA cuOA
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
59/73
2. Izomerizaea citratului n izocitrat
3 DH i decarboxilarea
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
60/73
3. DH i decarboxilareaizocitratului
d d l l
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
61/73
IDH NAD dependent- localizat n MCIDH NADP dependent- att n MC ct i n citozol
4 Decarboxilarea oxidativ a alfa
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
62/73
4. Decarboxilarea oxidativ a alfacetoglutaratului
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
63/73
5. Fosforilare la nivel de substrat
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
64/73
6. DH succinatului
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
65/73
7. Hidratarea fumaratului
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
66/73
8. DH malatului
Ciclul acizilor tricarboxilici1 Condensarea
2. Trecerea Citratului la
Izocitrat
3. Oxidarea Izocitratului la Alfa-t l t t E I it tDH
4. Oxidarea alfa cetoglutaratuluila succinil CoA sub actiuneacomple l i polien imatic Alfa
Diacilarea SuccinilCoA cuformare de Succinat iGTP lt t l
6.Dehidrogenarea
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
67/73
Ciclul acizilor tricarboxilici(Krebs)
Acetyl CoA
ICit
AC
Mal
FR
a-KG
ICDHNAD+
NADH
SCoA
aKGDH NAD+NADH
SucSCoAS
GDP
GTP
CitOAACS
Fum
SDH
FAD+
FADH2
MDHNAD+
NADH
3NADH+H+=> LR
FADH2 =>LR
1 CondensareaAcetil CoA cu OAE-Citrat sintetazacu formare deCitrat.
CH3-C=OI
SCoACOOH
I
CH2
I
C=O
I
COOH
COOH
I
CH2I
OH-C-COOH
I
CH2
I
COOH
COOH
I
CH2
I
H-C-COOH
I
CH- OH
ICOOH
COOH
I
CH2
I
CH2
I
CH=OI
COOH
COOH
I
CH2
I
HC-OH
I
COOH
COOH
I
CH2
I
CH2
I
C=O
I
SCoA
COOH
I
CH2
I
CH2
I
COOH
EAconitaz- ce contine Fe iglutation redus.
Enzima exist sub 2 formeizoenzimatice: a. n MC
b. Citoplasm
cetoglutarat . E-IzocitratDH, careare ca coenzim NAD, necesitMg2+, const din 8 subunitti(380000D)- este activat de:
ADP- inhibat de: NADH+H+ATP
complexului polienzimatic AlfacetoglutaratDH asemntorcu complexul Piruvat DHcompus din 5 coenzime i 3enzime. Procesul se
desfoarn cinci etape.
GTP, ca rezultat alfosforilrii la nivel desubstrat
gSuccinatului la FumaratE- SDH FADdependent-
8. Oxidarea Malatului la OA E- MDH7. Hidratarea Fumaratului la Malat
COOH
I
CH
II
CH
I
COOH
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
68/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
69/73
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
70/73
Reglarea ciclului Krebs
Citrat sintaza:Inhibat - succinil CoA; AG; NADH; citrat
Activat: S- OA, Acetil CoA IzocitratDH:
Activat: ADP, Mg, MnInhibat: NADH2i NADPH2,ATPAlfa cetoglutaratDHInhibat: succinil CoA; NADH2; Se mare
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
71/73
Reaciile anaplerotice
Reaciile ce furnizeaz produii intermediari aiciclului Krebs
1. Formarea de OAPiruvat +CO2+ATP
OA+ADP+PiE- piruvatcarboxilaza (biotin dependent)Asp+cetoglutarat OA+Glun miocard i muchi:
Fosfoenolpiruvat +CO2+GDP OA +GTPE- fosfoenolpiruvatcarboxikinaza
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
72/73
Reaciile anaplerotice
2. Formarea alfa cetoglutaratului:
Glu+Piruvat Ala + cetoglutarat + Ala
3. Formarea lui succinil CoAdin propionilCoA (1. din oxidarea AG cu numr imparde atomi de C; 2. din catabolismul Val, Ile,Met)
4. Formarea fumaratului(din catabolismulFen i Tyr)
8/12/2019 Metabolismul Energetic Ciclul Krebs
73/73