16
Makromolekulák_2010_11_ 23 Simon István

Makromolekul ák_2010_11_ 23

  • Upload
    janus

  • View
    44

  • Download
    0

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Simon István. Makromolekul ák_2010_11_ 23. 5pti: BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR. N-terminális. BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR. A CVFF forcefield. Az ECEPP forcefield. A prolil oligopeptidáz enzim szerkezete. Fő mozgás-irányok. A prolyl-oligopeptidáz szerkezeti dinamikája. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Makromolekulák_2010_11_ 23

Simon István

Page 2: Makromolekul ák_2010_11_ 23

N-terminális

5pti: BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR

Page 3: Makromolekul ák_2010_11_ 23

BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR

Page 4: Makromolekul ák_2010_11_ 23

A CVFF forcefield

Page 5: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Az ECEPP forcefield

Page 6: Makromolekul ák_2010_11_ 23

A prolil oligopeptidáz enzim szerkezete

Page 7: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Fő mozgás-irányok

Page 8: Makromolekul ák_2010_11_ 23

amin

osav

A prolyl-oligopeptidáz szerkezeti dinamikája

korreláltantikorrelált

Page 9: Makromolekul ák_2010_11_ 23
Page 10: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Chou-Fasman Paraméterek

Aminosav P(a) P(b) Alanine 142 83 Arginine 98 93 Aspartic Acid 101 54 Asparagine 67 89 Cysteine 70 119 Glutamic Acid 151 037 Glutamine 111 110 Glycine 57 75 Histidine 100 87 Isoleucine 108 160 Leucine 121 130 Lysine 114 74 Methionine 145 105 Phenylalanine 113 138 Proline 57 55 Serine 77 75 Threonine 83 119 Tryptophan 108 137 Tyrosine 69 147 Valine 106 170

Page 11: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Másodlagos szerkezetet becslő módszerek pontossága

Page 12: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Diszulfid becslő potenciál

Page 13: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Aminosavak konzervativitása és eltemetettsége

Page 14: Makromolekul ák_2010_11_ 23

http://manaslu.aecom.yu.edu/cysredox.html

Page 15: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Homológia meghatározása

Page 16: Makromolekul ák_2010_11_ 23

Szerkezetbecslés homológia alapján